Экзополисахарид бактерий Paenibacillus ehimensis
Диссертация
Биополимеры на основе полисахаридов, водные растворы которых отличаются высокой вязкостью и особой стабильностью при резких изменениях температуры и в условиях агрессивной среды, могут использоваться в нефтяной и газодобывающей промышленности в качестве стабилизаторов и структурообразователей промывных жидкостей, предназначенных для бурения нефтяных и газовых скважин, и обеспечивать более полное… Читать ещё >
Список литературы
- Беседнова, H.H. Иммунотропные свойства 1→3- I→6-?-D-niK)KaHOB Текст. / H.H. Беседнова, Л. А. Иванушко, Т. Н. Звягинцева, Л. А. Елякова. -Антибиотики и химиотерапия. -2000. № 2. — С. 37−44.
- Ботвинко, И.В. Экзополисахариды бактерий Текст. / И. В. Ботвинко // Успехи микробиологии. 1985. — Т. 20. -С. 79−122.
- Гринберг Т.А., Смоляр С. И., Малашенко Ю. Р., Пирог Т. П., Капиловская Е. Д. // Микробиол. журнал. 1991. Т. 53. № 5. С. 82 96.
- Гринберг, Т.А. Микробный синтез экзополисахаридов на С.-С2 соединениях Текст] / Т. А. Гринберг, Т. П. Пирог, Ю. Р. Малашенко, Г. Э. Пинчук. Киев: Наук. Думка, 1992. — 212 с.
- Егоренкова И.В., Состав и иммунохимическая характеристика экзополисахаридов ризобактерий Paenibacillus polymyxa 1465 Текст. / И. В. Егоренкова, К. В. Трегубова, Л. Ю. Матора, Г. Л. Бурыгин, В. В. Игнатов // Микробиология. 2008. — 77. — С. 623−629.
- Егорова Н.В., Синтез, исследования свойств, модификация и переработка высокомолекулярных соединений Текст. / H.JI. Егорова // 6 Межресп. научн. конф. студ. Вузов СССР: Тез. докл. науч. конф. Казань, 1991. — С. 132.
- Елинов, Н.П. Химия микробных полисахаридов Текст. / Н. П. Елинов. М.: Высш. шк., 1984.-200 с.
- Ибатуллин, P.P. Биополимеры полисахариды для увеличения нефтеотдачи пластов Текст. / P.P. Ибатуллин, И. Ф. Глумов, М. Р. Хисаметдинов, С. Г. Уваров // Нефтяное хозяйство. — 2006. — № 3. — С. 46−47.
- Каталог фирмы «Sigma-Aldrich, Inc.» Электронный ресурс. www. sigma-aldrich.com.
- Качественный химический анализ Текст./ Н. И. Блок. М.: Изд-во Госхимиздат, 1952.-650 с.
- Кириченко, Е.В., Титова, J1.B., Коць, С. Я. Роль экзометаболитов в процессе формирования и функционирования соево-ризобиального симбиоза Текст. / Е. В. Кириченко, JI.B. Титова, С. Я. Коць // Прикладная биохимия и микробиология. 2004. — № 5. — С. 567−570.
- Назина, Т.Н. Микроорганизмы нефтяных пластов и использование их в биотехнологии повышения нефтеотдачи Текст. / Т. Н. Назина. М.: ИНМИ РАН, 2000. — 67 с.
- Николаев, Ю.А. Биопленка «город микробов» или аналог многоклеточного организма? Текст. / Ю. А. Николаев, В. К. Плакунов // Микробиология. -2007. — № 2.-С. 149−163.
- Няникова, Г. Г. Иммобилизация на хитине Bacillus mucilaginosus -продуцента экзополисахаридов Текст. / Г. Г. Няникова, Е. Э. Куприна, О. В. Пестова, C.B. Водолажская // Прикладная биохимия и микробиология. -2002. -№ 3,-С. 300−304.
- Оводов, Ю.С. Биогликаны иммуномодуляторы Текст. / Ю. С. Оводов, Р. Г. Оводова, Ю. Н. Лоенко // Химия природных соединений. — 1983. — С. 675−694. Пат. 5 089 481 США, МКИ, А 61 К 31/70, СЩ8 В 37/00 от 18.02.92/ Muto Shigeaki.
- Пирог Т.П., Гринберг Т. А., Малашенко Ю. Р. // Прикл. биохимия и микробиология. 1998. — Т. 34. № 1. — С. 70−74.
- Пирог, Т.П. Образование экзополисахарида этаполана при выращивании Асте1:оЬас1ег эр. ИМВ В-7005 на смеси фумарата и глюкозы Текст. / Т. П. Пирог, Н. В. Высятецкая, Ю. В. Корж // Прикладная биохимия и микробиология. 2007,6. — № 6. — С. 790−796.
- Пирог, Т.П. Особенности синтеза экзополисахарида этаполана на энергетически дефицитных ростовых субстратов Текст. / Т. П. Пирог, Н. В. Высятецкая, Ю. В. Корж // Прикладная биохимия и микробиология. 2007, а. — № 1. — С. 32−38.
- Практикум по микробиологии Текст. / Под ред. А. И. Нетрусова. М.: Издательский центр «Академия», 2005. — 608 с.
- Практикум по микробиологии Текст. / Под ред. Н. С. Егорова. М.: Изд-во МГУ, 1976.-307 с.
- Свешникова, Е.В. Новые бактерии рода Pseudomonas анатагонисты фитопатогенов и перспективы их использования в сельскохозяйственной практике Текст.: автореф. дисс.. канд. биол. наук. / Е. В. Свешникова. -Уфа, 2003.-23 с.
- Семенова, Е.В. внеклеточные полисахариды микроорганизмов, условия их биосинтеза и физиологическая роль Текст. / Е. В. Семенова, H.H. Гречушкина // Экологическая роль микробных метаболитов / Под ред. Д. Г. Звягинцева. -М.:Изд-во МГУ, 1986.-С. 121−130
- Сохань, Т.С. Поиск новых бактериальных экзополисахаридов для нефтегазового комплекса Текст. / Т. С. Сохань, Данянь Чжан, И. В. Ботвинко, А. И. Нетрусов // Защита окружающей среды в нефтегазовом комплексе. № 5. 2008. — С. 62−64.
- Степаненко, Б.Н. Современные проблемы биохимии углеводов Текст. / Б. Н. Степаненко. М.: Наука, 1977. — 55 с.
- Стяжкин, К.К. Экзогенные полимеры микроорганизмов природных и техногенных экосистем нефтепромысловых районов Текст. / К. К. Стяжкин, И. Ю. Артемкина, JLB. Заквашевская // Нефтепромысловое дело. № 1. — 2007. -С. 21−25.
- Технология производства йогурта: йогурт, пищевое оборудование Электронный ресурс. www.protex.ru/solutions / 1ехпопо1е5/ктп/уоаиг1.рЬ1т1. — 2006.
- Усов А.И., Альгиновые кислоты и альгинаты: методы анализа, определения состава и установления строения Текст. / А. И. Усов // Успехи химии. 1999. -68.-С. 1051−1061.
- Хисаметдинов М.Р., Повышение Эффективности Выравнивания Профиля Приемистости И Ограничения Притока Вод На Основе Совершенствования Свойств Экзополисахарида Ксантана Текст.: автореф. дисс.. канд. фарм. наук. / М. Р. Хисаметдинов. Бугульма, 2009. — 24 с.
- А.с. 1 553 134 СССР, МКИ, А 61 15/16 от 30.03.90./Илларионова Е.Л.
- Alan W.D., Imaging an alginate polymer gel matrix using atomic force microscopy Text. / W.D. Alan // Carbohydrate Research. 1999. — 315. — P. 330−333.
- Alvarez A.M. Black rot of crucifers Text. / A.M. Alvarez // Mechanisms of Resistance to Plant Diseases. Dordrecht: Kluwer Academic Publications, 2000. -P.21−52.
- Ashby, M.J. Effect of antibiotics on non-growing planktonic cells and biofilms of Escherichia coli Text. / M.J. Ashby, J.E. Neale, S.J. Knott, I.A. Critchley // J. Antimicrob. Chemother. 1994. — 33. — P. 443−452.
- Atkins E.D.T., Crystalline structures of alginic acids Text. / E.D.T. Atkins, W. Mackie, E.E. Smolko // Nature 1970. — 225. — P. 626−628.
- Boucher, J.C. Pseudomonas aeruginosa in cystic fibrosis: Role of mucC in the regulation of alginate production and stress sensitivity Text. / J.C. Boucher, M.J. Schurr, H. Yu, D.W. Rowen, V. Deretic // Microbiology. 1997. — 143. — P. 34 733 480.
- Boyd A., Role of alginate lyase in cell detachment of Pseudomonas aeruginosa Text. / A. Boyd, A.M. Chakrabarty // Appl. Environ. Microbiol. 1994. — 60. — P. 2355−2359.
- Cambon-Bonavita M.A., A novel polymer produced by a bacterium isolated from a deep-sea hydrothermal vent polychaete annelid Text. / M.A. Cambon-Bonavita, G. Raguenes, J. Jean, P. Vincent and J. Guezennec // J. Appl. Microbiol. 2002. -93. P. 310−315.
- Cerning J., Isolation and characterization of exopolysaccharides from slime-forming mesophilic lactic acid bacteria Text. / J. Cerning, C. Bouillanne, M.J. Desmazeaud, M. Landon // J. Dairy Sei. 1997. — 75. — P. 692−699.
- Cochran, W.L. Role of RpoS and AlgT in Pseudomonas aeruginosa biofilm resistance to hydrogen peroxide and monochloramine Text. / W.L. Cochran, S.J. Suh, G.A. McFeters, P. S. Stewart // J. Appl. Microbiol. 2000. — 88. — P. 546 553.
- Cote G. L., Characterization of the exocellular polysaccharides from Azotobacter chroococcum Text. / G.L. Cote and L.H. Krull // Carbohydr. Res. 1988. — 181. -P. 143−152.r
- Dan V., Microbiologia produselor alimentare Text. / Dan V. // Ed. Alma, GalaNi -2000.
- Dogsa I., Structure of bacterial extracellular polymeric substances at different pH values as determined by SAXS /1. Dogsa, M. Kriechbaum, D. Stopar, P. Laggner // Biophysic Jour. 2005. — 89. — P. 2711−2720.
- Draget K.I., Alginates from Algae Text. / K.I. Draget, O. Smidsrod, G. Skjak-Brask // Polysaccharides and Polyamides in the food industry. Properties, Production, and Patents. —VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim, 2005. -P. 1−30.
- Emtiazi G., Production of extra-cellular polymer in Azotobacter and biosorption of metal by exopolymer Text. / G. Emtiazi, Z. Ethemadifar, M.H. Habibi // African Journal of Biotechnology. 2004. — 3. — P. 330−333.
- Fujihara, M. The effect of the content of D-mannuronic acid and L-guluronic acid blocks in alginates on mtitumor activity Text. / M. Fujihara, T. Nagumo // Carbolydr. Res. 1992. — 224. — P. 343−347.
- Gacesa P., Bacterial alginate biosynthesis recent progress and future prospects Text. / P. Gacesa // Microbiology. — 1998. — 144. — P. 1133−1143
- Galindo E, Molecular and bioengineering strategies to improve alginate and polydydroxyalkanoate production by Azotobacter vinelandii Text. / E. Galindo, C.
- Pena, C. Nunez, D. Segura and G. Espin // Microbial Cell Factories. 2007. — 6. -P.l-16.
- Gander S., Bacterial biofilms: resistance to antimicrobial agents Text. / S. Gander //J. Antimicrob. Chemother. 1996. — 37. — P. 1047−1050.
- Garner C.V., Immunogenic properties of Psezldomonas aerzlginosa mucoid exopolysaccharide Text. / C.V. Garner, D. Des Jardins, G.B. Pier // Infect. Immzln.- 1990.-58.-P. 1835−1 842.
- Geddie G.L., The effect of acetylation on cation binding by algal and bacterial alginates Text. / G.L. Geddie, I.W. Sutherland // Biotechnol. Appl. Biochem. -1994.-20.-P. 117−129.
- Gerald B.P., Role of Alginate O Acetylation in Resistance of Mucoid Pseudomonas aeruginosa to Opsonic Phagocytosis Text. / B.P. Gerald, F. Coleman, M. Grout, M. Franklin, E. D. Ohman II Infection And Immunity. 2001. -69.-P. 1895−1901.
- Gorin J.P.A., Exocellular alginic acid from Azotobacter vinelandii Text. / J.P.A. Gorin and T.J.F. Spencer // Can. J. Chem. 1966. — 44. — P. 993−998
- Govan J. R. W., Isolation of alginate-producing mutants of Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas putida and Pseudomonas mendocina Text. / J.R.W. Govan, J. A. M. Fyfe, T. R. Jarman 111. Gen. Microbiol. 1981. — 125. — P. 217 220.
- Grasdalen H., 13C-NMR studies of alginate Text. / H. Grasdalen, B. Larsen, O. Smidsrad // Carbohydr. Res. 1977. — 56. — P. 11−15.
- Guentas L., Production of a glucoglucuronan by a rhizobia strain infecting alfalfa Text. / L. Guentas, P. Pheulpin, A. Heyraud, C. Gey, B. Courtois and J. Courtois // Int. J. Biol. Macromol. 2000. — 27. — P. 269−277.
- Hammand A.M.M., Evaluation of alginate encapsulled Azothobacter croococcum as a phage-resistant and effective inoculum Text. / A.M.M. Hammand // J. Basic. Microbiol. 1998, — 1,-P. 9−16.
- Haug A., A study of the constitution of alginic acid by partial acid hydrolysis Text. / A. Haug, B. Larsen // Proc. Int. Seaweed Symp. 1966. — 5. — P. 271−277.
- Hentzer, M. Alginate overproduction affects Pseudomonas aeruginosa biofilm structure and function Text. / M. Hentzer, G.M. Teitzel, G.J. Balzer, A. Heydorn, S. Molin, M. Givskov, M.R. Parsek// J. Bacteriol. 2001. — 183. — P. 5395−5401.
- Jensen E.T., Human polymorphonuclear leukocyte response to Pseudomonas aeruginosa grown in biofilms Text. / A. Kharazmi, K. Lam, J.W. Costerton, N. Hoiby / /Infect. Immun. 1990. — 58. — P. 2383−2385.
- Kang K.S., Agar-like polysaccharide produced by a Pseudomonas species: production and basic properties Text. / K.S. Kang, G.T. Veeder, P J. Mirrasoul, T. Kaneko and W. Cottrell // Environ. Microbiol. 1982. — 43. — P. 1086−1089.
- Kanzawa Y., Difference of molecular association in two types of curdlan gel Text. / Y. Kanzawa, A. Harada, A. Koreeda, T. Harada, K. Okuyama // Carbohydrate Polymers. 1989. — 10. — P. 299−313.
- Kidambri P. S., Copper as a signal for alginate synthesis in Pseudomonas syringae pv. Syringae Text. / P. S. Kidambri, G.W. Sundin, A.D. Palmer, M.A. Chakrabarty, L.C. Bendar // Appl. Environ Microbiol. 1995. — 61. — P. 21 722 179.
- McSpadden Gardner B.B., Ecology of Bacillus and Paenibacillus spp. in agricultural system Text. / B.B. McSpadden Gardner // Phytopathology. 2004. -94.-P. 1252−1258.
- Morin A., Screening of polysaccharide-producing microorganisms, factors influencing the production and recovery of microbial polysaccharides Text. / A. Morin // Polysaccharides Structural Diversity and Functional Versatility. — 1998. — P.275−296
- Muhammadi, Isolation and characterization of exopolysaccharide produced by indigenous soil bacterium Bacillus strain CMG1403 Text. / Muhammadi and Nuzhat Ahmed // Iranian Polymer Journal. 2008. — 17. — P. 315−323.
- Nivens, D.E. Role of alginate and its O acetylation in formation of Pseudomonas aeruginosa microcolonies and biofilms Text. / D.E. Nivens, D. E. Ohman, J. Williams, and M. J. Franklin // J. Bacteriol. 2001. — 183. — P. 1047−1057.
- Nunez C., The Azothobacter vinelandii response regulator AlgR is essential for cyst formation Text. / C. Nunez, S. Moreno, G. Soberon-Chavez, G. Espin // J. Bacteriol. 1999.- 181.-P. 141−148.
- O’Toole, G. Biofilm formation as microbial development Text. / G. O’Toole, H. B. Kaplan, R. Kolter // Annu. Rev. Microbiol. 2000. — 54. — P. 49−79.
- Oren A., Diversity of halophilic microorganisms: Environments, phylogeny, physiology and applications Text. / A. Oren // Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 2002. — 28. — P. 56−63.
- Otterlei, M. Induction of cytokine production from human monocytes stimulated with alginate Text. / M. Otterlei, K. Ostgaard, G. Skjak-Braek, O. Smidsrod, P. Soon-Shiong, T. Espevik // J. Immunother. 1991. — 10. — 286−291.
- Pier G.B., Role of alginate O acetylation in resistance of mucoid Pseudomonas aeruginosa to opsonic phagocytosis Text. / G.B. Pier, F. Coleman, M. Grout, M. Franklin, and D.E. Ohman // Infect. Immun. 2001. — 69. — P. 1895−1901.
- Pollock T.J., Gellan-related polysaccharides and the genus Sphingomonas Text. / Pollock T.J. // J. Gen. Microbiol. 1993. — 139. — P. 1939−1945.
- Rathnayake I. V. N., Tolerance of heavy metals by gram positive soil bacteria Text. / I. V. N. Rathnayake, Mallavarapu Megharaj, Nanthi Bolan, and Ravi Naidu // World Academy of Science, Engineering and Technology. 2009. — 53. -P.1185−1189.
- Rehm B.H.A., Alginates from bacteria Text. / B.H.A. Rehm // Biopolymers for medical and pharmaceutical applications. 2005. -l.-P. 265 298.
- Rehm B.N.A., Alginate lyase from Pseudomonas aeruginosa CF1/M1 prefers the hexameric oligomannuronate as substrate Text. / B.N.A. Rehm // FEMS Microbiol. 1998. — 165. — P. 175−180.
- Remminghorst U., In vitro alginate polymerization and the functional role of Alg8 in alginate production by Pseudomonas aeruginosa Text. / U. Remminghorst and B.H.A. Rehm // App. and Env. Microbiol.- 2006. 72. — P. 298−305.
- Roberson E.B., Relationship between desiccation and exopolysaccharide production in a soil Pseudomonas sp. Text. / E.B. Roberson and M.K. Firestone // Appl. Environ. Microbiol. 1992.-58.-P. 1284−1291.
- Sabra W., Bacterial alginate: physiology, product quality and process aspects Text. / W. Sabra, A.-P. Zeng, W.-D. Deckwer // Appl Microbiol Biotechnol. -2001. 56. — P. 315−325.
- Sabra W., Function and variation of alginate production in Azothobacter vinelandii Text. / W. Sabra, A.-P. Zeng, W.-D. Deckwer // Appl. Environ. Microbiol. -2000.-66.-P. 4037−4044.
- Schierholz J.M., Antimicrobial substances and effects on sessile bacteria Text. / J.M. Schierholz, J. Beuth, D. Konig, A. Nurnberger, G. Pulverer // Zentralbl. Bakteriol. 1999. — 289. — P. 165−177.
- Shishido M., Endophytic colonization of spruce by plant growth-promoting rhizobacteria Text. / M. Shishido, B. Breuil, C.P. Chanway // FEMS Microbiol. Ecol.- 1999.-29.-P. 191−196.
- Shrikrishna S., Stimulation of exopolysaccharide production by fluorescent Pseudomonads in sucrose media due to dehydration and increased osmolarity Text. / Shrikrishna Singh and William F. Fett // FEMS Microbiology Letters. -1995.- 130.-P. 301−306.
- Skjak-Braek G, Monomer sequence and acetylation pattern in some bacterial alginates Text. / G. Skjak-Braek, H. Grasdalen, B. Larsen // Carbohydr. Res. -1986, — 154.-P. 238−250.
- Smidsrod O., Chemistry and physical properties of alginates Text. / O. Smidsrod, K.I. Draget // Carbohydrate in Europe 1996. — 14. — P. 6−13.
- Smidsrod O., The relative extension of alginates having different chemical composition Text. / O. Smidsrod, R.M. Glover, S.G. Whittington // Carbohydr. Res. 1973.-27. P. 107−118.
- Stanford E.C.C., British patent 142. London- 1881.
- Sutherland I.W., Biotechnology of microbial exopolysaccharides Text. / I.W. Sutherland // Cambridge Studies in Biotechnology. 1990. — 9. — P. 1−163.
- Sutherland I.W., Microbial exopolysaccharides-structural subtleties and their consequences Text. / I.W. Sutherland // Pure&App.Chem. 1997. — V.69. — P. 1911−1917
- Sutherland I.W., Microbial polysaccharides from Gram-negative bacteria Text. / I.W. Sutherland // Int. Dairy J. 2001. — 11. — P. 663−674.
- Sutherland I.W., Polysaccharides from microorganisms, plants and animals Text. / I.W. Sutherland, E. Vandamme, S. De Baets, A. Steinbuchel // Biopolymers. -2002.-5.-P. 1−19.
- Tait M.I., Effect of Growth Conditions on the Production, Composition and Viscosity of Xanthomonas campestris Exopolysaccharide Text. / M.I. Tait, I.W. Sutherland, A.J. Clarke-Sturman // J. Gen. Microbiol. 1986. — 132. — P. 14 831 492.
- Theilacker C., Construction and characterization of a Pseudomonas aeruginosa mucoid exopolysaccharide-alginate conjugate vaccine Text. / C. Theilacker, F.T. Coleman, S. Mueschenborn // Infect. Immun. 2003. — 71. — P. 3875−3884.
- Timmuck S., Paenibacillus polymyxa invades plant roots and forms biofilm Text. / S. Timmuck, N. Grantcharova, E.G.H. Wagner // Appl. Environ. Microbiol. -2005.-71.-P. 7292−7300.
- Vanhooren P., Biosynthesis, physiological role, use and fermentation process characteristics of bacterial exopolysaccharides Text. / Vanhooren P. and Vandamme E. J // Recent Res. Devel. Fermen.Bioeng. 1998. — 1. -P. 253−299.
- Watnick, P.I. Steps in the development of a Vibrio cholerae El Tor biofilm Text. / P.I. Watnick, R. Kolter // Mol. Microbiol. 1999. — 34. — P. 586−595.
- Yu J., Involvement of the EPS alginate in the virulence and epiphytic fitness of Pseudomonas syringae pv. syringae Text. / J. Yu, A Pen~ aloza-Va' zquez, A. M. Chakrabarty, C. L. Bender // Mol. Microbiol. 1999. — 33. — P. 712−720.