Неоднородность природных условий Южного Урала определяет разнообразие его почвенного покрова. Почвообразовательные процессы в горно-лесной зоне зависят от большой залесенности, горного рельефа, влажного и прохладного климата. Почвенный покров зоны очень неоднороден. Здесь четко прослеживается вертикальная поясность в распространении почв.
Верхние части гор заняты либо каменными россыпями, либо горно-тундровыми почвами с тундровой растительностью. Ниже расположены высокогорные луга с горно-луговыми почвами. На склонах хребтов и сопок распространены щебенчатые и дресвяные оподзоленные суглинистые и супесчаные почвы — основной почвенный фон зоны. В верхней части лесного пояса представлены травяные редкостойные леса с горно-луговыми оподзоленными почвами. Под хвойными и смешанными лесами преобладают горные серые и темно-серые лесные почвы. Встречаются горные дерново-лесные почвы под массивами смешанных лесов с травяно-моховым покровом. На остепененных склонах восточных предгорий Южного Урала появляются горные черноземы, чаще оподзоленные и выщелоченные черноземы. Территория Зауральского пенеплена и примыкающей к нему Западно-Сибирской низменности характеризуется достаточно выраженной сменой широтных зон. В северной части лесостепной зоны под березовыми лесами формируются серые лесные почвы, реже оподзоленные черноземы. Под лугово-степной растительностью — выщелоченные черноземы с пятнами темно серых лесных почв.
На плоских, слабо дренированных междуречьях встречаются лугово-черноземные почвы с пятнами солонцов и солодей, а в понижениях преобладают лугово-болотные комплексы.
В степной зоне выделяются две подзоны: северная с обыкновенными черноземами и южная — с южными черноземами. В южной части Зауральского пенеплена небольшое распространение имеют темно-каштановые почвы.
К выходам засоленных третичных глин приурочены солонцеватые черноземы, которые наиболее характерны для подзоны южных черноземов, распространенных на Западно-Сибирской низменности.
Сравнительно небольшие площади в степной зоне занимают солончаки и аллювиальные почвы. Солончаки — это почвы, которые в верхнем горизонте содержат много солей, выносимых грунтовыми водами.
Аллювиальные, или поименные, почвы расположены в долинах таких рек, как Урал, Уй, Тогузак и др. Вследствие ежегодных наносов илистых частиц, богатых органическими остатками, пойменные почвы отличаются высоким плодородием.
