После установления возможности передачи скрейпи в экспериментальных условиях овцам и козам были предложены вирусная, вироидная, белковая, полисахаридная, мембранная и др. гипотезы о природе агента скрейпи.
Вирусная гипотеза базировалась на малых размерах возбудителя, его инфекционж фильтруемости и неспособности расти на питательных средах. Главным возражением против вирусной теории служит необычайно высокая резистентность возбудителя к УФ лучам, ионизирующей радиации и нуклеазам.
Вироидная гипотеза предложена после того, как были открыты возбудители болезней растений (1971). Вироиды — односпиральные циркулярные РНК длиной 246−375 нуклеотидов. Они не кодируют белок и размножаются с помощью клеточной ДНК-зависимой РНК-полимеразы. Важным аргументом против вироидной гипотезы агента скрейпи является высокая устойчивость его к рибонуклеазам, которые легко разрушают вироиды.
Белковая природа приона основана на том, что агент скрейпи является самореплицирующимся белком. В клетке нет механизмов, с помощью которых бы белок обеспечивал синтез белка без участия НК.
Полисахаридная и мембранная гипотезы предполагают, что агент представляет собой вид полисахарида или часть измененной клеточной мембраны. Эти гипотезы носят достаточно умозрительный характер. 2].