ΠŸΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒ Π² написании студСнчСских Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚
АнтистрСссовый сСрвис

ВыявлСниС ΠΈ филогСнСтичСский Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΡƒΡŽ ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ†Ρƒ Ρ€ΠΈΠ±ΡƒΠ»ΠΎΠ·ΠΎ-1, 5-бисфосфаткарбоксилазы/оксигСназы Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I, Ρƒ Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… таксономичСских Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏ

Π”ΠΈΡΡΠ΅Ρ€Ρ‚Π°Ρ†ΠΈΡΠŸΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒ Π² Π½Π°ΠΏΠΈΡΠ°Π½ΠΈΠΈΠ£Π·Π½Π°Ρ‚ΡŒ ΡΡ‚ΠΎΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒΠΌΠΎΠ΅ΠΉ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹

Nanba et al., 2004). Однако ΡΡ‚Π΅ΠΏΠ΅Π½ΡŒ ΡƒΠ½ΠΈΠ²Π΅Ρ€ΡΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ этих ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π½Ρ‹Ρ… систСм ΠΎΠ³Ρ€Π°Π½ΠΈΡ‡ΠΈΠ²Π°Π»Π°ΡΡŒ Ρ‚Π΅ΠΌ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΎΠ½ΠΈ Π±Ρ‹Π»ΠΈ сконструированы Π½Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° нСбольшого числа ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ, ΠΈΠΌΠ΅Π²ΡˆΠΈΡ…ΡΡ ΠΊ Ρ‚ΠΎΠΌΡƒ ΠΌΠΎΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρƒ Π² ΠΌΠ΅ΠΆΠ΄ΡƒΠ½Π°Ρ€ΠΎΠ΄Π½Ρ‹Ρ… Π±Π°Π·Π°Ρ… Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ…. На Π½Π°Ρ‡Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… этапах Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠΈ ΡƒΠ½ΠΈΠ²Π΅Ρ€ΡΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π½Ρ‹Ρ… систСм для выявлСния Π³ΠΎΠΌΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ ΡƒΡ€ΠΎΠ²Π΅Π½ΡŒ… Π§ΠΈΡ‚Π°Ρ‚ΡŒ Π΅Ρ‰Ρ‘ >

ВыявлСниС ΠΈ филогСнСтичСский Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΡƒΡŽ ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ†Ρƒ Ρ€ΠΈΠ±ΡƒΠ»ΠΎΠ·ΠΎ-1, 5-бисфосфаткарбоксилазы/оксигСназы Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I, Ρƒ Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… таксономичСских Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏ (Ρ€Π΅Ρ„Π΅Ρ€Π°Ρ‚, курсовая, Π΄ΠΈΠΏΠ»ΠΎΠΌ, ΠΊΠΎΠ½Ρ‚Ρ€ΠΎΠ»ΡŒΠ½Π°Ρ)

Π‘ΠΎΠ΄Π΅Ρ€ΠΆΠ°Π½ΠΈΠ΅

  • ΠžΠ±Π·ΠΎΡ€ Π»ΠΈΡ‚Π΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Ρ‹
  • Π“Π»Π°Π²Π° 1. ΠŸΡƒΡ‚ΠΈ Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½ΠΎΠΉ ассимиляции БОг
    • 1. 1. Π’ΠΎΡΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ рибулозобисфосфатный Ρ†ΠΈΠΊΠ»
    • 1. 2. Π’ΠΎΡΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ Ρ†ΠΈΠΊΠ» Ρ‚Ρ€ΠΈΠΊΠ°Ρ€Π±ΠΎΠ½ΠΎΠ²Ρ‹Ρ… кислот
    • 1. 3. 3-гидроксипропионатный Ρ†ΠΈΠΊΠ» ΠΈ Π²ΠΎΡΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ Ρ†ΠΈΠΊΠ» Π΄ΠΈΠΊΠ°Ρ€Π±ΠΎΠ½ΠΎΠ²Ρ‹Ρ… кислот
    • 1. 4. НСцикличСскиС систСмы Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½ΠΎΠΉ ассимиляции БО
  • Π“Π»Π°Π²Π° 2. Π€ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ Π Π‘Π€Πš
    • 2. 1. Π€ΠΎΡ€ΠΌΠ°
    • 2. 2. Π€ΠΎΡ€ΠΌΠ° II
    • 2. 3. Π Π‘Π€Πš Π°Ρ€Ρ…Π΅ΠΉ (Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠ° III)
    • 2. 4. Π Π‘Π€Πš-ΠΏΠΎΠ΄ΠΎΠ±Π½Ρ‹Π΅ Π±Π΅Π»ΠΊΠΈ (Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠ° IV)
    • 2. 5. Локализация ΠΈ ΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΡ Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš
  • Π“Π»Π°Π²Π° 3. ЀилогСния ΠΈ ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΡ Π Π‘Π€Πš
    • 3. 1. БопоставлСниС Ρ„ΠΈΠ»ΠΎΠ³Π΅Π½ΠΈΠΈ Π Π‘Π€Πš с ΠΏΠ»Π°ΡΡ‚ΠΈΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚Π΅ΠΎΠ±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ Ρ„ΠΈΠ»ΠΎΠ³Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΉ
    • 3. 2. Π“ΠΎΡ€ΠΈΠ·ΠΎΠ½Ρ‚Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ пСрСнос Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš
    • 3. 3. Дупликация ΠΈ Π΄ΠΈΡ„Ρ„Π΅Ρ€Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ потСря Π³Π΅Π½Π°
  • Π“Π»Π°Π²Π° 4. Π˜Π·ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ биоразнообразия ΠΏΡ€ΠΈΡ€ΠΎΠ΄Π½Ρ‹Ρ… сообщСств
    • 4. 1. ΠœΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ»ΡΡ€Π½ΠΎ-биологичСскиС ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹ изучСния ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½Ρ‹Ρ… сообщСств
    • 4. 2. ИспользованиС Π³Π΅Π½ΠΎΠ², Π΄Π΅Ρ‚Π΅Ρ€ΠΌΠΈΠ½ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„ΠΈΡŽ, для Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° ΠΏΡ€ΠΈΡ€ΠΎΠ΄Π½Ρ‹Ρ… экосистСм
  • Π­ΠΊΡΠΏΠ΅Ρ€ΠΈΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ Ρ‡Π°ΡΡ‚ΡŒ
  • Π“Π»Π°Π²Π° 5. ΠœΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»Ρ‹ ΠΈ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹
    • 5. 1. ΠžΠ±ΡŠΠ΅ΠΊΡ‚Ρ‹ исслСдования
    • 5. 2. Π’Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π”ΠΠš
    • 5. 3. Π’Ρ‹Π±ΠΎΡ€ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ²
    • 5. 4. Амплификация Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² исслСдуСмых Π³Π΅Π½ΠΎΠ²
      • 5. 4. 1. Амплификация Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹
      • 5. 4. 2. Амплификация Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… 16S Ρ€Π ΠΠš
      • 5. 4. 3. Амплификация Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… мСтанмонооксигСназу
    • 5. 5. Π”Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚ΠΎΠ² ПЦР
    • 5. 6. ΠžΡ‡ΠΈΡΡ‚ΠΊΠ° ПЦР-Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ²
    • 5. 7. ΠšΠ»ΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ПЦР-Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ²
      • 5. 7. 1. ΠŸΡ€ΠΈΠ³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ΅Ρ‚Π΅Π½Ρ‚Π½Ρ‹Ρ… ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΠΊ
      • 5. 7. 2. Π›ΠΈΠ³ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅
      • 5. 7. 3. Врансформация ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΠΊ ΠΏΠ»Π°Π·ΠΌΠΈΠ΄Π½ΠΎΠΉ Π”ΠΠš
      • 5. 7. 4. Π’Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠ»Π°Π·ΠΌΠΈΠ΄Π½ΠΎΠΉ Π”ΠΠš
    • 5. 8. Π‘Π΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Π”ΠΠš
    • 5. 9. ЀилогСнСтичСский Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· исслСдуСмых ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ
    • 5. 10. Π”Π΅ΠΏΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ
  • Π Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ ΠΈ ΠΎΠ±ΡΡƒΠΆΠ΄Π΅Π½ΠΈΠ΅
  • Π“Π»Π°Π²Π° 6. Π Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ° ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΠ²Π΅Ρ€ΠΊΠ° систСмы ΠΎΠ»ΠΈΠ³ΠΎΠ½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² для Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Ρ„Ρ€Π°ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I, Ρƒ Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… таксономичСских Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏ
    • 6. 1. Π Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ° систСмы ΠΎΠ»ΠΈΠ³ΠΎΠ½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² для Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I, Ρƒ Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… таксономичСских Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏ
    • 6. 2. ΠŸΡ€ΠΎΠ²Π΅Ρ€ΠΊΠ° Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½Π½ΠΎΠΉ систСмы ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² Π½Π° Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½Ρ‹Ρ… бактСриях с ΠΈΠ·Π²Π΅ΡΡ‚Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΈΡ‡Π½ΠΎΠΉ структурой Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹
    • 6. 3. ΠžΠΏΡ‚ΠΈΠΌΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΡ условий ПЦР для Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹
  • Π“Π»Π°Π²Π° 7. ЀилогСнСтичСский Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Π³Π΅Π½ΠΎΠ² cbbL Ρƒ ΠΏΡ€Π΅Π΄ΡΡ‚Π°Π²ΠΈΡ‚Π΅Π»Π΅ΠΉ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… таксонов ΠΏΡ€ΠΎΠΊΠ°Ρ€ΠΈΠΎΡ‚
    • 7. 1. ВыявлСниС, сСквСнированиС ΠΈ Ρ„илогСнСтичСский Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Π³Π΅Π½ΠΎΠ² cbbL Ρƒ Ρ„ΠΎΡ‚ΠΎΠ»ΠΈΡ‚ΠΎΠ°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½Ρ‹Ρ… Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ сСмСйства Oscillochloridaceae
    • 7. 2. ВыявлСниС, сСквСнированиС ΠΈ Ρ„илогСнСтичСский Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Π³Π΅Π½ΠΎΠ² cbbL Ρƒ Ρ…Π΅ΠΌΠΎΠ»ΠΈΡ‚ΠΎΠ°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½Ρ‹Ρ… Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ
      • 7. 2. 1. p. Thiobacillus
      • 7. 2. 2. p. Thioalkalivibrio ΠΈ Thioalkalispira
      • 7. 2. 3. p. Thioalkalimicrobium ΠΈ Thiomicrospira
      • 7. 2. 4. p. Thioclava
  • Π“Π»Π°Π²Π° 8. ΠžΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ разнообразия эндосимбиотичСского сообщСства моллюска Bathymodiolus azoricus
  • Π’Ρ‹Π²ΠΎΠ΄Ρ‹

ΠŸΠ΅Ρ€Π²ΠΈΡ‡Π½Π°Ρ продукция органичСского ΡƒΠ³Π»Π΅Ρ€ΠΎΠ΄Π° Π² Π±ΠΈΠΎΡΡ„Π΅Ρ€Π΅ основана Π½Π° Π°ΡΡΠΈΠΌΠΈΠ»ΡΡ†ΠΈΠΈ БОг Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½Ρ‹ΠΌΠΈ ΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠ°ΠΌΠΈ. Π’ ΠΏΡ€ΠΎΡ†Π΅ΡΡΠ΅ ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΈ Ρƒ Ρ€Π°Π·Π½Ρ‹Ρ… Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏ Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„ΠΎΠ² Π²Ρ‹Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π»ΠΈΡΡŒ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Π΅ ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΡ‹ фиксации БО2: Π²ΠΎΡΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ рибулозобисфосфатный Ρ†ΠΈΠΊΠ» (Ρ†ΠΈΠΊΠ» Кальвина), Π²ΠΎΡΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ Ρ†ΠΈΠΊΠ» Ρ‚Ρ€ΠΈΠΊΠ°Ρ€Π±ΠΎΠ½ΠΎΠ²Ρ‹Ρ… кислот, 3-гидроксипропионатный Ρ†ΠΈΠΊΠ», Π²ΠΎΡΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ Ρ†ΠΈΠΊΠ» Π΄ΠΈΠΊΠ°Ρ€Π±ΠΎΠ½ΠΎΠ²Ρ‹Ρ… кислот, Π²ΠΎΡΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ Π°Ρ†Π΅Ρ‚ΠΈΠ»-КоА ΠΏΡƒΡ‚ΡŒ (Ρ†ΠΈΡ‚. ΠΏΠΎ ΠšΠΎΠ½Π΄Ρ€Π°Ρ‚ΡŒΠ΅Π²Π°, 1996).

ΠšΠ»ΡŽΡ‡Π΅Π²Ρ‹ΠΌ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠΌ Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½ΠΎΠΉ фиксации БО2 Π² Ρ†ΠΈΠΊΠ»Π΅ Кальвина являСтся Ρ€ΠΈΠ±ΡƒΠ»ΠΎΠ·ΠΎ-1,5-бисфосфаткарбоксилаза/оксигСназа (Π Π‘Π€Πš, КЀ 4.1.1.39). Π’ Ρ‚ΠΎ Π²Ρ€Π΅ΠΌΡ, ΠΊΠ°ΠΊ структурныС ΠΈ Π±ΠΈΠΎΡ…имичСскиС свойства этого Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π° ΠΎΠ±ΡΡ‚ΠΎΡΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎ исслСдованы классичСскими биохимичСскими ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π°ΠΌΠΈ, Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ ΠΎ Π΅Π³ΠΎ происхоТдСнии ΠΈ ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΈ Ρ‡Ρ€Π΅Π·Π²Ρ‹Ρ‡Π°ΠΉΠ½ΠΎ ΠΎΠ³Ρ€Π°Π½ΠΈΡ‡Π΅Π½Ρ‹. Π˜Π·Π²Π΅ΡΡ‚Π½ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½Ρ‹Π΅ ΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΡ‹, Π°ΡΡΠΈΠΌΠΈΠ»ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ БОг с ΠΏΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒΡŽ Ρ†ΠΈΠΊΠ»Π° Кальвина, ΠΏΡ€ΠΈΠ½Π°Π΄Π»Π΅ΠΆΠ°Ρ‚ ΠΊ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹ΠΌ ΠΈ Π΄ΠΎΡΡ‚Π°Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎ ΡƒΠ΄Π°Π»Π΅Π½Π½Ρ‹ΠΌ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ ΠΎΡ‚ Π΄Ρ€ΡƒΠ³Π° ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½Ρ‹ΠΌ вСтвям. Достаточно ΡˆΠΈΡ€ΠΎΠΊΠΎ Ρ€Π°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΠ΅ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ Π Π‘Π€Πš, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ Π² Π½Π°ΡΡ‚оящСС врСмя Ρ€Π°Π·Π΄Π΅Π»Π΅Π½Ρ‹ Π½Π° Ρ‡Π΅Ρ‚Ρ‹Ρ€Π΅ Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹, поэтому вопрос ΠΎ ΠΌΠΎΠ½ΠΎΠΈΠ»ΠΈ полифилСтичСском происхоТдСнии Π Π‘Π€Πš Π΄ΠΎ ΡΠΈΡ… ΠΏΠΎΡ€ остаСтся ΠΎΡ‚ΠΊΡ€Ρ‹Ρ‚Ρ‹ΠΌ.

Для исслСдования происхоТдСния ΠΈ ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΈ Π Π‘Π€Πš Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ молСкулярно-биологичСскиС ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹, ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ ΠΏΡ€ΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ΡŒ ΡΡ€Π°Π²Π½ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ структурных Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… этот Π±Π΅Π»ΠΎΠΊ, Ρƒ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏ ΠΏΡ€ΠΎΠΊΠ°Ρ€ΠΈΠΎΡ‚. ЀилогСнСтичСский Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·, основанный Π½Π° ΡΡ€Π°Π²Π½Π΅Π½ΠΈΠΈ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš, ΡˆΠΈΡ€ΠΎΠΊΠΎ примСняСтся Π² Ρ‚аксономии растСний ΠΈ Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡ€ΠΎΡΠ»Π΅ΠΉ ΠΈ Π½Π° Π½ΠΈΠ·ΡˆΠΈΡ… таксономичСских уровнях соотвСтствуСт Π΄Π°Π½Π½Ρ‹ΠΌ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΡ… ΠΌΠ°Ρ€ΠΊΠ΅Ρ€ΠΎΠ² (Clegg, 1993; Freshwater et al., 1994). Π‘Ρ€Π°Π²Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ филогСнСтичСских схСм (Π΄Π΅Ρ€Π΅Π²ΡŒΠ΅Π²), построСнных Π½Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš, Ρ‚Ρ€Π°Π΄ΠΈΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… 16S Ρ€Π ΠΠš, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅, Π² Π½Π΅ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… случаях, Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΡ… структурных Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΠΈΡ‚ΡŒ Π²Ρ‹ΡΠ²ΠΈΡ‚ΡŒ особСнности ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΈ ΠΈ Ρ„ункционирования Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš, Ρƒ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€ΠΎΠΊΠ°Ρ€ΠΈΠΎΡ‚Π½Ρ‹Ρ… ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ².

НСсмотря Π½Π° Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΡƒΡŽ ΡΠΊΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ‡Π΅ΡΠΊΡƒΡŽ ΠΈ ΠΏΡ€Π°ΠΊΡ‚ΠΈΡ‡Π΅ΡΠΊΡƒΡŽ Π·Π½Π°Ρ‡ΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒ процСсса фиксации БОг, Π΄ΠΎ Π½Π°ΡΡ‚оящСго Π²Ρ€Π΅ΠΌΠ΅Π½ΠΈ ΠΎΡΡ‚Π°ΡŽΡ‚ΡΡ ΠΌΠ°Π»ΠΎΠΈΠ·ΡƒΡ‡Π΅Π½Π½Ρ‹ΠΌΠΈ вопросы, связанныС с ΠΎΡ†Π΅Π½ΠΊΠΎΠΉ биоразнообразия Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½Ρ‹Ρ… Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ Π² ΠΏΡ€ΠΈΡ€ΠΎΠ΄Π½Ρ‹Ρ… сообщСствах, Π²ΠΊΠ»Π°Π΄Π° ΠΊΠΎΠ½ΠΊΡ€Π΅Ρ‚Π½ΠΎΠΉ экосистСмы Π² ΠΎΠ±Ρ‰ΡƒΡŽ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ†ΠΈΡŽ органичСского ΡƒΠ³Π»Π΅Ρ€ΠΎΠ΄Π°, влияния Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Ρ„Π°ΠΊΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠ² Π½Π° Π±ΠΈΠΎΡ€Π°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΠ΅ сообщСств.

ΠœΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ»ΡΡ€Π½ΠΎ-биологичСскиС ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡŽΡ‚ ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡ΠΈΡ‚ΡŒ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅, ΠΎΡ‚Ρ€Π°ΠΆΠ°ΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ вСсь спСктр ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½Ρ‹Ρ… Π²Π·Π°ΠΈΠΌΠΎΠΎΡ‚Π½ΠΎΡˆΠ΅Π½ΠΈΠΉ Π² ΠΌΠΈΡ€Π΅ ΠΏΡ€ΠΎΠΊΠ°Ρ€ΠΈΠΎΡ‚ ΠΈ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ ΠΏΡ€ΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΈΡ… Π²Ρ‹ΡΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ ΠΈΠ΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΡŽ. ΠšΡ€ΠΎΠΌΠ΅ Ρ‚ΠΎΠ³ΠΎ, ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ этих ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄ΠΎΠ² Π² ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½ΠΎΠΉ экологии позволяСт ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΎΠ±ΡˆΠΈΡ€Π½ΡƒΡŽ ΠΈΠ½Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠ°Ρ†ΠΈΡŽ ΠΎ ΡΠΎΡΡ‚Π°Π²Π΅ ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½ΠΎΠ³ΠΎ сообщСства ΡΡ€Π°Π²Π½ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎ быстро ΠΈ Ρ Π²Ρ‹ΡΠΎΠΊΠΎΠΉ ΡΡ‚Π΅ΠΏΠ΅Π½ΡŒΡŽ точности.

НаиболСС ΠΏΠΎΠ»Π½ΡƒΡŽ ΠΈΠ½Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠ°Ρ†ΠΈΡŽ ΠΎ Π±ΠΈΠΎΡ€Π°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΠΈ ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½Ρ‹Ρ… популяций, влиянии Π½Π° Π½Π΅Π³ΠΎ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… воздСйствий, Π΄ΠΈΠ½Π°ΠΌΠΈΠΊΠ΅ популяционных ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠΉ Π² Π½Π°ΡΡ‚оящСС врСмя ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π°ΡŽΡ‚ с ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ΠΏΠΎΠ΄Ρ…ΠΎΠ΄ΠΎΠ², основанных Π½Π° ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π° ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π°Π·Π½ΠΎΠΉ Ρ†Π΅ΠΏΠ½ΠΎΠΉ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ (ПЦР). ИспользованиС Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ 16S Ρ€Π ΠΠš Π² ΡΠΎΡ‡Π΅Ρ‚Π°Π½ΠΈΠΈ с ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π°ΠΌΠΈ клонирования ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΠΈΠ»ΠΎ ΠΈΠ·ΡƒΡ‡Π°Ρ‚ΡŒ состав ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½Ρ‹Ρ… популяций (Giovannoni et al., 1990; Ward et al., 1990). Π’Π°ΠΊΠΎΠΉ ΠΏΠΎΠ΄Ρ…ΠΎΠ΄ явился большим достиТСниСм Π² ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½ΠΎΠΉ экологии, ΠΏΠΎΡΠΊΠΎΠ»ΡŒΠΊΡƒ сущСствСнно Ρ€Π°ΡΡˆΠΈΡ€ΠΈΠ» прСдставлСниС ΠΎ ΡΠΎΡΡ‚Π°Π²Π΅ ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½Ρ‹Ρ… сообщСств, ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΠΈΠ² ΠΈΠ΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΡ†ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΡ‹ Π±Π΅Π· ΠΏΡ€Π΅Π΄Π²Π°Ρ€ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΊΡƒΠ»ΡŒΡ‚ΠΈΠ²ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π² Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ориях ΠΈ Π²Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΡ чистых ΠΊΡƒΠ»ΡŒΡ‚ΡƒΡ€.

Π’ Π½Π°ΡΡ‚оящСС врСмя всС Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ пСрспСктивными ΠΎΠ±ΡŠΠ΅ΠΊΡ‚Π°ΠΌΠΈ для исслСдований Π² ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚ΠΈ молСкулярной экологии становятся Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ Π³Π΅Π½Ρ‹, ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΈ ΠΈΠ΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΡ†ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΡ‹, Π²Ρ‹ΠΏΠΎΠ»Π½ΡΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½ΡƒΡŽ Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΡŽ Π² Π΄Π°Π½Π½ΠΎΠΉ экосистСмС. Π Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ° ΠΈ ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π½Π° ΠΏΡ€Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠΊΠ΅ ΡƒΠ½ΠΈΠ²Π΅Ρ€ΡΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π½Ρ‹Ρ… систСм, спСцифичных ΠΊ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΈΡ‡Π½Ρ‹ΠΌ Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹ΠΌ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡΠΌ Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π΅Π²Ρ‹Π΅ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρ‹ Ρ‚Π΅Ρ… ΠΈΠ»ΠΈ ΠΈΠ½Ρ‹Ρ… биохимичСских процСссов, позволяСт ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π²Π°Ρ‚ΡŒ своСобразныС Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ срСзы ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½Ρ‹Ρ… популяций, Π² ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… ΠΈΠ΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΡ†ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‚ΡΡ, срСди всСх ΠΏΡ€ΠΎΡ‡ΠΈΡ…, ΠΈ ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΡ‹, Π½Π΅ Π²Ρ‹ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΠΌΡ‹Π΅ ΠΊΠ°ΠΊ классичСскими микробиологичСскими ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π°ΠΌΠΈ, Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒΡŽ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° ΠΊΠ»ΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² суммарного Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ‚Π° 16S Ρ€Π”ΠΠš сообщСства.

Π’ Π½Π°ΡΡ‚оящСС врСмя спСцифичныС систСмы ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½Ρ‹ для Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ…: мСтанмонооксигСназу (Holmes et al., 1995; McDonald et al., 1995) — ΠΌΠ΅Ρ‚Π°Π½ΠΎΠ»Π΄Π΅Π³ΠΈΠ΄Ρ€ΠΎΠ³Π΅Π½Π°Π·Ρƒ (McDonald et al., 1995; McDonald a. Murrell, 1997) — монооксигСназу Π°ΠΌΠΌΠΈΠ°ΠΊΠ° (Rotthauwe et al., 1997) — Π½ΠΈΡ‚Ρ€ΠΎΠ³Π΅Π½Π°Π·Ρƒ (ΠœΠ°Ρ€ΡƒΡΠΈΠ½Π° ΠΈ Π΄Ρ€., 2001) — Π½ΠΈΡ‚Ρ€Π°Ρ‚Ρ€Π΅Π΄ΡƒΠΊΡ‚Π°Π·Ρƒ (Gregory et al., 2000) — Π½ΠΈΡ‚Ρ€ΠΈΡ‚Ρ€Π΅Π΄ΡƒΠΊΡ‚Π°Π·Ρƒ (Braker et al., 1998) — хлоритдисмутазу (Bender et al., 2004) — Π±ΠΈΡΡƒΠ»ΡŒΡ„ΠΈΡ‚Ρ€Π΅Π΄ΡƒΠΊΡ‚Π°Π·Ρƒ (Wagner et al., 1998) — арсСнатрСдуктазу (Malasarn et al., 2004), М-ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ†Ρƒ фотосинтСтичСского Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎΠ³ΠΎ Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ€Π° ΠΏΡƒΡ€ΠΏΡƒΡ€Π½Ρ‹Ρ… Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ (Achenbach et al., 2001) ΠΈ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΠ΅ Π±Π΅Π»ΠΊΠΈ.

Для обнаруТСния ΠΈ ΠΈΠ΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš, Ρ€Π°Π½Π΅Π΅ ΠΏΡ€Π΅Π΄Π»Π°Π³Π°Π»ΠΈΡΡŒ ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π½Ρ‹Π΅ систСмы, ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΡ†ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ участки этих Π³Π΅Π½ΠΎΠ² (Paul et al, 1990; Π§Π΅Ρ€Π½Ρ‹Ρ…, 1995; Pichard et al., 1997; Elsaied a. Naganuma, 2001; Alfreider et al., 2003;

Nanba et al., 2004). Однако ΡΡ‚Π΅ΠΏΠ΅Π½ΡŒ ΡƒΠ½ΠΈΠ²Π΅Ρ€ΡΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ этих ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π½Ρ‹Ρ… систСм ΠΎΠ³Ρ€Π°Π½ΠΈΡ‡ΠΈΠ²Π°Π»Π°ΡΡŒ Ρ‚Π΅ΠΌ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΎΠ½ΠΈ Π±Ρ‹Π»ΠΈ сконструированы Π½Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° нСбольшого числа ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ, ΠΈΠΌΠ΅Π²ΡˆΠΈΡ…ΡΡ ΠΊ Ρ‚ΠΎΠΌΡƒ ΠΌΠΎΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρƒ Π² ΠΌΠ΅ΠΆΠ΄ΡƒΠ½Π°Ρ€ΠΎΠ΄Π½Ρ‹Ρ… Π±Π°Π·Π°Ρ… Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ…. На Π½Π°Ρ‡Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… этапах Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠΈ ΡƒΠ½ΠΈΠ²Π΅Ρ€ΡΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€Π½Ρ‹Ρ… систСм для выявлСния Π³ΠΎΠΌΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ ΡƒΡ€ΠΎΠ²Π΅Π½ΡŒ ΡƒΠ½ΠΈΠ²Π΅Ρ€ΡΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ ΠΊΡ€ΠΈΡ‚ΠΈΡ‡Π½Ρ‹ΠΌ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠΌ зависит ΠΎΡ‚ ΠΎΠ±ΡŠΠ΅ΠΌΠ° Π²Ρ‹Π±ΠΎΡ€ΠΊΠΈ, Π½Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠΉ создаСтся систСма. Π’ Ρ€ΡΠ΄Π΅ случаСв появлСниС Π΄Π°ΠΆΠ΅ ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ Π½ΠΎΠ²ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ способно сущСствСнным ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠΌ ΠΏΠΎΠ²Π»ΠΈΡΡ‚ΡŒ Π½Π° ΠΊΠΎΠ½Π΅Ρ‡Π½Ρ‹ΠΉ Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚.

ЦСль настоящСй Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ Π·Π°ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°Π»Π°ΡΡŒ Π² Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ΅ ΡƒΠ½ΠΈΠ²Π΅Ρ€ΡΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ систСмы ΠΎΠ»ΠΈΠ³ΠΎΠ½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ², ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡŽΡ‰Π΅ΠΉ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΡ†ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρ‹ Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΡƒΡŽ ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ†Ρƒ Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ, ΠΈ Π΅Π΅ ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠΈ для Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° разнообразия исслСдуСмых Π³Π΅Π½ΠΎΠ² Ρƒ Ρ„ΠΎΡ‚ΠΎΠΈ Ρ…Π΅ΠΌΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½Ρ‹Ρ… Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ, Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π°ΡŽΡ‰ΠΈΡ…ΡΡ ΠΏΠΎ ΡΠΊΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ‡Π΅ΡΠΊΠΈΠΌ, физиологичСским особСнностям ΠΈ Ρ‚аксономичСскому полоТСнию.

Для достиТСния поставлСнной Ρ†Π΅Π»ΠΈ Ρ€Π΅ΡˆΠ°Π»ΠΈ ΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Π·Π°Π΄Π°Ρ‡ΠΈ:

1. ΠšΠΎΠ½ΡΡ‚Ρ€ΡƒΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΡƒΠ½ΠΈΠ²Π΅Ρ€ΡΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ систСмы ΠΎΠ»ΠΈΠ³ΠΎΠ½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ², ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡŽΡ‰Π΅ΠΉ Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΡ†ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρ‹ Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΡƒΡŽ ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ†Ρƒ Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I, Ρƒ ΠΌΠ°ΠΊΡΠΈΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎ ΡˆΠΈΡ€ΠΎΠΊΠΎΠ³ΠΎ спСктра Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ.

2. ΠŸΡ€ΠΎΠ²Π΅Ρ€ΠΊΠ° Π²Ρ‹Π±Ρ€Π°Π½Π½ΠΎΠΉ систСмы ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² Π½Π° ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚Π°Ρ… Π”ΠΠš, Π²Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… ΠΈΠ· Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ, для ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… Ρ€Π°Π½Π΅Π΅ Π±Ρ‹Π»Π° продСмонстрирована ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΊ Ρ„иксации БОг Ρ‡Π΅Ρ€Π΅Π· Ρ†ΠΈΠΊΠ» Кальвина ΠΈ ΠΈΠ·Π²Π΅ΡΡ‚Π½Π° пСрвичная структура Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš.

3. ΠŸΠΎΠ΄Π±ΠΎΡ€ ΠΈ ΠΎΠΏΡ‚имизация условий ПЦР для Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Π²Ρ‹Π±Ρ€Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš, ΠΈ ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… систСмы ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΠΊΠΎΠ»Π° провСдСния Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ для исслСдования модСльной Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏΡ‹ Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ, ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… восстановлСнныС соСдинСния сСры Π² ΠΊΠ°Ρ‡Π΅ΡΡ‚Π²Π΅ Π΄ΠΎΠ½ΠΎΡ€ΠΎΠ² элСктронов. ΠŸΡ€ΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΠ΅ филогСнСтичСского Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ.

4. БопоставлСниС филогСнСтичСских Π΄Π΅Ρ€Π΅Π²ΡŒΠ΅Π², построСнных Π½Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš ΠΈ 16S Ρ€Π ΠΠš.

5. ΠŸΡ€ΠΎΠ²Π΅Ρ€ΠΊΠ° примСнимости Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½Π½ΠΎΠΉ систСмы ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² для исслСдования ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½Ρ‹Ρ… сообщСств.

ΠžΠ‘Π—ΠžΠ  Π›Π˜Π’Π•Π ΠΠ’Π£Π Π«.

Π²Ρ‹Π²ΠΎΠ΄Ρ‹.

1. Π Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½Π° ΡƒΠ½ΠΈΠ²Π΅Ρ€ΡΠ°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ систСма ΠΎΠ»ΠΈΠ³ΠΎΠ½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² для Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΡƒΡŽ ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ†Ρƒ Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I, Ρƒ Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… таксономичСских Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏΠΏΠΎΠ΄ΠΎΠ±Ρ€Π°Π½Ρ‹ ΠΈ ΠΎΠΏΡ‚ΠΈΠΌΠΈΠ·ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Ρ‹ условия ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π°Π·Π½ΠΎΠΉ Ρ†Π΅ΠΏΠ½ΠΎΠΉ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ.

2. Π‘ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒΡŽ ΠΏΡ€Π΅Π΄Π»ΠΎΠΆΠ΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄ΠΈΠΊΠΈ ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π° пСрвичная структура ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ филогСнСтичСский Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² 32 Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I, Ρƒ ΡˆΠΈΡ€ΠΎΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΠΊΡ€ΡƒΠ³Π° сСрозависимых Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½Ρ‹Ρ… Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ.

3. ИспользованиС Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I, Π² ΠΊΠ°Ρ‡Π΅ΡΡ‚Π²Π΅ молСкулярных ΠΌΠ°Ρ€ΠΊΠ΅Ρ€ΠΎΠ² ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΠΈΠ»ΠΎ: Π°) Π²Ρ‹ΡΠ²ΠΈΡ‚ΡŒ особСнности ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΈ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏ Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„ΠΎΠ², ΠΊΠ°ΠΊ это Π±Ρ‹Π»ΠΎ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ Π½Π° ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π΅ pp. Oscillochloris, Thiobacillus, Thioalkalivibrio', Π±) ΠΏΡ€Π΅Π΄Π»ΠΎΠΆΠΈΡ‚ΡŒ схСму ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΈ Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš, ΠΈ ΠΏΠΎΠ΄Ρ‚Π²Π΅Ρ€Π΄ΠΈΡ‚ΡŒ Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒ таксономичСской Ρ€Π΅ΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΠΈ Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏΡ‹ «Thiomicrospira" — Π²) ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±ΡΡ‚Π²ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ описанию Π½ΠΎΠ²Ρ‹Ρ… таксонов Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„ΠΎΠ² (pp. Thiobacillus, Thioclava, Thioalkalispira) — Π³) ΠΏΡ€Π΅Π΄ΠΏΠΎΠ»ΠΎΠΆΠΈΡ‚ΡŒ сущСствованиС Π½ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ Π²Π°Ρ€ΠΈΠ°Π½Ρ‚Π° «ΠΊΡ€Π°ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ» Ρ‚ΠΈΠΏΠ° Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I Ρƒ Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ Oscillochloris trichoides ΠΈ Sulfobacillus acidophilus.

4. На ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π΅ симбиотичСского Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ сообщСства, ΠΎΠ±ΠΈΡ‚Π°ΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ Π² ΠΆΠ°Π±Ρ€Π°Ρ… Π³Π»ΡƒΠ±ΠΎΠΊΠΎΠ²ΠΎΠ΄Π½Ρ‹Ρ… двустворчатых моллюсков Ρ€ΠΎΠ΄Π° Bathymodiolus: Π°) ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½Π° ΡΡ„Ρ„Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½Π½ΠΎΠΉ систСмы ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² ΠΏΡ€ΠΈ выявлСнии Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π Π‘Π€Πš Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ I, Π² ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ»ΡΡ€Π½ΠΎ-экологичСских исслСдованияхб) ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… Π³Π΅Π½ΠΎΠ² ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ сущСствСнно Π΄ΠΎΠΏΠΎΠ»Π½ΠΈΡ‚ΡŒ Π²Ρ‹Π²ΠΎΠ΄Ρ‹, ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π°Π΅ΠΌΡ‹Π΅ ΠΏΡ€ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΠΈ стандартного Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… 16S Ρ€Π ΠΠš, ΠΈ Π΄Π°Ρ‚ΡŒ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΎΠ΅ прСдставлСниС ΠΎ ΡΠΎΡΡ‚Π°Π²Π΅ ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½Ρ‹Ρ… сообщСств.

ΠŸΠΎΠΊΠ°Π·Π°Ρ‚ΡŒ вСсь тСкст

Бписок Π»ΠΈΡ‚Π΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Ρ‹

  1. И. А., КСппСн О. И., ΠšΡ€Π°ΡΠΈΠ»ΡŒΠ½ΠΈΠΊΠΎΠ²Π° Π•. Н., Уголькова Н. Π’., Ивановский Π . Н. Π£Π³Π»Π΅Ρ€ΠΎΠ΄Π½Ρ‹ΠΉ ΠΌΠ΅Ρ‚Π°Π±ΠΎΠ»ΠΈΠ·ΠΌ аноксигСнных Π½ΠΈΡ‚Ρ‡Π°Ρ‚Ρ‹Ρ… Ρ„ΠΎΡ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½Ρ‹Ρ… Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ сСмСйства Oscillochloridaceae // ΠœΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ. 2005. — Π’. 74. — № 3. — Π‘. 305−312.
  2. Π›. М., Π¦Π°ΠΏΠ»ΠΈΠ½Π° И. А., ΠšΡ€Π°ΡΠΈΠ»ΡŒΠ½ΠΈΠΊΠΎΠ²Π° Π•. Н., Π‘ΠΎΠ³Π΄Π°Π½ΠΎΠ²Π° Π’. И., ΠšΠ°Ρ€Π°Π²Π°ΠΉΠΊΠΎ Π“. И. ΠœΠ΅Ρ‚Π°Π±ΠΎΠ»ΠΈΠ·ΠΌ ΡƒΠ³Π»Π΅Ρ€ΠΎΠ΄Π° Ρƒ Sulfobacillus thermosulfidooxidans ΡˆΡ‚Π°ΠΌΠΌ 1269 // ΠœΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ. 1994. — Π’. 63. — Π‘. 573−580.
  3. Π•. Н. АвтотрофныС ΠΏΡ€ΠΎΠΊΠ°Ρ€ΠΈΠΎΡ‚Ρ‹. М.: Изд-Π²ΠΎ ΠœΠ“Π£, 1996. -312 с.
  4. А. И., Π‘ΡƒΠ»Ρ‹Π³ΠΈΠ½Π° Π•. Π‘., ΠšΡƒΠ·Π½Π΅Ρ†ΠΎΠ² Π‘. Π‘., Π’ΡƒΡ€ΠΎΠ²Π° Π’. П., ΠšΡ€Π°Π²Ρ‡Π΅Π½ΠΊΠΎ И. К., Π“Π°Π»ΡŒΡ‡Π΅Π½ΠΊΠΎ Π’. Π€. БистСма ΠΎΠ»ΠΈΠ³ΠΎΠ½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ€ΠΎΠ² для Π°ΠΌΠΏΠ»ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Π³Π΅Π½ΠΎΠ² niftl Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… таксономичСских Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏ ΠΏΡ€ΠΎΠΊΠ°Ρ€ΠΈΠΎΡ‚ // ΠœΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ. 2001. -Π’. 70. -№ 1. — Π‘. 86−91.
  5. Н. Π’., Ивановский Π . Н. О ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠ΅ Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ‚Ρ€ΠΎΡ„Π½ΠΎΠΉ фиксации углСкислоты Ρƒ Chloroflexus aurantiacus II ΠœΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ. 2000. — Π’. 69. — № 2. — Π‘. 175−179.
  6. А. Π’., Ахунов Π­. Π”., Π’Π°Ρ…ΠΈΡ‚ΠΎΠ² Π’. А. Π‘Π΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Π”ΠΠš. М.:Наука, 1999.-429 с.
  7. Н. А. ИспользованиС ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π°Π·Π½ΠΎΠΉ Ρ†Π΅ΠΏΠ½ΠΎΠΉ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ для Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΊΡ†ΠΈΠΈ Π³Π΅Π½Π° Π Π‘Π€Πš Π² ΠΏΡ€ΠΈΡ€ΠΎΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·Ρ†Π°Ρ… // ΠœΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ. 1995. — Π’. 64. — № 6. — Π‘. 792−796
  8. L. A., Carey J., Madigan М. Π’. Photosynthetic and phylogenetic primers for detection of anoxygenic phototrophs in natural environments // Appl. Environ. Microbiol. 2001. — V. 67. — № 7. — P. 2922−2926.
  9. Alfreider A., Vogt C., Hoffmann D., Babel W. Diversity of ribulose-l, 5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large-subunit genes from groundwater and aquifer microorganisms // Microb. Ecol. 2003. — V. 45. — № 4, — P. 317−328.
  10. Ashida H., Danchin A., Yokota A. Was photosynthetic RuBisCO recruited by acquisitive evolution from RuBisCO-like proteins involved in sulfur metabolism? // Res. Microbiol. 2005. — V. 156.-№ 5−6.- P. 611−618.
  11. Ashida H., Saito Y., Kojima C., Kobayashi K., Ogasawara N., Yokota A. A functional link between RuBisCO-like protein of Bacillus and photosynthetic RuBisCO I I Science. -2003.-V. 302.-P. 286−290.
  12. Bassham J. A., Calvin M. The path of carbon in photosynthesis. Englewood Cliffs, NJ: Prentis Hall, 1957.- 104 p.
  13. Bazylinski D. A., Dean A. J., Williams T. J., Long L. K., Middleton S. L., Dubbels B. L. Chemolithoautotrophy in the marine, magnetotactic bacterial strains MV-1 and MV-2 // Arch. Microbiol. 2004. — V. 182. — № 5. — P. 373−387.
  14. Bhatnagar L., Jain M. K., Zeikus J. G. Methanogenic bacteria // In: Variations in autotrophic life / Shively J. M. a. Barton L. L. (Eds.). London: Academic Press, 1991. -P. 251−270.
  15. Bhattacharya D., Medlin L. The phylogeny of plastids: a review based on comparisons of small-subunit ribosomal RNA coding regions // J. Phycol. 1995. — V. 31. — № 4. — P. 489−498.
  16. Birnboim H. C., Doly J. A rapid alkaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA //Nucleic Acids Res. 1979. — V. 7. — № 6. — P. 1513−1523.
  17. Bonnet R., Suau A., Dore J., Gibson G. R., Collins M. D. Differences in rDNA libraries of faecal bacteria derived from 10- and 25-cycle PCRs // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. -2002.-V. 52. -№ 3. P. 757−763.
  18. Bowes G., Ogren W. L., Hagerman R. H. Phosphoglycolate production catalyzed by ribulose diphosphate carboxylase // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1971. — V. 45. -№ 3.-P. 716−722.
  19. Brinkhoff Π’., Muyzer G. Increased species diversity and extended habitat range of sulfur-oxidizing Thiomicrospira spp. // Appl. Environ. Microbiol. 1997. — V. 63. — № 10. — P. 3789−3796.
  20. Brinkhoff Π’., Muyzer G., Wirsen Π‘. O., Kuever J. Thiomicrospira chilensis sp. nov., a mesophilic obligately chemolithoautotrophic sulfur-oxidizing bacteria isolated from a Thioploca mat // Int. J. Syst. Bacterid. 1999a. — V. 49. — № 2. — P. 875−879.
  21. Π’. J., Π‘Π°Π³Ρƒ S. Π‘. Abundance of reverse tricarboxylic acid cycle genes in free-living microorganisms at deep-sea hydrothermal vents // Appl. Environ. Microbiol. -2004. V. 70. — β„– io. — P. 6282−6289.
  22. Campbell B. J., Stein J. L., Cary S. C. Evidence of chemolithoautotrophy in the bacterial community associated with Alvinella pompejana, a hydrothermal vent polychaete // Appl. Environ. Microbiol. 2003. — V. 69. — № 9. — P. 5070−5078.
  23. Cavanaugh Π‘. M. Symbiosis of chemoautotrophic bacteria in marine invertebrates from hydrothermal vents and reducing sediments // Biol. Soc, Wash. Bull. 1985. — V. 6. -P.373−388.
  24. Chandler D. P., Fredrickson J. K., Brockman F. J. Effect of PCR template concentration on the composition and distribution of total community 16S rDNA clone libraries // Mol. Ecol. 1997. — V. 6. — № 5. — P. 475−482.
  25. Clegg M. T. Chloroplast gene sequences and the study of plant evolution // Proc. Natl. Acad. Sci. 1993. — V. 90. — № 2. — P. 363−367.
  26. Cleland W. W., Andrews T. J., Gutteridge S., Hartman F. C., Lorimer G. H. Mechanism of Rubisco: the carbamate as general base // Chem. Rev. 1998. — V. 98. — № 2. — P. 549 561.
  27. Cobb B. Optimization of RAPD fingerprinting // In: Fingerprinting methods based on arbitrarily primed PCR / Micheli M. R. a. Bova R. (Eds.). Berlin: Springer-Verlag, 1997.-P. 93−102.
  28. Coulter-Mackie M. B. Single-base sequencing for rapid screening of plasmids for inserts with known mutations and correct orientation // Biotechniques. 1994. — V. 16. — № 6. -P. 1026−1029.
  29. De Rijk P., Van de Peer Y., Van den Broeck I., De Wachter R. Evolution according to large ribosomal subunit RNA // J. Mol. Evol. 1995. — V. 41. — № 3. — P. 366−375.
  30. Delwiche C. F., Kuhsel M., Palmer J. D. Phylogenetic analysis of tufk sequences indicates a cyanobacterial origin of all plastids // Mol. Phylogenet. Evol. 1995. — V. 4. -№ 2. -P. 110−128.
  31. Delwiche C. F., Palmer J. D. Rampant horizontal transfer and duplication of Rubisco genes in eubacteria and plastids // Mol. Biol. Evol. 1996. — V. 13. — № 6. — P. 873−882.
  32. Distel D. L., Cavanaugh Π‘. M. Independent phylogenetic origins of methanotrophic and chemoautotrophic bacterial endosymbionts in marine bivalves // J. Bacterid. 1994. -V. 176.-№ 7.-P. 1932−1938.
  33. Distel D. L., Lee H. K., Cavanaugh Π‘. M. Intracellular coexistence of methano- and thioautotrophic bacteria in a hydrothermal vent mussel // Proc. Natl. Acad. Sci. 1995. -V. 92. -№ 21. -P. 9598−9602.
  34. Douglas S. E., Murphy C. A. Structural, transcriptional and phylogenetic analyses of the atpB gene cluster from the plastid of Cryptomonas? (Cryptophyceae) // J. Phycol. -1994.-V. 30.-№ 2.-P. 329−340.
  35. D. Π’., Nelson D. C. DNA-DNA solution hybridization studies of the bacterial symbionts of hydrothermal vent tube worms (Riftia pachyptila and Tevnia jerichonana) И Appl. Environ. Microbiol. -1991. V. 57. — № 4. — P. 1082−1088.
  36. Ellis R. J. The most abundant protein in the world // Trends Biochem. Sci. 1979. -V. 4.-P. 241−244.
  37. Elsaied H., Naganuma T. Phylogenetic diversity of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large-subunit genes from deep-sea microorganisms // Appl.Environ.Microbiol. 2001. — V. 67. — № 4. — P. 1751−1765.
  38. English R. S., Williams C. A., Lorbach S. C., Shively J. M. Two forms of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase from Thiobaeillus denitrificans IIFEMS Microbiol. Lett. -1992. V. 94. — № 1,2. — P. 111−119.
  39. M. C., Buchanan Π’. Π’., Arnon D. I. A new ferredoxin-dependent carbon reduction cycle in a photosynthetic bacterium // Proc. Natl. Acad. Sci. 1966. — V. 55. — № 4. -P. 928−934.
  40. R. A., Black M. Π’., Π‘Π°Π³Ρƒ Π‘. S., Lutz R. A., Vrijenhoek R. C. Molecular phylogenetics of bacterial endosymbionts and their vestimentiferan hosts // Mol. Mar. Biol. Biotechnol. 1997. — V. 6. — № 3. — P. 268−277.
  41. Felsenstein J. Evolutionary trees from DNA sequences: a maximum likelihood approach // J. Mol. Evol. -1981. V. 17. — № 6. — P. 368−376.
  42. Felsenstein J. PHYLIP Phylogenetic Inference Package version 3.2 // Cladistics. -1989.-V. 5.-P. 164−166.
  43. Fennoy S. L., Bailey-Serres J. Synonymous codon usage in Zea mays L. nuclear genes is varied by levels of Π‘ and G-ending codons // Nucleic Acids Res. 1993. — V. 21. -№ 23.-P. 5294−5300.
  44. Finn M. W., Tabita F. R. Modified pathway to synthesize ribulose 1,5-bisphosphate in methanogenic archaea // J. Bacteriol. 2004. — V. 186. — № 19. — P. 6360−6366.
  45. Finn M. W., Tabita F. R. Synthesis of catalytically active form III ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase in archaea // J. Bacteriol. 2003. — V. 185. — № 10. -P. 3049−3059.
  46. Fitch W. M. Toward defining the course of evolution: minimum change for a specified tree topology // Systematic Zoology. -1971. V. 20. — P. 406−416.
  47. Fitch W. M., Margoliash E. Construction of phylogenetic trees // Science. 1967. -V. 155.-P. 279−284.
  48. French J. C., Chung M. G., Hur Y. K. Chloroplast DNA phylogeny of the Ariflorae // In: Monocotyledons: Systematics and Evolution / Rudall P. J. et al. (Eds.). Kew: Royal Botanic Gardens, 1995. — P. 255−275.
  49. Freshwater D. W., Fredericq S., Butler B. S., Hommersand M., Chase M. W. A gene phylogeny of the red algae (Rhodophyta) based on plastid rbcL // Proc. Natl. Acad. Sci. -1994. V. 91. — № 15. — P. 7281−7285.
  50. Fujiwara Y., Takai K., Uematsu K., Tsuchida S., Hunt J. C., Hashimoto J. Phylogenetic characterization of endosymbionts in three hydrothermal vent mussels: influence of host distributions //Mar. Ecol. Prog. Ser. 2000. — V. 208. — 147−155.
  51. Garrity G. M., Holt J. G, Phylum BVI. Chlorojlexi phy. nov. // In: Bergey’s manual of systematic bacteriology. 2 ed. / Boone D. R. et al. (Eds.). New York, Berlin, Heidelberg: Springer, 2001. — P. 427−446.
  52. Gibson J. L., Falcone D. L., Tabita F. R. Nucleotide sequence, transcriptional analysis, and expression of genes encoded within form I CO2 fixation operon of Rhodobacter sphaeroides // J. Biol. Chem. -1991. V. 266. — № 22. — P. 14 646−14 653.
  53. Gibson J. L., Tabita F. R. Different molecular forms of D-ribulose-l, 5-bisphosphate carboxylase from Rhodopseudomonas sphaeroides I I J. Biol. Chem. 1977a. — V. 252. -№ 3.-P. 943−949.
  54. Gibson J. L., Tabita F. R. Isolation and preliminary characterization of two forms of ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase from Rhodopseudomonas capsulata II J. Bacteriol. 1977b. — V. 132. — № 3. — P. 818−823.
  55. Gich F., Garcia-Gil J., Overmann J. Previously unknown and phylogenetically diverse members of the green nonsulfur bacteria are indigenous to freshwater lakes // Arch. Microbiol. 2001. — V. 177. — № 1. — P. 1−10.
  56. S. J., Britschgi Π’. Π’., Moyer C. L., Faild K. J. Genetic diversity in Sargasso Sea bakterioplankton // Nature. -1990. V. 345. — P. 60−63.
  57. Giri B. J., Bano N., Hollibaugh J. T. Distribution of RuBisCO genotypes along a redox gradient in Mono Lake, California // Appl. Environ. Microbiol. 2004. — V. 70. — № 6. -P. 3443−3448.
  58. Gregory L. G., Karakas-Sen A., Richardson D. J., Spiro S. Detection of genes for membrane-bound nitrate reductase in nitrate-respiring bacteria and in community DNA // FEMS Microbiol. Lett. 2000. — V. 183. — № 2. — P. 275−279.
  59. Gupta R. S. Protein phylogenies and signature sequences: A reappraisal of evolutionary relationships among archaebacteria, eubacteria, and eukaryotes // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998. — V. 62. — № 4. — P. 1435−1491.
  60. Hanada S., Takaichi S., Matsuura K., Nakamura K. Roseiflexus castenholzii gen. nov., sp. nov., a thermophilic, filamentous, photosynthetic bacterium that lacks chlorosomes // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002. — V. 52. — № 1. — P. 187−193.
  61. Hanson Π’. E., Tabita F. R. Insights into the stress response and sulfur metabolism revealed by proteome analysis of a Chlorobium tepidum mutant lacking the Rubisco-like protein// Photosynth. Res. 2003. — V. 78. — № 3. — P. 231−248.
  62. Haygood M. G. The potential role of functional differences between RuBisCO forms in governing expression in chemoautotrophic symbiosis // Limnol. Oceanogr. 1996. — V. 41.-№ 2.-P. 370−371.
  63. Heinhorst S., Baker S. H., Johnson D. R., Davies P. S., Cannon G. C., Shively J. M. Two copies of form I RuBisCO genes in Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23 270 // Curr. Microbiol. 2002. — V. 45. — № 2. — P. 115−117.
  64. Hilario E., Gogarten J. P. Horizontal transfer of ATPase genes the tree of life becomes a net of life // Biosystems. — 1993. — V. 31. — № 2−3. — P. 111−119.
  65. Holmes A. J., Costello A., Lidstrom M. E., Murrell J. C. Evidence that particulate methane monooxygenase and ammonia monooxygenase may be evolutionarily related // FEMS Microbiol. Lett. 1995. — V. 132. — № 3. — P. 203−208.
  66. Horken К. M., Tabita F. R. The «green» form I ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase from nonsulfur purple bacterium Rhodobacter capsulatus II J. Bacteriol. 1999. — V. 181. — № 13. — P. 3935−3941.
  67. Hugler M., Huber H., Stetter К. O., Fuchs G. Autotrophic CO2 fixation pathways in archaea (Crenarchaeota) // Arch. Microbiol. 2003. — V. 179. — № 3. — P. 160−173.
  68. Husemann M., Klintworth R., Buttcher V., Salnikow J., Weissenborn C., Bowien B. Chromosomally and plasmid-encoded gene clusters for CO2 fixation (cfx genes) in Alcaligenes eutrophus И Mol. Gen. Genet. 1988. — V. 214. — P. 112−120.
  69. Imhoff J. F., Truper H. G., Pfennig N. Rearrangement of the species and genera of the phototrophic 'purple nonsulfur bacteria' // Int. J. Syst. Bacteriol. 1984. — V. 34. — P. 340 343.
  70. Ishii M., Miyake Π’., Satoh Π’., Sugiyama H., Oshima Y., Kodama Π’., Igarashi Y. Autotrophic carbon dioxide fixation in Acidianus brierleyi II Arch. Microbiol. -1997.-V. 166.-№ 6.-P. 368−371
  71. Ivanova Π’. I., Tourova T. P., Antonov A. S. DNA-DNA hybridization studies on some purple nonsulfur bacteria // Syst. Appl. Microbiol. 1988. — V. 10. — P. 259−263.
  72. Ivanovsky R. N., Krasilnikova E. N., Fal Y. I. A pathway of the autotrophic CO2 fixation in Chloroflexus aurantiacus II Arch. Microbiol. 1993. — V. 159. — № 3. — P. 257−264.
  73. Ivanovsky R. N., Sintsov N. V., Kondratieva E. N. ATP-linked citrate lyase activity in the green sulfur bacterium Chlorobium limicola forma thiosulfatophilum II Arch. Microbiol. 1980. — V. 128. — № 2. — P. 239−241.
  74. Jannasch H. W., Wirsen Π‘. O., Nelson D. C., Robertson L. A. Thiomicrospira crunogena sp. nov., a colorless sulfur-oxidizing bacterium from a deep-sea hydrothermal vent // Int. J. Syst. Bacteriol. 1985. — V. 35. — P. 422−424.
  75. D. Π’., Ogren W. L. Species variation in the specificity of ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase //Nature. -1981. V. 291. — P. 513−515.
  76. Jouanneau Y., Tabita F. R. Independent regulation of synthesis of form I and form II ribulose bisphosphate carboxylase-oxygenase in Rhodopseudomonas sphaeroides II J. Bacteriol. 1986. — V. 165. — № 2. — P. 620−624.
  77. Kalkus J., Ren M., Schlegel H. G. Hydrogen autotrophy of Nocardia opaca strains is encoded by linear megaplasmids // J.Gen. Microbiol. 1990. — V. 136. — № 6. — P. 11 451 151.
  78. Kellogg E. A., Juliano N. D. The structure and function of RuBisCO and their implications for systematic studies // Am. J. Bot. 1997. — V. 84. — № 3. — P. 413−428.
  79. Kimura H., Higashide Y., Naganuma T. Endosymbiotic and ambient microflora of vestimentiferan tubeworms // Jpn. Mar. Sci. Technol. Center J. Deep Sea Res. 1999. -V. 15.-P. 25−33.
  80. Kimura H., Higashide Y., Naganuma T. Endosymbiotic microflora of the vestimentiferan tubeworm (Lamellibrachia sp.) from a bathyal cold seep // Mar. Biotechnol. 2003. — V. 5.-№ 6.-P. 593−603.
  81. Kimura H., Sato M., Sasayama Y., Naganuma T. Molecular characterization and in situ localization of endosymbiotic 16S ribosomal RNA and RuBisCO genes in the pogonophoran tissue // Mar. Biotechnol. 2003. — V. 5. — № 3. — P. 261−269.
  82. Kuenen J. G., Veldkamp H. Thiomicrospira pelophila, gen. ΠΏ., sp. ΠΏ., a new obligately chemolithotrophic colourless sulfur bacterium // Ant. van Leeuwenhoek. 1972. — V. 38. -P. 241−256.
  83. Kusano Π’., Takeshima Π’., Inoue C., Sugawara K. Evidence for two sets of structural genes coding for ribulose bisphosphate carboxylase in Thiobacillus ferrooxidans II J. Bacteriol. -1991. V. 173. — № 22. — P. 7313−7323.
  84. Kusian Π’., Bednarski R., Husemann M., Bowien B. Characterization of the duplicate ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase genes and ebb promoters of Alcaligenes eutrophus II J. Bacterid. -1995. V. 177. — № 15. — P. 4442−4450.
  85. Kusian Π’., Bowien B. Organization and regulation of ebb БОг assimilation genes in autotrophic bacteria // FEMS Microbiol. Rev. 1997. — V. 21. — № 2. — P. 135−155.
  86. D. J. 16S/23S sequencing // In: Nucleic acid techniques in bacterial systematics / Stackebrandt E. a. Goodfellow M. (Eds.). Chichester: John Wiley & Sons, Ltd., 1991. -P. 115−175.
  87. Li H., Sawaya M. R., Tabita F. R., Eisenberg D. Crystal structure of a RuBisCO-like protein from the green sulfur bacterium Chlorobium tepidum II Structure. 2005. — V. 13. — № 5. — P. 779−789.
  88. Maeda N., Kanai Π’., Atomi H., Imanaka T. The unique pentagonal structure of an archaeal Rubisco is essentional for its high thermostability // J. Biol. Chem. 2002. -V. 277.-№ 35.-P. 31 656−31 662.
  89. Malasarn D., Saltikov C. W., Campbell К. M., Santini J. M., Hering J. G., Newman D. K. arrA is a reliable marker for As (V) respiration // Science. 2004. — V. 306. — P. 455.
  90. Martin W., Brinkmann H., Savonna C., Cerff R. Evidence for a chimeric nature of nuclear genomes: eubacterial origin of eukaryotic glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase genes // Proc. Natl. Acad. Sci. 1993. — V. 90. — № 18. — P. 8692−8696.
  91. McClung C. R., Chelm Π’. K. A genetic locus essential for formate-dependent growth of Bradyrhizobium japonieum I I J. Bacterid. 1987. — V. 169. — № 7. — P. 3260−3267.
  92. McDonald I. R., Kenna E. M., Murrell J. C. Detection of methanotrophic bacteria in environmental samples with the PCR // Appl. Environ. Microbiol. 1995. — V. 61. — № 1. -P. 116−121.
  93. McDonald I. R., Murrell J. C. The methanol dehydrogenase structural gene mxa? and its use as a functional gene probe for methanotrophs and methylotrophs // Appl. Environ. Microbiol. 1997. — V. 63. — № 8. — P. 3218−3224.
  94. McFadden B. A. Autotrophic CO2 assimilation and the evolution of ribulose diphosphate carboxylase // Bacterid. Rev. 1973. — V. 37. — № 3. — P. 289−319.
  95. Medigue Π‘., Rouxel Π’., Vigier P., Henaut A., Danchin A. Evidence for horizontal gene transfer in Escherichia coli speciation. // J. Mol. Biol. -1991. V. 222. — № 4. — P. 851 856.
  96. Morse D., Salois P., Markovic P., Hastings J. W. A nuclear-encoded form II RuBisCO in dinoflagellates // Science. 1995. — V. 268. — P. 1622−1624.
  97. Moszer I., Rocha E. P., Danchin A. Codon usage and lateral gene transfer in Bacillus subtilis // Curr. Opin. Microbiol. 1999. — V. 2. — № 5. — P. 524−528.
  98. Musto H., Romero H., Rodriguez-Maseda H. Heterogeneity in codon usage in the flatworm Schistosoma mansoni // J. Mol. Evol. 1998. — V. 46. — № 2. — P. 159−167.
  99. Naganuma Π’., Kato C., Hirayama H., Moriyama N., Hashimoto J., Horikoshi K. Intracellular occurrence of s-proteobacterial 16S rDNA sequences in the vestimentiferan trophosome // Journal of Oceanography. 1997. — V. 53. — P. 193−197.
  100. Newman J., Gutteridge S. The X-ray structure of Synechococcus ribulose-bisphosphate carboxylase/oxygenase-activated quaternary complex at 2.2-A resolution // J. Biol. Chem. 1993. — V. 268. — № 34. — P. 25 876−25 886.
  101. Nishihara H., Igarashi Y., Kodama T. Hydrogenovibrio marinus gen. nov., sp. nov., a marine obligately chemolithoautotrophic hydrogen-oxidizing bacterium // Int. J. Syst. Bacteriol. -1991. V. 41. — P. 130−133.
  102. Palenik B" Swift H. Cyanobacterial evolution and prochlorophyte diversity as seen in DNA-dependent RNA polymerase gene sequences // J. Phycol. 1996. — V. 32. — № 4. -P. 638−646.
  103. Paoli G. C., Morgan N. S., Tabita F. R" Shively J. M. Expression of the cbbLcbbS and cbbM genes and distinct organization of the ebb Calvin cycle structural genes of Rhodobacter capsulatus II Arch. Microbiol. 1995. — V. 164. — № 6. — P. 396−405.
  104. Paoli G. C., Vichivanives P., Tabita F. R. Physiological control and regulation of the Rhodobacter capsulatus ebb operons // J. Bacteriol. 1998. — V. 180. — № 16. — P. 42 584 269.
  105. Paul J. H., Cazares L., Thurmond J. Amplification of the rbcL gene from dissolved and particulate DNA from aquatic environments // Appl. Environ. Microbiol. 1990. — V. 56. — № 6. — P. 1963−1966.
  106. Hl.Pichard S. L., Campbell L., Paul J. H. Diversity of the ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase form I gene (rbcL) in natural phytoplankton communities I I Appl. Environ. Microbiol. 1997. — V. 63. — № 9. — P. 3600−3606.
  107. Rajagopalan R., Altekar W. Characterisation and purification of ribulose-bisphosphate carboxylase from heterotrophically grown halophilic archaebacterium, Haloferax mediterranei II Eur. J. Biochem. 1994. — V. 221. — № 2. -P. 863−869.
  108. Robertson L. A., Kuenen J. G. The colourless sulfur bacteria // In: The prokaryotes: an evolving electronic resource for the microbiological community. 3 ed. -New York: Springer-Verlag, 1999. http://link.springer-ny.com/link/service/books/10 125/
  109. Rotthauwe J. H., Witzel K. P., Liesack W. The ammonia monooxygenase structural gene amok as a functional marker: molecular fine-scale analysis of natural ammonia-oxidizing populations //Appl. Environ. Microbiol. 1997. — V. 63. — № 12. — P. 4704−4712.
  110. E. G., Wirsen C. 0., Jannasch H. W. Chemolithotrophic sulfur-oxidizing bacteria from the Galapagos Rift hydrothermal vents // Appl. Environ. Microbiol. -1981. V. 42. -№ 2.-P. 317−324.
  111. Saitou N., Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees // Mol. Biol. Evol. 1987. — V. 4. — № 4. — P. 406−425.
  112. Schneider G., Lindqvist Y., Lundqvist T. Crystallographic refinement and structure of ribulose-l, 5-bisphosphate carboxylase from Rhodospirillum rubrum at 1.7 A resolution // J. Mol. Biol. 1990. — V. 211. — № 4. — P. 989−1008.
  113. Sekowska A., Danchin A. The methionine salvage pathway in Bacillus subtilis II BMC Microbiology. 2002. — V. 2. — P. 8−21.
  114. Shively J. M., van Keulen G., Meijer W. G. Something from almost nothing: carbon dioxide fixation in chemoautotrophs // Annu. Rev. Microbiol. 1998. — V. 52. — P. 191 230.
  115. Sorokin D. Y., Kuenen J. G. Chemolithotrophic haloalkaliphiles from soda lakes // FEMS Microbiol. Ecol. 2005. — V. 52. — № 3. — P. 287−295.
  116. Sorokin D. Y., Robertson L. A., Kuenen J. G. Isolation and characterization of alkaliphilic, chemolithoautotrophic, sulphur-oxidizing bacteria // Ant. van Leeuwenhoek. 2000. — V. 77. — № 3. — P. 251−262.
  117. Stein J. L., Haygood M., Felbeck H. Nucleotide sequence and expression of a deep-sea ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase gene cloned from a chemoautotrophic bacterial endosymbiont // Proc. Natl. Acad. Sci. 1990. — V. 87. — № 22. — P. 8850−8854.
  118. M. Π’., Shively J. M. Cloning and expression of the D-ribulose- 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase form II gene from Thiobaeillus intermedius in Escherichia coli II FEMS Microbiol. Lett. 1993. — V. 107. — № 2−3. — P. 287−292.
  119. Strauss G., Fuchs G. Enzymes of a novel autotrophic CO2 fixation pathway in the phototrophic bacterium Chloroflexus aurantiacus, the 3-hydroxypropionate cycle // Eur. J. Biochem. 1993. — V. 215. — № 3. — P. 633−643.
  120. Tabita F. R. Molecular and cellular regulation of autotrophic carbon dioxide fixation in microorganisms // Microbiol. Rev. 1988. — V. 52. — № 2. — P. 155−189.
  121. Tabita F. R. The biochemistry and metabolic regulation of carbon metabolism and CO2 fixation in purple bacteria // In: Anoxygenic photosynthetic bacteria / Blankenship R. E. et al. (Eds.). Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1995. — P. 885−914.
  122. Tabita F. R. Microbial ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase: a different perspective // Photosynth. Res. -1999. V. 60. — P. 1−28.
  123. Tabita F. R., Gibson J. L., Bowien Π’., Dijkhuizen L., Meijer W. G. Uniform designation for genes of the Calvin-Benson-Bassham reductive pentose phosphate pathway of bacteria // FEMS Microbiol. Lett. 1992. — V. 78. — № 2−3. — P. 107−110.
  124. Tabita F. R., McFadden B. A. D-Ribulose 1,5-disphosphate carboxylase from Rhodospirillum rubrum II J. Biol. Chem. 1974. — V. 249. — № 11. — P. 3459−3464.
  125. Tolli J., King G. M. Diversity and structure of bacterial chemolithotrophic communities in pine forest and agroecosystem soils // Appl. Environ. Microbiol. 2005. — V. 71. -№ 12.-P. 8411−8418.
  126. Y., Yokota A. «Green-like» and «red-like» RubisCO cbbL genes in Rhodobacter azotoformans II Mol. Biol. Evol. 2003. — V. 20. — № 5. — P. 821−830.
  127. Van de Peer Y., De Wachter R. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment // Comput. Applic. Biosci. -1994. V. 10. — № 5. — P. 569−570.
  128. Viale A. M., Arakaki A. K., Soncini F. C., Ferreyra R. G. Evolutionary relationships among eubacterial groups as inferred from GroEL (chaperonin) sequence comparisons // Int. J. Syst. Bacteriol. 1994. — V. 44. — № 3. — P. 527−533.
  129. Wagner M., Roger A. J., Flax J. L., Brusseau G. A., Stahl D. A. Phylogeny of dissimilatory sulfite reductases supports an early origin of sulfate respiration // J. Bacteriol. 1998. — V. 180. — № 11. — P. 2975−2982.
  130. D. M., Weller R., Bateson M. M. 16S rRNA sequences reveal numerous uncultured microorganisms in natural community // Nature. 1990. — V. 345. — P. 63−65.
  131. Watson G. M. F., Tabita F. R. Regulation, unique gene organization, and unusual primary structure of carbon fixation genes from a marine phycoerythrin-containing cyanobacterium // Plant Mol. Biol. 1996. — V. 32. — № 6. — P. 1103−1115.
  132. Watson G. M. F., Tabita F. R. Microbial ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase: a molecule for phylogenetic and enzymological investigation // FEMS Microbiol. Lett. 1997. — V. 146. — № 1. — P. 13−22.
  133. Watson G. M. F., Yu J. P., Tabita F. R. Unusual ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase of anoxic archaea // J. Bacteriol. 1999. — V. 181. — № 5. — P. 1569−1575.
  134. Won Y. J., Hallam S. J., O’Mullan G. D., Pan I. L., Buck K. R., Vrijenhoek R. C. Environmental acquisition of thiotrophic endosymbionts by deep-sea mussels of the genus Bathymodiolus II Appl. Environ. Microbiol. 2003. — V. 69. — № 11. — P. 67 856 792.
  135. Wood A. P., Kelly D, P. Isolation and characterization of Thiobacillus thyasiris sp. nov., a novel marine facultative autotroph and the putative symbiont of Thyasira flexuosa II Arch. Microbiol. -1989. V. 152. — P. 160 -166.
  136. Wood A. P., Kelly D. P. Reclassification of Thiobacillus thyasiris as Thiomicrospira thyasirae comb. nov. an organism exhibiting pleomorphism in response to environmental conditions // Arch. Microbiol. 1993. — V. 159. — P. 45 -47.
  137. Wood H. G., Ljungdahl L. G. Autotrophic character of the acetogenic bacteria // In: Variations in autotrophic life / Shively J. M. a. Barton L. L. (Eds.). London: Academic Press, 1991.-P. 201−250.
  138. Yang Z. Phylogenetic analysis by maximum likelihood (PAML). v. 3.0. London: University College London, 2000.
  139. Yang Z., Nielsen R. Estimating synonymous and nonsynonymous substitution rates under realistic evolutionary models // Mol. Biol. Evol. 2000. — V. 17. — № 1. — P. 32−43.
Π—Π°ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡƒ Ρ‚Π΅ΠΊΡƒΡ‰Π΅ΠΉ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΎΠΉ