Плазмидосодержащие ризосферные бактерии рода Pseudomonas, устойчивые к кобальту/никелю и стимулирующие рост растений
Диссертация
В последнее десятилетие у производителей сельскохозяйственной продукции возрос-интерес к применению биопрепаратов, разрабатываемых на основе ризосферных бактерий группы, PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) для стимуляции роста растений и защиты от фитопатогенов. Имеющиесяэкспериментальные данные свидетельствуют о том, что инокуляция растений ризосферными бактериями увеличивает риск… Читать ещё >
Список литературы
- Алексеев Ю.В. Тяжелые металлы в почвах и растениях. Л.: Агропромиздат, 1987. 142 с.
- Алимарин И.П., Иванов В. М. Практическое руководство по физико-химическим методам анализа. М.: Изд-во МГУ, 1987. 156 с.
- Андреева И.В., Говорила В. В., Ягодин Б. А., Досимова О. Т. Динамика накопления’и распределения никеля в*растениях овса // Агрохимия. 2000. № 4. С. 68−71.
- Аристархов, А.Н., Харитонова' А.Ф. Состояние: и методология прогнозирования загрязнения' почв1 тяжелыми металлами // А. Н. Аристархов, А.Ф. Харитонова//Плодородие. 2002. № 3. Вып. 6. С. 22−24.
- Балашов C.B. Деструкция сульфоароматических соединений- бактериями родов Pseudomonas и Comamonas. Дисс.. канд. биол. наук. Пущино,• 2007. 168 с.
- Белимов A.A. Взаимодействие ассоциативных бактерий и растений в зависимости от биотических и абиотических факторов. Дисс.. докт. биол. наук. С.-Петербург, 2008. 320 с.
- Белимов A.A., Кулакова A.M., Сафронова В. И., Степанок В. В., Юдкин Л. Ю., Алексеев Ю. В., Кожемяков А. П. Использование ассоциативных бактерий для инокуляции ячменя в условиях загрязнения почвы свинцом и кадмием//Микробиология. 2004. Т. 73. С. 118−125.
- Белимов A.A., Тихонович И. А. Микробиологические аспекты устойчивости и аккумуляции тяжелых металлов у растений (обзор) // Сельскохозяйственная биология. 2011. № 3. С. 10−15.
- Ю.Бергквист П., Харди К., Оудега Б., Панайотатос Н., Пагсли Э, Томас К., Янгмен Ф. Плазмиды / под ред. К. Харди. М.: Мир, 1989. 267 с.
- Беспамятное Т.П., Кротов Ю. А. Предельно допустимые концентрации химических веществ в окружающей среде, Справочник. JI.: Химия, 1985. 528 с.
- Бинтам Ф.Т. Некоторые вопросы токсичности ионов металлов: Пер. с англ. / под ред. Ф. Т. Бинтам, М. Коста, Э. Эйхенбергер и др. М.: Мир, 1993. 368 с.
- Благодатская Е.В., Пампура Т. В., Богомолова И. Н. Влияние загрязнения соединениями свинца на микробиологическую активность серой лесной, почвы под сеяным лугом // Агрохимия. 2003. № 4. С. 74−78.
- Вронский В.А. Прикладная экология. Ростов-на-Дону, 1996. 512 с.
- Гигиенические нормативы ГН 2.1.7.2041−06. Почва, очистка населенных мест, отходы производства и потребления, санитарная охрана почвы. Предельно допустимые концентрации (ПДК) химических веществ в почве (2006 г).
- Госкомприрода СССР, № 02−2333 от 10.12.90. Дополнение № 1 к перечню ОДК и ПДК № 6229−91 (1991).
- Григорян К.В. Влияние загрязненных промышленными отходами -оросительных вод на физические, физико-химические свойства и биологическую активность почв. Автореф. дисс.. канд. биол. наук. М., 1980. 25 с.
- Гузев B.C., Левин C.B. Перспективы эколого-микробиологической экспертизы состояния, почв при антропогенных воздействиях // Почвоведение. 1991. № 9. С. 50−62.
- Дополнение № 1 к перечню ОДК и ПДК № 6229−91.
- Иванов A.JI. Проблемы техногенеза в земледелии.Российской Федерации и системы мероприятий по реабилитации техногенно-нарушенных территорий // Вестник Российской академии сельскохозяйственных наук. 2003. № 1. С. 8−11.
- Иванов А. Ю., Фомченков В. М. Электрофизический анализ повреждения бактериальных клеток Escherichia coli ионами-серебра // Микробиология. 1991. Т. 61. Вып. 3. С. 464−471.
- Ильин В.Б., Сысо А. И. Микроэлементы и тяжелые металлы в почвах и растениях Новосибирской области. Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2001. 229 с.
- Кабата-Пендиас А., Пендиас X. Микроэлементы в почвах и растениях. М.: Мир, 1989. 439 с.
- Колесников С.И. Изменение микробиологической активности чернозема обыкновенного под влиянием загрязнения тяжелыми металлами // Мат. междунар. науч.-практ. конф. «Экология и современность». Ростов-на-Дону, 1995. С. 145.
- Кочетков В.В., Балакшина В. В., Мордухова Е. А., Воронин A.M. Плазмиды биодеградации нафталина в ризосферных бактериях рода Pseudomonas // Микробиология. 1997. Т. 66. № 2. С. 211−216.
- Кулакова А.Н., Воронин A.M., Мутанты плазмид биодеградации нафталина, детерминирующие окисление катехола по метапути // Микробиология. 1989. Т. 58. № 2. С. 298−304.
- Макарова В.Г. Экологические и медико-социальные аспекты охраны природной среды и здоровья населения / В. Г. Макарова, А. Р. Цыганов,
- B.А. Кирюшин. Минск: Хата, 2002. 284 с.
- Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. 1984. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир, 479 с.
- Методические указания по проведению комплексного мониторинга плодородия почв земель сельскохозяйственного назначения / Под ред. JIM. Державина, Д. С. Булгакова. Mi: ФГНУ «Росинформагротех», 2003. 240 с.
- Мирошников А.И., Фомченков В. М., Иванов А. Ю. Электрофизический анализразделение клеток. М.: Наука, 1986. 184, с.
- Назаров A.B., Иларионов С. А. 2005. Потенциал использования микробно-растительного взаимодействия для биоремедиации // Биотехнология. Т. 5.1. C. 54−62.
- Национальный перечень канцерогенов (перечень" веществ, продуктов, производственных и бытовых факторов, канцерогенных для человека. Москва СССР. № 6054−91 от 19:11.1991.
- Никольский H.H. / Общие механизмы клеточных реакций на повреждающие воздействия. Вып. 17. JI. 1977, С. 23.
- Оценка степени загрязнения почв химическими веществами. 4.1. Тяжелые металлы и пестициды. М.: Минприроды РФ, 1982.
- Перт С.Дж. Основы культивирования микроорганизмов и клеток. 1978. М.: Мир, С. 14−33.
- Псевдобактерин-2 5 лет на рынке. Пущино: ООО Изд-во «Агрорус», 2003.44:СанПиН 42−128−4433−87.
- Смирнов В. В. Киприанова Е.А. Бактерии, рода Pseudomonas. Киев: Наук. Думка, 1990. 264 с.
- Тихонович И.А., Проворов Н. А. Симбиозы растений и микроорганизмов: молекулярная генетика агросистем будущего. С.-Петербург, 2009.
- Черников В.А., Милащенко Н. З., Соколов О. А., Экологическая безопасность и устойчивое развитие // Книга 3. Устойчивость почв к антропогенному воздействию. Пущино: ОНТИ ПНЦ РАН, 2001, 203 с.
- Alam M.Z., Ahmad S., Malik A. Prevalence of heavy metal resistance in bacteria isolated from tannery effluents and affected soil / Environ. Monit. Assess. 2010. Sep 8. Epub ahead of print.
- Andersen C. Channel-tunnels: outer membrane components of type I secretion systems and multidrug efflux pumps of Gram-negative bacteria // Rev. Physiol. Biochem. Pharm. 2003. Vol. 147. P. 122−165.
- Anokhina T.O., Volkova O.V., Puntus I.F., Filonov A.E., Kochetkov V.V.,, Boronin A.M. Plant growth-promoting Pseudomonas bearing catabolic plasmids: naphthalene degradation and effect on plants // Process Biochemistry. 2006. Vol. 41. P. 2417−2423.
- Anton A., Grobe C., Reibman J., Pribyl T., Nies D.H. CzcD is a heavy metal ion transporter involved in regulation of heavy metal resistance in Ralstonia sp. strain CH34//J. Bacteriol. 1999. Vol. 181. P: 6876−6881.
- Azcon R., Peralvarez Mdel C., Roldan A., Barea J.M. Arbuscular mycorrhizal fungi, Bacillus cereus, and Candida parapsilosis from, a multicontaminated soil alleviate metal’toxicity inplants I I Microb. Ecol. 2010. Vol. 59. № 4. P. 68−77.
- Belimov A.A., Dietz K.-J. Effect of associative bacteria on element composition of barley seedlings grown in solution culture at toxic cadmium concentration//Microbiol. Res. 2000. Vol. 155. P. 113−121.
- Birnboim H.C. and Doly J. A rapid alkaline extraction procedure of screening recombinant plasmid DNA //Nucleic Acids Res. 1979. Vol. 7. P. 1513.
- Bose S. and Bhattacharyya’A.K. Heavy metal accumulation in wheat plant grown in soil amended with industrial sludge // Chemosphere. 2008. Vol. 70. № 7. P. 1264−1272.
- Bowen H.J. M. Environmental chemistry of the elements. London: Acad. Press, 1979, 333 p.
- Bozhkov A., Padalko V., Dlubovskaya V., Menzianova N. Resistance to heavy metal toxicity in organisms under chronic exposure // Indian J. Exp. Biol. 2010. Vol. 48. № 7. P. 679−696.
- Bradley M.J., Chivers P.T., Baker N.A. Molecular dynamics simulation of the Escherichia coli NikR protein: equilibrium conformational fluctuations reveal interdomain allosteric communication pathways // J. Mol. Biol. 2008. Vol. 378. № 5. P. 1155−1173.
- Bruick R.K. Oxygen sensing in the hypoxic response pathway: regulation of the hypoxia-inducible transcription factor // Genes Dev. 2003. Vol. 17. P. 26 142 623.
- Bruins M.R., Kapil S., Oehme F.W. Microbial resistance to metals in invironment //Ecotoxicology and Environmental Safety. 2000. Vol. 45. P. 198— 207.
- Burdon K. Fatty material in bacteria and fungi revealed by staining dried, fixed slide preparations //J. Bacteriology. 1946. Vol. 52. P. 665−668.
- Canovas D., Cases I., de Lorenzo V. Heavy metal tolerance and metal homeostasis in Pseudomonas putida as revealed by complete genome analysis I I Environ. Microbiol. 2003, Vol. 5. № 12. P. 1242−1256.
- Cavallo J. D., Plesiat P., Couetdic G., Leblanc F., Fabre R. Mechanisms of b-lactam resistance in Pseudomonas aeruginosa: prevalence of OprM-overproducing strains in- a? French multicentre study // J. Antimicrob. Chemother. 1997. Vol. 50. P. 1039−1043.
- Chen X.C., Wang Y.P., Lin Q>, Shi J.Y., Wu< W.X., Chen Y.X. Biosorption of copper (II) and. zinc (II) from aqueous solution" by Pseudomonas putida CZ1 // Colloids Surf. Biointerfaces. 2005. Vol. 46. № 2 P. 101−107.
- Chin-A-Woeng T.F., Bloemberg G.V., Mulders I.H., Dekkers L.C., Lugtenberg B.J. //Mol. Plant Microbe Interact. 2000. Vol. 13. № 12. P. 1340−1345.
- Chin-A-Woeng T.F.C., Bloemberg G.V., van der Bij A.J., van der Drift K.M.G.M., Scheffer J., Keel Ch., Bakker P.A.H.M., Tichy H.-V., de Bruijn
- Davis R.D., Beckett P.H.T., Wollan E. Critical levels of twenty potentially toxic elements injoung spring barley //Plant Soil. 1978. Vol: 49. P. 395.
- De Boeck M., Kirsch-Volders M., Lison D. Cobalt and antimony: genotoxicity and carcinogenicity//Mutat. Res. 2003. Vol. 533. P. 135−152.73:de Souza M.P., Huang C.P., Chee N., Terry N. // Planta. 1999. Vol. 209. № 2. P. 259−263.
- Diels L., Dong Q., van der Lelie D., Baeyens W., Mergeay M: The czc operon of Alcaligenes eutrophus* CH34: from resistance mechanism to the removal of heavy metals // J. Ind. Microbiol. 1995. Vol! 14. № 2. P. 142−153.
- Dressier C., Kues U., Nies D.H., and Friedrich B. Determinants encoding resistance to several heavy metals in newly isolated copper-resistant bacteria // Appl. Environ. Microbiol: 1991. Vol: 57, № 11. P. 3079−3085.
- Dua D. and Meera S. Purification and characterization' of naphthalene oxygenase from Corynebacterium^ renale II Eur. J. Biochem. 1981. Vol. 120. № 3. P." 461−465:
- Duffus J. Hi «Heavy metals»meaningless term? // (IUPAC Technical Report), Pure and Applied Chemistry. 2002. Vol. 74. P. 793−807.
- Duffy BK, DefagO' G. Environmental- factors modulating antibiotic and siderophore biosynthesis by Pseudomonas jluorescens biocontrol strains // Appl. Environ. Microbiol. 1999. Vol. 65. № 6. P. 2429−2438.
- Dunn< N.W., Gunsalus I.C. Trasmissible plasmids coding early enzymes of naphthalene oxidation in Pseudomonas putida I I J. Bacteriol. 1973. Vol. 114. P. 974−979.
- Edel J., Pozzi G., Sabbioni E. et al. Metabolic and toxicological studies on cobalt // Sci. Total Environ. 1994. — Vol. 150: — P. 233 — 244.
- Everhart J.L., McNear D.Jr., Peltier E., van der Lelie D., Chaney R. L., Sparks D.L. Assessing nickel bioavailability in smelter-contaminated soils // Science of the Total Environment. 2006. Vol. 367. P. 732−744.
- Fagan M.J., Saier M.HJr. P-type ATPases of eukaryotes and bacteria: sequence comparisons and construction of phylogenetic trees // J. Mol. Evol. 1994. Vol. 38. P. 57−99.
- Fan B. and Rosen B.P. Biochemical characterization of CopA, the Escherichia coli Cu (I)-translocating P-type ATPase // J. Biol. Chem. 2002. Vol. 277. P. 46 987−46 992.
- Feist C.F., Hegeman G.D. Phenol and benzoate metabolism by Pseudomonas putida of tangential pathways // J. Bacterid. 1969. Vol. 100. № 2. P. 869−877.
- Gilis A., Corbisier P., Baeyens W., Taghavi S., Mergeay M., van der Eelie D.J. Effect of the siderophore alcaligin E on the bioavailability of Cd to Alcaligenes eutrophus CH34 // Ind. Microbiol. Biotechnol. 1998. Vol: 20. № 1. P. 61−68.
- Glick B.R., Todorovic B.3 Crazny J., et al., Promotion of plant growth by bacterial4ACC deaminase // Crit. Rev. Plant Sci. 2007. Vol. 27. P. 227−242.
- Goldberg* M.', Pribyl T., Juhnke S. and Nies D.H. Energetics and1 topology of CzcA, a cation/proton antiporter of the KND protein family // J. Biol. Chem. 1999: Vol. 274. P. 26 065−26 070.
- Goldoni M., Catalani S., De Palma G. et al. Exhaled breath condensate as a suitable matrix to assess lung dose and* effects in-workers exposed to cobalt and tungsten//Environ. HealthPerspect. 2004. Vol. 112. P. 1293−1298.
- Gorbisier P. Bacterial metal-lux biosensors for a rapid determination of the heavy metal bioavailability and toxicity in soil samples //Res. Microbiol. 1997. Vol. 148. P. 534−536.
- Grass G., Gro? e C., and Nies D. l-I. Regulation of the cnr cobalt and nickel resistancedeteirninantfrom strainiCH34fi// J. Bacterioli 2000: Vol: 182. P. 1390−1398.
- Grass G., Fan Bl, RosenBl P., Lemke K.,.SchlegelH.-G., and Rensing-C. NreB from" Achromobacter xylosoxidans• 31A is a nickel-induced transporter conferring nickel resistance // J. BacterioL 2001. V. 183. № 9: P. 2803−2807.
- Grass G., Fricke B, Nies D.H. Control of expression of a periplasmic nickel efflux pump by pcriplasmic nickel concentrations // Biometals. 2005. Vol. 18.p. 437−448. ¦¦.. ¦ .'¦.¦',¦•.:.
- Gupta A., Kumar M., Goel R. Bioaccumulation properties of nickel-, cadmium-, and chromium-resistant mutants of Pseudomonas aeruginosa NBRI 4014 at alkaline pH //Biol. Trace Elem. Res. 2004. Vol: 99. № 1−3. P. 269−77.
- Gustin J.L., Zanis M.J., Salt D.E. Structure and evolution of the plant cation diffusion facilitator family of ion transporters // BMC Evol. Biol. 2011. Vol. 11. P. 76.
- Hambuckers-Berhin F., Remacle J. Cadmium sequestration in cells of two strains of Alcaligenes eutrophus II FEMS Microbiol. Ecol. 1990. Vol. 73. P. 309−316.
- Hassan M.T., van der Lelie D., Springael D., Romling U., Ahmed N. and Mergeay M. Identification-of a gene cluster, czr, involved in cadmium and zinc resistance in Pseudomonas aeruginosa II Gene. 1999. Vol. 238.' № 2. P. 417−425.
- Hegeman G.D. Synthesis of the enzymes of the mandelate pathway by Pseudomonas putida. Synthesis of enzymes by the wild type // J. Bacteriol. 1966. Vol. 91. P. 1140−1154.
- Herrmann L., Schwan D., Garner R., Mobley H.L.T., Haas R., Schafer K.P. and Melchers K. Helicobacter pylori cadA encodes an essential Cd (II)/Zn (H)/Go (II) resistance factor influencing urease activity // Mol. Microbiol. 1999. Vol: 33. P. 524−536.
- Hong J.W., Fomina M., Gadd G: M. F-RISA fungal clones as potential bioindicators of organic and metal contamination in" soil // J. Appl". Microbiol: 2010. Vol. 109. № 2. P. 415−430.
- Ivanov A., Khassanova L., Collery P., Khassanova Z., Choisy C., Etienne J.C. Microorganisms as a tooB of studying copper metal ions-induced changes in electrophysical cell properties // Gcll Mol. Biol. 1996. Vol. 42- № 6. P. 825−831.
- Johnson J. M- and Church G. M: Alignment and structure predictions of divergent protein families' periplasmic and outer membrane proteins of bacterial efflux pumps //J. Mol. Biol. 1999: Vol. 287. P: 695−715.
- Junker F., Cook A.M. Conjugative plasmids and the degradation of arylsulfonates in Gomamonas testosterone II Appl. Environ. Microbiol. 1997. Vol. 63. № 6. P. 2403−2410. '
- Kachur. A.V., Koch C! J., Biaglow J.E. Mechanism of copper-catalyzed oxidation of glutathione // Free Radic. Res. 1998. Vol. 28: № 3: P. 259−269:
- KalbfV.F., Bernlohr R.W. Anew spectrophotometric assay for proteinein-cell- extract^/ Anal- Biochem: 1977: Vol? 821 P! 362−367. -
- Kaluarachchi H, Chan Chung K.C., Zamble D.B. Microbial: nickel proteins // Nat. Prod. Rep. 2010. Vol. 27. № 5. P: 681−694.
- Kamashwaran S R. and Crawfbrdi DiE. Mechanisms of cadmium resistance in anaerobic bacterial enrichments degrading pentachlorophenol // Can. J. Microbiol. 2003. Vol. 49. № 7. P. 418−424).
- Kamnev A. A.,.van der Lelie D. Chemical and biological parameters as tools to evaluate and1 improve heavy metal phytoremediation // Biosci. Reports. 2000: Vol: 20. P. 239−258. •
- Karak T., Bhattacharyya P. Heavy metal accumulation in soil amended with roadside pond sediment and uptake by winter wheat (Triticum aestivum L. cv. PBW 343) I I Scientific WorldJournal. 2010. Vol. 14. № 10. P. 2314−2329.
- Khan M.S., Zaidi A., Wani P.A., et al., Role of plant growth promoting rhizobacteria in the remediation of metal contaminated soils // Environ. Chem. Lett. 2009. Vol. 7. P. 1−19.
- King E.O., Ward M.K., Raney D.E. 1954. Two simple media for the demonstration of pyocyanin and fluorescin // Ji Lab. Clin. Med. Vol. 44. P. 301−307.
- Kloke A. Content of arsenic, cadmium chromium, fluorine, lead- mercury and nickel in plants grown on contaminated soil / United Nations-EGE Symp. on-Effects of Air-borne Pollution on Vegetation Warsaw, August 20, 1979, P. 192.
- Koch Di, NieSi D.H. and' Grass G. The RcnRA (YohLM) system of Escherichia colt A connection between nickel, cobalt and iron homeostasis // Biometals. 2007. Vol'. 20. № 5. P. 759−771.
- Koronakis V., Sharff A., Koronakis E., Luisi B. and Hughes C. Crystal structure of the bacterial membrane protein TolC central to. multidrug efflux and protein efflux // Nature. 2000. Vol. 405. P: 914−915:
- Koronakis V., Sharff A., Koronakis E., Luisi B., Hughes C. Crystal structure of the bacterial membrane proteiniTolC central to multidrug efflux and protein export //Nature. 2000. Vol: 405. Pi 914−919.
- Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of the bacteriophage T4 //Nature. 1970. Vol. 227. P. 680.
- Lai H.Y., Juang K.W., Chen Z.S. Large-area experiment on uptake of metals by twelve plants growing in soils contaminated with multiple metals // Int. J. Phytoremediation. 2010. Vol. 12. № 8. P.1 785−797.
- Lane D.J. 16S/23S rRNA sequencing / Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics. Stackebrandt E., and Goodfellow M. (eds.). Chichester: Wiley Press, 1991. P. 130−141.
- Lee* S.W., Glickmann E. and Cooksey D.A. Chromosomal locus for cadmium resistance in Pseudomonas putida consisting of a cadmiumtransporting ATPase and a MerR family response regulator // Appl. Environ. Microbiol. 2001. Vol. 67. P. 1437−1444.
- Lee Y-K., Chang H-H., Lee H-J., Park H., Lee K. H. and Joe M-H. Isolation, of a-novel plasmid, p№ 15, from Enterobacter sp. Nil5 containing a nickel resistance gene // FEMS Microbiol. Lett. 2006. Vol. 257. № 2: P. 177.
- Legatzki A., Grass G., Anton A., Rensing C., Nies G.H. Interplay of the Czc system and two P-type ATPases in conferring metal resistance to Ralstonia metallidurans //Biodegradation. 2003. Vole 14. P. 153−168:
- Liesegang H.K. Lemke R.A. Siddiqui, Schlegel H.-G. Characterization of the inducible nickel and cobalt resistance, determinant- cnr from pMOL28 of Alcaligenes eutrophus CH34 // J. Bacteriol- 1993: Voh 175. P. 767−778
- Lison D., De Boeck M., Verougstraete V., Kirsch-Volders M. Update on the genotoxicity and carcinogenicity of cobalt compounds // Occup. Environ. Med. 200lr. Vol. 58. P. 619−625.
- Lortal S., van Heijenoort J., Grubek K., Sleytr B. S-layer of Lactobacillus helveticus ATCC12046: isolation, chemical characterization and reformation after extraction with lithium chloride. J. Gen. Microbiol. 1992. V. 138. № 3. P. 611−618.
- Lowry O.H., Rosebrough N.J., Farr A.L., Randall R.J. Protein-measurement with Folin phenol reagent // J. Biol.- Chem: 1957. Vol. 193. P. 265−275.
- Ma Y., Rajkumar M., Freitas H. Improvement of plant growth and nickel uptake by nickel resistant-plant-growth promoting bacteria' // J. Hazard Mater. 2009. Vol. 166. № 2−3. P. 1154−1161.
- Malik A. Metal bioremediation through growing cells // Environ. Int. 2004. Vol. 30. № 2. P. 261−278.
- Marrero J., Auling G., Coto O. and Nies D. H. High-level resistance to cobalt and nickel but probably no transenvelope efflux: metal resistance in the Cuban Serratia marcescens strain C-l // Microb. Ecol. 2007. Vol! 53. № 1. P. 123−133.
- McEldowney S. The impact of surface attachment on* cadmium accumulation by Pseudomonas fluorescens H2 // FEMS Microbiol, Ecol. 2000. Vol. 33. № 2. p'. 121−128.
- McGrath S.P., Chaudri A.M., Giller K.E. Long-term effects of metals in sewage sludge on soils, microorganisms and plants // J. Ind. Microbiol. 1995. Vol. 14. № 2. P. 94−104.
- Mengoni A., Barzanti R., Gonnelli: C., Gabbrielli R. and Bazzicalupo M. Characterization of nickel-resistant bacteria isolated from serpentine soil // Environ. Microb. 2001. Vol. 3. № 11. P. 69L
- Mergeay M., Houba C., and Gerits J. Extrachromosomal inheritance controlling resistance to cadmium, cobalt, and zinc ions: evidence from curing in a Pseudomonas II Arch. Int. Physiol.' Biochim. 1978. Vol. 86. № 2. P. 440−441.
- Mergeay M., Nies D, Schlegel H.G., Gerits J., Charles P. and Van Gijsegem F. Alcaligenes eutrophus CH34 is a facultative chemolithotroph with plasmid-bound resistance to heavy metals //J. Bacteriol: 1985. Vol. 162'. P. 328−334.
- Mikolay A., Nies D.FI. The ABC-transporter AtmA is involved in nickel and cobalt resistance of Cupriavidus metallidurans strain CH34 // Antonie Van Leeuwenhoek. 2009. Vol. 96. № 2. P. 183−191.
- Mitra B. and Sharma R. The cysteine-rich amino-terminal domain of ZntA, a Pb (II)/Zn (II)/Cd (II)-translocating ATPase from Escherichia coli, is not essential for its function // Biochemisrty. Vol. 40. P. 7694−7699.
- Moller V. Simplified tests for some amino acid decarboxylases and for arginine dihydrolase system // Acta Pathologica et Microbiological Scandinavica. 1955. Vol. 36. P. 158−172.
- Nies D.ll. Bacterial transition metal homeostasis / Nies D.H., Silver S. (eds) Molecular microbiology of heavy metals / Springer, Berlin, 2007. P. 118−142.
- Nies D.H. Biochemistry. How cells control zinc homeostasis // Science. 2007. Vol. 317. P. 1695−1696.
- Nies D.H. Efflux-mediated heavy metal resistance in prokaryotes // FEMS Microbiol. Rev. 2003. Vol. 27. P. 313−339.
- Nies D: H. Microbial heavy-metal resistance // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999. Vol: 51. № 6. P. 730−750.
- Nies D.H., Nies A., Chu L., Silver S. Expression and nucleotide sequence of a plasmid-determined divalent cation efflux system from Alcaligenes eutrophus //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1989a. Vol. 86. № 19. P. 7351−7355.
- Nies DH. Heavy metal-resistant bacteria as extremophiles: molecular physiology and biotechnological use of Ralstonia sp. CH34 // Extremophiles. 2000. Vol. 4. № 2. P. 77−82.
- Nwachukwu O.I., Pulford I.D. Microbial respiration as an indication of metal toxicity in contaminated organic materials and soil // J. Hazard Mater. 2011. Vol. 185. № 2−3. P. 1140−1147.
- Ownley B.H., Weller D.M., Tomashow L.S. Influence of in situ and in vitro pH on suppression of Gaeumannomyces graminis var. tritci by Pseudomonasfluorescens 2−79 //Phytopathology. 1992. Vol: 82. P: 178−184.
- Pastor N., Carlier, E., Andres J., Rosas S.B., Rovera M. Characterization of rhizosphere bacterial for control of phytopathogenic fungi of tomato // J. Environ. Manage. 2011. Apr 19. Epub ahead of print.
- Patel J.S., Patel P.C., Kalia K. Isolation and characterization of nickel uptake by nickel resistant bacterial isolate (NiRBI) // Biomed. Environ. Sci. 2006. Vol: 9l № 4. P. 297−301.
- Paulseni I.T., Saier M.H.Jr. A novel family of ubiquitous heavy metal ion transport proteins //J. Membr. Biol: 1997. Vol. 156: P. 99−103.
- Pereira S.I., Lima A.I., Figueira E.M. Screening possible mechanisms mediating cadmium resistance in Rhizobium leguminosarum bv. viciae isolated from contaminated Portuguese soils // Microb. Ecol. 2006. Vol. 52. № 2. P. 176−186.
- Pulido M.D., Parrish A.R. Metal-induced apoptosis: mechanisms // Mutat. Res. 2003. Vol. 533. № 1−2. P. 227−241.
- Rajkumar M., Vara- Prasad M.N., Freitas H.5 Ae N. Biotechnological applications of serpentine soil bacteria for phytoremediation of trace metals // Crit. Rev. Biotechnol. 2009. Vol. 29. № 2. P. 120−130.
- Rensing C., Pribyl T., Nies D.H. New functions for the three subunits of the CzcCBA cation-proton antiporter // J. Bacteriol. 1997. Vol. 179. P. 6871−6879.
- Roane T.M., Josephson K.L., Pepper I.L. Dual-bioaugmentation strategy to enhance remediation of cocontaminated soil // Appl. Environ. Microbiol. 2001. Vol. 67. № 7. P. 3208−3215.
- Rosen B.P. Transport and detoxification systems for transition metals, heavy metals ands metalloids in eukaryotic and* prokaryotic microbes // Comp. Biochem. Physiol. A Molt Integr. Physiol. 2002: Vol. 133. № 3. P. 689−693.
- Rossbach S., Kukuk M.L., Wilson T.L., Feng S.F., Pearson M: M. and Fisher M.A. Cadmium-regulated gene fusions in Pseudomonas fluorescens II Environ. Microbiol: 2000: Vol- 2. P. 373−382.
- Rubikas J., Matulis D., Leipus A., Urbaitiene D. Nickel* resistance in Escherichia coli V38 is dependent on the concentration used for induction // FEMS Microbiol. Lett. 1997. Vol. 155. P: 193−198.
- Rutherford J.C., Cavet J.S., Robinson N.J. Cobalt-dependent transcriptional switching by a dual-effector MerR-like protein regulates a cobalt-exporting variant CPx-type ATPase // J. Biol. Chem: 1999. Vol. 274. № 6. P. 25 827−25 832.
- Saeki K., Kunito T., Oyaizu H., Matsumoto S. Relationships between bacterial1 tolerance levels and forms of copper and zinc in soils // J. Environ. Qua! 2002. Vol. 31. № 5. P. 1570−1575.
- Sambrook J., Russell D.W. Molecular Cloning. New York: Cold: Spring Harbor Lab. Press, 2001. Vol, 1−3.
- Sandrin T.R., Maier KM! Impact of metalsionithe biodegradation of organic pollutants//Environ. HealthPerspect. 2003 Vol. 111. № 8- P. 1093−1101.
- Schlegel H.G., Cosson J.-P., Baker A.J.M. Nickel-hyperaccumulating plants provide a niche for nickel-resistant bacteria // Bot. Acta: 1991. Vol. 104. P. 18−25.
- Schmidt T., Schlegel H.G. Combined nickel-cobalt-cadmium resistance encoded by the ncc locus of Alcaligenes xylosoxidancs 31A // J. Bacteriol. 1994. Vol. 176. P. 7045−7054.
- Schmidt T., Schlegel H.G. Nickel and cobalt resistance of various bacteria isolated from soil and highly polluted domestic and industrial wastes // FEMS Microbiol. Ecol. 1989. Vol. 62. P. 315−328
- Schmidt T., Stoppel R.D., Schlegel H.G. High-level nickel resistance in Alcaligenes xylosoxydans 31A and Alcaligenes eutrophus KT02 // Appl. Environ. Microbiol. 1991. Vol. 57. № 11. P. 3301−3309.
- Scott J.A., Palmer S.J. Sites of cadmium uptake in bacteria used for biosorption//Appl. Inviron. Microbiol. 1990. Vol. 33. P. 221−225.
- Shamsuzzaman K.M., Barnsley E.A. The regulation of naphthalene catabolism in pseudomonads // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1974. Vol. 60. P. 582−587.
- Sharma P.K., Balkwill D.L., Frenkel A., Vairavamurthy M.A. A new Klebsiella planticola strain (Od-1) grows anaerobically at high cadmium concentrations and* precipitates cadmium sulfide // Appl. Environ. Microbiol. 2000. Vol.- 66. № 7. P. 3083−3087.
- Siddiqui R.A. and Schlegel H.G. Plasmid pMOL28-mediated inducible nickel resistance in Alcaligenes eutrophus strain CH34 // FEMS Microbiol. Lett. 1987. Vol. 43. P. 9−13.
- Siddiqui R.A. Benthin K. Shlegel H.G. Cloning of pMOL28-encoded nickel resistance genes end expression of the genes in* Alcaligenes eutrophus and Pseudomonas sp. //J. Bacteriol. 1989. Vol. 171. P. 5071−5078.
- Sierra G. A simple method for the detection) of lipolytic activity of microorganisms and some observations on the influence of the contact between cells and fatty substrates //Antonie van Leeuwenhoek. 1957. Vol1. 23. P. 15−22.
- Silver S. and Walderhaug M. Gene regulation of plasmid- and chromosome-determined inorganic ion transport in bacteria // Microbiol. Rev. 1992. Vol. 56. № 1. P. 195−228.
- Silver S. Plasmid-determined metal resistance mechanisms to heavy metals II Plasmid. 1992. Vol 27. P. 1−3.
- Silver S., Phung le T. A bacterial: view of the periodic table: genes and proteins for toxic inorganic ions//J: Ind. Microbiol. Biotechnol. 2005: Vol. 32. № 11−12. P. 587−605.
- Slininger P.J. and: Jackson M.A. Nutritional factors regulating growth and accumulation' of phenazine-l-carboxylic acid by Pseudomonas fluorescens 279 //Appl: Microbiol: Biotechnol: 1992. Vol: 37. P: 388^3921
- Smith D: L., Tao T., andtMaguire M.E. Membrane topology of a P-type ATPase. The MgtB magnesium transport protein of Salmonella typhimurium II J. Biol: Chem. 1993- Vol. 268- Issue 30. P. 22 469−22 479:
- Stanier R.Y., Palleroni N.J., and Doudoroff M. The aerobic, pseudomonads: A taxonomic study // J. Gen. Microbiol. //1966- Vol: 43. P. 159−271.
- Stefanowicz A.M., Niklinska M., Kapusta P., Szarek-Lukaszewska G. Pine forest and grassland differently influence the response of soil microbial communities to metal contamination // Sei. Total Environ. 2010. Vol. 408. № 24. P. 6134−6141.
- Stoppel R.-D., Schlegel H.G. Nickel-resistant bacteria from antropogenically nickel-polluted and naturally nickel-percolated ecosystems // Appl: Environ. Microbiol. 1995. Vol. 61. № 6. P. 2276−2285.
- Taghavi S., Delanghe H., Lodewyckx C., Mergeay M., van der Lelie D. Nickel-resistance-based minitransposons: new tools for genetic manipulation ofenvironmental bacteria // Appl. Environ. Microbiol. 2001. Vol. 67. № 2. P. 1015−1019.
- Tibazarwa C., Wuertz S., Mergeay M., Wyns L. Regulation of the cnr cobalt and nickel resistance determinant of Ralstonia eutropha (Alcaligenes eutrophus) CH34 // J. Bacteriol. 2000. Vol. 182. P. 1399−1409.
- Tikhonovich I.F., Provorov N.A. From plant-microbe interactions to symbiogenetics: an universal paradigm for the interspecies genetic integration // Ann. Appl. Biol. 2009.4 Vol. 154. P. 341−350.
- Timmusk S., Paalme V., Pavlicek T., Bergquist J., Vangala A., Danilas T., Nevo E. Bacterial distribution, in the rhizosphere of wild barley under contrasting microclimates //PLoS One. 2011. Vol. 6. № 3. P. el7968!
- Timotius K. Schlegel H.G. Microbial megaplasmids. Nickel-resistant bacteria isolated from sewage / Nachrichten der Academie der Wissenschaften in- Gottingen. II Mathematisch-Physikalische Klasse. Schwartz E. ed. 1987. Vol. 3. P. 1−9.
- Tralau T., Cook A.M., Ruff J. Map of the IncPlbeta plasmid pTSA encoding the widespread genes (tsa) for p-toluenesulfonate degradation in Comamonas testosteroni T-2 // Appl: Environ- Microbiol. 2001 Vol. 67. № 4. P. 1508−1516.
- Tripathi V.N., Srivastava S. Extracytoplasmic storage as the nickel resistance mechanism in a natural isolate of Pseudomonas putida S4 // Can. J. Microbiol. 2006. Vol. 52. № 4. P. 287−292.
- Turgay O.C., Gormez A., Bilen S. Isolation and characterization of metal resistant-tolerant rhizosphere bacteria from the serpentine soils in Turkey //
- Environ. Moni. t Assess. 2011 Mar 16. Epub ahead of print.
- Udo E.E., Jacob L.E., Mathew B. A cadmium resistance plasmid, pXU5, in Staphylococcus aureus, strain ATCC25923 // FEMS Microbiol. Lett. 2000. Vol. 189. № 1. P. 79−80.
- Vahrenkamp H. Metalle in Lebensprozessen // Chemie in Unserer Zeit. 1979. Vol. 7. P. 97−105.
- Werle E., Schneider C., Renner M., Volker M. and FiehnW. Convenient single-step- one tube purification of PCRproducts for direct sequencing //Nucl. Acids Res. 1994. Vol. 22. № 20: P: 4354−4355.
- Weyens N., Croes S., Dupae J., Newman L., van der Lelie D., Carleer R., Vangronsveld J. Endophytic bacteria improve phytoremediation of Ni andTCE co-contamination // Environ- Pollut. 2010. Vol. 158. № 7. P. 2422−2427.
- Whiting S.N., de Souza M.P., Terry N. Rhizosphere bacteria mobilize Zn for hyperaccumulation by Thlaspi caerulescens II Environ. Sci. Technol. 2001. Vol. 35. № 15. P. 3144−3150.
- Wu J., Jiang Ch., Wang B., Ma Y., Liu Zh., and Liu Sh. Novel partial reductive pathway for 4-chloronitrobenzene and nitrobenzene degradation in Comamonas sp. strain-CNB-1 // Appl. Environ. Microbiol- 2006. Vol. 72. № 3. P. 1759−1765.
- YamagamiK., Nishimura S., Sorimachi M. Cd2+ and Co2+ at micromolar concentrations mobilize intracellular Ca2+ via the generation of inositol 1,4,5-triphosphate in bovine chromaffin cells // Brain Res. 1998. Vol. 798: № 1—2. P. 316−319.
- Zaidi S., Usmani S., Singh B.R., Musarrat J. Significance of Bacillus subtilis strain SJ-101 as a bioinoculant for concurrent plant growth promotion andnickel accumulation in Brassica jimcea // Chemosphere. 2006. Vol. 64. № 6. P. 991−997.
- Zgurskaya H.I., Nikaido H. Bypassing the periplasm: reconstitution of the AcrAB multidrug efflux pump of Escherichia coli II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999. Vol. 96. № 13. P. 7190−7195.
- Zhan J., Sun Q. Diversity of free-living nitrogen-fixing microorganisms in wastelands of copper mine tailings during the process of natural ecological restoration II J. Environ. Sci. (China). 2011. Vol. 23. № 3. P. 476−487.
- Zhang Y., Ma Y.F., Qi S.W., Meng B., Chaudhry M.T., Liu S.Q., Liu S.J. Responses to arsenate stress by Comamonas sp. strain CNB-1 at genetic and proteomic levels // Microbiology. 2007. Vol. 153. Pt. 11. P. 3713−3721.
- Zhuang X., Chen J., Shim 1L, Bai Z. New advances in plant growth-promoting rhizobacteria for biorcmcdiation // Environ. Int. 2007. Vol. 33. № 3. P. 406−413.