Микрокалориметрическое исследование ДНК и синтетических полинуклеотидов в широкой области концентрации полимеров и ионов нейтральных солей
Диссертация
В условиях, создающих предпосылки для изменения относительных стабильностей AT и ГЦ — пар (высокие концентрации оцределенных солей и полимера) особенно важным является получение непосредственных данных о термодинамических величинах конфор-мационных изменений для правильной экстраполяции результатов к ситуации, близкой к условиям функционирования ДНК 1П VIVO Кроме того, детальное исследование… Читать ещё >
Список литературы
- Y/atson J.D., Crick F.H.C., A Structure for Deoxyribose' Nucleic Acid, — Nature, 1953, 171, P. 737−738.
- Crick F.H.C., Wang J.C., Bauer W.R. Is DNA Really a Double Helix? J. Mol. Biol., 1979, 129, p. 449−461.
- Puller W•, Wilkins M.H.F., Wilson H.R. and Hamilton L.D. (1965) The Molecular Configuration of DM IV. X-ray Diffraction Study of the A-form. J. Mol. Biol., 1965, 12, p. 60−80.
- Langridge R., Wilson H.R., Hooper C.W., Wilkins M.H.F., Hamilton L.D. The Molecular Configuration of DNA. X-ray Diffraction Study of a Crystalline Form of the Li Salt. -J. Mol. Biol., 1960, 2, p. 19−37.
- Arnot S., Seising E. Structures for the Polynucleotide Complexes poly dA. poly dT and poly dT. poly dA.poly dT. J. Mol. Biol., 1974, 88, p. 509−521.
- Marvin D.A., Spencer M., Wilkins M.H.F., Hamilton L.D. The Molecular Configuration of DNA. III. X-ray Diffraction Study of the C-form of Li Salt. J. Mol. Biol., 1961, 3, p. 547−565.
- Leslie A.G.W., Arnott S., Chandraeecaran R., Ratliff R.L. Polymorphism of DUA Double Helices. J. Mol. Biol., 1980, 143, p. 49−72.
- Arnott S., Chandasekaran R., Hukins D., Smith P., Watts L. Structural Details of a Double Helix Observed for DNA-s Containing Alternating Pyrine and Pyrimidine Sequences. -J. Mol. Biol., 1974, 88, p. 523−533.
- Ю. Мокульский M.A., Капитонова. K.A., Мокульская Т. Д. Вторичная структура ДЙК фага Т2- Молекулярная биология, 1972, 6, стр. 883−901.
- Wang A.H.-J., Quigley G.J., Kolpak F.J., Growford J.L., van Boon J.H., van der Marel G., Rich A. Molecular Structure of a Left-handed Double Helical DNA Fragment at Atomic Resolution. Nature, 1979, 282, p. 680−686.
- Arnott S., Chandrasekaran D.L., Birsdall D.L., Leslie A.G., Ratliff R. Left-handed DNA Helices. Nature, 1980, 283, p. 743−745.
- Drew H.R., Takano Т., kanaka S., Itakura K., Dickerson R. High-Salt d (CpGpCpG), a Left-Handed Z DNA Double Helix. -Nature, 1980, 286, p. 567−573.
- Скуратовский И.Я., Бартнев B.H. Исследование структуры магниевой и литиевой солей ДНК фага Т2 методом дифракции рентгеновских лучей. О возможном механизме участия катионов в структурных цревращениях ДНК Молекулярная биология, 1978, 12, стр.1359−1366.
- Tunis-Scneider M.J.В., Maestre M.F., Circular Dichroism Spectra of Oriented and Unoriented Deoxyribonucleic Acid Films A Preliminary Study. — J. Mol. Biol. 1970, 52, p. 5521−530.
- Иванов В.И. Круговой дихроизм и структура комплементарных нуклеиновых кислот. «Итоги науки и техники» сер. молекулярная биология. Т.9 М., ВИНИТИ, 1973 г., с.105−140.
- Zimmer Ch., Luck G. Circular Dichroism Studies of Salt-Induced Conformational Changes of DNAs of Different Base Composition. Biochim. et Biophys. Acta, 1974, 361, N1, p. 11−32.
- Heisaburo S. HMR Study of Conformation and Mobility of 145-Base-Pair Poly (dA dT) Poly (dA — dT) in Solution. -Eur. J. Biochem., 1981, 120, N2, p. 309−312.
- Dickerson R.E., Drew H.R., Conner B.H., Wing R.H., Fratini A.V., Корка M.L. The Anatomy of A-, B-, and Z-D1TA. Science, 1982, 216, p. 475−485.
- Moller A., Nordheim A. Nichols S.R., Rich A. Z-Methylguani-ne in Poly (dG-dC)" Poly (dG-dC) Facilitates Z-DHA Formation. Proc. Hat. Acad. Sci. USA Biol. S, 1981, 78, H8, p. 4777−4781.
- Malfog В., Hartmann В., Leng M. The В Z Transition of Poly (dG-dC)• Poly (dG-dC) Modified by Some Platinium Derivatives. Hucl. Acind. Res., 1981, 9, N21, p. 5659−5669.
- Pohl P.M. Metamorphoses of Double Helix. Biophys. Struct, and Mech., 1981, 7, N4, p. 238−248.
- Drew H.R., Dickerson R.E. Conformation and Dynamics in a- 134
- Z-ША Tetramer. J. Mol. Biol., 1981, 152, N4, p. 723−726.
- Pullman B. How Different is Z from B? Sci. and Sci. Essays Biochem. Biol, and Chem. Tokio e.a., 1981, p. 166 171.
- Drew H.R., Y/ing R.M., Takamo Т., Broka Ch., Tanaka S., Ita-kura K., Dickerson R.E. Structure of B-DNA Dodecamer. Conformation and Dynamics. Proc. Hat. Acad. Sci. USA Biol. Sci., 1981, 78, N4, p. 2179−2183.
- Bram S. Variation of Type B-DNA X-ray Fiber Diagrams with Base Composition. Eroc. Hat. Acad. Sci. USA, 1973, 70, p. 2167−2170.29″ Pillet, Brams J. Dependence of B-A Conformational Change in DNA on Base Composition. Nature, 1972, 236, p. 99−100.
- Premilat S., Albiser S. X-ray Diffraction Study of Three
- DHA Fibres with Different Base Composition. J. Mol. Biol., 1975, 99, P. 27−36.
- Campos J.b., Aymami J., Subirana J.A. The Conformational Versatility of DHA in the Presence of Basic Peptides. JUPAC MacrQ, Florence, Int. Symp. Macromol., 1980, Prepr. Vol. 2, p. 556−556.
- Minyat E.E., Minchenkova L.E., Ivanov V.I. Influence of Nucleotide Sequence upon the 13-S Transition of DNA. Stud. Biophys., 1980, 79, p. 37−38.
- Holbook S.IT., Sussman J.L., Kim S.-H., Absence of Correla* tion Between Base-Pair Sequence and DNA Conformation.
- Science, 1981, 212, N4500, p. 1275−1277.
- Журкин В.Б., Лысов Ю. Н., Иванов В. И. Исследование конформационных возможностей двойной спирали ДНК цри помощи ЭВМ. -В сб. «Конформационные изменения биополимеров в растворах», материалы Ш всесоюзной конференции, Тбилиси, 1975, с. 20.
- Нейфах Ю.А., Туманян В. Г. Возможные конформации ДНК Биофизика, 1979, 24, с.556−562.
- Туманян В.Г., Есипова, Н.Г. Общий метод построения структуры двуспиралышх нуклеионовых кислот. Докл. АН СССР, 1974, 218- с.1222
- Tumanyan V.G., Esipova N.G. Investigation of the Conformations of the Complementary Nucleic Acids. Biopolymers, 1975, 14, p. 2231−2236.
- Yathindra N., Sandaralingam Ы. Analyses of the Possible Helical Structures of Nucleic Acids. Nucleic Acids Res., 1976, 3, P. 729−738.
- Sasisekharan V., Pattabiraman N. Structure of DNA Predicted from Stereochemistry of Nucleoside Derivatives. Nature, 1978, 276, p. 159−160.
- Ильичева И.А., Туманян В. Г., Дашевский В. Г. Конформационный анализ двунитевых полинуклеотидов. «Итоги науки и техники», ВИНИТИ АН СССР, сер.молек.биология, 1979, 15, с. 125 187.
- Amott S., Seising Е. Conformation C-DNA. J. Mol. Biol., 1975, 98, N1, p. 265−269.
- Poltev V.I., Milova L.A., Zhorov B.S., Govyrin V.A. Simulation of Conformational Possibilities of DNA via Calculation of Nonbounded Interactions of Complementary Dinucleoside Phosphate Complexes. Biopolymers, 1981, 20, N1, p. 1−116.
- Bram S., Bandy P. X-ray Diffraction Studies of DNA at Reduced Water Contents. Nature, 1974, 250, N5465, p. 414−416.44* Shlyactenko L.S., Potaman V.N., Barmikov Yu.A. Does the A-form DNA exist in Solution? Stud. Biophis., 1980, 79, p. 53−54.
- Ivanov V.I., Michenkova L.E., Schyolkina A.K., Poletaev A.I. Different Conformations of Double-Stranded Nucleic
- Acid as Revealed by Circular Dichroism. Biopolymers, 1973, 12, p. 89−110.
- Zhurkin V.B. Lysov Y.P., Ivanov V.I. Different Families of Double-Stranded Conformations of DNA Revealed by Computer Calculations. Biopolymers, 1978, 17, p. 377−413.
- Савин В.Ф., Мокульский M.A. Рентгеноструктурное исследование (via -ДНК тимуса теленка цри разных температурах ДАН СССР, 1973, 212, с.1448−1450.
- Arnott S", Fuller W., Hodgson A., Prutton I. Molecular Conformations and Structure Transitions of RNA Complementary Helixes and Their Possible Biological Significance. Nature, 1968, 220, p. 561−564.
- Milman G., Chamberlain M., Langridge R. The Structure of A DNA-RNA Hybrid. Proc. Nati. Acad. Sci. USA., 1967, 57, p. 1804−1810.
- Franklin R., Gosling R.G. Molecular Configuration in Sodium. Nature, 1953, 171, p. 740−741- Acta Crystallogr., 1953, 6, p. 673−677.
- Falk M., Hartman K.A., Lord R.C. Hydration of Deoxyribonucleic Acid. I. A Gravimetric Study. J. Am. Chem. Soc., 1962, 84, p. 3843−3846.
- Migchelson C., Berendson H.J.C., Ruppecht A. Hydration of ША. Comparison of Nuclear Magnetic Results for Oriented DNA in the А, В and C-Form. J. Mol. Biol., 1968, 42, p. 235−257.
- Сухоруков Б.И., Семенов M.A., Малеев В. Я., Шапорина Л. И., Исследование структурных превращений сахарофосфатной цепии азотистых оснований гидрата, ЩШ методом ИК-спектроскопии.-Биофизика, 1979, 24, с.611−619.
- Семенов М.А., Сухоруков Б. И., Малеев В. Я. Гидратируются ли азотистые основания в ДНК при низких влажностях. Биофизика, 1981, 26, й 6, с.979−984.
- Семенов М.А., Малеев В. Я., Сухоруков Б. И. Исследование стабильности гидрата ДНК методом термогравиметрии. Биофизика, 1978, 23, J* 6, с.1097−1098.
- Lubas В., Wilczok I. NMK Study on Molecular Mobility of ША Molecules in Solution. Biopolymers, 1971, 10, p. 1267−1276.
- Lubas В., Wilczok T. Thermal Transition of DMA. Measuredby Ж Spin Echo Technique. — Biopolymers, 1967, 5, p. 967−974.
- Lubas В., Wilczok Т. DNA Hildration during Phase Transition. Stud. Biophys., 1981, 84, N1, p. 15−16.
- Pullman A., Pullman B. Hew Paths in the Molecular Orbital Approach to Solvation of Biological Molecules. Quart. Rev. Biophys., 1974, 7, p. 505−566,
- Perahia D., Jhon M.S., Pullman B. Theoretical Study of the Hydration of В-ША. B.B.A., 1977, 474, p.349−362.
- Lavery R., Pullman B. The Molecular Electrostatic Potential, Steric Accessibility and Hydration of Dickersons B-DNA Dodecamer d (CpGpCpGpApApTpTpCpGpCp G).- Nucl. Acids Res., 1981, 9, N15, P. 3765−3777.
- Perahia D., Pullman A., Pullman В., Molecular Electrostatic Potential of the В-ША Helix. V. Poly (dG-dC) and Poly (dA.dl). Int. J. Quantum Chem., 1979 (1980), Quantum Biol. Simp. N6, p. 353−363.
- Манник Я.X., Туманян £.Г. Локализация молекул воды в молекуле ДНК методом разностного Фурье-синтеза. Биофизика, 1979, 5, с.940−942.
- Tynis M.J., Hearst J.E. On the Hydration of ША. 1. Preferential Hydration and Stability of ША in Concentrated Trif-luoroacetate Solution. Biopolymers, 1968, 6, p. 1324−1344.
- Bram S., Tougard P. Polymorphism of Natural ША. Nature New. Biol., 1972, 239, p. 128−131.
- Pilet J., Brams J. Investigation of DNA Structural Changes Ъу Infrared Spectroscopy. Biopolymers, 1973, 12, p. 387 403.
- Pilet J., Blicharski J., Brams J. Conformations and Structural Transitions in Polydeoxynucleotides. Biochemistry, 1975, 14, p. 1869−1876.
- Mrevlishvili G.M., Japaridze G.Sh., Sokhadze V.M., Tatish-vili D.A., Orvelashvili L.M. Hydration of Nucleotides, Polynucleotides and Natural DNA. Ina Abstracts of Symposium on Biophysics of Nucleic Acids and Nucleoproteins, Tallin, 1981, p. 169.
- Crowford J.L., Kolpak F.L., Wang A.H.J., Doigley G.J., Van Boom J.H., Vander Marel G., Rich A. The Tetramer d (CpGpCpG) Crystallizes as a Left-Handed Double Helix. Proc. Nat. Acad. Sci. USA., 1980, 77, p. 4016−4020.
- Гасан А.И., Малеев В. Я. Влияние межполекулярного взаимодействия на переход спираль-клубок у ДНК. Доппов1д1 АН УССР, 1973, Б, №.4, с.356−358.
- Гасан А.И., Малеев В. Я. Исследование термической устойчивости ДНК в концентрированных растворах В материалах шестой Всесоюзной конференции по калориметрии, Тбилиси: «Мецниере-ба 1973, с.481−485.
- Buckin V.A., Tselikova S.V., Sarvasian А.P. A New Method of Investigation of Counterion Nucleic Acid Interactions. -Studia Biophysica, 1982, 87, p. 233−234.
- Buckin V.A., Sarvasyan A.P., Buckina S.N., Abagian R.A. The Hydration of Nucleic Bases in Aquens Solutions and its Changes at Stacking Association Process. In: Abstracts Symposium on Biophysics of Nucleic Acids and Nucleoproteins, Tallin, 1981, p. 171.
- Drew H.R., Dickerson R.E. Structure of a B-DNA Dodecamer III Geometry of Hydration. J. Mol. Biol., 1981, 151, p. 535−557.
- Корка M.L., Frantini A.V., Drew H., Dickerson R.E. A Quantitative Study of Ordered Water Structure Around a B-DNA Dodecamer. J. Mol. Biol., 1983, 163, P. 129−146.
- Conner В., Takano T., Tanaka S., Ikarua K., Dickerson R. E* The Molecular Structure of d (CpCpGpG), a Fragment of Right-handed Double Helical A-DNA. Nature, 1982, 295, N5847, p. 294−299.
- Гелларт, Бау P. Рентгеноструктурные исследования металлонук-леотидных и металлонуклеозидных комплексов. В кн.: Ионы металлов в биологических системах. „Мир“, М., 1982, с.9−52.
- Collins A.D., De Meester P., Goodgame D.M.L., Skapski A.C. The Site of Metal Ion Binding in a Nikel Derivative of Adenosine 5'-Monophosphate An X-Ray Study. Biochim, Biophys. Acta, 1975, 402, p. 1−9.
- Aoki К. Formation, Trapping and Lifetime of the Biradicals Generated in the Photochemistry of Valeraldehyde. J, Amer. Chem. Soc., 1978, 100, p. 7Ю6−7112.
- Melanson R., Rochon F.D. The Crystal Structure of Trans-Dichro (dimetylyesulfoxide- (2-picoline) Platinum (II) -Acta Crystallogr., 1978, Sect В, В 34(4), p. 1125−1127.
- Aoki K. X-ray Crystal Structure of 1:1 Manganese-Cytosine 5» Phosphate Complex: Metal Bonding to Both 0(2) of the Base and Phosphate. — Chem. Commun., 1976, p. 748−751.
- Bau R., Teller G., Koetzle T.F. Structure of /Pt (en)(5' -CMP)/2*2H20 An Example of Direct Platinum Phosphate Bonding. — J. Amer. Chem. Soc., 1977, 99, 3874−3878.
- Fischer B.E., Bau B. Coordination Sites in Nucleotides: X-ray Crystal Structure of the Ternary Complex Cooper (II) Uridine 5 ' -. monophosphate 2.2* - dipyridilamine. -Inorg. Chem., 1978, 17(1), p. 27−34.
- Cartwright B.A., Goodgame D.M.L., Jeeves I., Skarski A.C. X-ray Structure of a Compound of Cobalt with Uridine 5' -Monophosphate. Evidence for Metal-Phosphate Bonding Only. -Biochim. Biophys. Acta, 1977, 477, p. 195−199.
- Kistenmacher T.J., Sorrell T. Structural Chemistry of N (7) Substituted Pupines Crystal and Molecular Structure of 7-Methylyxanthine Hydrochloride Monohydrate. Acta Crystall- НЗ ogr., 1975, Sect. В 31(2), p. 489−492.
- Kosturko L.D., Folzer C., Stewart R.T. The Crystal and Molecular Structure of a 2:1 Complex of 1-Methyltymine-Mercury (II). Biochemistry, 1974, 13, p. 3949−3952.
- Carrabine J.A., Sundaralingam M. Mercury Binding to Nucleic Acids. Crystal and Molecular Structures of 2:1 Complexes of Uracil Mercuric Chloride and Dihydrouracil — Mercury Chloride. — Biochemistry, 1971, 10, p. 222−294.
- Sigel H., McCormick D.B. Discriminating Behavior of Metal Ions and Ligands with Regard to Their Biological Significance. Accts. Chem, Res., 1970, 3, p. 201−205.
- Sigel H., Mitchele P.R., Nauman C.F. Acidity of the N (1) proton in the Zinc (2+) and Zinc (2, 21 bypyridyl)2* Complexes of Inosine, Gyanosine, Uridine and Thymidine51 triphosphates. — Chem. Int. Ed., 1975, 14, p. 394−396.
- Ю4. Вилкинс M. Молекулярная структура нуклеиновых кислот (Нобелевская лекция). Приложение в кн. И. Гершкович «Генетика», М., «Наука, 1968, с.576−589.
- Rosenberg J.M., SeemanN.C., Kimm 1.1.P., Suddath P.L.,
- Nicholas H.B., Rich A. Double Helix at Atomic Resolution. -Nature, 1973, 243, p. 150−154.
- Ю6. Скуратовский И. Я., Волков, а Л.И., Капитонова К. А., Бартнев B.H. Положение тяжелого катиона в структуре кристаллической В-формы ДНК Биофизика., 1979, 24, 4, с.750−755.
- Bartenev V.N., Golovanov Eu.I., Kapitonova К.A., Mokulskii M.A., Volkova L.I., Skuratovskii I.Ya. Structure of the B-DNA Gationic Shell as Revealed by X-ray Diffraction Study of Cs DNA. J. Mol. Biol., 1983, 169, p. 217−234.
- Granot J., Feigon J., Kearns D.R. Interactions of DNA with Divalent Metal Ions I. NMR Studies. — Biopolymers, 1982, 21, N1, p. 181−201.
- Granot J., Kearns D. Interactions of DNA with Divalent Metal Ions. II Proton Relaxation Enhancement Studies. -Biopolymers, 1982, 21, N1, p. 203−218.
- Granot J., Kearns D.R. Interactions of DNA with Divalent Metal Ions. III. Extent of Metal Binding Experiment and Theory. Biopolymers, 1982, 21, N1, p. 219−232.
- Legoy J.L., Gueron M. The Distance of Manganese to Phosphorus Atoms of Polynucleotides and Dynamics of Binding. -Biochimie, 1981, 63, N1V12, p. 815−819.- 145
- Kotin. The Stability of Deoxyribonucleic Acids Charge Effects. J. Mol. Biol., 1963, 7″ Р» 309−318.113* Марыур Дж. В кн.: «Нуклеионовые кислоты», М., «Мир», 1969, с. 258.
- Scruggs R.L., Ross P.P. Viscositi Sudu of DNA. Biopolymers, 1964, 2, p. 593−609.
- Doty P., Bunce B.H. The Molecular Weight and Shape of Desoxypentose Nucleic Acid. J. Am. Cem. Soc., 1952, 74, p. 5029−5034.
- Василеску Д. Некоторые электрические свойства нуклеионо-вых кислот и их компонентов. В кн. «Физико-химические свойства нуклеионовых кислот». 1976, М., «Наука», с. 43 -76.
- Privalov P.L., Ptitsyn О.В., Birschtein Т.М. Determination of the Stability of the DNA Double Helix in Aqueous Medium. Biopolymers, 1969, 8, p. 559−570.
- Liebe D.C., Stuehr J.E. Cooper (II) DNA Denaturation 1• Concentration Dependence of Melting Temperature and Terminal Relaxation Time. — Biopolymers, 1972, 11, 145−166.
- Данилов В.И. О црироде гиперхромного эффекта в двухтяже-вых полинуклеотидах: роль водородных связей. Докл. АН СССР, 1975, 224, J5 I, 236−238.
- Marmur J., Doty P. Determination of the Base Composition of Deoxyribonucleic Acid from its Denaturation Temperature. J. Mol. Biol., 1962, 5, p. 109−115.
- Owen R.J., Hill L.R., Lapage S.P. Determination of DNA Base Compositions from Melting Profiles in Dilute Buffers. -Biopolymers, 1969, 7, p. 503−509.
- Schildkraut С., Lifson Sh. Dependence of the Melting Temperature of DNA on Salt Concentration. Biopolymers, 1969, 3, N2, p. 195−205.
- Габриелян А.Г. Конформационная сатабильность ДНК в растворах в присутствии солей. Канд.дисс., Пущино, 1974.
- Габриелян. Конформационные переходы ДНК в концентрированных растворах нейтральных солей. Биофизика, 1979, 24, 4, с.620−632.
- Emanuel С.Р. Some Physical Properties of Deoxyribonucleic Acids Dissolved in a High-Salt Medium: Salt Hyperchomicity. Biochim. Biophis. Acta, 1960, 42, N1, p. 91−98.
- Hamaguchi K., Geidushek E.P. The Effect of Electrolytes on the Stability of the Deoxyribonucleate Helix. J. Amer. Chem. Soc., 1962, 84, N8, p. 1329−1338.
- Taylor R.P., Kuntz I.D. Proton Accpor Abilities of Anions and Possible Reletance to the Hofmeister Series, J. Amer. Chem. Soc., 1972, 94, N23, p. 7963−7965.
- Perelroyzen M.P., Lyamichev V.I., Kalambet Yu. A., Lyub-chenko Yu. L., Vologodskii A.V. A Study of the Reversibility of Helix-Coil Transition in DNA.- Nucl. Acids Research, 1981, 9, 16, p. 4043−4059.- 147
- Юргайтис А.П., Лазуркин Ю. С. Механизм денатурации ДНК в присутствии ионов марганца. В сб. «Конформационные изменения биополимеров в растворах», Тбилиси, 1980, с. 23.
- Tachibana Н., Ueno-Nishio S., Goton О., Wada A. Salt-Concentration Dependence of Thermal Denaturation of Restriction Fragment DNAs from 0X174. J. Biochem., 1982, 92, p. 623−635.
- V/etmur I.G., Davidson N. Kinetics of Renaturation of DNA. -J. Mol. Biol., 1968, 31, P. 349−370.
- Chiang-Tung Chang T.C., Hain J.R., Hutton I.G., Wetmur I.C. Effects of Microscopic and Macroscopic «Viscosity on the Rate of Renaturation of DNA. Biopolymers, 1974, 13"p. 1847−1858.
- Gruenwedel D. Y/., Chi-Hsa Hsu. Salt Effects on the Denaturation of DNA. Biopolymers, 1969, 7, 4, p. 557−570.
- Gruenwedel D.W., Chi-Hsia Hsu. The Effects of Aqueous Neutral-Salt Solutions on the Melting Temperatures of Deoxyribonucleic Acids. Biopolymers, 1975, Ю, N1, p. 47−68.
- Gruenwedel D.W. Salt Effects on the Denaturation of DNA. TV. A Calorimetric Study of the Helix-Coil Conversion ofthe Alternating Copolymer poly/d (A T)/. — Biochim. Biophys. Acta, 1975, 395, N3, P. 246−257.
- Гасан А.И., Гимпелевич Б. Г., Малеев В. Я. Влияние нейтральных солей на конформационные переходы в ДНК- В сб.: «Конформационные изменения биополимеров в растворе. Мат. Ш Всес. конф., Тбилиси, 1975, с.48−49.
- Пермогоров В.И., Прозоров А. А., Шемякин М. Ф., Лазуркин Ю. С., Хесин Р. Б. В кн.: «Молекулярная биофизика», М., «Наука», 1965, с. 162.
- Hawley S.A., Macleod R.M. Pressure-Temperature Stability of DNA in Neutral Salt Solutions. Biopolymers, 1974, 13, N7, p. 1417−1426.
- Klump H., Ackerman T. Experimental Thermodynamics of the Helix Random Coil Transition. IV. Influence of the Base Composition of DNA on the Transition Enthalpy. — Biopolymers, 1971, 10, N3, p. 513−522.
- Привалов П.Л. Теплота плавления двойной спирали ДНК Мол. биология, 1969, 3, с.559−571.
- Евдокимов Ю.М., Варшавский Я. М. Термодинамические характеристики структурных переходов ДНК в растворах 10 и Д^О -Биофизика II, № I, с.7−17.
- De Voe H., Tinoco I. The Stability of Helical Polynucleotides: Base Contribution. J. Mol. Biol., 1962, 4, p. 500−517.
- Ts’o P.O.P. The Hydrophobic-Stacking Properties of the Bases in Nucleic Acids. Ann. N.Y. Acad. Sci., 1969, 153, p. 785−804.
- Gill S.J., Downing M., Sheats G.P. The Enthalpy of Self-Association of Purine Derivatives in Water. Biochemistry, 1967, v. 6, N1, p. 272−276.
- Фрэнке Ф. Взаимодействия низкомолекулярных веществ в водных растворах. Применимость модельных исследований в биохимической термодинамике. в сб. «Биохимическая термодинамика» М., «Мир», 1982, с.25−94.
- Данилов В.И., Закшевская К. М., Желтковский Н. В., Проблема стабильности ДНК: вклад оснований «Итоги науки и техники», ВИНИТИ АН СССР сер.молек.биология, 1979, 15, с.74−124.
- Рейн Р. Исследования биомолекулярных взаимодействий В сб. «Межмолекурные взаимодействия. От двухатомных молекул до биополимеров». М., «Мир», 1981, с.414−481.
- Porschke D. Cooperative Nonezymic Base Recognition II.
- Брауд P. В кн.: «Фазовые переходы», М., «Мир», 1967, с. 24.
- Lazurkin Yu. S., Prank-Kamenetskii M.D., Trifonov E.M. Melting of DNA: Its Study and Application as a Research Method. Biopolymers, 1970, 9, p. 1253−1306.- 151
- Lazurkin Yu. S., Frank-Kamenetskii M.D. Conformational Changes in DNA Molecules. Ann. Rev. Biophys. Bioenerg., 1974, 3, p. 127−150.
- Франк-Каменецкий М.Д. В сб. «Структура, свойства и генетические функции ДНК». Ин-т Атомн. энергии им. В. И. Курчатова, М., 1966, с.33−46.
- Crothers. Calculation of Melting Curves for DNA. -Biopolymers, 1968, 6, p. 1391−1402.165* Eichinger B.E., Fixman M. Helix-Coil Transition in Heterogeneous Chains. II. DNA Model. Biopolymers, 1970, 9, 205−217.
- Веденов A.A., Дыхне JI.M., Франк-Каменецкий. Переход спираль-клубок в ДНК. Усп.Физ.Наук, 1971, 105', В. З, с.479−519.
- Франк-Каменецкий М.Д., Франк-Каменецкий А. Д. Учет двунит-чатости в теории перехода спираль-клубок в ДНК. Молек. биол., 1969, 3, с.375−383.
- Франк-Каменецкий М.Д., Лазуркин Ю. С. Блочная гетерогенность ДНК из тимуса теленка и Мол.биол., 1971, 5, с.766−775.
- Hollman P.A., Weiner P.K., Deoring A. Studies of Nucleotide Conformqtions and Interactions. The Relative Stabilities of Double-Helical B-DNA Sequence Isomer. Biopolymers, 20, N12, p. 2583−2621.
- Lubchenko Yu. L., Frank-Kamenetskii M.D., Vologodskii A.V., Lazurkin Yu. S., Gause G.G. Pine Structure of DNA Melting Curves. Biopolymers, 1976, 15, p. 1019−1031.
- Франк-Каменецкий М. Д. Теоретические модели ДОС. «Итоги науки и техники», сер.мол.биология, ВИНИТИ АН СССР, М., 1979, T. I5, с.42−74.
- Франк-Каменецкий М. Д. Теоретическое рассмотрение влияния различных факторов на тепловую денатурацию ДНК. Докл. АН СССР, 1964, 157, № I, с.187−190.
- Франк-Каменецкий М. Д. Теория перехода спираль-клубок де-зоксифибонуклеиновой кислоты с дополнительными связями между цепями. Высокомолек.соед., 1965, 7, с.354−362.- 153
- Лазуркин Ю.С., Франк-Каменецкий М.Д. Термодинамические и кинетические подходы к исследованию структуры и свойств молекулы ДНК. Сб. «1У междунар. биофизич.контр.» кн.1, докл. симпозиумов, Бущино, 1973, с.255−273.
- De Marky Н., Manning G.S. On the Application of Polyelect-rolyte Limiting Laws to the Helix-Coil Transition of DM. IV. Dependence of Helix Stability on the Concentration of Divalent Metal Ions. Biopolymers, 1976, 15, 1T3, p. 457 468.
- Record M., Thomas Ir., Woodbury C.P., Lohman T.M. Na+ Effects on Transitions of DM and Polynucleotides of Variable Linear Charge Density. Biopolymers, 1976, 15, N5, p. 893 915.
- Asp ем А. А., Ландо Д. Ю. Влияние лигандов с избирательным характером взаимодействия на переход спираль-клубок «ВДК-Мол.биология, 1979, 13, В 5, с.1098−1109.
- Ландо Д.Ю., Кулба A.M., Ахрем А. А. Влияние лигандов с избирательным характером взаимодействия на переход спираль-клубок ДНК. 1У Тепловая денатурация ДНК в кислой среде.
- Мол.биология, 1981, 15, № 5, с.1093−119 185. Ландо Д. Ю., Крот В. И., Франк-Каменецкий М. Д. Плавление комплексов ДНК с протяженными лигандами Мол. биология, 1975, 9,? 6, с.856−860.
- Anshelevich V.V., Vologodskii A.V., Lukashin A.V., Frank-Kamenetskii M.D. Slow Relaxational Processes in the Melting of Linear Biopolymers: A Theory and Its Application to Nucleic Acids. Biopolymers, 1984, 23, p. 39−58.
- Привалов П.Л., Монаселидзе Ж. Р., Мрелишвили Г. М., Магалдад-зе В.А. Теплота внутримолекулярного плавления макромолекул. ЖЭТФ, 1964, 47, с.2073−2079.
- Привалов П. Л., Монаселидзе Дж.Р. Автоматический адиабатный дифференциальный микрокалориметр для исследования структурных переходов в макромолекулах. ПТЭ, 1965, 6, с.174−179.
- Бакрадзе Н.Г., Монаселидзе Де.Р.Прецизионный дифференциальный микрокалориметр. Измерительная техника, 1971, 2, с.58−60.
- Монаселидзе Дж.Р., Бакрадзе Н. Г. Адиабатный дифференциальный микрокалориметр. В кн.: Конформационные изменения биополимеров в растворах. М., Наука, 1973, с. 196−199.
- Бакрадзе Н.Г. Конформационные превращения тРНК. Кадн.дисс. Тбилиси, 1975,
- Кольтхоф И.М., Сендэл Е. Б. Количественный анализ. Изд-во АН СССР, М., 1948.
- Берестецкая И.В., Фраяк-Каменецкий М.Д., Лазуркин Ю. С. Зависимость ширины интервала плавления ДНК от ионной силы раствора В кн.: «Конформационные изменения биополимеров в растворах», 1973, «Наука», М., с.7−15.
- Hearst J.E. Determination of the Dominant Factors Which Influence the Net Hydration of Native Sodium Deoxyribonu-cleate. Biopolymers, 1965, 3, p. 57−68.
- Melchior W.B., von Hippel P.H. Alteration of the Relative Stability of dA"dT and dG’dC Base Pairs in DNA. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1973, 70, p. 298−302.
- Shapiro J.Т., Stannard B.S., Felsenfeld G. The Binding of Small Cations to Deoxyribonucleic Acid. Nucleotide Specificity. — Biochemistry, 1969, 8, 8, p. 3233−3241.
- Thermodinamical Quantities of the Transition Process Helix-Coil in DNA at High Concentrations of Neutral Ions In Abstracts of «Quatrieme Conference Internationale de Ther-modynamique Chimique», 1975, Montpellier France, V/18, p. 109−114.
- Grunwedel D.W. Salt Effects on the Denaturation of DNA.- 156
- I. A Calorimetric Investigation of the Transition Enthalpy of Calf Thymus DNA in NagSO^ Solutions of Varying Ionic Strength. Biochim. Biophys. Acta, 1974, 340, p. 16−30.
- Мгеладзе Г. Н., Монаселидзе Д.P. Микрокалориметрическое изучение процесса перехода спираль-клубок в ДНК в присутствии высоких концентраций ионов (CjgHg)^ fyMfo. В сб. «Кон-формационные изменения биополимеров в растворах, 1975, Тбилиси, с.54−60.
- Orosz J.LI., Wetmur G. DNA Melting Temperatures and Renatu-ration Rates in Concentrated Alkylamonium Salt Solutions. -Biopolymers, 1977, 16, p. 1183−1199.
- Wells R.D., Larson J.E., Grant R.S. Physicochemical Studies on Polydeoxyribonucleotides Containing Definel Repeating nucleotide Sequences. J.Mol. Biol., 1971, 54, N3, p. 465−497.
- Borner P.N., Dengler В., Tinoco I., Unlenbeck O.C. Stacks ing Interaction in DNA and RNA Molecules. J. Mol. Biol., 1974, 86, p. 843−853.
- Пермогоров В.И., Тяглов Б. В., Минаев В. Е. Исследование плавления двухцепочечной РНК бактериофага F 2, поли (А) поли (И) и поли (Г) поли © в присутствии бромистого те-траэтиламмония Мол. биология, 1980, 14, с.1013−1019.
- Хиппель П., Шлейк Т. Влияние нетральных солей на структуру и конформационную стабильность макромолекул в растворе. В сб. структура и стабильность макромолекул в растворе. «Мир», М., 1973, с.320−480.
- Engel G., Hertz H.G. On the Negative Hydration. A Nuclear Magnetic Relaxation Study. Ber. Buns. Gessel. Phys. Chim., 1968, v. 72, N5, p. 808−834.
- Chattoray D.K., Bull H.B. Calorimetric Study of Water -DNA Interactions. J. Col. Interf. Sci., 1971, 35, p. 220−226.
- Pullman В., Goldblum A., Berthod H. Anion Binding to Nucleic Acid Bases. A Quantum Mechanical Exploration Using Electrostatic Molecular Potentials. — Biochem. Biophys. Res. Communs., 1977, 77, 4, p. 1166−1169.
- Krakauer H., Sturtevant J.M. Heat of the Helix-Coil Transitions of the Poly A Poly U Complexes. — Biopolymers, 1968, 6, N4, p. 491−512.
- Robinson D.R., Grant М.Е. The Effects of Aqneus Salt Solutions on the Activity Coefficients of Purine and Pyrimidine Bases and Their Relation Tothe Denaturation of Deoxyribonu- 158 oleic Acid by Salts. J. Biol. Chem, 1966, 241, p. 4030−4041.
- Андроникашвшш Э.Л., Мгеладзе Г. Н., Монаселидзе Д. Р. Микрокалориметрическое исследование разбавленных и концентрированных растворов и пленок ДНК. В сб.: УТ Всесоюзная конф. по калориметрии. «Мецниереба», Тбилиси, 1973, с.496−500.
- Мгеладзе Г. Н., Монаселидзе Д. Р. Энтальпия плавления поли-дезоксинуклеотидов. В материалах Ш Всесоюзной конференции: «Конформационные изменения биополимеров в растворах. -Тбилиси, 1975, с.84−85.
- Андроникашвшш Э.Л., Есхшова Н. Г. Роль металлов в развитии некоторых опухолевых процессов. Биофизика, 1982, 27, с.1022−1025.
- Мгеладзе Г. Н., Монаселидзе Д.Р. Микрокалориметрическое исследование «Wobble «конформации двойной спирали поли
- Цт-Г), В сб. конформационные изменения биополимеров в растворах, Тбилиси, 1980, с. 15.
- Lezius A.G., Domin Е. A Wobbly Double Helix. Neture New Biology, 1973, 244, 8, p. 169−170.