Помощь в написании студенческих работ
Антистрессовый сервис

Пуриновые дисахаридные нуклеозиды. 
Синтез и свойства

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Оптимизирован ранее разработанный в лаборатории метод получения дисахаридных нуклеозидов, исследовано влияние температуры, различных катализаторов на протекание реакции гликозилирования, устойчивости yV-гликозидной связи и используемых защитных групп. Установлено, что триметилсилилтрифторметансульфонат эффективно катализирует изомеризацию 3', 5'-0-(тетраизопропилдисилоксан-1,3-диил)нуклеозидов… Читать ещё >

Пуриновые дисахаридные нуклеозиды. Синтез и свойства (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Содержание

  • Список использованных сокращений

Глава 1. Дисахаридные нуклеозиды. Особенности структуры. Биологическая активность. Методы синтеза. Включение в олигонуклеотиды. (Обзор литературы)

1.1 Природные дисахаридные нуклеозиды

1.1.1. Поли (АОР-рибоза)

1.1.2. Минорные нуклеозиды — компоненты тРНК

1.1.3. Дисахаридные нуклеозиды в составе низкомолекулярных биологически активных соединений

1.2 Методы синтеза дисахаридных нуклеозидов

1.2.1. Конденсация дисахаридов с нуклеиновыми основаниями (N-гликозилирование)

1.2.2. Конденсация моносахаридов с нуклеозидами (О-гликозилирование)

1.3 Дисахаридные нуклеозиды в составе олигонуклеотидов

Глава 2. Пуриновые дисахаридные нуклеозиды. Синтез и свойства. (Обсуждение результатов)

2.1. Проведение реакции гликозилирования

2.2. Изучение стабильности 3', 5'-0-(тетраизопропилдисилоксан-1,3-диил)-нуклеозидов в условиях реакции гликозилирования

2.3. Синтез 3'-0-Р~В-рибофуранозил-2'-дезоксиаденозина

2.4. Синтез 2'-0-а-0-рибофуранозилнуклеоздов

2.5. Ингибирование поли (АОР-рибозо)полимеразы-1 человека дисахаридными нуклеозидами — производными структурного элемента поли (АОР-рибозы)

Глава 3. Экспериментальная часть 76

Выводы 101

Список литературы

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ: В работе использованы символы и сокращения структурных компонентов нуклеиновых кислот и их производных в соответствии с рекомендациями Комиссии по номенклатуре Международного Союза чистой и прикладной химии (IUPAC) и Международного Союза биохимиков (IUB), а также следующие обозначения:

Агр — 2'-0-р-В-рибофуранозиладенозин-5'-фосфат- BSA — N, 0-бис (триметилсилил)ацетамид-

COSY — correlation spectroscopy, методика двумерной гомоядерной корреляции- Grp — 2'-0-р-О-рибофуранозилгуанозин-5'-фосфат-

НМВС — heteronuclear multibond correlation, методика гетероядерной корреляции дальних взаимодействий-

1 1 ^

HSQC — heteronuclear single quantum coherence, методика гетероядерной (Н- С) одноквантовой кореляции-

IC50 — half maximal inhibitory concentration, концентрация ингибитора, при которой активность фермента составляет 50% от исходной- Ру — пиридин-

ROESY — Rotating frame Overhause Effect Spectroscopy, методика двумерной протон-протонной корреляция во вращающейся системе координат, основанная на ядерном эффекте Оверхаузера-

ТЮН — трифторметансульфоновая кислота- TIPDS — тетраизопропилдисилоксан-1,3-диил- TMSOTf — триметилсилилтрифторметансульфонат- ДМСО — диметилсульфоксид- ДМФА — диметилформамид- ДХЭ — 1,2-дихлорэтан-

КССВ — константа спин — спинового взаимодействия-

ПАРП — поли (АБР-рибозо)полимераза-

ТГФ — тетрагидрофуран-

ЯЭО — ядерный эффект Оверхаузера.

Нумерация схем, таблиц и рисунков в экспериментальной части соответствует нумерации в обсуждении результатов. В обзоре литературы отдельная нумерация.

Дисахаридные нуклеозиды — важная группа природных соединений. Эти соединения являются структурными элементами биополимеров, таких как тРНК и поли (АБР-рибоза), входят в состав антибиотиков и других биологически активных соединений, проявляя широкий спектр биологической активности — антибактериальные, противогрибковые, гербицидные, инсектицидные, противоопухолевые и антивирусные свойства. В этих соединениях имеется дополнительный моносахаридный остаток, присоединенный к одной из гидроксильных групп нуклеозида (3-гликозидной связью. Наличие дисахаридного остатка и гетероциклического основания определяет свойства соединений, родственные свойствам углеводов и нуклеозидов.

Анализ литературных данных показывает, что дисахаридные производные нуклеозидов изучены недостаточно хорошо. Это объясняется отсутствием простых и эффективных методов их синтеза. Возможны два пути получения дисахаридных нуклеозидов. Синтез может быть осуществлен конденсацией соответственно защищенного дисахарида с нуклеиновым основанием или реакцией нуклеозида с моносахаридом. Большинство нуклеозидных антибиотиков были синтезированы по первому пути [1]. Эта схема синтеза многостадийна. Возможность использования природных нуклеозидов существенно упрощает схему синтеза. В литературе известны несколько примеров образования О-гликозидной связи из частично защищенного нуклеозида и моносахарида. Однако выходы подобных реакций не превышали 20−40% из-за образования ряда побочных продуктов [1].

В нашей лаборатории был разработан метод получения 2'-0-p-D-рибофуранозилнуклеозидов [2, 3, 4]. В отличие от предыдущих синтезов выход дисахаридных нуклеозидов на стадии конденсации составлял 70−80% и реакция протекала стереоспецифично с образованием Р-аномеров. Разработанный метод был распространен на получение и других дисахаридных нуклеозидов [5−10].

С использованием этого метода был осуществлен первый химический синтез минорных компонентов тРНК — 2'-(9-(3−0-рибофуранозиладенозин-5'-фосфата (Агр) и 2'-О-Р-0-рибофуранозилгуанозин-5'-фосфата (Grp) [11−13]. Впервые синтезирован фрагмент тРНК, содержащий минорный нуклеотид Агр [14].

Следует отметить, что химические методы синтеза поли (АБР-рибозы) до последнего времени разработаны не были. Поли (АВР-рибоза) вовлечена в процессы модуляции структуры хроматина, репликации, транскрипции, репарации ДНК и дифференцировки клеток [15, 16]. Поли (АВР-рибоз)илирование белков катализируется несколькими полимеразами, которые постоянно и в значительном количестве имеются в клетке. Основным из этих ферментов является поли (АБР-рибозо)полимераза-1 (ПАРП-1). Она отвечает за синтез 90% поли (АОР-рибозы) в клетке [17]. В последние годы ведутся активные поиски ингибиторов полимеразы, которая является ферментом-мишенью для создания лекарственных препаратов. Представляется перспективным создание новых ингибиторов ПАРП-1 на основе дисахаридных нуклеозидов [18,19].

Целью настоящей работы явился синтез новых дисахаридных нуклеозидов для создания на их основе ингибиторов ПАРП-1. В ходе исследования решались следующие задачи: оптимизация ранее разработанного метода гликозилирования (определение оптимальных условий проведения реакции: температуры, катализатора, времени взаимодействия и т. д.), исследование устойчивости в условиях реакции N-гликозидной связи и используемых защитных группсинтез 2'-(9-а-В-рибофуранозиладенозинаструктурного элемента поли (АОР-рибозы) и его аналогов для изучения ингибиторных свойств синтезированных дисахаридных нуклеозидов в реакции, катализируемой ПАРП-1 человека.

выводы.

1. Оптимизирован ранее разработанный в лаборатории метод получения дисахаридных нуклеозидов, исследовано влияние температуры, различных катализаторов на протекание реакции гликозилирования, устойчивости yV-гликозидной связи и используемых защитных групп. Установлено, что триметилсилилтрифторметансульфонат эффективно катализирует изомеризацию 3', 5'-0-(тетраизопропилдисилоксан-1,3-диил)нуклеозидов с образованием 2', 3'-0-(тетраизопропилдисилоксан-1,3-диил)производных.

2. Впервые осуществлен химический синтез 2'-0-а-О-рибофуранозиладенозина, структурного элемента поли (АВР-рибозы) и его аналогов, что открывает новые возможности для создания ингибиторов поли (АЕ)Р-рибозо)полимераз.

3. Разработан метод получения 3'-0-р-О-рибофуранозил-2'-дезоксиаденозина и его а-аномера с использованием реакции трансгликозилирования. Обнаружено, что в условиях реакции Орибозилирования А^-бензоил-5 '-О-т/?е/и-бутилдифенилсилил-2'-дезоксиаденозин подвергается эффективной аномеризации. Предложен механизм протекания этого процесса, связанный с неустойчивостью iV-гликозидной связи в присутствии кислот Льюиса.

4. В ходе работы синтезировано 29 новых соединений, структура которых подтверждена данными масс-спектрометрии, УФ-, КДи ЯМР-спектроскопии. В ряду синтезированных соединений обнаружены ингибиторы рекомбинантной поли (АОР-рибозо)полимеразы-1 с IC50 Ю" 5 М.

Показать весь текст

Список литературы

  1. Lerner L.M. Synthesis and properties of various disaccharide nucleosides. // In: Chemistry of Nucleosidesand Nucleotides. Ed. Townsend L.B. N.Y.: Plenum Press. 1991, V. 2, P. 27−79.
  2. Mikhailov S.N., De Bruyn A., Herdewijn P. Synthesis and properties of some 2−0-p-D-ribofuranosylnucleosides. II Nucleosides Nucleotides. 1995,14, P.481−484.
  3. Mikhailov S.N., Efimtseva E.V., Rodionov A.A., Bobkov G.V., Kulikova I.V., Herdewijn P. Synthesis of 2-O-P-D-ribofuranosylnucleosides. // In: Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry. N.Y.: John Wiley & Sons. 2006, Unit 1.14.1−1.14.19. Supplement 27.
  4. Mikhailov S.N., De Clercq E., Herdewijn P. Ribosylation of pyrimidine 2'-deoxynucleosides. // Nucleosides Nucleotides 1996,15, P. 1323−1334.
  5. А.А., Ефимцева E.B., Фомичева M.B., Падюкова Н. Ш., Михайлов С. Н. Дисахаридные нуклеозиды. Синтез пиримидиновых 5'-0-Р-Б-рибофуранозилрибо- и 2'-дезоксирибонуклеозидов. II Биоорган, химия. 1999,25, С. 203−210.
  6. Efimtseva E.V., Bobkov G.V., Mikhailov S.N., van Aerschot A., Schepers G., Busson R., Rozenski J., Herdewijn P. Oligonucleotides containing disaccharide nucleosides. // Helv. Chim. Acta. 2001, 84, P. 2387−2397.
  7. Г. В., Жухлистова Н. Е., Некрасов Ю. В., Бобков Г. В., Ефимцева Е. В., Михайлов С. Н. Дисахаридные нуклеозиды. Кристаллическая и молекулярная структура 2'-0-p-D-рибопиранозилцитидина. // Кристаллография 2005, 50, С. 440−444.
  8. Rodionov А.А., Efimtseva E.V., Mikhailov S.N. Synthesis of 0-p-D-ribofiiranosyl-(l"-2')-adenosine-5"-0-phosphate. II Nucleosides Nucleotides 1999,18, P. 623−624.
  9. Rodionov A.A., Efimtseva E.V., Mikhailov S.N., Rozenski J., Luyten I., Herdewijn P. Synthesis and properties of 0-p-D-ribofuranosyl-(l"-2')-adenosine-5" — O-phosphate and its derivatives. // Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids 2000,19, P. 1847−1859.
  10. Efimtseva E.V., Shelkunova A.A., Mikhailov S.N., Nauwelaerts K., Rozenski J., Lescrinier E., Herdewijn P. Synthesis and properties of <9-P-D-ribofuranosyl-(1' 2')-guanosine-5"-0-phosphate and its derivatives. // Helv. Chim. Acta 2003,86, P. 504−514.
  11. D’Amours D., Desnoyers S., D’Silva I., Poirier G.G. Poly (ADP-ribosyl)ation reactions in the regulation of nuclear functions. // Biochem. J. 1999,342, P. 249−268.
  12. Hassa P.O., Haenni S.S., Elser M., Hottiger M.O. Nuclear ADP-ribosylation reactions in mammalian cells: where are we today and where are we going? // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2006, 70, P. 789−829.
  13. M.B., Лаврик О. И., Ходырева С. Н. Поли(АОР-рибозо)полимераза-1 -регулятор белково-нуклеиновых взаимодействий в процессах, возникающих при генотоксическом воздействии. // Молекулярная биология 2004,38, С. 834−847.
  14. Curtin N.J. PARP inhibitors for cancer therapy. // Expert Rev. Mol. Med. 2005, 7, P. 1−20.
  15. Jagtap P., Szabo C. Poly (ADP-ribose) polymerase and the therapeutic effects of its inhibitors. II Nat. Rev. Drug Discov. 2005, 4, P. 421−440.
  16. Dictionary of Natural Products on CD-ROM. Version 9:2, February 2001. Chapman & Hall / CRC.
  17. Knapp S. Synthesis of complex nucleoside antibiotics. // С hem. Rev. 1995,95, P. 1859−1876.
  18. Nauwelaerts K., Efimtseva E.V., Mikhailov S.N., Herdewijn P. Disaccharide nucleosides, an important group of natural compounds. // In: Frontiers in Nucleosides and Nucleic Acids. Eds Schinazi R.F., Liotta D.C.:IHL Press. Tucker USA. 2004, P. 187−220.
  19. E.B., Михайлов C.H. Дисахаридные нуклеозиды. // Успехи химии. 2004, 73, С. 435−448.
  20. Efimtseva E.V., Kulikova I.V., Mikhailov S.N. Disaccharide Nucleosides and their Incorporation into Oligonucleotides. // Cur. Org. Chem. 2007,11, P. 337−354.
  21. E.B., Куликова И. В., Михайлов C.H. Дисахаридные нуклеозиды важнаягруппа природных соединений. II Молекулярная биология. 2009, 43, С. 327−338.
  22. Sugimura Т., Miwa М. Poly (ADP-ribose): historical perspective. // Mol. Cell. Biochem. 1994, 138, P. 5−12.
  23. Ferro A.M., Oppenheimer N.J. Structure of a poly (adenosine diphosphoribose) monomer: 2'-(5"-phosphoribosyl)-5'-adenosine monophosphate. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1978, 75, P. 809 813.
  24. Oppenheimer N.J., Sing M., Sweeley C.C., Sung S.J. Srere P.A. The configuration and location of the ribosidic linkage in the prosthetic group of citrate lyase (Klebsiella aerogenes). // J Biol Chem. 1979, 254, P. 1000−1002.
  25. Schneider K., Dimroth P., Bott M. Identification of triphosphoribosyl-dephospho-CoA as precursor of the citrate lyase prosthetic group. // FEBSLett. 2000, 483, P. 165−168.
  26. Hoenke S., Wild M.R., Dimroth P. Biosynthesis of triphosphoribosyl-dephospho-coenzyme A, the precursor of the prosthetic group of malonate decarboxylase. // Biochemistry. 2000, 39, P. 13 223−13 232.
  27. Rozenski J., Crain P.F., Mc Closkey J.A. The RNA Modification Database: 1999 update. // Nucleic Acids Res. 1999,27, P. 196−197.
  28. Rozenski J., Crain P.F., Mc Closkey J.A. The RNA Modification Database. University of Utah. //Available at: http://medlib.med.utah.edu/RNAmods/.
  29. Keith G., Glasser A.-L., Desgres J., Kuo K.C., Gehrke C.W. Identification and strucctural characterization of 0-p-ribosyl-(l"-2')-adenosinc-5"-phosphate in yeast methionone initiator tRNA. // Nucleic Acids Res. 1990,18, P. 5989−5993.
  30. Kiesewetter S., Ott G., Sprinzl M. The role of modified purine 64 in initiator/elongator discrimination of tRNAMet from yeast and wheat germ. // Nucleic Acids Res. 1990, 18, P. 46 774 682.
  31. Glasser A.-L., Desgres J., Heitzler J., Gehrke C.W., Keith G. O-Ribosyl-phosphate purine as a constant modified nucleotide located at position 64 in cytoplasmic initiator tRNAsMet of yeasts. // Nucleic Acids Res. 1991,19, P. 5199−5203.
  32. Basavappa R., Sigler P.B. The 3 A crystal structure of yeast initiator tRNA: functional implications in initiator/elongator discrimination. // EMBO J. 1991,10, P. 3105−3111.
  33. Kiesewetter S., Ott G., Sprinzl M. The role of modified purine 64 in initiator/elongator discrimination of tRNAMet from yeast and wheat germ. // Nucleic Acids Res. 1990, 18, P. 46 774 682.
  34. Forster C., Chakraburtty K., Sprinzl M. Discrimination between initiation and elongation of protein biosynthesis in yeast: identity assured by a nucleotide modification in the initiator tRNA. // Nucl. Acids Res. 1993,21, P. 5679−5683.
  35. Isono K. Nucleoside antibiotics: structure, biological activity, and biosynthesis. // J. Antibiot. 1988,41, P. 1711−1739.
  36. Isono K. Current progress on nucleoside antibiotics. // Pharmacol. Ther. 1991,52, P. 269−286.
  37. Ubukata M., Kimura К., Isono К., Nelson C.C. Gregson J.M., McCloskey J.A. Structure elucidation of liposidomycins, a class of complex lipid nucleoside antibiotics. // J. Org. Chem.1992, 57, P. 6392−6403.
  38. Knapp S., Morriello G.M., Doss G.A. Synthesis of the Liposidomycin Diazepanone Nucleoside. // Org. Lett. 2002,4, P. 603−606.
  39. Knapp S., Morriello G.M., Nandan S., Emge T.J., Doss G.A., Mosley R.T., Chen L. Assignment of the Liposidomycin Diazepanone Stereochemistry. // J. Org. Chem. 2001, 66, P. 5822−5831.
  40. Correa V., Riley A.M., Shuto S., Home G., Nerou E.P., Marwood R.D., Potter B.V., Taylor C.W. Structural determinants of adenophostin A activity at inositol trisphosphate receptors. // Mo I Pharmacol. 2001, 59, P.1206−1215.
  41. Borissow C.N., Black S.J., Paul M., Tovey S.C., Dedos S.G., Taylor C.W., Potter B.V. Adenophostin A and analogues modified at the adenine moiety: synthesis, conformational analysis and biological activity. // OrgBiomol Chem. 2005,3, P. 245−252.
  42. McCormick J., Li Y., McCormick K., Duynstee H.I., van Engen A.K., van der Marel G.A.,
  43. Ganem В., van Boom J.H., Meinwald J. Structure and total synthesis of HF-7, a neuroactive106glyconucleoside disulfate from the funnel-web spider Hololena curta. II J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, P. 5661−5665.
  44. Taggi A.E., Meinwald J., Schroeder F.C. A new approach to natural products discovery exemplified by the identification of sulfated nucleosides in spider venom. // J. Am. Chem. Soc. 2004,126, P. 10 364−10 369.
  45. Kobayashi J., Doi Y., Ishibashi M. Shimofuridin A, a nucleoside derivative embracing an acylfucopyranoside unit isolated from the Okinawan marine tunicate Aplidium multiplicatum II J. Org. Chem. 1994, 59, P. 255−257.
  46. Doi Y., Ishibashi M., Kobayashi J. Isolation and structure of shimofuridins B-G from the Okinawan marine tunicate Aplidium multiplicatum. II Tetrahedron 1994, 50, P. 8651−8656.
  47. Stewart J.B., Bornemann V., Chen J.L., Moore R.E., Caplan F.R., Karuso H., Larsen L.K., Patterson G.M. Cytotoxic, fungicidal nucleosides from blue green algae belonging to the Scytonemataceae. И J. Antibiot. 1988, 41, P. 1048−1056.
  48. Kim S.H., Yoo S.M., Park I.S., Kim Y.H. A new inosine disaccharide from the. crustacean Ligia exotica: isolation and structure elucidation by total synthesis. // J. Nat. Prod. 2000, 63, P. 1188−1191.
  49. Seto H., Otake N., Sato S., Yamaguchi H., Takada K., Itoh M., Lu H.S.M., Clardy J. The structure of a new nucleoside antibiotic, capuramycin. // Tetrahedron Lett. 1988, 29, P. 23 432 346.
  50. Flynn E.H., Hinman J.W., Caron E.L., Woolf Jr. D.O. The chemistry of amicetin, a new antibiotic И J. Am. Chem. Soc. 1953, 75, P. 5867−5871.
  51. Shiomi К., Haneda К., Tomoda H., Iwai Y., Omura S. Cytosaminomycins, new anticoccidial agents produced by Streptomyces sp. KO-8119. II. Structure elucidation of cytosaminomycins A, В, С and D. II J. Antibiot. 1994,47, P. 782−786.
  52. Shomura Т., Nishizawa N., Iwata M., Yoshida J., Ito M., Amano S., Koyama M., Kojima M., Inouye S. Studies on a new nucleoside antibiotic, dapiramicin. I. Producing organism, assay method and fermentation. H J. Antibiot. 1983,36, P. 1300−1304.
  53. Nishizawa N., Kondo Y., Koyama M., Omoto S., Iwata M., Tsuruoka Т., Inouye S. Studies on a new nucleoside antibiotic, dapiramicin. II. Isolation, physico-chemical and biological characterization. II J. Antibiot. 1984,37, P. 1−5.
  54. Hamill R.L., Hoehn M.M. Anthelmycin, a new antibiotic with anthelmintic properties. // J. Antibiot. 1964, Ser. A 17, P. 100−103.
  55. Uchida K., IchikawaT., Shimauchi Y., Ishikura Т., Ozaki A. Hikizimycin, a new antibiotic. // J. Antibiot. 1971,24, P. 259−262.
  56. Gonzalez A., Vazquez D., Jimenez A. Inhibition of translation in bacterial and eukaryotic systems by the antibiotic anthelmycin (hikizimycin) // Biochim. Biophys. Acta (BBA) Nucleic Acids and Protein Synthesis 1979, 561, P. 403−409.
  57. Sakata, K., Sakurai Т., Tamura S. Structures of ezomycins B15 B2, CI, C2, D1 and D2. // Agric. Biol. Chem. 1977, 41, P. 2033−2039.
  58. Sakata K., Uzawa J., Sakurai A. Application of carbon-13 n.m.r. spectroscopy to the structural investigation of ezomycins.// Org. Magn. Resonance 1977,10, P. 230−234.
  59. Suzuki Y., Uchida K. Formation of p-galactosyl compounds of arabinosylcytosine in growing culture of Sporobolomyces singularis. II Biosci. Biotechnol. Biochem. 1994, 58, P. 639−643.
  60. Uchida K., SuzukiY. Formation of 3'-(2-p-Galactosyl compounds of 5-bromouridine by Sporobolomyces singularis. И Biosci. Biotechnol. Biochem. 2003, 67, P. 643−645.
  61. Auer C.A., Cohen J. D. Identification of a benzyladenine disaccharide conjugate produced during shoot organogenesis in petunia leaf explants // Plant Physiol. 1993,102, P. 541−545.
  62. Grancharov K., Naydenova Z., Lozeva S., Golovinsky E. Natural and synthetic inhibitors of UDP-glucuronosyltransferase // Pharmacol. Ther. 2001, 89, P. 171−186.
  63. Veal G.J., Back D.J. Metabolism of Zidovudine. // Gen. Pharmacol. 1995,26, P. 1469−1475.
  64. Barbier O., Turgeon D., Girard C., Green M.D., Tephly T.R., Hum D.W., Belanger A 3'!azido-3'-deoxythimidine (AZT) is glucuronidated by human UDPglucuronosyltransferase 2B7 (UGT2B7). II Drug Metab. Dispos. 2000,28, P. 497−502.
  65. Rooseboom M., Commandeur J.N.M., Vermeulen N.P.E Enzyme-Catalyzed Activation of Anticancer Prodrugs // Pharmacol. Rev. 2004, 56, P. 53−102.
  66. Desmoulin F., Gilard V., Malet-Martino M., Martino R. Metabolism of capecitabine, an oral fluorouracil prodrug: (19)F NMR studies in animal models and human urine. // Drug Metab. Dispos. 2002,30, P. 1221−1229.
  67. Watanabe K. A., Hollenberg D. H., Fox J. J. Nucleosides. LXXXV. Mechanisms of nucleoside synthesis by condensation reactions // J. Carbohydr. Nucleosides Nucleotides 1974,1, P. 1−37.
  68. Vorbruggen H. Adventures in silicon-organic chemistry // Acc. Chem. Res. 1995, 28, P. 509 520.
  69. Vorbruggen H., Ruh-Pohlenz C. Handbook of Nucleoside Synthesis. N.Y.: Wiley. 2001.
  70. Toshima K., Tatsuta K. Recent progress in O-glycosylation methods and its application to natural products synthesis. // Chem. Rev., 1993,93, P. 1503−1531.
  71. Schmidt R.R. Synthsis of Glycosides // In: Comprehensive Organic Synthesis. Eds.: Trost B.M., Fleming I., Winterfeldt E. Oxford: Pergamon Press, 1991, V. 6, P. 33−64.
  72. Kochetkov N.K. Recent developments in the synthesis of polysaccharides and stereospecificity of glycosylation reactions // In: Studies in Natural Products Chemistry. Ed. Atta-ur-Rahman Amsterdam: Elsevier, 1994- V. 14, P. 201−266.
  73. Pellissier H. Use of O-glycosylation in total synthesis. // Tetrahedron 2005, 61, P. 2947−2993.
  74. Knapp S., Gore V.K. Synthesis of shimofuridin nucleoside disaccharide. // J. Org. Chem. 1996,61, P. 6744−6747.
  75. Duynstee H.I., Wijsman E.R., van der Marel G.A., van Boom J.H. Synthesis of 21−0-4"-O sorboyl)-a-L-fucopyranosyl.inosine: a shimofuridin analogue. // Synlett. 1996, P. 313−314.
  76. Ning J., Xing Y., Kong F. A new and efficient strategy for the synthesis of shimofuridin analogs: 2'-0-(4−0-stearoyl-a-L-fucopyranosyl)thymidine and -uridine. // Carbohydr. Res. 2003, 338, P. 55−60.
  77. Watanabe K.A., Matsuda A., Halat M.J., Hollenberg D.H., Nisselbaum J.S., Fox J.J. Nucleosides. 114. 5-O-Glucuronides of 5-fluorouridine and 5-fluorocytidine. Masked precursors of anticancer nucleosides. II J. Med. Chem., 1981,24, P. 893−897.
  78. Suzuki Т., Tanaka S., Yamada I., Koashi Y., Yamada K., Chida N. Total synthesis of spicamycin amino nucleoside. // Org. Lett. 2000,2, P. 1137−1140.
  79. Niewczyk A., Krzyzaniak A., Barciszewski J., Markiewicz W.T. Studies on the synthesis of O-ribosyl-adenosine a new minor nucleoside of tRNA // Nucleosides Nucleotides, 1991, 10, P. 635−638.
  80. Markiewicz W.T., Niewczyk A., Gdaniec Z., Adamiak D.A., Dauter Z., Rypniewski W., Chmielewski M. Studies on synthesis and structure of O-P-D-ribofuranosyl (l"—>2')ribonucleosides and oligonucleotides. // Nucleosides Nucleotides 1998, 17, P. 411−424
  81. Markiewicz W. T, Bartoszuk A. Transformation of rings containing tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl group an equilibrium process enlarging the scope of applications of the group // Bull. Polish Acad. Sci. 1984, N. 32, P. 453−461.
  82. Yamaguchi Т., Saneyoshi M. Synthetic nucleosides and nucleotides. XXI. On the synthesis and biological evaluations of 2-deoxy-a-D-ribofuranosyl nucleosides and nucleotides. II Chem. Pharm. Bull 1984,32, P. 1441−1450.
  83. Mikhailov S.N., Kulikova I.Y., Nauwelaerts K., Herdewijn P. Synthesis of 2'-0-a-D-ribofuranosyladenosine, monomeric unit of poly (ADP-ribose). // Tetrahedron 2008, 64, P. 28 712 876.
  84. Kulikova I.V., Muradova D.A., Varizhuk I.S., Mikhailov S.N. Stereospecific Synthesis of 2'-O-a-D-ribofuranosylnucleosides. // Collection Symp. series 2008,10, P. 155−158.
  85. Nogami I., Arai Y., Yoneda M. Process for the production of purine derivatives. // Japan Kokai Tokkyo Koho 1974, 74−117 689. Chem. Abstr. 1973, 78, P. 27 900.
  86. Munakata Т., Shirahata K., Hayashi T. Process for the production of 5'-(P-D-galactosyl)-inosine. И Japan Kokai Tokkyo Koho 1972, 72−23 599. Chem. Abstr. 1975, 82, P. 153 800.
  87. Suzuki Y., Uchida K. Formation of p-galactosyl compounds of arabinosylcytosine in growing culture of Sporobolomyces singularis. I I Biosci. Biotechnol. Biochem. 1994, 58, P. 639−643.
  88. Suzuki Y., Uchida K., Fujimori S. Formation of adenosine p-galactosides by p-galactosidase. // Nippon Nogeikagaku Kaishi (in Japanese) 1974, 48, P. 605−611. Chem. Abstr. 1975, 82, P. 134 727.
  89. Suzuki Y., Uchida K. Formation of inosine P-galactosides by p-galactosidase.-// Nippon Nogeikagaku Kaishi (in Japanese) 1976,50, P. 231−236. Chem. Abstr. 1976, 85, P. 74 157.
  90. Suzuki Y., Uchida K., Formation of uridine p-galactosides by p-galactosidase.--// Nippon Nogeikagaku Kaishi (in Japanese), 1976 50, P. 237−242. Chem. Abstr. 1976, 85, P. 74 158.
  91. Binder W. H., Kahlig H., Schmid W. Galactosylation by use of beta-galactosidase: enzymatic syntheses of disaccharide nucleosides. // Tetrahedron: Asymmetry 1995, 6, P. 1703−1710.
  92. Huang H., Chopra R., Verdine G.L., Harrison S.C. Structure of a covalently trapped catalytic complex of HIV-1 reverse transcriptase: implications for drug resistance // Science 1998, 282, P. 1669−1675.
  93. B.C., Михайлов C.H. Реакция периодатного окисления в химии нуклеиновых кислот. Диальдегидные производные нуклеозидов, нуклеотидов и олигонуклеотидов. // Биоорган, химия 2000,26, С. 483−504.
  94. С.Н., Ефимцева Е. В. Дисахаридные нуклеозиды и олигонуклеотиды на их основе: новые инструменты исследования ферментов метаболизма нуклеиновых кислот. Биохимия. 2002,67, С. 1374−1384.
  95. О.М., Громова Е. С. Диальдегидсодержащие нуклеиновые кислоты и их компоненты: синтез, свойства, аффинная модификация белков. // Успехи химии 1999, 68, С. 267−278.
  96. Tunitskaya V.L., Rusakova E.E., Memelova L.V., Kochetkov S.N., van Aerschot A.,
  97. Herdewijn P., Efimtseva E.V., Ermolinsky B.S., Mikhailov S.N. The mapping of T7 RNA113polymerase active site with novel reagents oligonucleotides with reactive dialdehyde groups. // FEBSLett. 1999,442, P. 20−24.
  98. Mikhailov S.N., Rozenski J., Efimtseva E.V., Busson R., van Aerschot A., Herdewijn P. Chemical incorporation of 1-methyladenosine into oligonucleotides. // Nucleic Acids Res. 2002. 30, P. 1124−1131.
  99. Bobkov G.V., Brilliantov K.V., Mikhailov S.N., Rozenski J., van Aerschot A., Herdewijn P. Synthesis of oligoribonucleotides containing pyrimidine 2'-0-(hydroxyalkoxy)methyl.-ribonucleosides. // Collection Czech. Chem. Comm. 2006, 71, P. 804−819.
  100. Bobkov G. V., Mikhailov S. N., van Aerschot A., Herdewijn P. Phosphoramidite building blocks for efficient incorporation of 2'-0-aminoethoxy (and propoxy) methyl-nucleosides intoroligonucleotides. // Tetrahedron 2008, 64, P. 6238−6251.
  101. И.С., Куликова И. В., Мурадова Д. А., Михайлов С. Н. Синтез дисахаридных нуклеозидов. // Труды XVI Международной конференции и дискуссионного научного клуба IT+M& Украина, Гурзуф: 2008, С. 223−224.
  102. И.В., Мурадова Д. А., Михайлов C.H. Стабильность 3', 5'-0-(тетраизопропилдисилоксан-1,3-диил)нуклеозидов в присутствии кислот Льюиса. // Вестник МИТХТ, 2008,3, С. 90−95.
  103. Markiewicz W.T. Tetraisopropyldisiloxane-l, 3-diyl, a group for simultaneous protection of З'-and 5'-hydroxy functions of nucleosides. И J. Chem. Res. (S) 1979, P. 24−25.
  104. Verdegaal C.H.M, Jansse P.L., de Rooij J.F.M., van Boom J.H. Acid-catalysed isomerization of the tetraisopropyldisiloxane-l, 3-diyl group. Simultaneous protection of two secondary alcoholic functions. // Tetrahedron Lett. 1980,21, P. 1571−1574.
  105. Davies D.B. Conformations of Nucleosides and Nucleotides. // Progress in NMR-Spectroscopy V1978,12, P. 135−225.
  106. Kulikova I.V., Varizhuk I.S., Bobkov G.V., Efimtseva E.V., Mikhailov S.N. Effective Anomerisation of 2'-Deoxyadenosine and Thymidine Derivatives. // Collection Symposium series 2005, 7, P. 425−427.
  107. Oivanen M., Hovinen J., Lehikoinen P., Lonnberg H. Hydrolysis of the N-glycosidic bond of nucleosides and nucleotides. // Trends Org. Chem. 1993, 4, P. 397−412.
  108. Blunden S.J., Gusack P.A., Smith P.J. The use of tin compounds in carbohydrate and nucleoside chemistry. // J. Organomet. Chem. 1987,325, P. 141−152.
  109. Vorbruggen H., Ruh-Pohlenz C. Synthesis of nucleosides. // In: Organic Reactions. Ed. Paquette, L.A. N.Y.: Wiley. 2000- V. 55, P. 1−630.
  110. Rosemeyer H., Seela F., Toth G. Assignment of anomeric configuration of D-ribo-, arabino-, 2 '-deoxyribo-, and 2 ', 3 '-dideoxyribonucleosides by NOE difference spectroscopy. // Nucleosides Nucleotides 1989, 8, P. 587−597.
  111. Robins M.J., Robins R.K. The synthesis of 2'-deoxy-9-a- and p-D-ribofuranosylpurines and the correlation of their anomeric structure with proton magnetic resonance spectra. // J. Am. Chem. Soc. 1965, 87, P. 4934−4940.
  112. И.В., Мурадова Д. А., Михайлов С. Н. Синтез 2'-0-a-D-рибофуранозиладенозина, структурного элемента поли(АГ)Р-рибозы) // Труды XV Международной конференции и дискуссионного научного клуба ГГ+М&Ес'2007 Украина, Гурзуф: 2007, С. 320−321.
  113. F., Madej D., Robins M.J. 2' And З'-ketonucleosides and their arabino and xylo reduction products: Convenient access via selective protection and oxidation of ribonucleosides. // Tetrahedron 1984, 40, P.125−135.
  114. А., Форд Р. Спутник химика. М: Мир. 1976, С. 437−444.
  115. Ti G.S., Gaffney B.L., Jones R.A. Transient protection efficient one-flask syntheses of protected deoxynucleosides. II J. Am. Chem. Soc. 1982.104. P. 1316−1319.
  116. Ф. Г. Методы химии углеводов. М: Мир. 1967, С. 126.
  117. Работа выполнена при финансовой поддержке РФФИ, ИНТАС, программы РАН «Молекулярная и клеточная биология», Федерального агентства по науке и инновациям Российской Федерации (гос. контракт № 02.512.11.2247).
Заполнить форму текущей работой