Хитинолитический и пектинолитический микробные комплексы наземных экосистем
Диссертация
Впервые отмечено, что развитие хитинолитического сообщества обусловлено, главным образом, прокариотными организмами, в то время как пектинолитического — его эукариотной составляющей. Для определенных условий эксперимента установлена регрессионная зависимость структурных показателей микробного сообщества (грибов и актиномицетов) в наземных экосистемах разных биоклиматических зон в рамках… Читать ещё >
Список литературы
- Актуганов Г. Э., Мелентьев А. И., Кузьмина Л. Ю., Галимзянова Н. Ф., Широков A.B. Хитинолитическая активность бактерий Bacillus cohn.-антагонистов фитопатогенных грибов. //Микробиология. 2003. № 3 С.356−360.
- Балабуха B.C., Разбитная JI.M., Разумовский М.О. и. др. Проблема выведения из организма долгоживущих радиоактивных изотопов. М.: Госатомиздат, 1962 -167с.
- Булыгина Е.С. Выделения ДНК из бактерий. Микробиология. 2002. //Т. 71. № 4. С. 500−508.
- Быков В.П., Фурман Д. И. Получение хитозана из гуммароса. Новые перспективы в исследовании хитина и хитозана. Москва-Щелково. 1999. С. 1820.
- Гаузе Г. Ф., Преображенская Т. П., Свешникова М. А. Определитель актиномицетов // М: Наука, 1983, 248 с.
- Горовой J1. Ф. Петюшенко А. П. Механизмы сорбции ионов металлов грибными хитинсодержащими комплексами. Новые перспективы в использовании хитина и хитозана. Москва-Щелково, 1999
- Грачева И.М., Кривова А. Ю. Технология ферментных препаратов.- М.: Изд-во Эвалар, 2000.-512 с.
- Донченко JI.B., Фирсов Г. Г. Пектин основные свойства, производство и применение. М.: ДеЛи принт, 2007
- Запороженко A.B., Слободова Н. В., Булыгина Е. С., Кравченко И.К., Кузнецов
- Калакуцкий Л.В., Шарая Л. С. Актиномицеты и растения. // Успехи микробиологии. 1990. Т.25. С. 26−65.
- Качалай и др. Методические указания по использованию в лечебно-профилактических целях пектинов и пектинсодержащих продуктов. Киев: Урожай, 1990 № 5049−89- 15с.
- Кириллова Л.Н., Муравьева М. Б., Козин А.И, Елякова Е. Г., МирощниковА.И. Полиаминосахаридсодержащие сорбенты из отходов микробиологических производств. Новые перспективы в исследовании хитина и хитозана. Москва -Щелково, 1999.
- Кожевин П.А. Микробные популяции в природе. М.: МГУ, 1989. -175 с.
- Кравченко И.К., Кизилова А. К., Быкова С. А., Менько Е. В., Гальченко В.Ф.
- Молекулярный анализ накопительных культур с высоким сродством к метану, выделенных из почв лесного биоценоза и агроценозов. Микробиология. 2009
- Манучарова H.A. Молекулярно-биологические аспекты исследований в экологии и микробиологии // Москва, Изд-во МГУ, с. 47.
- Манучарова H.A., Белова Э. В., Полянская JI.M., Зенова Г. М. Хитинолитический комплекс чернозема. // Микробиология. 2004. Е 73. В.1. С. 68−72.
- Манучарова H.A., Власенко А. Н., Менько Е. В., Звягинцев Д. Г. Специфика хитинолитического микробного комплекса в почвах, инкубируемых при различных температурах // Микробиология. 2011. Т.80. № 2. С219−229.
- Мелентьев А.И., Актуганов Г. Э., Галимзянова Н.Ф.Роль хитиназы в проявлении антигрибной активности штаммов Bacillus sp.739. // Микробиология. 2001. Т.70.№ 5.С.636−641.
- Методы почвенной микробиологии и биохимии. // М.: Изд-во МГУ. 1991. 303с.
- Мешалкина Ю.М., Самсонова В. П. Математическая статистика в почвоведении. Практикум. М.:МАКС Пресс, 2008.- 84 с.
- Моисеева В.Г., Зайко Г. М. Влияние чистоты пектинового препарата на физико-химические и комплексообразующие свойства пектина // Пищевая технология, 1976 № 3, стр.27−30.
- Панкратов Т.А., Белова С. Э., Дедыш С. Н. Оценка филогенетического разнообразия прокариотных микроорганизмов в сфагновых болотах с использованием метода FISH.// Микробиология, 2005. Т. 74, № 6, С. 831−837.
- Панкратов Т.А. Бактериальные сообщества сфагновых болот и их участие в деструкции природных полимеров. Диссер.к.б.н. ИнМи РАН, М., 2007
- Плиско Е.А., Нудьга JI.A., Данилов С. Н. Хитин и его химические превращения. //
- Успехи химии. Т .46. № 8. 1977. С. 1472−1476.
- Полянская JI.M. Микробная сукцессия в почве. Автореф. дисс. докт. Биол. Наук. М.: МГУ, 1996. 96 с.
- Терехов А.С. Экологические ниши почвенных актиномицетов. Диссертация кан. биол. наук. М.: МГУ, 2003. 182 с.
- Терехова Л.П., Галатенко О.А." Алферова И. В., Преображенская Т. П. Использование селективных сред для выделения актиномицетов // Поиск продуцентов антибиотиков среди актиномицетов редких родов. Алма-Ата. Гылым. 1990. С.5−12.
- Тихонов В.Е. Макропористый хитин и сорбенты «Chitimac» на его основе. Новые перспективы в исследовании хитина и хитозана. Москва-Щелково. 1999.С.74−75.
- Тиунова Н.А., Пиреева Д. А., Фениксова Р. В. Образование хитиназы Actinomyces kurssanovii. //Микробиология. 1976.T.XLV. С.625−629.
- Феофилова Е.П. Хитон, хитин, хитан, хитозан. // «Химия и жизнь», № 11, 1992. С.
- Хенглейн Н.Ф. Пектины // Биохимические методы анализы растений. -М.Ин.лит, 1960. с.280−323
- Шелухина Н.П., Ашубаева З.Д, Аймухамедова Г. Б. Пектиновые вещества их некоторые свойства и производные. Фрунзе: Илим, 1970- 73с.
- Шелухина Н.П. Научные основы технологии пектина. Фрунзе: Илим, 1988. -168с.
- ЗЗ.Шишов JT.JI., Тонконогов В. Д., Лебедева И. И, Герасимова М. И. Под ред.
- Добровольского Г. В. Классификация и диагностика почв России. Смоленск:1. Ойкумена. 2004. 342 с.
- Шлегель Г. Г. Общая микробиология. Москва. Изд-во Мир. 1987. 566 с.
- Andrews J. Н., and R. F. Harris. 2000. The ecology and biogeography of microorganisms on plant surfaces. Annual Rev. Phytopathol. 38:145−180
- Amann R.I., Krunholz L., Stahl D.A. Fluorescent-oligonucleotide probing of whole cells for determinative, phylogenetic, and environmental studies in microbiology. Bacteriol., 1990. V. 172. P. 762−770.
- Amann R.I., Ludwig W., Schleifer K.-H. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation // Microbiol. Rev. 1995. V. 59. P. 143−169.
- Amann R.I., Ludwig W. Ribosomal RNA-targeted nucleic acid probes for studies in microbial ecology //FEMS Microbiol. Reviews, 2000. V. 24. P. 555−565.
- Bergey D.H., John G Holt et al. Bergey’s manual of determinative bacteriology 9th Edition // Williams & Wilkins, 1994. p. 787.
- Bradford M.M. A rapid and sensitive method for quantitationof microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding // Anal. Biochem. 1976. V. 72. P. 248−254.
- Bharat Bhushan and G.S. Hoondal Isolation, purification and properties of a thermostable chitinase from an alkalophilic Bacillus sp. BG-11, 1998 //Biotechnology Letters, Vol 20, No 2, pp. 157−159
- Black Sharon A., Smit C.J.B. The grading of low ester pectin for use in dessert gels // J. Food Sci., 1972. vol. 37,5 -p.726−729
- Casida L.E. Jr. Industrial Microbiology. Enzymes as Fermentation Products 4th edition, Wiley Eastern Limited New Delhi, 1991. pp. 390−401.
- Deboer W., Gerards S., Gunnenwiek P.J.A., Modderman K. Response of the chitinolytik microbial community to chitin amendments of dune soils. // Biologi and fertility of soils. 1999. V.29. Is.2. Pp. 170−177.
- Dedysh, S. N., Panikov N. S., Liesack W., Grobkopf R., Zhou J., and Tiedje J. M. Isolation of acidophilic methane-oxidizing bacteria from northern peat wetlands // Science, 1998. V. 282. P. 281−284.
- Domsch K.H., Gams W., Traute-Heidi Anderson. «Compendium of soil fungi"// Eching: IHW-Verl. Reprint der Ausg. Von 1980. Vol. 1 (1993).
- Eltarabily-KA, Soliman-MH, Nassar-AH, Alhassani-HA. Biologycal-Control of Sclerotinia Minor Using a Chitinolytic Bacterium and Actinomycetes. // Plant Pathology. 2000. V.49. Iss 5. Pp. 573−583.
- Frankenberger, W. T. Jr. & W. A. Dick, 1983. Relationships between enzyme activities and microbial growth and activity indices in soil. //Soil Science Society of America Journal 47: p. 945−951.
- Giersher K. Pectin and pectic enzymes in fruit and vegetables technology/ // Gordian, 1981, vol.81, №№ 7−8-p.171−176
- Gooday G.W. Physiology of microbial degradation of chitin and chitosan // Biodegradation. 1990. 1: 177−190.
- Gould W.D., Bryant R.J., Trofimow J.A., Anderson R.V., Coleman D.C. Chitin decomposition in a model soil system. // Soil biology and biochemistry. 1981. V.13. Pp. 487−492.
- G6moryova E., R. Hrivnak, M. Janisova, K. Ujhazy and D. Gomory Changes of the functional diversity of soil microbial community during the colonization of abandoned grassland by a forest
- Gray TRG, Baxby P (1968) Chitin decomposition in soil. II. The ecology of chitinoclastic micro-organisms in forest soil. Trans Br Mycol Soc 51: p. 293−309
- Gummadi S.N., Kumar D.S. Microbial pectic transeliminases // Biotechnology Letters, 2005. V. 27. P. 451−458.
- Hildgund Schrempf. Recognition and degradation of chitin by streptomycetes. // Antonie van Leeuwenhoek.2001. V79. Pp. 285−289.
- Kang H., Freeman C., Park S.S., and Chun J., N-Acetylglucosaminidase Activities in Wetlands: A Global Survey // Hydrobiologia. 2005. 535: 103−110.
- Kapoor M., Kuhad R.C. Improved polygalacturonase production from Bacillus sp. Mg Cp — 2 under submerged (SMF) and solid state (SSF) fermentation.// Lett. Appl. Microbiol. 2002. 34: 317−322.
- Kertesz L.I. The pectin substances. New York: Intersciense Publishers, 1951, 628p.
- Knudsen K.E.B. Carbohydrate and lignin contents of plant materials used in animal feeding// Animal Feed Technology, 1997. v.61. p. 319−338
- Kox E. Der durh Pilze und aerobe Bacterien veranlasste Pectin und Cellulose -Abbau im Hochmoor unter besonerer Berucksichtigung des Sphagum — Abbaus // Archiv fur microbiologic. 1954. V. 20. P. 111−140.
- Lindow S.E., Brandl M.T. Microbiology of the Phillosphere. // Applied and Environmental Microbiology, 2003. Vol. 69. № 4. p. 1875−1883.
- Manucharova N. A. The Microbial Destruction of Chitin, Pectin, and Cellulose in Soils // Eurasian Soil Science. 2009. V. 42. Suppl. 13. pp.1526−1532.
- Manz W., Amann R., Ludwig W., Wagner M., Schleifer K.-H. Phylogenetic oligonucleotide probes for the major subclasses of Proteobacteria: problems and solutions// Syst. Appl. Microbiol., 1992. V. 15. P. 593−600.
- Meier H., Amann R., Ludwig W., Schleifer K.-H. Specific oligonucleotide probes for in situ detection of a major group of gram-positive bacteria with low DNA G+C content// Syst. Appl. Microbiol, 1999. V. 22. P. 186−196.
- Mitchell R, Alexander M. 1962. Microbiological processes associated with the use of chitin for biological control. Soil Sei Soc Proc 26: p. 556−558
- Neef A., Amann R., Schlesner H., Schleifer K.-H. Monitoring a widespread bacterial group: in situ detection of Planctomycetes with 16S rRNA-targeted probes // Microbiology, 1998. V. 144. P. 3257−3266.
- Raskin L., Stromley J.M., Rittmann B.E., Stahl D.A. Group-specific 16S rRNA hybridization probes to describe natural communities of methanogens // Appl. Environ. Microbiol., 1994. V. 60. P. 1232−1240.
- Raymond J. St. Leger, Lokesh Joshi, and Donald Roberts, 1998. Ambient pH Is a Major Determinant in the Expression of Cuticle-Degrading Enzymes and
- Hydrophobin by Metarhizium anisopliae II Appl Environ Microbiol, February 1998, p. 709−713, Vol. 64, No. 2
- Redford A.J., Robert M. Bowers, Rob Knight, Yan Linhart and Noah Fierer «The ecology of the phyllosphere: geographic and phylogenetic variability in the distribution of bacteria on tree leaves» // Environmental Microbiology (2010) 12(11), 2885−2893
- Roller C., Wagner M., Amann R., Ludwig W., Schleifer K.- H. In situ probing of Gram-positive bacteria with high DNA G+C content using 23 S rRNA- targeted oligonucleotides //Microbiology, 1994. V.140. P. 2849−2858
- ROUT S. K., Jayachandran S., and Prinyawiwatkul W. Enzyme Activity of Chitinase-Producing Microorganisms as Affected by pH, Temperature and Carbon Source, 2007. // http://ift.confex.com
- Seymour G.B., Knox J.P. Pectin’s and their manipulation. USA: Blackwell, 2002 -250p.
- Uffen R.L. Xylan degradation: a glimpse at microbial diversity // J. of Industr. Microb. Biochem., 1997. v. 19. p. 1−6
- Veldkamp H 1955. A study of the aerobic decomposition of chitin by microorganisms. Meded Landbouwhogesch Wageningen 55: p. 127−174
- Williamson N., Brian P.& E.M.H.Wellington. Molecular detection of bacterial and streptomycete chitinases in the enviroment// Antonie van Leeuwenhoek.2000. V78. Pp. 315−321.
- Zelentski S.N., Akopova T.A. Solid state modification of polysaccharides under conditions of plastic flow. 2001.//Polimer Degradation and Stability. V. 73. Pp. 557 560. O