Специальных судебных органов в Новгородской республике не существовало. Суд не был отделен от администрации. Все правительственные органы и высшие должностные лица центрального и местного управления участвовали в судопроизводстве. Князь с посадником рассматривали наиболее сложные дела. В качестве судебного органа могли выступать и вече, и боярский совет, и тысяцкий. Судебные дела рассматривали старосты, сотские. Феодально-зависимое население вотчин судилось владельцами. Этим нравом вотчинной юстиции пользовались также монастыри, церкви, духовенство (и прежде всего «владыка»).
Большим своеобразием отличался суд по торговым делам. Эти дела рассматривались тысяцкими вместе со старостами, избираемыми от купечества. Особую роль играл торговый суд при церкви Ивана Предтечи, который решал споры, возникавшие в корпорации иванских купцов. В него входили тысяцкий, представители житьих людей и купцов.
Этот же торговый суд, но с участием посадника рассматривал споры новгородских купцов с иноземными. Суд «Иванского ста» рассматривал дела, связанные с «обмериванием и обвешиванием», касавшиеся всего купечества Новгорода.
Псковская судная грамота упоминала «братчину» — сословный купеческий орган, создававшийся в корпорациях и разбиравший иски по торговым делам.
Большое значение имел суд Новгородского архиепископа. Его важнейшая обязанность — рассмотрение тяжб, но так называемым «совестным» делам: преступления против церкви, религии, семьи, нравственности и т. д. Но поскольку обман и мошенничество в торговых делах новгородцы, считавшие торговлю важнейшей отраслью своей жизни" относили и к преступлениям против морали, Софийский собор был хранителем эталонов мер и весов, а «владыка» имел право следить за их соблюдением. Архиепископу и его наместникам было подсудно духовенство. «Владыка» участвовал и в светском суде, когда речь шла о наиболее опасных преступлениях или о рассмотрении дел в высшей судебной инстанции (суд высшей инстанции происходил в резиденции «владыки», в него входили посадник, князь или княжеский наместник, представители от боярства и житьих людей).
Особенность организации суда в Новгороде — довольно четкое определение подсудности различных судебных органов и понятие о низших и высших судебных инстанциях (имевших право на «пересуд»), а также наличие многочисленных судебных должностных лиц (докладчиков, тиунов, изветчиков, приставов и пр.).
