Источник — Военная доктрина Республики Казахстан.
Верховным Главнокомандующим ВС РК является президент страны, который осуществляет общее руководство строительством, подготовкой и применением военной организации, обеспечением военной безопасности государства.
Парламент РК принимает законы по вопросам военной безопасности и обороны государства, решает вопросы войны и мира, принимает решение об использовании Вооружённых Сил для выполнения международных обязательств по поддержанию мира и безопасности, ратифицирует и денонсирует международные договоры по вопросам обороны и военного сотрудничества.
Правительство РК организует оснащение Вооружённых Сил вооружением, военной и специальной техникой, их финансовое и материальное обеспечение, оперативное оборудование территории страны в интересах обороны, гражданскую и территориальную оборону, определяет перечень стратегических объектов, подлежащих физической защите, штатную численность Вооруженных Сил, порядок предоставления и использования для нужд обороны всех природных ресурсов.
Министерство обороны РК через Комитет начальников штабов осуществляет централизованное руководство Вооружёнными Силами в мирное время, решает задачи, связанные с обеспечением военной безопасности и обороны страны, координирует разработку основных направлений военной реформы, программ развития Вооружённых Сил, определяет их структуру и штатную численность, проводит единую военно-техническую политику в государстве, осуществляет международное военное сотрудничество.
Комитет начальников штабов Министерства обороны РК разрабатывает основные направления военной реформы, планы строительства и развития Вооружённых Сил, их оперативной, боевой и мобилизационной подготовки, организует и осуществляет планирование применения Вооружённых Сил, разрабатывает план оперативного оборудования территории страны в интересах обороны[3].
Аналогичным образом осуществляется руководство другими войсками и воинскими формированиями, предназначенными для выполнения задач военными методами, — к ним относятся Республиканская гвардия, Внутренние войска МВД РК и Пограничная служба КНБ РК.