Взаимодействие онкогенов и регуляторных генов в клетках, трансформированных вирусом саркомы Рауса

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Взаимодействие онкогенов и регуляторных генов в клетках, трансформированных вирусом саркомы Рауса (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Содержание

I. Литературный обзор
- 1. 1. Семейство G-белков
- 1. 1. Строение классических G-белков
- 1. 2. Участие G-белков в образовании вторичных посредников
- 1. 3. Строение и функции фосфолипаз
- 1. 4. Семейство малых G-белков белков
- 1. 2. Семейство протеинтирозинкиназ Src. '
- 2. 2. Доменная структура белка Src и функциональное значение каждого домена
- 2. 3. Различие в структуре вирусного и клеточного Src белков
- 2. 4. Регуляция Src киназ
- 1. 3. Пути передачи сигналов в клетках и участие в них Src и малых ГТФ-аз
- 3. 1. Общая схема передачи сигналов через Src и малые ГТФ-азы
- 3. 2. Сеть взаимодействий малых ГТФ-аз
- 3. 3. Влияние мутаций р21 ГТФ"аза на выбор пути сигнала в клетке
- 3. 4. Участие тирозинкиназы Src в сигнальных каскадах
- 3. 5. Участие тирозинкиназы Src в трансформации
II. Материалы и методы
- II. 1. Использованные материалы
- 11. 2. Выделение нуклеиновых кислот
- 11. 3. Электрофорез нуклеиновых кислот
- 11. 4. Гибридизация ДНК или РНК иммобилизованных на фильтрах
- 11. 5. Молекулярное клонирование
- 11. 6. Растровая (сканирующая) электронная микроскопия (РЭМ)
II. 7 Выделение и анализ белковой фракции клеток
И.8. Исследование фосфолипазной активности srPLA
- 11. 9. Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
- 11. 10. Секвенирование
III. Результаты
- III. 1. Общая характеристика использованной системы клеток. 76 111.2.1. Трансфекция плазмид и описание биологических свойств полученных клеточных линий
  - 111. 2. 2. Морфология клеток
  - 111. 2. 3. Исследование интеграции трансфицированных генов
  - 111. 2. 4. Исследование экспрессии интегрированных генов. 88 III.3. Исследование белков, потенциально способных взаимодействовать с p60v"irc
  - 111. 3. 1. Теоретические основы метода двойных гибридов
  - 111. 3. 2. Фосфолипаза srPLA
  - 3. 2. 1. Анализ последовательности srPLA
  - 3. 2. 2. Транскрипция РНК SrPlA2 в различных клеточных линиях
  - 3. 2. 3. Взаимодействие in vitro srPLA2 и v-Src
  - 3. 2. 4. Изучение фосфолипазной активности srPLA
  - 111. 3. 3. Последовательность vseap
  - 3. 3. 1. Анализ ДНК-последовательности vseapl
  - 3. 3. 2. Трансляция последовательности vseapl. 119 3.3.3 Экспрессия vseapl в различных клеточных линиях
IV. Обсуждение
V. Выводы

В настоящее время считается признанным, что рак — это генетическая болезнь, связанная с потерей, повреждением, активацией или привнесением извне определенных генов. Фенотипическим проявлением этих генетических нарушений является появление клонов клеток с новым митотическим индексом, высокой частотой аномальных митозов и атипией, проникающих в окружающую строму и сосуды, в результате чего образуются опухоли и метастазы. Эти признаки указывают на нарушения в контроле клеточного цикла.

В норме важнейшие процессы жизнедеятельности клетки (такие как деление и рост, перестройка цитоскелета и движение, реакция на стресс) регулируются с помощью различных белков сигнальных систем. Гены, кодирующие белки сигнальных систем, запускающих деление клетки, являются потенциальными онкогенами. Гены, препятствующие вступлению клеток в митоз — гены-супрессоры опухолевого роста или антионкогены.

В цепь передачи сигнала входят следующие важные компоненты: сигнальные молекулырецепторыфосфорилирующие (киназы) или дефосфорилирующие белки, адаптерные белки (не обладающие ферментативной активностью, связывающие белки). Заканчивается такая цепь в клеточном ядре. Там происходит активация факторов транскрипции, что в конечном итоге приводит к синтезу белков, необходимых для ответной реакции. При повреждении или нерегулируемой активации генов, отвечающих за любой из компонентов этой цепи, может происходить трансформация клеток.

В организме существует система, противостоящая превращению нормальной клетки в опухолевую. Это система «проверки клеточного цикла». На определенных этапах клеточного цикла существуют «точки проверки», при прохождении которых специальные белки определяют, все ли в клетке в порядке и готова ли она к переходу в следующую фазу цикла. Гены, кодирующие белки, помогающие клетке беспрепятственно пройти через цикл, выступают в роли онкогенов. Гены, кодирующие белки, которые блокируют прохождение клетки через точки проверки, выступают в роли генов супрессоров опухолевого роста.

В норме при повреждении ДНК запускается механизм репарации. Но, если число нарушений слишком велико или репарация не происходит, то клетка вступает в апоптоз — «программированную смерть» — мощный защитник от превращения нормальной клетки в раковую. Гены, определяющие запуск апоптоза и снижающие, таким образом, вероятность полявления генетических нарушений относятся к генам супрессорам опухолевого роста.

Различные нозологические формы онкологических заболеваний характеризуются определенным спектром генетических нарушенийразличными нарушениями онкогенов и антионкогенов — т. е. имеют свой «генетический портрет», который и определяет свойства опухоли.

Для понимания связи определенных генетических нарушений с соответствующими характеристиками опухолевых клеток большое значение приобрели методологические подходы, позволяющие создть различные экспериментальные модели для исследований in vitro механизмов взаимодействия и функционирования продуктов онкогенов. К таким экспериментальным моделям относятся клетки различных линий, в геном которых вводятся исследуемые генетические агенты: онкогены, антионкогены, вирусные гены и другие последовательности, продукты которых, различным образом изменяя звенья в цепи передачи сигналов, влияют на функциональное состояние клеток.

Одним из особенно опасных свойств опухолей является их способность к метастазированию. Гены, отвечающие за этот процесс, исследованы значительно хуже, чем гены, вызывающие трансформацию. Метастазирование состоит из последовательно связанных между собой этапов преодоления защитных барьеров на пути злокачественных клеток. Наиболее продуктивным подходом для выявления и изучения «генов метастазирования» является анализ клеточных линий, близких по происхождению и, следовательно, имеющих общий генетический статус, но различающихся по способности к метастазированию.

Подобная система клеточных линий была получена в лаборатории противоопухолевого иммунитета НИИ канцерогенеза ОНЦ РАМН. Это линии эмбриональных фибробластов сирийского хомячка, трансформированные in vitro вирусом саркомы Рауса. Все линии высокотуморогенны, но отличаются по спонтанной метастатической активности: три из них были высокометастазирующими, а одна — низкометастазирующей [Deichman GI et al., 1989]. Результаты исследования структуры провирусов из этих линий указывают, что вероятной причиной различий метастатической активности этих клеток являются различия в структуре онкогенов v-src, интегрированных в геном этих линий (лтсНМ у высокометастазирующих линий, лтсЬМ у низкометастазирующей). Наиболее существенные замены, различающие эти изоформы онкогена v-src, локализованы в v-src специфическом С-концевом домене белка [TatosyanAG et al, 1996]. Подробнее свойства этих клеток описаны в разделе «Результаты» .

Метастатические свойства этих линий коррелируют с двумя параметрами: устойчивостью к перекиси водорода (Н202к), цитотоксическому продукту активированных макрофагов, и способностью к секретированию простагландина Ег (PGES) в ответ на контакт с натуральными киллерами (NK) [Deichman GI et al., 1989]. Эти свойства косвенно указывают на способность этих клеток противостоять защитным механизмам организма, основанным на использовании активных форм кислорода.

Была предпринята попытка изменить метастатические свойства трансформированных v-src клеток путем введения в них онкогена другого семейства — N-ras. Онкогены N-ras и v-src относятся к различным классам. Оба эти онкогена известны своей способностью к трансформации in vivo и in vitro, а также экспрессией в опухолях различного происхождения. В результате был получен ряд линий клеток, которые являются новой экспериментальной моделью, позволяющей исследовать различные аспекты «взаимодействий» этих онкогенов в качестве отдельных звеньев в цепи передачи сигналов в трансформированной клетке. Известно, что активированный р21ras способен изменять уровень экспрессии тех или иных генов [Grand RJ, Owen D, 1991; Sistonen L et al, 1989]. Вызываемые геном ras изменения, приводящие к неопластической трансформации, связаны с модулированием им транскрипционной активности промоторов многих генов, отвечающих за контроль клеточного роста и регуляцию метаболизма [Geiser AG et al, 1991]. Кроме того, активированные продукты генов ras могут влиять на промоторы онкогенных вирусов, в частности, вируса полиомы [Satake М et al., 1988], а также LTR эндогенных ретротранспозонов [Gallien et. al, 1991].

Онкобелок рр6(Ггс является протеинкиназой и связывается с различными клеточными белками, активируя или подавляя пути передачи сигнала к ядру клетки. Можно предположить, что из-за аминокислотных замен, которыми различаются изоформы v-src, спектр клеточных белков, связываемых SrcHM и SrcLM, не одинаков. Один из подходов к выявлению сигнальных путей, в которые вовлечены изоформы v-Srcидентификация белковых субстратов, дифференциально связывающихся с SrcHM и SrcLM методом двойных гибридов. В результате скрининга, проведенного этим методом, О. М. Мизениной были идентифицированы последовательности ДНК, кодирующие белковые продукты, способные взаимодействовать с белком рр62 v~'STcHM через его С-концевой участок.

Целью данной работы являлась характеристика структуры и экспрессии онкогенов (v-src и N-ras), определяющих биологические свойства клеток данной модельной системы, а также выяснение.

I. Литературный обзор Введение.

Способность опухолевой клетки к метастазированию зависит от многих ее свойств: скорости роста, адгезивности, подвижности, устойчивости к системам защиты организма, секреции протеолитических ферментов и эндогенных факторов, способности к деформации.

Процесс метастазирования состоит из нескольких этапов. Он начинается с инвазии окружающей нормальной стромы одиночной опухолевой клеткой с повышенной подвижностью и/или группой клеток из первичной неоплазии. После того как, такая клетка проникает в кровеносное или лимфатическое русло, она переносится током крови и должна противостоять специфической и неспецифической системам защиты организма. Далее клетки задерживаются в капиллярном русле органа или дренажной системе лимфатического узла. И этот процесс зависит от представленных на поверхности эндотелия рецепторов и способности связываться с ними метастазирующей клетки. Проникновение в паренхиму органа идет по механизму инвазии. В органе клетка должна размножиться и создать микрометастаз. Дальнейший рост метастаза требует развития новой системы капиллярного кровоснабжения.

Сигналы на всех этапах метастазирования опухолевые клетки получают не только от взаимодействия рецепторов с цитокинами, но и в результате большого количества адгезивных взаимодействий. Клетки контактируют с нерастворимыми компонентами базальной пластинки (фибронектин, коллаген, ламинин и др.) и внеклеточного матрикса, т. е. с молекулами клеточной поверхности различных нормальных клеток (кровяными пластинками, лимфоцитами, эндотелиальными клетками и др.). Эти взаимодействия играют важную роль в том, что опухолевые клетки различного тканевого происхождения предпочитают определенные оккупируемые ткани и органы при метастазировании.

На разных этапах метастазирования включаются разные сигнальные пути в клетке. Но при всем разнообразии сигнальные пути имеют общие принципы работы и общие компоненты, разбору которых (в некоторой степени) посвящен данный обзор литературы.

Последовательность передачи сигнала в клетке имеет следующие этапы:

1. присоединение лиганда и, часто, кластеризация рецепторных молекул;

2. конформационные изменения, или аутофосфорилирование рецептора;

3. вторичный мессенджер или G-белки;

4. каскад киназных и фосфатазных реакций;

5. активация транскрипционного фактора;

6. синтез мРНК или сборка цитоскелета или запуск пролиферации, т. е. — запуск каскада «ответа».

Взаимодействие рецептора с лигандом — это обратимая реакция. Присоединение лиганда не ковалентное и такая система очень зависит от колебаний концентрации рецептора и лиганда. Рецепторы могут распознавать ничтожно малое количество сигнальных молекул (наномоли или менее), т.к. обладают высокой аффинностью. Очень многие рецепторы для связывания с лигандом димеризуются или олигомеризуются. Эта система не приспособлена для процессов, требующих реакции по типу «все или ничего», которая важна для запуска многих процессов в клетке.

В клетках есть два механизма, обеспечивающих быстрое переключение белков из одного состояния в другое — это белок-фосфорилирующие циклы и циклы, катализируемые ГТФ-зависимыми регуляторными белками, обладающими ГТФ-гидролизующей активностью, — G-белками (рис. 1). В этих циклах прямая и обратная реакции разобщены. Концентрация АТФ, АДФ и фосфата в клетке постоянна и такова, что протеинкиназы будут катализировать только фосфорилирование, а фосфатазы — только дефосфорилирование. Такой способ позволяет быстро переключать направление реакции, усиливать сигнал и обладает высокой чувствительностью. Фосфорилирующие циклы, в отличие от циклов G-белков (для которых это пока неизвестно), позволяют иметь систему разветвления по пути передачи сигнала, или, наоборот, на одну молекулу могут прийти сигналы от разных молекул, что делает возможным регуляцию по типу обратной связи ингибированием. Это возможно потому, что протеинкиназы могут иметь несколько различающихся сайтов фосфорилирования и взаимодействия с белками мишенями.

А) Присоединение лиганда к рецептору.

Protein + ligand^-Protein, ligand.

Б) Цикл фосфорилирования белков АТР ADP.

Protein Р-Protein.

-^^ мо protein phosphatase 2.

С) Цикл — G-белков.

GTP «GDP.

G protein. GDP G protein.GTP.

Pi"^GAP H2° Рис. 1 Схемы циклов и взаимодействий, в результате которых происходит передача сигнала в клетке [ed. Harddie G, Hanks. 1998].

В циклах G-белков главную роль играет G-белок, который обладает ГТФ-гидролизующей активностью, т. е. превращает ГТФ в ГДФ, отщепляя у-фосфат. G-белок гидролизует связанный ГТФ за секунды и затем возвращается к занятому рецептору, чтобы вновь активироваться. Для активации необходим гуанин обменивающий фактор (GEFguanine exchange factor), который катализирует замену нуклеотида ГДФ на ГТФ в G-белке, в отличие от протеинкиназ, которые катализируют перенос фосфата с АТФ на аминокислотный остаток в белке. Занятый рецептор может активировать много G-белков. Подробно свойства цикла будут описаны далее.

Лигандами могут быть и молекулы внеклеточного матрикса, и молекулы поверхности клеток, и циркулирующие факторы. К циркулирующим митогенным агентам относятся факторы роста и регуляторные пептиды (например, инсулин). Эти соединения регулируют рост клеток в различных условиях, особенно в эмбриогенезе, а во взрослом организме при пролиферации, которая является частью иммунного ответа или репарации.

Ответ на действие гормона или нейромедиатора обычно является кратковременным даже при постоянном присутствии лиганда, т. е. рецептор отключается. Это явление называется десенсибилизацией. В животных клетках решающую роль в десенсибилизации играет фосфорилирование рецепторов по специфичным сайтам специальными киназами. Часто киназа фосфорилирует только комплекс рецептор/лиганд, после чего образуются везикулы мембраны, на которой был рецептор, т. е. происходит интернализация фосфорилированного рецептора путем эндоцитоза. В эндоцитозных везикулах находится фосфатаза, которая отщепляет фосфатную группу (ы) и регенерирует активную форму рецептора, возвращающегося к плазматической мембране. Реакции аутофосфорилирования рецепторов, обладающих тирозинкиназной активностью, как правило, являются стимуляторными.

Связывание рецептора с лигандом приводит к кластеризации рецепторных молекул, конформационным изменениям или аутофосфорилированию рецептора и далее может запускать сразу каскад киназных-фосфатазных реакций, или является причиной изменений в концентрации внутриклеточных сигнальных молекул (вторичных мессенджеров). Известными или вероятными вторичными мессенджерами являются: циклические сАМФ и сГМФ, инозитол-трифосфат (IP3), фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфат (PIP3), циклическая АДФрибоза (cADPR), арахидоновая кислота (АА) и диацилглицерол (DAG). Са также можно назвать вторичным мессенджером. К вторичным мессенджерам относятся и G-белки, представителем которых является белок N-Ras.

В экспериментальных исследованиях, использующих сравнительные методы для выяснения механизмов метастазирования, одним из главных затруднений является то, что опухоли представляют собой гетерогенные субпопуляции клеток, различающихся по таким характеристикам, как скорость роста, рецепторы поверхности, антигенный и иммуногенный статус, чувствительность к цитотоксическим агентам, способность к инвазии и метастазированию. Тем не менее, получены стабильные высокотуморогенные клеточные линии, метастатическая активность которых остается постоянной в течение длительного периода времени. Клеточная система, использованная в нашей работе, была получена при трансдукции RSV в первичные эмбриональные фибробласты. В последствии, в результате внесения в эти клетки дополнительного активного онкогена N-ras, был обнаружен феномен модуляции экспрессии онкогена v-src и изменение ряда биологических параметров трансформированных клеток.

В обзоре будут рассмотрены строение и механизмы работы онкобелков Src и Ras и их участие в различных путях передачи сигнала в клетках.

Сигнальные пути, в которых участвуют продукты генов src и N-ras, очень разнообразны и молекулы эти включаются на разных стадиях сигнальных каскадов. Обычно G-белки работают «выше» по пути передачи сигнала в клетке по сравнению с нерецепторными фосфотирозинкиназами, к которым относится Src, и служат активаторами вторичных посредников или являются сами вторичными посредниками. Ras-похожие ГТФ-связывающие белки также относятся к суперсемейству G-белков, но обладают большей независимостью от рецептора и относятся к суперсемейству малых G-белков.

V. Выводы:

1. На модельной системе клеток, трансформированных онкогеном v-src и дополнительно трансфицированных онкогеном N-ras, выявлены следующие формы функциональной зависимости активности двух онкогенов: а) снижение экспрессии какого-либо из онкогеновб) полное подавление экспрессии одного из геновв) деления какого либо из онкогенов;

Одновременная высокая активность двух онкогенов не обнаружена.

2. Методом двойных гибридов выявлены два новых гена, кодирующих белки — потенциальные субстраты онкобелка pp62vs. rPLA2 (src-associated phospholipase А2).- относящаяся к семейству фосфолипаз группы IIA (р1А2) и vseapl (v-src-end-associated-protein-клон 1) из стресс-индуцированных генов семейства gadu.

Q rrn лттл Л лтrtm лг" лттттт т v тггглпгтллчг d-t*LJT, А л Лттплт гмлтт л от л о т" ггт>т т-%.г Ллтглчг* j. LJ ipanw/ij/upivmpuoanriDiA JJIV о/1 jujtli uvna^J/ivi'iDavIVA D ДЬ^Л vpv/ршаА. nШ/ТПwтг1^тлихп.ш тт^ттттт^гпги^хтот/гтг с */rr%7Tf^wTTamjnfT МЙГЛПМ пяиши 1 7 тгТТя w jt/AJ-J ЛX AJL"V 1VX V L V/J, UI VV V timpJ. AVXl IflUVWXAj Л. $ АЪ^М1 «А г, екпетиповяшп. тй чпеттьтй бетток с. массой 14 кГГ.

——г——J——————X—————————————- - —Г-1.

4. Белок srPLA2 взаимодействует с онкобелком Src и фосфорилирован по тирозину.

5. В трансформированных v-src клетках последовательность vseapl транскрибируется в виде двух типов РНК: 0,9 т. н. (основной) и 3.1 т.н. (минорный). В клетках с подавленной экспрессией v-src количество РНК 3.1 т гт литгмлаттл х. хх. viumvvuu.

6. Пептид в 8 аминокислот, кодируемый vseap 7, взаимодействует с Сконцом белка v-Src.

Показать весь текст

Список литературы

Албертс Б., Брей Д., Льюис Дж., Рэфф М., Роберте К., Уотсон Дж. Молекулярная биология клетки. Т. 2. М., «Мир», 1994, 359−371.
Брашишките Д.А., А.Г. Татосян, Ф. Л. Киселев, Е.А, Кашлева, Г. И. Дейчман Различия в распределении провирусов в низко- и высокометастатических вариантах клеток хомяков, трансформированных вирусом саркомы Рауса. Мол.биол., 1989, 23.
Геннис Р. «Биомембраны». М., «Мир», 1997
Abo A, Pick Е, Hall A, Totty N, Teahan CG, Segal AW — Activation of the NADPH oxidase involves the small GTP-binding protein p21 rac 1. Nature, 1991,353,668−70.
Aftab DT, Kwan J, Martin GS. Ras-independent transformation by v-Src. Proc Natl Acad Sci USA. 1997, 7, 3028−33.
Blom N, Gammeltoft S and Brunak S. Sequence and structure-based prediction of eukaryotic protein phosphorylation sites. J. Mol.Biol., 1999, 294, 1351
Bolen J. Nonreceptor tyrosine proteine kinases. Oncogerxi, 1993, 8, 20 252 031.
Bowman T, Garcia R, Turkson J, Jove R. STATs in oncogenesis. Oncogene. 2000, 19(21), 2474−88.
Bromberg JF, Horvath CM, Besser D, Lathem WW, Darnell JE Jr. Stat3 activation is required for cellular transformation by v-src. Mol Cell Biol, 1998, 18,2553−8.
Bromberg JF, Wrzeszczynska MH, Devgan G, Zhao Y, Pestell RG, Albanese C, Darnell JE Jr. Stat3 as an oncogene. Cell, 1999, 98(3), 295−303.
Brown MT, Cooper JA. Regulation, substrates and functions of src. Biochim BiophysActa, 1996, 1287(2−3), 121−49.
Brugge JS, Erikson RL. Identification of a transformation-specific antigen induced by an avian sarcoma virus. Nature, 1977, 269, 346−8.
Buss JE, Kamps MP, Gould K, Sefton BM. The absence of myristic acid decreases membrane binding of p60src but does not affect tyrosine protein kinase activity. J Virol., 1986, 58, 468−74.
Chackalaparampil I, Shalloway D. Altered phosphorylation and activation of pp60c-src during fibroblast mitosis. Cell, 1988, 52, 801−10.
Chant J, Corrado K, Pringle JR, Herskowitz I. Yeast BUD5, encoding a putative GDP-GTP exchange factor, is necessary for bud site selection and interacts with bud formation gene BEM1. Cell, 1991, 65, 1213−24.
Cicchetti P, Mayer В J, Thiel G, Baltimore D. Identification of a protein that binds to the SH3 region of Abl and is similar to Bcr and GAP-rho. Science, 1992, 257, 803−6.
Collett MS, Brugge JS, Erikson RL. Characterization of a normal avian cell protein related to the avian sarcoma virus transforming gene product. Cell, 1978, 15, 1363−9.
Cooper JA and Howell B. The when and how of Src regulation. Cel, 1993, 73, 1051−1054.
Cooper JA, Esch FS, Taylor SS, Hunter T. Phosphorylation sites in enolase and lactate dehygrogenaze utilized by tyrosine protein kinases in vivo and in vitro. J. Biol. Chem, 1984, 259, 7835−41.
Cooper JA, Gould KL, Cartwright CA, Hunte T. Tyrosine 527 is phosphorylated in pp60°"src: implications for regulation. Science, 1986, 231,1431.1434.
Cotton PC and Brugge JS. Neural tissues express high levels of the cellular src gene product pp60c-src. Mol.Cell. Biol. 1983, 3, 1157−1162,
Courtneidge SA. Activation of pp60c"src kinase by middle T antigene binding or by dephosphorylation. EMBO J. 1985, 4, 1471−77.
Courtneidge SA, Dhand R, Pilat D, Twamley GM, Waterfield MD, Roussel MF. Activation of src-family kinases by CSF-1, and their association with its receptor. EMBO J., 1993, 12, 943−950.
Crawford DR, Scools G, Salmon S, Davies K. Hydrogen peroxide induces the expression of adaptl5, a novel RNA associated with polysomes in hamster HA-1 cells. Arch Biochem Biophys., 1996, 325,256−64.
Cross FR, Garber EA, Hanafusa H. N-terminal deletions in Rous sarcoma virus p60src: effects on tyrosine kinase and biological activities and on recombination in tissue culture with cellular src gene. Moll. Cell. Biol., 1985, 5, 2789−95
Cross FR, Garber EA, Pellman D, Hanafusa H. A short sequence in the p60src N terminus is required for p60src myristylation and membrane association and for cell transformation. Moll. Cell. Biol., 1984, 4, 1834−42.
DeClue JE, Martin GS. Linker insertion-deletion mutagenesis of the v-src gene: isolation of host- and temperature-dependent mutants. J Virol. 1989, 63(2), 542−54.-
Deichman GI, Kashkina LM, Mizenina OA, Gorojanskaya EG, Nikiforov MA, Gudkov AV, Dyakova NA, Komelkov AV, Prilutskaya MO, Kushlinsky NE and Tatosyan AG. Int. J. Cancer, 1996, 66, 747−752.
Dennis EA. Regulation of eicosanoid production: role of phospholipases and inhibitors. Bio/Technology, 1987, 5, 1294−1300.
Dennis EA. Diversity of group types, regulation, and function of phospholipase A2. J. Biol. Chem., 1994, 269, 13 057−13 060.
Ellis C, Moran M, McCormick F and Pawson T. Phosphorylation of GAP and GAP-associated proteins by transforming and mytogenic tyrosine kinases. Nature, 1990, 343, 377−380.
Falcone G, Tato F and Alema S. Distinctive effects of the viral oncogenes myc, erb, fps, and src on the differentiation program of quail myogenic cells. PNAS USA, 1985, 82, 426−430.
Fanger GR, Johnson NL, Johnson GL. MEK kinases are regulated by EGF and selectively interact with Rac/Cdc42. EMBOJ. 1997, 16(16), 4961−72.
Fields S. and Song O. A novel genetic system to detect protein-protein interactions. Nature, 1989, 340, 245−246.
Fornase AJ, Alamo I, Hollander MC. DNA damage-inducible transcrips in mammalian cells. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 1988, 85, 8800−8804
Forster S, Ilderton E, Norris JF, Summerly R and Yardley HJ. Characterization and activity of phospholipase A2 in normal human epidermis and in lesion-free epidermis of patients with psoriasis or eczema. Br. J. Dermatol, 1985, 112, 135−147
Geiser AG, Kim SJ, Roberts AB, Sporn MB. Characterization of the mouse transforming growth factor-beta 1 promoter and activation by the Ha-ras oncogene. Mol Cell Biol, 1991, 11(1), 84−92.
Feng GS, Pawson T. Phosphotyrosine phosphatases with SH2 domains: regulators of signal transduction. Trends Genet., 1994, 10(2), 54−58.
Gibbs JB, Maarshall MS. The ras oncogene~an important regulatory element in lower eucaryotic organisms. Microbiol Rev., 1989, 53(2), 171−185.
Gibbs JB. Ras C-terminal processing enzymes — new drug targets? Cell, 1991 65(1), 1−4.
Golden A, Nemeth SP, and Brugge JS. Blood platelets express high levels of the pp60c-src-specific tyrosine kinase activity. Proc.Natl. Acad. Set USA, 1986, 853, 852−856.
Golden A, Brugge JS, Shattil SJ. Role of platelet membrane glycoprotein Ilb-Illa in agonist-induced tyrosin phosphorylation of platelet proteins. J. Cell. Biol., 1990, 11,3117−3127.
Grand RJ, Owen D. The biochemistry of ras p21. Biochem J., 1991, 279, 609−31.
Fanger GR, Gerwins P, Widmann C, Jarpe MB, Johnson GL. MEKKs, GCKs, MLKs, PAKs, TAKs, and tpls: upstream regulators of the c-Jun amino-terminal kinases? Curr Opin Genet Dev, 1997, 7(1), 67−74.
Ferrell JE, Martin GS. Tyrosine-specific protein phosphorylation is regulated by glycoprotein Ilb-IIIa in platelets. Proc.Natl. Acad. Sci. USA, 1989, 86, 2234−2238.
Hancock JF, Cadwallader K, Marshall CJ. Methylation and proteolysis are essential for efficient membrane binding of prenylated p21K-ras (B). EMBOJ., 1991, 10(3), 641−6.
Hancock JF, Magee Al, Childs JE, Marshall CJ. All ras proteins are polyisoprenylated but only some are palmitoylated. Cell, 1989, 57, 1167−77.
Hancock JF, Paterson H, Marshall CJ. A polybasic domain or palmitoylation is required in addition to the CAAX motif to localize p21ras to the plasma membrane. Cell, 1990, 63, 133−139.
Hanks SK, Quinn AM. Protein kinase catalytic domain sequence database: identification of conserved features of primary structure and classification of family members. Methods Enzymol. 1991, 200, 38−62.
Hunter T, Sefton BM. Transforming gene product of Rous sarcoma virus phosphorylates tyrosine. Proc Natl Acad Sci USA, 1980, 77, 1311−5.
Harddie G, Hanks S ed., The protein kinase Facts Book, Academic press London, 1998.
Hirai H, Varmus HE. Site-directed mutagenesis of the SH2- and SH3-coding domains of c-src produces varied phenotypes, including oncogenic activation of p60c-src. Mol Cell Biol, 1990 a, 10(4), 1307−18.
Hirai H, Varmus HE Mutations in sre homology regions 2 and 3 of activated chicken c-src that result in preferential transformation of ."mouse or chicken cells. Proc Natl Acad Sci USA, 1990 b, 87(21), 8592−6.
Hirai H, Varmus HE SH2 mutants of c-src that are host dependent for transformation are trans-dominant inhibitors of mouse cell transformation by activated c-src. Genes Dev, 1990 c, 4, 2342−52.
Holland J, Owens T. Signaling through intercellular adhesion molecule 1 (ICAM-1) in, а В cell lymphoma line. The activation of Lyn tyrosine kinase and the mitogen-activated protein kinase pathway. J Biol Chem, 1997, 272, 9108−12.
Hollander MC, Alamo I, Fornase AJ. A novel DNA damage-inducible transcript, gadd7, inhibits cell growth, but lacks a protein product. Nucleic Acids Research, 1996, 24, 1589−1593.
Iba H, Cross FR, Garber EA, Hanafusa H. Low level of cellular protein phosphorylation by non-transforming overproduced p60°"sro. Moll. Cell. Biol., 1985, 5, 1058−66.
Imamoto A, Soriano P. Disruption of the csk gene, encoding a negative regulator of Src family tyrosine kinases, leads to neural tube defects and eembryonic lethality in mice. Cell, 1993, 73.
Irby RB, Mao W, Coppola D, Kang J, Loubeau JM, Trudeau W, Karl R, Fujita DJ, Jove R and Yeatman TJ. Activating SRC mutation in a subset of advanced human colon cancers. Nat Genet, 1999, 21(2), 187−90.
Kamps MP, Sefton BM. Neither arginine nor histidine can carry out the function of lysine-295 in the ATP-binding site of p60src. Moll. Cell. Biol, 1986, 6, 751−57.
Kamps MP, Taylor SS, Sefton BM. Direct evidence that oncogenic tyrosine kinase and cyclic AMP-dependent protein kinases have homologous ATP-binding sites. Nature, 1984, 310, 589−592.
Kami R, Jove R, Levitzki A. Inhibition of pp60c-Src reduces Bcl-XL expression and reverses the transformed phenotype of cells overexpressing EGF and HER-2 receptors. Oncogene, 1999, 18(33), 4654−62.
Kmiecik ТЕ, Jonson PJ, Schalloway D. Regulation by the autophosphorylation site in overexpressed pp60c-src. Moll Cell. Biol, 1988, 8, 4541−4546.
Krasilnikov MA. Shatskaya VA. Shtutman M. Regulation of phospholipid turnover in hamster fibroblasts, transformed by oncogenes v-src and N-ras. Biochemistry (Moscow), 1995,59, 1315−1320.
Krueger JG, Garber EA, Goldberg AR, Hanafusa H. Changes in aminoterminal sequences of p60v"src lead to decreased membrane association and decreased in vivo tumorigenicity. Cell, 1982, 28, 889−896
Krueger JG, Wang E, Goldberg AR. Evidence that the src gene product of Rous sarcoma virus is membrane associated. Virology, 1980, 101, 25−40.
Kypta RM, Goldberg Y, Ulug ET and Courtheidge SA. Association between the PDGF receptor and members of the src family of tyrosine kinases. Cell, 1990, 62, 481−492.
Leto TL, Lomax KJ, Yolpp BD, Nunoi H, Sechler JM, Nauseef WM, Clark RA, Gallin JI, Malech HL. Cloning of a 67-kD neutrophil oxidase factor with similarity to a noncatalytic region of p60c-src.Science. 1990, 248, 727−30.
Linder ME and Burr JG. Nonmyristoylated p60v-src fails to phosphorylate proteins of 115−120 kDa in chicken embryo fibroblasts. Ph’AS USA, 1988, 85, 2608−2612.
Liu X, Marengere LE, Koch CA, Pawson T. The v-Src SH3 domain binds phosphatidylinositol 3'~kinase. Mol Cell Biol, 1993, 13,5225−32.
Loo WM, Berestecky JM, Kanemitsu MY and Lau AF. pp60src-mediated phosphorylation of connexin 43, a gap junction protein. J Biol Chem, 1995, 270(21), 12 751−61.
Lowenstein EJ, Daly RJ, Batzer AG, Li W, Margolis B, Lammers R, Ullrich A, Skolnik EY, Bar-Sagi D, Schlessinger J. The SH2 and SH3 domain-containing protein GRB2 links receptor tyrosine kinases to ras signaling. Cell, 1992, 70(3), 431−42.
Luban J, Goff S. The yeast two-hybrid system for studying protein-protein interactions. Curr Opin Biotechnol, 1995, 59−64.
Machesky LM, Hall A. Role of actin polymerization and adhesion to extracellular matrix in Rac- and Rho-induced cytoskeletal reorganization. J Cell Biol. 1997,138(4), 913−26.
Makowski L, Caspar DL, Phillips WC, Goodenoudh DA. Gap junction structures. J. Cell. Biol. 1977, 74, 629−645.
Manser E, Loo TH, Koh CG, Zhao ZS, Chen XQ, Tan L, Tan I, Leung T, Lim L. РАК kinases are directly coupled to the PIX family of nucleotide exchange factors. Mol Cell, 1998, 1(2), 183−92.
Marilyn D Resh Myristylation and halmitylation of Src family members: the fats of the metter. Cell, 1994, 76, 411−413
Marshall CJ. Ras effectors. Curr Opin Cell Biol, 1996, 8(2), 197−204.
Marshall CJ. Cell signalling. Raf gets it together. Nature, 1996, 383, 127−8.
Martin GS. The hunting of the Src. Nat Rev Mol Cell Biol, 2001, 2(6), 467−75.
Mayer В J, Hamaguchi M, Hanafusa H. A novel viral oncogene with structural similarity to phospholipase C. Nature, 1988, 332, 272−5.
McCormick F. How receptors turn Ras on. Nature, 1993, 363, 15−16.
Moodie SA and Wolfmann A. The 3Rs of life: Ras, Raf and growth regulation. Trends in genetics, 1994, 10, 44−48.
Moran MF, Koch С A, Anderson D, Ellis C, England L, Martin GS, Pawson T. Src homology region 2 domains direct protein-protein interactions in signal transduction. Proc Natl Acad Sci USA, 1990, 87(21), 8622−6.
Mukherjee, AB, MieleL, Pattabiraman N. Phospholipase A2 enzymes: regulation and physiological role. Biochem Pharmacol, 1994, 48(1), 1−10
Nada S, Yagi T, Takeda H, Tokunaga T, Nakagawa H, Ikawa Y, Okada M, Aizawa S. Constitutive activation of Src family kinases in mouse embryos that lack Csk. Cell, 1993,73
Nada S, Okada M, MacAuley A, Cooper JA, Nakagawa H. Cloning of a complementary DNA for a protein-tyro sine kinase «that specifically phosphorylates a negative regulatory site of p60c-src. Nature, 1991, 351, 6972.
O’Brien MC, Fukui Y, Hanafusa HActivation of the proto-oncogene p60c-src by point mutations in the SH2 domain. Mol Cell Biol, 1990, 10(6), 2855−62.
Okada M and Nakagawa H. A protein tyrosine kinase involved in regulation of pp60c-src function. J. Biol. Chem., 1989, 264, 200 886−20 893.
Okada M, Nada S, Yamanashi Y, Yamamoto T, Nakagawa H. CSK: a protein-tyrosine kinase involved in regulation of src family kinases. J. Biol. Chern., 1991,266, 24 249−24 252.
Okada M, Howell BW, Broome MA, Cooper JA. Deletion of the SH3 domain of Src interferes with regulation by the phosphorylated carboxyl-terminal tyrosine. J Biol Chem., 1993, 268(24), 18 070−5.
Olson MF, Ashworth A, Hall A. An essential role for Rho, Rac, and Cdc42 GTPases in cell cycle progression through Gl. Science, 1995, 269, 1270−2
Oppermann H, Levinson AD, Yarmus HE, Levintow L, Bishop JM. Uninfected vertebrate cells contain a protein that is closely related to the product of the avian sarcoma virus transforming gene (src). Proc Natl Acad Sci USA. 1979, 76(4), 1804−8.
Ostermeyer AG, Anderson SM. Induction of growth factor-independence and GM-CSF secretion by the v-src oncogene in murine myeloid cells does not require membrane association of pp60v-src.Exp Hematol, 1996, 24(2), 176 184.
Ozawa M, Ringwa M and Demler R. Uvomorulin-catenin complex formation is regulated by a specific domain in the cytoplasmic region of the cell adhesion molecule. Proc Natl Acad Sci USA, 1990, 87(11), 4246−50.
Parsons JT and Weber MJ. Genetics of src: structure and functional organization of a protein tyrosine kinase. Curr. Top. Microbiol. Immunol., 1989, 147, 79−127.
Patschinsky T, Hunter T, Esch FS, Cooper JA, Sefton BM. Analysis of the sequence of amino acids surrounding sites of tyrosine phosphorylation. Proc Natl Acad Sci USA, 1982, 79(4), 973−7.
Pawson T and Gish GD. SH2 andSH3 domains: from structure to function. Cell, 1992,71,359−362.
Pawson T. Protein modules and signalling networks. Nature, 1995, 373, 57 380.
Penuel E and Martin GS. Transformation by v-Src: Ras-MAPK and PI3K-mTOR mediate parallel pathways. Mo I Biol Cell, 1999, 10, 1693−703.
Purchio AF. Evidence that pp60src, the product of the Rous sarcoma virus src gene, undergoes autophosphorylation. J. Virol, 1982, 41, 1−7
Raymond VM and Parsons JT. Identification of an amino terminal domain required for the transforming activity of the Rous sarcoma virus src protein. Virology, 1987, 160, 400−10.
Ren R, Mayer BJ, Cicchetti P and Baltimore D. Identification of a ten-amino acid proline-rich SH3 binding site. Science, 1993, 259, 1157−1161.
Reynolds AB, Herbert L, Cleveland JL, Berg ST and Gaat JR. pl20, a novel substrate of proteine tyrosine kinase receptors and of p60v"src is related to cadherin-binding factors P-catenin, plakoglobin and armadillo. Oncogene 1992, 7, 2439−2445.
Rickles RJ, Botfield MC, Zhou XM, Henry PA, Brugge JS, Zoller MJ. Phage display selection of ligand residues important for Src homology 3 domain binding specificity. Proc Natl Acad Sci USA, 1995,92, 10 909−13.
Rous P. A sarcoma of the fowl transmissible by an agent separable from the tumour cells. J. Exp. Med., 1911,13, 397−411
Roussel RR, Brodeur SR, Shalloway D, Laudano AP Selective binding of activated pp60c-src by an immobilized synthetic phosphopeptide modeled on the carboxyl terminus of pp60c-src. Proc Natl Acad Sci USA, 1991, 88(23), 10 696−700.
Satake M, Furukawa К, Ito Y. Biological activities of oligonucleotides spanning the F9 point mutation within the enhancer region of polyomavirus DNA. J Virol, 1988, 62, 970−7.
Schlaepfer DD, Hanks SK, Hunter T, Geer P. Integrin-mediated signal transduction linked to Ras pathway by GRB2 binding to focal adhesion kinase. Nature, 1994, 372, 786−791.
Schroder T, Kivilaakso E, Kinnunen PK, Lempinen M. Serum phospholipase A2 in human acute pancreatitis. Scand. J. Gastroenterol, 1980, 15, 633−636.
Schwartzberg PL. The many faces of Src: multiple functions of a prototypical tyrosine kinase. Oncogene, 1998, 17, 1463−8.
Sefton BM, Trowbridge IS, Cooper JA, Scolnick EM. The transforming proteins of Rous sarcoma virus, Harvey sarcoma virus and Abelson virus contain tightly bound lipid. Cell, 1982, 31, 465−74.
Sefton BM, Hunter T, Beemon K, Eckhart W. EVidence that the phosphorylation of tyrosine is essential for cellular transformation by Rous sarcoma virus. Cell, 1980, 20, 807−816.
Segal J. Calmodulin modulates thymocyte adenylate cyclase activity through the guanine nucleotide regulatory unit. Mol Cell Endocrinol, 1989, 64(1), 95 103.
Shalloway D, Coussens P, Yaciuk P. Overexpression of the c-src protein does not induce transformation of NIH 3T3 cells. PNAS USA. 1984, 81, 7071−75.
Sicheri F, Kuriyan J. Structures of Src-family tyrosine kinases. Curr Opin Struct Biol, 1997, 7, 777−85.
Sistonen L, Holtta E, Lehvaslaiho H, Lehtola L, Alitalo K. Activation of the neu tyrosine kinase induces the fos/jun transcription factor complex, the glucose transporter and ornithine decarboxylase. J Cell Biol, 1989, 109(5), 1911−9.
Smith MR, DeGudicibus SJ, Stacey DW. Requirement for c-ras proteins during viral oncogene transformation. Nature, 1986, 320, 540−3.
Snyder MA, Bishop JM, McGrath JP, Levinson AD. A mutation at the ATP-binding site of pp60v"src abolilishes kinase activity, transformation, and tumorigenicity. Mol. Cell. Biol, 1985, 5, 1772−1779.
Soriano P, Montgomery C, Geske R, and Brandley A. Targeted disruption of the c-src proto-oncogene leads to osteopetrosis in mice. Cell, 1991, 64, 693 702.
Souyri MC, Koehne F, CTDonnell PV, Aldrich TH, Furth ME, Fleissner E. Biologikal Effects of a murine retrovirus carrying an activated N-ras gene of human origin. Virology, 1987, 158, 69−78.
Stehelin D, Varmus H, Bishop J, Vogt P. DNA related to the transforming gene (s) of avian sarcoma viruses is present in normal avian DNA. Nature, 1976, 260, 170−173.
Sten PL, Vogel H, Soriano P. Combined deficiencies of Src, fyn and Yes tyrosine kinases in mutant mice. Genes Dev, 1994, 8, 1999−2007.
Stokoe D, McCormick F. Activation of c-Raf-1 by Ras and Src through different mechanisms: activation in vivo and in vitro. EMBO J., 1997, 16(9), 2384−96.
Sugimoto Y, Whitman M, Cantley LC, Erikson RL Evidence that the Rous sarcoma virus transforming gene product phosphorylates phosphatidyl inositol and diacylglycerol. Proc Natl Acad Sci USA, 1984, 81(7), 2117−21.
Superti-Furga, G, Courtneidge SA. Structure-function relationships in Src family and related protein tyrosine kinases. Bioessays, 1995, 17(4), 321−30.
Taniguchi T. Cytokine signaling through nonreceptor protein tyrosine kinases. Science. 1995,268,251−5.
Takekawa M, Posas F, Saito H. A human homolog of the yeast Ssk2/Ssk22 MAP kinase kinase kinases, MTK1, mediates stress-induced activation of the p38 and JNK pathways. EMBO J., 1997, 16(16), 4973−82. *
Takey Т., Hanafusa H. Structure and sequence of the cellular gene homologous to the RSV src gene and the mechanism for generating the transforming virus. Cell 1983, 32, 881−90.
Tang Y, Chen Z, Ambrose D, Liu J, Gibbs JB, Chernoff J, Field J. Kinase-deficient Pakl mutants inhibit Ras transformation of Rat-1 fibroblasts. Mol Cell Biol, 1997, 17(8), 4454−64.
Tatosyan A, Shtutman M, Topol L, Kisseljova N, Musatkina E, Deichman G. Selective integration of virus genome in high and low metastatic transformed cell lines. Modern trends in human leukemia, 1991, 9, p 235−238.
Thomas SM, Brugge JS. Cellular functions regulated by Src family kinases. Annu Rev Cell Dev Biol, 1997, 13, 513−609.
Tischfield JA. A reassessment of the low molecular weight phospholipase A2 gene family in mammals. J Biol Chem., 1997, 272(28), 17 247−50.
Ushiro H, Cohen S. Identification of phosphotyrosine as a product of epidermal growth factor-activated protein kinase in A-431 cell membranes. J Biol Chem, 1980, 255(18), 8363−5.
Vadas P. Elevated plasma phospholipase A2 levels: correlation with the hemodynamic and pulmonary changes in gram-negative septic shock. J Lab Clin Med, 1984, 104(6), 873−81.
Verderame MF, Kaplan JM, Varmus HE. A mutation in v-src that removes a single conserved residue in the SH-2 domain of pp60v-src restricts transformation in a host-dependent manner. J Virol, 1989, 63(1), 338−48.
Vojtek AB, Hollenberg SM, Cooper JA. Mammalian Ras interacts directly with the serine/threonine kinase Raf. Cell, 1993, 74(1), 20 544.
Wages DS, Keefer J, Rail ТВ, Weber MJ. Mutations in the SH3 domain of the src oncogene which decrease association of phosphatidylinositol З'-kinase activity with pp60v-src and alter cellular morphology. J Virol, 1992, 66(4), 1866−74.
Weeks MO, Hager GL, Lowe R, Scolnick EM. Development and analysis of a transformation-defective mutant of Harvey murine sarcoma tk virus and its gene product. J Virol, 1985, 54(2), 586−97.
West CM, Boettiger D. Selective effect of Rous sarcoma virus src gene expression on contractile protein synthesis in chick embryo myotubes. Cancer Res, 1983, 43, 2042−2048.
Williams LT. Signal transduction by the platelet-derived growth factor receptor. Science, 1989, 243, 1564−1570.
Kypta RM, Goldberg Y, Ulug ET, Courtheidge SA. Association between the PDGF receptor and members of the src family of tyrosine kinases. Cell, 1990, 62, 481−492.
Willumsen BM, Norris K, Papageorge AG, Hubbert NL, Lowy DR. Harvey murine sarcoma virus p21 ras protein: biological and biochemical significance of the cysteine nearest the carboxy terminus. EMBOJ, 1984, 3(11), 2581−5.
Willumsen BM, Papageorge AG, Hubbert N, Bekesi E, Kung HF, Lowy DR. Transforming p21 ras protein: flexibility in the major variable region linking the catalytic and membrane-anchoring domains. EMBOJ, 1985, 4(11):2893−6.
Zheng XM, Resnick RJ, Shalloway D. A phosphotyrosine displacement mechanism for activation of Src by PTPalpha. EMBOJ, 2000, 19(5), 964−78.
Xu W, Doshi A, Lei M, Ere MJ, Harrison SC. Crystal structures of c-Src reveal features of its autoinhibitory mechanism. Mol Cell, 1999, 3(5), 629−38.
Xu W, Harrison SC, Eck MJ. Three-dimensional structure of the tyrosine kinase c-Src. Nature, 1997, 385, 595−602.
Yoon H, Boettiger D. Expression of v-src alters the expression of myogenic regulatory factor genes. Oncogene, 1994, 9, 801−807.
Yoshida H, Hagashi SI, Kunisada T, Ogawa M, Nishikawa S, Okamura H, Sudo T, Shultz LD, Nishikawa SI. The murine mutation osteopetrosis is in the coding region of the macrophage colony stimulating factor gene. Nature, 1990,345,442−444.
Yu CL, Meyer DJ, Campbell GS, Larner AC, Carter-Su C, Schwartz J, Jove R. Enhanced DNA-binding activity of a Stat3-related protein in cells transformed by the Src oncoprotein. Science, 1995, 269, 81−3.
Yu H, Chen JK, Feng S, Dalgamo DC, Brauer AW, Schreiber SL. Structural basis for the binding of proline-rich peptides to SH3 domains. Cell, 1994, 76(5), 933−45.
Zheng XM, Wang Y, Pallen CJ. Cell transformation and activation of ррбОс-sre by overexpression of a protein tyrosine phosphatase. Nature, 1992, 359, 336−339.150
Выражаю глубокую благодарность моему научному руководителю д.б.н. А. Г. Татосяну за научное руководство, моральную поддержку и терпение при подготовке этой работы.
Я благодарю Комелькова А. В. за большую помощь в обучении компьютерным методам обработки данных.

Заполнить форму текущей работой