Применение методов геносистематики для решения вопросов таксономии и изучения биоразнообразия прокариот
Турова Т. П., Колганова Т. В., Кузнецов Б. Б., Пименов Н. В. Филогенетическое разнообразие архейного компонента бактериальных обрастаний на коралловидных постройках в зонах выхода метана в Черном море. Микробиология. 2002,71,2,230−236. Марусина А. И., Булыгина Е. С., Кузнецов Б. Б., Турова Т. П., Кравченко И. К., Гальченко В. Ф. Система олигонуклеотидных праймеров для амплификации генов nijH… Читать ещё >
Применение методов геносистематики для решения вопросов таксономии и изучения биоразнообразия прокариот (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Содержание
- ВЫВОДЫ
1. Анализ распределения значений показателей гибридизации ДНК-ДНК, свидетельствующий о дискретности степеней родства бактерий, а также изучение с помощью общеупотребимых методов геносистематики родственных взаимоотношений представителей порядка На1оапаегоЫа1ез (как эталонного таксона) позволили предложить ориентировочные количественные критерии определения рангов таксонов бактерий от вида до семейства.
2. На примерах изучения некоторых таксонов бактерий проанализированы возможные причины несоответствия данных генотипического и фенотипического анализов. Показано, что часть таких несоответствий может быть снята при изменении классификации, однако не исключена возможность их объективного существования, объясняемая особенностями эволюции фенотипа и генотипа.
3. Включены в международную базу данных СепЬапк и проанализированы 415 нуклеотидных последовательностей генов 16Б рибосомных РНК, которые были использованы в описании 3 новых порядков, 4 новых семейств, 35 новых родов и 96 новых видов прокариот. Эти исследования подтверждают необходимость использования в современной таксономии бактерий результатов «рибосомной» филогенетики, как наиболее технологичного в настоящее время метода определения родственных взаимоотношений прокариот.
4. В геноме типового штамма термофильной сульфатвосстанавливающей бактерии Оехи1/о1отаси1ит ки: пе1. чох>и впервые было обнаружено существование двух копий гена 16Б рРНК, между которыми была выявлена значительная степень различий (до 8.3%) за счет сверхдлинных вставок, расположенных в вариабельных 5'- и З'-концевых областях последовательностей генов. Показано, что гетерогенность двух вариабельных-копий генов 168 рРНК может искажать положение исследуемого организма на филогенетическом дереве и предложены рекомендации для коррекции результатов филогенетического анализа.
5. В рамках комплексного филогенетического анализа проведены исследования белок-кодирующих генов, детерминирующих различные функциональные особенности бактерий: а) Включены в международную базу данных вепВапк 4 нуклеотидных последовательности фрагментов генов РМО-белка, результаты анализа которых совпадают с данными «рибосомной» филогенетики зеленых серных бактерий, но позволяют в сомнительных случаях дополнить и уточнить эти данные. Это подтверждает необходимость использования анализа данных генов в таксономии зеленых серных бактерий филы СЫогоЫ. б) Включены в международную базу данных СепВапк 19 нуклеотидных последовательностей генов нитрогеназы, результаты анализа которых в значительной степени совпадают с данными «рибосомной» филогенетики. Это свидетельствует о возможности использования нитрогеназных генов в качестве дополнительных филогенетических маркеров при изучении таксономии азотфиксирующих бактерий, а также при изучении биоразнообразия этих бактерий в природных экосистемах. в) Включены в международную базу данных СепВапк 70 нуклеотидных последовательностей генов РБФК, результаты анализа которых позволили выявить особенности эволюции различных групп автотрофных бактерий. Сравнение этих результатов с результатами «рибосомной» филогенетики свидетельствует о значительном вкладе в эволюцию автотрофов дупликации генов РБФК, а также процессов их горизонтального переноса, что
71 во многих случаях ограничивает использование данных генов в качестве молекулярных маркеров. г) Включены в международную базу данных GenBank 53 нуклеотидные последовательности генов биодеградации н-алканов геобацилл, анализ которых показал множественность этих генов в геномах штаммов геобацилл, а также отсутствие видовой специфичности этих генов, что не позволяет использовать их как для таксономических целей, так и для оценки разнообразия геобацилл в природных экосистемах. Однако полученные результаты могут быть полезными для изучения эволюции функции биодеградации алканов у бактерий.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
В настоящее время в молекулярной биологии выработан целый ряд экспериментальных подходов, позволяющих устанавливать степень генетического родства организмов для таксонов самого разного ранга — от отдельных индивидуумов (в микробиологии — штаммов) до доменов. Тем самым систематикам, в том числе, и в микробиологии, была предоставлена возможность установления филогенетических связей по объективным критериям и создания естественных систем, основанных на степени генетического родства.
Оценивая достижения хотя и сравнительно молодой, но уже достаточно зарекомендовавшей себя области систематики прокариот — молекулярной (или гено-) систематики следует подчеркнуть, что они дают возможность взглянуть на решение проблем изучения разнообразия форм бактерий с новой точки зрения. Несомненно, что многие конкретные эволюционные и таксономические заключения, вытекающие из результатов методов геносистематики, в настоящее время не являются бесспорными и, возможно, впоследствии будут опровергнуты, изменены или дополнены, но сама возможность выдвижения таких заключений на принципиально новой основе чрезвычайно важна.
Современный этап развития геносистематики бактерий можно охарактеризовать следующим образом. В настоящее время полностью определены возможности использования в таксономии бактерий результатов метода ДНК-ДНК гибридизации. Необходимость получения таксономических заключений с помощью этого метода на видовом уровне закреплена в Правилах
69 номенклатуры бактерий. В значительной степени определена значимость «рибосомной» филогенетики, результаты которой стали своего рода «филогенетическим скелетом» в таксономии бактерий. В то же время, ограничения в использовании результатов этих, ставших уже традиционными, методов диктуют необходимость поиска дополнительных или даже альтернативных молекулярно-биологических подходов. Одним из таких подходов может стать введение в практику таксономических исследований методов сравнительного анализа белок-кодирующих генов, детерминирующих различные процессы метаболизма.
Этот подход, как и основанный на сравнении рибосомных генов, подвергается критике на том основании, что представляя лишь незначительную часть генома, индивидуальные гены не могут служить индикаторами степени родства всего организма. Это отчасти справедливо: чем более протяженные участки генома анализируются, тем надежнее филогенетические
выводы, которые делаются на этом основании. Однако комплексный анализ моногенных филогенетических построений, включающий сравнение как рибосомных, так и различных структурных генов, детермирующих независимые друг от друга метаболистические функции («смешение» филогений), свидетельствует о том, что такой подход может в достаточной степени отражать филогению организмов. Дальнейший прогресс в этом направлении связан с новым, интенсивно развивающимся подходом — геномикой, т. е. сравнительным анализом полностью расшифрованных геномов организмов. При этом становится возможным не только простое сравнение нуклеотидных последовательностей по количеству нуклеотидных замен, но и сопоставление конкретных особенностей организации различных геномов, приобретаемых в процессе эволюции и включающих возможные масштабные перестройки.
1. Антонов A.C., Леванова Г. Ф., Попов JI.C., Турова Т. П., Урюпина Н. В. Об уточнении систематического положения некоторых морских бактерий методом гибридизации ДНК-ДНК. Ж. микробиол. эпидвмиол. иммунол. 1975, 1,94−96.
2. Леванова Г. Ф., Турова Т. П. Попытка установления геномного сходства Alcaligenes faecalis с некоторыми грамотрицательными бактериями с помощью метода молекулярно гибридизации ДНК-ДНК. Микробиология. 1977, 46, 1, 92−95.
3. Турова Т. П., Антонов A.C. Сходство полинуклеотидных последовательностей ДНК холерных и так называемых неагглютинирующихся вибрионов. Ж. микробиол. эпидемиол. иммунол. 1977,7,47−50.
4. Антонов A.C., Белоусова A.A., Лысенко A.M., Турова Т. П. Экспресс-методы идентификации микроорганизмов, основанные на гибридизации ДНК. Микробиология. 1978, 47, 6, 1049−1054.
5. Медников Б. М., Турова Т. П. Анализ термостабильности гибридных молекул ДНК микроорганизмов как средство повышения разрешающей способности метода молекулярной гибридизации. Молекулярная биология. 1978, 12, 4, 853−856.
6. Турова Т. П. Сходство нуклеотидных последовательностей ДНК некоторых вибрионов. Ж. микробиол. эпидемиол. иммунол. 1979, 12, 2528.
7. Турова Т. П. Определение таксономического положения Vibrio parahaemolyticus с помощью метода молекулярной гибридизации ДНК. Биологические науки. 1980, 2, 26−28.
8. Турова Т. П. Дивергенция геномов близкородственных штаммов вибрионов. Биологические науки. 1980, 6, 29−32.
9. Турова Т. П., Леванова Г. Ф. Геномная характеристика новой группы микроорганизмов семейства Vibrionaceae. Ж. микробиол. эпидемиол. виру con. 1980, 3, 27−29.72.
10. Турова Т. П., Иванова Т. Л., Антонов А. С. Гибридизация ДНК пурпурных фототрофных бактерий. Известия АН СССР, серия биологическая. 1982, 5, 763−767.
11. Бондаренко В. М., Афанасьева С. М., Турова Т. П. Нуклеотидный состав и степень гомологии ДНК штаммов трибы Klebsielleae. Молекул, генетика, микробиол. вирусол. 1983, 1,43−46.
12. Примакова Г. А., Турова Т. П., Заворуев В. В., Воробьева Т. И. Определение таксономического положения Photobacterium belozerskii. Микробиология. 1983, 52, 1,98−101.
13. Cherevach N.V., Tourova Т.Р., Belikova V.L. DNA-DNA homology studies among strains of Kurthia zopfii. FEMSMicrobiol. Lett. 1983, 19, 243−245.
14. Турова Т. П., Графова Т. И., Бодапов И. М. Алломонады новая группа микроорганизмов семейства Vibrionaceae. Сообщение V. Таксономическое положение алломонад на основе изучения их ДНК. Ж. микробиол. эпидемиол. иммунол. 1983, 1, 22−24.
15. Воробьева Л. И., Турова Т. П., Краева Н. И., Алексеева М. А: Пропионовокислые кокки и их систематическое положение. Микробиология. 1983, 52, 3, 465−471.
16. Иванова Т. Л., Турова Т. П., Антонов А. С. Определение родственных связей бактерий рода Ectothiorhodospira. Микробиология. 1983, 52, 4, 538 542.
17. Примакова Г. А., Турова Т. П., Воробьева Т. И., Фиш A.M., Антонов А. С. Определение таксономического положения культур психрофильных светящихся бактерий путем молекулярной гибридизации ДНК-ДНК. Микробиология. 1983, 52, 2, 290−293.
18. Ценева Г. Я., Бондаренко В. М., Турова Т. П. Нуклеотидный остав и степень гомологии ДНК Y. pseudotuberculosis различных патоваров. Молекул, генетика, микробиол. вирусол. 1983, 3, 23−26.
19. Kalina G.P., Antonov A.S., Tourova Т.Р., Grafova T.I. Allomonas enterica gen.nov., sp.nov.: deoxiribonucleid acid homology between Allomonas and some other members of the Vibrionaceae. Int. J. Syst. Bacteriol., 1984, 34, 2, 150−154.
20. Иванова Т. Л., Турова Т. П., Антонов А. С. Определение родственных связей пурпурных серных бактерий семейства Chromatiaceae. Микробиология. 1984, 53, 4, 762−764.
21. Турова Т. П., Родионова И. В. Гомология ДНК и таксономия рода Francisella. Молекул, генетика, микробиол. вирусол. 1984, 11, 45−47.
22. Турова Т. П., Иванова Т. Л. Родственные взаимоотношения пурпурных бактерий рода Rhodopseudomonas. Микробиология. 1984, 53, 2, 313−317.
23. Ogarkova О.А., Tourova Т.Р., Balayeva N.M. The use of molecular hybridization to evaluate the divergence of some altered Rickettsia prowazekii strains. Acta virol., 1985, 29, 329−333.
24. Компанцева Е. И., Иванова Т. Л., Турова Т. П. О таксономическом статусе новых галофильных бактерий семейства Rhodospirillaceae. Микробиология. 1985, 54, 2, 227−228.73.
25. Компанцева Е. И., Иванова Т. Л., Турова Т. П. О таксономическом значении фенотипических признаков бактерий рода Ectothiorhodospira. Микробиология. 1985, 54,3,499−501.
26. Ivanova T.L., Tourova Т.Р., Antonov A.S. DNA-DNA and rRNA-DNA hybridization studies in the genus Ectothiorhodospira and other purple sulfur bacteria. Arch. Microbiol. 1985, 143, 154−156.
27. Хальчицкий A.E., Турова Т. П. Изучение таксономического положения азотфиксирующих спирилл. Микробиология. 1986, 55, 2, 301−304.
28. Примакова Г. А., Турова Т. П., Иванова T.JI. Дивергенция геномов культур психрофильных светящихся бактерий рода Photobacterium. Микробиология. 1986, 55, 2, 344−346.
29. Бакулов И. А., Котляров В. М., Турова Т. П., Бакалдина Н. Б., Иванова Т. Л. Идентификация листерий с помощью метода молекулярной ДНК-ДНК гибридизации. Молекул, генетика, микробиол. еирусол. 1988, 7, 31−35.
30. Ivanova T.L., Tourova Т.Р., Antonov A.S. DNA-DNA hybridization studies on some purple nonsulfiir bacteria. System. Appl. Microbiol. 1988, 10, 259−263.
31. Филиппова C.H., Кузнецов В. Д., Турова Т. П., Иванова T.JI. Анализ сходства геномов стрептомицетов флуоресцирующей подгруппы как подтверждение их таксономической ревизии популяционным методом. Микробиология. 1989, 58, 1, 87−90.
32. Tourova Т.Р., Poltaraus A B.,.Lebedeva I. A., Tsaplina I A., Bogdanova T.I., Karavaiko G.I. 16S ribosomal RNA (rDNA) sequence analysis and phylogenetic position of Sulfobacillus thermosulfidooxidans. System. Appl. Microbiol. 1994, 17, 509−512.
33. Tourova Т.Р., Boulygina E.S., Zhilina T.N., Hanson R.S., Zavarzin G.A. The phylogenetic study of haloanaerobic bacteria by 16S ribosomal RNA sequence analysis. System. Appl. Microbiol, 1995,18, 2. 189−195.
34. Жилина Т. Н., Турова Т. П., Лысенко A.M.: Кевбрин В. В. Реклассификация штамма Halobacteroides halobius Z- 7287 на основе филогенетического анализа в качестве нового вида Halobacteroides elegans sp.nov. Микробиология. 1997,66,1,114−121.
35. Турова Т. П., Назина Т. Н., Полтараус А. Б., Осипов Г. А. Филогенетическое положение и хемотаксономические характеристики сульфатвосстанавливающих бактерий рода Desulfomicrobium. Микробиология. 1998, 67, 6, .799−806.
36. Doronina N.V., Trotsenko Y.A., Krausova V.l., Bouligina E.S., Tourova T.P. Methylopila, a new genus of non-pigmented facultatively methylothrophic bacteria. Int. J. Syst.Bacteriol. 1998.48, 4, 1313−1321.
37. Турова Т. П., Омельченко М. В., Фегединг К. В., Васильева JI.B. Филогенетическое положение Methylobacter psychrophilus sp.nov. Микробиология. 1999, 68, 4, 568−570.
38. Жилина Т. Н., Турова Т. П., Кузнецов Б. Б., Кострикина H.A., Лысенко A.M. Orenia sivashensis sp.nov. новая умеренно галофильная анаэробная бактерия из лагун Сиваша. Микробиология. 1999, 68, 4, 529−537.
39. Григорьева Н. В., Авакян З. А., Турова Т. П., Кондратьева Т. В., Каравайко Г. И. Скрининг и изучение микроорганизмов, деструктирующих цианиды и тиоцианаты. Микробиология. 1999. 68. 4. 453−460.
40. Турова Т. П., Гарнова Е. С., Жилина Т. Н. Филогенетическое разнообразие алкалофильных анаэробных сахаролитических бактерий, выделенных из содовых озер. Микробиология. 1999, 68, 5,701−709.
41. Сорокин Д. Ю., Турова Т. П., Кузнецов Б. Б., Брянцева И., Горленко В. М. Roseinatronobacter thiooxidans gen. nov., sp. nov., новая алкалофильная аэробная бактериохлорофилл a-содержащая бактерия из содового озера. Микробиология. 2000, 69, 1, 89−97.
42. Турова Т. П., Кузнецов Б. Б., Колганова T.B., Бонч-Осмоловская Е. А. Филогенетическое положение De sulfur ос ос cus amylolyticus. Микробиология. 2000, 69, 3, 447−448.
43. Брянцева И. А., Горленко В. М., Турова Т. П., Кузнецов Б. Б., Лысенко.
44. A.M., Быкова С. А., Гальченко В. Ф., Митюшина JI.JI., Осипов Г. А. Heliobacterium sulfidophilum sp. nov. и Heliobacterium undosum sp. nov.: сульфидокисляющие гелиобактерии из термальных сероводородных источников. Микробиология. 2000, 69, 3, 396−406.
45. Sorokin D.Yu., Tourova T.P., Kuenen J.G. A new facultatively autotrophic hydrogenand sulfur-oxidizing bacterium from an alkaline environment. Extremophiles. 2000, 4, 4,237−45.
46. Bryantseva I.A., Gorlenko V.M., Kompantseva E.I., Tourova T.P., Kuznetsov.
47. B.B., Osipov G.A. Alkaliphilic heliobacterium Heliorestis baculata sp. nov. and emended description of the genus Heliorestis. Arch. Microbiol. 2000, 174, 4, 283−291.
48. Каравайко Г. И., Турова Т. П., Цаплина И. А., Богданова Т. И. Филогенетическое положение аэробных умеренно-термофильных бактерий вида Sulfobacillus, окисляющих Fe2+, S (0) и сульфидные минералы. Микробиология. 2000, 69, 6, 857−860.
49. Simankova M.V., Parshina S.N., Tourova Т.Р., Kolganova T.V., Zehnder A.J.B., Nozhevnikova A.N. Methanosarcina lacustris sp.nov., a new psychrotolerant methanogenic archaeon from anoxic lake sedimrnts. Syst. Appl. Microbiol. 2001, 24, 362−367.
50. Турова Т. П., Кузнецов Б. Б., Новикова E.B., Полтараус А. Б., Назина Т. Н. Гетерогенность нуклеотидных последовательностей генов 16S рибосомной РНК типового штамма Desulfotomaculum kuznetsovii. Микробиология. 2001, 70. 6. 788−795.
51. Турова Т. П., Кузнецов Б. Б., Доронина H.В., Троценко Ю.А.— Филогенетический анализ аэробных метилотрофных бактерий, использующих дихлорметан. Микробиология. 2001, 70, 1, 92−97.
52. Марусина А. И., Булыгина Е. С., Кузнецов Б. Б., Турова Т. П., Кравченко И. К., Гальченко В. Ф. Система олигонуклеотидных праймеров для амплификации генов nijH различных таксономических групп прокариот. Микробиология. 2001; 70, 1, 86−91.
53. Sorokin D.Yu., Tourova Т.Р., Lysenko A.M., Kuenen J.G. Microbial thiocyanate utilization under highly alkaline conditions. Appl. Environ. Microbiol. 2001, 67,2, 528−538.
54. Жилина Т. Н., Гарнова Е. С., Турова Т. П., Кострикина Н. А., Заварзин Г. А. Halonatronum saccharophilum gen. nov. sp. nov-новая галоалкалофильная бактерия порядка Haloanaerobialis из озера Магади. Микробиология. 2001, 70, 1, 77−85.77.
55. Doronina N.V., Trotsenko Y.A., Kuznetzov B.B., Tourova T.P. Emended description of Paracoccus kondratievae. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002, 52, 2, 679−682.
56. Колганова T.B., Кузнецов Б. Б., Турова Т. П. Подбор и тестирование олигонуклеотидных праймеров для амплификации и секвенирования генов 16S рРНК архей. Микробиология. 2002, 71, 2,283−286.
57. Турова Т. П., Колганова Т. В., Кузнецов Б. Б., Пименов Н. В. Филогенетическое разнообразие архейного компонента бактериальных обрастаний на коралловидных постройках в зонах выхода метана в Черном море. Микробиология. 2002,71,2,230−236.
58. Булыгина Е. С., Кузнецов Б. Б., Марусина А. И., Турова Т. П., Кравченко И. К., Быкова С. А., Колганова Т. В., Гальченко В. Ф. Изучение нуклеотидных последовательностей ni/H генов у представителей метанотрофных бактерий Микробиология. 2002, 71, 4, 500−508.
59. Muntyan M. S., Tourova T.P., Lysenko A. M., Kolganova T. V., Fritze D., Skulachev V. P. Molecular identification of alkaliphilic and halotolerant strain Bacillus sp. FTU as Bacillus pseudofirmus FTU. Extremophiles, 2002, 6, 3, 195−199.
60. Sorokin D. Yu, Tourova T.P., Kolganova T.V., Sjollema K.A., Kuenen J.G. Thioalkalispira microaerophila gen. nov., sp. nov., a novel lithoautotrophic, sulfur-oxidizing bacterium from a soda lake. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002, 52, 6,2175−2182.78.
61. Попова H.A., Николаев Ю. А., Турова Т. П., Лысенко А. М, Осипов Г. А., Верховцева Н. В., Панйков Н. С. Geobacillus uralicus новый вид— термофильных микроорганизмов. Микробиология. 2002 71,3, 391−398.
62. Назина Т. Н.,.Григорьян А. А, Сюэ Ян-Фен, Полтараус А. Б., Новикова Е. В., Турова Т. П.,.Беляев С. С. Физиологическое и филогенетическое разнообразие аэробных сапротрофных бактерий из нефтяного месторождения Дацин. Микробиология. 2002, 71, 1, 103−110.
63. Karavaiko G.I., Kondrat’eva T.F., Tourova Т.Р., Lysenko A.M., Kolganova T.V., Ageeva S.N., Muntyan L.N., Pivovarova T.A. Phylogenetic heterogeneity of the species Acidithiobacillus ferrooxidans. Int J Syst Evol Microbiol. 2003, 53,1,113−119.
64. Gamova E.S., Zhilina T.N., Tourova Т.Р., Lysenko A.M. Anoxynatronum sibiricum gen.nov., sp.nov. alkaliphilic saccharolytic anaerobe from cellulolytic community of Nizhnee Beloe (Transbaikal region). Extremophiles. 2003, 7, 3, 213−220.
65. Ушакова Н. А., Белов Л. П., Варшавский А. А., Козлова А. А., Колганова Т. В., Булыгина Е. С., Турова Т. П. Расщепление целлюлозы при дефиците азота бактериями, выделенными из кишечника растительноядных позвоночных. Микробиология. 2003, 72, 3, 400−406.
66. Меламуд B.C., Пивоварова Т. А., Турова Т. П., Колганова Т. В., Осипов Г. А., Лысенко A.M., Кондратьева Т. Ф., Каравайко Г. И. Sulfobacillus sibiricus sp. nov., новая умеренно термофильная бактерия. Микробиология. 2003, 72, 5, 681−688.
67. Sorokin D. Yu., Tourova Т.Р., Sjollema К. A., Kuenen J. G. Thialkalivibrio nitratireducens sp. nov., a nitrate-reducing member of an autotrophic denitrifying consortium from a soda lake. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003, 53, 6, 1779−1783.
68. Sizova M.V., Panikov N.S., Tourova T.P., Flanagan P.W. Isolation and Characterization of Oligotrophic Acido-Tolerant Methanogenic Consortia from Sphagnum Peat Bog. FEMS Microbial.Ecol. 2003. 45, 301−315.
69. Горленко B.M., Брянцева И. А., Пантелеева E. E., Турова Т. П., Колганова Т. В., Махнева З. К., Москаленко А. А. Ectothiorhodosinus mongolicum gen. nov., sp. nov. новая пурпурная серная бактерия из содового озера Монголии. Микробиология. 2004, 73,1, 80−88.
70. Ушакова Н. А., Феоктистова Н. Ю., Колганова Т. В., Турова Т. П. Microbacterium oxydans симбионт хомячка Кэмпбелла, обладающий пробиотическими свойствами. Прикладная биохимия и микробиология. 2004, 40, 6, 639−644.
71. Sorokin D.Yu., Tourova T.P., Muyzer G. Oxidation of thiosulfate to tetrathionate by an haloarchaeon isolated from hypersaline habitat. Extremophiles. 2005, 9, 6, 501−504.
72. Sorokin, D.Yu., Tourova, T.P., Muyzer, G. Citreicella thiooxidans gen. nov., 81sp. nov., a novel lithoheterotrophic sulfur-oxidizing bacterium from the Black Sea. Syst. Appl. Microbiol. 2005, 28, 8, 679−687.
73. Жилина Т. Н., Кевбрин В. В., Турова Т. П., Лысенко A.M., Кострикина Н. А., Заварзин Г. А. Clostridium alkalicellum sp. nov. — облигатно алкалофильный целлюлозолитик из содового озера Прибайкалья. Микробиология. 2005, 74, 642−653.
74. Подкопаева Д. А., Грабович М. Ю., Дубинина Г. А., Лысенко A.M., Турова Т. П., Колганова Т. В. Два новых вида микроаэрофильных серных спирилл, Spirillum winogradskii sp. nov. и Spirillum kriegii sp. nov. Микробиология. 2006, 75, 2, 212−220.
75. Берестовская Ю. Ю., Лысенко A.M., Турова Т. П., Васильева Л. В. Психротолерантный Caulobacter sp. из почв российской полярной тундры. Микробиология. 2006, 75, 3, 377−382.
76. Слободова Н. В., Колганова Т. В., Булыгина Е. С., Кузнецов Б. Б., Турова Т. П., Кравченко И. К. Сравнительная характеристика метанотрофных накопительных культур с помощью серологических и молекулярных методов. Микробиология. 2006, 75, 3, 397−403.
77. Sorokin D.Yu., Zhilina T.N., Lysenko A.M., Tourova T.P., Spiridonova E.M. Metabolic versatility of haloalkaliphilic bacteria from soda lakes belonging to the Alkalispirillum-Alkalilimmcola group. Extremophiles. 2006, 10, 3, 213−220.
78. Sorokin D.Yu., Tourova Т.Р., Lysenko A.M., Muyzer G. Diversity of culturable halophilic sulfur-oxidizing bacteria in hypersaline habitats. Microbiology (UK). 2006, 152, 10, 3013- 3023.83.
79. Спиридонова Е. М., Кузнецов Б. Б., Пименов Н. В., Турова Т. П. Определение филогенетического разнообразия эндосимбионтов моллюска Bathymodiolus azoricus на основании анализа генов 16S рРНК, cbbL и ртоА. Микробиология. 2006, 75, 6, 798−806.
80. Дорошенко Е. В., Булыгина Е. С., Спиридонова Е. М., Турова Т. П., Кравченко И. К. Выделение и характеристика азотфиксирующих бактерий рода Azospirillum из почвы сфагнового болота. Микробиология. 2007, 76, 1, 107−115.
81. Sizova M.V., Panikov N.S., Spiridonova E.M., Slobodova N.V., Tourova T.P. Novel facultative anaerobic acidotolerant Telmatospirillum siberiense gen. nov. sp. nov. isolated from mesotrophic fen. Syst. Appl. Microbiol. 2007, 30, 3, 213 220.
82. Sorokin D. Yu., van Pelt S., Tourova T. P., Takaichi S., and Muyzer G. Acetonitrile degradation under haloalkaline conditions by Natronocella acetinitrilica gen. nov., sp. nov. Microbiology (UK). 2007, 153, 1157−1164.
83. Sorokin D.Y., van Pelt S., Tourova T.P., Muyzer G. Microbial isobutyronitrile utilization under haloalkaline conditions. Appl. Environ. Microbiol. 2007, 73, 17, 5574−5579.
84. Кеппен О. И., Турова Т. П., Ивановский Р. Н., Лебедева Н. В., Баслеров Р. В., Берг И. А. Филогенетическое положение трех штаммов зеленых серных бактерий. Микробиология. 2008, 77, 2, 282−285.
85. Кеппен О. И., Берг И. А., Лебедева Н. В., Таисова А. С., Колганова Т. В., Слободова Н. В., Булыгина Е. С., Турова Т. П., Ивановский Р. Н. Новая зеленая серная бактерия Chlorobium macestae sp.nov. Микробиология.2008, 77, 1, 79−88.
86. Sorokin I.D., Kravchenko I.K., Doroshenko E.V., Boulygina E.S., Zadorina E.V., Tourova T.P., Sorokin D.Y. Haloalkaliphilic diazotrophs in soda solonchak soils. FEMSMicrobiolEcol. 2008, 65, 425−433.
87. Shapovalova A.A., Khijniak T.V., Tourova T.P., Muyzer G., Sorokin D.Y. Heterotrophic denitrification at extremely high salt and pH by haloalkaliphilic Gammaproteobacteria from hypersaline soda lakes. Extremophiles. 2008, 12, 619−625.
88. Sorokin D.Y., Tourova T.P., Henstra A.M., Stams A.J., Galinski E.A., Muyzer G. Sulfidogenesis under extremely haloalkaline conditions by85.
89. Desulfonatronospira thiodismutans gen. nov., sp. nov., and Desulfonatronospira delicata sp. nov. a novel lineage of Deltaproteobacteria from hypersaline soda lakes. Microbiology (UK). 2008, 154, 5, 1444−1453.
90. Турова Т. П., Назина Т. Н., Михайлова Е. М., Родионова Т. А.,. Екимов А. Н, Машукова А. В., Полтараус А. Б. Гомологи alkB термофильных бактерий рода Geobacillus. Молекулярная биология. 2008, 42, 2, 47−57.
91. Sorokin D.Y., van Pelt S., Tourova T.P. Utilization of aliphatic nitriles under haloalkaline conditions by Bacillus alkalinitrilicus sp. nov. isolated from soda solonchak soil. FEMS Microbiol Lett. 2008, 288, 2, 235−240.
92. Sorokin I.D., Zadorina E.V., Kravchenko I.K., Boulygina E.S., Tourova T.P., Sorokin D.Y. Natronobacillus azotifigens gen. nov., sp. nov., an anaerobic diazotrophic haloalkaliphile from soda-rich habitats. Extremophiles. 2008.12, 6, 819−827.
93. Т. П. Турова. Филогения прокариот на основании анализа аминокислотных и нуклеотидных последовательностей. Успехи микробиологии. 1983, 18, 92−112.
94. Tourova Т.Р., Antonov A.S. Identification of microorganisms by rapid DNADNA hybrisization. Methods in Microbiology. 1987,19, 333−355.
95. Турова Т. П. Использование гибридизационного анализа нуклеиновых кислот для идентификации бактерий. Успехи микробиологии. 1992, 27, 185−209.
96. Турова Т. П. Изучение происхождения двух типов строения клеточной стенки эубактерий и способности к спорообразованию с помощью молекулярно-биологических методов. Микробиология. 1995,.64, 3, 301 309.
97. Турова Т. П. Применение данных ДНК-ДНК гибридизации и анализа генов 16S рРНК для решения таксономических проблем на примере порядка Haloanaerobiales. Микробиология. 2000, 69, 6. 741−752.
98. Турова Т. П. Мультикопийность рибосомных оперонов прокариот и ее влияние на проведение филогенетического анализа. Микробиология. 2003, 72, 4, 437−452.
99. Турова Т. П. Молекулярная экология микроорганизмов. Глава 6. В: Экология микроорганизмов. Учебник для вузов (под ред. Нетрусова А.И.), М: Академия, 2004, 246−256.1. Научно-популярная статья:
100. Турова Т. П. Геносистематика прокариот: развитие, проблемы, перспективы. Биология в школе, 1999, 6, 3−11.1. Авторское свидетельство:
101. Антонов A.C., Белоусова A.A., Лысенко A.M., Турова Т. П. Способидентификации микроорганизмов. № 649 751, 1979.