Помощь в написании студенческих работ
Антистрессовый сервис

Использование топологических характеристик лазерных спекл-структур при идентификации бактерий и тканей

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Также в работе исследованы некоторые свойства спекл-структур, формирующихся при рассеянии лазерного излучения на биологических объектах, обладающих фрактальными свойствами. Исследованы особенности формирования спекл-структур, образующихся при облучении модельных фракталов: ковра Серпинского, множества Мандельброта. Изучена взаимосвязь между фрактальными свойствами дифракционной картины… Читать ещё >

Использование топологических характеристик лазерных спекл-структур при идентификации бактерий и тканей (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Содержание

  • Глава 1. СОВРЕМЕННЫЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ БИОЛОГИЧЕСКИХ ОБЪЕКТОВ, ОСНОВАННЫЕ НА ИСПОЛЬЗОВАНИИ ЛАЗЕРНЫХ СПЕКЛОВ: КРИТИЧЕСКИЙ 1 АНАЛИЗ ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Применение спекл-полей в исследованиях биологических 11 объектов
    • 1. 2. Визуализация биообъектов методом LASCA
    • 1. 3. Оптические фракталы и биофракталы
    • 1. 4. Применение моментов Цернике при идентификации 17 бактериальных колоний

При диагностике состояний живых систем используются различные методики, такие как морфометрия, когерентная и некогерентная микроскопия, микробиологические методы изучения и их комбинации. Все вышеуказанные методы имеют свои достоинства и недостатки. Из вышеперечисленных методов следует выделить методы, основанные на использовании спекл-структур для анализа характеристик рассеивающих объектов и характера их движения [1]. При облучении движущихся объектов, по динамике спеклов можно судить о характере движения исследуемого объекта и его внутренних свойствах, таких как концентрация рассеивающих частиц. Такая возможность привела к использованию спеклов при измерении скорости кровотока и исследованию топологии микрососудов головного мозга [2, 3, 4, 5].

Несмотря на перечисленные примеры использования спекл-полей на практике, следует отметить, что их статистические характеристики весьма слабо связаны с характеристиками рассеивающих объектов [6, 7, 8]. Развитые спекл-поля обычно подчиняются гауссовской статистике [6], их геометрические размеры обусловлены конфигурацией рассеяния, но в некоторых случаях это не так. В работах [9, 10], например, показано, что если флуктуация фазы, вносимая рассеивающим объектом, подчиняется К-распределению, то статистика спекл-поля также будет подчиняться К-распределению. В этом случае и случаях подобных описанному применение уже ставших классическими методов анализа статистических характеристик спекл-структур может оказаться малоинформативным и возникнет потребность в более специфических методах анализа. Это открывает перспективы в разработке методов исследования биообъектов на основе изучения характеристик квазифрактальных спекл-полей, образующихся при освещении биообъектов когерентным светом.

В связи с вышесказанным в качестве актуальных задач диссертационной работы можно сформулировать следующие:

1. компьютерное моделирование процессов формирования дифракционной картины при облучении объекта, обладающего фрактальными свойствами.

2. исследование влияния различных условий облучения (смещение центра светового пучка относительно центра изучаемого объекта, модуляция полосами, диаметр светового пучка) на фрактальную размерность, получаемой дифракционной картины;

3. Исследование принципиальной возможности идентификации и классификации бактериальных колоний различных видов бактерий и различных штаммов одного вида, на основании величин фрактальных размерностей спекл-полей, получаемых при облучении исследуемых объектов лазерным светом;

4. Исследование принципиальной возможности классификации патологических изменений в биотканях in vivo и in vitro с использованием анализа фрактальной размерности и методов t-LASCA.

На основании вышеизложенного была сформулирована цель диссертационной работы:: изучение принципиальной возможности использования при идентификации и классификации живых систем методов анализа инвариантных к повороту моментов Цернике и фрактальных размерностей спекл-полей, образующихся при освещении изучаемого объекта лазерным излучением, а также использования метода t-LASCA применительно к задачам диагностики биотканей.

В работе проведено сравнение результатов компьютерного моделирования процессов рассеяния гауссовых пучков в бактериальных колониях с экспериментальными данными.

Особое внимание уделено фрактальным свойствам биоспеклов, образующихся при рассеянии света на колониях бактерий различных штаммов, в частности вакцинного штамма чумного микроба. Показана принципиальная возможность определения колоний Yersinia pestis EV НИИЭГ, Staphylococcus aureus B6 и Escherichia coli с использованием анализа фрактальной размерности.

Также в работе исследованы некоторые свойства спекл-структур, формирующихся при рассеянии лазерного излучения на биологических объектах, обладающих фрактальными свойствами. Исследованы особенности формирования спекл-структур, образующихся при облучении модельных фракталов: ковра Серпинского, множества Мандельброта. Изучена взаимосвязь между фрактальными свойствами дифракционной картины и параметрами рассеивающей структуры (геометрические размеры модельного фрактала, глубина фрактала) в случае облучения сфокусированным световым пучком, размер которого сравним с размером облучаемого объекта. Проведены теоретическое и экспериментальное исследования зависимости величины фрактальной размерности биоспеклов как от условий освещения бактериальных колоний, так и от условий их роста.

Новизна исследований, проведенных в ходе диссертационной работы, состоит в следующем:

— впервые изучено влияние условий освещения фрактальных объектов на фрактальную размерность формирующихся при этом спекл-структур;

— исследованы фрактальные свойства спекл-структур, формирующихся в ближней и дальней зонах дифракции, а также в системах формирования изображений при освещении фрактальных объектов лазерным пучком;

— впервые исследованы фрактальные свойства спекл-полей, формирующихся при рассеянии когерентного излучения в бактериальных колониях;

— проведены исследования статистических характеристик спекл-полей, образующихся внутри кожи и прилегающих к ней жировых и мышечных тканях;

— показана принципиальная возможность разработки методов идентификации и дифференциации микроорганизмов на основе анализа фрактальных размерностей спекл-структур, формирующихся при рассеянии лазерных пучков в бактериальных колониях, выросших на пластинах агара.

Достоверность полученных теоретических результатовполученных результатов обеспечивается строгостью используемых математических моделей, использованием в компьютерном моделировании стандартного программного обеспечения, соответствием результатов численного и натурного экспериментов. Достоверность экспериментальных результатов обеспечивается применением стандартной измерительной аппаратуры, высокой степенью автоматизации процесса регистрации экспериментальных данных и применением стандартных программ для их обработки.

Практическая значимость полученных результатов:

Разработаны методы и средства для дифференциации бактериальных колоний на основе анализа фрактальных размерностей спекл-структур.

Показаны преимущества методаЬАБСА по сравнению с б-ЬАБСА с точки зрения оценки состояния, визуализации и мониторинга роста/регрессии злокачественных новообразований.

Метод иЬАБСА адаптирован к задачам визуализации злокачественных опухолей (на примере миелом). Изучены фрактальные свойства ЬАБСА-изображений, наблюдаемых при исследовании злокачественных опухолей в когерентном свете.

Разработаны методы и средства для визуализации и оценки состояния опухолей, основанные на анализе динамических спекл-полей в сочетании с определением их фрактальной размерности.

На защиту выносятся следующие положения:

1. Использование методов фрактального анализа спекл-структур, формирующихся при рассеянии лазерного излучения в бактериальных колониях, позволяет проводить дифференциацию между такими штаммами бактерий как Yersinia pestis EV НИИЭГ, Escherichia coli B6 и Staphylococcus aureus 209 P.

2. Фрактальная размерность спекл-структур, образующихся при рассеянии лазерного излучения в злокачественных опухолях (миеломах), достоверно увеличивается более чем на 75% по сравнению со случаем рассеяния в нормальных/здоровых тканях.

3. Предложены in vitro и in vivo методы предварительной диагностики миеломы, основанные на анализе топологических характеристик спекл-структур.

Личный вклад автора в работе выразился в теоретической разработке и практической реализации компьютерного моделирования процессов рассеяния когерентного излучения на объектах, обладающих фрактальными свойствамипроведении экспериментальных работ по получению дифракционных картин, формирующихся при облучении различных биологических объектов, таких как гистологические срезы тканей с доброкачественными и злокачественными опухолями, бактериальные колонии различных видов бактерийсопоставление полученных результатов с результатами компьютерного моделированияа также в участии в формулировании научных положений и выводов.

Во введении обоснована актуальность темы исследований, сформулирована цель диссертационной работы, определена новизна исследований, обсуждена практическая значимость полученных результатов, приведены основные положения, выносимые на защиту, изложено краткое содержание диссертации.

В первом разделе приведены результаты критического анализа исследований в области современных методов изучения биологических объектов (как живых систем, так и специально подготовленных тканевых материалов), рассмотрены методы морфологии, когерентная и некогерентная микроскопия, методы бактериологического анализа и методы спекл-имиджинга.

Во втором разделе приведены результаты компьютерного моделирования процессов рассеяния когерентного света на объектах, обладающих фрактальной структурой, а также проведен анализ факторов наиболее часто влияющих на величину фрактальной размерности получаемой дифракционной картины. Результаты моделирования учтены при экспериментальной работе, описанной в дальнейших главах.

В третьем разделе описаны результаты экспериментальных работ по изучению принципиальной возможности использования метода анализа фрактальной размерности при идентификации и классификации бактериальных колоний различных видов. Отмечены факторы влияющие на достоверность получаемых результатов, а также определены границы применимости метода анализа фрактальных размерностей.

В четвертом разделе приведены результаты экспериментальных работ по использованию метода анализа фрактальных размерностей, инвариантных моментов Цернике и анализа фрактальных размерностей 8-ЬА8СА изображений при идентификации и классификации патологически измененных биотканей. Определены границы применимости указанных методов.

В заключении сформулированы основные результаты и выводы, полученные в ходе выполнения диссертационной работы.

Заключение

.

В данной диссертационной работе выявлены основные закономерности формирования фрактальных спекл-структур, появляющихся при рассеянии лазерного излучения на фрактальных объектах биологического происхождения. Проведен анализ топологических характеристик спекл-полей, формирующихся в системах формирования изображения и в свободном пространсте, как в ближней, так и в дальней зонах дифракции. Установлена взаимосвязь между фрактальными свойствами спекл-структур и условиями освещения фрактальных объектов.

В данной диссертационной работе показана возможность идентификации и дифференциации микроорганизмов на основе анализа фрактальных размерностей спекл-структур, что может быть положено в основу новых экспресс-методов диагностики.

В данной диссертационной работе также разработаны фундаметальные основы методов:

— дифференциации патологических новообразований в тканях на основании анализа величин инвариантных моментов Цернике,.

— дифференциации патологических образований на основании анализа фрактальных размерностей изображений, полученных при помощи метода LASCA.

Особой актуальностью отличаются исследования, направленные на мониторинг роста злокачественных опухолей методом t-LASCA. В частности, в работе было установлено, что гипотеза о равенстве средних значений контраста ?/^СЛ-изображений, зарегистрированных в норме и в условиях патологии принимается при уровне значимости а=0.05. Это означает, что контраст LASCA-изображения интактной ткани практически не отличается от контраста ХЛЗ’СЛ-изображения ткани с миеломой. Таким образом, контраст спеклов является малоинформативной величиной и его использование в диагностике опухолей нецелесообразно.

Однако, напротив, гипотеза о равенстве средних значений фрактальной размерности? ЛбО-изображений, зарегистрированных в норме и при исследовании злокачественной опухоли отклоняется. Иными словами проверка гипотезы указывает на наличие значимых и достоверных отличий в значениях фрактальной размерности ?/45С4-изображений тканей интактных и с миеломой.

Достоверно установлено, что фрактальная размерность ?/^СЛ-изображений, зарегистрированных от миеломной опухоли, увеличивается на 75% в условиях патологии по сравнению с контролем при возможной ошибке измерений не превышающей ± 1.3%.

Показать весь текст

Список литературы

  1. М. Оптика спеклов. М.: Мир — 1980 — 171 с.
  2. В. В. Лазеры и волоконная оптика в биомедицинских исследованиях. Саратов: Изд-во Сарат. ун-та — 1998 — 384 с.
  3. Е. I., Brill G. Е., Aizu Y., Ulyanov S. S., Tuchin V. V. Speckle and Doppler methods of blood and lymph flow monitoring (In the Handbook of Optical Biomedical Diagnostics). Bellingham: SPIE Press Monograph — 2002 — 875 p.
  4. Dunn A. K., Bolay H., Moskowitz M. A., Boas D. A. Dynamic Imaging of Cerebral Blood Flow Using Laser Speckle // Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism 2001 — № 21 — p. 195
  5. Briers J. D., Webster S. Laser speckle contrast analysis (LASCA): a nonscanning, full-field technique for monitoring capillary blood flow // Journal of Biomedical Optics 1996-Vol. 1(2)-p. 174
  6. Dainty J. C. Topics in Applied Physics Berlin: Springer — 1975 — 75 p
  7. Дж., Введение в Фурье-оптику М.: Мир — 1970 — 364 с. о
  8. Дж., Статистическая оптика М.: Мир — 1988 — 536 с.
  9. O’Donnell К. A. Speckle statistics of doubly scattered light // J. Opt. Soc. Am. -1982 -№ 72-p. 1459
  10. D. К distributions from doubly scattered light // J. Opt. Soc. Am. -1985-№ 2-p. 22
  11. Tuchin V. V. Handbook of optical biomedical diagnostics. Bellingham: WA: SPIE Press-2002- 1085 p.12
  12. Tuchin V. V. Tissue optics: Light scattering methods and instruments formedical diagnosis. 2-nd edition — Bellingham: WA: SPIE Press — 2007 — 882 p115
  13. Ishii К., Asakura Т. Correlation properties of light backscattered multiply from fractal aggregates of particles under brownian motion // Journal of Biomedical Optics 1999 — Vol. 4(2) — p. 230
  14. Wada N., Uozumi J., Asakura Т., Effects of random noise on bispectra of fractal objects // Pure Appl. Opt. 1995 — Vol. 4 — p. 857 11
  15. Sini M. S., Linsely J. A. Analysis of cerebral blood flow imaging by registered laser speckle contrast analysis (rLASCA) // Proc on Signal Processing, Communication, Computing and Networking Technologies (ICSCCN) 2011 — p. 207 -212.
  16. Д. H., Тимошина П. А., Виленский М. А., Федосов И. В., Тучин В. В. Исследование параметров микроциркуляции крови в области ногтевоголожа с использованием метода лазерной спекл-визуализации // «Известия СГУ» Серия «Физика» 2012
  17. Draijer M., Hondebrink E., Ton van Leeuwen, Steenbergen W. Review of laser speckle contrast techniques for visualizing tissue perfusion // Lasers Med Sci -2006 Vol.21. N4 — p.208 — 212.9 (
  18. Miao P., Li N., Thakor N. V, Tong S. Random process estimator for laser speckle imaging of cerebral blood flow // Opt. Express 2010 — Vol. 18. N. 1 -p. 218 — 236.
  19. Zhu D., Lu W., Weng Y., Cui H., Luo Q. Monitoring thermal-induced changes in tumor blood flow and microvessels with laser speckle contrast imaging // Applied Optics 2007 — Vol. 46. N. 10 — p. 1911 — 1917.
  20. Kruijt В., de Bruijn H. S., van der Ploeg-van den Heuvel A., Sterenborg H. J., Robinson D. J. Laser speckle imaging of dynamic changes in flow during photodynamic therapy // Lasers Med Sci 2006 — Vol. 21. N.4 — p. 208 — 212.9Q
  21. Yu P., Peng L., Mustata M. Time-dependent speckle in holographic optical coherence imaging and the health of tumor tissue // Opt. Lett 2004 — Vol. 29 -p. 68 — 70.1. ТЛ
  22. Kalchenko V., Madar-Balakirski N., Kuznetsov Y., Meglinski I., Harmelin A. Functional imaging of tumor vascular network in small animal models // Novel
  23. Biophotonic Techniques and Applications, H. Sterenborg and I. Vitkin, eds. -Proceedings of SPIE-OSA Biomedical Optics. 2011 — Vol. 8090.31
  24. Mimura M., Sakaguchi H., Matsushita M. Reaction-diffusion modeling of bacterial colony patterns // Physcia A 2000 — vol. 282 — p. 283 — 303
  25. Lega J., Passot T. Hydrodynamics of bacterial colonies: A model // Phys. Rev. E -2003-vol. 67-p. 3 190 637 • •
  26. Mukundan R., Ramakrishnan K. R. Fast computation of Legendre and Zernike moments // Pattern recognition 1995 -vol. 28(9) — p. 143 339 • •
  27. Funamizu H., Uozumi J. Generation of fractal speckles by means of a spatial light modulator // Optics Express 2007 — Vol. 15(12) — p. 7415
  28. Uozumi J., Ibrahim M., Asakura T. Fractal Speckles // Opt. Commun 1998 -vol 156-p. 350 — 358
  29. Uozumi J. Fractality of the optical fields scattered by power-law-illuminated diffusers // Proc. SPIE 2001 — vol. 4607 — p. 257 — 267
  30. Cheng C. F., Liu C. X., Teng S. Y. Half-width of intensity profiles of light scattered from self-affine fractal random surfaces and simulational verifications // Phys. Rev. E 2002 — vol. 65(6) — p. 61 104
  31. Berry M. V. Diffractals. // J. Phys. A: Math. Gen. -1979 vol 12 — p. 781 — 797
  32. Jakeman E. J. Scattering by a Corrugated Random Surface with Fractal Slope // J. Phys. A: Math. Gen. 1982 — vol. 15 — p. 55
  33. Jakeman E. Fraunhofer Scattering by a Sub-Fractal Diffiiser // Opt. Acta 1983 -vol. 30-p. 1207 — 1212
  34. Jordan D. L., Hollins R. C., Jakeman E. Experimental Measurement of Non-Gaussian Scattering by a Fractal Diffuser // Appl. Phys. B 1983 — vol. 31 -p. 179- 186
  35. Mendoza-Suarez A., Mendez E.R. Light scattering by a reentrant fractal surface // Appl. Opt. 1997 — vol. 36 — p. 3521 — 3531
  36. Guerin C. A., Holschneider M., Saillard M. Electromagnetic scattering on multi-scales rough surfaces // Waves Random Media 1997 — vol. 7 — p. 331 — 349
  37. Sanchez-Gil J. A., Garcia-Ramos J. V., Mendez E. R. Influence of nanoscale cutoff in random self-affine fractal silver surfaces on the excitation of localized optical modes // Opt. Lett. 2001 — vol. 26 — p. 1286 — 1288
  38. Uozumi J., Kimura H., Asakura T. Fraunhofer diffraction by Koch fractals: the dimensionality // J. Mod. Opt. 1991 — vol. 38 — p. 1335 — 1347
  39. Uno K., Uozumi J., Asakura T. Correlation properties of speckles produced by diffractal-illuminated diffusers // Opt. Commun. 1996 — vol. 124 — p. 16−22
  40. Uozumi J. Generation and properties of laser speckle with long correlation tails // Proc. SPIE 2002 -vol. 4705 — p. 95 — 106
  41. Uozumi J. Generating random fractal fields by double-scattering process // Proc. SPIE 1999 — vol. 3904 — p. 320 — 331
  42. Hanson S. G., Jakobsen M. L., Hansen R. S., Yura T. H. Compound speckles and their statistical and dynamical properties // Proc. SPIE 2008 — vol. 7008 -p. 70080M-1
  43. Okamoto T., Fujita S. Statistical properties of three-dimensional speckle distributions produced by crossed scattered waves // J. of the Opt. Soc. of America A 2008 — vol. 25(12) — p. 3030 — 3042
  44. Khlebtsov N. G. An approximate method for calculating scattering and absorption of light by fractal aggregates // Optics and Spectroscopy 2000 -vol. 88(4)-p. 594−601
  45. Schmitt J. M., Kumar G. Optical scattering properties of soft tissue: A discrete particle model // Applied Optics 1998 — vol. 37(13) — p. 2788 — 27 971. C Q
  46. Wang R. K. Modelling optical properties of soft tissue by fractal distribution of scatters // J. Mod. Opt. -2000 vol. 47 — p. 103 — 120
  47. Zimnyakov D. A., Tuchin V. V. Fractality of speckle intensity fluctuations // Appl. Opt. 1996 — vol. 35 — p. 4325 — 4333
  48. Tuchin V. V. Controlling of tissue optical properties // J. Biomed. Opt. 1999 -vol. 4-p. 106- 124
  49. Zimnyakov D. A. Binary fractal image quantification using probe coherent beam scanning// Opt. Eng. 1997-vol 36(5)-p. 1443 — 1451
  50. O’Holleran K., Dennis M. R., Flossmann F, Padgett M. J. Fractality of light’s darkness // Phys.Rev. Lett. 2008 — vol. 100 — p. 53 902−163 *
  51. Angel sky O. V., Ushenko A. G., Burkovets D. N., Pishak O. V., Ushenko Yu. A., Pishak V. P. Laser polarization visualization and selection of biofractal images // Proc SPIE 2003 — vol. 4829 — p. 188
  52. Ushenko Yu. A., Kuritscin A. N. Laser polarimetry of biofractal structure // Proc. SPIE 2001 — vol. 4242 — p. 233
  53. Einstein A. J., Wu H. S., Gil J. Self-affinity and lacunarity of chromatin texture in benign and malignant breast epithelial cell nuclei // Phys. Rev. Lett. 1998 -vol. 80-p. 397−400
  54. Bauer W. Physics and Astronomy and National Superconducting Cyclotron Laboratory // Heavy Ion Physics 2001 — vol. 14 — p.39o
  55. Pyhtila J. W., Ma H., Simnick A. J, Chilkoti A., Wax A. Analysis of long range correlations due to coherent light scattering from in-vitro cell arrays using angle-resolved low coherence interferometry. // J. Biomed. Opt. 2006 — vol. 11p. 3 402 270 •
  56. Sboner A., Bauer P., Zumiani G., Eccher C., Blanzieri E., Forti S., Cristofolini M. Clinical validation of an automated system for supporting the early diagnosis of melanoma // Skin Research and Technology 2004 — vol. 10 — p. 184 — 19 271 • •
  57. Kelloff G. J., Sullivan D. C., Baker H. Workshop on imaging science development for cancer prevention and preemption // Cancer Biomarkers 2007 -vol. 3 — p. 1
  58. Zhifand L., Hui L., Qiu Y., Fractal analysis of laser speckle for measuring roughness // Proc. SPIE 2006 — vol. 6027 — p. 470 — 476
  59. Pothuaud L., Lespessailles E., Harba R, Jennane R., Roy ant V., Eynard E. Benhamou C. L. Fractal analysis of trabecular bone texture on radiographs: discriminant value in postmenopausal osteoporosis // Osteoporos. Int. 1998 -vol. 8-p. 618
  60. Ha T. H., Yoon U, Lee K. J., Shin Y. W., Lee J. M., Kim I. Y., Ha K. S., Kim S. I., Kwon J. S. Fractal dimension of cerebral cortical surface in schizophrenia and obsessive-compulsive disorder // Neurosci. Lett. 2005 — col. 384-p. 172−17 678
  61. Bauer W., Mackenzie C. D. Cancer Detection via Determination of Fractal Cell Dimension // Heavy Ion Physics 2001 — vol. 14 — p. 39 — 46
  62. Eke A., Herman P., Kocsis L., Kozak L. R. Fractal characterization of complexity in temporal physiological signals // Physiological measurement 2002 -Vol. 23-p. R1
  63. Wyatt P. J. Identification of Bacteria by Differential Light Scattering, // Nature -1969-vol. 221 p. 1257 — 1258
  64. Stull V. R. Size distribution of bacterial cells // J. Bacteriology 1972 -vol. 109(3)-p. 1301 — 1303
  65. Salzman G. C., Griffith J. K., Gregg C. T. Rapid identification of microorganisms by circular-intensity differential scattering // Appl. Env. Microbiology- 1982-vol. 44(5)-p. 1081 1085
  66. Bronk B. V., Van de Merwe W., Huffman D. R. Light scattering as a means for detecting subtle changes in microbial populations. // Modem Techniques for Rapid Microbiological Analysis. W. Nelson, editor NY: VCH Publishers — 1992
  67. Devarakonda V., Manickavasagam S. Polarized light scattering technique for morphological characterization of waterborne pathogens // Proc. SPIE 2009 -vol. 7306-p. 73061B-1
  68. Yeo C. B. A., Watson I. A., Wong J. W. M. Optical Imaging and Analysis of Speckle Patterns from Escherichia Coli in Disinfectant Solution // Conference on Lasers and Electro-Optics. -Europe-Technical-Digest Piscataway: IEEE — 1998 -p. 13
  69. Murialdo S E, Sendra G H, Passoni L I, Arizaga R, Gonzalez J F, Rabal H., Trivi M. Analysis of bacterial chemotactic response using dynamic laser speckle // J. Biomed. Opt. 2009 — vol. 14 — p. 64 015
  70. Krishnan A., Watson I., Parton R., Peden I. Laser speckle analysis of E. coli growth and motility in liquid culture // Food Processing Faraday, New Technologies for the Food Industry Pera Innovation Park: Melton Mowbray -2004
  71. Bae E., Bai N., Aroonnual A., Bhunia A. K., Robinson J. P., irleman E. D. Modelling light propagation through bacterial colonies and its correlation with forward scattering patterns // J. Biomed. Opt. 2010 — vol. 15(4) — p.45 001−1
  72. Bae E., Banada P. P., Huff K., Bhunia A. K., Robinson J. P., Hirleman E. D. Analysis of time-resolved scattering from macroscale bacterial colonies // J. Biomed. Opt. 2008 — vol. 13(1) — p. 14 010−1
  73. Bayraktar B., Banada P. P., Hirleman E. D., Bhunia A. K., Robinson J. P., Rajwa B. Feature extraction from light-scatter pattern of Listeria colonies for identification and classification // J. Biomed. Opt. 2006 — vol.11(3) — p.34 006−1
  74. Stramski D., Sedlak M., Tsai D., Amis E. J., Kiefer D. A. Dynamic light scatteringby cultures of heterotrophic marine bacteria // Proc. SPIE 1992 -vol. 1750-p. 73 — 85
  75. Katz A., Alimova A., Xu M., Savage H. E., Shah M., Rosen R. B., Alfano R. R. In situ Identification of bacteria by light scattering // Proc. SPIE 2003 — vol. 4965 -p. 73−76
  76. Kotsyumbas I. Ya., Kushnir I. M., Bilyy R. O., Yarynovska I. H., Getman V. B., Bilyy A. I. Light scattering application for bacterial cell monitoring during cultivation process // Proc. SPIE-OSA Biomed. Opt., SPIE 2007 — vol. 6631 -663 111−1
  77. Liao S. X., Pawlak M. On the Accuracy of Zernike Moments for Image Analysis // IEEE Transactions on pattern analysis and machine intelligence 1998 -Vol. 20(12)-p. 1358
  78. Khotanzad A., Hong Y. H. Invariant image recognition by Zernike moments // IEEE Transactions on pattern analysis and machine intelligence 1990 -Vol. 12(5)-p. 489
  79. Yap P. T., Raveendran P. Image focus measure based on Chebyshev moments // IEE Proc.-Vis. Image Signal Process. 2004 — vol. 151(2) — p. 128
  80. Ulyanov A. S. Analisys of fractal dimensions in the express diagnostics of bacterial colonies // Optics and Spectroscopy 2009 — vol. 107(6) — p. 866
  81. Ulyanov S., Laskavy V., Golova A., Polyanina Т., Ulianova O., Feodorova V., Ulyanov A. Application of t-LASCA and speckle-averaging techniques for diagnostics of malignant tumors on animal models // Proc SPIE 2012
  82. А. В., Короновский А. А., Минюхин И. M., Яшков И. А. Определение фрактальной размерности овражно-балочной сети города Саратова // Нелинейная динамика в действии 2006 — Т. 14(2) — с. 64
  83. Wu S. С., Chen М. F., Fung А. К. Non-gaussian surface generation // IEEE Transactions on Geoscience and remote sensing 1988 — vol. 26(6) — p. 885−888
  84. Tishkin S. M., Laskavyj V. N. Cytostatic composition. European Patent EP20090814148- US Patent US 2009/203 800 Al.
  85. Miao P., Lu H., Liu Q., Li Y., Tong S. Laser speckle contrast imaging of cerebral blood flow in freely moving animals // J Biomed Opt. 2011.Vol. 16. N. 8. P.86 0111(ъ. Бендат Дж., Пирсол А. Прикладной анализ случайных данных. М.: Мир — 1989−540 с.
  86. Ш6. Miao P., Rege A., Li N., Thakor N., Tong S. High Resolution Cerebral Blood Flow Imaging by Registered Laser Speckle Contrast Analysis // IEEE Trans Biomed Eng. 2010. Vol. 57. N.5. P. l 152−1157.
Заполнить форму текущей работой