Помощь в написании студенческих работ
Антистрессовый сервис

Исследование круга хозяев, полиморфизма и клонирование генома Х вируса шалота

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Тем не менее, вирусы, поражающие некоторые семейства растений, остаются недостаточно изученными. В их число входят и вирусы растений рода Allium. Растения этого рода, в особенности размножающиеся вегетативно, как правило, в природных условиях поражаются одновременно несколькими вирусами. Выделение и изучение отдельных компонентов вирусных комплексов из таких растений осложняется тем, что вирусы… Читать ещё >

Исследование круга хозяев, полиморфизма и клонирование генома Х вируса шалота (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Содержание

  • Список сокращений
  • I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
  • 1. Общая характеристика вирусов, поражающих культурные виды рода Allium
    • 1. 1. Потивирусы
      • 1. 1. 1. Вирус желтой карликовости лука
      • 1. 1. 2. Вирус желтой штриховатости лука-порея
      • 1. 1. 3. Предполагаемые члены группы потивирусов
      • 1. 1. 4. Нуклеотидные последовательности РНК потивирусов, выделенных из растений рода Allium
    • 1. 2. Карлавирусы
      • 1. 2. 1. Латентный вирус шалота
      • 1. 2. 2. Латентный вирус чеснока
    • 1. 3. Вирусы других групп, обнаруженные в растениях рода Allium
  • 2. X вирус шалота и ХВШ-подобные вирусы
    • 2. 1. Морфология и физико-химические свойства вирусных частиц
    • 2. 2. Симптоматика и круг хозяев
    • 2. 3. Серологические свойства
    • 2. 4. Цитопатология
    • 2. 5. Характеристика геномной РНК
  • 3. Организация генома и сравнительная характеристика генов карла-, потеке- и ХВШ-подобных вирусов
  • 4. Инфекционные кДНК копии геномных РНК фитовирусов
    • 4. 1. Конструкция и экспрессия инфекционных вирусных кДНК
    • 4. 2. Определение инфекционности к ДНК копий
    • 4. 3. Исследование полноразмерных кДНК копий геномных РНК вирусов
  • II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
  • 1. Выделение ХВШ и вирусной РНК
  • 2. Синтез и клонирование кДНК
  • 3. Получение однонаправленных делеций
  • 4. Определение нуклеотидной последовательности
  • 5. Отбор полноразмерных кДНК копий геномной РНК ХВШ
  • 6. Получение протопластов
  • 7. In vitro транскрипция
  • 8. In vitro трансфекция протопластов
  • 9. Электрофорез в сочетании с ИФА (Western blot)
  • 10. Электронная микроскопия
  • 11. Иммуносорбентная электронная микроскопия
  • 12. Компьютерный анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей и вторичной структуры РНК
  • III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ
  • 1. Род Allexviruses: поиск новых видов и предложения по классификации и номенклатуре
  • 2. Моновирусная инфекция растений X вируса шалота: герерогенность нуклеотидной последовательности геномной РНК и морфологическая гетерогенность вирионов
    • 2. 1. Морфологическая гетерогенность вирионов
    • 2. 2. Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей
      • 2. 2. 1. 42К белок
      • 2. 2. 2. 28К белок
      • 2. 2. 3. 15К белок
  • 3. Полноразмерная кДНК-копия геномной РНК X вируса шалота: получение, клонирование, структура, in vitro транскрипция и тестирование инфекционности
    • 3. 1. Клонирование полноразмерной кДНК-копии ХВШ
    • 3. 2. Определение инфекционности кДНК-копий ХВШ

Практически все растения подвержены вирусной инфекции. В результате нескольких десятилетий исследований было охарактеризовано несколько сот фитовирусов, которые по своей морфологии и серологическим свойствам были объединены в несколько семейств и более 30 групп.

Наиболее интенсивно фитовирусология стала развиваться когда появились первые данные о структуре и организации вирусных геномов. Именно эти результаты легли в основу современного представления о механизмах репликации и экспрессии вирусных геномов, взаимодействии вируса с растениями-хозяевами и переносчиками, транспорте вирусной инфекции и т. д. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей геномных РНК вирусов дал возможность выяснить филогенетические отношения между отдельными группами фитовирусов и некоторые аспекты их эволюционного развития. Работы направленные на изучение структуры и экспрессии геномов фитовирусов имеют не только фундаментальное, но и очевидное прикладное значение, поскольку на их основе ведутся разработки принципиально новых методов защиты растений от вирусной инфекции.

Тем не менее, вирусы, поражающие некоторые семейства растений, остаются недостаточно изученными. В их число входят и вирусы растений рода Allium. Растения этого рода, в особенности размножающиеся вегетативно, как правило, в природных условиях поражаются одновременно несколькими вирусами. Выделение и изучение отдельных компонентов вирусных комплексов из таких растений осложняется тем, что вирусы сложно разделить традиционными методами, поскольку зачастую вирусные частицы практически неразличимы по морфологии и физическим свойствам.

Современные молекулярно-биологические исследования РНК-содержащих вирусов растений все чаще базируются на подходах, связанных с клонированием полноразмерных кДНК-копий вирусных геномов, РНК-транскрипты которых способны инициировать вирусную инфекцию. Такие технологии, в частности, позволяют выявить функциональную значимость не только тех или иных вирусспецифических белков, но и отдельных их доменов.

Настоящая работа посвящена молекулярно-биологическому исследованию сравнительно недавно открытого в лаборатории молекулярной вирусологии ВНИИСБ фитовируса — X вируса шалота (ХВШ), ставшего типовым представителем новой группы ХВШ-подобных фитовирусов, получившей название Аллексивирусы (Allexiviruses). Структура генома ХВШ-подобных вирусов наиболее близка к потекеи карлавирусам. Характерной особенностью ХВШ-подобных вирусов является наличие уникального 42К белка.

Основными задачами настоящей работы было следующее: выявление спектра хозяев ХВШ-подобных вирусов и проведение для этого серологического скрининга в растениях филогенетически близких роду Alliumисследование влияния аминокислотной последовательности вирусспецифических ХВШ белков на морфологию вирусных частицсинтез полноразмерной кДНК-копии геномной РНК ХВШ и ее клонирование в составе рекомби-нантных плазмидисследование инфекционности транскриптов.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1. ХАРАКТЕРИСТИКА ВИРУСОВ, ПОРАЖАЮЩИХ КУЛЬТУРНЫЕ.

РАСТЕНИЯ РОДА ALLIUM.

Род, Allium относится к семейству Liliaceae, классу Monocoty и включает более 600 видов. Хозяйственное значение имеют выращиваемые как овощные культуры, широко распространенные в сельском хозяйстве: А. серарепчатый лук, A. sativum — чеснок, А. сера var. ascalonicum — лук-шалот (шалот), A. ampeloporassum var. porrum — лук-порей (порей), а так же ряд декоративных культур.

Культурные растения рода Allium в природных условиях поражены, как правило, не одним, а одновременно несколькими вирусами, различающимися по своей морфологии и принадлежности к той или иной группе фи-товирусов (Bos, 1982аVan Dijk et al, 1991).

1.1. Потивирусы.

Одними из часто встречающихся в растениях рода Allium фитовирусов являются потивирусы — наиболее обширная из известных в настоящее время групп. Потивирусы получили свое название от типичного представителя этой группы Y вируса картофеля (YBK, potato virus Y) (Гиббс и Харрисон, 1978). Группа содержит более 200 различных вирусов, имеющих форму палочковидных или нитевидных частиц, построенных по принципу спиральной симметрии (Gibbs, 1969). Одни представители этой группы обладают достаточно широким спектром растений-хозяев, другие, особенно передаваемые семенами (например, вирус мозаики фасоли и вирус мозаики салата), ограниченным. Потивирусы поражающие растения рода Allium являются высоко патогенными, вызывая на растениях-хозяев сильные повреждения в виде штриховатой мозаики, некрозов и хлорозов.

Как правило, наиболее ясно выраженные характерные симптомы у луковых возникают при поражении потивирусами. Именно благодаря этому обстоятельству потивирусы репчатого лука и лука-порея были обнаружены еще в 30-е и 50-е годы (Henderson, 1935, Кирке, 1957). Тем не менее, принадлежность ряда поражающих растения рода Allium вирусов к семейству по-тивирусов остается не доказанной. В настоящее время только вирус желтой карликовости лука (ВЖКЛ, onion yellow dwarf virus) и вирус желтой штри-ховатости лука-порея (ВЖШЛП, leek yellow stripe virus) идентифицированы как потивирусы совершенно четко и корректно.

выводы.

1. На основании результатов серологического скрининга нескольких сотен растений, принадлежащих к 12-ти семействам, сделан вывод о чрезвычайно ограниченном спектре хозяев ХВШ-подобных вирусов и обнаружен новый представитель этой группы, поражающий некоторые виды семейства Amaryllidaceae.

2. В вирусных препаратах, полученных из индивидуальных растений Allium ascalonicum в условиях моноинфекции ХВШ, обнаружены вирионы двух морфологических классов. Показано что частицы с различной морфологией образуются при участии гомологичных геномных РНК и серологически идентичных белков оболочки, что дает основание рассматривать частицы обоих классов как различные формы вирионов ХВШ.

3. Определены частичные нуклеотидные последовательности геномных РНК двух морфологических классов вирионов ХВШ. В белке оболочки и 15К белке локализованы аминокислотные замены.

4. Проклонирована полноразмерная кДНК копия геномной РНК ХВШ под контролем промотора РНК полимеразы фага Т7. Показано, что в результате трансфекции протопластов сахарной свеклы РНК-транскриптами синтезируется белок оболочки и формируются вирусные частицы.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

.

Совокупность полученных результатов позволяет рассматривать ХВШ, как новый вирус, эволюция которого находится, по видимому, в процессе развития. В пользу этого представления свидетельствуют ограниченность спектра хозяев и морфологическая гетерогенность вирусных частиц, обусловленная незначительными изменениями в аминокислотной последовательности его белка оболочки. Получение полноразмерной кДНК-копии геномной РНК ХВШ, синтез инфекционных транскриптов и создание эффективной модельной системы трансфекции протопластов сахарной свеклы позволит в дальнейшем детально исследовать молекулярные механизмы репликации геномной РНК, экспрессии вирусных белков и эволюции ХВШ.

Показать весь текст

Список литературы

  1. Н.В., Конарева Т. Н., Рябов Е. В. и Завриев С.К. (1995) 42К белок X вируса шалота экспрессируется в инфицированных растениях рода Allium. Молекулярная биология 29, 192−198.
  2. Н.В., Конарева Т. Н., Черемушкина Н. П. и Завриев (1996) Идентификация компонентов вирусного комплекса, персистирующего в культурных растениях рода Allium. Сельскохозяйственная биология 30, 105 111.
  3. Т.В. (1996) Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук, М.
  4. А. Харрисон Б. (1978) Основы вирусологии растений.
  5. К.В. (1991) Структура З'-концевой области РНК М вируса картофеля и возможные механизмы экспрессии генома вируса. Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук, М.
  6. К.Э. (1991) Структурная организация генома карлавирусов: М вирус картофеля и В вирус хризантемы. Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук, М.
  7. Т., Фрич Э. и Сэмбрук Дж. (1984) Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М.Мир.
  8. Г. М. Капкова Е.А., Черемушкина Н. П. и Еременко В.Д. (1969а) Мозаичные болезни чеснока. Защита растений 12, 23.
  9. Г. М. Капкова Е.А. и Черемушкина Н.П. (19 696) Клещи Aceria tulipae (Eriophydae) переносчик вируса мозаики лука. Зоологический журнал 48, 288−289.
  10. В.В., Морозов С. Ю., Канюка К. В., Журина В. Ю. Лукашева Л.И. и Завриев С.К. (1990) Нуклеотидная последовательность и структурная организация геномной РНК М-вируса картофеля. Молекулярная биология, 24, 448−459.
  11. Е.Б., Генерозов Э. В., Феттен Г. Д., Завриев С. К. (1996) Анализ З'-концевой области генома переносимого клещем нитевидного вируса свидетельствует о его принадлежности к группе X вируса шалота. Молекулярная биология, 30, 104−110.
  12. Е.В. (1994) Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук, М.
  13. А.Е. и Легункова P.M. (1961) Электронная микрофотография вируса мозаики лука. Микробиология 30, 165−167.
  14. A.N. & Barbara D.J. (1980) Host range, purification and some properties of hop mosaic virus. Annals of Applied Biology 96, 201−208.
  15. Ahlquist P., Janda M., Loesch-Fries L.S. (1984) Multicomponent RNA plant virus infection derived from cloned viral cDNA, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 81,7066.
  16. Ahlquist P (1986) In Vitro Transcription of infectious Viral RNA from Cloned cDNA. Methods in enzymology, 118, 704−716.
  17. G. Posthumus E. & Bol J. (1989) Biological activity of transcripts synthesized in vitro from full-length and mutated DNA copies of tobacco rittle virus RNA 2. The Netherlands Received April 26, 68−76.
  18. D.L., Guilford P.J., Voot D.M., Anderson M.T. & Forster R.S.L. (1991) Triple gene block proteins of white clover mosaic potexvirus ara required for transport. Virology 183,695−702.
  19. P.G. & Tinsley, T.W. (1971) Poplar mosaic virus. CMI/AAB Description of plant viruses No. 75.
  20. Bos L. (1972) Ernstige uitbreidingvan uiegeelstreepvirus in prei. Gewasbescherming 3, 81−87.
  21. Bos L. (1976) Oninon yellow dwarf virus. CMI/AAB Description of plant viruses No. 158.
  22. Bos L., Huijberts N., Huttinga H & Maat D.Z. (1978a) Leek yellow stripe virus and its relationships to onin yellow dwarf virus- characterisation, ecology and possible control. Netherlands Journal of Plant Pathlogy 84, 185−204.
  23. Bos L., Huttinga H & Maat D.Z. (1978b) Shallot latent virus, a new carlavirus. Netherlands Journal of Plant Pathlogy 84, 227−237.
  24. Bos L. (1981) Leek yellow stripe virus. CMI/AAB Description of plant viruses No. 240.
  25. Bos L. (1982a) Viruses and virus diseases of Allium species. Acta horticulturae 127, 11−29.
  26. Bos L. (1982b) Shallot latent virus. CMI/AAB Description of plant viruses No. 250.
  27. K.L., Weiland J.J. & Dreher T.W.(1991) Proteolytic maturation of the 206-kDa nonstructural protein encoded by turnip yellow mosaic virus. Virology 184, 351−358.
  28. Brugidou C., Holt C., Ngon A Yassi M., Zhang S., Beachy R. & Fauquet C. (1995) Synthesis of an infectious full-length cDNA clone of Rice Yellow Mottle Virus and Mutagenesis of the Coat Protein. Virology 206, 108−115.
  29. J., Nagy P. & Russo M. (1990) Synthesis of infectious RNA cloned cDNA to RNA of cymbidium ringspot tombusvirus. Journal of General Viroloogy 71, 1857−1860.
  30. E.L. & Harrison B.D. (1963) Outbreaks of tomato black ring virus in onion and leek crops in Northern Ireland. Hortic. Res. 2, 115−120.
  31. S., Hills G., Watts J. & Baulcombe D. (1992) Mutational Analysis of the Coat Protein Gene of Potato Virus X: Effects on Virion Morphology and Viral Pathogenicity. Virology 191, 223−230.
  32. J.E. (1992) Zink proteins: Enzymes, storage proteins, transcription factors, and replication proteins. Annual Rev. Biochem. 61, 897
  33. D.E., Kiefer M.C. & Owens R.A. (1983) Construction of infectious potato spindle tuber viroid cDNA clones. Nucleic Acids Research 11, 6821.
  34. Cronin S., Verchot J., Haldeman-Cachill R., Schaad M.C. & Carrington J.C. (1995) Long-distance movement factor: A transport function of the potyvirus helper component proteinase. The Plant Cell 7, 549−559.
  35. W.O., Beck D.L., Knorr D.A. & Grantham G.L. (1986) cDNA cloning of the complete genome of tobacco mosaic virus and production of infectious transcripts, Proc. Nat.,. Acad.Sci. U.S.A., 83, 1832.
  36. B. & Lot H. (1981) Yiroses de l’ail: I. Mise en evidence et essais de caracterisations par immuno-electromicroscopie d’un complexe de trois virus chez differentes populations d’ail atteintes de mosaique. Agronomie 1, 763−770.
  37. C.J., Tate H.D. & Harris H.M. (1933) The relationship of aphids to the transmission of ywllow dwarf of onion. Journal of economical Enthomology 26,841−846.
  38. Forster R.L.S., Bavan M.W., Harriso S.-A. & Gardner K.S. (1988) The complete nucleotide sequence of the potexvirus white clover mosaic virus. Nucleic Acids Rasearch 16,291−303.
  39. Foster G.D.& Mills P.R. (1991) Cell-free translation of American hop latent virus. Virus genes 5, 327−334.
  40. Foster G.D.& Mills P.R. (1991) Translation of potato virus S RNA in vitro- evidence of protein processing. Virus Genes 6, 45−52.
  41. Ge Z., Hiruki C. & Roy K.L. (1993) Nucleotide sequence of sweet clover necrotic mosaic virus RNA-1. Virus Research 28, 113−124.
  42. M.C., Marliere P., Kofoid E.C., Lous B.G. (1985) Initiator tRNA may racognize more than the initation codan in mRNA: A model for translational initiation. Proc Nat. Acad. Sci. USA 82, 4587−4591.
  43. W.L., Buzayan J.M., Schneider I.R. & Bruening G. (1986) Satellite tobacco ringsport virus RNA: biological activity of DNA clones and their in vitro transcripts. Virology 151, 172.
  44. A.J. (1969) Plant virus classification.
  45. D., Bouzoubaa S., Gilley H., Richards K. & Jonard G. (1992) Efficient cell-to-cell movement of beet necrotic yellow vein virus requires 3' proximal genes located on RNA2. Virology 189, 40−47.
  46. A., Courtpozans A. & Rohde W. (1990) The 12 kDa protein of potato virus M displays proierties of a nucleic acid binding regulatory protein. FEBS Letters 276, 34−38.
  47. P.J. & Forster R.L.S. (1986) Detection of polyadenilated subgenomic RNAs in leaves infected with the potexvirus daphne virus X. Journal of General Virology 67, 83−90.
  48. Hamilton W.D.O. & Baulcombe D.C. (1988) Infectious RNA Produced by in vitro Transcription of a Full-length Tobacco Rattle Virus RNA-1 cDNA. Journal of General Virology 70, 963−968.
  49. D. (1986) Teqniques for transformation of E.coli. In: DNA cloning: a practical approach. I.(Ed. by Glover D.M.) IRL Press Limited. Oxford, 1986.
  50. Harrison B.D., FinchJ.T., Gibbs A.J., Hollings M., Shepperd R.J., Valenta V. & Wetter C. (1971) Sixteen groups of plant viruses. Virology 45, 356−363.
  51. W.J., (1935) Yellow dwarf, a virus disease of onins, its control. Res. Bull. Iowa Agr. Exp. Stn. 188, 209−225.
  52. B.I. & Lawrence D.M. (1993) Carlaviruses.
  53. S. & AbouHaidar M.G. Production of infectious in vitro transcripts from a full-length clover yellow mosaic virus cDNA clone. Journal of General Virology 74, 781−784.
  54. T., Madhani H.D., Masiarz F.R. & Varmus H.E. (1988) Signals for ribosomal frameshifting in the Rous sarcoma virus gag-pol region. Cell 56, 447−458.
  55. M., French R., & Ahlquist P. (1987) High efficiency T7 polymerase synthesis of infectious RNA from cloned brome mosaic virus cDNA and effects of 5' extension on transcript infectivity, Virology, 158, 259.
  56. G., Drugeon G., Savithiri H.S. & Haenni A.-L.(1992) Comparison of the strategies of expression of five tymovirus RNAs by in vitro translation studies. Journal of General Virology 73, 493−499.
  57. B. (1955) Some properties of four viruses isolated from carnation plants. Annals of Applied Biology 43, 103−113.
  58. Klement J.F., Ling M.-L., & McAllister W.T. (1986) Sequencing of DNA using T3 RNA polymerase and chain terminating ribonucleotide analogs. Gene Anal. Tech., 3, 59
  59. Koonin E. V (1991) The phylogeny of RNA-dependent RNA polymerases of positive-strand RNA viruses. Journal of General Virology 72, 2197−2207.
  60. E.V. & Dolja (1993) Evolution and taxonomy of positive-strand RNA viruses: implications of coomparative analysis of amino acid sequences. CRC Crit. Rev. Biochem Molec. Biol.
  61. E.V., Mushegian A.R., Ryabov E.V. & Dolja (1991) Diverse groups of plant DNA and RNA viruses share related movevent proteins that may posess chaperone-like activity. Journal of General Virology 72, 2895−2903.
  62. W. (1957) Die Gelbstreifigkeit, eine gefahrliche Krankheit des Porrees. Rhein. Monatschr. Gem. Obst- Gartenbau 45, 173.
  63. MacFarlane S.A. Gilmer D. & Davies J.W. (1992) Efficient inoculation with CaMV 35S promoter-driven DNA clones of the Tobravirus PEBV. Virology 187, 829−831.
  64. McWhorter F.P. (1987) Cell inclusions in onion yellow dwarf. Phytopathology 27, 1627−1628.
  65. Meeham B.M.& Mills P.R. (1991) Cell-free translation of carnation latent virus RNA and analysis of virus specific dsRNA. Virus genes 5, 175−181.
  66. Meeham B.M.& Mills P.R. (1991) Nucleotide sequence of the 3'-terminal region of carnation latent virus. Intervirology 32, 262.
  67. Melton D.A., Krieg, P.A., Rebagliati M.R., Maniatis T., Zinn K. & Green M.R. (1984) Efficient in vitro synthesis of biologically active RNA and RNA hybridization probes from plasmids containing a bacteriophage SP6 promoter, Nucleic Acids Res., 12, 7035.
  68. T., Ishikawa M., Motoyoshi F., Semba K. & Okada Y. In vitro transcription of infectious RNAs from full-length cDNA of tobaco mosaic virus. Proc. Natl. Acad. Sci.USA. 83, 5043−5047.
  69. C.M. & Marrou J. (1965) Selection snitaire de 1'ail: deux slutions possible au probleme de la mosaique de Tail: plantes sensibles saines, ou plantes virosees tolerantes. C.R. Le J. Phytiatr. Phytopharm. Tr. Circummedit. Marseille: 204−206.
  70. N.A. & Young B.R. (1980) Leek yellow stripe virus (incidence in 19 789) in New Zeaiand. New Zeland J. Agric. Res. 23, 129−131.
  71. Morch M.-D., Boyer J.-Ch. & Haenni A.-L.(1988) Overlapping open reading frames revaeled by complete sequebcing of turnip yellow mosaic virus genomic RNA. Nucleic Acid Research 16, 6157−61−73.
  72. Morch M.-D., Drugeon G., Szafrinski P. & Haenni A.-L. (1989) Proteolytic origin of the 150-kilodalton protein encoded by turnip yellow mosaic virus genomic RNA. Journal of Virology 63, 5153−5158.
  73. M., Mise K., Kobayashi K., Okuno T. & Furusawa I. (1991) Infectivity of plasmids containing broome mosaic virus cDNA linked to the cauliflower mosaic virus 35S RNA promoter. Journal of General Virology 72, 243−246.
  74. S.Yu., Dolja V.V. & Atabekov J.G. (1989) Probable reassortment of genomic elements among elongated RNA-contained plant viruses. Journal of Molecular Evolution 29, 52−62.
  75. S.Yu., Kanyuka K.V., Levay K.E. & Zavriev S.K. (1990a) The putative RNA replicase of potato virus M: obvous sequence similarity with potex-and tymoviruses. Virology 179, 911−914.
  76. S.Y., Miroshnichenko N.A., Zelenina D.A., Fedorkin O.N., Solovijev A.G., Lukassheva L.I., Atabecov J.G. (1990b) Expression of RNA transcripts of potato virus X ful-length and subgenomic cDNAs. Biochimie 72, 677−684.
  77. S.Y., Miroshnichenko N.A., Solovijev A.G., Fedorkin O.N., Zelenina D.A., Lukassheva L.I., Karasev A.V., Dolja V.V. & Atabecov J.G. (1991)
  78. Exspression strategy of the poyato virus X tripe gene block. Journal of General Virology 72, 1−4.
  79. K.W. & Gierer A. (1958) Die Erzeugung von Mutationen des Tabakmosaikvirus durch chemische Behandliung seiner NucleinsSiure in vitro. Z. ind. Abst. Vererbungslehre 89, 614.
  80. K.W. (1960) Z. ind. Abst. Vererbungslehre 91, 87.
  81. M., Kiduchi S., Kiho Y., Ohno T., Meshi T. & Okada Y. (1985) Nucleic Acids Research 13, 5585.
  82. Otsuki Y., Takebe I., Honda Y., Kajita S.& Matsu C. (1974) Infection of tobacco mesophyll protoplast by potato virus X. Journal of General Virology 22,375−385.
  83. S. & Gilliand. G. (1990) Site-specific mutagenesis using asymmetric polymerase chain reaction and a single mutant primer. Nucleic Acids Research 18, 24, 7433−7437.
  84. Petty I.T.D. & Jackson A.O. (1990) Mutational analisis of Barley Stripe Mosaic Virus RNA p. Virology 179, 712−718.
  85. V.R. & Baltimore D. (1981) Science 214, 916.
  86. M.N., Koonin E.V. & Gorbalenya A.E. (1992) Conservation of the putative methyltransferase domain: a hallmark of the 'Sindbis-like' supergroup of positive-strand RNA viruses. Journal of General Virology 73, 2129−2134.
  87. V.V., Morozov S.Yu., Kanyuka K.V. & Zavriev S.K. (1989) Partial nucleotide sequence of potato virus M shows similarities to potexviruses in gene arrangement and the encoded amino acid sequences. Journal of General Virology 70,1861−1869.
  88. E.V., Generozov E.V., Kendall T.L., Lommel S.A. & Zavriev S.K. (1994) Nucleotide sequence of carnation ringspot dinathovirus RNA-1. Journal of General Virology 75, 243−247.
  89. J., Fritsch E.F. & Maniatis T. (1989) Molecular cloning.
  90. B. L., Dorner A.J., Wimmer E. (1984) Production of infectious poliovirus from cloned cDNA is dramatically increased by SV40 transcription and replication signals. Nucleic Acids. Res. 12, 5123.
  91. Song S.I., Song J.T., Kim C.H., Lee J.S. & Choi Y.D. (1998) Molecular characterization of the garlic virus X genome. Journal of General Virology 79, 155−159.
  92. M. & Klevit R.E. (1984) Zinc finger diversity. Current Option in Structural Biology 4, 28−35.
  93. Shi B.-J., Ding S.-W. & Symons R. (1997) Plasmid vector for cloning infectious cDNAs from plant RNA viruses: high infectivity of cDNA clones of tomato aspermy cucumovirus. Journal of General Virology 78, 1181−1185.
  94. K.G., Morozov S.Yu., Kraev A.S., Rozanov M.N., Chernov B.K., Lukasheva L.I. & Atabekov J.G. (1988) Conserved and variable elements in RNA genomes of potexviruses. FEBS Letters 240, 33−40.
  95. A.G., Novikov V.K., Merits A., Savenkov E.I. Zelenina D.A. Tyulkina L.G. & Morozov S.Yu. (1994) Genome characterisation and taxonomy of Plantago asiatica mosaic potexvirus. Journal of General Virology 75, 259 267
  96. Sumi S, Tsuneyoshi T. & Furutani H. (1993) Novel rod-shaped viruses isolated from garlic, Allium sativum, posessing a unique genome organisation. Journal of General Virology 74, 1879−1885.
  97. S. & Richardson Ch.C. (1987) DNA sequence analysis with a modified bacteriophage T7 polyverase. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 84, 4767−4772.
  98. N., Ishikawa M., Meshi T. & Okada Y. (1987) Expression of bacterial chloramphenicol acetyltransferase gene in tobacco plants mediated by TMV RNA. EMBOO J. 6, 307.
  99. T., Palmieri M. & Weissmann C. (1978) Q? DNA-containing hybrid Plasmids giving rise to Q? phage formation in the bacterial host. Nature (London) 274, 223.
  100. S.M. (1984) Physicocemical properties of potato virus M. Virology 133, 427−430.
  101. H.D. (1935) Intracellular abnormalities associated with yellow dwarf of onions. Iowa State Coll. J.Sci. 9, 677−683.
  102. H.D. (1940) Insects as a vectors of yellow dwarf, a virus disease of onion. Iowa State Coll. J.Sci. 14, 267−294.
  103. N.P. (1974) Electron microscopy ultrathin sections study of the relationship between Allium mosaic virus and its vectjr-mite Aceria tulipae L. Comm. Inst. Biol. Pedol. Vladivostok 28, 174−177.
  104. N.P. (1975) The role of Aceria tulipae in spreading onion mosaic virus. Comm. Inst. Biol. Pedol. Vladivostok 28, 174−177.
  105. T. & Simi S. (1996) Differentiation among garlic viruses in mixed infections based on RT-PCR procedures and direct tissue blotting immunoassays. Phytopathology 86, 253−259.
  106. V.K., Konareva T.N. & Zavriev S.K. (1993) A new filamentous virus in shallot. Plant Pathology 42, 121−126.
  107. Van der Werf S., Bradley J., Wimmer E., Studier F.W. & Dunn J.J. (1986) Synthesis of infectious poliovirus RNA by purified T7 RNA polymerase, Proc. Natl. Acad. Sci.U.S.A., 83, 2330.
  108. Van Dijk P., Verbeek M. & Bos L. (1991) Mite-borne virus isolates from cultivated Allium species, and their classification into two new rhymoviruses in the family Potiviridae. Nederlands Journal of Plant Pathology 97, 381 399.
  109. Van Dijk P. (1994) New mite borne virus isolates from rakkyo, shallot and wild leek species. Nederlands Journal of Plant Pathology
  110. Van Emmelo J., Ameloot P. & Fiers W. (1987) Expression in plants of the cloned satellite tobacco necrosis virus genome and of derived insertion mutants. Virology 157, 480.
  111. Van Vloten-doting L (1995) The Plant Viruses 1,117.
  112. Walkey D.G.A., Webb M.J.W., Bolland C.J. & Miller A. (1987) Production of virus-free garlic (Allium sativum L.) and shallot (A. ascalonicum L.) by meristem-tip culture. Journal of Horticultural Science 62, 221−220.
  113. C.J. & Jackeson J.F. (1986) An alternative procedure for the synthesis of double -stranded cDNA for cloning in phage and plasmid vectors. In: DNAcloning: a practical approach. I.(Ed. by Glover D.M.) IRL Press Limited. Oxford, 1986.
  114. Waye M.M.Y., Yerhoeyen M.E., Jones P.T. & Winter G. (1985) EcoK selection vectors for shootgun cloning into M13 and deletion mutagenesis. Nucleic Acids Research 13, 23, 8560−8571.
  115. H., Haeckel P. & Peitzner A.J.P. (1992) Journal of Virology J., 3909−3912.
  116. J.H. & Mills P.R. (1993) 3'terminal gene expression of potato virus S. Abstracts of the IX International congress of virology, Glasgow, Abstract P61−13.
  117. C. & Milne R.G. (1981) Tha Carlaviruses. In: Handbook of Plant Virus Infection and Comparative Diagnosis (Ed. by E. Krstak), pp 695−720. Elsevier/North Holland, Amsterdam.
  118. H.G. (1965) Die Proteinstruktur der Defektmutante PM2 des Tabakmosaikvirus. Z. ind. Abst. Vererbungslehre 97,297−304.
  119. K.A., Bancroft J.B. & Mackie G.A. (1992) Mutagenesis of hexanucleotide sequence conserved in potexvirus RNAs. Virology 189, 817−820.
  120. K.A., & Mackie G.A. (1990) Control and expression of 3' open reading frames in clover yellow mosaic virus. Virology 179, 576−584.
  121. Woo Lee Y., Yamazaki S., Osaki T. & Inouye T. (1979) Two elongated viruses in garlic, garlic latent virus and garlic mosaic virus. Ann. Phytopath. Soc. Japan 45, 727−734.
  122. Z. & Lommel S.A. (1989) The complete nucleotide sequence and genome organisation of red clover necrotic mosaic virus RNA-1. Virology 171, 543 554.
  123. Xiong Z., Kim K.H., Kemdall T.L. & Lommel S.A. (1993) Synthesis of the putative red clover necrotic mosaic virus polymerase by ribosomal frameshifting in vitro. Virology 193, 213−221.
  124. K., Sakai J. & Hanada K. (1996) Characterization of a New Virus from Garlic (Allium sativum L.), Garlic Mite-borne Mosaic Virus. Ann. Phytopathool. Sooc. Jpn. 62, 483−489.
  125. S.K., Kanyuka K.V. & Levay K.E.(1991) The genome organisation of potato virus M RNA. Journal of General Virology 72,9−14.
  126. S.K., Hickey C.M. & Lomrael S.A. (1995) Mapping of the Red Clover Necrotic Mosaic Virus Subgenomic RNA. Virology 216, 407−410.
Заполнить форму текущей работой