Ветеринарная санитария — это наука о профилактике инфекционных и инвазионных болезней животных, в том числе и антропозоонозов, о путях получения продуктов, сырья и кормов животного происхождения высокого санитарного качества. Она основывается на знании биологических особенностей патогенных и условно-патогенных микроорганизмов, способных не только паразитировать в организме животного (или человека), но, а продолжительно выживать на различных объектах внешней среды приводить в негодность многие продукты питания, корма и сыры животного происхождения, способных распространяться на больших расстояния и территории с живыми переносчиками: перелетными птицами, насекомыми и клещами, грызунами.
Основная задача ветеринарной санитарии — это санирование объектов внешней среды, куда от больного животного попадает патогенная и условно-патогенная микрофлора. Попав во внешнюю среду, патогенные микроорганизмы продолжительно выживают в ней, поддерживая тем самым очаги инфекции.
Биологическими отходами являются: трупы животных и птиц, в том числе лабораторных; абортированные и мертворожденные плоды; ветеринарные конфискаты (мясо, рыба, другая продукция животного происхождения), выявленные после ветеринарно-санитарной экспертизы другие отходы, получаемые при переработке пищевого и непищевого сырья животного происхождения.
Отходы животноводства утилизируют путем переработки на ветеринарно-санитарных утилизационных заводах (цехах) в соответствии с действующими правилами, обеззараживают в биотермических ямах, уничтожают сжиганием. Уничтожение биологических отходов путем захоронения в землю категорически запрещается.
Ветеринарная санитария осуществляет контроль за ветеринарно-санитарным. состоянием воды водоисточников и разрабатывает меры, предупреждающие ее загрязнение. Навоз от больных животных является потенциальным источником около 100 болезней животных может быть фактором их передачи.
Основные задачи ученых научное обоснование и разработка санитарно-гигиенических требований к системам удаления, переработки и использования навоза в крупных животноводческих хозяйствах промышленного типа разработка способов обеззараживания и дезодорации навоза и сточных вод; разработка методов санитарного контроля за работой очистных сооружений.
Интенсивное животноводство, как правило, развивается вокруг крупных промышленных центров. Наряду с природными аномалиями содержания минералов в почве и воде, накладывается антропогенное влияние: выбросы промышленных предприятий, тепловых электростанций, автотранспорт, аэродромы, горнорудная промышленность. В результате их деятельности меняется геохимическая ситуация.