Изучение физиологических свойств бактерии Rhodococcus erythropolis штамм Ас-858 Т для оптимизации условий получения углеводородразрушающего биопрепарата
Диссертация
Целью настоящей работы явилось исследование физиологических свойств штамма Rhodococcus eiythropolis Ас-858 Т и возможности его использования в качестве биопрепарата для деградации углеводородных загрязнений. Для достижения поставленной цели необходимо было решить следующие задачи: 1. Изучить изменение липидного состава клеток R. erythropolis в процессе роста на средах разного состава- 2… Читать ещё >
Список литературы
- Андреева И.С. Психротолерантные штаммы-нефтедеструкторы для биоремедиации почв и водной среды / И. С. Андреева, Е. К. Емельянова, С. Н. Загребельный, С. Е. Олькин, И. К. Резникова, В. Е. Репин // Биотехнология. -2006. -№ 1.~ С. 43−52.
- Андреева И.С. Утилизация углеводородов психротолерантными штаммами- деструкторами / И. С. Андреева, Е. К. Емельянова, С. Е. Олькин, И. К. Резникова, С. Н. Загребельный, В. Е. Репин // Прикладная биохимия и микробиология. 2007. — Т. 43, № 2. — С. 223−228.
- Арзуманян В.Г. Степень галофильности Rhodococcus erythropolis и Halobacterium salinarum определяется парциальным давлением кислорода / В. Г. Арзуманян, H.A. Воронина, В. К. Плакунов, С. С. Беляев // Микробиология. 2000. — Т. 69, № 2. — С. 290−292.
- Аристархова В.И. Нокардиоподобные микроорганизмы / В. И. Аристархова. М.: Наука, 1989. — 248 с.
- Аушева Х.А. Разработка новой формы биопрепарата для очистки водных объектов от тонких нефтяных пленок. Автореф.дис.канд. тех. наук / Х. А. Аушева. Москва: РХТУ, 2007. — 20 с.
- Бабошин М.А. Кометаболизм флуорена культурами Rhodococcus rhodochrous и Pseudomonas fluorescens / М. А. Бабошин, З. И. Финкельштейн, Л. А. Головлева // Микробиология. 2003. — Т. 72, № 2. — С. 194−198.
- Белоусова Н.И. Деструкция нефтепродуктов различной степени конденсации микроорганизмами при пониженных температурах / Н. И. Белоусова, А. Н. Шкидченко // Прикладная биохимия и микробиология. -2004. Т.40, № 3. — С. 312 — 316.
- Беляев С.С. Взаимосвязь кинетики роста и дыхания у родококков в присутствии высоких концентраций солей / С. С. Беляев // Микробиология. -1999.-Т. 68, № 1. С. 40−44.
- Бергельсон Л.Д. Препаративная биохимия липидов / Л. Д. Бергельсон, Э. В. Дятловицкая, Ю. Г. Молотковский. М.: Наука, 1981. — 256с.
- Бердичевская M.B. Особенности физиологии родококков, разрабатываемых нефтяных залежей / М. В. Бердичевская // Микробиология.-1989 Т.58, № 1. — С. 60−65.
- Болдырев A.A. Биомембранология / A.A. Болдырев, Е. И. Кяйвяряйнен, В. А. Илюхина. Петрозаводск: Изд-во Кар НЦ РАН, 2006. -226 с.
- Вельков В.В. Биоремедиация: принципы, проблемы, подходы / В. В. Бельков // Биотехнология, — 1995.- № 3.- С. 20−27.
- Волде М.И. Сапротрофные бактерии в почвах, загрязненных нефтью / М. И. Волде // Межд. конф. студ. и аспирантов по фундам. наукам «Ломоносов-1996», Москва, 1996 г.: Тез. докл. Почвоведение.- М., 1996. -С.14.
- Волченко H.H. Гидрофобность клеток как критерий отбора бактерий, продуцентов биосурфактантов / H.H. Волченко, С. Г. Карасёв, Д. В. Нимченко, Э. В. Карасёва // Микробиология. — 2007. — Т. 76, № 1. — С. 126−128.
- Геннис Р. Биомембраны. Молекулярная структура и функции / Р. Геннис: Пер. с англ. М.: Мир, 1997. — 624 с.
- Глазачева JLE. Клеточные приспособления Rhodococcus rhodochrous и Rhodococcus ruber, усваивающих пропан и «-бутан / JT.E. Глазачева, И. Б. Ившина, A.A. Оборин // Микробиология. -1990 Т. 59, № 2. -С. 301−306.
- Градова Н.Б. Использование бактерий рода Azotobacter при биоремедиации нефтезагрязненных почв / Н. Б. Градова, И. Б. Горнлва, Р. Эддауди, Р. Н. Салина // Прикладная биохимия и микробиология. 2003. — Т. 39, № 3.-С. 318−321.
- Гузев B.C. Влияние масляной кислоты на физиологическую активность углеводородокисляющих родококков / B.C. Гузев, М. И. Волде, И. С. Куличевская, JI.B. Лысак // Микробиология. — 2001. Т. 70, № 3. — С. 313−320.
- Гузев B.C. Регуляторное действие глюкозы на активность углеводородокисляющих микроорганизмов в почве / B.C. Гузев, Э. М. Халимов, М. И. Волде, И. С. Куличевская // Микробиология. 1997. — Т. 66, № 2. —С. 154−159.
- Гусев M.B. Микробиология / M.B. Гусев, JI.А. Минеева. М.: Мир, 1987.- 118с.
- Донова М.В. Трансформация стероидных соединений актинобактериями (обзор) / М. В. Донова // Прикладная биохимия и микробиология. 2007. — Т. 43, № 1. — С. 5−18.
- Егоров Н.С. Сравнение липидного состава R-, S- и М-вариантов Rhodococcas rubropertinctus / Н. С. Егоров, Т. В. Коронелли, Е. С. Милько, P.A. Степанова, Б. В. Розынов, М. Г. Плетенко // Микробиология. — 1986. Т. 55, Вып. 2. — С. 227−230.
- Еловикова Е.А. Иммунофлуоресцентный анализ в экологических исследованиях бактерий рода Rhodococcus / Е. А. Еловикова // IV Молод. Науч. конф. Ин-та биол. «Актуальные проблемы биологии», Сыктывкар, 1112 апр., 1996: Прогр. и тез.- Сыктывкар, 1996. С. 44.
- Жегневская JI.B. Изучение биодеградации углеводородов нефти / Л. В. Жегневская, В. Б. Барахнина // Матер. 47 научн.-техн. конф. студ., аспирантов и мол. ученых Уфим. гос. нефт. техн. ун-та, Уфа, 1996 г. Т.1.-Уфа, 1996.-С. 124.
- Жуков Д.В. Изучение биодеградации углеводородов нефти штаммами рода Rhodococcus / Д. В. Жуков, В. П. Мурыгина, C.B. Калюжный //
- Конф. «Проблемы биодеструкции техногенных загрязнителей окружающей среды», 14−16 сентября 2005 г.: Тез. докл.- Саратов, 2005. С.22−23.
- Звягинцева И.С. Влияние солености среды на деструкцию нефтяных масел нокардиоподобными бактериями / И. С. Звягинцева, М. Н. Поглазов, М. Т. Готоева, С. С. Беляев // Микробиология. -2001. -Т.70, № 6. С. 657−666.
- Ившина И.Б. Биология бактерий рода Rhodococcus, усваивающих пропан и н-бутан: Автореф.дис.канд. биол. наук / И. Б. Ившина. -Киев, 1982.-21 с.
- Ившина И.Б. Биосинтез свободных аминокислот родококками / И. Б. Ившина, Г. И. Безматерных / Биосинтез вторичных метаболитов: Тезисы докл. Всесоюзн. конф. Пущино, 1987. С. 33−34.
- Ившина И.Б. Пропанокисляющие родококки / И. Б. Ившина, P.A. Пшеничнов, A.A. Оборин. Свердловск: УНЦ АН СССР, 1987. -125 с.
- Ившина И.Б. Фенотипическая характеристика алканотрофных родококков из различных экосистем / И. Б. Ившина, М. В. Бердичевская, JI.B. Зверева // Микробиология. 1995.- Т.64, № 4. С.507−513.
- Ившина И.Б. Новые экологически безопасные биосурфактанты родококков / И. Б. Ившина, Д. Филп, М. С. Куюкина и др. / Матер. Междун. конф., посвящ. памяти акад. A.A. Баева. 20−22 мая 1996. -М., 1996. С. 161
- Ившина И.Б. Эффективное извлечение цезия клетками бактерий рода Rhodococcus / И. Б. Ившина, Т. А. Пешкур, В. П. Коробов // Микробиология. -2002. Т. 71, № 3. — С. 418−423.
- Ившина И.Б. Биотрансформация ß--ситостирола и его сложных эфиров актинобактериями рода Rhodococcus / И. Б. Ившина, В. В. Гришко, Е. М. Ноговицина, Т. П. Кукина, Г. А. Толстиков // Прикладная биохимия и микробиология. 2005. — Т.41, № 6. — С. 626 — 633.
- Квасников Е.И. Микроорганизмы деструкторы нефти в водных бассейнах / Е. И. Квасников, Т. М. Клюшникова. — Киев: Наук, думка, 1981. —131 с.
- Кейтс М. Техника липидологии. Выделение, анализ и идентификация липидов / М. Кейтс. М.:Мир, 1975. — 322 с.
- Кирхнер Ю. Тонкослойная хроматография: в 2 т. Т.2. / Ю. Кирхнер. -М.: Мир, 1981.-523 с.
- Козлов C.B. Биологическая характеристика бактериальных штаммов активных продуцентов нитрилгилролизующих ферментов. Автореф.дис.канд. биол. наук / C.B. Козлов. — Пермь: Институт экологии и генетики микроорганизмов, 2007. — 24 с.
- Коломыцева М.П. Гетерогенность Rhodococcus opacus 1СР как ответ на стрессовое воздействие хлорфенолов / М. П. Коломыцева, И. П. Соляникова, E.JI. Головлев, JI.A. Головлева // Прикладная биохимия и микробиология. 2005. — Т.41, № 5, — С. 541−546.
- Комарова Т.И. Роль низкомолекулярных азотистых соединений в осмотолерантности бактерий родов Rhodococcus и Arthrobacter / Т. И. Комарова, Т. В. Коронелли, Е. А. Тимохина // Микробиология. 2002. — Т. 71, № 2.-С. 166−170.
- Комов В.П. Биохимия / В. П. Комов, В. Н. Шведова. М.: Дрофа, 2004.-638 с.
- Коронелли Т.В. Проникновение углеводородов в клетки микроорганизмов / Т. В. Коронелли // Успехи микробиологии. 1980. — № 1ё5. -С. 99−111.
- Коронелли Т.В. Видовая структура углеводородокисляющих бактериоцинозов водных экосистем разных климатических зон / Т. В. Коронелли, С. Г. Дермичева, В. В. Ильинский, Т. И. Комарова, О. В. Поршнева // Микробиология. 1984. — Т. 63, Вып. 5. — С. 917−923.
- Коронелли Т.В. Липиды микобактерий и родственных микроорганизмов / Т. В. Коронелли. -М.: Изд-во Моск. ун-та, 1984. 160 с.
- Коронелли T.B. Определение активности углеводородокисляющих бактерий с использованием н-алканов, меченых тритием / Т. В. Коронелли, С. Г. Дермичева, М. И. Семененко // Прикл. биохим. и микробиология. 1988. -Т.24, № 2. — С. 203−207.
- Коронелли Т.В. Распространение миколатов трегалозы в родококках / Т. В. Коронелли, Т. И. Комарова, М. Н. Алексеева // Микробиология. 1988. — Т. 57, Вып. 5. — С. 886−781.
- Коронелли Т.В. Образование миколатов трегалозы родококками в зависимости от возраста клеток и источника углерода / Т. В. Коронелли, Т. И. Комарова, С. Г. Батраков // Микробиология. 1990. — Т. 59, Вып. 5. — С. 777 781.
- Коронелли Т.В. Полярные липиды углеводородокисляющих бактерий / Т. В. Коронелли, Т. И. Комарова, С. Г. Юферова, В. В. Ильинский, О. Б. Чивкунова, Б. В. Розынов // Микробиология. 1993. — Т. 62, Вып. 2. — С. 231−237.
- Коронелли Т.В. Экофизиологические основы и практический опыт интродукции углеводородокисляющих бактерий в природные экосистемы / Т. В. Коронелли // Конф. «Интродукция микроорганизмов в окружающую среду», 17−19 мая 1994 г.: Тез. докл.-М., 1994.- С. 53.
- Коронелли Т.В. Принципы и методы итенсификации биологического разрушения углеводородов в окружающей среде / Т. В. Коронелли // Прикл. биохим. и микробиология.-1996.-Т.32, № 6. С.579−585.
- Коронелли Т.В. Интродукция бактерий рода Rhodococcus в тундровую почву, загрязненную нефтью / Т. В. Коронелли, Т. И. Комарова, В. В. Ильинский, Ю. И. Кузьмин, Н. Б. Киреанов, A.C. Яненко // Прикл. биохим. и микробиология.- 1997.- Т. ЗЗ, № 2. — С. 198−201.
- Крутецкая З.И. Механизмы внутриклеточной сигнализации / З. И. Крутецкая, O.E. Лебедев, JLC. Курилова. СПб.: Изд-во С. Петерб. Ун-та, 2003. — 208 с.
- Куликова A.K. Эпоксидирование газообразных алкенов культурой Rhodococcus erythropolis 3/89 / A.K. Куликова, A.A. Беззубов, A.M. Безбородов // Прикладная биохимия и микробиология. 1993. — Т.29, № 4. — С. 512−515.
- Куликова А.К. Выделение и характеристика пропанассимилирующих бактерий / А. К. Куликова, Е. В. Летунова, A.M. Безбородов // Прикладная биохимия и микробиология. — 1993. — Т.29, № 3. — С. 431 -436.
- Куликова А.К. Окисление органических соединений пропанмонооксигеиазой Rhodococcus erythropolis 3/89 / А. К. Куликова, A.M. Безбородов II Прикладная биохимия и микробиология. 2000. — Т.36, № 3. — С. 267−271.
- Куликова А.К. Ассимиляция пропана и свойства пропанооксигеназы Rhodococcus eiythropolis 3/89 / А. К. Куликова, A.M. Безбородов II Прикладная биохимия и микробиология. 2001. — Т.37, № 2. — С. 186- 189.
- Куюкина М.С. Влияние состава клеточных липидов на формирование неспецифической антибиотикорезистентности алканотрофных родококков / М. С. Куюкина, И. Б. Ившина, М. И. Рычкова, О. Б. Чумаков // Микробиология 2000. — Т.69, № 1. — С.62−69.
- Куюкина М.С. Биосурфактанты актинобактерий рода Rhodococcus: индуцированный биосинтез, свойства, применение. Автореф.дис.докт. биол. наук / М. С. Куюкина. Пермь: Институт экологии и генетики микроорганизмов, 2006. — 23 с.
- Лысак Л. В. Экзогликаны почвенных бактерий родов Arthrobacter и Rhodococcus / Л. В. Лысак, С. Е. Горин, Т. Ф. Вустина // Микробиология. -1992. Т.61, № 4. — С. 622 — 627.
- Максимов А.Ю. Влияние нитрилов и амидов на рост и нитрилгидратазную активность штамма Rhodococccns sp. gt 1 / А. Ю. Максимов, M.B. Кузнецова, Г. В. Овечкина, C.B. Козлов, Ю. Г. Максимова,
- B.А. Демаков // Прикладная биохимия и микробиология. 2003. — Т.39, № 1. —1. C. 63 68.
- Марченко Н.Д. Исследование плазмидного состава штаммов Rhodococcus opacus / Н. Д. Марченко //Рукопись ВИНИТИ. -1990. № 642, вып. 90.- 4с.
- Милехина Е.И. Углеводородокисляющая микрофлора заводняемых нефтяных месторождений Татарии с различной минерализацией пластовых вод / Е. И. Милехина, И. А. Борзенков, Ю. М. Миллер, М. В. Иванов // Микробиология. -1991.- Т. 60, № 1 С. 747−755.
- Милько Е.С. Гетерогенность популяции бактерий и процесс дисоциации / Е. С. Милько, Н. С. Егоров. М.: Наука, 1991. — 326 с.
- Милько Е.С. Гидрофильно-гидрофобные и адгезивные свойства диссоциантов Rhodococcus rubropertinctus / Е. С. Милько, Егоров Н. С. // Микробиология. 1994. — Т. 63, вып. 2. — С. 382−384.
- Назина М.В. Образование нефтевытесняющих соединений микроорганизмами из нефтяного месторождения Дацин (КНР) / М. В. Назина,
- Д.Ш. Соколова, Я. Ф. Сюэ, С. С. Беляев, М. В. Иванов // Микробиология. -2003. Т.72, № 2. — С. 206 — 211.
- Нестеренко O.A. Жирнокислотный состав некоторых корине- и нокардиоподобных бактерий /O.A. Нестеренко, J1. B, Андреев, Т. М. Ногина и др. // Микробиол. журн. -1980.- Т.42, № 3.-С.288−293.
- Нестеренко O.A. Нокардиоподобные и коринеподобные бактерии / O.A. Нестеренко, Е. И. Квасников, Т. М. Ногина. Киев: Наук, думка, 1985. -336 с.
- Новицкая Г. В. Методическое руководство по тонкослойной хроматографии фосфолипидов / Г. В. Новицкая. М.: Наука, 1972. — 64 с.
- Определитель бактерий Берджи: В 2-х т. Т.2 / Под ред. Д. Хоулта, Н. Крига, П. Смита, Д. Стейли, С. Уильямса М.: Мир, 1997. — 368 с.
- Перт С.Дж. Основы культивирования микроорганизмов и клеток / С.Дж. Перт. М.: Мир, 1978. — 332с.
- Пешкур Т. А. Аккумуляция цезия актинобактериями рода Rhodococcus: Автореф. дис. .канд. биол. наук. / Т. А. Пешкур. Пермь, 2002. -22 с.
- Пирог Т.П. Использование иммобилизованных на керамзите клеток нефтеокисляющих микроорганизмов для очистки воды от нефти / Т. П. Пирог, Т. А. Шевчук, И. Н. Волошина, H.H. Грегирчак // Прикладная биохимия и микробиология. 2005. — Т.41, № 1. — С. 58 — 63.
- Пирог Т.П. Синтез поверхностно-активных веществ при росте штамма Rhodococcus erythropolis ЕК-1 на среде с гексадеканом / Т. П. Пирог, И. Н. Волошина, C.B. Игнатенко, Р.И. Вильданова-Марцишин // Биотехнология. 2005. — № 6. — С. 27−36.
- Плешакова E.B. Приемы стимуляции аборигенной нефтеокисляющей микрофлоры / Е. В. Плешакова, Е. В. Дубровская, О. В. Турковская // Биотехнология. 2005. — № 1. — С.42−50.
- Плешакова Е.В. Получение нефтеокисляющего биопрепарата путем стимуляции аборигенной углеводородокисляющей микрофлоры / Е. В. Плешакова, Н. Н. Позднякова, О. В. Турковская // Прикладная биохимия и микробиология. 2005. — Т. 41, № 6. — С. 634 — 639.
- Пырченкова И.А. Выбор и характеристика активных психротропных микроорганизмов деструкторов нефти / И. А. Пырченкова, А. Б. Гафаров, И. Ф. Пунтус, А. Е. Филонов, A.M. Воронин // Прикладная биохимия и микробиология. — 2006. — Т.42, № 3, — С. 298 — 305.
- Рогачёва С.М. Респираторная активность микробных клеток Rhodococcus rhodochrous М8, продуцирующих нитрилгидролизующие ферменты / С. М. Рогачёва, О. В. Игнатов // Прикладная биохимия и микробиология. 2004. — Т.37, № 3, — С. 326 — 331.
- Рубан Е.Л. Микробные липиды и липазы / Е. Л. Рубан. — М.: Наука, 1977.-218 с.
- Рубашко Г. Е. Оптимизация процесса деградации флуорена штаммом Rhodococcus rhodochrous 111 ! Г.Е. Рубашко, М.П. коломыцева, Л. А. Головлёва // Прикладная биохимия и микробиология. 2006. — т.42, № 4. С. 448−451.
- Сассон А. Биотехнология: свершения и надежды / А. Сассон М.: Мир, 1987.-411 с.
- Сваровская Л.И. Активность почвенной микрофлоры в условиях нефтяных загрязнений / Л. И. Сваровская, Л. К. Алтунина // Биотехнология. — 2004.-№ 3.-С. 63−69.
- Сидоров Д.Г. Микробиологическая деструкция мазута в почве при использовании биопрепарата Деворойл / Д. Г. Сидоров, И. А. Борзенков, Е. И. Милехина, С. С. Беляев, М. В. Иванов // Прикл. биохим. и микробиология. -1998. -Т.34, № 3. С. 281−286.
- Синолицкий М.К. Выделение нитрилгидратазы из клеток Rhodococcus rhodochrous М8 и опредиление N-концевой аминокислотной последовательности субъединиц / М. К. Синолицкий, C.B. Полтавская, С.М.
- Рогачева, И.В. Севрюгина, С.П. Воронин // Прикладная биохимия и микробиология. 1997. — Т. ЗЗ, № 4. — С. 383 — 387.
- Современная микробиология. Прокариоты / Ред. И. Лингелер, Г. Древе, Г. Шлегель. М.: Мир, 2005. Т.2. 493с.
- Тарасов А.Л. Использование Н2О2 в качестве источника кислорода бактериями родов Pseudomonas и Rhodococciis / А. Л. Тарасов, И. А. Борзенков, Е. И. Милехина, И. С. Мысякина, С. С. Беляев // Микробиология. -2004. Т. 73, № 4. -С. 465−471.
- Хабибуллина Ф. М, Исследование способности нефтеокисляющих бактерий утилизировать углеводороды нефти / Ф. М. Хабибуллина, A.A. Шубаков, И. Б. Арчегова, Г. Г. Романов // Биотехнология. 2002. — № 6. — С. 57−62.
- Черепица C.B. Определение инспектируемых параметров дизельных топлив / C.B. Черепица, С. М. Бычков, А. Н. Коваленко, А. Л. Мазаник, Н. М. Макоед, H.H. Гремяко, Д. Е. Кузменков, Я. Л. Лучнина // Химия и технология топлив и масел. 2003. — № 6. — С. 45−48.
- Шкидченко А.Н. Биодеградация углеводородов нефти в открытых системах / А. Н. Шкидченко, Е. С. Иванова // Конф. «Проблемы биодеструкции техногенных загрязнителей окружающей среды», 14−16 сентября 2005 г.: Тез. докл.- Саратов, 2005. С.57−58.
- Шульга А. Н. Внеклеточные липиды и поверхностно-активные свойства бактерии Rhodococcus eiythropolis в зависимости от источника углеродного питания / А. Н. Шульга, Е. В. Карпенко, С. А. Елисеев // Микробиология. 1990. — Т. 59, Вып. 3. — С. 443−447.
- Ягафарова Г. Г. Испытания биопрепарата «Родотрин» для ликвидации нефтяных загрязнений / Г. Г. Ягафарова, Э. М. Гатауллина // Баш. хим. ж. 1995. Т.2, № 3−4. С. 69−70.
- Ягафарова Г. Г. Новый нефеокисляющий штамм бактерий Rhodococcus erythropolis / Г. Г. Ягафарова, И. Н. Скворцова // Прикл. биохим. и микробиология. 1996. -Т.32, № 2. — С. 224−227.
- Allen C.C.R. Metabolism of naphthalene, 1-naphthol, indene, and indole by Rhodococcus sp. strain NCIMB 12 038 / C.C.R. Allen, D.R. Boyd, M.J. Larkin, K.A. Reid, N.D. Sharma, K. Wilson // Appl. Environ. Microbiol. 1997. — Vol. 63. — P. 151−155.
- Alvarez H. M. Formation of intracytoplasmic lipid inclusions by Rhodococcus opacus strain PD630 / H.M. Alvarez, F. Mayer, D. Fabritius, A. Steinbuchel // Arch. Microbiol.-1996. Vol .165. — P.377−386.
- Alvarez H.M. Accumulation of storage lipids in species of Rhodococcus and Nocardia and effect of inhibitors and polyethylene glycol / H.M. Alvarez, R. Kalscheuer, A. Steinbuchel // Fett Lipid.- 1997.- Vol. 99. P. 239−246.
- Alvarez H.M. Accumulation and mobilization of storage lipids by Rhodococcus opacus PD630 and Rhodococcus ruber NCIMB 40 126 / H.M. Alvarez, R. Kalscheuer, A. Steinbuchel // Appl. Microbiol. Biotechnol.- 2000. -Vol.54.-P. 218−223.
- Alvarez H.M. Biosynthesis of fatty acids and triacylglycerols by 2,6,10,14-tetramethyl pentadecane-grown cells of Nocardia globerula 432 / H.M. Alvarez, M. F. Souto, A. Viale, 0. H. Pucci // FEMS Microbiol. Lett.- 2001. -Vol. 200.-P. 195−200.
- Alvarez H.M. Triacylglycerols in prokaryotic microorganisms / H.M. Alvarez, A. Steinbuchel // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. -Vol. 60. -P.367−376.
- Angelova B. Hydroxylation of androstenedione by resting Rhodococcus •sp. cells in organic media / B. Angelova, S. Mutafov, T. Avramova, I. Dimova, L. Boyadjieva// Process Biochem. 1996. — Vol. 31, № 2. — P. 179−184.
- Bell K. S. The genus Rhodococcus/ K. S. Bell, J. C. Philip, D. W. J. Aw, N. Christofi // J. Appl. Microbiol.-1998. -Vol. 85.-P.195−210.
- Berridge M.J. Calcium a life and death signal / M.J. Berridge, M.D. Bootman, P. Lipp // Nature. — 1998. — Vol. 395. — P.645−648.
- Bligh E. Rapid method of total lipid extraction and purification / E. Bligh, W. Duer // Can. J. Biochim. Physical. 1959. — V.37. — P. 911- 917.
- Bock C. Degradation and bioconversion of aliphatic and aromatic hydrocarbons by Rhodococcus ruber 219 / C. Bock, R.M. Kroppenstedt, H. Diekmann//Appl. Microbiol. Biotechnol. 1996. — Vol. 45. — P. 408−410.
- Bortolini O. Biotransformatuon on steroid nucleus of bile-acid / O. Bortolini, A. Medici, S. Poli // Steroids. 1997. — Vol. 62, № 8−9. — P. 564−577.
- Bradford M.M. A rapid and sensitive method for the quantization of microgram quantities of protein utilizing the principal of protein-bye binding / M.M. Bradford // Anal. Biochem. 1976. — Vol. 72. — P. 248 — 254.
- Briglia M. Rhodococcus percolatus sp. nov., a bacterium degrading 2,4,6- trichlorophenol / M. Briglia, F.A. Rainey, E. Stackebrandt et. al. // Int. J. Syst. Bacteriol. -1996. Vol.46. — P. 23−30.
- Butler W.R. High-performance liquid chromatography analysis of mycolic acids as an aid in laboratory identification of Rhodococcus and Nocardia species / W.R. Butler, O. Kilburn, G.P. Kubica // J. Clin. Microbiol. 1987. -Vol. 25, № 11. — P. 2126−2131.
- Butler W.R. Mycolic Acid Analysis by High-Performance Liquid Chromatography for Identification of Mycobacterium Species / W.R. Butler, L.S. Guthertz 11 Clin. Microbiol. Rev. 2001. — Vol. 14, № 4. — P. 704−726.
- Cooper D.G. Enhanced production of surfactin from B. subtilis by continuous product removal and metal cation additions / D.G.Cooper, C.R.
- Macdonald, S.J.B. Duff, N. Kosaric // Appl. Environ. Microbiol. 1981. V.42. № 3. P.408−412.
- Dabbs E.R. Plasmid-borne resistance to arsenate, arsenite, cadmium and chloramphenicol in a Rhodococcus species / E.R. Dabbs, G.J. Sole //Mol. Gen. Genet. (MGG). -1988. Vol. 211. -P. 148−154.
- Deeb R.A. Temperature effects and substrate interactions during the aerobic biotransformation of BTEX mixtures by toluene-enriched consortia and Rhodococcus rhodochrous / R.A. Deeb, L. Alvarez-Cohen // Biotechnol. Bioeng. -1999. -Vol. 62.-P. 526−536.
- Desai J.D. Microbial production of surfactans and their commercial potencial / J.D. Desai, I.M. Banat // Microbial. Mol. Biol. Rev. 1997. — Vol. 61, № 1. — P. 47−64.
- Espyny M.J. Nutritional requirements of a biosurfactant producing strain Rhodococcus sp. 51T7 / M.J. Espuny, S. Egido, J. Rodok, M.E. Mercade, A. Manresa // Biotechnol. Lett. 1996. — Vol. 18. — P. 521−526.
- Esteve- Nunez A. Biological Degradation of 2,4,6- Trinitrotoluene / A. Esteve- Nunez, A. Caballero, J.L. Ramos // Microbiol, and Mol. Biol. Rev.- 2001. -Vol. 65, № 3.-P. 335−352.
- Femandes P. Microbial conversion of steroid compounds: recent developments / P. Fernandes, A. Cruz, B. Angelova, H.M. Pinheiro, J.M.S. Cabral // Enz. Microb. Technol. 2003. — Vol. 32, № 6. — P. 688−705.
- Ferraro D. J. Structural Basis for Regioselectivity and Stereoselectivity of Product Formation by Naphthalene 1,2-Dioxygenase / D. J. Ferraro, A. L. Okerlund, J. C. Mowers, S. Ramaswamy // J. Bacteriol. 2006. — Vol. 188. — P. 6986−6994.
- Finnerti W. The biologi and genetics of the genus Rhodococcus / W. Finnerti //Annu. Rev.Microbiol. -1992. -Vol. 46.- P. 193−218.
- Fuller M.E. Aerobic gram- positive and gram-negative bacteria exhibit differential sensitivity to and transformation of 2,4,6 trinitrotoluene (TNT) / M.E. Fuller, J. Manning // Curr. Microbiol. — 1997. — Vol. 35. — P. 77−83.
- Gadda G. Characterization of cholesterol oxidase from Streptomyces hydroscopicus and Brevibacterium sterolicum / G. Gadda, G. Wels, L. Pollegioni, S. Zucchelli, D. Ambrosius, M. Pilone, S. Ghisla // Eur. J. Biochem. 1997. Vol. 1, № 250.-P. 369−376.
- Gakhar L. Structure and Increased Thermostability of Rhodococcus sp. Naphthalene 1,2-Dioxygenase / L. Gakhar, Z. A. Malik, C. C. R. Allen, D. A. Lipscomb, M. J. Larkin, S. Ramaswamy // J. Bacterid.- 2005. Vol. 187, № 21. -P. 7222−7231.
- Gibson D. T. Aromatic hydrocarbon dioxygenases in environmental biotechnology / D. T Gibson, R. E. Parales // Curr. Opin. Biotechnol. 2000. -Vol.11.-P. 236−243.
- Goodfellow M. The actinomycete-genus Rhodococcus: a home for the «rhodochrous» complex/ M. Goodfellow, G. Alderson// J. Gen. Microbiol. -1977. Vol.100, № 1.-P. 99−122.
- Goodfellow M. Introduction to chemosystematics / M. Goodfellow, D.E. Minnikin // Chemical Methods in Bacterial Systematics / Sos. Appl. Bacterid.-1985.-Vol. 20.-P. 1−15.
- Gurtler V. Can whole genome analysis refine the taxonomy of the genus Rhodococcus? / V. Gurtler, B. C. Mayall, R. Seviour // FEMS Microbiol. Rev. -2004. Vol. 28. — P. 377−403.
- Habe H. Genetics of polycyclic aromatic hydrocarbon metabolism in diverse aerobic bacteria / H. Habe, T. Omori // Biosci. Biotechnol. Biochem. -2003. Vol. 67. — P. 225−243.
- Haroune N. Metabolism of 2-Mercaptobenzothiazole by Rhodococcus rhodochrous / N. Haroune, B. Combourieu, P. Besse, M. Sancelme, A. Kloepfer, T. Reemtsma, H. D. Wever, A.-M. Delort // Appl Environ Microbiol. -2004. Vol. 70, № 10. -P. 6315−6319.
- Heipieper H.-J. Adaptation of Pseudomonas putida S12 to ethanol and toluene at the level of fatty acid composition of membranes / H.-J. Heipieper, J.A.M. de Bont // Appl. Environ. Microbiol. 1994. — Vol. 60. — P. 4440-^1444.
- Hoskisson P.A. Antibiotic production, accumulation of intracellular carbon reserves, and sporulation in Micromonospora echinospora (ATCC 15 837) / P. A. Hoskisson, G. Hobbs, G. P. Sharpies // Can. J. Microbiol. 2001. — Vol.47. -P.148−152.
- Iwabuchi N. Relationships between colony morphotypes and oil tolerance in Rhodococcus rhodochrous / N. Iwabuchi, M. Sunairi, H. Anzai, M. Nakajima, S. Harayama // Appl. Environ. Microbiol. 2000. — Vol. 66, № 11. — P. 5073−5077.
- Jang J.Y. Isolation and Characterization of a Rhodococcus Species Strain Able to Grow on ortho- andpara-~XyQWQ / J.Y. Jang, D. Kim, H.W. Bae, K.Y. Choi, J.-C. Chae, G.J. Zylstra, Y.M. Kim, E. Kim // J. Microbiol.-2005. Vol.43, № 4. -P. 325−330.
- Jung I.G. Characteristics of Rhodococcus pyridinovorans PYJ-1 for the biodegradation of benzene, toluene, m-xylene (BTX), and their mixtures / I.G. Jung, C.H. Park // J. Biosci. Bioeng. 2004. — V.97, № 6. — P. 429−431.
- Kalafut T. Biotranaformation patterns of 2,4,6 trinitrotoluene by aerobic bacteria / T. Kalafut, M.E. Wales, V.K. Rastogi, R.P. Naumova, S.K. Zaripova, J.R. Wild // Curr. Microbiol. — 1998. — Vol. 36. — P. 45−54.
- Kaprelyants A.S. Intercellular signalling and the multiplication of prokaryotes: bacterial cytokines / A.S. Kaprelyants, G.V. Mukamolova, S.S.
- Kormer, Weichart, M. Young, D.B. Kell // Symp. Soc. Gen. Microbiol. 1999. -Vol. 57.-P. 33−69.
- Kell D.B. Pheromones, social behaviour and the functions of secondary metabolism in bacteria / D.B. Kell, A.S. Kaprelyants, A. Grafen // Tree. 1995. — Vol. 10.-P. 126−129.
- Kim D. Regioselective oxidation of xylene isomers by Rhodococcus sp. Strain DK 17 / D. Kim, Y.-S. Kim, J.M. Jung, G.J. Zylstra, Y.M. Kim, S.-K. Kim, E. Kim // FEMS Microbiol.-2003.- Vol.223.- P.211−214.
- Kim J.-S. Microbial glycolipid production under nitrogen limitation and resting cell conditions / J.-S. Kim, M. Powalla, S. Lang, F. Wagner, H. Lunsdorf, V. Wray //J. Biotechnol. 1990. — Vol. 13. — P. 257−266.
- Kulakov L. A., and M. J. Larkin Genetic organization of Rhodococcus / L. A. Kulakov, M. J. Larkin // In A. Danchin (ed.), Genomics of GC-rich grampositive bacteria. Caister Academic Press, Wymondham, United Kingdom, 2002. -P. 15−46.
- Lang S. Surface-active lipids in rhodococci / S. Lang, J.C. Philp // Antonie van Leeuwenhoek Int. J. Cen. Mol. Microbiol. 1998. — V. 74. — P. 5970.
- Lang S. Biological amphiphiles (microbial biosurfactants) / S. Lang // Cur. Opin. Colloid Interface Sei. 2002. — Vol. 7. — P. 12−20.
- Larkin M. J. Applied aspects of Rhodococcus genetics / M. J. Larkin, M. R. De, L. A. Kulakov, I. Nagy // Antonie Leeuwenhoek. 1998. — Vol. 74. -P. 133−153.
- Lechevalier M.P. Biology of actinomicetes not belonging to genus Streptomyces / M.P.Lechevalier, H. Lechevalier // Biology of Industrial
- Microorganisms / Edit.: A. L. Demein, N.A. Solomon. Menlo Park, CA: Benjamin / Cumminds. -1985. P.315−358.
- Lichtinger T. Biochemical Identification and Biophysical Characterization of a Channel-Forming Protein from Rhodococcus erythropolis / T. Lichtinger, G. Reiss, R. Benz // J Bacteriol. 2000. — Vol. 182, № 3. — P. 764 770.
- Marinetti G.V. Chromatographic analysis of polar lipids on silisic acid impregnated papen / G.V. Marinetti // New Biochem. Separation. 1964. — V.7. -P. 349.
- Margesin R. Characterization of hydrocarbon degradative microbial populations in contaminated and pristine alpine soils / R. Margesin, D. Labbe, F. Schinner, C.W. Greer, L.G. Whyte // Appl. And Environ. Microbiol. — 2003. -Vol. 69, № 6.-P. 3085−3092.
- McAllister K.A. Microbial degradation of pentachlorophenol / K.A. McAllister, H. Lee, J.T. Trevors // Biodegradation. 1996. — Vol. 7. — P. 1−40.
- Miyamoto M. Transformation of steroids by actinobacteria / M. Miyamoto, T. Iwaya, E. Itagaki // Biochim. Biophys. Acta. 1995. — Vol. 1251, № 2.-P. 115−124.
- Neu T.R. Structural studies of an emulsion stabilizing exopolysaccharide produced by an adhesive, hydrophobic Rhodococcus strain / T.R. Neu, T. Dengler, B. Jann, K. Poralla //"J. Gen. Microbiol. — 1992. — Vol. 138, № 12.-P. 2531−2537.
- Niepel T. Intraspecific Variation of Unusual Phospholipids from Corynebacterium spp. Containing a Novel Fatty Acid / T. Niepel, H. Meyer, V. Wray, W.-R. Abraham // J. Bacteriol. 1998. — Vol. 180, № 17. — P. 4650^1657.
- Nishino S.F. Aerobic degradation of dinitrotoluenes and pathway for bacterial degradation of 2, 6-dinitrotoluene / S.F. Nishino, G.C. Paoli, J.C. Spain // Appl. Environ. Microbiol. 2000. — Vol. 66. — P. 2139−2147.
- Olukoshi E.R. Importance of stored triacylglycerols in Streptomyces— possible carbon source for antibiotics / E.R. Olukoshi, N. M. Packter // Microbiol.- 1994.- Vol.140. -P.931−943.
- Packter N. M. Ultrastructural studies of neutral lipid localisation in Streptomyces / N.M. Packter, E. R. Olukoshi // Arch. Microbiol. -1995. -Vol.164.-P.420−427.
- Paje M.L. Degradation of benzene by a Rhodococcus sp. using immobilized cell systems / M.L. Paje, P. Marks, I. Couperwhite // World J. Microbiol. Biotechnol. 1998.-Vol. 14. — P.675−680.
- Parales R. E. Biodegradation, Biotransformation, and Biocatalysis (B3) / R. E. Parales, N. C. Bruce, A. Schmid, L. P. Wackett // Appl. Environ. Microbiol.- 2002. Vol. 68. — P. 4699−4709.
- Park H.-S. Degradation of Chloronitrobenzenes by a Coculture of Pseudomonas putida and a Rhodococcus sp. / H.-S. Park, S.-J. Lim, Y. K. Chang, A. G. Livingston, H.-S. Kim // Appl Environ Microbiol. -1999. Vol. 65, № 3. -P.1083−1091.
- Patrauchan M. A. Catabolism of benzoate and phthalate in Rhodococcus sp. strain RHA1: redundancies and convergence / M. A. Patrauchan, C. Florizone, M. Dosanjh, W. W. Mohn, J. Davies, L. D. Eltis // J Bacteriol. 2005. — Vol. 187, № 12.-P. 4050−4063.
- Pinkart H.C. Cell envelope changes in solvent-tolerant and solventsensitive Pseudomonas putida strains following exposure to o-xylene / H.C. Pinkart, J.W. Wolfram, R. Rogers, D.C. White // Appl. Environ. Microbiol. -1996. Vol. 62. — P. 1129−1132.
- Prescott J.F. Use of a virulence — associated protein based enzyme — linked immunosorbent assay for Rhodococcus egid serlogy in horses / J.F. Prescott, A.S. Fernandez, V.M. Nicholson // Eguine Vet. J. — 1996. — Vol. 28. — P. 344 -349.
- Rainey F.A. Plyphasic evidence for the transfer of Rhodococcus roseus to Rhodococcus rhodochrous / F.A. Rainey, J. Burghatdt, R. M. Kroppenstedt et. al //Int. J. Syst. Bacteriol. -1995.-Vol. 45.-P. 101−103.
- Rapp P. Formation, isolation and characterization of trehalose dimycolates from Rhodococcus eiythropolis grown on n-alkanes / P. Rapp, H. Bock, V. Wray, F. Wagner // J. Gen. Microbiol. 1979. — Vol. 115. — P. 491−503.
- Ristau E. Formation of novel anionic trehalose tetraesters from Rhodococcus eiythropolis under growth- limiting conditions / E. Ristau, F. Wagner//Biotechnol. Lett. 1983. — Vol. 5. -P. 95−100.
- Singer M.E. Growth of Acinetobacter sp. strain HOl-N on n-hexadecanol: physiological and ultrastructural characteristics / M. E. Singer, S. M. Tyler, W. R. Finnerty // J. Bacteriol.- 1985. Vol. 162. — P. 162−169.
- Suenaga H. Directed Evolution of Biphenyl Dioxygenase- Emergence of Enhanced Degradation Capacity for Benzene, Toluene, and Alkylbenzenes / H. Suenaga, M. Mitsuoka, Y. Ura, T. Watanabe, K. Furukawa // J. Bacteriol. -2001.-Vol. 183.-P. 5441−5444.
- Sutcliffe I.C. Cell envelope components of Rhodococcus equi and closely related bacteria / I.C. Sutcliffe // Vet Microbiol. 1997. — Vol.56. — P.287−299.
- Sutcliffe I. C. Cell envelope composition and organisation in the genus Rhodococcus / I.C. Sutcliffe // Antonie Leeuwenhoek. 1998. — Vol.74. — P.49−58.
- Tomioka N. Cesium accumulation and growth characteristics of Rhodococcus erythropolis CS98 said Rhodococcus sp. strein CS402 / N. Tomioka, H. Uchiyama, O. Yagi // Appl. Env. Microbiol. 1994. — V. 60. — P. 2227−2231.
- Tsitko I.V. Effect of Aromatic Compounds on Cellular Fatty Acid Composition of Rhodococcus opacits / I.V. Tsitko, G.M. Zaitsev, A.G. Lobanok, M.S. Salkinoja-Salonen // Appl. Environ. Microbiol. 1999. — Vol. 65, № 2. — P. 853−855.
- Vaskovsky V.E. Modified yunguccelis reagent for detecting phospolipids and other phosmorus compounds on thinlayer chromatograms / V.E. Vaskovsky, N. Latyshev //J. chromatogr.-1975.-V.l 15.-P.246−249.
- Vaskovsky V.E. A universal reagent for phospholipids analysis / V.E. Vaskovsky, I. Vasondin, E.V. Kostetsky // J. Chromatogr. 1975. — V. l 14. — P. 129−141.
- Vorbeck C. Initial reductive reactions in aerobic microbial metabolism of 2,4,6 trinitrotoluene / C. Vorbeck, H. Lenke, P. Fisher, J.C. Spain, H.-J. Knackmuss // Appl. Environ. Microbiol. — 1998. — Vol. 64, № 1. — P. 246−252.
- Wagner F. Production of surface active anionic glycolipids by resting and immobilized microbial cells / F. Wagner, J.-S. Kim, S. Lang, Z.-J. Li,
- G.Marwede, U. Matulovie, E. Ristau, C. Syldatk // Proc. European Congress on Biotechnology. Verlag Chemie, Weinheim, Germany, 1984. Vol. 1. — P. 3−8.
- Warhust A.W. Biotransformations catalysed by the genus Rhodococcus / A.W. Warhust, C.A. Fewson // Crit. Rev. Biochem. 1994. — V. 14. — P. 29−73.
- Weber F.J. Cis/trans isomerization of fatty acids as a defense mechanism of Pseudomonas putida strains to toxic concentrations of toluene / F.J. Weber, S. Isken, J. A M. de Bont // Microbiol. 1994. — Vol. 140. — P. 2013−2017.
- Wick L.Y. Responses of Mycobacterium sp. LB501T to the low bioavailability of solid anthracene / L.Y. Wick, A.R. de Munain, D. Springael,
- H.Harms // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. — V. 58. — P. 378−385.
- Zaitsev G.V. Growth of Rhodococcus opacus on mixtures of monohalogenated benzenes and phenols / G.M. Zaitsev, E.G.Surovtseva // Mikrobiolog. -2000. -Vol.69, № 4. -P. 488−93.