Помощь в написании студенческих работ
Антистрессовый сервис

Хемолитоавтотрофия (окисление восстановленных неорганических соединений для получения энергии)

РефератПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Окисление неорганических соединений для получения энергии, сопряженное с построением клеточного материала из С02, свойственно только прокариотам. Такой modus vivendi носит название хемолитоавтотрофии. Процесс хемолитоавтотрофии был открыт в 1887 г. С. Н. Виноградским, работавшим в ту пору в Страсбурге в лаборатории А. де Бари. Исследуя метаболизм бесцветной нитчатой серобактерии из рода… Читать ещё >

Хемолитоавтотрофия (окисление восстановленных неорганических соединений для получения энергии) (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Окисление неорганических соединений для получения энергии, сопряженное с построением клеточного материала из С02, свойственно только прокариотам. Такой modus vivendi носит название хемолитоавтотрофии. Процесс хемолитоавтотрофии был открыт в 1887 г. С. Н. Виноградским, работавшим в ту пору в Страсбурге в лаборатории А. де Бари. Исследуя метаболизм бесцветной нитчатой серобактерии из рода Beggiatoa, растущей на поверхности донных осадков в застойных водоемах, ученый заметил, что клетки росли и размножались, окисляя H2S и откладывая элементарную серу в цитоплазме. При исчерпании сероводорода микроорганизмы окисляли отложенную серу до сульфата. В 1983 г. было показано, что штамм, с которым работал С. Н. Виноградский, требует небольших количеств органических соединений для роста, т. е. является факультативным автотрофом. Значительно позднее из морских местообитаний в зоне «черных курильщиков» были выделены облигатно автотрофные виды Beggiatoa. Там они обеспечивают первичную продукцию органического вещества за счет хемолитоавтогрофии. Также тионовые бактерии участвуют в образовании микробных матов толщиной до 60 см и диаметром до 32 м, где толстые и длинные клетки Beggiatoa служат структурообразующим элементом.

В настоящее время известно значительное число тионовых микроорганизмов, способных окислять восстановленные соединения серы. Эти микроорганизмы принимают участие в глобальном цикле серы. Сероводород образуется в природе повсеместно в процессе аммонификации и по достижении аэробной зоны окисляется тионовыми микроорганизмами. Таким образом, тионовые микроорганизмы являются бактериальным газовым фильтром для H2S, не позволяющим ему попадать в значительных количествах в атмосферу. В районах с вулканической активностью имеются природные выходы серы на поверхности Земли (сольфатары).

Тионовые микроорганизмы являются, в основном, аэробами. Короткий период они могут существовать без кислорода, окисляя сероводород в процессе нитратного дыхания, но при наличии подвижности активно покидают анаэробные местообитания.

Традиционно организмы, окисляющие восстановленные соединения серы, делят на две группы: I группа окисляет сероводород и откладывает элементарную серу в виде капель внутри клеток, а II группа никогда серу внутри клеток не откладывает. К I группе относятся морфологически своеобразные микроорганизмы. Это представители родов Beggiatoa, Thiothrix, Macromonas, Bilophococcus, ThiopIocay Thiospirillopsis, Achromatium, Thiobacterium, Thiospiray Thiovulvum. Только для некоторых представителей четко установлен тип метаболизма, поскольку лишь в первых четырех родах из списка получены чистые культуры. Выделение чистых культур бактерий I группы затруднено из-за присутствия в их слизистых чехлах многочисленных микробов-спутников. В эту группу входят грамотрицательные бесцветные клетки разной морфологии (крупные кокки и овалы, мелкие спирали, нити и длинные палочки), растущие на средах с H2S и откладывающие серу в клетках. Некоторые движутся с помощью скольжения или жгутиков, Achromatium и Thiobactenum — неподвижны. Большинство образует мощные капсулы или чехлы. Они обычно растут на границе аэробной и анаэробной зон (в зоне хемоклина стратифицированных озер) в условиях микроаэрофилии, образуя налет на донных осадках. Оптимальная концентрация кислорода для их роста составляет 0,6—6%. Для тионовых бактерий I группы характерен отрицательный светои аэротаксис, некоторые имеют магнитосомы. Считается, что тионовые бактерии — гетеротрофы или миксотрофы, склонные к олиготрофии. Предельная концентрация органических кислот для роста бесцветных нитчатых серных бактерий — 20 мМ (для ацетата это 1,2 г/л).

II группа тионовых микроорганизмов — это одиночные небольшие палочковидные клетки, относящиеся к наиболее изученным родам Thiobacillus, Acidithiobacillus у Sulfobacillus, а также археи родов Sulfolobus и Acidianus. Они никогда не откладывают элементарную серу в клетках и проводят процесс до образования сульфата. Первые тиобациллы были выделены А. Натансоном в 1902 г., а в 1904 г. М. Бейеринк показал, что Thiobacillus thioparus и Т. thiooxidans (в настоящее время относимая к роду Acidithiobacillus) используют в своем метаболизме сероводород.

Микроорганизмы этих родов различаются по отношению к pH: тиобациллы растут при слабокислых значениях pH, а ацидитиобациллы и сульфобациллы — при pH < 4,0 (до 1,5). Большинство представителей этой группы — мезофилы. Они широко распространены и обитают в почвах, соленых болотах, в зоне термоклина стратифицированных озер, в сольфатарах, там, где на выходе горячих серных источников на поверхности образуются желтые осадки элементарной серы, в сточных водах, в кислых шахтных водах (pH 2,5—1,5). Наличие в щелочных почвах тиобацилл иногда используют для «исправления» pH: в почвы вносят порошок серы, и образующийся при ее окислении SO4- подкисляет почву. При температуре выше 50 °C серу окисляют археи (Sulfolobus, Acidianus) или представители рода Sulfobacillus.

Реакции окисления восстановленных соединений серы характеризуются разными значениями свободной энергии:

Хемолитоавтотрофия (окисление восстановленных неорганических соединений для получения энергии).

Электроны попадают в ЭТИ, тионовых бактерий на уровне цитохромов (рис. 7.35), поэтому для синтеза восстановительных эквивалентов приходится затрачивать энергию для синтеза восстановительных эквивалентов путем обратного переноса электронов.

Использование соединений серы тионовыми микроорганизмами.

Рис. 7.35. Использование соединений серы тионовыми микроорганизмами:

а — схема превращений соединений серы; R-SS — мембрансвязанный полисульфид; АФС — аденозинфосфосульфат; б — организация ЭТЦ некоторых гиобацилл В 1987 г. было показано, что у Desulfovibrio и Desulfobacter может идти реакция диспропорционирования тиосульфата:

Хемолитоавтотрофия (окисление восстановленных неорганических соединений для получения энергии).

Автотрофная ассимиляция С02 у тионовых микроорганизмов происходит через цикл Кальвина. В клетках формируются окруженные простой белковой мембраной карбоксисомы, в которых содержится ключевой фермент этого цикла — рибулозобисфосфаткарбоксилаза-оксигеназа (РубисКО, RubisCO). При переходе к ассимиляции органических веществ карбоксисомы в клетках не обнаруживается.

В том же году установили наличие такой реакции:

Хемолитоавтотрофия (окисление восстановленных неорганических соединений для получения энергии).

Металлокисляющие микроорганизмы — это еще одна группа хемолитоавтотрофов, среди которых наиболее изучены железоокисляющие организмы, окисляющие Fe2+ до Fe3+. Большой вклад в их исследование внесли С. Н. Виноградский и М. Бейеринк.

Такие микроорганизмы легко обнаруживаются в природных водоемах в виде обрастаний нижней части водных растений. Большинство из них растет при средних температурах в аэробных условиях, экстремальные термофилы встречаются только среди архей. При pH < 5,0 Fe2+ стабилен, поэтому в таких природных местообитаниях преимущественно развиваются ацидофильные железоокислители (например, бактерии рода Leptothrix и Acidithiobacillus). Они, как правило, заключены в слизистые чехлы, которые постепенно инкрустируются гидроксидом железа (III). Лишь некоторые представители железоокислителей (например, Galionella ferruginea, выделенная X. Г. Эренбергом в 1836 г.) растут в нейтральных средах. Поскольку при pH = 7,0 в аэробных условиях Fe2+ нестабилен, то галионеллы обитают на выходе подземных ключей, где концентрация кислорода очень низкая. G. ferruginea имеет фасолевидные клетки, прикрепляющиеся к поверхности с помощью слизистой скрученной ножки, инкрустированной Fe (OII)3.

Fe-оксидоредуктаза, содержащая в качестве кофактора рустицианин с ОВП + 680 мВ, передает электроны на цитохром аа3, поэтому ЭТЦ получается короткой с одним пунктом сопряжения. Окисление Fe2+ до Fe3+ дает мало энергии (при pH = 2,0 OBnFe3+/Fe2+ = +650 мВ), и для поддержания роста микроорганизму необходимо переработать большое количество двухвалентного железа. Подсчитано, что для фиксации 48 г С02 требуется окислить 2,8 кг Fe2+. Предполагают, что в природных условиях может происходить процесс одновременного окисления железа и сульфида в составе н ерастворим ых мин ерал о в:

Хемолитоавтотрофия (окисление восстановленных неорганических соединений для получения энергии).

Выделены микроорганизмы, способные окислять другие металлы, например, Мп2+, устойчивый при щелочных pH, до Мп4+. Окисление марганца термодинамически выгодно в интервале pH от 6 до 8, поэтому такие микроорганизмы растут в этом диапазоне кислотности среды. С понижением pH оно становится менее выгодным, а для окисления железа зависимость обратная. Микроорганизмы, способные окислять и железо, и марганец, обладают устойчивым ростом в широком диапазоне значений pH:

Хемолитоавтотрофия (окисление восстановленных неорганических соединений для получения энергии).

Некоторые металлокисляющие микроорганизмы представлены в табл. 7.4.

Таблица 7.4

Микроорганизмы, окисляющие металлы.

Микроорганизм.

Неорганический субстрат.

Форма клеток.

Место обитания.

Бактерии-автотрофы.

Galionella ferruginea

Fc2+

Изогнутые фасолевидные палочки с закругленными концами.

Пресная вода.

Leptospirillum

fenuginea

Fe2+

Изогнутые и спиральные палочки.

Кислые шахтные воды.

Stibiobacter senarmontii

Sb3+

Плейоморфные палочки.

Пресные воды.

A cidithiobacillus fetrooxidans

Fe2+, S°, Se°, U4+

Палочки.

Кислые шахтные воды.

Бактерии-гетеротрофы.

Arthrobacter sp.

Mn2+

Плейоморфные палочки.

Почва.

Окончание табл. 7.4

Микроорганизм.

Неорганический субстрат.

Форма клеток.

Место обитания.

Bacillus megaterium

Se°.

Палочки.

Почва.

Bacillus sp.

Mn2t

Палочки.

Пресные воды.

Citrohacter sp.

Mn2*.

Палочки.

Почва.

Hyphomicrobium sp.

Mn2*.

Почкующиеся палочки.

Пресные и морские воды.

Leptothrix discophora

Fe2+, Mn2*.

Искривленные палочки.

Пресные воды.

Oceanospirillum sp.

Mn2*.

Искривленные и спиральные палочки.

Морские воды.

Pedomicrobium sp.

Mn2*.

Почкующиеся палочки.

Почва.

Pseudomonas sp. S-36.

Mn2*.

Палочки.

Пресные воды.

Vibrio sp.

Mn2*.

Искривленные палочки.

Морские воды.

Археи-автотрофы.

Sulfolobus

addocaldarius

Mn2*, S°, Fc2*.

Лопастные и кокковидные клетки.

Горячие источники.

Среди бактерий к автотрофии за ечет окисления железа способны представители родов Galionella, Leptospirillum, Acidithiobacillus. Последние могут также окислять элементную серу, селен и уран. К автотрофному окислению сурьмы способен Stibiobacter senarmontii. Автотрофный архей Sulfolobus addocaldarius, выделенный из горячего источника, может использовать для получения энергии железо и марганец. Только для Sulfolobus addocaldarius доказана четкая автотрофия при окислении марганца, при этом С02 фиксируется в цикле Кальвина. Гетеротрофные металлоокислители распространены в почве, пресных и морских водоемах. Это представители родов Bacillus, Arthrobacter, Hyphomicrobium, Pedomicrobium, Pseudomonas, Vibrio и др. Бурное развитие железоокисляющих микроорганизмов рода Leptothrix

в водопроводных трубах приводит к их забиванию слизью и губчатой ржавчиной. Для местообитаний с низкой кислотностью среды (pH < 5,0) характерно присутствие Acidithiobacillus thiooxidans и A. ferrooxidans. Недавно установлен факт развития A. ferrooxidans за счет анаэробного дыхания с Fe3+ и S° в качестве конечных акцепторов электронов.

Установлено, что ряд микроорганизмов при окислении металлов не получает энергии, а просто откладывает их оксиды в своих слизистых чехлах. Например, так накапливает оксид марганца Crenothrix manganifera.

Окисление ряда металлов с переменной валентностью (Cu2+, U4+, As3+, Sb3+, Мо4+, Se°, Zn2+, Co2+, Pb2+, Ni2+, Au° и т. д.) показано для некоторых накопительных культур.

Микроорганизмы, способные окислять восстановленные соединения серы и металлы с переменной валентностью, применяют в биогидрометаллургии для получения (выщелачивания) металлов из бедных руд. Обычно используют природные микробные сообщества, содержащие представителей бактериальных родов Acidithiobacillus (A. ferrooxidans и A. thiooxidans), Leptospirillum, Sulfobacillus и архей родов Sulfolobus, Ferroplasma, Metallosphaera, Acidianus. Суспензия микроорганизмов, обогащенная кислородом, закачивается в пласт, либо ею орошают рудные отвалы. Посредством следующих реакций металл переводится в растворенное состояние:

Хемолитоавтотрофия (окисление восстановленных неорганических соединений для получения энергии).

Полученный раствор откачивают из скважины или собирают у подножия кучи, концентрируют и осаждают из него металл. Участвующие в этом процессе микроорганизмы обладают устойчивостью к высоким концентрациям металлов. Микробиологические процессы используют при получении меди, урана, марганца, а также для освобождения олова, серебра и золота из нерастворимых сульфидных минералов, содержащих мышьяк.

Еще одной группой хемолитоавтотрофов являются нитрифицирующие микроорганизмы. Процесс превращения аммиака в нитрат использовался в Европе для получения селитры при изготовлении пороха задолго до того, как стала известна его микробная природа. Земляные валы поливали кровью животных со скотобоен, перекапывали для обогащения кислородом и вносили золу для нейтрализации и как источник калия. Белки крови разлагались под действием почвенных микроорганизмов с выделением аммиака, который окислялся нитрифицирующими бактериями до нитрата. При реакции нитрата с ионами калия образовывался выцвет селитры, который растворяли и выпаривали.

С. Н. Виноградский для выделения чистых культур нитрификаторов предложил метод «отрицательных пластинок»: сильно разведенные сусиензии высевались на агар или силикагель, и те кусочки агара, где не было роста гетеротрофов, переносили на среду с NH В его статье, появившейся в 1890 г., процесс нитрификации описывался как одностадийный (NHJ—> —" NO з). В том же году Дж. и Г. Франкланды опубликовали статью о выделении микроорганизма, который осуществляет реакцию NH J -> N0 2. Стало ясно, что нитрификация идет в две стадии, а супруги Франкланд выделили микроорганизмы I фазы. В 1949 г. С. Н. Виноградский исправил прежнюю статью, признав двустадийность процесса нитрификации (NHJ—> ^NOi->NOi).

Нитрифицирующие микроорганизмы — это грамотрицательные виды, объединенные по способности окислять аммиак, а не филогенетически. Они встречаются в классах Beta-, Gamma- и Epsilonproteobacteria филума Proteobacteria, а также в классе Nitrospira филума Nitrospirae. Названия родов нитрификаторов I фазы обычно начинаются с Nitroso-, а нитрификаторов II фазы — с Nit.ro-. Микроорганизмы I (NH3 —> М02) и II (N02 —" —"N03) стадий нитрификации в природе всегда живут вместе, и токсичный нитрит, образованный бактериями I стадии, быстро потребляется нитрификаторами II фазы и не накапливается выше, чем НГ1 М. Клетки различной формы (палочковидные, изогнутые, спиральные, кокковидные) могут быть подвижными в молодом возрасте, а при старении формируют биопленки. Нитрификаторы имеют в разной степени развитые внутриклеточные разрастания ЦПМ. У Nitrosomonas они параллельны мембране клетки, у Nitrosococcus образуют стопки ламелл, у Nitrosolobus формируют инвагинации.

Для фиксации С02 нитрификаторы используют цикл Кальвина, в котором затрачивается большое количество АТФ и восстановительных эквивалентов. При автотрофном росте в клетках образуются карбоксисомы с РубисКО. Процесс образования карбоксисом для бактерий II фазы более редок, чем для микроорганизмов I фазы. Все нитрификаторы 11 фазы способны также к миксотрофному росту. Некоторые представители рода Nitrobacter могут расти гетеротрофно, используя органические вещества (ацетат, казеин, пируват и т. д.), но преимуществ в росте при этом не получают.

При окислении аммиака и нитрита электроны поступают в ЭТЦ на уровне цитохромов, и энергии запасается мало, так как имеется только один пункт сопряжения (рис. 7.36). На I стадии аммиак проникает в клетки и окисляется монооксигеназой до гидроксиламина: NH3 + V2O2 —> NH2OH. Эта реакция идет с затратой энергии в виде восстановителя. При окислении гидроксиламина периплазматической гидроксиламиноксидоредуктазой образуется нитрит (N112OII + Н20 —> IIN02 + 4Н+ + 4с). При этом электроны переносятся на уровень цитохромов b и с. Гидроксиламиноксидоредуктаза — эго фермент с молекулярной массой ~ 200 кДа, имеющий структуру а3Р3 и находящийся в периплазме. С активностью этого фермента связаны также активности монооксигеназы аммиака и цитохромоксидазы. В то же время клетки на среде с чистым гидроксиламином вырастить не удается (без аммиака гидроксиламин целыми клетками не окисляется).

Схема ЭТЦ окисления субстратов нитрификаторами I фазы.

Рис. 736. Схема ЭТЦ окисления субстратов нитрификаторами I фазы:

МО — монооксигеназа; ГАОР — гидроксиламиноксидоредуктаза Для образования восстановленных пиридиннуклеотидов у нитрификаторов I фазы задействован обратный перенос электронов с затратой энергии. Именно поэтому они растут довольно медленно (время генерации составляет около 24 ч) и накапливают мало биомассы.

II стадия нитрификации приводит к окислению нитрита в нитрат с участием мембрансвязанного фермента нитритоксидоредуктазы: N0 2 + Н20 —".

—" NO3 + 2H+ + 2ё и 2Н+ + 2ё + !2 —" Н20. Подсчитано, что при окислении 14,5 моля NO2 в NO3 образуется 4 • 1()7 клеток Nitrobacter, а время генерации составляет от 10 до 100 ч. Пара нитрит/нитрат имеет ОВП = = +400 мВ, и электроны переносятся на уровень цитохромоксидазы, поэтому в результате генерируется только одна молекула ЛТФ (имеется один пункт сопряжения). Подсчитано, что на образование 1 моля НАДН путем обратного переноса электронов необходимо затратить 5 молей нитрита, а для фиксации 1 г С02 нужно окислить 35 г N02". В то же время установлено, что клетки рода Nitrobacter используют только 2—10% энергии, заключенной в NO^.

Нитрификаторы обычно растут в аэробных (или микроаэрофильных) зонах с нейтральным pH (оптимум pH 7,5) и средними температурами (оптимум 28—30°С). При низком pH (< 5,0) нитрит диспропорционирует на нитрат и оксид азота. Нитрификаторы чувствительны к повышенной концентрации нитрата и кислорода.

В настоящее время доказана способность к нитрификации у архей, объединенных в новый филум Thaumarchaeota и обитающих преимущественно в океанах в аэробных и микроаэрофильных зонах. В конце 2015 г. в журнале «Nature» была опубликована статья об обнаружении бактерий рода Nitrospira, которые осуществляют самостоятельно полную нитрификацию аммония в нитрат, т. е. один микроорганизм проводит обе стадии процесса, названного комаммокс (сотаттох — complete ammonia oxidation). Оказалось, что полная нитрификация — это энергетически выгодный процесс, а комаммокс-бактерии широко распространены в природных местообитаниях. Открытие комаммокс-процесса привело к ревизии схемы глобального цикла азота и к добавлению еще одной «ветви» в его окислительную часть (см. Т. 2, рис. 14.3).

Ранее считали, что нитрификация — это сугубо аэробный процесс. Однако в анаэробных реакторах, осуществляющих очистку стоков от соединений азота, было показано, что аммоний окисляется в присутствии нитрита в соответствии с реакцией 15NH| + 14N02—" l4,15N2T + Н20, наличие которой было доказано с помощью меченых соединений. Процесс получил название анаммокс (апаттох — anaerobic ammonia oxidation). Анаэробное окисление аммония осуществляют особые бактерии-планктомицеты, входящие в филум Planctomycetes. Клетки анаммокс-бактерий имеют кокковидную или нерегулярно изрезанную форму диаметром около 1 мкм. В их клеточной стенке не обнаружено пептидогикана, но имеется S-слой. Клетки анаммокс-планктомицетов разделены на три компартмента, что необычно для прокариот. Под цитоплазматической мембраной лежит область толщиной 31—39 им, не содержащая РНК (парифоплазма) с пока неясными функциями. Под ней находится первая внутренняя мембрана, за которой лежит рибоплазма, типичная бактериальная цитоплазма, содержащая рибосомы, нуклеоид и часто гранулы гликогена. Ниже расположена анаммоксосома, отграниченная прочной непроницаемой двуслойной мембраной и занимающая 50—70% объема клетки. В этой структуре осуществляются катаболические реакции клетки, и она может считаться функциональным аналогом митохондрий эукариот. Мембрана анаммоксосомы для увеличения площади поверхности образует складки, с ней ассоциирована АТФ-аза и цитохромы с. Непроницаемая мембрана не позволяет токсичным интермедиатам анаммокс-процесса проникать в рибоплазму, а также поддерживает протонный градиент. Мембраны анаммокс-бактерий содержат уникальные ладдеральные липиды (от англ, ladder — лестница), состоящие из циклобутановых колец, расположенных в одной плоскости, придающих мембранам прочность и малую проницаемость.

Анаммокс-бактерии являются медленно растущими микроорганизмами (среднее время удвоения в лаборатории составляет 11 сут.). Они обычно существуют в виде сарциноподобных микроколоний, образующих агрегаты. Ни один представитель пока нс получен в виде чистой культуры, описанным анаммокс-планктомицетам присвоен статус Candidatus. В природных местообитаниях анаммокс-бактерии конкурируют с денитрификаторами. При наличии большого количества органических веществ денитрификаторы абсолютно доминируют из-за высокой скорости роста, но по мере исчерпания органического донора начинают преобладать анаммокс-бактерии, являющиеся хемолитотрофами. Недавно показана также функциональная связь анаммокси комаммокс-бактерий и присутствие их в одних и тех же агрегатах в условиях низкого содержания кислорода. Процесс окисления аммиака в анаэробных условиях всегда идет автотрофно.

Некоторые почвенные бактерии и плесневые грибы способны к гетеротрофному окислению аммиака (аммония). В этом случае ионы аммония окисляются до нитрата без запасания энергии. Такой процесс наносит вред сельскому хозяйству, поскольку приводит к вымыванию связанных форм азота из почвы вследствие перевода аммонийного азота в более растворимые нитратные формы.

Группа водородных микроорганизмов, способных к хемолитоавготрофии, окисляет молекулярный водород и ассимилирует С02. Н2 — очень энергоемкий субстрат, дающий до трех молекул АТФ при прохождении электронов по ЭТИ, (рис. 7.37).

ЭТЦ водородных бактерий при росте в автотрофных условиях.

Рис. 7.37. ЭТЦ водородных бактерий при росте в автотрофных условиях.

С этим субстратом работают ферменты гидрогеназы, которые бывают двух типов: поглощающая (у водородокисляющих микроорганизмов) и выделяющая (у микроорганизмов, образующих водород в процессе брожений, фототрофов и т. д.). У аэробных форм конечным акцептором электронов служит кислород. Эти микроорганизмы способны расти на очень простой среде, по сути дела осуществляя постепенную реакцию «гремучего газа». Среди анаэробов водородотрофные микроорганизмы распространены в группах метаногенов, гомоацетогенов, сульфатредукторов и пурпурных бактерий. Некоторые представители водородиспользующих микроорганизмов разных систематических и функциональных групп приведены в табл. 7.5.

Примеры водородных микроорганизмов.

Группа микроорганизмов.

Микроорганизм.

Путь фиксации C02

Автотрофы и миксотрофы.

Alcaligenes eutrophus

Цикл Кальвина.

Aquaspirillum autotrophicum

Arthrobacter sp. 11/x.

Bradyrhizobium japonicum

Paracoccus denitrificans

Mycobacterium gordonae

Hydrogenobacter thermophilus

Цикл Арнона.

Гомоацетогены.

A. woodii

Ацетил-КоА-путь.

Acetogenium kivui

Clostridium aceticum

Метаногены.

Methanobrevibacter

arboriphilus

Methanosarcina barkeri

Сульфатредукторы.

Desulfobacter hydrogenophilus

Desulfobacterium

autotrophicum

Автотрофная ассимиляция углекислого газа у разных групп водородных микроорганизмов происходит различными способами. Метаногены, гомоацетогены и сульфатредукторы фиксируют С02 в ацетил-КоА-пути, у большинства аэробных бактерий обнаружен цикл Кальвина. Аэробные водородные бактерии, как правило, являются факультативными автотрофами, т. е. способны переключаться на потребление органических веществ. Так, Alcaligenes eutrophus может аэробно расти на средах с глюкозой. A. eutrophus обладает цитохромами а, Ь, с, причем высокие концентрации цит с обнаруживаются в периплазме. Этот микроорганизм имеет две плазмиды — большую и маленькую. Установлено, что некоторые компоненты гидрогеназ и ферментов цикла Кальвина закодированы в плазмидах. Этот микроорганизм имеет два типа поглощающей гидрогеиазы — растворимую и мембрансвязанную, содержащие в своем составе Ni2+. Первая поставляет восстановленные пиридиннуклеотиды в цикл Кальвина, вторая восстанавливает НАД+, окисляющийся в ЭТЦ. Регуляция этих ферментов осуществляется по типу репрессии-дерепрессии.

Другая водородная бактерия, облигатный автотроф Hydrogenobacter thermophilus, является типичным градиентным организмом, микроаэрофилом, растущим при 70 °C на среде с соотношением газов Н2: С02: 02, равным 75: 10: 15. При этом он имеет «анаэробный» цикл фиксации С02 (восстановительный ЦТК, модифицированный цикл Арнона). Углекислый газ фиксируется в реакциях карбоксилирования ацетил~КоА, пирувата, сукцинил~КоА и а-кетоглутарата. Модификации цикла Арнона у гидрогенобактера заключаются в том, что отсутствует ферредоксин в ЭТЦ, а пирувати а-кетоглутаратдегидрогеназы не зависят от пиридиннуклеотидов.

Еще одна водородная бактерия, азотфиксирующий микроорганизм Bradyrhizobium japonicum, имеет нитрогеназу, выделяющую Н2. Когда клетки растут в виде бактероидов в клубеньках, они синтезируют цит Р42о, цит с и флавопротеин-цитохромоксидазу, а в чистой культуре — цит а, при этом конечные звенья ЭТЦ разветвлены. При пониженном содержании кислорода (1—2%) наряду с нитрогеназным комплексом экспрессируется гидрогеназа, связанная с мембранами и содержащая Ni2+, и другие ферменты литотрофного метаболизма. Это дает микроорганизму определенное экологическое преимущество, поскольку молекулярный водород, являющийся «отходом» азотфиксации, может быть использован как дополнительный источник энергии.

Водородных бактерий применяют для синтеза микробного белка в качестве кормовой добавки. Молекулярный водород для этого процесса получают электролизом воды с затратой энергии гидроэлектростанций. Водородные микроорганизмы могут использоваться как поглотители углекислоты в замкнутых системах (на подводных лодках, космических кораблях и станциях). Данные микроорганизмы интересны и как источник природных полимеров. Такие вещества, получившие название природных термопластиков (самое известное и распространенное — поли-ргидроксимасляная кислота), синтезируются в качестве запасного продукта до 90% по массе при росте водородных бактерий на глюкозе и могут быть легко разрушены микроорганизмами. Если такое вещество использовать как сополимер при синтезе полиэтилена или полипропилена, широко применяемых в качестве упаковочных материалов, то их разложение в природе будет происходить значительно быстрее.

Карбоксидотрофные микроорганизмы как группа хемолитоавтотрофов похожи по метаболизму на водородных микроорганизмов. Часто эти активности присутствуют у одной культуры. Угарный газ (СО) может служить как акцептором электронов при карбонатном дыхании, так и донором электронов у карбоксидобакгерий. Если микроорганизмы используют СО как донор электронов, то акцептором могут быть: 02, S°, SO2-, NO3, Fe3+, С02.

Угарный газ появляется в природе, в основном, за счет деятельности человека, а также при горении лесов и извержении вулканов. В атмосфере он подвергается фотоокислению до С02.

Некоторые карбоксидотрофные микроорганизмы, входящие в разные аэробные и анаэробные функциональные группы, приведены в табл. 7.6.

Микроорганизмы, использующие в метаболизме СО.

Физиологическая группа.

Микроорганизмы.

Типичные карбоксидотрофы-аэробы.

Acinetobacter sp.

Alcaligenes carboxydus

Arthrobacter sp.

Bacillus schlegelii

Pseudomonas carboxydoflava

P. carboxydovorans

P. gazotropha

Азотфиксаторы.

Streptomyces thermoautotrophicus

Azovorans sp.

Azospirillum lipoferum

Azotobacter sp.

Bradyrhizobium japonicum

Метанотрофы.

Methylomonas methanica

Methylosinus trichosporium

Methylococcus capsulatus

Гомоацегогены.

Acetobacterium woodii

Clostridium formicoaceticum

C. pasteurianum

C. thermoaceticum

Метаногены.

Methanobacterium thermoautotrophicum

Methanosarcina barkeri

Methanobrevibacter arboriphilus

Melhanosaeta soehngenii

Фототрофы.

Rhodocyclus gelatinosa

Rhodospirillum rubrum

Spimlina platensis

Сульфатредукторы.

Desulfobacterium autotrophicum

Desulfotomaculum acetoxydans

Desulfovibrio vulgaris

Каждой функциональной группой микроорганизмов использование угарного газа происходит в соответствии с реакциями:

  • 7СО + 2,502+ Н20 —" (СНО) + 6СО, — для аэробных карбоксидотрофов; СО + 2Н20 —> СН/, + С02 — для метаногенов;
  • 4СО + 2Н20 —> СН3-СООН + 2С02 — для гомоацетогенов;

СО + Н20 —> Н2 + С02 — для фотогрофов и анаэробных хемотрофов;

4СО + H2S04 —> 4С02+ H2S — для сульфатредукторов.

Недавно выделены термофильные водородобразующие анаэробные прокариоты, окисляющие угарный газ по реакции СО + Н20 —> С02+ Н2. Это прямые и изогнутые палочки или нити, имеющие клеточную стенку грамположигельного типа и S-слой (Carboxydothermus hydrogenojоплат, С. restrictus, Carboxydocella thermoautotrophica и др.). Многие из них обладают жгутиковой подвижностью. Они обитают в пресных и морских водоемах при температуре 80—85°С и pH, близком к нейтральному. К этой группе относится и архей рода Thermococcus, выделенный из глубоководного горячего источника. Такие микроорганизмы используют угарный газ в качестве единственного источника углерода и энергии.

Аэробные карбоксидобактерии обладают оксидазными системами, малочувствительными к угарному газу, а у анаэробов оксидазы отсутствуют. Окисление СО кислородом (типичная карбоксидотрофия) происходит, но уравнению.

Хемолитоавтотрофия (окисление восстановленных неорганических соединений для получения энергии).

У аэробных карбоксидотрофов обнаружена Mo-Fe-флавиновая форма фермента СО-дегидрогеназы (обычно НАД+-зависимой) массой 300 кДа, состоящая из грех субъединиц, содержащая молибден и FeS-кластер. Для анаэробных бактерий и архей, окисляющих СО, показана Ni-Fe-форма этого фермента. Иногда гены, кодирующие СО-дегидрогеназу, находятся в плазмидах. Анаэробные прокариоты, имеющие ацетил-КоА-путь, могут окислять угарный газ с помощью СО-дегидрогеназы-ацетил-КоА-синтазы.

Показать весь текст
Заполнить форму текущей работой