Разработана классификация этих простейших, дающая представление о том, как выглядит каждая форма. Вакуолярная форма выглядит типично. Значение наружного диаметра: 5−20 мкм. В ней от 1 до 4 ядер. В очень тонком цитоплазматическом слое находятся составляющие, в том числе и митохондрии. Слой окружает большую оцентрованную вакуоль. Роль вакуоли не доказана, но есть мнение, что она нужна для хранения питательных элементов.
Гранулярная форма похожа на первую из описанных. Но в вакуоле содержится гранулированная субстанция с некоторым количеством липидов, гликогена, миелиноподобных структур и проч. Микроскопическая авакуолярная и амебная форма находятся в толстом кишечнике. Их размер небольшой, всего 5 мкм и меньше, потому лабораторно они почти никогда не обнаруживаются. Когда они выходят за пределы кишечника, то погибают. Амебная форма статична.
Мультивакуолярная форма бластоцист обитает в кишечнике. Формируется она из группы авакуолярных форм. В цитоплазме есть вакуоли, а самая большая вакуоля отсутствует. Структуры имеют плотную внешнюю оболочку, что защищает эту форму от окружающей среды.
Когда начинается неблагоприятное воздействие внешней среды, все из выше названных форм могут трансформироваться в клетки с многослойной стенкой, называемые цистами.
