Отложения озер представлены терригенными, хемогенными и органогенными осадками. Состав накапливающихся в озерах осадков в первую очередь определяется климатической зональностью.
В озерах гумидных областей накапливаются преимущественно алевро-глинистые отложения, часто с большим количеством органики. Отмершие организмы, а также материал, сносимый в озеро, откладываются на дне и образуют гиттию-озерные отложения, состоящие из органических остатков. Органическое вещество гиттий образуется преимущественно за счет продуктов распада живущих в воде растительных и животных организмов, в меньшей степени за счет принесенных с окружающей суши остатков наземных растений.
Минеральная часть состоит из песчано-глинистого материала и осажденных из вод окислов кальция, железа и магния.
В полупустынных и пустынных аридных зонах озера бессточные с интенсивным испарением. Поскольку реки и подземные воды всегда приносят соли, а испаряется только чистая вода, то происходит постепенное повышение солености озерных вод. Концентрация солей может повышаться настолько значительно, что из перенасыщенной солями воды (рапы) происходит осаждение соли на дно озера (самосадочные озера). В целом, для аридных областей характерны галогенно-карбонатные отложения, бедных органикой.
В ряде случаев решающую роль в характере осадконакопления имеет происхождение озерных котловин. Для ледниковых озер характерны ленточные глины, формирующиеся за счет сочетания озерных и ледниковых отложений. В карстовых озерах накапливаются карбонаты, иногда нагромождение глыб обвального происхождения.
Специфичные хемогенные минеральные отложения связаны с озерами, приуроченными к областям современной эндогенной активности, в которые привнос минеральных веществ осуществляется гидротермальными растворами.
