Помощь в написании студенческих работ
Антистрессовый сервис

Исследование судьбы экзогенной ДНК, интегрированной в геном соматических клеток млекопитающих

Диссертация: Исследование судьбы экзогенной ДНК, интегрированной в геном соматических клеток млекопитающих
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Хорошо известно, что мутационные или делеционные события в резидентных генах клеток млекопитающих достаточно редки и, как правило, происходят с частотами не выше 1 на 1 ООО ООО клеточных делений, часто приводя к злокачественному перерождению клетки (Kopnin, 2000). Спонтанная же потеря гена в популяции перевиваемых клеток представляет собой практически невероятное событие. В то же время, есть… Читать ещё >

Исследование судьбы экзогенной ДНК, интегрированной в геном соматических клеток млекопитающих (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Содержание

  • Список сокращений
  • Глава 1. Обзор литературы
    • 1. 1. Интеграция чужеродной ДНК в геном клеток млекопитающих
    • 1. 2. Вопрос об экстрахромосомном существовании пДНКу млекопитающих
    • 1. 3. Нестабильность интеграции чужеродной ДНК
      • 1. 3. 1. Нестабильность интеграции вирусной ДНК
      • 1. 3. 2. Нестабильность интеграции плазмидной ДНК
      • 1. 3. 3. Влияние копийности на интеграцию ДНК
      • 1. 3. 4. Влияние метилирования на интеграцию ДНК
      • 1. 3. 5. Проявление генетической нестабильности интегрированных
  • ДНК на модели трансгенных мышей
    • 1. 4. Наиболее вероятный механизм нестабильности чужеродной ДНК -рекомбинация
      • 1. 4. 1. Гомологичная рекомбинация
      • 1. 4. 2. Гомологичная рекомбинация и таргетинг генов
      • 1. 4. 3. Различные проявления негомологичной рекомбинации
    • 1. 5. Молекулярные механизмы рекомбинационных явлений
      • 1. 5. 1. Строение и биохимические свойства белка ЯесА
      • 1. 5. 2. Распространение семейства ЛесА-подобных белков
      • 1. 5. 3. Гомологи белка КесА у эукариот и их функции
      • 1. 5. 4. Другие белки, взаимодействующие с КесА/И.ас151, и необходимые для рекомбинации
      • 1. 5. 5. Белки 88 В и ЯРА
      • 1. 5. 6. Белок 11ас
      • 1. 5. 7. Белки В11СА1 и ВЯСА
      • 1. 5. 8. Другие белки, способствующие рекомбинации
      • 1. 5. 9. Оверэкспрессия рекомбинантных белков в клетках млекопитающих
      • 1. 5. 10. Белки, осуществляющие негомологичное воссоединение концов ДНК
      • 1. 5. 11. Изменения в структуре хроматина, происходящие во время негомологичного воссоединения концов ДНК
  • Глава 2. Материалы и методы
    • 2. 1. Культуры клеток
    • 2. 2. Плазмиды, использованные в работе
    • 2. 3. Электропорация- получение и селекция TIC клеток линии А
    • 2. 4. Анализ наличия трансгенной ДНК в клетках
      • 2. 4. 1. Выделение ДНК
      • 2. 4. 2. Подготовка геномной ДНК для использования в качестве вектора для трансфекции
      • 2. 4. 3. Анализ методом ПЦР
      • 2. 4. 4. Секвенирование ДНК
    • 2. 5. Анализ экспрессии гена тимидинкиназы вируса герпеса
    • 2. 6. Получение и анализ клонов клеток млекопитающих, экспрессирующих белок RecA
      • 2. 6. 1. Вестерн — блот
      • 2. 6. 2. Comet assay
    • 2. 7. Статистическая обработка результатов
  • Глава 3. Результаты исследования
    • 3. 1. Изучение феномена нестабильности
    • 3. 2. Доказательства действительности потери чужеродной ДНК из генома культивируемых клеток линии А
    • 3. 3. Проявление нестабильности интеграции чужеродной ДНК различных плазмидных конструкций на разных клеточных линиях
    • 3. 4. Поиск и исследование факторов, влияющих на нестабильность
      • 3. 4. 1. Облучение у-радиацией
      • 3. 4. 2. Влияние усиления гомологичной рекомбинации за счет экспрессии бактериального белка RecA
        • 3. 4. 2. 1. Получение клеточных линий, экспрессирующих RecA
        • 3. 4. 2. 2. Проверка наличия гена RecA в трансфецированных клетках и его экспрессии
        • 3. 4. 2. 3. Проверка работоспособности белка RecA в эукариотических клетках: .облучение и Comet assay
        • 3. 4. 2. 4. Нестабильность чужеродной пДНК в клетках, экспрессирующих RecA
      • 3. 4. 3. Конструирование плазмиды, содержащей последовательности флангов интеграции, и ее анализ
        • 3. 4. 3. 1. Стратегия получения плазмиды, содержащей фланги места интеграции в геном плазмиды р!
        • 3. 4. 3. 2. Выбрасывание из генома клеток линии А
  • ДНК «вторичной» плазмидыр
    • 3. 4. 3. 3. Определение нуклеотидной последовательности флангов места интеграции в геном первоначальной плазмиды
  • Глава 4. Обсуждение
  • Выводы

Актуальность проблемы:

Геном клеток высших эукариот находится под постоянным риском инвазии чужеродной ДНК. In vivo клетки млекопитающих продолжительное время контактируют с различными бактериями, вирусами и фрагментами их ДНК, что предполагает возможность горизонтального переноса генетической информации. В действительности, свидетельства о захвате и сохранении бактериальной ДНК в геноме млекопитающих достаточно ограничены (Scrable, Stambrook 1999; Doerfler et al., 2001). Практическое отсутствие остатков фрагментов бактериальной ДНК в геноме млекопитающих дают основания для предположения о наличии в их клетках высокоэффективной системы по защите собственного генома от приобретения нежелательной чужеродной ДНК. Экспериментально доказать наличие таких систем достаточно сложно, и исследования в этой области находятся на начальной стадии (Awadala, 2003). Несмотря на то, что подобные защитные системы были описаны для бактерий, простейших (Selker, 2003; Yao et al., 2003) и растений (Matzke et al., 2000), об их существовании у млекопитающих свидетельствуют лишь немногочисленные отрывочные данные (Hemmi et al., 2000; Pravtcheva, Wise, 2003; Pipes et al., 2005).

Знание подобных аспектов стабильности генома особенно важно в случаях направленного введения в клетки высших эукариот желательных фрагментов ДНК, таких как геномные исследования, генная терапия, получение трансгенных животных и т. д. (Smith, 2004).

В сфере медицинских исследований большое значение имеет вопрос об особенностях интеграции в геном соматических клеток человека вирусов, в том числе и онкогенных. Кроме достаточно хорошо изученного момента интеграции вирусной ДНК в клеточный геном, остаётся плохо понятной дальнейшая судьба вирусной ДНК и ее взаимоотношения с системами поддержания стабильности генома (Doerfier et al., 1997).

Хорошо известно, что мутационные или делеционные события в резидентных генах клеток млекопитающих достаточно редки и, как правило, происходят с частотами не выше 1 на 1 ООО ООО клеточных делений, часто приводя к злокачественному перерождению клетки (Kopnin, 2000). Спонтанная же потеря гена в популяции перевиваемых клеток представляет собой практически невероятное событие. В то же время, есть достаточно старые наблюдения, что интегрированные в геном культивируемых клеток млекопитающих экзогенные плазмидные ДНК, несущие селективные гены, могут быть потеряны с частотами, варьирющими от 1 на 100 до 1 на 1000 000 на клеточное деление (Sandri-Goldin et al., 1981; Глебов, Абрамян, 19 856). Отмечается, что при культивировании часто наблюдается спонтанная потеря искусственно интегрированных в геном селективных маркеров в процессе роста клеточных популяций. Возникает необходимость поиска объяснения наблюдаемому феномену удаления встроившейся чужеродной ДНК из генома клеток млекопитающих.

На начальной стадии исследования было предложено две основных гипотезы, объясняющие это явление:

1) Клетка млекопитающих может «узнавать» и удалять места интеграции чужеродной ДНК с помощью механизмов гомологичной рекомбинации за счет взаимодействия с гомологичной хромосомой или хроматидой;

2) Основное влияние на стабильность интегрированного в геном трансгена оказывают нуклеотидные последовательности флангов, окружающих сайт внедрения чужеродной ДНК в хромосому.

Цель исследования:

Целью данного исследования является демонстрация явления нестабильности интеграции чужеродной ДНК в геном соматических клеток млекопитающих на модели культур клеток, количественная характеристика этого явления для линии клеток китайского хомячка А23, поиск и изучение факторов, влияющих на удаление чужеродной ДНК из генома клеток млекопитающих.

Задачи исследования:

1) на модели культуры соматических клеток китайского хомячка А23 продемонстрировать и количественно охарактеризовать феномен нестабильности интегрированной в геном плазмидной ДНК;

2) с помощью метода ПЦР доказать действительную потерю интегрированных последовательностей ДНК из генома клонов клеток, характеризующихся подобной нестабильностью;

3) продемонстрировать функциональность модифицированного бактериального белка 11есА в клетках исследуемых линий;

4) рассмотреть влияние возможного усиления гомологичной рекомбинации на стабильность интегрированной чужеродной ДНК на примере введения в соматические клетки млекопитающих бактериального белка ЯесА;

5) разработать подход для анализа областей генома, окружающих место интеграции плазмиды, попытаться определить роль влияния фланговой геномной ДНК на стабильность интегрированной чужеродной ДНК.

Научная новизна:

На модели культур клеток продемонстрирован и впервые количественно описан феномен потери интегрированной чужеродной ДНК. Выявлено, что основным фактором, влияющим на такую нестабильность, являются фланги хромосомной ДНК, окружающие место интеграции плазмиды.

Показано, что бактериальный белок ЯесА, модифицированный сигналом ядерной локализации большого Т-антигена вируса БУ40, а также гиперрекомбиногенный белок 11есА-Х53, экспрессированные в клетках млекопитающих, функционально активны и приводят к некоторому уменьшению повреждений ДНК после облучения. Данная картина визуализирована методом щелочного гель-электрофореза изолированных клеток (Comet assay). Установлено, что усиление процессов гомологичной рекомбинации с помощью экспрессии этих белков практически не влияет на нестабильность трансгенов.

Разработан оригинальный подход конструирования «вторичной» плазмиды, содержащей участки генома клетки китайского хомячка вокруг места интеграции первоначальной плазмиды.

Теоретическое и практическое значение результатов работы:

Полученные данные о нестабильности интеграции плазмидной ДНК в геном культивируемых клеток млекопитающих говорят о существовании в клетках высших эукариот пока до конца неизвестных механизмов защиты генома от инвазии чужеродной ДНК. Хотя предположения о существовании подобных систем у эукариот существуют достаточно давно, а их работе у растений посвящен целый выпуск журнала «Nature» (Dangl, Jones, 2001; Waterhouse et al., 2001), об их действиях по защите генома млекопитающих свидетельствуют только единичные отрывочные данные (Doerfler et al., 2001). Данное исследование говорит о необходимости дополнительного изучения систем поддержания стабильности генома и репарации у млекопитающих.

Это приобретает особую актуальность в случаях удаления из генома интегрированной ДНК провирусов, а также в случаях генной терапии различных заболеваний. Хотя данное исследование проведено на культурах клеток, явление нестабильности введенной ДНК проявляется и на трансгенных животных (Scrable, Stambrook, 1999; Pravtcheva, Wise, 2003), что также необходимо учитывать при проведении соответствующих экспериментов.

Кроме того, настоящая работа нарушает «классическую» концепцию, согласно которой трансген после интеграции в геном рассматривается как часть хозяйской хромосомной ДНК, неотличимой от собственных генов организма.

Разработана стратегия оценки степени нестабильности в динамике во время культивирования клеток млекопитающих in vitro.

Положения, выносимые на защиту:

1) На модели культуры клеток А23 и плазмиды р 16 наблюдается явление направленного удаления чужеродной ДНК, предварительно интегрированной в геном.

2) Попытки усилить ГР в клетках исследуемых линий с помощью экспрессии бактериального белка RecA не приводят к существенным изменениям нестабильности интегрированных чужеродных генов.

3) С помощью оригинального подхода по определению влияния нуклеотидной последовательности флангов геномной ДНК, окружающих места интеграции плазмиды, на стабильность существования чужеродной плазмидной ДНК в геноме соматических клеток млекопитающих демонстрируется возможность зависимости судьбы чужеродной ДНК от места ее интеграции в геном.

Выводы:

1. Интеграция чужеродной плазмидной ДНК в геном соматических клеток млекопитающих линий А23, F9 и Ag 11 395 происходит как стабильно, так и нестабильно.

2. В случае нестабильной интеграции можно выделить три типа динамики потери селективных признаков: полная потеря на 90 сутки после трансфекции, и два типа частичной потери, статистически различающиеся темпами потери селективных признаков на 40 — 90 сутки эксперимента.

3. Ген бактериального белка RecA, обеспечивающего проявление гомологичной рекомбинации у бактерий, дополненный нуклеотидной последовательностью сигнала транспорта в ядро и эукариотическим промотером, активно экспрессируется в клетках млекопитающих различных линий и не является токсичным для таких клеток.

4. По всей видимости, экспрессия бактериального белка RecA в клетках млекопитающих не оказывает существенного влияния на стабильность существования интегрированной чужеродной ДНК в геноме таких клеток.

5. На основе использования обработанной ультразвуком совокупной геномной ДНК клеток млекопитающих в качестве вектора для трансфекции разработан подход по выделению и анализу последовательностей флангов сайта интеграции плазмидной конструкции.

6. Получены аргументы в пользу того, что влияние на стабильность интегрированной в геном клеток млекопитающих чужеродной плазмидной ДНК могут оказывать фланги сайта интеграции.

Показать весь текст

Список литературы

  1. А.А. Структурно-функциональный анализ белка RecA у Escherichia coli. О роли С-концевого домена белка в рекомбинантной реакции.: Автореф. дис.. канд. биол. наук. Гатчина, 1995. 24 с.
  2. В.А. Гетерохроматин. Структура, молекулярная эволюция и регуляторные взаимодействия // Проблемы и перспективы молекулярной генетики. М.: Наука, 2003. — Т. 1. — С. 15−27.
  3. Л.Б. Влияние трансгенеза на неопластический рост и количественные полигенные признаки у мышей.: Автореф. дис.. канд. биол. наук. СПб, 2003. 24 с.
  4. O.K., Абрамян Д. С. Генетическая трансформация соматических клеток. VII. Потеря трансформантного фенотипа сопровождается как стабильными, так и нестабильными изменениями в ДНК // Цитология. -19 856. Т. 27, № 7. — С. 797−804.
  5. И.А., Мануйлова Е. С. Эмбриональные стволовые клетки в изучении функции генов в процессах дифференцировки и развития // Проблемы и перспективы молекулярной генетики. М.: Наука, 2003. — Т. 1. -С. 290−306.
  6. B.JI. Введение в молекулярную вирусологию. СПб.: Из-во СПбГТУ, 2002. — 302 с.
  7. О.Н., Лебедев В. В. Обработка результатов измерений. -М.: Наука 1970.-411 с.
  8. Ю. Статистическая теория открытых систем. М.: Янус 1995.-624 с.
  9. А.И. Автономные трансгены и перспективы генной терапии // Проблемы и перспективы молекулярной генетики. М.: Наука, 2003. — Т. 1. -С. 218−247.
  10. В.Н. Основы генетической инженерии. СПб.: Изд-во СПбГТУ, 2002. — 522 с.
  11. В.З. Таргетинг генов как современный подход к изучению их функции // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 1996. -№ 2.-С. 2−13.
  12. H.A., Щербакова О. Г., Крутяков В. М., Филатов М. В. Автономная репликация плазмид, содержащих фрагменты ДНК из альфа полимеразного комплекса печени крысы // Мол. биол. 1990. — Т. 24, № 3. -С. 814−823.
  13. Н.В. Генетическая стабильность клетки. Л.: Наука, 1983.156 с.
  14. Н.В. Репарация двунитевых разрывов ДНК и стабильность хромосом в клетках высших эукариот // Бреслировские чтения. СПб., 2002. — С. 70−83. Редактор В. А. Ланцов, 322 с.
  15. С., Макги Дж. Молекулярная клиническая диагностика. Методы. М.: Мир, 1999. — 558 с.
  16. О.Г. Изучение гомологичной и негомологичной интеграции экзогенной ДНК в геном соматических клеток млекопитающих.: Автореф. дис.. канд. биол. наук. СПб, 2000. 26 с.
  17. Adzuma K. Stable synapsis of homologous DNA molecules mediated by the Escherichia coli RecA protein involves local exchange of DNA strands // Genes, and Develop. 1992. — Vol. 6, № 9. — P. 1679−1694.
  18. Aguilera A. Double-strand break repair: are Rad51/RecA-DNA joints barriers to DNA replication? // Trends in Genetics. 2001. — Vol.17, № 6. — P. 318−321.
  19. Aigner B., Fleischmann M., Muller M., Brem G. Stable long term germ-line transmission of transgene integration sites in mice // Transgenic Research. 1999. -Vol. 8, № 1. — P. 1−8.
  20. Alexeev A., Mazin A., Kowalczykowski S.C. Rad54 protein possesses chromatin-remodeling activity stimulated by the Rad51-ssDNA nucleoprotein filament//Nature Struct. Biol. 2003. — Vol. 10, № 3,-P. 182−186.
  21. Allen C., Halbrook J., Nickoloff J.A. Interactive competition between homologous recombination and non-homologous and joining // Molecular Cancer Res. 2003. — Vol. 1, № 12. — P. 913−920.
  22. Anderson L.K., Offenberg H.H., Verkuijlen W.M.H.C., Heyting C. RecA-like proteins are components of early meiotic nodules in lily // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1997. — Vol. 94, № 13. — P. 6868−6873.
  23. Aravind L., Walker D.R., Koonin E.V. Conserved domains in DNA repair proteins and evolution of repair systems // Nucleic Acids Res. 1999. — Vol. 27, № 5.-P. 1223−1242.
  24. Asefa B., Kauler P., Cournoyer D., Lehnert S., Chow T.Y. Genetic analysis of the yeast NUD1 endo-exonuclease: a role in the repair of DNA double-strand breaks // Curr. Genet. 1998 — Vol. 34, № 5. — P. 360−367.
  25. Awadala P. The evolutionary genomics of pathogen recombination 11 Nature Rev. Genetics. 2003. — Vol. 4, № 1. — P. 50−60.
  26. Baitin D.M., Zaitsev E.N., Lanzov V.A. Hyper-recombinogenic RecA protein from Pseudomonas aeruginosa with enhanced activity of its primary DNA binding site//J. Mol. Biol. 2003. — Vol. 328, № l.-P. 1−7.
  27. Bakhlanova I.V., Ogawa T., Lanzov V.A. Recombinogenic activity of chimeric recA genes (Pseudomonas aeruginosa/Escherichia coli): A search for RecA Protein regions responsible for this activity // Genetics. 2001. — Vol. 159, -P. 7−15.
  28. Bergerat A., de Massy B., Gadelle D., Varoutas P., Nicolas A., Forterre P. An atypical topoisomerase II from Archaea with implications for meiotic recombination //Nature. 1998. — Vol. 386, № 6623. — P. 414−417.
  29. Bishop J.O., Smith P. Mechanism of chromosomal integration of microinjected DNA // Mol. Biol. Med. 1989. — Vol. 6, № 4. — P. 283−298.
  30. Bradley A., Evans M., Kaufman M., Robertson E. Formation of germ line chimeras from embryo-derived teratocarcinoma cell lines // Nature. 1984. — Vol. 309, № 5965.-P. 255−256.
  31. Brendel V., Brocchieri L., Sandler S.J., Clark A.J., Karlin S. Evolutionary comparisons of RecA-like proteins across all major kingdoms of living organisms //J. Mol. Evol.- 1997.-Vol. 44, P. 528−541.
  32. Brenneman M.A., Wagener B.M., Miller C.A., Allen C., Nickoloff J.A. XRCC3 controls the fidelity of homologous recombination: roles for XRCC3 in late stages of recombination // Molecular Cell. 2002. — Vol. 10, № 2. — P. 387 395.
  33. Broday L., Lee Y.-W., Costa M. 5-Azacytidine induces transgene silencing by DNA methylation in Chinese hamster cells // Mol. Cell. Biol. 1999. — Vol. 19, № 4.-P. 3198−3204.
  34. Burma S., Chen B.P., Murphy M., Kurimasa A., Chen D.J. ATM phosphorylates histone H2AX in response to DNA double-strand breakes // J. Boil. Chem. 2002. — Vol. 276, № 45. — P. 42 462−42 467.
  35. Burnett B., Rao B.J., Jwang B., Reddy G., Radding C.M. Resolution of the three-stranded recombination intermediate made dy recA protein. An essential role of ATP hydrolysis // J. Mol. Biol. 1994. — Vol. 238, № 4. — P. 540−554.
  36. Camenisch G., Gruber M., Donogo G. A polyoma-based episomal vector efficiently expresses exogenous genes in mouse embryonic stem sell // Nucl. Acids Res. 1996. — Vol. 24, № 19. — P. 3707−3713.
  37. Cao J., Combs C., Jagendorf A.T. The chloroplast-located homolog of bacterial DNA recombinase // Plant Cell Physiol. 1997. — Vol. 38, № 12. — P. 1319−1325.
  38. Capecchi M.R. Generating mice with targeted mutations // Nature Medicine. 2001. — Vol. 7, № 10. — P. 1086−1090.
  39. Chan M.F., van Amerongen R., Nijjar T., Cuppen E., Jones P.A., Laird P.W. Reduced rates of gene loss, gene silencing, and gene mutation in Dnmt I-deficient embryonic stem cells // Mol. Cell. Biol. 2001. — Vol. 21, № 22. — P. 7587−7600.
  40. Chen C., Okayama H. High-efficiency transformation of mammalian cells by plasmid DNA // Mol. Cell. Biol. 1987. — Vol. 7, № 8 — P. 2745−2752.
  41. Chen R.Z., Petterson U., Beard C., Jackson-Grusby L., Jaenisch R. DNA hypomethylation leads to elevate mutation rates // Nature. 1998. — Vol. 395, № 6697. — P. 89−93.
  42. Clark S.J., Harrison J., Frommer M. CpNpG methylation in mammalian cells // Nature Genetics. 1995. — Vol. 10, № l.-P. 20−27.
  43. Cooper M.J., Lippa M., Payne J.M. Safety-modified episomal vectors for human gene therapy // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1997. — Vol. 94, № 12. — P. 6450−6455.
  44. Covarrubias L., Nishida Y., Mintz B. Early postimplantation embryo lethality due to DNA rearrangements in a transgenic mouse strain // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1986. — Vol. 83, № 16. — P. 6020−6024.
  45. Cox M.M., Battista J.R. Deinococcus radiodurans the consummate survivor // Nat Rev Microbiol. — 2005. — Vol. 3, № 11. — P. 882−892.
  46. Culver K.W. Gene Therapy: A handbook for Physicians. N.Y.: May Ann Liebert Inc. Publ., 1994, — 117 p.
  47. D’Adda D.I., Fagagna F., Hande M.P., Tong W.M., Lansdorp P.M., Wang Z.Q., Jackson S.P. Function of Poly (ADP-ribose) polymerase in controlling telomere length and chromosomal stability // Nature Genetics. 1999. — Vol. 23, № 1. — P. 76−80.
  48. D’Amours D., Desnoyers S., D’Silva I., Poirier G.G. Poly (ADP-ribosyl)ation reactions in the regulation of nuclear functions // Biochemical Journal. 1999. -Vol. 342,№ 2.-P. 249−268.
  49. D’Amours D., Jackson S.P. The Mrel 1 complex: at the crossroads of DNA repair and checkpoint signaling // Nature Rev. Mol. Cell. Biol. 2002. — Vol. 3, № 5.-P. 317−327.
  50. Dangl J.L., Jones J.D.G. Plant pathogens and integrated defence responses to infection // Nature. 2001. — Vol. 411, № 6839. — P. 826−833.
  51. Deng C., Capecchi M. Reexamination of gene targeting frequency as a function of the extent of homology between the targeting vector and the target locus // Mol. Cell. Biol. 1992. — Vol.12, № 8. — P. 3365−3371.
  52. Dernburg A., McDonald K., Moulder G., Barstead R., Dresser M.E., Villeneuve A. Meiotic recombination in C. elegance initiates by a concerved mechanism and is dispensable for homologous chromosome synapsis // Cell. -1998. Vol. 94, № 3. — P.387−398.
  53. Doerfier W., Schubbert R., Heller H., Kammer С., Hilger-Eversheim К., Knoblauch M., Remus R. Integration of foreign DNA and its consequences in mammalian systems // Trends in Biotech. 1997. — Vol. 15, № 8. — P. 297−301.
  54. Doerfier W., Hohlweg U., Muller К., Remus R., Heller H., Hertz J. Foreign DNA Integration — Perturbations of the Genome — Oncogenesis // Ann. New York Acad. Sei. 2001. — Vol. 945, — P. 276−288.
  55. Dougherty W.G., Parks T.D. Transgenes and gene suppression: telling us something new? // Curr. Opin. Cell Biol. 1995. — Vol. 7, № 3. — P. 399−405.
  56. Dresser M.E., Ewing D.J., Conrad M.N., Dominguez A.M., Barstead R., Jiang H., Kodadek T. DMC1 functions in a Saccharomyces cerevisiae meiotic pathway that is largely independent of the RAD51 pathway // Genetics. 1997. -Vol. 147, № 2.-P. 533−544.
  57. Dressler D., Potter H. Molecular mechanism in genetic recombination // Ann. Rev. Biochem. 1982. — Vol. 51, — P. 727−761.
  58. Eisen J.A., Hanawalt P.C. A phylogenomic study of DNA repair genes, proteins, and processes // Mutat Res. 1999. — Vol. 435, № 3. — P. 171−213.
  59. Etkin L.D., Pearman В., Roberts M., Bektesh S.L. Replication, integration and expression of exogenous DNA injected into fertilized eggs of Xenopus laevis II Differentiation. 1984. — Vol. 26, № 3. — P. 194−202.
  60. Felgner P.L., Gadek T.R., Holm M., Roman R., Chan H.W., Wenz M., Northrop J.P., Ringold G.M., Danielsen M. Lipofection: a highly efficient, lipidmediated DNA-transfection procedure // Proc. Nat. Acad. Sei. USA. 1987. Vol. 84, № 21.-P. 7413−7417.
  61. Fernandes-Capetillo O., Nussenzweig A. Linking histone deacetylation with the repair of DNA breaks // Proc. Nat. Acad. Sei. USA. 2004. Vol. 101, № 6. — P. 1427−1428.
  62. Filatov M. V., Pantina R.A., Noskin L.A. Methods for registration of spontaneous DNA instability in mammalian cells // Mutat Res. 1998. Vol. 403, № 1−2.-P. 95−101.
  63. Flores-Rozas H., Kolodner R.D. Links between replication, recombination and genome instability in eukaryotes // Trends in Biohem. Sei. 2000. — Vol. 25, № 4.-P. 196−200.
  64. Frank E.G., Hauser J., Levine A.S., Woodgate R. Targeting of the UmuD, UmuD', and MucA' mutagenesis proteins to DNA by RecA protein // Proc. Nat. Acad. Sei. USA. 1993.-Vol. 90, № 17.-P. 8169−8173.
  65. Friedman D.I., Court D.L. Bacteriophage lambda: alive and well and still doing its thing // Curr. Opin. Microbiol. 2001. — Vol. 4, № 2. — P. 201−207.
  66. Galande S., Kohwi-Shigematsu T. Poly (ADP-ribose) polymerase and Ku autoantigene form a complex and synergistically bind to matrix attachment sequences // J. Biol. Chem. 1999. — Vol. 274, № 29. — P. 20 521−20 528.
  67. Garrick D., Fiering S., Martin D.I., Whitelaw E. Repeat-induced gene silencing in mammals //Nat. Genet. 1998. — Vol. 18, № 1. — P. 56−59.
  68. Gersten D.M. Gel Electrophoresis: Proteins: Essential Techniques Series. -: John Wiley & Sons Ltd., 1996. 223 p.
  69. Godthelp B.C., Wiegant W.W., A. van Duijn-Goedhart, Scharer O.D., P.P. W. van Buul, Kanaar R., Zdzienicka M.Z. Mammalian RAD51C contributes to
  70. DNA cross-link resistance, sister chromatid cohesion and genomic stability // Nucleic Acids Research. 2002. — Vol. 30, № 10. — P. 2172−2182.
  71. Goers J. Immunochemical Techniques. Laboratory Manual.: Academic Press, 1993.-392 p.
  72. Goudelock D.M., Jiang K., Pereira E., Russell B., SanchezY. Regulatory interactions between the checkpoint kinase Chkl and the proteins of the DNA-dependent protein kinase complex // J. Biolog. Chem. 2003. — Vol. 278, № 32. -P. 29 940−29 947.
  73. Haber J.E. A super new twist on the initiation of meiotic recombination // Cell. 1997. — Vol. 89, № 2. — P. 163−166.
  74. Hamada T., Sasaki H., Seki R., Sakaki Y. Mechanism of chromosomal integration of transgenes in microinjected mouse eggs: sequence analysis of genome-transgene and transgene- transgene janctions at two loci // Gene. 1993. -Vol. 128,-P. 197−202.
  75. W., Zirkel D., Mehdorn H.M., Westphal M., Israel M.A. (E)-5-(2-bromovinyl)-2'-deoxyuridine potentiates ganciclovir-mediated cytotoxicity on herpes simplex virus-thymidine kinase-expressing cells // Cancer Gene Ther. -2001.-Vol. 8, № 5.-P. 388−396.
  76. Hasty P., Ramirez-Solis R., Krumlauf R., Dradley A. Introduction of a subtle mutation into the Hox-2.6 locus in embryonic stem cells // Nature. 1991. -Vol. 350, № 6315.-P. 243−246.
  77. Hayday A., Ruley H.E., Fried M. Structural and biological analysis of integrated polioma virus DNA and its adjacent host sequences cloned from transformed rat cells // J. Virol. 1982. — Vol. 44, № 1.-P. 67−77.
  78. Hejnar J., Elleder D., Hajkova P., Walter J., Blazkova J., Svoboda J. Demethylation of host-cell DNA at the site of avian retrovirus integration // Bioch. and Biophysical Res. Comm. 2003. — Vol. 311, № 3. — P. 641−648.
  79. Hemmi H., Takeuchi O., Kawai T., Kaisho T., Sato S., Sanjo H., Matsumoto M., Hoshino K., Wagner H., Takeda K., Akira S. A Toll-like receptor recognizes bacterial DNA // Nature. 2000. — Vol. 408, № 6813. — P. 740−745.
  80. Henderson G., Simon P. Processing of DNA prior to illegitimate recombination in mouse cells // Mol. Cell Biol. 1997. Vol. 17, № 7. — P. 37 793 785.
  81. Hendrickson E. Cell-cycle regulation of mammalian DNA double-strand break repair // Am. J. Hum. Genet. 1997. — Vol. 61, № 4. — P. 795−800.
  82. Henikoff S., Matzke M.A. Exploring and explaining epigenetic effects // Trends in Genet. 1997. — Vol. 13, № 8. — P. 293−295.
  83. Holliday R. A mechanism for gene conversion in fungi // Genet. Res. -1964. Vol. 5, № 2. — P. 282−304.
  84. Holmes-Son M.L., Appa R.S., Chow S.A. Molecular genetics and target site specificity of retroviral integration // Adv. Genet. 2001. — Vol. 43, — P. 33−69.
  85. Horvathova E., Dusinska M., Shaposhnikov S., Collins A.R. DNA damage measured in different genomic regions using the comet assay with fluorescent in situ hybridization // Mutagenesis. 2004. — Vol. 19, № 4. — P. 269−276.
  86. Hough-Evans B.R., Britten R.J., Davidson E.H. Mosaic incorporation and regulated expression of exogenous gene in the sea urchin embryo // Developmental Biology. 1988. — Vol. 129, — P. 198−208.
  87. Hsieh C-L. Dynamics of DNA methylation pattern // Curr. Opin. Genet. Dev. 2000. — Vol. 10, № 2. — P. 224−228.
  88. Hsu H-L., Gilley D., Blackburn E.H., Chen D.J. Ku is associated with the telomere in mammals // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1999. — Vol. 96, № 22. — P. 12 454−12 458.
  89. Jazayeri A., McAinsh A.D., Jackson S.P. Saccharomyces cerevisiae Sin3p facilitates DNA double-strand break repair // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 2004. -Vol. 101, № 6. — P. 1544−1649.
  90. Jeddeloh J.A., Stokes T.L., Richards E.J. Maintenace of genomic methylation requires a SWI2/SNF2-like protein // Nature Genet. 1999. — Vol. 22, № l.-P. 94−97.
  91. Kalderon D., Roberts B., Richardson W., Smith A. A short amino acid sequence able to specify nuclear location // Cell. 1984. — Vol. 39, № 3 Pt 2. — P. 499−509.
  92. Kanaar R., Hoeijmakers J.H., van Gent D.C. Molecular mechanisms of DNA double-strand break repair // Trends in Cell Biol. 1998. — Vol. 8, № 12. — P. 483 489.
  93. Kang Y-K., Park J.S., Lee C-S., Yeom Y.I., Chung A-S., Lee K-K. Efficient integration of short intersperspersed element-flanked forein DNA via homologous recombination // J. Biol. Chem. 1999. — Vol. 274, № 51. — P. 36 558- 36 591.
  94. Karran P. DNA double strand break repair in mammalian cells // Curr. Opin. Genet. Dev. -2000. Vol. 10, № 2.-P. 144−150.
  95. Kass S.U., Pruss D., Wolffe A.P. How does DNA methylation repress transcription? // Trends in Genet. 1997. — Vol. 13, № 11. — P. 444−449.
  96. Keeney S., Gitropux C., Kleckner N. Meiosis-specific DNA double-strand breaks are catalyzed by Spoil, a member of widely conserved protein family // Cell. 1997. — Vol. 88, № 3. — P. 375−84.
  97. Kido M., Yoneda Y., Nakanishi M., Tsuyshi U., Okada Y. Escherichia coli RecA protein modified with a nuclear location signal binds to chromosomes in living mammalian cells // Exp. Cell Res. 1992. — Vol. 198, № 1. — P. 107−114.
  98. Kopnin B.P. Targets of oncogenes and tumor suppressors: key for understanding basic mechanisms of carcinogenesis // Biochemistry (Moscow). -2000.-Vol. 65, № l.-P. 2−27.
  99. Kowalczykowski S.C. Initiation of genetic recombination and recombination-dependent replication // Trends in Biohem. Sci. 2000. — Vol. 25, № 4.-P. 156−165.
  100. Krejci L., Chen L., Van Komen S., Sung P., Tomkinson A. Mending the break: two DNA double-strand break repair machines in eukaryotes // Prog. Nucleic Acids Res. Mol. Biol. 2003. — Vol. 74, — P. 159−201.
  101. Kurumizaka H., Ikawa S., Nakada M., Eda K., Kagawa W., Takada M., Takeda S., Yokoyama S., Shibata T. Homologous-pairing activity of the human DNA-repair proteins Xrcc3-Rad51C // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 2001. Vol. 98,№ 10.-P. 5538−5543.
  102. Maeshima K., Morimatsu K., Shinohara A., Horii T. RAD51 homologues in Xenopus laevis: two distinct genes are highly expressed in ovary and testis // Gene. 1995.-Vol. 160, № 2.-P. 195−200.
  103. Mahajan K.N., Gangi-Peterson L., Sorscher D.H., Wang J., Gathy K.N., Mahajan N.P., Reeves W.H., Mitchell B.S. Association of terminal deoxynucleotidyl transferase with Ku. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1999. — Vol. 96,№ 24.-P. 13 926−13 931.
  104. Manivasakam P., Schiestl R.H. Nonhomologous end joining during restriction enzyme-mediated DNA integration in Saccharomyces cerevisiae 11 Molecular and Cellular Biology. 1998. — Vol. 18, № 3. — P. 1736−1745.
  105. Mansour S.L., Thomas K.R., Capecchi M.R. Distruption of the proto-oncogene int-2 in mouse embrio-derived stem sell: a general strategy for targeting mutations to non-selectable genes // Nature. 1988. — Vol. 336, № 6197. — P. 348 353.
  106. Martin T., Parker S.E., Hedstrom R., Le T., Hoffman S.L., Norman J., Hobart P., Lew D. Plasmid DNA malaria vaccine: the potential for genomic integration after intramascular injection // Human Gene Therapy. 1999. — Vol. 10,№ 5.-P. 759−768.
  107. Marvo S.L., King S.R., Jaskunas S.R. Role of short regions of homology in intermolecular illegitimate recombination events // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. -1983. Vol. 80, № 9. — P. 2452−2456.
  108. Matsuyama A., Shiraishi T., Trapasso F., Kuroki T., Alder H., Mori M., Huebner K., Croce C.M. Fragile site orthologs FHIT/FRA3B and Fhit/Fral4A2:
  109. Evolutionarily conserved but highly recombinogenic // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. -2003.-Vol. 100, № 25.-P. 14 988−14 993.
  110. Matzke M.A., Mette M.F., Matzke A.j. Transgene silencing by the host genome defense: implications for the evolution of epigenetic control mechanisms in plants and vertebrates // Plant Mol. Biol. 2000. — Vol. 43, № 2−3. — P. 401 415.
  111. Mazin A.V., Alexeev A.A., Kowalczykowski S.C. A novel function of Rad54 protein. Stabilization of the Rad51 nucleoprotein filament // J. Biol. Chem. 2003. — Vol. 278, № 16. — P. 14 029−14 036.
  112. McBurney M.W., Fournier S., Schmidt-Kastner P.K., Craig J. Unstable integration of ttransfected DNAs into embrional carcinoma cells // Somat. Cell Mol. Genet. 1994. — Vol. 20, № 6. — P. 529−540.
  113. Minton K., Daly M. A model for repair of radiation-induced DNA doublestrand breaks in the extreme radiophile Deinococcus radioduram II BioEssays. -1995. Vol. 17, № 5. — P. 457−464.
  114. Morrison C., Takeda S. Genetic analysis of homologous DNA recombination in vertebrate somatic cells // Inter. J. Biochem. Cell Biol. 2000. -Vol. 32,№ 8.-P. 817−831.
  115. Muller K., Heller H., Doerfler W. Foreign DNA integration: genome-wide perturbations of methylation and transcription in the recipient genomes // J. Biol. Chem.-2001.-Vol. 276, № 17.-P. 14 271−14 278.
  116. Mullis K.B., Fallona F.A. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction // Methods Enzymol. 1987. — Vol. 155. — P. 335−350.
  117. Murnane J.P. Influence of cellular sequences on instability of plasmid integration sites in human cells // Somatic Cell and Molecular Genetics. 1990. -Vol. 16, № 3, — P. 195−209.
  118. Murnane J.P., Young B. Nucleotide sequence analysis of novel functions near an unstable integrated plasmid in human cells // Gene. 1989. — Vol. 84, № 1. -P. 201−205.
  119. Murnane J.P., Yu L. Acquision of telomere repeat sequences by transfect DNA integrated at the sote of a chromosome break // Mol. Cell Biol. 1993. -Vol. 13, № 2.-P. 977−983.
  120. Namsaraev E.A., Baitin D.M., Bakhlanova I.V., Alexeyev A.A., Ogawa H. Biochemical basis of of hiper-recombinogenic activity of Pseudomonas aeruginosa RecA protein in Escherichia coli cells // Mol. Microbiol. 1998. -Vol. 27, № 4. — P. 727−738.
  121. Neale M., Ramachandran M., Trelles-Sticken E., Scherthan H., Goldman A.S. Wild-type levels of Spoil-induced DSBs are required for normal singlestrand resection during meiosis // Mol. Cell. 2002. — Vol. 9, № 4. — P. 835−846.
  122. Ng H-H., Bird A. DNA methylation and chromatin modification // Cur. Opinion Genet and Develop. 1999. — Vol. 9, № 2. — P. 156−163.
  123. Nielsen T.O., Cossons N.H., Zannis-Hadjopoulos M., Price G.B. Circular YAC vectors containing short mammalian origin sequences are maintained under selection as HeLa episomes // J. Cell Biochem. 2000. — Vol. 76, № 4. — P. 674 685.
  124. Oberle I., Rousseau F., Heitz D., Kretz C., Devys D., Hanauer A., Boue J., Bertheas M.F., Mandel J.L. Instability of a 550-base pair DNA segment and abnormal methylation in fragile X syndrome // Science. 1991. — Vol. 252, № 5010.-P. 1097−1102.
  125. Palmer T.D., Rosman G.L., Osborne W.R.A., Miller D. Genetically modified skin fibroblasts persist long after transplantation but gradually inactivateintroduced genes // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1991. — Vol. 88, № 4. — P. 13 301 334.
  126. Paul R., Dalibart R., Lemoine S., Lestienne P. Expression of E. coli RecA targeted to mitochondria of human cells // Mutat. Res. 2001. — Vol. 486, № 1. -P. 11−19.
  127. Paull T. T, Gellert M. Nbsl potentiates ATP-driven DNA unwinding and endonuclease cleavage by the Mrel 1/Rad50 complex // Genes and Development. -1999. Vol. 13, № 10. — P. 1276−1288.
  128. Paull T.T., Rogakou E.P., Yamazaki V., Kirchgrssner C.U., Gellert M., Bonner W.M. A critical role for histone H2AX in recruitment of repair factors to nuclear foci after DNA damage // Curr. Biol. 2000. — Vol. 10, № 15. — P. 886 895.
  129. Pecina A., Smith K.N., Mezard C., Murakami H., Ohta K., Nicolas A. Targeted stimulation of meiotic recombination // Cell. 2002. — Vol. 111, № 2. -P. 173−184.
  130. Pellegrini L., Yu D.S., Lo T., Anand S., Lee M., Blundell T.L., Venkitaraman A.R. Insights into DNA recombination from the structure of a RAD51-BRCA2 complex //Nature. 2002. — Vol. 420, № 6913. — P. 287−293.
  131. Peruccho M., Hanahan D., Wigler M. Genetic and physical linkage of exogenous sequences in transformed cells // Cell. 1980. — Vol. 22, № 1 Pt 1. — P. 309−317.
  132. Petrini J.H., Bressan D.A., Yao M.S. The Rad52 epistatic group in mammalian double strand break repair // Semin. Immunol. 1997. — Vol. 9, № 3. -P. 181−188.
  133. Petukhova G., Stratton S.A., Sung P. Single strand DNA binding and annealing activities in the yeast recombination factor Rad59 // J. Biol. Chem. -1999. Vol. 274, № 48. — P. 33 839−33 842.
  134. Piechaczek C., Fetzer C., Baiker A. A vector based on SV 40 origin of replication and chromosomal S/MARs replicates episomally in CHO cells // Nucl. Acids Res. 1999. — Vol. 27, № 2. — P. 426−428.
  135. Pipes B.L., Vasanwala F.H., Tsang T.C., Zhang T., Luo P., Harris D.T. Brief heat shock increases stable integration of lipid-mediated DNA transfection // BioTechniques 2005. — Vol. 38, № 1. — P. 48−52.
  136. Pravtcheva D.D., Wise T.L. Transgene instability in mice injected with an in vitro methylated Igf2 gene // Mutat. Res. Fund. Mol. Mech. of Mutagenesis. -2003. — Vol. 529, № 1−2. — P. 35−50.
  137. Reich C.I., McNeil L.K., Brace J.L., Brucker J.K., Olsen G.J. Archaeal RecA homologues: different response to DNA-damaging agents in mesophilic and thermophilic Archaea // Extremophiles. 2001. — Vol. 5, № 4. — P. 265−275.
  138. Reiss B.M., Klemm M., Kosak H., Schell J. RecA protein stimulates homologous recombination in plants // Proc. Nat. Acad. Sei. USA. 1996. — Vol. 93, № 7.-P. 3094−3098.
  139. Reiss B., Kosak H., Klemm M., Schell J. Targeting of a functional Escherichia coli RecA protein to the nucleus of plant cells // Mol. Gen.Genet. -1997. Vol. 253, № 6. — P. 695−702.
  140. Remus R., Kammer C., Heller H., Schmitz B., Schell G., Doerfler W. Insertion of foreign DNA into an established mammalian genome can alter the methylation of cellular DNA sequences // J. Virol. 1999. — Vol. 73, № 2. — P. 1010−1022.
  141. Roca A., Cox M. RecA protein: structure, function, and role in recombinational DNA repair // Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 1997. — Vol. 56,-P. 129−223.
  142. Rogakou E.P., Nieves-Niera W., Boon C., Pommier Y., Bonner W.M. Initiation of DNA fragmentation during apoptosis induces phosphorilation of histone H2AX at serine 139 // J. Biol. Chem. 2000. — Vol. 275, № 13. — P. 93 909 395.
  143. Rogakou E.P., Pilch D.R., Orr A.H., Ivanova V.S., Bonner W.M. DNA double-stranded breaks induce histone H2AX phosphorilation on serine 139 // J. Boil. Chem. 1998. — Vol. 273, № 10. — P. 5858−5868.
  144. Roth, D., J. Wilson. Relative rates of homologous and nonhomologous recombination in transfected DNA // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1985. — Vol. 82, № 10.-P. 3355−3359.
  145. Sambrook J., Botchan M., Hu S.L., Mitchison T., Stringer J. Integration of viral DNA sequences in cells transformed by adenovirus 2 or SV40 // Proc. R LondBBiol Sci. 1980.-Vol. 210, № 1180.-P. 423−435.
  146. Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. Molecular cloning. A laboratory manual. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. — 482 p.
  147. Sandler S. J, Satin L. H, Samra H. S, Clark A.J. recA-like genes from three Archaean species with putative protein products similar to Rad51 and Dmcl proteins of the yeast Saccharomyces cerevisiae II Nucleic Acids Res. 1996. -Vol. 24, № 11.-P. 2125−2132.
  148. Sandri-Goldin R. M, Goldin A. L, Levine M, Glorioso J.C. High-frequency transfer of cloned Herpes Simplex Virus Type 1 sequences to mammalian cells by protoplast fusion // Mol. Cel. Biol. 1981. — Vol.1, № 8. — P. 743−752.
  149. Saxon P.J., Srivatsan E.S., Leipzig V., Sameshima J.H., Stanbridge E.J. Selective transfer of individual human chromosomes to recipient cells // Mol. Cel. Biol. 1985,-Vol. 5, № l.-P. 140−146.
  150. Schiestl R.H., Zhu J., Petes T.D. Effects of mutations in genes affecting homologous recombination on restriction enzyme-mediated and illegitimate recombination in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cel. Biol. 1994. — Vol.14, № 7.-P. 4493−4500.
  151. Scrable H., Stambrook P.J. A genetic program for deletion of foreign DNA from the mammalian genome // Mutat. Res. 1999. — Vol. 429, № 2. — P. 225−237.
  152. Selker E.U. A Self-help guide for a trim genome // Science. 2003. — Vol. 300,№ 5625.-P. 1517−1518.
  153. Shcherbakova O.G., Lanzov V.A., Ogawa H., Filatov M.V. Overexpression of bacterial RecA protein stimulates homologous recombination in somatic mammalian cells // Mutat. Res. 2000. — Vol. 459, № 1. — P. 65−71.
  154. Shiloh Y. ATM and related protein kinases: safeguarding genome integrity // Nature Review Cancer. 2003. — Vol. 3, № 3. — P. 155−168.
  155. Shinohara A., Ogawa H., Matsuda Y., Ushio N., Ikeo K., Ogawa T. Cloning of human, mouse and fission yeast recombination genes homologous to RAD51 and recA // Nature Genet. 1993. — Vol. 4, № 3. — P. 239−243.
  156. Shinohara A., Ogawa T. Rad51/RecA protein families and the associated proteins in eukaryotes//Mutat. Res. 1999. — Vol. 435, № l.-P. 13−21.
  157. Shinohara M., Sakai K., Shinohara A., Bishop D.K. Crossover interference in Saccharomyces cerevisiae requires a TID1/RDH54- and DMC1-dependent pathway // Genetics. 2003. — Vol. 163, № 4. — P. 1273−1286.
  158. Shinohara A., Shinohara M. Roles of RecA homologues Rad5l and Dmcl during meiotic recombination // Cytogenetic and Genome Res. 2004. — Vol. 107, № 3−4.-P. 201−207.
  159. Smith K.R. Gene therapy: the potential applicability of gene transfer technology to the human germline // int. J. Med. Sci. 2004. — Vol. 1, № 2. — P. 76−91.
  160. Smith K.N., Nicolas A. Recombination at work for meiosis // Curr. Opin. Genet. Dev. 1998. — Vol. 8, № 2. — P. 200−211.
  161. Smolkova B., Dusinska M., Raslova K., McNeill G., Spustova V., Blazicek P., Horska A., Collins A. Seasonal changes in markers of oxidative damage to lipids and DNA- correlations with seasonal variation in diet //Mut. Res. 2004. -Vol. 551.-P. 135−144.
  162. Song B., Sung P. Functional interactions among yeast Rad51 recombinase, Rad52 mediator, and replication protein A in DNA strand exchange // J. Biol. Chem. 2000. — Vol. 275, № 21. — P. 15 895−15 904.
  163. Soustelle C., Vedel M., Kolodner R., Nicolas A. Replication protein A is required for meiotic recombination in Saccharomyces cerevisiae II Genetics. -2002.-Vol. 161,№ 2.-P. 535−547.
  164. Stark J.M., Hu P., Pierce A.J., Moynahan M.E., Ellis N., Jasin M. ATP hydrolysis by mammalian RAD51 has a key role during homology-directed DNA repair // J. Biol. Chem. 2002. — Vol. 277, № 23. — P. 20 185−20 194.
  165. Stringer J.R., Kuhn R.M., Newman J.L., Meade J.C. Unequal homologous recombination between tandemly arranged sequences stably incorporated into cultured rat cells // Mol. Cell Biol. 1985. — Vol. 5, № 10. — P. 2613−2622.
  166. Subramani S., Rubnitz J. Recombination events after transient infection and stable integration of DNA into mouse cells // Mol. Cell Biol. 1985. — Vol. 5, — P. 659−666.
  167. Sudo K., Ogata M., Sato Y., Iguchi-Ariga S.M., Ariga H. Cloned origin of DNA replication in c-myc gene can function and be transmitted in transgenic mice in an episomal state // Nucleic Acids Res. 1990. — Vol. 25, № 18. — P. 54 255 432.
  168. Sugawara N., Haber J.I. Characterization of double-strand break-induced recombination: homology requirements and single-stranded DNA formation // Moi. Cell Biol. 1992. — Vol. 12, № 2. — P. 563−575.
  169. Sung P. Yeast Rad55 and Rad57 proteins form a heterodimer that functions with replication protein A to promote DNA strand exchange by Rad51 recombinase // Genes Dev. 1997. — Vol. 11, № 9. — P. 1111−1121.
  170. Sung P., Krejci L., Van Komen S., Sehorn M.G. Rad51 recombinase and recombination mediators // J. Biol. Chem. 2003. — Vol. 278, № 44. — P. 4 272 942 732.
  171. Symington L.S. Role of RAD52 epistasis group genes in homologous recombination and double-strand break repair // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2002. — Vol. 66, № 4. — P. 630−670.
  172. Tashiro S., Kotomura N., Shinohara A., Tanaka K., Ueda K., Kamada N. S phase specific formation of the human Rad51 protein nuclear foci in lymphocytes //Oncogene. 1996,-Vol. 12, № 10. — P. 2165−2170.
  173. Tashiro S., Walter J., Shinohara A., Kamada N., Cremer T. Rad51 accumulation at sites of DNA damage and in postreplicative chromatin // J. Cell Biol. 2000. — Vol. 150, № 2. — P. 283−291.
  174. Te Riele H., Maandag E.R., Berns A. Highly efficient gene targeting in embryonic sterm cell through homologous recombination with isogenic DNA constructs // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1992. — Vol. 89, № 11. — P. 5128−5132.
  175. Thacker J. A surfeit of RAD51 -like genes? // Trends in Genetics. 1999. -Vol. 15, № 5.-P. 166−168.
  176. Thomas K., Capecchi M. Site-directed mutageneses by gene targeting in mouse enbryo-derived stem cells//Cell. 1987. — Vol. 51, № 3.- P. 503−512.
  177. Thyagarajan B., Padua R.A., Campbell C. Mammalian mitochondria possess homologous DNA recombination activity // J. Biol. Chem. 1996. — Vol. 271, № 44.-P. 27 536−27 543.
  178. Trujillo K.M., Roh D.H., Chen L, Komen S.V., Tomkinson A., Sung P. Yeast Xrs2 binds DNA and helps target Rad50 and Mrel 1 to DNA ends // J. Biol. Chem. 2003. — Vol. 278, № 49. — P. 48 957−48 964.
  179. Truong T., Sun G., Doorly M., Wang J.Y., Schwartz M.A. Modulation of DNA damage-induced apoptosis by cell adhesion is independently mediated by p53 and c-Abl // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 2003. — Vol. 100, № 18. — P. 1 028 110 286.
  180. Tsukamoto M., Yamashita K., Miyazaki T., Shinohara M., Shinohara A. The N-terminal domain of Rad52 promotes Rad51 Independent recombination in Saccharomyces cerevisiae II Genetics. — 2003. — Vol. 165, № 4. — P. 1703−1715.
  181. Vispe S., Cazaux C., Lesca C., Defais M. Overexpression of Rad51 protein stimulates homologous recombination and increases resistance of mammalian cells to ionizing radiation // Nucleic Acids Res. 1998. — Vol. 26, № 12. — P. 28 592 864.
  182. Vispe S., Defais M. Mammalian Rad51 protein: A RecA homologue with pleiotropic functions // Biochimie. 1997. — Vol. 79, № 9−10. — P. 587−592.
  183. Waterhouse P.M., Wang M-B., Lough T. Gene silencing as an adaptive defence against viruses //Nature. 2001. — Vol. 411, № 6839. — P. 834−842.
  184. West S.C. Molecular views of recombination proteins and their control // Nature Rev. Mol. Cell. Biol. 2003. — Vol. 4, № 6. — P. 435−445.
  185. Willers H., Xia F., Powell S.N. Recombinational DNA Repair in Cancer and Normal Cells: The Challenge of Functional Analysis // J Biomed Biotechnol. -2002.-Vol. 2, № 2.-P. 86 -93.
  186. Wiese C., Collins D.W., Albala J.S., Thompson L.H., Kronenberg A., and Schild D. Interactions involving the Rad51 paralogs Rad51C and XRCC3 in human cells // Nucleic Acids Res. 2002. — Vol. 30, № 4.-P. 1001 — 1008.
  187. Wigler M., Pellicer A., Silverstein S., Axel R. Biochemical transfer of single copy eucariotyc genes using total cellular DNA as donor // Cell. 1978. — Vol. 14, № 3. — P. 725−731.
  188. Wilkie T.M., Palmiter R.D. Analysis of the integrant in MyK-103 transgenic mice in which males fail to transmit the integrant // Mol. Cell Biol. 1987. — Vol. 7, № 5. — P. 1646−1655.
  189. Wilkinson D. The western lights: chemiluminiscent techniques for western blot detection let researchers shed their lead aprons // The Scientist. 2000. — Vol. 14,№ 5.-P. 29.
  190. Yagi T., Ikawa I., Yoshida R. Homologous recombination at c-fyn locus of mouse embryonic stem cells with use of diphtheria toxin A-fragment gene in negative selection // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1990. — Vol. 87, № 24. — P. 9918−9922.
  191. Yanez R., Porter A. Gene targeting is enhanced in human cells overexpressing hRAD51 // Gene Ther. 1999. — Vol. 6, № 7. — P. 1282−1290.
  192. Yang D., Waldman A.S. Fine-Resolution Analysis of Products of Intrachromosomal Homeologous Recombination in Mammalian Cells // Mol. Cell Biol. 1997.-Vol. 17, № 7. -P. 3614−3628.
  193. Yano O., Hirano H., Karasaki Y., Higashi K., Nakamura H., Akiya S., Gotoh S. Cloning and sequencing of viral integration site in human fibroblastsimmortalized by simian virus 40 // Cell Struct. Funct. 1991. — Vol. I, № 1. — P. 63−71.
  194. Yao M-C., Fuller P., Xi X. Programmed DNA deletion as an RNA-guided system of genome defense // Science. 2003. — Vol. 300, № 5625. — P. 1581−1584.
  195. Yoshihara T., Ishida M., Kinomura A., Katsura M., Tsuruga T., Tashiro S., Asahara T., Miyagawa K. XRCC3 deficiency results in a defect in recombination and increased endoreduplication in human cells // EMBO Journal. 2004. — Vol. 23, № 3.-P. 670−680.
  196. Yu X., Egelman E.N. The LexA repressor binds within the deep helical groove of the activated RecA filament // J. Mol. Biol. 1993. — Vol. 231, № 1. — P. 29−40.
Заполнить форму текущей работой

Сессия? Спокойно!