Полиморфизм гена рецептора E.COLI F18 (ECR F18/FUT1) и его влияние на хозяйственно-полезные признаки свиней
Диссертация
Впервые работы по исследованию гена рецептора E. coli Fl8 (ECR F18/FUT1) как гена-кандидата, обуславливающего чувствительность или, наоборот, устойчивость поросят к колибактериозу, были проведены в 1997 P. Vogeli с соавторами. Ими был выявлен полиморфизм гена FUTI, расположенного на одной хромосоме с геном ECR F18 и находящегося с ним в тесном сцеплении. Используя метод ПЦР-ПДРФ, были выявлены… Читать ещё >
Список литературы
- Айала Ф., Дж. Кайгер. Современная генетика. В трех томах, том1. под ред. д-ра биол. наук Ю. П. Алтухова, М.: Мир, 1987, 288 с.
- Арсиенко Р.Ю. Полиморфизм гена белка, связывающего жирные кислоты (H-FABP), и его влияние на хозяйственно-полезные признаки свиней. Автореферат на соискание ученой степени кандидата биологических наук, Дубровицы, 2003.
- Ахметсадыков H.H., Муканов К. К. Адгезивные антигены эшерихий и их морфологические особенности. / Материалы науч.-практ. конференции «Актуальные проблемы патологии животных и человека». Барнаул. — 1996 г.
- Бочкарев В.В. Молекулярно-генетический анализ локуса ß--лактоглобулина у овец различных полутонкорунных пород. Автореферат дисс. на соиск. уч. степени канд. биол. наук. Дубровицы, 1998.
- Брем Г., Кройслих X., Штранцингер Г. Экспериментальная генетика в животноводстве//М. РАСХН.- 1995- 326 с.
- Вартапетян А.Б. Полимеразная цепная реакция//Молекулярная биология. 1991. — Том 25, № 4, с. 926−936.
- Гааль Э., Медьеши Г., Верецкей JI. Электрофорез в разделении биологических макромолекул. М.: Мир, 1982, с.365−367.
- Гладырь Е.А. ДНК-диагностика вариантов генов каппа-казеина и бета-лактоглобулина у крупного рогатого скота. Диссертация на соиск. учен, степ канд. биол. наук, Дубровицы, 2001.
- Гладырь Е.А. и др. ПЦР анализ вариантов каппа-казеина у крупного рогатого скота/ТМатериалы научно-технической конференции «Повышение конкурентоспособности животноводства и задачи кадрового обеспечения». Быково. -2000.
- Головко А.Н. Антигенная вариабельность фимбриальных адгезинов E.coli. Ветеринария, № 8, 1997, с.23−25.
- Глазко И.И. ДНК-технологии животных//под ред. A.A. Созинова -Киев, 1997, — 173 с.
- Дворкин Г. Л., Гутковский A.A. Колибактериоз телят и поросят. Факторы вирулентности возбудителя, эпизоотология, диагностика, меры борьбы. Минск. — 1989, с. 5−20.
- Елисеева И.И., Рукавишников В. О. Группировка, корреляция, распознавание образов (Статистические методы, классификация и измерения связей). М.: Статистика, 1977, 138 с.
- Зароза В.Г. Антигены адгезии E.coli: морфологические и биофизические свойства (обзор). Сельскохозяйственная биология, 1988, № 4.
- Зиновьева H.A. и др. Введение в молекулярную генную диагностику сельскохозяйственных животных// Дубровицы: ВИЖ, 2002, 128 с.
- Зиновьева H.A. Молекулярно-генетические аспекты в решении задач современного животноводства//Автореф. докт. дис. Дубровицы — 1998а-36 с.
- Зиновьева H.A., Попов А. Н., Эрнст Л. К., Марзанов Н. С., Бочкарев В. В., Стрекозов Н. И., Брем Г. Методические рекомендации по использованию метода полимеразной цепной реакции в животноводстве//Дубровицы 1998b — 47 с.
- Зиновьева H.A., Васичек Д., Айгнер Б., Попов А. Н., Брем Г. Диагностика различных аллельных вариантов ДНК «single tube» методом аллелоспецифической ПЦР//Биотехнология 1996 — № 6 — с. 45−49.
- Зиновьева H.A., Гладырь Е. А. Перспективы использования молекулярной генной диагностики сельскохозяйственных животных. ДНК-технологии в клеточной инженерии и маркировании признаков сельскохозяйственных животных. Дубровицы — 2001 — с.44−49.
- Зиновьева H.A., Эрнст Л. К., Брем Г. Трансгенные животные и возможности их использования. Молекулярно-генетические аспекты трансгенеза в животноводстве//Дубровицы 2001 — 128 с.
- Калашникова JI.A., Дунин И. М., Глазко В. И., Рыжова Н. В., Голубина Е. П. ДНК-технологии оценки сельскохозяйственных животных// Лесные Поляны 1999 — 148 с.
- Калашникова Л. А. и др. Генная диагностика стрессчувствительности свиней /Калашникова Л. А., Рыжова Н. В., Гупалов Н. В.//Молекулярно-генетические маркеры животных. Киев, 1996.-с. 10.
- Калашникова Л.А., Дунин И. М., Глазко В. И. Селекция XXI века: использование ДНК-технологий//Лесные Поляны 2000 — 31 с.
- Картель H.A. Биоинженерия: методы и возможности. Минск, «Ураджай», 1989, 141 с.
- Карышева А.Ф., Карышев C.B. Инфекционные болезни животных (Справочная книга), Кишинев, Картя Молдовеняскэ, 1989, с.228−233.
- Кленовицкий П.М., Моисейкина Л.Г" Марзанов Н. С. Цитогенетика сельскохозяйственных животных//Элиста 1999 — 142 с.
- Коновалова E.H., Гладырь Е. А., Зиновьева H.A. Использование гена рецептора E.coli К88 в качестве генетического маркера в свиноводстве//Материалы докладов науч.-практ. конференции «Перспективы и развитие свиноводства в XXI веке». Быково. — 2001.
- Коновалова E.H., Гладырь Е. А., Зиновьева H.A. ПЦР-ПДРФ-анализ гена рецептора E.coli ECR F18 свиней. Школа-практикум
- Методы исследований в биотехнологии сельскохозяйственных животных" 2-ой Межд. научной конференции «Современные достижения и проблемы биотехнологии сельскохозяйственных животных». Дубровицы. — 2002.
- Коновалова E.H., Гладырь Е. А., Лобан H.A., Шмаков Ю. И. Зиновьева H.A. Полиморфизм гена рецептора Е. coli Fl8 свиней. «Доклады РАСХН», № 6, с. 25−27.
- Меркурьева Е.К., Шангин-Березовский Г.Н. Генетика с основами биометрии. М.: Колос. — 1983. — 400 с.
- Меркурьева Е.К., Абрамова З. В., Бакай A.B., Кочиш И. И. Генетика. М.: Агропромиздат. — 1991. — 444 с.
- Плохинский H.A. Биометрия М.: Издательство Московского Университета. — 1970. — 366 с.
- Сайки Р. Анализ генома//Методы. М. — Мир. — 1990. — 400 с.
- Светоч Э.А. Факторы патогенности возбудителей эшерихиозов сельскохозяйственных животных. Автореферат дисс. на соиск. учен, степ, доктора вет. наук. М., 1992.
- Сингер М., Берг Г. Гены и геномы/в 2-х томах//М.: Мир 1998.
- Справочник по болезням свиней/А.И. Собко, В. Ф. Романенко, Г. К. Божко и др.- под ред. А. И. Собко 2-е изд., доп. и перераб. — К.: Урожай, 1988.
- Тимофеев JI.B., Лукьянов В. Н. Способность к откорму и качество мяса стрессоустойчивых и стрессочувствительных свиней// Доклады ВАСХНИЛ, 1990, № 11, с. 43−47.
- Фролкин Д-А., Скрининг гена злокачественного гипертермического синдрома (MHS-гена) у свиней. Автореферат дисс. на соискание уч. степ. канд. биол. наук. Дубровицы, 2000.
- Шибата Д.К. Полимеразная цепная реакция и молекулярно-генетический анализ биоптатов//Методы. Молекулярная клиническая диагностика. М.: Мир. — 1999. — с. 395−428.
- Ясуи В., Ито X., Taxapa Е. Анализ ДНК в архивных образцах и его применение для изучения патогенеза опухолей//Методы. Молекулярная клиническая диагностика М.: Мир, — 1999 — с. 395−428.
- Beckman J.S., Soller М. Restriction fragment length polymorphism in genetic improvement: Methodologies mapping and costs // Theory and Apply Genet. 1983, — V.67. — p. 35−43.
- Beckman J.S. Oligonucleotide polymorphism is a new tool for genomic genetics. Bio/Technology 5, 1988, p. 573−576.
- Bidanel J.P., Milan D., Iannuccelli N. et al. Detection of quantitative trait loci for growth and fatness in pigs. Genet Sei. Evol. 2001 May-Jun-33(3): p. 289−309.
- Billey LO, Erickson AK, Francis DH. Multiple receptors on porcine intestinal epithelial cells for the three variants of Escherichia coli K88 fimbrial adhesin. Vet. Microbiol. 1998 Jan 16−59 (2−3): p.203−12.
- Binder S., Hormansdorfer K.-U., Gotz S.,, Thaller G., Fries R. Untersuchungum uber die Allelfrequenzen des Fucosyltransferase-1 Gens in bayerichen Schweinpopulation, Technische Universitat Munchen, September 2001.
- Botstein D., White R.L., Skolnick M., Davis R.W. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphism. American J. Human Genetics 32, 1980, p. 314−331.
- Casas-Carillo E., Prill-Adams A., Price S.G., Clutter A.C., Kirkpatrick B.W. Relationship of growth hormone and insulin-like growth factor-1 genotype with growth and carcass traits in swine Anim. Genet. 1997a -28.-p. 88−93.
- Davis G.P., DeNise S.K. The impact of genetic markers on selection. CSIRO Tropical Agriculture. Brisbane, Australia. J Anim. Sei. 1998 Sep-76 (9): p. 2331−9.
- Davies W, Hoyheim B, Chaput B, Archibald A.L., Frelat G. Characterization of microsatellites from flow-sorted porcine chromosome 13. Mamm. Genome 1994 Nov- 5 (11): p. 707−11.
- Donnis-Keller H. et al. (30 Autoren). A genetic linkage map of the human genome. Cell 51, 1987, p. 319−337.
- Francis D.H., Erickson A.K., Grange P.A. K88 adhesins of enterotoxigenic Escherichia coli and their porcine enterocyte receptors. Adv Exp. Med. Biol. 1999- 473: p. 147−54.
- Fries R., Ruddle F.H. Gene mapping in domestic animals. In Proc. 10th Belsville Symposium in Agricultural Research, vol. 10, (ed. By J. St. John), 1986, p. 19−37.
- Fujii J., Otdu K., et al. Identification of a mutation in porcine ryanodine receptor associated with malignant hyperthermia. Science. 253: p. 448−451.
- Grunwald K.A., Schueler K., Uelmen P.J., Lipton B.A., Kaiser M., Buhman K., Attie A.D.//J. Lipid Res. 1999. — 40. — p. 475−485.
- Hahn E.: Adhesive organelles of pathogenic Escherichia coli. Difference in polymeric structures of fimbriae and pili as demonstrated on Fl8 fimbriae and type 1 pili. Thesis, Mathematisch Naturwissenschaftliche Fakultat, Universitat Zurich, 2002.
- Hahn E., Wild P., Hermanns U. et al. Exploring the 3D Molecular Architecture of Escherichia coli Type 1 Pili. J. Mol. Biol. 323: 2002- p. 845 857.
- Hasler-Rapacz J., Ellegren H., Andersson L., Kirkpatrick B.W., Fridolfsson A.K., Rapacz J.// Anim.Genet. 1996. — 27(Suppl.2). — p. 113.
- Hasler-Rapacz J., Ellegren H., Fridolfsson A.K., Kirkpatrick B.W., Kirk S., Andersson L., Rapacz J.//Am. J./Med. Genet. 1998. — 76. — p. 379−386.
- Herman N., Botteldoorn S. E. coliF18 and a polymorphism in the aa (l, 2) fiicosyltransferase gene. Department of Animal Production, Facultyof Agricultural and Applied Relation between colibacillosis, Biological Sciences, Ghent University., 2002.
- Hu Z.L., Dong W.G., Song Y.C. Theoretical studies of QTL analysis of complex genetic diseases in humans. Yi Chuan Xue Bao. Chinese. 2002 Feb- 29(2): p. 101−4.
- Innis M.A., Gelfand D.H. Optimization of PCRs. In Innis M.A., Gelfand D.H., Sninsky J.J., White T.J. PCR protocols: A guide to methods and applications// Academic Press, San Diego. 1990. — p. 3−12.
- Jeffreys A.J., V Wilson, S.L. Thein. Hypervariable «minisatellite» regions in human DNA. Nature 314, 1985, p. 67−73.
- Jeon J.H., Carlborg O., Tornsten A. et al.//Nat. Genet. 1999. — 21 (Suppl.2). — p. 157−158.
- Jeyasingham M.D., Butty P., King T.P., Begbie R., Kelly D. Escherichia coli K88 receptor expression in intestine of disease-susceptible weaned pigs. Vet Microbiol. 1999 Aug 31- 68 (3−4): p. 219−34.
- Jiang Z.-H., Gibson J.P.// Mamm.Genome.- 1999. 10. — p. 191−193.
- Jin L.Z., Zhao X. Intestinal receptors for adhesive fimbriae of enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) K88 in swine~a review. Appl. Microbiol Biotechnology. 2000 Sep- 54 (3): p. 311−8. Review.
- Jin L.Z., Marquardt R.R., Baidoo S.K., Frohlich A.A. Characterization and purification of porcine small intestinal mucus receptor for Escherichia coli K88ac fimbrial adhesin. Immunol. Med Microbiol. 2000 Jan-27 (1): p. 17−22.
- Kan Y.W., Sozy A.M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 75, 1978, p. 56 315 636.
- Kijas J.M., Wales R., Tornsten A., Chardon P., Moller M., Andersson L.//Genetics.- 1998.- 150.-p. 1177−1185.
- Knorr C., Moser G., Muller E., Geldermann H. Associations between GH gene variations with performance traits in F2 generations of European Wild Boar, Pietrain and Meishan Pigs. Anim. Genet. 1997. 28: p. 124−128.
- Lee S., Moser G., Cepoca S., Knoll A., Chen Y., Muller E., Geldermann H., Moran CM 26th Int. Conf. Anim. Genetics. 1998. — E.047.
- Li N., Zhao Y.F., Xiao L., Zhang F.J. et al.// Proc. 6th World Cong. Genet. Appl. Livest. Prod. Armidale. — 11−16.01.1998. -26. — p. 403−408.
- Max F. Rothschild. Identification of major genes and quantitative trait loci in swine. Department of Animal Science Iowa State University, Ames, Iowa 50 011, USA 1997.
- McGraw Linda. New test could help breed edema-resistant pigs. News Service Agricultural Research Service, USDA July 6, 1999.
- Meijerink E., Fries R., Vogeli P. et al. Two alpha (l, 2) fucosyltransferase genes on porcine chromosome 6ql 1 are closely linked tothe blood group inhibitor (s) and Escherichia coli F18 receptor (ECF18R) loci. Mamm. Genome 1997: 8 (10), p. 736−741.
- Messer L., Wang L., Yelich J., Pomp D., Geisert R., Rotshild M.F. Mapping and investigation of candidate genes for litter size in French Large White pigs. Anim. Genet. 1996a. -27. — p. 175−177.
- Messer L., Wang L., Rotshild M.F.// Anim. Genet. 1996b. -27(Suppl.2) — p. 114.
- Messer L., Wang L., Yelich J., Pomp D., Geisert R., Rotshild M.F.// Mamm. Genome. 1996c. — 7. — p. 396.
- Milan D., Jeon J.T., Looft C., Amarger V. et al.//Science. 2000. — p. 288.
- Nagybela W., Shannon C., Imberechts H., Bertschinger H.U., Nystrom E., Casey T. Biologic relationship between Fl07 (F18ab) and 2134p (F18ac) fimbriae of enterotoxigenic and verotoxigenic Escherichia coli isolated from weaned pigs, 1998.
- Nakamura Y.M., Leppert P.O., Connell R., Wolff T. et al. Variable number of tandem repeat (VNTR) markers for human gene mapping. Science 235, 1987, p. 1616−1622.
- Nagy Be’La, Richard A., Wilson, Thomas S. Whittam. Genetic Diversity among Escherichia coli Isolates Carrying F18 Genes from Pigs with Porcine Postweaning Diarrhea and Edema Disease. Journal of clinical microbiology, 1999.
- Nezer C., Moreau L., Brouwers B., Coppieters W. et al. // Nat. Genet. 1999.-21.-p. 155−156.
- Nielsen V.H., Larsen N.J., Agergaard N. Association of DNA polymorphism in the growth hormone gene with basal plasma growth hormone concentration and production traits in pigs. J. Anim. Breed. Genet. — 1995. — 112. — p. 205−212.
- Nielsen V.H., Davoli R., Korsgaard I.R., Thomsen B., Bigi D., Russo V. Association of a DNA Polymorphism in the aminopepitdase N (ANPEP) locus with production traits in pigs. Anim. Genet. 1996 — 27 (Suppl. 2): p. 115.
- Ouwehand A.C., Conway P.L. Purification and characterization of a component produced by Lactobacillus fermentum that inhibits the adhesion of K88 expressing Escherichia coli to porcine ileal mucus. J Appl. Bacteriol. 1996 Mar-80 (3): p. 311−8.
- Patterson A.H., E.S. Lander, J.G. Hewitt et al. Resolution of quantitative traits into Mendelian factors by using a complete linkage map of restriction fragment length polymorphism. Nature 335, 1988, p. 721−726.
- Peelman L.J. Genetic investigation of the resistance mechanisms of the pig against diarrhea caused by E. coli Verh. K. Acad. Geneeskd. Belg. 1999- 61 (4): p. 489−515. Dutch.
- Rothschild M.F., Jacobson C., Vaske D., Tuggle C., Wang L. et al The Estrogen receptor locus is associated with a major gene influencing litter size in pigs. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996. — 93. — p. 201−205.
- Saiki R.K., Scharf S., Faloona F., Mullis K.B. et al Science, 230, p. 1350, 1985.
- Snodgrass D.R., Chandler D.S., Makin T.J. Inheritance of Escherichia coli K88 adhesion in pigs: identification of nonadhesive phenotypes in a commercial herd. VetRec. 1981 Nov 21- 109 (21): p. 461−3.
- Soumillion A., Erkens J.H.F., Lenstra J.A., Rettenberger G., Te Pas M.F.W. Genetic variation in the porcine myogenin gene locus. Mamm. Genome, 1997−8 (8), p. 564−568.
- Stancekova K., Vasicek D., Peskovicova D., Bulla J., Kubek A.//Anim. Genet. Effect of genetic variability of the porcine pituitary-specific transcription factor (Pit-1) on carcass traits in pigs. 1999. — 30. -p. 313−315.
- Te Pas M.F.W., Harders F.H., Soumillion A., Verburg F.J., Meuwissen T.H.E. // 26th Int. Conf. of Anim. Genet. 1998. -E048.
- The F4 fimbrial antigen of Escherichia coli and its receptors. Vet Microbiol. 2000 Feb- 71 (3−4): p. 223−44. Review. PMID: 10 703 706 PubMed indexed for MEDLINE.,
- Van Poucke M., Yerle M., Tuggle C., Piumi F., Genet C., Van. Zeveren A., Peelman L.J. Integration of porcine chromosome 13 maps. Cytogenet. Cell Genet. 2001- 93 (3−4): p. 297−303. PMID: 11 528 129 PubMed indexed for MEDLINE.
- Vogeli P., Bertschinger. H.-U. OedemKrankneit und Colidurchfall beim Schwein. Nr. 53, Juni 1999.
- Vogeli P. Search for marker genes linked to the genes specifying receptors of F18 fimbriated Escherichia coli strains causing oedema disease and postweaning diarrhoea in the pig. Vet. Med. Faculty, University Zurich. 19/02/02.
- Wang J. Optimal marker-assisted selection to increase the effective size of small populations. Institute of Zoology, Zoological Society of London, Regent’s Park, London NW1 4RY, United Kingdom. Genetics 2001 Feb- 157(2): p. 867−74.
- White R., Lalouel J.M. Chromosome mapping with DNA markers. Scient. American 258, 1988, p. 20−28.
- Wu X.L., Shi Q.S., Liu X.C., Peng Y.L., Jiang J., Yang S.L., Xiao B.N. A search for chromosome 13 QTL in a complex pig family. Yi Chuan Xue Bao. 2002 Jan- 29 (1): p. 1−6. Chinese.
- YuT.-P., Rothschild M.F., Tugglle C.K. et al. Pit-1 genotypes are associated with birth weight in three unrelated pig resource families. J. Anim. Sci //J. Anim. Sci. 1996. — 74(Suppl.l). — p. 122.
- Zhao Y.F., Li N., Chen Y., Wu Ch.X.//Acta Vet. Zootech. Sinica. -1998.-29.-23−26.