Молекулярная характеристика локусов, содержащих динуклеотидные микросателлиты, генома партеногенетической ящерицы Darevskia unisexualis
Диссертация
Молекулярные механизмы и характеристика процессов нестабильности генома являются наиболее актуальными вопросами молекулярной биологии и биохимии нуклеиновых кислот. Микросателлитные последовательности ДНК выступают как один из факторов подобной нестабильности. Микросателлиты представляют собой тандемные повторы ДНК с размером мономерного звена от 2 до 6 нуклеотидов. Микросателлитный кластер… Читать ещё >
Список литературы
- Алтухов Ю.П., Салменкова Е. А. Полиморфизм ДНК в популяционной генетике // Генетика. 2002. Т. 98. № 9. С. 11−73.
- Апонин Ю.М., Апонина Е. А. Иерархия моделей математической биологии и численно-аналитические методы их исследования // Математическая биология и биоинформатика, 2007. Т. 2. № 2. С.347−360.
- Базыкин А.Д. Нелинейная динамика взаимодействующих популяций. М. Иж.: ИКИ. 2003. 368 с.
- Бакланов Г. И. Некоторые вопросы индексного метода. М.: Статистика, 1972. 72 с.
- Банников А.Г., Даревский И. С., Денисова М. Н., Дроздов Н. Н., Иорданский Н. Н. Жизнь животных. М.: «Просвещение». 1969. Т. 6. С. 282 284.
- Брусиловский П.М. Становление теоретической биологии и математическое оделирование // Проблемы анализа биологических систем: Сборник Под. Ред. В. Н. Максимова. Изд-во МГУ, 1983. — 132 с.
- Даревский И.С. Эволюция и экология партеногеиетического размножения у пресмыкающихся / В сб.: Современные проблемы теории эволюции. М.: «Наука». 1993. С. 89−109.
- Елисеева И.И., Юзбашев М. М. Общая теория статистики. М.: Финансы и Статистика, 2008. 655 с.
- Животовский JI.A. Микросателлитная изменчивость в популяциях человека и методы её изучения // Вестник ВОГиС. 2006. Т. 10. № 1. С. 74−96.
- Забаровский Е.Р. Альтернативные подходы к секвенированию и картированию генома// Молекулярная биология. 2001. Т. 35. № 2. С. 224.
- Зимницкий А.Н., Башкатов С. А., Уразбаев В. Н. Тамдемные повторы ДНК и концепция матричного синтеза протеогликанов. М.: Лабиринт, 2005. — 103 с.
- Калюжный Д. Н., Бондарев Ф. С., Щелкина А. К., Лившиц М. А., Борисова О. Ф. Внутримолекулярные G-квадруплексы, образованные микросателлитной последовательностью d(GT)i2 в присутствии ионов К+ // Молекулярная биология, 2008. Т.42. № 1. С.693−700.
- Костюченко М.В., Удина И. Г., Зайцев A.M., Храброва Л. А., Сулимова Г. Е. Изучение генетического разнообразия пород лошадей отечественной селекции на основе RAPD-PCR и микросателлитных маркеров //Сельскохоз. биология. 2001. № 6. С.29−34.
- Куприянова Л.А. Некоторые цитогенетические закономерности сетчатого видообразования однополых видов ящериц (Reptilia, Lacerddae) и других групп позвоночных животных. // Цитология. 1997. Т.39. № 2. С. 1089 1108.
- Левич А.П. Энтропия как мера структурированности сложных систем // Труды семинара «Время, хаос и математические проблемы». Вып.2. М.: Книжный дом «Университет». 2001. С. 163 — 176.
- Левич А.П., Фурсова П. В. Задачи и теоремы вариационного моделирования в экологии сообществ // Фундаментальная и прикладная математика, 2002, том 8, вып. 4, с. 1035−1045.
- Малышева Д.Н., Вергун А. А., Токарская О. Н. Нуклеотидные последовательности аллельных вариантов микросателлитного локуса Du215 (arm) у партеновида Darevskia armeniaca (Lacertidae). II Генетика, 2007. Т. 43. № 2. С. 170−175.
- Малышева Д.Н., Токарская О. Н., Даниелян Ф. Д., чл-корр. Даревский И. С., чл-корр. Рысков А. П. Обнаружение микросателлитных мутаций у партеногенетических ящериц Darevskia armeniaca. // Доклады Академии Наук.2005. Т. 400(2). С. 265−268.
- Мартиросян И.А., Кан Н.Г., Петросян В. Г. и др. Фингерпринтный анализ вариабельности мини- и микросателлитных повторов ДНК упартеногенетических ящериц Darevskia armeniaca. II Генетика. 2003. Т. 39(2). С. 215−222.
- Патрушев JT. И., Минкевич И. Г. Проблема размеров генома эукариот // Успехи биологической химии, 2007. Т.47. С. 293−370.
- Ризниченко Г. Ю. Лекции по математическим моделям в биологии. // М-Ижевск, Изд. РХД, 2002, 236 с.
- Ризниченко Г. Ю. Математические модели в биофизике и экологии. М. — Иж.: ИКИ. 2003. 184 с.
- Ризниченко Г. Ю. Математическое моделирование // 1999. http://www.library.biophys.msu.ru/MathMod/
- Рис Э., Стернберг М. Введение в молекулярную биологию: от клеток к атомам: Пер. с англ. М.: Мир, 2002. — 142с.
- Рысков А.П. Мультилокусный ДНК-фингерпринтинг в генетико-популяционных исследованиях биоразнообразия // Молекуляр. биология, 1999. Т. 33. № 6. С. 997−1011.
- Симан Н. Нанотехнология и двойная спираль // В мире науки, 2007. № 9. С.23−31.
- Сингер М, Берг П. Гены и Геномы. М.: «Мир». 1998. Т. 2. С. 201 204.
- Сулимова Г. Е. ДНК-маркеры в генетических исследованиях: типы маркеров, их свойства и области применения // Электронный журнал лаб. Сравнительной генетики животных ИОГен им. Н. И. Вавилова РАН, 2004. № 1. (http://lab-cga.ru/articles/Jornal01/Statial.htm).
- Токарская О.Н., Даревский И. С., Мартиросян И. А. Генетическая нестабильность (GATA)n микросателлитных повторов ДНК и соматический мозаицизм у однополых ящериц Darevskia unisexualis II Доклады Академии Наук. 2003. Т. 388. № 6. С. 825−828.
- Токарская О.Н., Кан Н.Г., Петросян В. Г., и др. Вариабельность GATA-микросателлитных ДНК в популяциях партеногенетического вида ящериц Lacerta unisexualis Darevsky. ll Генетика. 2000. Т.36. № 5. С. 693 698.
- Фомин С. В., Беркинблит М. Б. Математические проблемы в биологии. М.: 1973. 200 с.
- Хедрик Ф. Генетика популяций. М.: Техносфера, 2003, — 592с.
- Шноль С.Э. Физико-химические факторы эволюции. М.: Наука, 1979. 201с.
- Aharoni A., Baran N., Manor Н. Characterization of a multi-subunit human protein which selectively binds single stranded d (GA) n and d (GT)n sequence repeats in DNA. // Nucleic Acid Research, 1993. V. 21. P.5221 -5228.
- Anselmi C., Bocchinfuso G., De Santis P., Savino M., Scipioni A. A Theoretical Model for the Prediction of Sequence-Dependent Nucleosome Thermodynamic Stability//Biophysical Journal, 2000. V. 79. P. 601−613.
- Arcot S.S., Wang Z., Weber J.L., Deininger P.L. and Batzer M.A. Alu repeats: a source for the genesis of primate microsatellites. // Genomics, 1995. V.29. P. 136 -144.
- Arribas О J. Phylogeny and relationships of the mountain lizards of Europe and Near
- East (Archaeolacerta Merttens, 1921, Sensu Lato) and their relationships among the i Eurasian Lacertid lizards. // Russian J. Herpetology, 1999. V. 6(1). P. 1−22.
- Badaeva T.N., Malysheva D.N., Korchagin V.I., Ryskov A.P. Genetic variation and de novo mutations in the parthenogenetic Caucasian rock lizard Darevskia unisexualis. // PloS One, 2008. V.3(7): e2730. (http://www.plosone.org/home.action).
- Berger S.L. Histone modifications in transcriptional regulation // Curr. Opin. Genet. Devel., 2002. V. 12. P.142−148.
- Bernardi G. Isochores and the evolutionary genomics of vertebrates.// Gene, 2000. V. 241. P. 3−17.
- Bernardi G. The neoselectionist theory of genome evolution. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2007, V.104. P. 8385−8390.
- Bertoni F., Codegoni A.M., Furlan D., Tibiletti M.G., Capella C., Broggini M. CHK1 frameshift mutations in genetically unstable colorectal and endometrial cancers. // Genes Chromosomes Cancer, 1999. V. 26. P. 176−180.
- Biemont C., Vieira C. Genetics: Junk DNA as an evolutionary force // Nature, 2006. V. 443. P. 521−524.50