Функционализация клеток микроорганизмов с использованием полиэлектролитов и наночастиц

Актуальность темы

.

В последние годы развитие практически-ориентированных технологий на стыке биологии, физики, химии, электроники и материаловедения привело к формированию нового взгляда на роль микроорганизмов в создании биоаналитических и биоэлектронных устройств, которые уже в ближайшее время могут из прототипных проектов превратиться в рабочие инструменты биомедицины, экологического мониторинга и вычислительной техники.

Микроорганизмы рассматриваются как перспективный объект исследований в области синтетической биологии и биомиметики, междисциплинарных науках, целями которых являются создание искусственной жизни и биоимитирующих материалов и функциональных устройств, соответственно. Достижения синтетической биологии и биомиметики позволяют конструировать новые, основанные на биологических механизмах и процессах, технологии и устройства, применяемые практически во всех областях хозяйственной деятельности человека. Так, генетически модифицированные микроорганизмы могут быть использованы в качестве элементов биосенсоров (Huang et al., 2008), в масштабном производстве рекомбинантных белков и лекарств, а также в выработке биотоплива (Ro et al., 2006; Atsumi et al., 2009), а такие свойства микробных сообществ как, например, чувство кворума, могут быть использованы в логических устройствах и в микроэлектронике (Silva-Rocha, de Lorenzo, 2008; Danino et al., 2010). В связи с развитием нанотехнологии как междисциплинарной области исследований, возник особый интерес исследователей к работам, в которых осуществляется комбинация функциональных свойств микробных клеток и наноразмерных структур (нанопленок, наночастиц, квантовых точек, нанотрубок и т. д.) (Berry, Saraf, 2005; Sugunan et al., 2007). В результате были получены и описаны гибридные биоимитирующие системы, состоящие из клеток микроорганизмов и наночастиц (Baia et al., 2009). Предполагается, что такие системы могут быть использованы в качестве электронных микроконтактов (Berry et al., 2005), микропроводов (Li et al., 2003) и средств эффективной терапии онкологических заболеваний (Kuo et al., 2008). Кроме того, модификация клеток микроорганизмов позволяет придать им дополнительные функции, не свойственные исходным, не модифицированным клеткам. Например, искусственный магнетотаксис, обусловленный комбинацией магнитных наночастиц и микробных^ клеток, обеспечивает осуществление манипуляций с модифицированными клетками в пространстве с использованием внешнего магнитного поля, что, в итоге, дает возможность создания новых сорбентов и ферментативных комплексов на основе микроорганизмов (Safarik et al., 2007). Кроме того, были разработаны методы упорядоченной иммобилизации клеток на поверхностях биоэлектронных устройств (Berry et al., 2004) и созданы прикрепленные к субстратам биопленки (Eun, Weibel, 2009), имеющие строго определенную геометрическую форму. В ряде последних публикаций наблюдается тенденция к переходу от работы с миллиардами клеток к использованию единичных, индивидуальных клеток микроорганизмов (Song et al., 2005), организованных в виде искусственных многоклеточных кластеров (Gupta et al., 2008; Gupta et al., 2010; Regot et al., 2011). Таким образом, функционализация клеток микроорганизмов, то есть контролируемое придание клеткам новых функциональных возможностей, и создание биоаналитических устройств и упорядоченных многоклеточных кластеров является одним из наиболее перспективных направлений на стыке микробиологии, физической и коллоидной химии, нанотехнологии и биоэлектроники.

В соответствии с вышеизложенным были определены цель и задачи настоящего исследования.

Целью работы стала разработка методологических основ функционализии клеток микроорганизмов с помощью модификации поверхности микробных клеток полимерными нанопленками и функциональными наночастицами различной природы и формирование гибридных биоаналитических систем и упорядоченных многоклеточных кластеров.

Основные задачи исследования:

1. Разработка биосовместимых методов функционализации клеток микроорганизмов при помощи многослойных пленок полиэлектролитов, допированных наночастицами золота, серебра, оксида железа и углеродными нанотрубками.

2. Биоимитирующая микроинкапсуляция клеток микроорганизмов при помощи мезопористых неорганических микрооболочек карбоната кальция.

3. Разработка методов пробоподготовки образцов микроорганизмов для их характеристики при помощи поверхностно-усиленной спектроскопии комбинацинного рассеяния (Рамановской спектроскопии).

4. Определение возможности использования функционализированных клеток микроорганизмов в качестве биорецепторных элементов электрохимических биосенсоров и микрофлюидных аналитических устройств.

5. Оценка эффективности использования функционализированных клеток-биорепортеров в анализе токсичности жидких сред.

6. Конструирование трехмерных многоклеточных кластеров определенной геометрии с использованием функционализированных клеток микроорганизмов и неорганических темплатов.

Научная новизна и значимость работы.

Разработан универсальный метод функционализации клеток микроорганизмов при помощи функциональных наночастиц, включенных в состав многослойных пленок полиэлектролитов, позволяющий сохранить жизнеспособность клеток. Показано сохранение жизнеспособности и ферментативной активности в функционализированных клетках. Установлено, что некоторые аспекты жизнедеятельности и биохимического состава функционализированных клеток могут быть изучены с использованием спектроскопических и электрохимических методов.

Впервые показан феномен образования микрооболочек из карбоната кальция (фатерита) на поверхности клеток микроорганизмов в процессе копреципитации ионов Са2+ и СО32″ в водной среде без утраты жизнеспособности инкапсулированных клеток.

Установлено, что функционализация клеток микроорганизмов при помощи биосовместимых полимер-стабилизированных магнитных наночастиц не оказывает ингибирующего воздействия на генотоксин-обусловленный синтез зеленого флуоресцентного белка в клетках дрожжей Saccharomyces cerevisiae и люциферазы в бактериях Acinetobacter baylyi, а также на процесс фотосинтеза в одноклеточных водорослях Chlorella pyrenoidosa.

Впервые были получены и охарактеризованы стабильные трехмерные многоклеточные кластеры (названные нами цитозомами), представляющие собой гибридные коллоидные микрочастицы, состоящие из живых клеток дрожжей, включенных в микроскопические полиэлектролитные полые капсулы с определенной и контролируемой геометрической структурой. Морфологическое сходство цитозом с некоторыми примитивными колониальными и многоклеточными организмами, а также простота и широкая распространенность в природе частиц, подобных использованным нами темплатам (микрокристаллы и микропузырьки воздуха) дает основание предполагать, что' аналогичный процесс мог иметь место в эволюционном процессе возникновения многоклеточных организмов.

Практическая значимость работы.

Разработан метод иммобилизации широкого спектра наноматериалов на поверхности клеточных стенок микроорганизмов (Патент РФ № 2 377 310). На основе данного метода разработаны электрохимические биосенсоры для определения общей токсичности среды и гербицидов триазинового ряда с использованием функционализированных клеток дрожжей Saccharomyces cerevisiae и одноклеточных водорослей Chlorella pyrenoidosa. Впервые разработана методика пробоподготовки образцов микроорганизмов путем послойной функционализации единичных клеток с помощью полимерных пленок и наночастиц благородных металлов для их идентификации при помощи Рамановской спектроскопии.

Разработана эффективная методика синтеза стабильных гидрофильных биосовместимых наночастиц (средний диаметр 15 нм) оксида железа. С использованием данных наночастиц в качестве модификаторов поверхности клеток были впервые созданы микрофлюидные биоаналитические устройства для анализа генотоксичности (на основе магнитно-модифицированных клеток дрожжей GreenScreen™) и магнитно-модифицированные клетки-биорепортеры для анализа широкого спектра токсикантов (салициловая, кислота, толуол, алканы с различной длиной углеродной цепи) на основе штаммов бактерий Acinetobacter baylyi (заявка на Патент Китайской Народной Республики № ZL201010513790.5).

Разработанная методика контролируемого нанесения клеток на поверхности коллоидных частиц позволит оптимизировать методические подходы в создании биологических микрореакторов, а также в тканевой инженерии.

Материалы диссертации используются в лекционных курсах «Основы бионанотехнологии» и «Философские вопросы в биологии» биолого-почвенного факультета Казанского (Приволжского) федерального университета- «Topics in Physical Chemistry» химического отделения университета г. Халл (University of Hull, United Kingdom) и учебном курсе.

Основы биологической химии" для студентов специальности «Химическая технология пищевых добавок и косметических средств» в Национальном университете «Львівська Політехніка», Львов, Украина.

Основные положения, выносимые на защиту.

1. Разработанный метод функционализации клеток микроорганизмов, основанный на послойном нанесении тонких пленок полиэлектролитов, допированных наночастицами золота, серебра, оксида железа и углеродными нанотрубками, применим для создания новых биоимитирующих систем.

2. Реакция соосаждения ионов СО3″ и Са2+ из растовора в присутствии клеток микроорганизмов приводит к образованию мезопористых неорганических микрооболочек из карбоната кальция на клеточных стенках.

3. Модификация поверхности микробных клеток функциональными наночастицами (наночастицы благородных металлов, оксида железа, углеродные нанотрубки) позволяет осуществлять характеристику микроорганизмов методом поверхностно-усиленной Рамановской спектроскопии и использовать их в качестве биорецепторных элементов в микрофлюидных и электрохимических биоаналитических устройствах.

4. Микроорганизмы и неорганические темплаты, модифицированные при помощи многослойных полиэлектролитных пленок, образуют трехмерные многоклеточные кластеры (цитозомы), воспроизводящие геометрическую форму темплата и являющиеся гипотетической моделью первичных колониальных микроорганизмов.

Апробация работы.

Основные результаты исследований были представлены и обсуждены на ежегодных итоговых научных конференциях Казанского государственного университета (2008;2010 гг.) — II и IV международных конференциях.

Современные достижения бионаноскопии" (Москва, 2008, 2010) — II международной научно-практической конференции «Постгеномная эра в биологии и проблемы биотехнологии» (Казань, 2008) — XII и XIV международных научных молодежных школах «Когерентная оптика и оптическая спектроскопия» (Казань, 2008, 2010) — IV съезде Российского общества биохимиков и молекулярных биологов (Новосибирск, 2008) — всероссийской школе для студентов, аспирантов и молодых ученых.

Нанотехнологии: проблемы и перспективы" (Белгород, 2010, пленарный доклад), 2nd Saint — Petersburg international conference of NanoBioTechnologies.

NanoBio'08″ (С.-Петербург, 2008) — VIII научной конференции научнообразовательного центра КГУ «Материалы и технологии XXI века» (Казань,.

2008) — XIII всероссийской конференции «Структура и динамика молекулярных систем (Казань, 2009) — Annual Materials Research Society Fall.

Meeting (Boston, USA, 2009) — XIII международной конференции «Синтез, исследование свойств, модификация и переработка высокомолекулярных tii соединений — V Кирпичниковские чтения» (Казань, 2009) — 13ш Annual European Symposium «SymBioSE 2009: „Biology: Expansion of Borders“ (Kazan, 2009) — 14th UK Polymer Colloids Forum Annual Meeting (Hull, United Kingdom, 2009) — V Міжнародна конференція» Біологія: від молекули до біосфери" (Харьків, Україна, 2010, пленарный доклад) — 1st International Conference of Young Scientists «Chemistry and Chemical Technology» (Lviv, tin.

Ukraine, 2010, приглашенный доклад) — 14 International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (Groningen, The Netherlands, 2010).

Место выполнения работы и личный вклад соискателя.

Научные положения диссертации и выводы, вытекающие из анализа полученного экспериментального материала базируются на результатах собственных исследований автора. Личный вклад автора состоял в планировании и проведении исследований, анализе, обобщении и интерпретации полученных результатов, их оформлении для публикаций. Экспериментальные данные были получены автором за время работы на кафедрах биохимии и микробиологии Казанского (Приволжского) федерального университета. Эксперименты по характеристике клеток с помощью сканирующей электронной микроскопии и Рамановской микроскопии проведены в лаборатории др-а М. Чулха на кафедре генетики и биоинженерии университета Йедитепе (Yeditepe Universitese, Стамбул, Турция). Исследования по созданию цитозом и синтезу магнитных наночастиц проведены в лаборатории др-а В. Паунова на кафедре химии университета г. Халл (University of Hull, Халл, Великобритания). Исследования по магнитной функционализации и характеристике бактериальный биорепортерных клеток осуществлены в лаборатории экологической микробиологии др-а В. Хуанга в Исследовательском институте Крото университета г. Шеффилд (University of Sheffield, Шеффилд, Великобритания). Автор выражает искреннюю благодарность коллективам названных лабораторий.

Связь работы с научными программами.

Работа выполнялась в соответствии с темами НИР Казанского (Приволжского) федерального университета: «Механизмы регуляции функциональной активности клетки» и «Исследование биомакромолекул, участвующих в регуляции метаболизма животных и растительных клеток. Разработка нанотехнологических методов определения компонентов». Исследования выполнены при поддержке грантов. Правительства Республики Татарстан «Алгарыш» (2006, 2008), Академии наук Республики Татарстан № 14/15 (Г)-2009 и РФФИ № 09−04−5 079−6, а также персональных стипендий университетов г. Халл, Великобритания (2009, 2010), г. Шеффилд, Великобритания (2010) и универститета Йедитепе, Стамбул, Турция (2007, 2008, 2009).

Публикация результатов исследования.

По теме диссертации опубликовано 49 печатных работ, 18 из которых представлены в рецензируемых журналах, рекомендованных ВАК. Получен патент Российской Федерации и подана заявка на патент Китайской Народной Республики. Также опубликованы: глава в учебно-методическом пособии, 4 статьи в сборниках материалов конференций и 24 тезиса докладов научных конференций.

Объем и структура диссертационной работы.

Работа изложена на 340 страницах машинописного текста, содержит 7 таблиц и 133 рисунка. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, четырех глав, где описаны и обсуждены результаты исследований, выводов, списка цитируемой литературы, включающего 400 источников и приложения.

1. Дерябин, Д. Г. Применение природных и рекомбинантных люминисцирующих микроорганизмов для биотестирования минеральных вод / Д. Г. Дерябин, Е. С. Алешина // Прикладная биохимия и микробиология. — 2008. — Т. 44., № 4. — С. 417−421.

2. Дерябин, Д. Г. Влияние солей на свечение биосенсора на основе природного и рекомбинантного штаммов люминесцирующих бактерий /Д.Г. Дерябин, Е. С. Алешина // Прикладная биохимия и микробиология. -2008. -Т. 44, № 3.-С. 324−329.

3. Плакунов, В. К. Персистенция и адаптивный мутагенез в биопленках / В. К. Плакунов, Е. А. Стрелкова, М. В. Журина // Микробиология. 2010. — Т. 79, № 4. — С. 447−458.

4. Понаморева, О. Н. Микробные биосенсоры для определения биологического потребления кислорода / О. Н. Понаморева, В. А. Арляпов, В. А. Алфёров, А. Н. Решетилов // Прикладная биохимия и микробиология. -2011.-Т. 47, № 1.-С. 5−15.

5. Решетилов, А. Н. Микробные, ферментные и иммунные биосенсоры для экологического мониторинга и контроля биотехнологических процессов / А. Н. Решетилов // Прикладная биохимия и микробиология. 2005. -Т. 41, № 5. — С. 504−513.

6. Смирнова, Т.А. Структурно-функциональная характеристика бактериальных биопленок / Т. А. Смирнова, JI.B. Диденко, P.P. Азизбекян, Ю. М. Романова //Микробиология. 2010. — Т. 79, № 4. — С. 435−446.

7. Феофилова, Е. П. Клеточная, стенка грибов: современные представления о составе и биологической функции / Е. П. Феофилова // Микробиология. 2010. — Т. 79, № 6. — С. 723−733.

8. Abbott, A. Cell culture: biology’s new dimension / A. Abbott // Nature 2003. — V. 424. — P. 870−872.

9. Agarwal, M. Conductive paper from lignocellulose wood microfibers coated with a nanocomposite of carbon nanotubes and conductive polymers / M. Agarwal, Q. Xing, B.S. Shim, N. Kotov, K. Varahramyan, Y. Lvov // Nanotechnology- 2009. V. 20. — P. 215 602.

10. Ai, H. Electrostatic layer-by-layer nanoassembly on biological microtemplates / H. Ai, M. Fang, S.A. Jones, Y. Lvov // Platelets. Biomacromolecules 2002. — V. 3. — P. 560−564.

11. Alonso-Lomillo, M.A. Screen-printed biosensors in microbiology: a review / M.A. Alonso-Lomillo, O. Dominguez-Renedo, M.J. Arcos-Martinez // Talanta 2010. V. 82. — P. 1629−1636.

12. Alp, B. Formation of artificial, structured microbial consortia (ASMC) by dielectrophoresis / B. Alp, G.M. Stephens, G.H. Markx // Enzyme Microb. Tech. 2002. — V. 31. — P. 35-^-3.

13. An, Z. Fabrication and characterization of human serum albumin and Ladimyristoylphosphatidic acid microcapsules based on template technique / Z. An, C. Tao, G. Lu, H. Mohwald, S. Zheng, Y. Cui, J. Li // Chem. Mater. 2005 -V. 17(10).- P. 2514−2519.

14. Andersen, J.B. New unstable variants of green fluorescent protein for studies of transient gene expression in bacteria / J.B. Andersen, C. Sternberg, L.K. Poulsen, S.P. Bj0rn, M. Givskov, S. Molin // Appl. Environ. Microb. 1998. — V. 64.-P. 2240−2246.

15. Anzai, J. Construction of multilayer thin-films of enzymes by means of sugar-lectin interactions /J. Anzai, Y. Kobayashi // Langmuir 2000. — V. 16 -P.2851−2856.

16. Applegate, B.M. A chromosomally based tod-lux CDABE whole-cell reporter for benzene, toluene, ethybenzene, and xylene (BTEX) sensing / B.M. Applegate, S.R. Kehrmeyer, G.S. Sayler // Appl. Environ. Microb. 1998. — V. 64. -P. 2730−2735.

17. Arida, A.I. Encapsulation of ketoprofen for controlled drug release / A. I. Arida, M.M. Al-Tabakha // Eur. J. Pharm. Biopharm. 2007. — V. 66. — P. 4854.

18. Aruoja, V. Toxicity of nanoparticles of CuO, ZnO and Ti02 to microalgae Pseudokirchneriella subcapitata / V. Aruoja, H.C. Dubourguiera, K. Kasemetsa, A. Kahrua // Sci. Total. Environ. 2009. — V. 40(7). — P. 1461−1468.

19. Asharani, P.V. Cytotoxicity and genotoxicity of siver nanoparticles in human cells / P.V. Asharani, G.L. Kah Mun, M.P. Hande, S. Valiyaveettil // ACS Nano 2009. — V. 3. — P. 279−290.

20. Atsumi, S. Direct photosynthetic recycling of carbon dioxide to isobutyraldehyde / S. Atsumi, W. Higashide, J. C. Liao // Nat. Biotechnol. 2009. -V. 27.-P. 1177−1180.

21. Audet, P. Two-phase dispersion process for the productionof biopolymer gel beads: effect of various parameters on bead size and', their distribution / P. Audet, C. Lacroix // Process Biochem. 1989. — V. 12. — P. 217 226.

22. AutioK. Detection" of active yeast cells (Saccharomyces cerevisiae) in, frozen dough sections / K. Autio, T. Matilla-Sandholm // Appl. Environ. Microb. -1992.-V. 58.-P. 2153−2157.

23. Baia, B. A novel yeast bio-template route to synthesize Cr203 hollow microspheres / B. Baia, P. Wang, L. Wu, Li. Yang, Z. Chen, // Mater. Chem. Phys. -2009. V. 114.-P. 26−29.

24. Balkundi, S.S. Encapsulation of bacterial spores in nanoorganized polyelectrolyte shells / S.S. Balkundi, N.G. Veerabadran, D.M. Eby, G.R. Johnson, Y.M. Lvov//Langmuir-2009.-V. 25.-P. 14 011−14 016.

25. Baronian, K.H.R. The use of yeast and moulds as sensing elements in biosensors / K. H. R. Baronian // Biosens. Bioelectron. 2004. — V.19. — P.953−962.

26. Baumler, H. Biological cells as templates for hollow microcapsules / H. Baumler, B. Neu, A. Voigt, R. Mitlohner, S. Leporatti, C.Y. Gao, E. Donath, H. Kiesewetter, H. Mohwald, H.J. Meiselman // J. Microencapsul. 2001. — V. 18(3). -P. 385−395.

27. Bechor, O. Recombinant microorganisms as environmental biosensors: pollutants detection by Escherichia coli bearing fabAr. lux fusions / O. Bechor, D.R. Smulski, T.K. Van Dyk, R.A. LaRossa, S. Belkin // J. Biotechnol. 2002. -V. 94.-P. 125−132.

28. Bekyarova, E. Functionalized single-walled carbon nanotubes for carbon fiber-epoxy composites / E. Bekyarova, T. Thostenson, A. Yu, M. E. Itkis, D. Fakhrutdinov, T-W. Chou, R. C. Haddon // J. Phys. Chem. C 2007. — V. lll (48).-P. 17 865−17 871.

29. Belkin, S. Microbial whole-cell sensing systems of environmental pollutants / S. Belkin // Curr. Opin. Microbiol. 2003. — V. 6. — P. 206−212.

30. Belkin, S. Oxidative stress detection with Escherichia coli harboring a katG: hix fusion / S. Belkin, D.R. Smulski, A.C. Vollmer, T.K. Van Dyk, R.A. LaRossa // Appl. Environ. Microb. 1996. — V. 62. — P. 2252−2256.

31. Ben-Yoav, H. A whole cell electrochemical biosensor for water genotoxicity bio-detection / H. Ben-Yoav, A. Biran, R. Pedahzurb, S. Belkin, S. Buchinger, G. Reifferscheid, Y. Shacham-Diamanda // Electrochim. Acta. 2009. -V. 54.-P. 6113−6118.

32. Bergbreiter, D.E. Polyvalent hydrogen-bonding fiinctionalization of ultrathin hyperbranched films on polyethylene and gold / D.E. Bergbreiter, G.L.Tao, J.G. Franchina, L. Sussman // Macromolecules 2001. — V. 34 — P. 30 183 023.

33. Berry, V. Deposition of CTAB-terminated nanorods on bacteria to form highly conducting hybrid systems / V. Berry, A. Gole, S. Kundu, C. J Murphy, R.F. Saraf//J. Am. Chem. Soc.-2005. V.127.-P. 17 600−17 601.

34. Berry, V. Highly selective, electrically conductive monolayer of nanoparticles on live bacteria / V. Berry, S. Rangaswamy, R. F. Saraf // Nano Lett. 2004. — V. 4(5). — P.939 -942.

35. Berry, V. Self-assembly of nanoparticles on live bacterium: an avenue to fabricate electronic devices / V. Berry, R. F. Saraf // Angew. Chem. Int. Edit. — 2005. -V. 44. P. 6668 -6673.

36. Beunink, J. Coupled reductive and oxidative degradation of 4-chloro-2-nitrophenol by a co-immobilized mixed culture system / J. Beunink, H.J. Rehm // Appl. Microbiol. Biotech. 1990. — V. 34. — P. 108−115.

37. Binks, B.P. Emulsions stabilised solely by colloidal particles / B.P. Binks, R. Aveyard, J.H. Clint // Adv. Colloid Interface 2003. — V. 100−102. — P. 503−546.

38. Binks, B.P. Naturally occurring spore particles at planar fluid interfaces and in emulsions / B.P. Binks, J.H. Clint, G. Mackenzie, C. Simcock, C.P. Whitby // Langmuir 2005. — V. 21 — P. 8161−8167.

39. Binks, B.P. Particle-stabilized emulsions: a bilayer or a bridging monolayer / B.P. Binks, T.S. Horozov // Angew. Chem. Int. Edit. 2006. — V. 45. -P. 773−776.

40. Binks, B.P. Particle-stabilised foams: an interfacial study / B.P. Binks, A. Stocco, W. Drenckhan, E. Rio, D. Langevin // Soft Matter 2009. — V. 5. — P. 2215−2222.

41. Biran, A. Bacterial genotoxicity bioreporters / A. Biran, S. Yagur-Kroll, R. Pedahzur, S. Buchinger, G. Reifferscheid, H. Ben-Yoav, Y. Shacham-Diamand, S. Belkin // Microb. Biotechnol. 2010. — V. 3. — P. 412−427.

42. Blodgett, K. B. Monomolecular films of fatty acids on glass / K. B. Blodgett // J. Am. Chem.Soc.- 1934. V.56.-P.495- 513.

43. Blodgett, K. B. Build-up films of barium stearate and their optical properties / K. B. Blodgett, I. Langmuir // Phys. Rev. 1937. — V.51. — P. 964−982.

44. Bottomley, L. A. Impact of nanoand mesoscale particles on the performance of microcantilever-based sensors / L. A. Bottomley, M. A. Poggi, S. Shen // Anal. Ghem. 2004. — V.76 (19). — P. 5685−5689.

45. Brogan, K.L. Optical fiber-basedsensors: application to. chemical biology / K.L. Brogan, D.R. Walt //• Curr. (c)pinChem. Biol. 2005. — V. 9. — P. 494−500.

46. Brooke, N.M. The evolution of multicellularity and" early animal genomes / N.M. Brooke, P.W.H. Holland // Curr. Opin. Genet. Dev. 2003. — V. 13.-P. 599−603.

47. Brynda, E. Characterization of flexibility of ultrathin protein films by optical sensing / E. Brynda, M. Houska, A. Wikerstal, Z. Pientka, J. E. Dyr, A. Brandenburg // Langmuir 2000. — V. 16. — P. 4352−4357.

48. Byfield, M.P. Biochemical aspects of biosensors / M.P. Byfield, R.A. Abuknesha // Biosens. Bioelectron. 1994. — V. 9. — P. 373−399.

49. Caruso, F. Assembly of alternating polyelectrolyte and protein multilayer films for immunosensing / F. Caruso, K. Niikura, N. Furlong, Y. Okahata // Langmuir 1997. — V.13. -P. 3427−3433.

50. Caruso, F. Magnetic nanocomposite particles and hollow spheres constructed by a sequential layering approach / F. Caruso, M. Spasova, A. Susha, M. Giersig, R.A. Caruso // Chem. Mater. 2001. — V. 13(1). — P. 109−116.

51. Caruso, F. Enzyme encapsulation in layer-by-layer engineered polymer multilayer capsules / F. Caruso, D. Trau, H. Mohwald, R. Renneberg // Langmuir -2000. —V.16(4). — P.1485−1488.

52. Cassidy, M.B. Environmental applications of immobilized microbial cells: a review / M.B. Cassidy, H. Lee, J.T. Trevors // J. Ind. Microbiol. Biot. -1996.-V. 16.-P. 79−101.

53. Cayre, O.J. Fabrication of novel colloidosome microcapsules with gelled aqueous cores / O.J. Cayre, — P. F Noble, V.N. Paunov // J. Mater. Chem. -2004.-V. 14.-P. 3351−3355.

54. Chang, R. K. Surface enhanced Raman scattering / R. K. Chang, T. E. Furtak // Plenum Press publishing 1982. — P. 432.

55. Channon, K. Synthetic biology through biomolecular design and engineering / K. Channon, E.H.C. Bromley, D.N. Woolfson // Curr. Opin. Struc. Biol. 2008. — V. 18. — P. 491−498.

56. Chen, H. A novel approach based on ferricyanide-mediator immobilized in an ion-exchangeable biosensing film for the determination of biochemical' oxygen demand / H. Chen, T. Ye, B. Qiu, G. Chen, X. Chen // Anal. Chim. Acta. 2008. — V. 612. — P. 75−82.

57. Chen, L. Bacteria-mediated synthesis of metal carbonate minerals with unusual morphologies and structures / L. Chen, Y. Shen, A. Xie, B. Huang, R. Jia, R. Guo, W. Tang // Cryst. Growth Des. 2009. — V. 9. — P. 743−754.

58. Chen, X. Interfacing carbon nanotubes with living cells / X. Chen, U.C. Tam, J.L. Czlapinski, G.S. Lee, D. Rabuka, A. Zettl, C.R. Bertozzi // J. Am. Chem. Soc. 2006. — V. 128. — P. 6292−6293.

59. Cheng, L. Electrochemical-behavior and electrocatalytic properties of ultrathin films containing silicotungstic heteropolyanion SiW120404 / L. Cheng, S. J. Dong // J. Electrochem. Soc. 2000. — V.147. — P. 606−612.

60. Cheung, J.H. Molecular-level processing of conjugated polymers. Layer-by-layer manipulation of polyaniline via electrostatic interactions / J.H. Cheung, W.B. Stockton, M.F. Rubner // Macromolecules 1997. — V. 30(9). -P.2712−2716.

61. Choi, S.H. A whole cell, bioluminescent biosensor for the detection of membrane-damaging toxicity / S.H. Choi, M.B.Gu // Biotechnol. Bioproc. E. 1999.-V. 4.-P. 59−62.

62. Chong, K.F. Whole cell environmental biosensor on diamond / K.F. Chong, K.P. Loh, K. Ang, Y.P. Ting // Analyst 2008. — V. 133(6). — P. 739−743.

63. Chouteau, C. A bi-enzymatic whole cell conductometric biosensor for heavy metal ions and pesticides detection in water samples / C. Chouteau, S. Dzyadevych, C. Durrieu, J.M. Chovelon // Biosens. Bioelectron. 2005. — V. 21. -P. 273−281.

64. Chouteau, C. Development of novel conductometric biosensors based on immobilised whole cell Chlorella vulgaris microalgae / C. Chouteau, S. Dzyadevych, J. Chovelon, C. Durrieu // Biosens. Bioelectron. 2004. — V. 19. — P. 1089−1096.

65. Chu, L.Y. A molecular-recognition microcapsule for environmental stimuli-responsive controlled release / L.Y. Chu, T. Yamaguchi, S. Nakao // Adv. Mater. 2002. — V.14. — P. 386−389.

66. Colville, K. Effects of poly (L-lysine) substrates on attached Escherichia coli bacteria / K. Colville, N. Tompkins, A.D. Rutenberg, M.H. Jericho // Langmuir 2010. — V. 26. — P. 2639−2644.

67. Correa-Duarte, M.A. Layer-by-layer assembly of multiwall carbon nanotubes on spherical colloids / M.A. Correa-Duarte, A. Kosiorek, W. Kandulski, M. Giersig and L.M. Liz-Marzan // Chem. Mater. 2005 — V. 17(12). — P. 3268 -3272.

68. Cortez, C. Targeting and uptake of multilayered particles to colorectal cancer cells / C. Cortez, E. Tomaskovic-Crook, A.P.R. Johnston, B. Radt, S.H. Cody, A.M. Scott, E.C. Nice, J.K. Heath, F. Caruso // Adv. Mater. -2006. V.18. -P. 1998;2003.

69. Crespilho, F. N. Electrochemistry of layer-by-layer films: a review / F. N. Crespilho, V. Zucolotto, O. N. Oliveira Jr., F. C. Nart // Int. J. Electrochem. Sc. -2006.-V.1.-P. 1194−1214.

70. Culha, M. Characterization of thermophilic bacteria using surface-enhanced raman scattering / M. Culha, A. Adiguzel, M.M. Yazici, M. Kahraman, F. Sahin, M. Gulluce // Appl. Spectrosc. 2008. — V. 62. — P.1226−1232.

71. Dahne, L. Tailor-made polyelectrolyte microcapsules: from multilayers to smart containers / L. Dahne, C.S. Peyratout // Angew. Chem. Int. Edit. 2004. -V. 43.-P. 3762−3783.

72. Dai, Z.F. Highly stable and biocompatible nafion-based capsules permeability for low molecular weight species / Z.F. Dai, H. Mohwald // Chem.-Eur. J. 2002 — V. 8. — P. 4751−4755.

73. Daligault, F. Microalga Chlorella sorokiniana: a new sulfoxidation biocatalyst / F. Daligault, C. Nugier-Chauvin, H. Patin // Org. Biomol. Chem. -2006.-V. 4.-P. 1474−1477.

74. Damosa, F. S. Dissolved oxygen amperometric sensor based on layer-by-layer assembly using host-guest supramolecular interactions / F. S. Damosa, R. C.S. Luza, A. A. Tanakac, L. T. Kubota // Anal. Chim. Acta. 2010. — V. 664. -P.144−150.

75. Danino, T. A synchronized quorum of genetic clocks / T. Danino, O. Mondragon-Palomino, L. Tsimring, J. Hasty // Nature 2010. — V. 463. — P.326−330.

76. Davidov, Y. Improved bacterial SOS promoter: lux fusions for genotoxicity detection / Y. Davidov, R. Rozen, D.R. Smulski, T.K. Van Dyk, A.C. Vollmetr, D.A. Elsmore, R.A. LaRossa, S. Belkin // Mutat. Res.- Gen. Tox. En. -2000.-V. 466.-P. 97−107.

77. Davidson, M.W. Optical microscopy / M.W. Davidson, M. Abramowitz // Molecular expressions: optical microscopy primer. — 1999. 41p.

78. Davis, S.A. Bacterial templating of ordered macrostructures in silica and silica-surfactant mesophases / S.A. Davis, S.L. Burkett, N.H. Mendelson, S. Mann // Nature 1997. — V. 385. — P. 420−423.

79. Decher, G. Fuzzy nanoassemblies: toward1 layered polymeric multicomposites / G. Decher // Science 1997. — V.277. — P. 1232−1237.

80. Decher, G. New nanocomposite films for biosensors: layer-by-layer adsorbed films ofpolyelectrolytes, proteins or DNA / G. Decher, B. Lehr, K. Lowack, Y. Lvov, J. Schmitt // Biosens. Bioelectron. 1994. — V. 9. — P. 677−684.

81. Decher, G. Multilayer thin films / G. Decher, J. B. Schlenoff// Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. 2002. -P. 535.

82. Decher, G. Fine-tuning of the film thickness of ultrathin multilayer composed of consecutively alternating layers of anionic and cationic polyelectrolyte / G. Decher, J. Schmitt // J. Colloid Polym. Sei. 1992. — V.89. -P. 160−164.

83. DeFraia, C.T. A rapid biosensor-based method for quantification of free and glucose-conjugated salicylic acid / C.T. DeFraia, E. A Schmelz, Z. Mou // Plant Methods 2008. — V. 4. — P. 28−39.

84. Desnitski, A.G. On the origins and early evolution of multicellularity / A.G. Desnitski //Biosystems 1993. — V. 29. — P. 129−132.

85. Diaspro, A. Single living cell encapsulation in nano-organized polyelectrolyte shells / A. Diaspro, D. Silvano, S. Krol, O. Cavalleri, A. Gliozzi // Langmuir 2002. — V. 18. — P.5047−5050.

86. Ding, L. Trends in cell-based electrochemical biosensors / L. Ding, D. Du, X. Zhang, H'. Ju // Curr. Med. Chem. 2008. — V. 15. — P. 3160−3170.

87. Dinsmore, A.D. Colloidosomes: selectively permeable capsules composed of colloidal particles / A.D. Dinsmore, M.F. Hsu, M.G. Nikolaides, M. Marquez, A.R. Bausch, D.A. Weitz // Science 2002. — V. 298. — P. 1006−1009.

88. Donath, E. Novel hollow polymer shells by colloid-templated assembly of polyelectrolytes / E. Donath, G. B. Sukhorukov, F. Caruso, S. A. Davis, H. Mohwald // Angew. Chem. Int. Edit. 1998. — V. 37(16). — P: 2202−2205.

89. Dorobantu, L.S. Stabilization of oil-water emulsions by hydrophobic bacteria / L.S. Dorobantu, A.K.C. Yeung, J.M. Foght, M.R. Gray // Appl. Environ. Microb. 2004. — V. 70. — P. 6333−6336.

90. D’Souza, S.F. Microbial biosensors / S.F. D’Souza // Biosens. Bioelectron. — 2001. V. 16.-P. 337−353.

91. Dubas, S.T. Polyelectrolyte multilayers containing a weak polyacidconstruction and deconstruction / S.T. Dubas, Schlenoff // Macromolecules 2001. -V. 34.-P. 3736−3740.

92. Eckle, M. Tuning the performance of layer-by-layer assembled OLEDs by controlling the position of isolating clay barrier sheets / M. Eckle, G. Decher // Nano Lett. 2001. — V. 1. — P.45−49.

93. Efrima, S. Understanding SERS of bacteria / S. Efrima, L. Zeiri // J. Raman Spectrosc. 2009. — V. 40. — P. 277−288.

94. Elasri, M.O. Response of a Pseudomonas aeruginosa biofilm community to DNA-damaging chemical agents / M.O. Elasri, T. Reid, S. Hutchens, R.V. Miller // FEMS Microbiol. Ecol. 2000. — V. 33. — P. 21−25.

95. Elbert, D. Thin polymer layers formed by polyelectrolyte multilayer techniques on biological surfaces / D. Elbert, C. Herbert, J. Hubbell // Langmuir -1999. -V. 15. -P: 5355−5362.

96. El-Sayed, I.H. Surface plasmon resonance scattering and absorption-of anti-EGFR antibody conjugated gold nanoparticles in cancer diagnostics: applications in oral cancer / I.H. El-Sayed, X. Huang, M.A. El-Sayed // Nano Lett. -2005.-V. 5.-P. 829−834.

97. Eun, Y J. Fabrication’of microbial biofilm arrays by geometric control of cell adhesion / Y.J. Eun, D.B. Weibel // Langmuir 2009. — V. 25. — P. 46 434 654.

98. Fahrner, W. R. Nanotechnology and nanoelectronics: materials, devices, measurement techniques / W.R. Fahrner. Springer-Verlag Berlin Heidelberg. — 2005. — P.254.

99. Fakhrullin, R.F. A direct technique for preparation of magnetically functionalised living yeast cells / R.F. Fakhrullin, J. Garcia-Alonso, V.N. Paunov // Soft Matter 2010. — V.6. — P.391 — 397.

100. Fan, X. Bio-inspired, smart, multiscale interfacial materials / X. Fan, J. Lei // Adv. Mater. 2008. — V. 20. — P. 2842−2858.

101. Firkowska, M. O. Highly ordered MWNT-based matrixes: topography at the nanoscale conceived for tissue engineering / M.O. Firkowska, N. Pazos-Perez, J. Rojas-Chapana, M. Giersig, // Langmuir 2006. — V. 22. — P. 5427−5434.

102. Gabier, A.-C. Intracellular physiological events of yeast Rhodotorula glutinis during storage at +4 / A.-C. Gabier, P. Gourdon, J. Reitz, J.-Y. Leveau, M. Bouix // Int. J. Food Microbiol. 2005. — V. 105. — P. 97−109.

103. Galluzzi, L. Intracellular redox equilibrium and growth phase affect the performance of luciferase-based biosensors / L. Galluzzi, M. Karp // J. Biotechnol. -2007. V. 127.-P. 188−198.

104. Gao, X. H. In vivo cancer targeting and imaging with semiconductor quantum dots / X. H. Gao, Y.Y.Cui, R. M. Levenson, L. W. K. Chung & S. M. Nie // Nat. Biotechnol. 2004. — V.22 (8). — P.969−976.

105. Garcia-Alonso, J. A prototype microfluidic chip using fluorescent yeast for detection of toxic compounds / J. Garcia-Alonso, G. Greenway, J. Hardege, S. Haswell // Biosens. Bioelectron. 2009. — V. 24. — P. 1508−1511.

106. Garcia-Alonso, J. Rapid and direct magnetization of GFP-reporter yeast for micro-screening systems / J. Garcia-Alonso, R.F. Fakhrullin, V.N. Paunov // Biosens. Bioelectron. 2010. — V.25. — P.1816−1819.

107. Gautier, C. Label-free detection of DNA hybridization based on EIS investigation of conducting properties of functionalized polythiophene matrix / C. Gautier, C. Cougnon, J.F. Pilard, N. Casse // J. Electroanal. Chem. 2006: — V. 587.-P. 276−283.

108. Giardi, M.T. Photosystem II-based biosensors for the detection of pollutants / M.T. Giardi, M. Koblizek, J. Masojidek // Biosens. Bioelectron. -2001.-V. 16.-P. 1027−1033.

109. Gin, H. Agarose encapsulation of islets of Langerhans: reduced toxicity in vitro / H. Gin, B. Dupuy, C. Baquey, D. Ducassou, J. Aubertin // J. Microencapsul. 1987. — V. 4'. — P. 239−242.

110. Glinel, K. Influence of polyelectrolyte charge density on the formation of multilayers of strong polyelectrolytes at low ionic strength / K. Glinel, A. Moussa, A.M. Jonas, A. Laschewsky // Langmuir 2002. — V.18(4). — P. 14 081 412.

111. Goodman, T.T. Increased nanoparticle penetration in collagenase-treated multicellular spheroids / T.T. Goodman, P.L. Olive, S.H. Pun // Int. J. Nanomed. 2007. — V. 2. — P. 265−274.

112. Graham, D. Control of enhanced Raman scattering using a DNA-based assembly process of dye-coded nanoparticles nature nanotechnology / D. Graham, D.G. Thompson, W.E. Smith, K. Faulds // Nat. Nanotechnol. 2008. — V. 3. -P. 548−551.

113. Green, V.S. Assay for fluorescein diacetate hydrolytic activity: optimization for soil samples / V.S. Green, D.E. Stott, M. Diack // Soil Biol. Biochem. 2006. — V.38. — P.693−701.

114. Griffith, L.G. Capturing complex 3D tissue physiology in vitro / L.G. Griffith, M.A. Swartz // Nat. Rev. Mol. Cell Bio. 2006. — V. 7. — P. 211−224.

115. Gu, M.B. Whole-cell-based biosensors for environmental biomonitoring and application / M.B. Gu, R.J. Mitchell, B.C. Kim // Adv. Biochem. Eng. Biot. 2004. — V. 87. — P. 269−305.

116. Gupta, S. On-chip dielectrophoretic coassembly of live cells and particles into responsive biomaterials / S. Gupta, R.G. Alargova, P.K. Kilpatrick, O.D. Velev // Langmuir 2010. — V, 26. — P. 3441−3452.

117. Gupta, S. On-chip electric field driven assembly of biocomposites from live cells and functionalized particles / S. Gupta, R.G. Alargova, P.K. Kilpatrick, O.D. Velev // Soft Matter 2008. — V. 4. — P. 726−730.

118. Haixia, Y. Carbon nanotube capsules self-assembled by W/O emulsion technique / Y. Haixia, S. Huaihe, C. Xiaohong // Langmuir 2007. — V. 23. — P. 3199−3204.

119. Handley, D.A. Colloidal gold: principles, methods, and applications. -N.Y: Academic press 1989. — 13 lp.

120. Havel, M. Transparent thin films of multiwalled carbon nanotubes self-assembled on polyamide nanofibers / M. Havel, K. Behler, G. Korneva, Y. Gogotsi // Adv. Funct. Mater. 2008. — V. 18. — P. 2322−2327.

121. He, P. Layer-by-layer fabrication and characterization of DNA-wrapped single-walled carbon nanotube particles / P. He, M. Bayachou // Langmuir 2005. — V.21. — P.6086−6092.

122. Hillberg, A. L. Biorecognition through layer-by-layer polyelectrolyte assembly: in-situ hybridization on living cells /A. L. Hillberg, M. Tabrizian // Biomacromolecules 2006. — V.7. — P. 2742−2750.

123. Ho, V.H.B. Generation and manipulation of magnetic multicellular spheroids / V.H.B. Ho, K.H. Muller, A. Barcza, R. Chen, N.K.H. Slater // Biomaterials 2010. — V. 31. — P. 3095−3102.

124. Holz, C. Bacterial motility and clustering guided by microcontact printing / C. Holz, D. Opitz, J. Mehlich, B.J. Ravoo, B. Maier // Nano Lett. 2009. -V. 9.-P. 4553−4557.

125. Hoogeveen, N. G. Formation and stability of multilayers of polyelectrolytes / N. G. Hoogeveen, M. A. C. Stuart, G. Fleer, M. R. Bohmer // Langmuir -1996. V. 12. P. 3675−3 681.

126. Huang, W.E. Characterizing the regulation of the Pu promoter in Acinetobacter baylyi ADP1 / W.E. Huang, A.C. Singer, AJ. Spiers, G.M. Preston, A.S. Whiteley // Environ. Microbiol. 2008. — V. 10. — P. 1668−1680.

127. Hyde, K. Layer-by-layer deposition of polyelectrolyte nanolayers on natural fibres: cotton / K. Hyde, M. Rusa, J. Hinestroza // Nanotechnology 2005. -V. 16.-P. 422−428.

128. Inacker, O. Manipulation in molecular dimensions / O. Inacker, H. Kuhn, D. Mubius, G. Debuch, // J. Phys. Chem. 1976. — V.101. — P.337−360.

129. Ismagilov, R.F. Can we build synthetic, multicellular systems by controlling developmental signaling in space and time? / R.F. Ismagilov, M.M. Maharbiz // Curr. Opin. Chem. Biol. 2007. — V. 11. — P. 604−611.

130. Jain, P.K. Noble metals on the nanoscale: optical and photothermal properties and some applications in imaging, sensing, biology, and medicine / P.K. Jain, H.I., Huang, M.A. El-Sayed-// Acc. Chem. Res. 2008. — V. 41. — P. 15 781 586.

131. Jan, E. Successful differentiation of mouse neural stem cells on layer-by-layer assembled single-walled carbon nanotube composite / E. Jan, N. A. Kotov // Nano Lett. 2007. — V. 7. — P. 1123−1128.

132. Jarvis, R. M. Rapid analysis of microbiological systems using SERS / R. M: Jarvis, A. Brooker, R. Goodacre // Anal. Chem. 2004. — V. 76. — P. 51 985 202.

133. Jarvis, R.M. Rapid discrimination of bacteria using surface enhanced Raman spectroscopy/ R.M. Jarvis, R. Goodacre // Anal. Chem. — 2004: V. 76. -P.40−47.

134. Jarvis, R.M. Surface-enhanced Raman scattering from intracellular and extracellular bacterial locations / R. M. Jarvis, N. Law, I. T. Shadi, P. O'Brien, J. R. Loyd, R. Goodacre // Anal. Chem. 2008. — V.80 (17). — P.6741−6746.

135. Jasonov, P.G. A modernized coercivity spectrometer / P.G. Jasonov, D.K. Nurgaliev, B.V. Burov, F. Heller // Geol. Carpath. 1998. — V. 49. — P. 224 225.

136. Jha, S.K. Entrapment of live microbial cells in electropolymerized polyaniline and their use as urea biosensor / S. K Jha, M. Kanungo, A. Nath, S.F. D’Souza // Biosens. Bioelectron. 2009. -V. 24. — P. 2637−2642.

137. Jing, W. Transmission electron microscopy and atomic force microscopy characterization of nickel deposition on bacterial cells / W. Jing., H. ShiYing, X. LiNa, G. Ning // Chinese Sci. Bull. 2007. — V.52. — P.21−27.

138. Joel, I. Theory of enhanced light scattering from molecules adsorbed at the metal-solution interface /1. Joel, L. Ronald, R. John // Phys. Rev. Lett. 1979. -V.43.-P. 147−150.

139. Johnson, A.P.R. Layer-by-layer ingineered capsules and their applications / A.P.R Johnson, C. Cortez, A.S. Angelatos, F. Caruso // Curr. Opin. Colloid Interface 2006. — V. l 1(4). — P. 203−209.

140. Kahraman, M. Convective assembly of bacteria for surface-enhanced Raman scattering / M. Kahraman, M. M. Yazici, F. Siiahin, M. Culha // Langmuir -2008. V. 24.-P. 894−901.

141. Kahraman, M. Reproducible surface-enhanced Raman scattering spectra of bacteria on aggregated silver nanoparticles / M. Kahraman, M.M. Yazici, F. Siiahin, M. Culha, O.F. Bayrak, // Appl. Spectrosc. 2007. — V. 61. — P. 479−485.

142. Karoubi, G. Single-cell hydrogel encapsulation for enhanced survival of human marrow stromal cells / G. Karoubi, M.L. Ormiston, D.J. Stewart, D.W. Courtman // Biomaterials 2009. — V. 30. — P. 5445−5455.

143. Kayushina, R. Construction and X-ray reflectivity study of self-assembled lysozyme polyions multilayers / R. Kayushina, Y. Lvov, N. Stepina, Y. Khurgin // Thin Solid Films 1996. — V. 284. — P. 246−248.

144. Keane, A. Exposing culprit organic pollutants: A review / A. Keane, P. Phoenix, S. Ghoshal, P.C.K. Lau // J. Microbiol. Meth. 2002. — V. 49. — P. 103 119.

145. Kelm, J.M. Microscale tissue engineering using gravity-enforced cell assembly / J.M. Kelm, M. Fussenegger // Trends Biotechnol. 2004. — V. 22. — P. 195−202.

146. Kim B.-S., Hydrogen-bonding layer-by-layer assembled biodegradable polymeric micelles as drug delivery vehicles from surfaces / B.-S. Kim, S. W. Park, P. T. Hammond // ACS Nano. 2008. — V.2. — P.386−392.

147. Kim, M.N. Construction and comparison of Escherichia coli whole-cell biosensors capable of detecting aromatic compounds / M.N. Kim, H.H. Park, W.K. Lim, H.J. Shin // J. Microbiol. Meth. 2005. — V. 60. — P. 235- 245.

148. King, N. The unicellular ancestry of animal development / N. King // Dev. Cell. 2004. — V. 7. — P. 313−325.

149. Kirk, D.L. A twelve-step program for evolving multicellularity and a division of labor / D.L. Kirk // Bioessays. 2005. — V. 27. — P. 299−310.

150. Klabunde, K. J. Nanoscale materials in chemistry / K. J. Klabunde. -John Wiley & Sons, Inc. 2001.

151. Knaebel, D.B. Immobilization of bacteria in macroand microparticles / D.B. Knaebel, K.E. Stormo, R.L. Crawford // Bioremediation Protocols 1996. -P. 67−78.

152. Knauer, M. Surface-enhanced Raman scattering-based label-free microarray readout for the detection of microorganisms / M. Knauer, N. P. Ivleva, X. Liu, R. Niessner, C. Haisch // Anal. Chem. 2010. — V.82 (7). — P. 2766−2772.

153. Kneipp, J. Optical probing and imaging of live cells using SERS labels / J. Kneipp, H. Kneipp, A. Rajadurai, R.W. Redmond, K. Kneipp // J. Raman Spectrosc. 2009. — V. 40. — P. 1−5.

154. Knight, A.W. A yeast-based cytotoxicity and genotoxicity assay for environmental monitoring using novel portable instrumentation / A.W. Knight, P.O. Keenan, N.J. Goddard, P.R. Fielden, R.M. Walmsley // J. Environ. Monitor. -2004.-V. 6.-P. 71−79.

155. Ko, H. Carbon nanotube arrays encapsulated into freely suspended flexible films / H. Ko, C. Jiang, H. Shulha, V.V. Tsukruk // Chem. Mater. 2005. -V. 17.-P. 2490−2493.

156. KongW. Immobilized bilayer glucose isomerase in porous trimethylamine polystyrene based on molecular deposition / W. Kong, L. Wang, M. Gao, H. Zhou, X. Zhang, W. Li, J. Shen // J. Chem. Soc., Chem. Comm. -1994.-V. 11.-P. 1297−1298.

157. Kotov, N. A Ordered layered assemblies of nanoparticles / N.A. Kotov // MRS Bull. 2001. — V. 26 (12). — P.992−997.

158. Kroger, S. Biosensors for marine applications We all need the sea, but does the sea need biosensors / S. Kroger, R.J. Law // Biosens. Bioelectron. 2005. -V. 20.-P. 1903;1913.

159. Krol, S. Encapsulated yeast cells inside Paramecium primaurelia a model system for protection capability of polyelectrolyte shells / S. Krol, O. Cavalleri, P. Ramoino, A. Gliozzi, A. Diaspro // J. Microscopy. 2003. — V. 212. -P. 239−243.

160. Krol, S. Encapsulated living cells on microstructured surfaces / S. Krol, M. Nolte, A. Diaspro, D. Mazza, R. Magrassi, A. Gliozzi, A. Fery // Langmuir -2005. V. 21. — P.705−709.

161. Kuang, Y. Living bacterial cell array for genotoxin monitoring / Y. Kuang, I. Biran, D.R. Walt // Anal. Chem. 2004. — V. 76. — P. 6282−6286.

162. Kuhn, H. Systeme aus monomolekularen schichtenZusammenbau und chemisches verhalten / H. Kuhn, D. Mubius // Angew. Chem. Int. Edit. 1971. -V.83. — P.672−690.

163. Kuo, W.S. Biocompatible bacteria@Au composites for application in the photothermal destruction of cancer cells /W.S. Kuo, C.M. Wu, Z.S. Yang, S.Y. Chen, C.Y. Chen, C.C. Huang, W.M. Li, C.K. Sun, C.S. Yeh // Chem. Commun. -2008. V. 37. — P. 4430−4432.

164. Kurth, D.G. Ultrathin composite films incorporating the nanoporous isopolyoxomolybdate keplerate (NH4)(42)(Moi320372(Ch3Coo) (30)(H20)(72)) / D.G. Kurth, D. Volkmer, M. Ruttorf, B. Richter, A. Muller// Chem. Mater. 2000. -V. 12.-P. 2829−2834.

165. Lange, S.A. Microcontact printing of DNA molecules / S.A. Lange, V. Benes, D.P. Kern, J.K. Heinrich Horber, A. Bernard // Anal. Chem. 2004. — V. 76.-P. 1641−1647.

166. Laucks, M.L. Comparison of psychro-active arctic marine bacteria and common mesophillic bacteria using surface-enhanced Raman spectroscopy / M.L. Laucks, A. Sengupta, K. Junge, E.J. Davis, B.D. Swanson // Appl. Spectrosc. -2005. -V. 59. P. 1222−1228.

167. Layton, A.C. Construction of a bioluminescent reporter strain to detect polychlorinated biphenyls / A.C. Layton, M. Muccini, M.M. Ghosh, G.S. Sayler // Appl. Environ. Microb. 1998. — V. 64. — P. 5023−5026.

168. Lebedeva, O.V. Mechanical properties of polyelectrolyte-filled multilayer microcapsules studied by atomic force and confocal microscopy / O.V. Lebedeva, B.S. Kim, O.I. Vinogradova // Langmuir 2004. — V. 20(24). -P.10 685−10 690.

169. Lee C.-W. Study of gold nanoparticles and live cells interactions by using planar evanescent wave excitation / C.-W. Lee, E.-H. Lin, J.-Y. Cheng // J. Biomed. Opt. 2009. — V. 14. — P. 1−6.

170. Lee, J.H. A cell array biosensor for environmental toxicity analysis / J.H. Lee, R.J. Mitchell, B.C. Kim, D.C. Cullen, M.B. Gu // Biosens. Bioelectron. -2005.-V. 21.-P. 500−507.

171. Lee, J.H. Chemical-specific continuous biomonitoring using a recombinant bioluminescent bacterium DNT5 (nagR-nagAa: :luxCDABE) / J.H. Lee, R.J. Mitchell, M.B. Gu // J. Biotechnol. 2007. — V. 131. — P. 330−334.

172. Lee, K.T. Synthesis of tin-encapsulated spherical hollow carbon for anode material in lithium secondary batteries / K.T. Lee, Y.S. Jung, S.M. Oh // J. Am. Chem. Soc. 2003. — V. 125. — P. 5652−5653.

173. Lee, M.-J. Electrical manipulation of nanofilaments in transition-metal oxides for resistance-based memory/ M.-J. Lee, S. Han, S. H. Jeon // Nano Lett. -2009. -V.9 (4). -P.1476−1481.

174. Lee, P. C Adsorption and surface-enhanced Raman of silver and gold sols / P. C Lee, D. Meisel // J. Phys. Chem. 1982. — V.86. — P.3391−3395.

175. Lee, S.T. Biodegradation of pyridine by freely suspended and immobilized Pimelobacter sp / S.T. Lee, S.K. Rhee, G.M. Lee // Appl. Microbiol. Biot. 1994. -V. 41. — P. 652−657.

176. Leenen, E.J.T.M. Characteristics of and selection criteria for support materials for cell immobilization in wastewater treatment / E.J.T.M. Leenen, V.A.P. Dos Santos, K.C.F. Grolle, J. Tramper, R.H.Wijffels // Water Res. 1996. -V.30.-P. 2985−2996.

177. Leor, J. Cells, scaffolds, and molecules for myocardial tissue engineering / J. Leor, Y. Amsalem, S. Cohen // Pharmacotherapy 2005. -V. 105. -P. 151−163.

178. Lewinski, N. Cytotoxicity of nanoparticles / N. Lewinski, V. Colvin, R. Drezek // Small 2008. — V.4. — P. 26- 49.

179. Li, C. Controlling the growth behaviour of multilayered films via layer-by-layer assembly with multiple interactions / C. Li, J. Zhang, S. Yang, B.-L. Li, Y.-Y. Li, X.-Z. Zhang R.-X. Zhuo // ChemPhysChem 2009. — V. 11. — P. 88 358 840.

180. Li, J. An electrochemical immunosensor for carcinoembryonic antigen enhanced by self-assembled nanogold coatings on magnetic particles / J. Li, H. Gao, Z. Chen, X. Wei, C. F. Yang // Anal. Chim. Acta. 2010. — V. 665. — P. 98 104.

181. Li, Z. Living templates for the hierarchical assembly of gold nanoparticles / Z. Li, S.W. Chung, J.M. Nam, D.S. Ginger, C.A. Mirkin // Angew. Chem. Int. Edit. 2003: — V. 42. — P. 2306−2309.

182. Li, Z.Q. One-step solution-based catalytic route to fabricate novel a-Mn02 hierarchical structures on a large scale / Z.Q. Li, Y. Ding, Y.J. Xiong, Q. Yang, Y. Xie // Chem. Commun. 2005. — V. 7. — P. 918−920.

183. Li, J. Amplifying the electrical hybridization signals of DNA array by multilayer assembly of Au nanoparticle probes / J. Li, M. Xue, H. Wang, L. Cheng, L. Gao, Z. Lu, M. Chan // Analyst 2003. — V. 128. — P. 917−923.

184. Lian B. Carbonate biomineralization induced by soil bacterium Bacillus megaterium / B. Lian, Q. Hu, J. Chen, J. Ji, H.H. Tengon // Geochim. Cosmochim. Ac. 2006. — V. 70. — P. 5522−5535.

185. Lin, R.Z. Recent advances in three-dimensional multicellular spheroid culture for biomedical research / R.Z. Lin, H.Y. Chang // Biotechnol. J. 2008. -Y.3.-P. 1172−1184.

186. Little, A.E.F. Rules of engagement: interspecies interactions that regulate microbial communities / A. E. F. Little, C. J. Robinson, S. B. Peterson, K. F. Raffa, J. Handelsman // Annu Rev. Microbiol. 2008. — V. 62. — P. 375−401.

187. Liu, C. Direct toxicity assessment of toxic chemicals with electrochemical method / C. Liu, T. Sun, X. Xu, S. Dong, //Anal. Chim. Acta. -2009.-V. 641.-P. 59−63.

188. Liu, Z. Carbon nanotubes in biology and medicine: in vitro and in vivo detection, imaging and drug delivery / Z. Liu, S. Tabakman, K. Welsher, H. Dai // Nano Res. 2009. — V. 2. — P. 85−120.

189. Liu, Z.-Y. Synthesis of gold nanoparticles on the cell wall of Bacillus megatherium / Z.-Y. Liu, J.-M. Wu, B.-Q. Fu, R. Xue, J.-Z. Zhou, Q.-X. Zheng, Y.-Y. Liu, J.-K. Fu // Acta Chim. Sin. 2004. — V. 62. — 1829−1834.

190. Liu, K. Self-assembly of inorganic nanorods/ K. Liu, N. Zhao, E. Kumacheva // Chem. Soc. Rev. 2011. — V. 40. — P. 656−671.

191. Lohe, M. R. Heating and separation using nanomagnet-functionalized metal-organic frameworks / M. R. Lohe, K. Gedrich, T. Freudenberg, E. Kockrick, T. Dellmann, S. KaskeM Chem. Commun. -2011. -DOI: 10.1039/c0cc05278g.

192. Lowe, C.R. Handbook of biosensors and biochips / C.R. Lowe, R. S. Marks, D. C. Cullen, I. Karube, H.H. Weetall Wiley, Chichester, — 2007. — V. 1. -P. 7−22.

193. Lu, Z., Effects of the concentration of tetramethylammonium hydroxide peptizer on the synthesis of Fe3CVSiC)2 core/shell nanoparticles / Z. Lu, G. Wang, J. Zhuang, W. Yang // Colloid Surface A. 2006. — V. 278. P.140−143.

194. Luckarift, H.R. Enzyme immobilization in a biomimetic silica support / H.R. Luckarift, J.C. Spain, R.R. Naik, M.O. Stone // Nat. Biotechnol. 2004. — V. 22.-P. 211−213.

195. Luo, D. Cell encapsules with tunable transport and mechanical properties / D. Luo, S. R. Pullela, M. Marquez, Z. Cheng // Biomicrofluidics — 2007. V.l. — P. 34 102 — 34 106.

196. Luo, L. Fabrication of layer-by-layer deposited multilayer films containing DNA and its interaction with methyl green / L. Luo, J. Liu, Z. Wang, X. Yang, S. Dong, E. Wang, // Biophys. Chem. 2001. — V.94. — P. 11−22.

197. Lvov, Y. Assembly of multicomponent protein films by means of electrostatic layer-by-layer adsorption / Y. Lvov, K. Ariga, I. Ichinose, T. Kunitake // J. Am. Chem. Soc. 1995. — V. 117. — P. 6117−6123.

198. Lvov, Y. Layer-by-layer assembly of alternate protein-polyion ultrathin films / Y. Lvov K. Ariga, T. Kunitake // Chem. Lett. 1994. — P: 2323−2326.

199. Lvov, Y. Assembly, structural characterization and thermal behavior of layer-by-layer deposited ultrathin films of polyvinylsulfonate and polyallylamine / Y. Lvov, G. Decher, H. Mohwald // Langmuir. 1993. — V. 9. — V. 481−486.

200. Lvov, Y. Assembly of thin films by means of successive deposition of alternate layers of DNA and poly (allylamine) / Y. Lvov, G. Decher, G. Sukhorukov // Macromolecules 1993. — V. 26. — P. 5396−5399.

201. Lvov, Y. Protein architecture: assembly of ordered films by means of alternated adsorption of oppositely charged macromolecules / Y. Lvov, G.B. Sukhorukov//Membr. Cell Biol.-1997.-V. 11.-P. 277−303.

202. Ma, H. A novel electrochemical DNA biosensor fabricated with layer-by-layer covalent attachment of multiwalled carbon, nanotubes and gold nanoparticles / H. Ma, L. Zhang, Y. Pan, K. Zhang, Y. Zhang // Electroanalysis2008. V.20. — P.1220−1226.

203. Maheshwari, V. Ion mediated monolayer deposition of gold nanoparticles on microorganisms: discrimination by age / V. Maheshwari, E. Fomenko, G. Singh, R. F. Saraf// Langmuir 2010. — V. 26. — V. 371−377.

204. Manna, U. Layer-by-layer self assembly of modified hyaloronic acid/chitosan based on hydrogen bonding / U. Manna, S. Bharani, S. Patil // Biomacromolecules 2009. — V.10. — P. 2632−2639.

205. Mantzila, A.G. Development of a faradic impedimetric immunosensor for the detection of Salmonella typhimurium in milk / A.G. Mantzila, V. Maipa, M.I. Prodromidis // Anal. Chem. 2008. — V. 80. — P. 1169−1175.

206. Maraha, N. Monitoring physiological status of GFP-tagged Pseudomonas fluorescens SBW25 under different nutrient conditions and in soil by flow cytometry / N. Maraha, A. Backman, J.K. Jansson // FEMS Microbiol. Ecol. -2004.-V. 51.-V. 123−132.

207. Marinova, K.G. Charging of oil-water interfaces due to spontaneous adsorption of hydroxyl ions / K.G. Marinova, R.G. Alargova, N.D. Denkov, O.D. Velev, D.N. Petsev, I.B. Ivanov, R.P. Borwankar // Langmuir 1996. — V. 12. — P. 2045;2051.

208. Mathews, C.K. Biochemistry / C.K. Mathews, K.E. van Holde, K.G. Ahern San Francisco: Addison-Wesley. — 1999. -305 p.

209. Mbeunkui, F. Bioavailable nitrate detection in water by an immobilized luminescent cyanobacterial reporter strain / F. Mbeunkui, C. Richaud, A.L. Etienne, R.D. Schmid, T.T. Bachmann // Appl. Microbiol. Biot. 2002. — V. 60. -P. 306−312.

210. Mercier-Bonin, M. Study of bioadhesion on a flat plate with a yeast/glass model system / M. Mercier-Bonin, K. Ouazzani, P. Schmitz, S. Lorthois // J. Colloid. Interface Sci. 2004. — V. 271, — P. 342−350.

211. Michod, R. E. Life-history evolution and the origin of multicellularity / R.E. Michod, Y. Viossat, C.A. Solari, M. Hurand, A.M. Nedelcu // J. Theor. Biol. 2006. — V. 239. — P. 257−272.

212. Mironov, V Organ printing: tissue spheroids as building blocks / V. Mironov, R.P. Visconti, V. Kasyanov, G. Forgacs, C.J. Drake, R.R. Markwald // Biomaterials 2009 — V. 30, № 12. — P. 2164−2174.

213. Miura, N. Cytotoxic effect and apoptosis induction by silver nanoparticles in HeLa cells / N. Miura, Y. Shinohara // Biochem. Bioph. Res. Co. -2009. V. 390. — P. 733−737.

214. Morita, R.Y. Calcite precipitation by marine bacteria / R.Y. Morita // Geomicrobiol. J. 1980. — V. 2. — P. 63−82.

215. Morris, K. Ferricyanide mediated biochemical oxygen demanddevelopment of a rapid biochemical oxygen demand assay / K. Morris, K. Catterall, H. Zhao, N. Pasco, R. John // Anal. Chim. Acta 2001. — V. 442. — P. 129−139.

216. Moslemy, P. Production of size-controlled gellan gum microbeads encapsulating gasoline-degrading bacteria / P. Moslemy, S.R. Guiot, RJ. Neufeld // Enzyme Microb.Tech. 2002. — V. 30. — P. 10−18.

217. Moya, S. Polyelectrolyte multilayer capsules templated on biological cells: core oxidation influences layer chemistry / S. Moya, L. Dahne, A. Voigt, S. Leporatti, E. Donath, H. Mohwald // Colloid Surface A 2001. — V. 183−185. — P. 27−40.

218. Mohwald, H. From Langmuir monolayers to nanocapsules / H. Mohwald // Colloid Surface A 2000. — V. 171 (1−3). — P. 25−31.

219. Mueller, R. Melting of PDADMAC/PSS capsules investigated with AFM force spectroscopy / R. Mueller, K. Kohler, R. Weinkamer, G. Sukhorukov, A. Fery //Macromolecules — 2005. — V. 38(23).-P. 9766−9771.

220. Mugweru, A. Voltammetric sensor for oxidized DNA using ultrathin films of osmium and ruthenium metallopolymers / A. Mugweru, B. Wang, J. Rusling // Anal. Chem. 2004. — V.76. — P.5557−5563.

221. Munoz, L. Paradoxial changes in the expression of estrogen receptor alpha in breast cancer multicellular spheroids / L. Munoz, M. Espinosa, V. Quintanar-Jurado, A. Hidalgo, J. Melendez-Zajgla, V, Maldonado 11 Tissue Cell -2010.-V. 42.-P. 334−337.

222. Murray, C. B. Synthesis and characterization of monodisperse nanocrystals and close-packed nanociystal assembles / C. B. Murray, C. R. Kagan, M. G. Bawendi // Ann. Rev. Mat. Sci. 2000. — V. 30 (1). — P.545−610.

223. Naessens, M. Fiber optic biosensor using Chlorella vulgaris for determination of toxic compounds / M. Naessens, J.C. Leclerc, C. Tran-Minh // Ecotox. Environ. Safe. 2000. — V. 46. — P. 181−185.

224. Naessens, M. Whole-cell biosensor for direct determination of solvent vapours / M. Naessens, C. Tran-Minh // Biosens. Bioelectron. 1998. — V. 39. — P. 341−346.

225. Nassif, N. Living bacteria in silica gels / N. Nassif, O. Bouvet, M.N. Rager, C. Roux, T. Coradin, J. Livage // Nat. Mater. 2002. — V. 1. — P. 42−44.

226. Naumann, D. The characterization of microorganisms by Fourier transorm infrared spectroscopy (FT-IR) / D Naumann, D. Helm, H. Labischinski, P. Giesbrecht // Modern Techniques for Rapid Microbiological Analysis. — 1991. — P.133−141.

227. Nguyen-Ngoc, H. Fluorescent biosensor using whole cells in an inorganic translucent matrix / H. Nguyen-Ngoc, C. Tran-Minh // Anal. Chim. Acta. -2007. — V. 583.-P. 161- 165.

228. Nguyen-Ngoc, H. Sol-gel process for vegetal cell encapsulation / H. Nguyen-Ngoc, C. Tran-Minh // Mater. Sci Eng.C. 2007. — V. 27. — P. 607−611.

229. Nie, Z. Patterning surfaces with functional polymers / Z. Nie, E. Kumacheva // Nat. Mater. 2008. — V. 7. — P. 277−290.

230. Nir, R. Single-cell entrapment and microcolony development within uniform microspheres amenable to flow cytometry / R. Nir, R. Lamed, L. Gueta, E. Sahar// Appl. Environ. Microb. 1990. -V. 56. — P. 2870−2875.

231. Nolte, M. Coupling of individual polyelectrolyte capsules onto patterned substrates / M. Nolte, A. Feiy // Langmuir 2004. — V. 20(8). — P. 29 952 998.

232. Nomura, T. Fabrication of silica hollow particles using Escherichia coli as a template / T. Nomura, Y. Morimoto, H. Tokumoto, Y. Konishi // Mater. Lett. 2008. — V.62. — P. 3727−3729.

233. Novitsky, J.A. Calcium carbonate precipitation by marine bacteria / J.A. Novitsky // Geomicrobiol. J. 1981. — V. 21 — P. 375−388.

234. O’Connor, K. M. The alchemical creation of life (takwin) and other concepts of Genesis in medieval Islam / K.M. O’Connor // PhD Thesis submitted at University of Pennsylvania, 1994.

235. Oh, B.K. Surface plasmon resonance immunosensor for the detection of Salmonella typhimurium / B.K. Oh, Y.K. Kim, K.W. Park, W.H. Lee, J.W. Choi // Biosens. Bioelectron. -2004. V.19. -P. 1497−1504.

236. Onda, M. Sequential reactions by glucose oxidase/peroxidase molecular films assembled by layer-by-layer alternate adsorption / M. Onda, Y. Lvov, K. Ariga, T. Kunitake // Biotechnol.Bioeng. 1996. — V.51. — P. 163−166.

237. Onda, M. Sequential reaction and product separation on molecular films of glucoamylase and glucose oxidase assembled on an ultrafilter / M. Onda, Y. Lvov, K. Ariga, T. Kunitake // J. Ferment. Bioengin. 1997. — V.82. — P.502−506.

238. Otto, A. Investigations of electrode surfaces in acetonitrile solutions using surface-enhanced Raman spectroscopy / A. Otto Light Scattering in Solids. -V. 4.-P. 289.

239. Palath, N. Polypeptide multilayer nanofilm artificial red blood cells / N. Palath, S. Bhad, R. Montazeri, C. A. Guidry, D. T. Haynie // J. Biomed. Matter. Res.: Appl. Biomat. -2006. V. 81. — P. 261−268.

240. Paloniemi, H. Layer-by-layer electrostatic self-assembly of single-wall carbon nanotube poly electrolytes / H. Paloniemi, M. Lukkarinen, T. Aaritalo, S. Areva, J. Leiro, M. Heinonen, K. Haapakka, J. Lukkari // Langmuir 2006. — V. 22:-P. 74−83.

241. Pampaloni, F. The third dimension bridges the gap between cell culture and live tissue / F. Pampaloni, E.G. Reynaud, E.H. Stelzer // Nat. Rev. Mol. Cell Bio. -2007. -V. 8. P. 839−845.

242. Pandard, P. Comparison of twotypes of sensors using eukaryotic algae to monitor pollution of aquatic systems / P. Pandard, P. Vasseur, D.M. Rawson // Water Res. 1993. — V. 27. — P. 427−431.

243. Panhuis, M. Assembling carbon nanotubosomes using an* emulsioninversion technique / M. Panhuis, V.N. Paunov // Chem. Commun. 2005. — V. 13.-P. 1726−1728.

244. Park, J.-H. Biodegradable luminescent porous silicon nanoparticles for in vivo applications / J.-H. Park, L. Gu, G. Maltzahn, E. Ruoslahti, S. N. Bhatia, M. J. Sailor // Nat. Mater. 2009. — V. 8. — 331−336.

245. Park, M.K. Sustained release control via photo-cross-linking of polyelectrolyte layer-by-layer hollow capsules / M.K. Park, S. Deng, R.C. Advincula // Langmuir 2005. — V. 21(12). — P. 5272−5277.

246. Paquet, C. Nanostructured polymers for photonics / C. Paquet, E. Kumacheva // Materials Today 2008. — V. 11. — P. 48−56.

247. Pasztaleniec, A. Pediastrum species (Hydrodictyaceae, Sphaeropleales) in phytoplankton of Sumin Lake (L^czna-Wlodawa Lakeland) / A. Pasztaleniec, M. Poniewozik // Act. Soc. Bot. Pol. 2004. — V. 73. — P. 39−46.

248. Paunov, V. N. Fabrication of carbon nanotube-based microcapsules by colloid templating technique / V. N. Paunov, M. Panhuis // Nanotechnology -2005.-V. 16. -P.1522−1525.

249. Pei, R. Assembly of alternating polycation and DNA multilayer films by electrostatic layer-by-layer adsorption / R. Pei, X. Cui, X. Yang, E. Wang // Biomacromolecules 2001. — V.2. — P.463−468.

250. Peinado, R. Yeast biocapsules: a new immobilization method and their applications / R. Peinado, J. Moreno, J. Villalba, J. Gonzalez-Reyes, J. Ortega, J. Mauricio // Enzyme Microb. Tech. 2006. — V. 40. — P. 79−84.

251. Pellinen, T. Detection of traces of tetracyclines from fish with a bioluminescentsensor strain incorporating bacterial luciferase reporter genes / T. Pellinen, G. Bylund, M. Virta, A. Niemi, M. Karp // J. Agr. Food Chem. 2002. -V. 50.-P. 4812−4815.

252. Pissuwan, D. Functionalised gold nanoparticles for controlling pathogenic bacteria / D. Pissuwan, C.H. Cortie, S.M. Valenzuela, M.B. Cortie // Trends Biotechnol. 2010. — V. 28. — P. 207−213.

253. Plomp, M. Mapping of proteomic composition onthesurfaces of Bacillus spores by atomic force microscopy-based immunolabeling / M. Plomp, A.J. Malkin // Langmuir 2009. — V. 25. — P. 403−409.

254. Podola, B. Selective real-time herbicide monitoring by an array chip biosensor employing diverse microalgae / B. Podola, M. Melkonian // J. Appl. Phyc.-2005. —V. 17. -P.261−271.

255. Podola, B. The use of multiple-strain algal sensor chips for the detection and identification of volatile organic compounds / B. Podola, E.C.M. Nowack, M. Melkonian // Biosens. Bioelectron. 2003. — V. 19. — P. 1253−1260.

256. Premasiri, W. R. Characterization of the surface enhanced raman scattering (SERS) of bacteria / W. R. Premasiri, D.T. Moir, M.S. Klempner, N. Krieger, G. Jones, L.D. Ziegler // J. Phys. Chem. 2005. — V. 109. — P.312−320.

257. Premkumar, J.R. Antibody-based immobilization of bioluminescent bacterial sensor cells / J.R. Premkumar, O. Lev, R.S. Marks, B. Polyak, R. Rosen, S. Belkin // Talanta P. 2001. -V. 55. — P. 1029−1038.

258. Puppels, G. J. Studying single living cells and chromosomes by confocal Raman microspectroscopy / G. J. Puppels, F. F. De Mul, C. Otto, J. Greve, M. Robert-Nicoud, D. J Arndt-Jovin // Nature 1990. — V. 347. — P. 301 303.

259. Quist, A.P. Recent advances in microcontact printing / A.P. Quist, E. Pavlovic, S. Oscarsson // Anal. Bioanal. Chem. 2005. — V. 381. — P. 591−600.

260. Rao, C.N. Synthesis of inorganic nanomaterials / C.N. Rao, S.R.C. Vivekchand, K. Biswas, A. Govindaraj // Dalton. T. 2007. — P. 3728−3749.

261. Rautaray, D. Biosynthesis of CaC03 crystals of complex morphology using a fungus and an Actinomycete / D. Rautaray, A. Ahmad, M. Sastry // J. Am. Chem. Soc.-2003.-Y. 125.-P. 14 656−14 657.

262. Rautaray, D. Biological synthesis of strontium carbonate crystals using the fungus Fusarium oxysporum / D. Rautaray, A. Sanyal, S.D. Adyanthaya, A. Ahmad, M. Sastry // Langmuir 2004. — V. 20. — P. 6827−6833.

263. Regot, S. Distributed biological computation with multicellular engineered networks / S. Regot, J. Macia, N. Conde, K. Furukawa, J. Kjellen, T. Peeters, S. Hohmann, E. de Nadal, F. Posas, R. Sole // Nature 2011 — V. 469. — P. 207−211.

264. Rhee, S.W. Patterned cell culture inside microfuidic channels / S.W. Rhee, A.M. Taylor, C.H. Tu, D.H. Cribbs, C.W.Cotman, N.L. Jeon // Lab. Chip -2004.-V. 5.-P. 102−107.

265. Ricardo, R. Counting and determining the viability of cultered cells / R. Ricardo, K. Phelan // J. Vis. Exp. 2008. — P. 752−758.

266. Ro, D.K. Production of the antimalarial drug precursor artemisinic acid in engineered yeast / D. K. Ro, E. M. Paradise, M. Ouellet, K. J. Fisher, K. L Newman, J. M. Ndungu // Nature 2006. — V. 440 — P. 940−943.

267. Roda, A. Biotechnological applications of bioluminescence and chemiluminescence / A. Roda, P. Pasini, M. Mirasoli, E. Michelini, M. Guardigli // Trends Biotechnol. 2004. -V. 22. — P. 295−303.

268. Rodriguez, M. Biosensors for rapid monitoring of primaiy-source drinking water using naturally occurring photosynthesis / M. Rodriguez, C.A. Sanders* E. Greenbaum // Biosens. Bioelectron. 2002. — V. 17. — P. 843−849.

269. Rosen, R. Microbial sensors of ultraviolet radiation based on recAj.:lux fusions / R. Rozen, Y. Davidov, R.A. LaRossa, S. Belkin // Appl. Biochem. Biotech.-2000. V. 89. P. 151- 160.

270. Rouse, J. H. Sol-gel processing of ordered multilayers to produce composite, films of controlled thickness / Rouse, J. H., Macneill, B. A., Ferguson, G. S. // Chem. Mater. 20 001 — V. 12. — P. 2502−2507.

271. Rowan, BPatterning bacteria within hyperbranched polymer film templates / B. Rowan, M.A. Wheeler, R.M. Crooks // Langmuir 2002. -V. 18. -P. 9914−9917.

272. Sano, M. Formation of ultrathin polymer layers on solid substrates by means of polymerizationinduced epitaxy and alternate adsorption / M. Sano, Y. Lvov, T. Kunitake // Annu. Rev. Mar. Sci. 1996. — V. 26. — P. 153−187.

273. Safarik, I. Magnetically modified microbial cells: A new type of magnetic adsorbents / I. Safarik, M. Safarikova // China Part. 2007. — V. 5: — P. 19−25.

274. Safarikova, M. Dye adsorbtion on magnetically modified Chlorella vulgaris cells / M. Safarikova, B.M.R. Ропа, E. Mosiniewicz-Szablewska, F. Weyda, I. Safarik // Fresen. Environ. Bull. -2008. V. 17 (4). — P.486−492.

275. Santhanam, V. Microcontact printing of uniform nanoparticle arrays / V. Santhanam, R.P. Andres // Nano Lett. 2004. — V. 4. — P. 41−44.

276. Schmid, G. Metal clusters and colloids / G. Schmid, L.F. Chi //Adv. Mater. 1998. — V.10. — P.515−526.

277. Selhuber-Unkel, C. Tracking cell-nanoparticle interactions / C. Selhuber-Unkel // J. Biomed. Nanotechnol. 2009. — V. 5. — P. 634−640.

278. Sengupta, A. Detection of bacteria by surface-enhanced Raman spectroscopy / A. Sengupta, M. Mujacic, E. Davis // Anal. BioanaL Chem 2006. -V. 386.-1379−1388.

279. Serizawa, T. A novel-approach for fabricating ultrathin polymer-films by the repetition of the adsorption drying processes / T. Serizawa, M. Akashi // J. Polym. Sci. 1998.-V. 37.-P. 1903;1906.

280. Serizawa, T. Alternating bioactivity of polymeric layer-by-layer assemblies: anticoagulation vs procoagulation of human blood / T. Serizawa, M. Yamaguchi, M. Akashi // Biomacromolecules 2002. — V. 3. — P. 724−731.

281. Shaw, D.R. Comparison of chlorofil II fluorescence and fresh weight as herbicide bioassay techniques / D.R. Shaw, T.F. Peeper, D.L. Nofzinger // Weed Sci. 1985. -V. 33. — P. 29−33.

282. Shimazaki, Y. Molecular-weight dependence of alternate adsorption through charge-transfer interaction / Y. Shimazaki, R. Nakamura, S. Ito, M. Yamamoto // Langmuir 2001. — V. 17. — P. 953−956.

283. Shitanda, I. Amperometric biosensing systems based on motility and gravitaxis of flagellate algae for aquatic risk assessment / I. Shitanda, K. Takada, Y. Sakai, T. Tatsuma // Anal. Chem. 2005. — V. 77. — P. 6715−6718.

284. Shitanda, I. Amperometric screen-printed algal biosensor with flow injection analysis system fordetection of environmental toxic compounds / I. Shitanda, S. Takamatsu, K. Watanabe, M. Itagaki // Electrochim. Acta. 2009. -V. 54.-P. 4933−4936.

285. Silva-Rocha, R. Mining logic gates in prokaryotic transcriptional regulation networks / R. Silva-Rocha, V. de Lorenzo // FEBS Lett. 2008. — V. 582-P. 1237−1244.

286. Small W. R. Fabrication of novel sensors from nanomaterials I W.R. Small I I PhD Thesis submitted at University of Hull, 2008.

287. Song, J. M. A compact CMOS biochip immunosensor towards the detection of a single bacteria / J. M. Song, M. Culha, P. M. Kasili, G. D. Griffin, T. Vo-Dinh // Biosens. Bioelectron. 2005. — V. 20 — P. 2203−2209.

288. S0rensen, S.J. Making bio-sense of toxicity: new developments in whole-cell biosensors / S.J. Sorensen, M. Burm0lle, L.H. Hansen // Curr. Opin. Biotech. 2006. — V. 17. — P. 11−16.

289. Stoodley, P. Biofilms as complex differentiated communities / P. Stoodley, K. Sauer, D. G. Davies, J. W. Costerton // Annu. Rev. Microbiol. 2002. -V. 56.-P. 187−209.

290. Stormo, K. E. Preparation of encapsulated microbial cells for environmental applications / K. E. Stormo, R. L. Crawford // Appl. Environ. Microb. 1992. -V. 58. — P. 727−730.

291. Stroeve, P. Transfer in supported films made by molecular self-assembly of ionic polymers / P. Stroeve, V. Vasques, M.A. Coelho, N. Rabolt // Thin Solid Films. 1996. -V. 284/285. — P. 708−712.

292. Su, L. Microbial biosensors: A review / L. Su, W. Jia, C. Hou^ Y. Lei // Biosens. Bioelectron.-2011. -V. 26. P. 1788−1799.

293. Sugunan, A. Nutrition-driven assembly of colloidal nanoparticles: growing fungi assemble gold nanoparticles as micro wires /A. Sugunan, P. Melin, J. Schnurer, J. G. Hilborn, J. Dutta // Adv. Mater. 2007. — V. 19. — P. 77−81.

294. Sukhorukov, G.B. Layer-by-layer self assembly of polyelectrolytes on colloidal particles / G.B. Sukhorukov, E. Donath, H. Lichtenfeld, E. Knippel, M. Knippel, A. Budde, H. Mohwald // Colloid Surface A. 1998. — V. 137 (1−3). — P. 253−266.

295. Sukhorukov, G. Layer-by-layer assembly of DNA and polynucleotides films by means of alternate adsorption with polycations / G. Sukhorukov, H. Mohwald, G. Decher, Y. Lvov // Thin Solid Films. 1996. — V. 284. — P. 220−223.

296. Suo, Z. Efficient immobilization and patterning of live bacterial cells / Z. Suo, R. Avci, X. Yang, D.W. Pascual // Langmuir 2008. — V. 24. — P. 41 614 167.

297. Suo, Z. Antibody selection for immobilizing living bacteria / Z. Suo, X. Yang, R. Avci, M. Deliorman, P. Rugheimer, D.W. Pascual, Y. Idzerda // Anal. Chem. 2009. — V. 81. — P. 7571−7578.

298. Sutherland, R.M. Cell and environment interactions in tumor microregions: the multicellular spheroid model / R.M. Sutherland // Science -1988.-V. 240.-P. 177−184.

299. Tang, H.W. Probing intrinsic and extrinsic components in single osteosarcoma cells by near-infrared surface-enhanced raman scattering / H.W. Tang, X.B. Yang, J. Kirkham, D.A. Smith // Anal. Chem. 2007. — V. 79. — P. 3646−3653.

300. Tatsuma, T. Algal biosensor array on a single electrode / T. Tatsuma, Y. Yoshida, I. Shitanda, H. Notsu // Analyst 2009. — V. 134. — P. 223−225.

301. Trevors, J.T. Use of alginate and-other carriers for encapsulation of microbial cells for use im soil / J.T. Trevors, J. DElsas, H. Lee, L.S. Overbeek // Microb. Releases. -1992. V. 1. — P- 61−69.

302. Trevors, J.T. Survival of alginateencapsulated Pseudomonas fluoresceins^cells^Tn soil / J.T. Trevors, J.D. Elsas, H. Lee, A.C. Wolters // Appl. Microbiol. Biot. 1993. V. 39.-P. 637−643.

303. Trubetskoy, V. S. Layer-by-layer deposition of oppositely charged polyelectrolytes on the surface of condensed DNA particles / V. S: Trubetskoy, A. Loomis, J. E. Hagstrom, V. G Budker, J. A., Wolff // Nucleic Acids Res. 1999. -V. 27.-P. 3090−3095.

304. Vakarelski, I.U. Penetration of living cell membranes with fortified carbon nanotube tips / I.U. Vakarelski, S.C. Brown, K. Higashitani, B. M Moudgil // Langmuir 2007. — V. 23. — P. 10 893−10 896.

305. Van Der Meer, J.R. Where microbiology meets microengineering: design and applications of reporter bacteria / J. R*. Van Der Meer, S. Belkin // Nat. Rev. Microbiol. 2010. — V. 8. — V. 511−522.

306. Van Der Meer, J.R. Illuminating the detection chain of bacterial bioreporters / J.R. Van Der Meer, D. Tropel, M. Jaspers // Environ. Microbiol. -2004.-V. 6.-1005−1020.

307. Van Dyk, T.K. LuxArray, a high-density, genomewide transcription analysis of Escherichia coli using, bioluminescent reporter strains / T.K. Van Dyk, E.J. DeRose, G.E. Gonye // J. Bacteriol. 2001. — V. 183. — P. 5496−5505.

308. Vanduffel, B. Fuzzy assembly and 2nd-harmonic generation of clay/polymer/dye monolayer films / B. Vanduffel, T. Verbiest, S. Vanelshocht, A. Persoons, F. Deschryver, R1. A. C. Schoonheydt // Langmuir 2001. — V. 17. — P. 1243−1249.

309. Vedrine, C. Optical whole-cell biosensor using Chlorella vulgaris designed for monitoring herbicides / C. Vedrine, J.C. Leclerc, C. Durrieu, C. Tran-Minh // Biosens. Bioelectron. 2003. — V. 18. — P. 457−463.

310. Veerabadran, N.G. Nanoencapsulation of stem sells within polyelectrolyte multilayer shells / N. G. Veerabadran, P.L. Goli, S.S. Stewart-Clark, Y.M. Lvov, D.M. Mills // Macromol. Biosci. 2007. — V. 7. — P. 877−882.

311. Velev, O.D. On-chip micromanipulation and assembly of colloidal particles by electric fields / O.D. Velev, K.H. Bhatt // Soft Matter 2006. — V. 2. -P. 738−750.

312. Velev, O.D. Assembly of latex particles by using emulsion droplets as templates 1. Microstructured hollow spheres / O. D. Velev, K. Furusawa, K. Nagayama // Langmuir 1996. — V. 12. — P. 2374−2380.

313. Velev, O.D. Assembly of Latex Particles by Using Emulsion Droplets 3. Reverse (Water in Oil) Systems / O. D. Velev, K. Nagayama / Langmuir 1997. -V. 13.-P. 1856−1864.

314. Velev, O. D. Materials fabricated by micro and nanoparticle assemblyThe challenging path from science to engineering / O. D. Velev, S. Gupta // Adv. Mater. -2009.-V. 21.-P. 1897−1905.

315. Wan, C.A.A. Nanomaterials for in situ cell delivery and tissue regeneration / C.A.A. Wan, J. Y. Ying // Adv. Drug Deliver. Rev. 2010. — V. 62. -P. 731−740.

316. Wang, B. Yeast cells with an, artificial mineral shell: protection and modification of living cells by biomimetic mineralization / B. Wang, P. Liu, W. Jiang, H. Pan, X. Xu, R. Tang // Angew. Chem. Int. Edit. 2008. — V. 120. — P. 3616−3620.

317. Wang, F. Layer-by-layer assembly of aqueous dispersible, highly conductive poly (aniline-co-o-anisidine)/poly (sodium 4-styrenesulfonate)/MWNTs core-shell nanocomposites / F. Wang, G. Wang, S. Yang, C. Li // Langmuir -2008.-V. 24.-P. 5825−5831.

318. Wang, L. Preparation of uniform needle-like aragonite particles by homogeneous precipitation / L. Wang, I. Sondi, E. Matijevic // J. Colloid Interf. Sci. 1999. — V. 218. — P. 545−553.

319. Wang, Q. Enhanced surface plasmon resonance for detection of DNA hybridization based on layer-by-layer assembly films / Q. Wang, X. Yang, K. Wang // Sensor Actuat. BChem. 2007. — V. l23. — P. 227−232.

320. Wang, T. Soft polymer and nano-clay supracolloidal particles in adhesives: synergistic effects on, mechanical properties / T. Wang, P.J. Colver, S.A.F. Bon, J.L. Keddie // Soft Matter 2009: — V. 5, — P. 3842−3849.

321. Weibel, D.B. Microfabrication meets microbiology / D.B. Weibel, W.R. Diluzio, G.M. Whitesides // Nat. Rev. Microbiol: 2007. — V. 5. — P. 209 218.

322. Winterton, L. US Patent Appl. № 20 010 048 975 / L. Winterton, J. Lally, M. Rubner, Y. Qui// US Patent Appl. 2001.

323. Xing, Q. Cellulose fiber-enzyme composites fabricated through layer-by-layer nanoassembly / Q. Xing, S. R. Eadula, Y. M. Lvov // Biomacromolecules 2007. — V. 8. — P. 1987;1991.

324. Xu, L. Microcontact printing of living bacteria arrays with cellular resolution / L. Xu, L. Robert, Q. Ouyang, F. Taddei, Y. Chen, A.B. Lindner, D. Baigl // Nano Lett. 2007. — V. 7. — P. 2068;2072.

325. Yang, C. Measurement of the zeta potential of gas bubbles in aqueous solutions by microelectrophoresis method / C. Yang, T. Dabros, D. Li, J. Czarnecki, J.H. Masliyah // J. Colloid Interf. Sci. 2001. — V. 243. — P. 128−135.

326. Yang, P. The chemistry of nanostructured materials / P. Yang. World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd. — 2003.

327. Yang, S.H. Biomimetic encapsulation of individual cells with silica / S.H. Yang, K.B. Lee, B. Kong, J.H. Kim, H.S. Kim, I.S. Choi // Angew. Chem. Int. Edit. -2009. -V. 48. P. 9160 -9163.

328. Yang, Z.Z. Templated synthesis of inorganic hollow spheres with a tunable cavity size onto core-shell gel Particles / Z.Z. YangZ.W. Niu, Y.F. Lu, Z.B. Hu, C.C. Han // Angew. Chem. Int. Edit. 2003. — V.42. — P: 1943; 1945.

329. Yoon, H: C. Multilayered assembly of dendrimers with enzymes on gold thickness-controlled biosensing interface / H.C. Yoon, H. S Kim // Anal. Chem. — 2000. — V. 72. — P: 922−926.

330. Zhang, J. Layer-by-layer fabrication and direct electrochemistry of glucose oxidase on single wall carbon nanotubes / J. Zhang, M. Feng, H. Tachikawa // Biosens. Bioelectron. 2007. — V. 22. — P. 3036−3041.

331. Zhang, K. Fabrication of a sensitive impedance biosensor of DNA hybridization based on gold nanoparticles modified gold electrode / K. Zhang, H. Ma, L. Zhang, Y. Zhang // Electroanal. 2008. — V.20. — P. 2127−2133.

332. Zhang, Y. Fabrication of stable hollow capsules by covalent layer-by-layer self-assembly / Y. Zhang, S. Yang, Y. Guan, W. Cao, J. Xu // Macromolecules 2003. — V. 36(11). — P. 4238−4240.

333. Zhao, B. A bone mimic based on the self-assembly of hydroxyapatite on chemically functionalized single-walled carbon nanotubes / B. Zhao, H. Hu, S. K. Mandal, R. C. Haddon // Chem. Mater. 2005. — V. 17. — 3235−3241.

334. Zhao, L. Assembly of layer-by-layer films of heme proteins and singlewalled carbon nanotubes: electrochemistry and electrocatalysis / L. Zhao, H. Liu, N. Hu // Anal. Bioanal. Chem. 2006. — V. 384. — P. 414−422.

335. Zheng, S. Self-assembly and characterization of polypyrrole and polyallylamine multilayer films and hollow shells / S. Zheng, C. Tao, Q. He, H. Zhu and J. Li // Chem. Mater. 2004 — V. 16(19). — P. 3677−3681.

336. Zhi, Z.-L Polysaccharide multilayer nanoencapsulation of insulin-producing /?-cells grown as pseudoislets for potential cellular delivery of insulin / Z.-L Zhi, B. Liu, P. M Jones, J. C Pickup // Biomacromolecules 2010. — V. 11.-P. 610−616.

337. Zhong, Z.Y. Preparation of mesoscale hollow spheres of Ti02 and Sn02 by templating against crystalline arrays of polystyrene beads / Z.Y. Zhong, Y.D. Yin, B. Gates, Y.N. Xia // Adv. Mater. 2000. — V. 12. — P. 206−209.

338. Zhou, H. Hydrothermal synthesis of ZnO hollow spheres using spherobacterium as biotemplates / H. Zhou, T. Fan, D. Zhang // Micropor. Mesopor. Mat. 20 107. -V. 100. — P. 322−327.

339. Zhou, W. How rigid rods self-sssemble at curved surfaces / W. Zhou, J. Cao, W. Liu, S. Stoyanov // Angew. Chem. Int. Edit. 2009. — V. 48. — P. 378 -381.

340. Zhu, L. DNA damage induced by multiwalled carbon nanotubes in mouse embryonic stem cells / L. Zhu, D. W. Chang, L. Dai, Y. Hong // Nano Lett. 2007. — V.7 (12). — P.3592−3597.