Разработка ускоренных способов ДНК-диагностики для определения бактерий в мясе и мясопродуктах
Диссертация
Сальмонеллы вызывают первичные инфекции у животных и человека, нередко сопровождающиеся смертельным исходом. Они чаще локализуютя в печени, кишечнике, лимфатических узлах. Для выявления бактерий рода Salmonella производят посев на дифференциально-диагностические среды (Miller et al., 1991). Дифференциация сальмонелл от кишечной палочки основана на способности последних ферментировать лактозу… Читать ещё >
Список литературы
- Антонов A.C. Молекулярные основы геносистематики. Изд. МГУ, М., 1980. л
- Асеев Н. В., Светличкин В. В., Астахова О. И. Тест-система для ускоренной индикации и идентификации сальмонелл и кишечной палочки в продуктах убоя с/х животных на основе генных зондов. Труды ВНИИВСГЭ, т. 94, 1994, с.95−98.
- Белоусова Р.В., Гончарова Т. М., Асеев Н. В. и др. Разработка способов и технических средств полевой индикации возбудителей инфекционныхзаболеваний животных на основе генных зондов. В кн.: Вопросы ветеринарной биологии. М, 1994, с. 68−70.
- Блохина И.Н., Леванова Г. Ф. Геносистематика бактерий. М., 1976.
- Бочков Ю.В., Дрыгин В. В., Борисов A.B., Гусев A.A. Методические указания по индикации генома и штаммовой дифференциации вируса инфекционного бронхита кур методом полимеразной цепной реакции
- ПЦР) и секвенированием вариабельной области S1 гена. Утв.
- Департаментом ветеринарии Минсельхозпрода РФ, 21.02.1997.
- Ю.Бровкина А. Н. Характеристика поливалентных сальльмонеллёзных диагностикумов для реакции латекс-агглютинации.// Сб. науч. Трудов ВНИИВСГЭ, том 107, М., 1999, с.22−26.
- Вальехо-Роман К. М. Гибридизация ДНК В кн.: Молекулярные основы геносистематики. Изд-во МГУ, М, 1980, с.86−105.
- Голубева И.В. Дифференциация и идентификация бактерий семейства Enterobacteriaceae. // Труды МосНИИ вакцин и сывороток. .1977, т.77, с. 2330.
- М.Горбовицкая М. Диагностика болезни Марека с использованием ДНК-зондов. // Птицеводство. М. 1996. № 2, с 27−28.
- Госионов Р. Некультивируемые формы микроорганизмов.// Ветеринарная газета. № 5, март 2000.
- ГОСТ 21 237–75. «Мясо. Методы бактериологического анализа».
- Грановский H.H., Власихина Е. М., Доценко Г. Н. и др. Вопросы вирусологии, 1986, т. 31, № 4, с.449−452.
- Гринькевич В.А., Лысенко A.M., Мунтян М. С., Скрипникова Е. В., Африкян Э. К. Идентификация штамма Bacillus Sp. FTU и изучение гомологии оксидаз сааз-типа. // «Биохимия», 1997, том 62, № 7, с.842−849.
- Дерюшева С.Е. Биотинилирование ДНК-зондов с помощью полимеразной цепной реакции. Труды ВНИИ генетики и разведения с/х животных. Санкт-Петербург, 1993, с.43−45.
- Доронина Н.В., Говорухина Н. И., Лысенко A.M., Троценко Ю. А. Анализ ДНК-ДНК гомологий у облигатно-метилотрофных бактерий.// «Микробиология», 1988, том 57, № 4, с.629−633.
- Друца В.Л. Радиоизотопное мечение ДНК. В. кн.: Молекулярные основы геносистематики. Изд. МГУ. М., 1980, с.35−50.
- Золотарев Ф. Н, Голубев Д. Б., Петров H.A. Метод точечной гибридизации в вирусологии.//Успехи современной биологии.- 1989.-том 108.- с. 375−382.
- Иванов Л.Г. Систематика, морфологическая характеристика и биологические свойства возбудителей токсикоинфекций. Автореф. на соискание ученой степени доктора биологических наук МГУ им. Ломоносова. 1992.
- Калюжная М.Г., Хмелленина В. Н., Сузина Н. Е., Лысенко A.M., Троценко Ю. А. Новые метанотрофные изоляты из щелочных озер южного Забайкалья. «Микробиология», 1999, том 68, № 5, с.677−685.
- Карелин А.И., Макаров В. А., Боровков М. Ф. Словарь ветеринарных, зоогигиенических и санитарных терминов. М.: Росагропромиздат., 1990.
- Квятковская А.Ю. Разработка автоматизированных методов ДНК -диагностики эшерихий и сальмонелл в объектах ветеринарно-санитарного надзора.// Автореферат диссертации на соискание учёной степени кандидата биологических наук. М, 1998.
- Кисленко В.Н. Патогенные сальмонеллы. Лекция. Новосибирск, агр. ин-т. Новосибирск, 1992.
- Коромыслов Г. Ф., Фомин Б. А., Артюшин С. К. и др. Диагностикумы инфекционных болезней сельскохозяйственных животных на основе генной инженерии. Труды ВИЭВ, 1994, т. 69, с. 8−14.
- Красько А.Г., Ркхадзе Г. Г., Сергеев В. А. и др. Диагностика ротавирусной инфекции человека методом точечной гибридизации. «Вопросы вирусологии», 1987, т.32, № 2, с.208−212.
- Лабинская A.C. Микробиология с техникой микробиологических исследований. М," Медицина", 1978.
- Лысенко A.M., Суходолец В. В. Дивергенция Streptococcus thermophilus по уровню гомологии ДНК. «Микробиология», 1999, № 4, с.448−451.
- Макаров В.Б., Сафронов В. В. Цитогенетические методы анализа хромосом. М, «Наука», 1978.
- Маккреди Б.Д., Чимера Д. А. Обнаружение и идентификация патогенных микроорганизмов молекулярными методами. В кн. Молекулярная клиническая диагностика. М, Мир, 1999, с.496−506.
- Мальков И.Г. Нетрадиционные методы анализа в ускоренной диагностике патогенных микробактерий. В кн.: Проблемы ветеринарной санитарии, 1992, с. 3−14.
- Мальков И.Г., Артюшин С. К., Фомин Б. А., Коромыслов Г. Ф. Разработка метода идентификации микобактерий человеческого и бычьего видов с использованием ПЦР.// Молек. генетика микроб, вирусол., 1993. -2.- С. 3−9. М.-" Медицина".
- Маниатис Т, Фритч Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М., «Мир»., 1994.
- Медников Б.Н. Дивергенция геномов и некоторые вопросы эволюционной теории. Автореф. на соискании ученой степени доктора биологических наук. Москва, 1978.
- Медников Б.Н., Леванова Г. Ф. О возможных принципах построения естественной системы микроорганизмов. Физиология и биохимия микроорганизмов. Межвуз. Сб. № 2, Горький, 1980.
- Микерин С.М. Способ бактериологической диагностики пищевых токсикоинфекций сальмонеллезной этиологии. Тез. докл. Нижний Новгород, 1991, т. I.e. 107−108.
- Монахова Е.В., Власов В. П., Вуцан В. Н., Е.И.Седых, Н. К. Михась.// Видоспецифический ДНК-зонд для идентификации холерных вибрионов. // Молекул, генетика микроб.вирусол. 1993.-4, — с.8−1 1.- М.-«Медицина».
- Неплюев И.В., Дорошенко Н. В., Стаханова В. М. «Молекулярная генетика, микробиология, вирусология», 1987, № 9, с. 35−38.
- Пак С. П., Пальцев П. А. Сальмонеллез. М., «Медицина», 1989.
- Петров Н.Б. Методы изучения реассоциации ДНК. В кн. Молекулярные основы геносистематики. Антонов A.C. М. ИздМГУ, 1980, с. 51−75.
- Поляков A.A. Ветеринарная санитария. М., «Колос»., 1989.
- Поставин В.А. Пищевые токсикоинфекции. М., «Медицина», 1980.
- Правила ветеринарного осмотра убойных жиаотных и ветеринарносанитарной экспертизы мяса и мясопродуктов. Утв. Главным упрравлением ветеринарии Министерства сельского хозяйства СССР, 27 декабря 1983 г. М, ВО «Агропромиздат», 1988.
- Прохватилова Л.Б., Ломакин А. И., Дрыгин В. В., Гусев A.A. Методические указания по индикации генома провируса лейкоза" крупногорогатого скота методом полимеразной цепной реакции. Утв. Департаментом ветеринарии Минсельхозпрода РФ, 21.02.1997.
- Пыльнов В.А., Андреев В. Г., Гусев АА. Методические указания по индикации генома вируса респираторно-репродуктивного синдрома свиней методом полимеразной цепной реакции. Утв. Департаментом ветеринарии Минсельхозпрода РФ, 21.02.1997.
- Романенко Л.А., Лысенко A.M., Михайлов В. В., Курика A.B. Новый вид буропегментированных агарлитических бактерий рода Alteromonas. «Микробиология», 1994, том 63, № 6, с. 1081−1087.
- Романенко Л.А., Михайлов В. В., Лысенко A.M., Степаненко В. И. Новый вид меланинсинтезирующих бактерий рода Alteromonas. // «Микробиология», 1995, том 64, № 1, с.74−77.
- Романова Л.В., Мишанкин Б. Н. Сучков И.Ю. Полимеразная цепная реакция: генотипический скрининг штаммов Fran. tularensis с использованием неспецифических праймеров.// Биотехнология, 1993. N6.-с. 8−9.
- Санитарные правила и нормы. СанПиН 2.3.2. 560−96. Гигиенические требования к качеству и безопасности продовольственного сырья и пищевых продуктов. М, 1997, п. 6, с.22−50.
- Светличкин В.В., Лысенко A.M., Петров Н. Б. и др. Сравнение различных способов введения метки в ДНК микроорганизмов. «Биологические науки», 1985, № 6, с. 130−135.
- Сидоров М.А., Билетова Н. В. КорпелаеваЛ.М. Микробиология мяса, мясопродуктов и птицепродуктов. М., Агропромиздат, 1996.
- Синагатуллина Э.М. Разработка тест-систем для выявления инфекционных агентов с использованием нерадиоактивных биотиниллированных ДНК-зондов. Автореферат диссертации на соискание учёной степени кандидата биологических наук. М., 1992.
- СтентГ. Молекулярная генетика. М, Мир. 1974, с. 1−535.
- Стикланд Ю.Е. Получение зондов и их мечение. В кн. Молекулярная клиническая диагностика. М, Мир, 1999. с. 329−372.
- Тимошин В.Б., Замараев B.C., Антонов В. А., Липницкий A.B. Видоспецинфический ДНК-зонд для идентификации токсигенных штаммов возбудителя сибирской язвы. // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 1994, № 1, с. 30−33.
- Турова Т.П. Определение таксономического положения микроорганизмов с помощью метода гибридизации ДНК. «Биологические науки „, 1989, № 2, с.26−28.
- Турова Т.П., Троицкий A.B., Игнашёв В. Г., Светличкин В. В. Применение метода ДНК-ДНК гибридизации для идентификации бактерий из смешанных культур. „Лабораторное дело“, 1981, с.48−51.
- Фрумгарц Л.Ф., Киприянов С. М., Калачиков С. М. и др. Получение флуоресцентной меченой ДНК и использование ее в качестве зонда при молекулярной гибридизации. „Биоорганическая химия“, 1986, № 11, с. 15 081 513.
- Херрингтон С., Макги Дж. Молекулярная клиническая диагностика. // М, Мир., 1999. с. 558.
- Чан Т.В. Т. Гибридизация нуклеиновых кислот. В кн. Молекулярная клиническая диагностика. Методы. М, Мир. с.374−394.
- Шибата Д.К. Полимеразная цепная реакция и молекулярно-генетический анализ биоптатов. В кн. Молекулярная клиническая диагностика. Методы. М, Мир, 1999. с.395−425.
- Эйзендерг М., Чимера Д. А. Идентификация личности: анализ полиморфизма длины амплификационных фрагментов. В кн. Молекулярная клиническая диагностика. Методы. Под ред. Херрингтона С., Макги Дж. М, Мир, 1999, с.507−516.
- Agrowal S., Cristodoulou C., Gait M. Efficient methods for attaching nonradioactive labels to the 5 ends of syntheticaligodeoxy ribonucleotides.// Nucl. Acid. Res. 1986. V. 14, p. 6227−6245.
- Andrew V., Sayler G. The use of gene probes in the rapid analysis of natural microbial communities.//“ J. Ind. Microbiol.» 1988, 3, № 5, p. 281−292.
- Andriman W., Gradoville L., Heston L. Use of cloned probes to detect Epstein Barr viral DNA in tissues of patients with neoplastic and lympho-proliferative diseases.//. Journal of infectious Disease. 1983, V.148, p. 967−977.
- Arends M.J. Identification of HPV: in situ hybridization or polymerase chain reaction. //J. Pathol. 1991, V. 164, № 3, p. 191−193.
- Arrand J. Preparation of nucleic acid probes: Nucleic acid hydridization: a practical approach.// Ed. By BD Harnes, IRL Rpess. 1986, p.40.
- Asai T., Zaporojets D., Squires C., Squires C.L. // An Escherichia coli strain with all chromosomal rRNA operons inactivated: Complete exchange of rRNA genes between bacteria. // PNAS, 1996, v.96, p. 1971−1976.
- Ashall F., Miless M. Diagnosis of parasitic diseases using DNA to DNA hybridization.// «Trans Roy Soc trop. Med. Hyg.». 1988, № 2, p. 235−236.
- Baker R.F. Binding of DNA to cellulose nitrate filters under denaturing conditions. // «Anal. Biochem.», 1977, v.78, p.569−571.
- Berger C., Melchers F. In situ hybridization ofmRNA molecule in single cells.// «Annu rep., 1985, Basel Inst. Lmmunol», Basel, p. 1−10.
- Bernet C., Carret M., de Barbeyrac B. Detection ofMycoplasma pneumoniae by Using the Polymerase chain Reaction.// J.clin. Microbiol.-1989.-Vol. 27. N II.- p. 2492−2495.
- Bevan I. S" Daw R.A., Day P.J.R., Ala F.A., Walker M.R. Polymerase chain reaction for detection of human cytomegalovirus infection in a blood donor population.// Brit. J. Haematol. 1991. v.78, N I, p. 94−99.
- Bohm H., Karch H. DNA fingerprinting of Escherichia coli 0157: H7 strains by pilsed-fild gel electroforesis.//J. Clin. Microbiol., 1992, v.30, p.2169−2172.
- Boom R, Sol C, Beld M., Weel J., Goudsmit J., Wertheim-van Dillen. Improved Silica-Guanidiniumthiocyanate DNA isoation Procedure Based on Selectiv Binding of Bovin Alpha-Casein to Silica Particles. //J. Clin. Microbiol, 1999, v.37, № 3, p.615−619.
- Brechot C. Application du donare de 1 DNA du virus de 1 hepatite B pour le diagnostic des infection lines au virus de 1 hepatite B.// «Ann. Biol. Clin», 1985, № 4, p. 351.
- Brenner D. Gene Probes in Detection and identification of Pathogenic Bacteria.// «Clinical Microbiol», 1986, № 7, p. 106−109.
- Britten R. J., Kohe D.E. Repeated sequences in DNA.// «Science», 1968, v.161, p.529−540.
- Brytting M, Sundgvist V.-A., Stahlhandske P., Linde A., Wahren B. Cytomegalovirus DNA detection of an immediate early protein gene with nested primer oligonucleotides. // J. Virol. Meth. 1991. v. 32, № 2−3, p. 1127−138.
- Cassiman I. Diagnosis of genetic diseases by probes.// «Acta clin. Belg.», 1988, p. 181−184.
- Chou S., Merigan T.C. Rapid detection and quantitation of human cytomegalovirus in urine through DNA hybridization. // New England Journal of Medicine. 1985, v. 308, p. 921−925.
- Chu B.C.F., Wahl G.M., Orgel L.E. Derivatization of unprotected polynucleotides.//Nucl. Acid Res. 1983, v. ll, p. 6513−6529.
- Church R.B. Method for study of hybridization and reassociation of nucleic acids axtracted from cells of higher animals. In: Molecular techniques and approach in developmental biology, ed. by M. J. Chrispeels. N. Y., 1973, p. 223 301.
- Coates P.J., Mak W.P., Slavin G., Ardenne A.J. Detection of singl copies of Epstein-Barr virus in paraffin wax sections by nonradioactive in situ hybridization. // J. Clin. Pathol., 1991, v.44, № 6, p. 487−491.
- Codex Alimentarius. Vol. 10, FAO, WHO, 1991, 223 p.
- Conner C.P., Heithoff D.M., Julio S.M., Sinseheimer R.L., Mahan M.J. // Differential papperns of acquired virulence genes distinguish Salmonella ctrains. PNAS, 1998, v.95, p.4641−4645.
- Сох K.H., DeLeon D.V., Angerer L.M. Detection of mRNAs in sea unchin embryos by in situ hibridization using asymmetric RNA probes. // Developmental Biology, 1987, V. 101, p.485−502.
- Day P.J.R., Bevan I.S., Gurney S.J., Young L. S., Walker M.R. Synthesis in vitro and application of biotinylated DNA probes for human papiloma virus type 16 by utilizing the polimerase chain reaction. // Biochm.I. 1990. v.267, № 1, p.119−123.
- De Ley I., Cattoir H., Reynaerts A. The quantitative measurement of DNA hybridization from renaturatiun rates. // «Europ. J. Biochem.», 1970, v. 12, p.133−142.
- Denhardt D.T. A membrane filter technique for the detection of complementery DNA.// «Biochem. Biophys. Res. Commun.», 1966, v.23, p. 641 646.
- Erlich H.A. PCR technology.// Stockton Press, New York, 1989.
- Falkow S., Moseley S. Application oftechique of DNA-DNA hybridization in diagnostic microbiology.// Патент CUIA№ 4 187 351, 03.04.1980, 435/5.
- Falkow S., Moseley S. Specific DNA probes in diagnostic microbiology.// Патент США № 4 358 535,10.11.1982,435/15.
- Ferenezy A. Latent papilomavirus and recurring genital warts.// N. Engl. J. Mod., 1985, № 14, p. 784.
- Fine S.P., Reddy G.R., Marnett L.J. Mutagenicity in Escherichia coli of the mayor DNA adduct derived from the endogenous mutagen malondialdehyde. // Proc. Natl. Acad. Sei, 1997, v.94, p. 8652−8657.
- Flint S.H., Hartley N.J. Evaluation of the TECRA Escherichia coli 0157 visual immunoassay for tests on dairy products.// «Lett Appl Microbiol», 1995, v. 21(2), p.79−82.
- Forster A., Modness J., Skingle D. Non-radioactive hybridization probes prepared by chemical labeling of DNA and RNA with novel reagent, photobiotin.// «Nuc. Acid Res», 1985, № 3, p.745.
- Gaillot O., Camillo P.D., Berche P. Comparison of CHROMagar Salmonella Medium and Hektoen Enteric Agar for isolation of Salmonellae from stool samples.//J. Clin. Microbiol, 1999, v.37, p.762−765.
- Gannon V. P., King R. K, Kim J. Y, Thomas E.J. Rapid and sensitive metod for detection of Shiga-like toxin-produsing Escherichia coli in ground beef using the polimerase chain reaction.// Appl. Environ Microbiol, 1992- v.58, p.3809−3815.
- Garger S, Turpen T. Use of RNA probes to detect plant RNA viruses.// «Meth Enzymol.», v. l 18, Orlando, 1986, p. 717−722.
- Gillespie D, Spiegelman S. A quantive assay for DNA-RNA hybrids with DNA-RNA immobilized on a membrane.// «J. Molecul. Biol.», 1965, v. 12, p.829−842.
- Gou D. F, Kubota H, Onuma N, Kodama H. Detection of salmonid heipes virus in fisli by Southern-blot technique.// J. Vet. Mod. Sei. 1991. v. 53, NI. P 4348.
- Gramley W.A., Asghar A, Frierson H. F, Powell J. M, Powell S.M. Detection of Helicobacter pylori DNA in Fecal Samples from in fected individuals.// J. Clin. Microbiol, 1999, v.37, p.2236−2240.
- Haase A. Analysis of infections and pothological conditions by in situ hybridization. «DNA Probes: Appli. Genet, and Infic. Disease and Cancer- Cent,
- Cold Spring Harbor. Apr. 20−23, 1986″, Cold Spring. Harbor. N. Y., 1986, p. l 13- 118.
- Haase A., Brahic M., Blum H. Detection of viral nucleic acids by in situ hybridization.// „Meth. Virol. Vol.“, Orlando c. a., 1984, p. 189−226.
- Halt C., Ward M.E., Clarke l.N. Analysis of the entire nucleotide sequence of the ciyptic plasrnid of Chlamidia trachomatis serovar L I. Evidence for involvement in DNA replication. // „Nucl. Acid. Res.“, 1988, v. 16.- p.4053−4067.
- Hames B.D., Higgins S.J. Nucleic acid hybridisation: a practical approach.// IRL Press, Oxford, 1985.
- Hashimoto Y., Itho Y., Fujinada Y., Khan A.Q., Sultana F., Miyake M., Hirose K., Yamamoto H., Ezaaki T. // Development of nested PCR based on the ViaB sequence to detect Salmonella thyphi. // J. Clin. Microbiol., 1995, v.33, p.775−777.
- Hayashi K. Manipulation of DNA by PCR. In. PCR the Polimerase chain reaction, Eds.: Mullis K.B., Ferre F. & Gibbs R.A., Birkhauser, 1994, p. 3−14.
- Herrick J., Michalet X., Conti C., Schurra C., Bensimon A. Quantifying single gene copy number by measuring fluorescent probe lengths on combed genomic DNA.// „Proc. Natl. Acad. Sci“, 2000, v. 97 (1), p 222−227.
- Hill W., Madden J. Foodbome enterotoxigenis Escherichia coli: detection and enumeration by DNA hybridization.// „Appl. and Enviro. Microbiol“, 1983, № 4, p.1324−1330.
- Hill W., Payne A. Detection and enumeration of virulent Yersinia enterocalitica in food by DNA colony hybridization.// „Appl. F Environmental Microbiology“, 1984, № 4, 801−807.
- Hopmar A., Wiegant J., Tesser G. A no-radioactive in situ hybridization method based on mercurated nuelcie acid probes and sulfhydryl-hapten ligands.// „Nuel. Acid. Res.“, 1986, v.14, № 16, p. 6471−6488.
- Huck L.G., Dorn C.R., Angrick E.J. DNA probe for detection of serogroup 0157 enterohemorrhagic Escherichia coli.// Int. J. Food Microbiol- 1995, v.25, № 3, p.277−287.
- Huss H.H. Control of indigenous pathogenic bacteria in seafood. Food control, 1997, v.8, № 2, p.91−98.
- Ikeda S., Yamamoto M., Nagao K., Zhang B., Watanabe S., Oda T. Nonradioactive hybridization probes prepared using M13 phage vector and the universal sequencing primer.// Acta mod. Okajama. 1989. v.43, № 4, p. 11 971 202.
- Innis M.A., Gelfand D.H., Sninsky J.J., White T.J. Optimization of PCRs. In: PCR protocols, a guide to methods and applications.// Academic Press, San Diego, California, 1990.
- ISO 9001. Quality systems models for quality assurance in design, 1987, pp. 6−8.
- Ivanova T., Turova T., Antonov A. DNA-DNA and rRNA-DNA hybridization studies in the genus Ectothiorhodosrira and other purple sulfur bacreria.// „Arch. Microbiol“, 1985, № 2, p. 154−156.
- Jaulhac B., Nowicki V., Boznstein N. Detectoin Legionella pneurnofila method PCR.//J.Clin. Microbiol.-1992.-v.30 № 4.p 92−94.
- Joseph T., Navo P.E., Caron C.F. Molecula characterization of Chlamidia trachomatis and Chlamidia psitace- Plasmids. //Infect. Innwn.-1986.-Vol.5L-p.699- 703.
- Jremstein M. and Hognes D. Colony hybridization: A method for the isolation of cloned DNAs that contain a specific gene.// „Proc. Nail. Acad. Sci. USA“, 1975, p. 3961−3965.
- Kacian D., Lawrence T., Sanders M., Putnam J., Majlessi M., McDonough S., Ryder T. A rapid and sensitive chemiluminescent DNA probe system for detection of amplified HIV and HBV DNA. // Fresenius J. Anal. Chem. 1990. v.337, № 1, p. 95.
- Karh H., Meyer T. Evalution of oligonucleotide probes for identification of shiga-like-toxin-producing Esherichia coli.// J. Clin Microbiol, 1998, v.27, p.1180−1186.
- Kauffmann F., Edwards P.R. Classification and nomenclature of Hntcrobacteriaccae.// Int. Bull. Bact. Norn.Tax. 1952, p. 20−37.
- Kim J., Nietfeldt J., Benson A.K. Octamer-based genome scanning distinguishes a unigue subpopulation of Escherichia coli 0157: H7 strains in cattle.// Proc. Nail. Acad. Sci. USA, 1999, v. 96, Issue 23, p. 13 288−13 293.
- Kimpton C.P., Morris D.J., Corbit G. Sensitive non-isotopic DNA hybridisation assay or immerdiate-early antigen detection for rapid identification of human cytomegalovirus in urin.//J. Virol. Meth. 1991, v.32, № 1, p. 189−199.
- Kohne D. Novel approach for rapid and sensitive detection of microorganisms.//"Clinicae Microbiol», 1987, № 6, p. 110−112.
- Lakshmi D., James D. A solution hybridization assay for the quantitation of prodynorphin mRNA.// «Mol. Brain Res.», 1987, № 2, p. 173−176.
- Lanata C. Sensitivity and specifity of DNA probes with the stool blot technique for detection of Eschenchia coli enterotoxins.// «J. Infec. Diseases», 1985, № 5, p. 1087−1090.
- Langer P. R., Waldrop A.A., Ward D.C. Enzymatic synthesis of biotimlabelled polynucleotides: novel nucleic acid affinity probes.// Proc. Nat. Acad. Science. 1982. v.79. p. 4381−4385.
- Leiser R., Schubert J. Nachweis phytopathogener Virren mit Hilfe der RNA-RNA-hydridisierung auf Filtern.// «Acta biotechnol», 1986, № 1, p. 14−16.
- Lim J.K., Gunther N. W., Zhao H., Johnson D.E., Keay S.K., Mobley H.L.T. // In Vivo Phase Variation of Escherichia coli Type 1 Fimbrial Genes in Women with Urinary Tract Infection. // Infection and immunity, 1998, v. 66, № 7, p.3303−3310.
- Lockcnsgard J.R., Thawley D.G., Molitor T.W. Enzymatic aimplification of latent Pseudorabies virus nucleic acids sequences.//J.Virol.Meth. 1991. v.34, № 1. P. 45−55.
- Longer P. Enzymatic synthesis of biotin-labelekl polynucleotides novel nucleic acid affinity probes.// Proc. Natl. Acad. Sei USA, 1981, № 11, p. 6633.
- Louie M., de Azavedo J, Clarke R., Borczyk A., Lior H., Richter M., Brunton J. Sequence heterogeneity of the eae gene and detection of verotoxin-produsing Escherichia coli using serotype-specific primers.// Epidemiol Infect- 1994, № 112, p. 449−461.
- Luk J.M., Kongmuang U., Trans R.S., Lindberg A.A. An enzyme-linked immunosorbent assay to detect PCR products of the rfbS gene from serogroup D salmonellae: a rapid screening prototype.// J. Clin. Microbiol. 1997, v.35, p.714−718.
- March S.B., Ratnam S. Latex agglutination test for detection of Escherichia coli serotype 0157.// J. Clin Microbiol, 1989, v. 27, p.1675−1677.
- Marmur J., Doty P. Heterogeneity in deoxyribonucleic acids. I. Dependens on composition of the configurational stbility of deoxyribonucleic acid.// «Nature», 1959, v.183, p.1427−1431.
- Marmur J., Doty P. Thermal renaturation of deoxyribonucleic acid. // «J. Molecul. Biol.», 1961, v.3, p.585−594.
- Martm R. H. Non-radioactive techiques for the labelling of nucleic acids.// Biotech. Adv. 1991, v.9, p. 185−196.
- Maxwell J.H., Van Ness J., Hahn W.E. Assay of DNA-RNA hybrids by SI nuclease digestion and adsorption to DEAE-cellulose Filters.// «Nucl. Acids. Res.», 1978, v.5, p.2033−2037.
- McCol K. A., Gould A. R. Detection and characterisation of bilietongue virus using the polymerase chain reaction.// Virus. Res. 1991. v.21, № 1, p. 1934.
- Meyer R. F., Brown C.C., House C., House J. A., Monitor T. W. Rapid and sensitive detection of foot-and-mouth disease virus in tissues by enzymatic RNAamplification of the polymerase gene.// J. Virol. Meth. 1991. v.34, № 2, p. 161−172.
- Metcalf T. G., Jiang X., Ester M. K., Melnick J. L. Nucleic acid probes and molecular hybridization for detection of viruses in environmental samples.// Progr. Med. ViroL 1988. v. 35, p. 186−214.
- Miller G., Tare C. R. Mallmson E.T. Salmonella. Xylose-lysine-tergitol 4: an unproved selective agar medium for the isolation of Salmonella.// Poultry Sci, 1991, № 12, p. 2429−2432.
- Moore R., Schmid J. Gounder J and Stuley J Deoxyribonuclei acid Hology Among the Gaulobacters.// Inter J of Systemat. Bacter, 1978, v.28, № 3, p.349−353.
- Moseley S.L., Hyg J. Detection of enterotoxigen Esherichia coli by DNA colong hybridization.// «J. Infect», 1989, № 6, p. 892−898.
- Murtanyh M.P., Lin G.F., Haggard D.L., Weber A.F., MeiskeJ.C. Detection of bovine leukemia virus in cattle by the polymerase chain reaction.// J. Virol. Meth. 1991 .v. 33, № 11−12, p. 73−85.
- Montor T.W., Oraveerakul K., Zhang Q.Q., Choi C.S., Ludemann L.R. Polymerase chain reaction amplification for the detection of porcin parvovirus.//J. Virol. Meth. 1991. v.32, № 2−3, p. 201−211.
- Nataro J.P. Detection of an abherence factor of enteropathogenes Escherichia coli with a DNA probe.// «J. Infec. Diseases», 1985, № 3, p.560−565.
- Palva A. A gene in the detection ofEscherichia coli and other Enterobacteriaceae by nucleic acid sandwich hybridization.// «J. Clin. Microbiol.», 1983, № 1, p.92−100.
- Paul P. S. Application of nucleic acid probes in veterinary infectious diseases. // Voter. Microbiol. 1990, v. 24, № ¾, p. 409−417.
- Peirce C., DNA technology provides new tools for identifycirung genetic causes of disease.// «Res. Resour. Report.», 1988, № 8, p. 1−4. .
- Persing D.H., Smith T.F., Tenover F.C., White T.J. Target selection and optimization of amplification reaction.// In: Diagnostic molecular microbiology, ASM, 1993, p. 88−102.
- Piiparinen H., Vaheri A. Genotyping of herpes simplex virusesby polymerase chain reaction.//Arch. Virol. 1991. v. 119 № 13−4, p. 275−283.
- Pulco P R., Khatib R., Barientes S., Atmar R., Tony M.A. Detection of all 6 Coxsackieviral serotypes by polymerase chain reaction.// J. Cell Biochem. 1991. Suppl. 15 c. p. 194.
- Ranki M. Sandweich hybridization as a convmient method for detection ofnucleic acids in crude samples.// «Gene 21″, 1983, p. 77.
- Renz M, Kiirz C. A colorirnetric method for DNA hybridization.// Nlicleic Acids Res. 1984. v. 12, № 8, p. 13 435−13 444.
- Rifai S, Barbancon V, Prevost G, Piemont Y. Staphylococcus aureus Synthetic exfoliative toxin A and B DNA probes for detecton of toxigenic Staphylococcus aureus strains.// „J. Clin. Microbiol.“, 1989, № 3, p. 504−506.
- Rowley A. H., Wolinsky S. M, Sambol S. P, Barkholt L, Elirnst A., Andersson J. P. Rapid detection of citomegalovirus DNA in blood of renal transplant patients by in vitro enzymatic amplification.// Transplantation. 1991. v. 51, № 5, p. 1028−1033.
- Rubin F, Lane E, Lesman M, Hoffman S. Use of a DNA probe to detect Salmonella typhi in the blood patiens with typhoid fever.// „J. Clin. Microbiol“, 1989, № 5, p. 1112−1114.
- Rusvai M, Belak S. Detection of bovine adenovirus nuclric acid sequences in nasal specimens by biotinylated DNA probes. 1992, № 4, p.311−316.
- Saiki R. X, Chu-An Chang B. S, Levenson C. H, Warren T. C, Bochm C. D, Kazazian J. H, ErilchH.A. //NewEng. J. Mod. 1988. v. 391. p. 537−541.
- Sallie R, Rayner A, Portmann B, Eddieston A.L.W.F, Williams R, Detection of hepatitis „C“ virus informalin-fixed liver tissue by nested polymerase chain reaction.// J. Mod. Virol. 1992. v.37, № 4.
- Samadpour M, Liston J, Ongerth J. E, Tarr P.I. Evalution of DNA probes for detection of Shiga-like-toxin-producing Escherichia coli in food and calf fecals samples.// Appl. Environ Microbiol, 1990, v.56, p. 1212−1215.
- Sansonetti P., Boileau С. H Sonde d» DN et procede pour la detection de Shigelles et des souches entero-invasives de Esherichia coli. Патент ЕР, № 170 584, 12.07.1985, С 12 Q 1/68.
- Sausern J. Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electroohoresis.//J.Molec.Biolog.- 1975.-98.-p. 503.
- Seeling R., Renz M., Seelig H. P. PCR in the diagnosis of viral hepatitis.// Ann. Mod. 1992. v.24,№ 3.
- Serhir В., Dugord D., Jacques M., Higgins R., Harel J. Cloning and characterization gene (dexS) from Streptococcus suis.// GENE, 1997, № 190, p. 257−261.
- Sharma K.B. Arya S.C. Detection of Salmonella typhi by Nested PCR Based on the ViaB Sequence. // J. Clin. Microbiol., Dec., 1995, p.3361.
- Shibata D., Martin W., Appiemen M. Detection of cytomegalovirus DNA in periferal blood of patients infected with human immunodefficiency virus. «Infec. Deseases» 1988, № 6, p. 1185−1192.
- Tchen P., Ranki M. Time-resolved fluoromentri, a sensitive method to quantify DNA-hybrids. «Nucl. Acid Res.», 1986, № 2, p. 1017−1028.
- Tenover F. Studies ofantimicrobiol resistance genes using DNA probes. «Antimicrob Ag Chemother. «, 1986, N5, p.721−725.
- Todd D., Creelan J. L., MeNulty M. S. Dot-hybridization assay for chicken anemia agent using a cloned DNA probe.// J. Clin. Microbiol. 1991. v.29, № 5, p. 933−939.
- Trainer G., Hobbs F. New methods for labeling nucleic acids with reporter groups.// «J. Cell. Biochem.» 1989, suppl., № 13 E., p. 289.
- Van der Giessen J.W.B., Eger A., Haagsma J., Haring R., Gaastra., van der Zeijst B. A. M. Micobacterium paratuberculosis. Amplification of 165 rRNA sequences to detect Mycobacterium paratuberculosis.// L. Med. Microbiol, 1992, № 4, p. 255−256.
- Verger J. M., Grimont F. Grimon PAD Grayon M Brucella, a monospicific genus as shocon by dioxyribonucleic acid hydridisation.// «Int J-Syst Bacteriol», 1985, p.292−295.
- Viscidi R.P., Yolken R.G. Molecular diagnosis of infection diseases by nucleic acid hybridization.// Mol. and Cell. Probes. 1987. № 1, p. 3−14.
- Wetmur J. G., Davidson W. Kinetics ofrenaturation of DNA.//J. Mol. Biol. 1968. № 31, p. 349−370.
- Wilde J., Yolken R., Willoughby R., Eiden J. Improved detection of rotavirus shedding by polymerase chain reaction.// Lancet. 1991. v.337. № 8737, p. 323 326.
- Wright D.J., Chapman P.A., Siddons C.A. Immunomagnetic separation as a sensitive method for isolating Escherichia coli 0157 from food samples.// «Epidemiol infect», 1994, v. 113, p. 31−39.
- Министерства тйства и П1Я РФ
- В.В. Селиверстов «28.' «марта 2000 г.
- МЕТОДИЧЕСКИЕ УКАЗАНИЯ ' по индикации энтеробактерий в объектах ветеринарно-санитарного надзора на основе ДНК-гибридизации1.Общие положения
- Настоящие методические указания предназначены для ускоренной индикации бактерий родов Escherichia и Salmonella в мясе, мясе птицы и мясном. фарше на основе реакции гибридизации нуклеиновых кислот с использованием меченых биотином ДНК-зондов.
- Компонентами реакции являются: испытуемый материал (выделенная из объекта исследования ДНК контаминируемых микроорганизмов) и меченые биотином ДНК-зонды. Реакция проводится на мембранных нитроцеллюлозных фильтрах с диаметром пор 0,45 мкм.2.ДНК-ЗОНДЫ
- РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ НАУК (РАСХН)
- Отделение ветеринарной медицины
- МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ ПО ИНДИКАЦИИ И ИДЕНТИФИКАЦИИ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ В ОБЪЕКТАХ ВЕТЕРИНАРНО-САНИТАРНОГО НАДЗОРА НА ОСНОВЕ1. ДНК-ДИАГНОСТИКИ
- УТВЕРЖДАЮ: Академик-секретарь отделения ветеринарной медицины академик РАСХН1. А. М. Смирнов 2000 г.1. МОСКВА 2000.