ΠΠ΅Π½Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠ°Ρ Ρ Π°ΡΠ°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΡΡΠΈΠΊΠ° ΠΈ ΠΏΠ°ΡΠΏΠΎΡΡΠΈΠ·Π°ΡΠΈΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ² ΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠ°Π»ΠΎΡΠΊΠΈ-Π°Π½ΡΠ°Π³ΠΎΠ½ΠΈΡΡΠΎΠ² ΡΠΈΡΠΎΠΏΠ°ΡΠΎΠ³Π΅Π½Π½ΡΡ Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠΉ ΠΈ Π³ΡΠΈΠ±ΠΎΠ²
Π‘Π»Π΅Π΄ΡΡΡΠΈΠΌ ΡΡΠ°ΠΏΠΎΠΌ Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ B. subtilis ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΠΠ Π΄Π²ΡΠΌΡ ΡΠ΅ΡΠΌΠ΅Π½ΡΠ°ΠΌΠΈ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠΈΠΈ Ρ ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ²ΡΠ΅ΠΌΠ΅Π½Π½ΡΠΌ ΠΌΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Π±ΠΈΠΎΡΠΈΠ½ΠΎΠΌ. ΠΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΡΠ΅ΡΡΡ Π΄Π²Π΅ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·Ρ — ΠΊΡΡΠΏΠ½ΠΎΡΠ΅ΠΏΡΡΠ°Ρ ΠΈ ΠΌΠ΅Π»ΠΊΠΎΡΠ΅ΠΏΡΡΠ°Ρ. ΠΠΎΠΈΡΠΊ in-silico Π²ΡΡΠ²ΠΈΠ», ΡΡΠΎ Π»ΡΡΡΠ΅ΠΉ ΠΊΡΡΠΏΠ½ΠΎΡΠ΅ΠΏΡΡΠ΅ΠΉ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·ΠΎΠΉ ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ SgsI, ΠΈΠΌΠ΅ΡΡΠΈΠΉ ΡΠ°ΠΉΡ ΡΠ·Π½Π°Π²Π°Π½ΠΈΡ ΠΈ ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΡ GGvCGCGCC. ΠΠ°Π½Π½ΡΠΉ ΡΠ΅ΡΠΌΠ΅Π½Ρ ΠΈΠΌΠ΅Π΅Ρ 39 ΡΠ°ΠΉΡΠΎΠ² ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΡ Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ΅ B. subtilis… Π§ΠΈΡΠ°ΡΡ Π΅ΡΡ >
ΠΠ΅Π½Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠ°Ρ Ρ Π°ΡΠ°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΡΡΠΈΠΊΠ° ΠΈ ΠΏΠ°ΡΠΏΠΎΡΡΠΈΠ·Π°ΡΠΈΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ² ΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠ°Π»ΠΎΡΠΊΠΈ-Π°Π½ΡΠ°Π³ΠΎΠ½ΠΈΡΡΠΎΠ² ΡΠΈΡΠΎΠΏΠ°ΡΠΎΠ³Π΅Π½Π½ΡΡ Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠΉ ΠΈ Π³ΡΠΈΠ±ΠΎΠ² (ΡΠ΅ΡΠ΅ΡΠ°Ρ, ΠΊΡΡΡΠΎΠ²Π°Ρ, Π΄ΠΈΠΏΠ»ΠΎΠΌ, ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»ΡΠ½Π°Ρ)
ΠΠΠΠΠ’ΠΠ§ΠΠ‘ΠΠΠ― Π₯ΠΠ ΠΠΠ’ΠΠ ΠΠ‘Π’ΠΠΠ Π ΠΠΠ‘ΠΠΠ Π’ΠΠΠΠ¦ΠΠ― Π¨Π’ΠΠΠΠΠ Π‘ΠΠΠΠΠ ΠΠΠΠΠ§ΠΠ — ΠΠΠ’ΠΠΠΠΠΠ‘Π’ΠΠ Π€ΠΠ’ΠΠΠΠ’ΠΠΠΠΠΠ«Π₯ ΠΠΠΠ’ΠΠ ΠΠ Π ΠΠ ΠΠΠΠ
ΠΠΊΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈ ΡΠΈΡΡΡΠΌ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠΌ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»Ρ Π½Π°Π΄ ΡΠΈΡΠΎΠΏΠ°ΡΠΎΠ³Π΅Π½Π°ΠΌΠΈ ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄, ΠΏΡΠ΅Π΄ΠΏΠΎΠ»Π°Π³Π°ΡΡΠΈΠΉ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ²-Π°Π½ΡΠ°Π³ΠΎΠ½ΠΈΡΡΠΎΠ². ΠΠ΄Π½ΠΈΠΌ ΠΈΠ· Π½Π°ΠΈΠ±ΠΎΠ»Π΅Π΅ ΡΠΈΡΠΎΠΊΠΎ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΡΠ΅ΠΌΡΡ Π²ΠΈΠ΄ΠΎΠ² ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ²-Π°Π½ΡΠ°Π³ΠΎΠ½ΠΈΡΡΠΎΠ² ΡΠΈΡΠΎΠΏΠ°ΡΠΎΠ³Π΅Π½Π½ΡΡ Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠΉ ΠΈ Π³ΡΠΈΠ±ΠΎΠ² ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ ΡΠ΅Π½Π½Π°Ρ ΠΏΠ°Π»ΠΎΡΠΊΠ° — B. subtilis [1, P. 32]. ΠΡΠΎ ΠΎΠ±ΡΡΡΠ½ΡΠ΅ΡΡΡ Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΌΠΈ ΡΠ²ΠΎΠΉΡΡΠ²Π°ΠΌΠΈ Π΄Π°Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΠΈΠ΄Π°, ΡΠ°ΠΊΠΈΠΌΠΈ ΠΊΠ°ΠΊ ΡΠ°ΡΠΏΡΠΎΡΡΡΠ°Π½Π΅Π½Π½ΠΎΡΡΡΡ Π² ΠΏΡΠΈΡΠΎΠ΄Π΅ ΠΈ, ΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎ, ΠΏΡΠΈΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±Π»ΡΠ΅ΠΌΠΎΡΡΡΡ ΠΊ ΡΠ°Π·Π»ΠΈΡΠ½ΡΠΌ ΡΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΡΠΌ ΡΡΠ΅Π΄Ρ, Π² ΡΠΎΠΌ ΡΠΈΡΠ»Π΅ Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ ΡΠ³Π½Π΅ΡΠ΅Π½ΠΈΡ Π΄ΡΡΠ³ΠΈΡ Π²ΠΈΠ΄ΠΎΠ² ΠΊΠΎΠ½ΠΊΡΡΠ΅Π½ΡΠ½ΡΡ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ². ΠΡΠΎΠΌΠ΅ ΡΠΎΠ³ΠΎ, ΡΠ΅Π½Π½Π°Ρ ΠΏΠ°Π»ΠΎΡΠΊΠ° ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΠ΅Ρ ΡΠΏΠΎΡΡ, ΡΡΠΎ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΠ΅Ρ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ°ΡΡ Π±ΠΈΠΎΠΏΡΠ΅ΠΏΠ°ΡΠ°ΡΡ Π΄ΠΎΡΡΠ°ΡΠΎΡΠ½ΠΎ ΡΡΠ°Π±ΠΈΠ»ΡΠ½ΡΠ΅ ΠΏΡΠΈ Ρ ΡΠ°Π½Π΅Π½ΠΈΠΈ. ΠΠ»Ρ Π½Π°Π΄Π΅ΠΆΠ½ΠΎΠΉ ΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΈ ΠΈ ΠΏΠ°ΡΠΏΠΎΡΡΠΈΠ·Π°ΡΠΈΠΈ ΡΠ°ΠΊΠΈΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ² Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎ ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΡΠΎΠ²ΡΠ΅ΠΌΠ΅Π½Π½ΡΡ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΈΠΊ Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ². ΠΠ΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΠ΅Ρ ΠΏΡΠΈΡΠ²ΠΎΠΈΡΡ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎ-Π³Π΅Π½Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ «ΡΡΡΠΈΡ -ΠΊΠΎΠ΄» ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠΌΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΡ, ΡΡΠΎ ΠΊΡΠ°ΠΉΠ½Π΅ Π²Π°ΠΆΠ½ΠΎ ΠΏΡΠΈ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ² Π½Π° ΠΏΡΠ°ΠΊΡΠΈΠΊΠ΅, ΠΏΡΠΈ ΡΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠΈ ΡΠΏΠΎΡΠ½ΡΡ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² ΠΈ ΠΏΡΠΈ Ρ ΡΠ°Π½Π΅Π½ΠΈΠΈ ΠΊΠΎΠ»Π»Π΅ΠΊΡΠΈΠΉ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ² Π² Π»Π°Π±ΠΎΡΠ°ΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΡΡ . ΠΠΎΠΌΠΈΠΌΠΎ ΡΡΠΎΠ³ΠΎ, Π΅ΡΡΡ Π²Π΅ΡΠΎΡΡΠ½ΠΎΡΡΡ ΡΠΎΠ³ΠΎ, ΡΡΠΎ ΠΎΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½ΡΠΉ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ ΠΠΠ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ Π±ΡΡΡ ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ Ρ Π²Π°ΠΆΠ½ΠΎΠΉ Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΉ ΠΈΠ»ΠΈ Ρ ΠΎΠ·ΡΠΉΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΠΎ-ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π½ΠΎΠΉ ΠΎΡΠΎΠ±Π΅Π½Π½ΠΎΡΡΡΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠ°, ΡΡΠΎ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΠΈΡ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°ΡΡ Π΅Π³ΠΎ Π² ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π΅ ΠΌΠ°ΡΠΊΠ΅ΡΠ° Π΄Π°Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ²ΠΎΠΉΡΡΠ²Π° ΠΏΡΠΈ ΠΈΠ·ΡΡΠ΅Π½ΠΈΠΈ Π΄ΡΡΠ³ΠΈΡ ΠΏΠΎΡΠ΅Π½ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΠΎ ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π½ΡΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ².
Π‘ΡΡΠ΅ΡΡΠ²ΡΠ΅Ρ ΠΌΠ½ΠΎΠΆΠ΅ΡΡΠ²ΠΎ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠ² ΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ². Π Π½Π°ΡΡΠΎΡΡΠ΅Π΅ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ·Π½Π°ΡΠ½ΠΎ Π΄ΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, ΡΡΠΎ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄Ρ, ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡΠ΅ Π½Π° ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠΎΡΡΠΈΠ·ΠΌΠ΅ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ ΠΠΠ (Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅), ΡΠ²Π»ΡΡΡΡΡ Π½Π°ΠΈΠ±ΠΎΠ»Π΅Π΅ ΡΡΠ²ΡΡΠ²ΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠΌΠΈ ΠΈ Π²ΠΎΡΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΡΠΌΠΈ [2, P. 4; 3, P. 136].
ΠΠ° ΡΠ΅Π³ΠΎΠ΄Π½Ρ ΡΠ°ΠΌΡΠΌ ΡΠΎΡΠ½ΡΠΌ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠΌ Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ ΠΠ ΠΠ (Π΄Π²ΠΎΠΉΠ½ΠΎΠ΅ ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ ΠΈΠ·Π±ΠΈΡΠ°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΠ΅ ΠΌΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅), ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠΉ Π²ΠΏΠ΅ΡΠ²ΡΠ΅ Π±ΡΠ» ΡΠ°Π·ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π½ Π΄Π»Ρ ΠΊΠ»ΠΈΠ½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ ΠΈΠ·ΠΎΠ»ΡΡΠΎΠ² ΠΏΠ°ΡΠΎΠ³Π΅Π½Π½ΡΡ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ² — Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus ΠΈ Salmonella spp. [4, P. 284; 5, P. 417]. Π Π΅Π·ΡΠ»ΡΡΠ°ΡΠΎΠΌ Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠΌ ΠΠ ΠΠ ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ Π³ΡΡΠΏΠΏΠ° ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ Π² Π²ΠΈΠ΄Π΅ ΠΏΠΎΠ»ΠΎΡ Π½Π° ΡΠΈΠ»ΡΡΡΠ΅, ΡΠ°ΡΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΡ ΡΠΏΠ΅ΡΠΈΡΠΈΡΠ½ΠΎ Π΄Π»Ρ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠ³ΠΎ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠ° ΠΈΠ»ΠΈ Π±Π»ΠΈΠ·ΠΊΠΎΡΠΎΠ΄ΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΠΎΠΉ Π³ΡΡΠΏΠΏΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ². Π’ΠΎΡΠ½ΠΎΡΡΡ ΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΈ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ², ΡΠ°ΡΡΡΠΈΡΡΠ²Π°Π΅ΠΌΠ°Ρ ΠΏΠΎ ΠΈΠ½Π΄Π΅ΠΊΡΡ Π΄ΠΈΡΠΊΡΠΈΠΌΠΈΠ½Π°ΡΠΈΠΈ [6, P. 2465] ΠΏΡΠ΅Π²ΡΡΠ°Π΅Ρ ΡΠΎΡΠ½ΠΎΡΡΡ ΡΠ΅ΠΊΡΡΠ΅Π³ΠΎ «Π·ΠΎΠ»ΠΎΡΠΎΠ³ΠΎ ΡΡΠ°Π½Π΄Π°ΡΡΠ°» Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ (ΠΏΡΠ»ΡΡ-Π³Π΅Π»Ρ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΡΠΎΡΠ΅Π·) ΠΈ Π΄ΠΎΡΡΠΈΠ³Π°Π΅Ρ Π΄Π»Ρ ΠΎΡΠ΄Π΅Π»ΡΠ½ΡΡ Π²ΠΈΠ΄ΠΎΠ² ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ² Π·Π½Π°ΡΠ΅Π½ΠΈΡ 0,98.
ΠΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΈΠΊΠ°. ΠΠ΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ² ΠΏΡΠ΅Π΄ΠΏΠΎΠ»Π°Π³Π°Π΅Ρ Π²ΡΠ΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π²ΡΡΠΎΠΊΠΎΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠΉ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ ΠΠΠ. ΠΠ° ΠΏΠ΅ΡΠ²ΠΎΠΌ ΡΡΠ°ΠΏΠ΅ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΉ Π±ΡΠ»Π° ΠΏΡΠ΅Π΄Π»ΠΎΠΆΠ΅Π½Π° Π½Π°Π΄Π΅ΠΆΠ½Π°Ρ ΠΈ Π±ΡΡΡΡΠ°Ρ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΈΠΊΠ° Π²ΡΠ΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΡ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ ΠΠΠ ΠΈΠ· ΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠ°Π»ΠΎΡΠΊΠΈ. ΠΠ»Ρ ΡΡΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌ ΠΊΡΠ»ΡΡΠΈΠ²ΠΈΡΡΡΡ Π² ΡΡΠ΅Π΄Π΅ Ρ ΡΠ΅Π»ΡΡ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΡΠΈΡΡΠΎΠΉ ΠΊΡΠ»ΡΡΡΡΡ. ΠΡΠ»ΠΎ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΎ ΡΡΠ΄ ΠΏΠΎΠ΄Ρ ΠΎΠ΄ΠΎΠ² ΠΊ Π²ΡΠ΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΡ ΠΠΠ ΠΈ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄, ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡΠΉ Π½Π° ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ Π»ΠΈΠ·ΠΎΡΠΈΠΌΠ° Π΄Π»Ρ ΡΠ°Π·ΡΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΡΠ΅Π½ΠΊΠΈ, ΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π»ΡΡ Π½Π°ΠΈΠ±ΠΎΠ»Π΅Π΅ ΡΡΡΠ΅ΠΊΡΠΈΠ²Π½ΡΠΌ.
Π Ρ ΠΎΠ΄Π΅ ΡΠ°Π±ΠΎΡΡ Π±ΡΠ»Π° Π²ΡΠ±ΡΠ°Π½Π° Π½Π°ΠΈΠ±ΠΎΠ»Π΅Π΅ ΠΏΡΠΎΡΡΠ°Ρ ΠΈ ΡΠ΅Ρ Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ½Π°Ρ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΈΠΊΠ° Π²ΡΠ΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΡ Π²ΡΡΠΎΠΊΠΎΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠΉ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ ΠΠΠ B. subtilis. ΠΡΠ΅ ΡΡΠ°ΠΏΡ ΡΡΠΎΠΉ ΠΎΠΏΡΠΈΠΌΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΏΡΠΎΡΠ΅Π΄ΡΡΡ ΠΈΠ·Π»ΠΎΠΆΠ΅Π½Ρ Π½ΠΈΠΆΠ΅:
ΡΠ΅Π½ΡΡΠΈΡΡΠ³ΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΊΡΠ»ΡΡΡΡΠ°Π»ΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ΅Π΄Ρ ΠΈ ΡΠΎΠ±ΡΠ°ΡΡ Π½Π°Π΄ΠΎΡΠ°Π΄ΠΎΡΠ½ΡΡ ΠΆΠΈΠ΄ΠΊΠΎΡΡΡ. ΠΡΠ°Π΄ΠΎΠΊ ΠΊΡΠ»ΡΡΡΡΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ ΡΡΠ΅Π΄Ρ Π²ΡΠ±ΡΠΎΡΠΈΡΡ;
ΠΊΡΠ»ΡΡΠΈΠ²ΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ B. subtilis Π² ΡΡΠΎΠΉ ΠΏΡΠΎΠ·ΡΠ°ΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΡΠ΅Π΄Π΅ ΠΏΡΠΈ 30ΡΠ‘ Π² ΡΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ Π½ΠΎΡΠΈ (ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅ΡΠ½ΠΎ 16 ΡΠ°ΡΠΎΠ²), Π°ΡΡΠΎΠ±Π½ΠΎ, Π½Π° ΡΠ΅ΠΉΠΊΠ΅ΡΠ΅ 200 ΠΎΠ±/ΠΌΠΈΠ½;
ΡΠ΅Π½ΡΡΠΈΡΡΠ³ΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ 3 ΠΌΠ» ΠΊΡΠ»ΡΡΡΡΡ 8000 ΠΎΠ±/ΠΌΠΈΠ½ 5 ΠΌΠΈΠ½ΡΡ, ΡΠ»ΠΈΡΡ Π½Π°Π΄ΠΎΡΠ°Π΄ΠΎΡΠ½ΡΡ ΠΆΠΈΠ΄ΠΊΠΎΡΡΡ;
ΡΡΡΠΏΠ΅Π½Π΄ΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΎΡΠ°Π΄ΠΎΠΊ Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠΉ Π² 300Β΅l Π±ΡΡΠ΅ΡΠ° TES (50 mMTris-HCL -20 mMEDTA — 10 mM NaCL, 8,0), Π²Π½Π΅ΡΡΠΈ 30Β΅l Π»ΠΈΠ·ΠΎΡΠΈΠΌΠ° (10 ΠΌΠ³/ΠΌΠ», Π±ΡΡΠ΅Ρ Π’Π -10 ΠΌΠΡΡΠΈΡ-1ΠΌΠΌ ΠΠΠ’Π), ΡΠΌΠ΅ΡΠ°ΡΡ, ΠΈΠ½ΠΊΡΠ±ΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΏΡΠΈ 37ΡΠ‘ 60 ΠΌΠΈΠ½ΡΡ;
Π²Π½Π΅ΡΡΠΈ 20 Β΅l SDS (10% Π² Π²ΠΎΠ΄Π΅), ΡΠΌΠ΅ΡΠ°ΡΡ, ΠΈΠ½ΠΊΡΠ±ΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΏΡΠΈ 37ΡΠ‘ 15 ΠΌΠΈΠ½ΡΡ;
Π²Π½Π΅ΡΡΠΈ ΡΠ°Π²Π½ΡΠΉ ΠΎΠ±ΡΠ΅ΠΌ ΡΠΌΠ΅ΡΠΈ ΡΠ΅Π½ΠΎΠ»-Ρ Π»ΠΎΡΠΎΡΠΎΡΠΌ-ΠΈΠ·ΠΎΠ°ΠΌΠΈΠ»ΠΎΠ²ΡΠΉ ΡΠΏΠΈΡΡ, ΠΌΠ΅ΡΠ°ΡΡ 3 ΠΌΠΈΠ½ΡΡΡ, ΡΠ΅Π½ΡΡΠΈΡΡΠ³ΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ 10 000 ΠΎΠ±/ΠΌΠΈΠ½ 10 ΠΌΠΈΠ½ΡΡ;
ΠΎΡΠΎΠ±ΡΠ°ΡΡ Π²Π΅ΡΡ Π½ΡΡ ΡΠ°Π·Ρ Π² Π΄ΡΡΠ³ΡΡ ΠΏΡΠΎΠ±ΠΈΡΠΊΡ;
ΠΏΡΠΈΠ±Π°Π²ΠΈΡΡ ΡΠ°Π²Π½ΡΠΉ ΠΎΠ±ΡΠ΅ΠΌ ΠΈΠ·ΠΎΠΏΡΠΎΠΏΠΈΠ»ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠΏΠΈΡΡΠ°, ΡΠΌΠ΅ΡΠ°ΡΡ;
ΡΠ΅Π½ΡΡΠΈΡΡΠ³ΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ, ΠΎΡΠ°Π΄ΠΎΠΊ ΠΠΠ ΠΏΡΠΎΠΌΡΡΡ 70% ΡΡΠΈΠ»ΠΎΠ²ΡΠΌ ΡΠΏΠΈΡΡΠΎΠΌ, ΠΏΠΎΠ΄ΡΡΡΠΈΡΡ ΠΈ ΡΠ°ΡΡΠ²ΠΎΡΠΈΡΡ Π² 50Β΅l Π±ΡΡΠ΅ΡΠ° Π’Π.
Π‘Π»Π΅Π΄ΡΡΡΠΈΠΌ ΡΡΠ°ΠΏΠΎΠΌ Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ B. subtilis ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΠΠ Π΄Π²ΡΠΌΡ ΡΠ΅ΡΠΌΠ΅Π½ΡΠ°ΠΌΠΈ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠΈΠΈ Ρ ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ²ΡΠ΅ΠΌΠ΅Π½Π½ΡΠΌ ΠΌΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Π±ΠΈΠΎΡΠΈΠ½ΠΎΠΌ. ΠΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΡΠ΅ΡΡΡ Π΄Π²Π΅ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·Ρ — ΠΊΡΡΠΏΠ½ΠΎΡΠ΅ΠΏΡΡΠ°Ρ ΠΈ ΠΌΠ΅Π»ΠΊΠΎΡΠ΅ΠΏΡΡΠ°Ρ. ΠΠΎΠΈΡΠΊ in-silico Π²ΡΡΠ²ΠΈΠ», ΡΡΠΎ Π»ΡΡΡΠ΅ΠΉ ΠΊΡΡΠΏΠ½ΠΎΡΠ΅ΠΏΡΡΠ΅ΠΉ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·ΠΎΠΉ ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ SgsI, ΠΈΠΌΠ΅ΡΡΠΈΠΉ ΡΠ°ΠΉΡ ΡΠ·Π½Π°Π²Π°Π½ΠΈΡ ΠΈ ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΡ GGvCGCGCC. ΠΠ°Π½Π½ΡΠΉ ΡΠ΅ΡΠΌΠ΅Π½Ρ ΠΈΠΌΠ΅Π΅Ρ 39 ΡΠ°ΠΉΡΠΎΠ² ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΡ Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ΅ B. subtilis ΠΈ ΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΠΈΡ «Π»ΠΈΠΏΠΊΠΈΠ΅» ΠΊΠΎΠ½ΡΡ, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ ΠΌΠ΅ΡΡΡΡΡ Π±ΠΈΠΎΡΠΈΠ½ΠΈΠ»ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡΠΌ Π΄Π΅Π·ΠΎΠΊΡΠΈΡΠΈΡΠΎΠ·ΠΈΠ½ΠΎΠΌ (Bio-dCTP) Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ Taq-ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠ΅ΡΠ°Π·Ρ. ΠΠΎΠ»ΡΡΠ°Π΅ΠΌΡΠ΅ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΡ ΠΠΠ Π½Π΅ ΠΌΠΎΠ³ΡΡ Π±ΡΡΡ ΡΠ°Π·Π΄Π΅Π»Π΅Π½Ρ Π² ΠΎΠ±ΡΡΠ½ΠΎΠΌ Π°Π³Π°ΡΠΎΠ·Π½ΠΎΠΌ Π³Π΅Π»Π΅, ΡΠ°ΠΊ ΠΊΠ°ΠΊ ΡΠ²Π»ΡΡΡΡΡ ΡΠ»ΠΈΡΠΊΠΎΠΌ ΠΊΡΡΠΏΠ½ΡΠΌΠΈ. ΠΠΎΡΡΠΎΠΌΡ, Π² ΡΠ΅Π°ΠΊΡΠΈΡ Π²Π²ΠΎΠ΄ΠΈΠΌ ΠΌΠ΅Π»ΠΊΠΎΡΠ΅ΠΏΡΡΡΡ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·Ρ. Π ΡΠ΅Π·ΡΠ»ΡΡΠ°ΡΠ΅ ΡΠ°ΠΊΠΎΠ³ΠΎ Π΄Π²ΠΎΠΉΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΡ ΡΠ°Π·ΠΌΠ΅Ρ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ ΠΎΠΏΡΠΈΠΌΠ°Π»ΡΠ½ΡΠΌ Π΄Π»Ρ ΡΠ°Π·Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΡ Π² Π°Π³Π°ΡΠΎΠ·Π½ΠΎΠΌ Π³Π΅Π»Π΅. ΠΡΠΎΠ±Π΅Π½Π½ΠΎΡΡΡΡ ΠΌΠ΅Π»ΠΊΠΎΡΠ΅ΠΏΡΡΠ΅ΠΉ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·Ρ ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ ΡΠΎ, ΡΡΠΎ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ°Π΅ΠΌΡΠ΅ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΡ ΠΠΠ ΠΈΠΌΠ΅ΡΡ Π»ΠΈΠ±ΠΎ ΡΡΠΏΡΠ΅, Π»ΠΈΠ±ΠΎ 3Ρ-Π²ΡΡΡΡΠΏΠ°ΡΡΠΈΠ΅ ΠΊΠΎΠ½ΡΡ, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ Π½Π΅ ΠΌΠΎΠ³ΡΡ Π²ΠΊΠ»ΡΡΠΈΡΡ Bio-dCTP. Π’Π°ΠΊΠΈΠΌ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠΌ, Π² ΡΠ΅Π°ΠΊΡΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ ΡΠΌΠ΅ΡΠΈ ΠΏΡΠΈΡΡΡΡΡΠ²ΡΠ΅Ρ ΠΎΠ³ΡΠ°Π½ΠΈΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠ΅ ΡΠΈΡΠ»ΠΎ ΠΌΠ΅ΡΠ΅Π½ΡΡ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ ΠΌΠΎΠ³ΡΡ Π±ΡΡΡ ΡΠ°Π·Π΄Π΅Π»Π΅Π½Ρ ΠΈ Π²ΠΈΠ·ΡΠ°Π»ΠΈΠ·ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Ρ.
ΠΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈ ΠΏΡΠΎΡΠ΅Π΄ΡΡΠ° Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΠ ΠΠ Π²ΠΊΠ»ΡΡΠ°Π΅Ρ 1) Π΄Π²ΠΎΠΉΠ½ΠΎΠ΅ ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ ΠΈΠ·Π±ΠΈΡΠ°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΠ΅ ΠΌΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ 2) ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΡΠΎΡΠ΅Π· Π² Π°Π³Π°ΡΠΎΠ·Π½ΠΎΠΌ Π³Π΅Π»Π΅ 3) ΠΏΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΎΡ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ Π½Π° Π½Π΅ΠΉΠ»ΠΎΠ½ΠΎΠ²ΡΠΉ ΡΠΈΠ»ΡΡΡ 4) Π΄Π΅ΡΠ΅ΠΊΡΠΈΡ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ Π½Π° ΡΠΈΠ»ΡΡΡΠ΅.
ΠΠ²ΠΎΠΉΠ½ΠΎΠ΅ ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ ΠΈΠ·Π±ΠΈΡΠ°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΠ΅ ΠΌΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΡΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡΡΡ ΠΊ Π²Π½Π΅ΡΠ΅Π½ΠΈΡ Π² ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΏΡΠΎΠ±ΠΈΡΠΊΡ 15 ΠΌΠΊΠ» Π²ΠΎΠ΄Ρ, 2 ΠΌΠΊΠ» 10-ΠΊΡΠ°ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π±ΡΡΠ΅ΡΠ° R (Fermentas™), 2 ΠΌΠΊΠ» Π²ΡΠ΄Π΅Π»Π΅Π½Π½ΠΎΠΉ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ ΠΠΠ ΠΈ 1 ΠΌΠΊΠ» ΡΠ΅ΡΠΌΠ΅Π½ΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΠΌΠ΅ΡΠΈ (Π΄Π²Π΅ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·Ρ, Taq-ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠ΅ΡΠ°Π·Π° ΠΈ ΠΌΠ΅ΡΠΊΠ° Bio-dCTP). ΠΠ½ΠΊΡΠ±Π°ΡΠΈΡ ΠΏΡΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡΡΡ Π² ΡΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ 2−3 ΡΠ°ΡΠΎΠ² ΠΏΡΠΈ 37 Β°C.
ΠΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΡΠΎΡΠ΅Π· ΠΏΡΠΎΠΈΡΡ ΠΎΠ΄ΠΈΡ Π² 0,8% Π°Π³Π°ΡΠΎΠ·Π½ΠΎΠΌ Π³Π΅Π»Π΅ Π΄Π»ΠΈΠ½ΠΎΠΉ20 ΡΠΌΠΏΡΠΈ Π½Π°ΠΏΡΡΠΆΠ΅Π½ΠΈΠΈ 60 Π Π² ΡΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ 16 ΡΠ°ΡΠΎΠ².
ΠΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΎΡ ΡΠ°Π·Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½ΡΡ Π² ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΡΠΎΡΠ΅Π·Π΅ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ Π½Π° Π½Π΅ΠΉΠ»ΠΎΠ½ΠΎΠ²ΡΠΉ ΡΠΈΠ»ΡΡΡ ΠΎΡΡΡΠ΅ΡΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ Π½Π΅ΠΌΠ΅Π΄Π»Π΅Π½Π½ΠΎ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΡΠΎΡΠ΅Π·Π° Π² Π΄ΠΈΡΡΠΈΠ»Π»ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Π½ΠΎΠΉ Π²ΠΎΠ΄Π΅ Π½Π° Π²Π°ΠΊΡΡΠΌΠ½ΠΎΠΌ ΠΏΡΠΈΠ±ΠΎΡΠ΅ (Π΄Π΅Π½Π°ΡΡΡΠ°ΡΠΈΡ ΠΈ Π½Π΅ΠΉΡΡΠ°Π»ΠΈΠ·Π°ΡΠΈΡ ΠΠΠ Π½Π΅ ΡΡΠ΅Π±ΡΠ΅ΡΡΡ). ΠΠ΅ΡΠ΅ΠΊΡΠΈΡ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ Π½Π° ΡΠΈΠ»ΡΡΡΠ΅ ΠΏΡΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡΡΡ Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ ΠΎΠ±ΡΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΠ²Π΅ΡΠ½ΠΎΠΉ Ρ ΠΈΠΌΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΉ ΡΠ΅Π°ΠΊΡΠΈΠΈ, ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Π½Π½ΠΎΠΉ Π½Π° Π²ΡΡΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΠΈ ΡΠ΅Π»ΠΎΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΠΎΡΡΠ°ΡΠ°Π·Ρ.
Π Π΅Π·ΡΠ»ΡΡΠ°ΡΡ. ΠΠΎΡΠ»Π΅ ΠΈΡΠΏΡΡΠ°Π½ΠΈΡ Π³ΡΡΠΏΠΏΡ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π· Π±ΡΠ»Π° ΠΎΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π° ΠΎΠΏΡΠΈΠΌΠ°Π»ΡΠ½Π°Ρ ΠΊΠΎΠΌΠ±ΠΈΠ½Π°ΡΠΈΡ Π΄Π»Ρ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΡΡΡΠ΅Π³ΠΎ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π² Π³Π΅Π½Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΉ ΠΏΠ°ΡΠΏΠΎΡΡΠΈΠ·Π°ΡΠΈΠΈ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ² B. subtilis — SgsI ΠΈ Eco32I. Π Π΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·Π° SgsI ΠΈΠΌΠ΅Π΅Ρ 39 ΡΠ°ΠΉΡΠΎΠ² ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΡ Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ΅ B. subtilis (ΡΠ΅ΠΎΡΠ΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈ ΠΌΠ°ΠΊΡΠΈΠΌΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠ΅ ΡΠΈΡΠ»ΠΎ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ Π±ΡΠ΄Π΅Ρ 78). ΠΠΎΠ»ΡΡΠ°Π΅ΠΌΡΠ΅ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΡ ΠΠΠ ΠΌΠΎΠ³ΡΡ Π±ΡΡΡ ΠΏΠΎΠΌΠ΅ΡΠ΅Π½Ρ Π±ΠΈΠΎΡΠΈΠ½ΠΎΠΌ Π² ΡΠ΅Π°ΠΊΡΠΈΠΈ ΠΠ ΠΠ. Π Π΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·Π° Eco32I ΠΈΠΌΠ΅Π΅Ρ 1684 ΡΠ°ΠΉΡΠ° ΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΡ, ΡΡΠΎ Π΄Π°Π΅Ρ ΡΡΠ΅Π΄Π½ΠΈΠΉ ΡΠ°Π·ΠΌΠ΅Ρ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠ° ΠΠΠ ΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠ°Π»ΠΎΡΠΊΠΈ 3000 ΠΏΠ°Ρ ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΉ, ΡΡΠΎ ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ ΠΎΠΏΡΠΈΠΌΠ°Π»ΡΠ½ΡΠΌ Ρ ΡΠΎΡΠΊΠΈ Π·ΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΡΠ°Π·Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΡ ΠΠΠ Π² 0,8% Π°Π³Π°ΡΠΎΠ·Π½ΠΎΠΌ Π³Π΅Π»Π΅. Π£ΠΊΠ°Π·Π°Π½Π½ΡΠ΅ ΡΠ΅ΡΡΡΠΈΠΊΡΠ°Π·Ρ Ρ ΠΎΡΠΎΡΠΎ ΡΠΎΠ²ΠΌΠ΅ΡΡΠΈΠΌΡ Π² ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΌ Π±ΡΡΠ΅ΡΠ΅ — Π±ΡΡΠ΅Ρ R (Fermentas™), Π½Π΅ ΠΏΡΠΎΡΠ²Π»ΡΡΡ «Π·Π²Π΅Π·Π΄Π½ΠΎΠΉ» Π°ΠΊΡΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡΠΈ, ΡΡΠ°Π±ΠΈΠ»ΡΠ½Ρ, Π΄ΠΎΡΡΠ°ΡΠΎΡΠ½ΠΎ ΡΠΏΠ΅ΡΠΈΡΠΈΡΠ½Ρ ΠΈ Π½Π΅ Π΄ΠΎΡΠΎΠ³ΠΈ.
ΠΠ΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΠ΅Ρ Π²ΡΡΠ²ΠΈΡΡ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ 30 ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ, ΡΠ°ΡΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΡ ΡΠΏΠ΅ΡΠΈΡΠΈΡΠ½ΠΎ Π² ΠΎΡΠ½ΠΎΡΠ΅Π½ΠΈΠΈ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠ³ΠΎ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠ°. ΠΠΎΡΠ»Π΅ ΠΎΠΏΡΠΈΠΌΠΈΠ·Π°ΡΠΈΠΈ ΡΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΠΉ ΠΏΡΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΡ ΡΠ΅Π°ΠΊΡΠΈΠΈ ΠΠ ΠΠ Π½Π° Π΄Π²ΡΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠ°Ρ ΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠ°Π»ΠΎΡΠΊΠΈ, Π±ΡΠ»ΠΎ ΠΏΡΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΎ Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ 13 ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ².
Π ΡΠ΅Π·ΡΠ»ΡΡΠ°ΡΠ΅ Π±ΡΠ»ΠΎ Π²ΡΡΠ²Π»Π΅Π½ΠΎ 6 Π³ΡΡΠΏΠΏ (ΠΊΠ»Π°ΡΡΠ΅ΡΠΎΠ²) Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈ ΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ²:
- 1) Π10
- 2) Π22, 1Π, 2Π, 3Π, 4Π, 5Π
- 3) 1Π
- 4) Π€Π -318
- 5) Π€Π -327
- 6) 147/48/314, 110/723, 85/3/8 (Longus niger)
ΠΠ΅ΡΠΎΠ΄ ΠΠ ΠΠ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΠΈΠ» ΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΡΠΈΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΡΠ»Π΅Π΄ΡΡΡΠΈΠ΅ ΡΠ½ΠΈΠΊΠ°Π»ΡΠ½ΡΠ΅ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΡ — 1Π, Π€Π -318, ΠΈ Π€Π -327. Π ΡΠΎ ΠΆΠ΅ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ, ΠΈΠΌΠ΅ΡΡΡΡ ΡΡΠΈ Π³ΡΡΠΏΠΏΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ², ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ Π½Π΅ Π±ΡΠ»ΠΈ Π΄ΠΈΡΡΠ΅ΡΠ΅Π½ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Ρ Π½Π° ΠΎΡΠ΄Π΅Π»ΡΠ½ΡΠ΅ Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΡ — ΡΡΠΎ Π³ΡΡΠΏΠΏΡ 2 ΠΈ 6 Π² ΡΠΏΠΈΡΠΊΠ΅. ΠΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΡΠΌ ΠΎΠ±ΡΡΡΠ½Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ΡΡΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ Π±ΡΡΡ Π³Π΅Π½Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠ°Ρ Π±Π»ΠΈΠ·ΠΎΡΡΡ ΡΠΊΠ°Π·Π°Π½Π½ΡΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ² Π² ΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π°Ρ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠΉ Π³ΡΡΠΏΠΏΡ. ΠΡΠΈ Π½Π°ΠΊΠΎΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΠΈ ΠΎΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠΈΡΠ»Π° ΠΌΡΡΠ°ΡΠΈΠΎΠ½Π½ΡΡ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠΉ Π² Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ΅ ΠΏΠΎΡΠ²Π»ΡΡΡΡΡ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΡ ΠΈ Π² ΡΠ°ΡΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠΈ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ (Π½Π°ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅Ρ, ΡΡΠ°ΠΌΠΌΡ Π€Π -318 ΠΈ Π€Π -327 ΠΎΡΠ»ΠΈΡΠ°ΡΡΡΡ Π²ΡΠ΅Π³ΠΎ Π΄Π²ΡΠΌΡ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠ°ΠΌΠΈ ΠΠΠ). ΠΡΠΈ ΠΏΠΎΡΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΠΈ Π»ΡΠ±ΡΡ Π½Π΅ΡΠΎΠ²ΠΏΠ°Π΄Π΅Π½ΠΈΠΉ Π² ΡΠ°ΡΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠΈ ΡΡΠ°Π³ΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΠΠ Ρ Π΄Π²ΡΡ ΠΈΠ·ΡΡΠ°Π΅ΠΌΡΡ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΠΎΠ² ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ Π½Π° 100% ΡΡΠ²Π΅ΡΠΆΠ΄Π°ΡΡ, ΡΡΠΎ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΡ ΠΎΡΠ½ΠΎΡΡΡΡΡ ΠΊ Π΄Π²ΡΠΌ Π³Π΅Π½Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈ ΡΠ°Π·Π»ΠΈΡΠ½ΡΠΌ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±Π½ΡΠΌ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠ°ΠΌ. Π‘ Π΄ΡΡΠ³ΠΎΠΉ ΡΡΠΎΡΠΎΠ½Ρ, Π΅ΡΠ»ΠΈ Π΄Π²Π° ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΠ° Π½Π΅ ΡΠ°Π·Π»ΠΈΡΠ°ΡΡΡΡ, Π΅ΡΡΡ Π½Π΅ΠΊΠΎΡΠΎΡΠ°Ρ Π²Π΅ΡΠΎΡΡΠ½ΠΎΡΡΡ, ΡΡΠΎ ΠΎΠ½ΠΈ Π²ΡΠ΅-ΡΠ°ΠΊΠΈ ΡΠ°Π·Π»ΠΈΡΠ½Ρ. ΠΠ΅ ΠΈΡΠΊΠ»ΡΡΠ΅Π½ΠΎ, ΡΡΠΎ Π΄ΡΡΠ³ΠΈΠ΅ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄Ρ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° ΠΌΠΎΠ³ΡΡ Π² ΠΊΠ°ΠΊΠΈΡ -ΡΠΎ ΡΠ»ΡΡΠ°ΡΡ Π²ΡΡΠ²ΠΈΡΡ ΡΠ°Π·Π½ΠΈΡΡ. ΠΠ΄Π½Π°ΠΊΠΎ, Π΄Π°Π½Π½ΡΠ΅ Π½Π° Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΈΡ Π²ΠΈΠ΄Π°Ρ ΠΊΠ»ΠΈΠ½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈ Π·Π½Π°ΡΠΈΠΌΡΡ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ² (ΡΠ°Π»ΡΠΌΠΎΠ½Π΅Π»Π»Ρ, Π·ΠΎΠ»ΠΎΡΠΈΡΡΡΠΉ ΡΡΠ°ΡΠΈΠ»ΠΎΠΊΠΎΠΊΠΊ, ΠΏΡΠ΅Π²Π΄ΠΎΠΌΠΎΠ½Π° ΠΈ ΠΊΠ»ΠΎΡΡΡΠΈΠ΄ΠΈΠΈ) ΡΠΊΠ°Π·ΡΠ²Π°ΡΡ, ΡΡΠΎ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ ΠΠ ΠΠ ΡΠ°ΠΌΡΠΉ Π²ΡΡΠΎΠΊΠΎΡΡΠ²ΡΡΠ²ΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠΉ Π² ΠΏΠ»Π°Π½Π΅ Π²ΡΡΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΡ Π³Π΅Π½Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ ΡΠ°Π·Π»ΠΈΡΠΈΠΉ ΠΌΠ΅ΠΆΠ΄Ρ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠ°ΠΌΠΈ. Π³Π΅Π½ΠΎΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌ Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΡΠΉ ΡΡΠ°ΠΌΠΌ Π’Π°ΠΊΠΈΠΌ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠΌ, ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΠ΅Ρ ΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΡΠΈΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΎΡΠ΄Π΅Π»ΡΠ½ΡΠ΅ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΡ ΠΈ Π³ΡΡΠΏΠΏΡ Π±Π»ΠΈΠ·ΠΊΠΎΡΠΎΠ΄ΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΡΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ² ΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠ°Π»ΠΎΡΠΊΠΈ. ΠΠ΅ΡΠΎΠ΄ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ ΡΠ΅ΠΊΠΎΠΌΠ΅Π½Π΄ΠΎΠ²Π°ΡΡ Π΄Π»Ρ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»Ρ ΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ Π°Π½ΡΠΈΡΠΈΡΠΎΠΏΠ°ΡΠΎΠ³Π΅Π½Π½ΡΡ Π±ΠΈΠΎΠΏΡΠ΅ΠΏΠ°ΡΠ°ΡΠΎΠ² Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΏΡΠΈΡΠΎΠ΄Ρ ΠΏΡΠΈ ΠΈΡ ΠΊΠΎΠΌΠΌΠ΅ΡΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΌ ΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΡΡΠ²Π΅. ΠΡΠΈ ΠΏΡΠΎΠΌΡΡΠ»Π΅Π½Π½ΠΎΠΌ ΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΡΡΠ²Π΅ Π±ΠΈΠΎΠΏΡΠ΅ΠΏΠ°ΡΠ°ΡΠΎΠ² ΠΌΠ°Π»ΠΎΠ²Π΅ΡΠΎΡΡΠ½Π° ΠΊΠΎΠ½ΡΠ°ΠΌΠΈΠ½Π°ΡΠΈΡ Π΄ΡΡΠ³ΠΈΠΌ ΠΊΠΎΠΌΠΌΠ΅ΡΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΌ ΠΈΠ»ΠΈ Π³Π΅Π½Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈ Π±Π»ΠΈΠ·ΠΊΠΈΠΌ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠΌ. Π‘ΠΊΠΎΡΠ΅Π΅ Π²ΡΠ΅Π³ΠΎ, ΠΊΠΎΠ½ΡΠ°ΠΌΠΈΠ½Π°ΡΠΈΡ ΠΏΡΠΎΠΈΡΡ ΠΎΠ΄ΠΈΡ ΠΊΠ°ΠΊΠΈΠΌ-Π»ΠΈΠ±ΠΎ Π΄ΠΈΠΊΠΈΠΌ ΠΏΡΠΈΡΠΎΠ΄Π½ΡΠΌ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠΌ, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠΉ Π³Π΅Π½Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈ Π·Π½Π°ΡΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎ ΠΎΡΠ»ΠΈΡΠ°Π΅ΡΡΡ ΠΎΡ ΠΊΠΎΠΌΠΌΠ΅ΡΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΠΈ, ΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎ, ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ Π±ΡΡΡ ΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΡΠΈΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠΌ ΠΠ ΠΠ.
ΠΠ°ΠΊΠ»ΡΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅
ΠΡΠ» ΡΠ°Π·ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π½ ΡΡΡΠ΅ΠΊΡΠΈΠ²Π½ΡΠΉ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ Π²ΡΠ΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΡ Π²ΡΡΠΎΠΊΠΎΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠΉ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΉ ΠΠΠ B. subtilis, ΠΎΠΏΡΠΈΠΌΠΈΠ·ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Ρ ΡΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΡ ΠΏΡΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΡ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎ-Π³Π΅Π½Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΡΠΈΠΏΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π΄Π»Ρ ΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΈ ΠΈ ΠΏΠ°ΡΠΏΠΎΡΡΠΈΠ·Π°ΡΠΈΠΈ Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ°ΠΌΠΌΠΎΠ².
ΠΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΠ³ΡΠ°ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ ΡΠΏΠΈΡΠΎΠΊ
- 1. El-Hamshary O.I.M., Abo-Aba S.E.M., Awad N., Gomaa A.M. Genetic profile of Bacillus subtilis indigenous isolates and their performance as Bio-control agent against the plant pathogen Fusarium oxysporum // Res.J.Cell Mol.Biology. 2008. V. 2. P.30−38.
- 2. Van Belkum. Guidelines for the validation and application of typing methods for the use in bacterial epidemiology // Clin. Microbial. Infect. 2007. V. 13. P. 1−46.
- 3. Terletski V., Schwarz S., Carnwath J., and Niemann H. Typing of Salmonella enterica subsp. enterica serovars Choleraesuis, Typhimurium, Dublin and laboratory strains of Escherichia coli using subtracted restriction fingerprinting (SRF) // Microbiol. Res. 2003. V.158. P. 135−142.
- 4. Terletskiy V., Kuhn G., Francioli P., Blanc D. Application and evaluation of double digest selective label (DDSL) typing technique for Pseudomonas aeruginosa hospital isolates // J. Microbiol. Methods. 2008. V. 72. P. 283−287.
- 5. Terletskiy V., Tyshchenko V., Martinez-BallesterosI.et al. Validation of Double Digest Selective Label database for sequenced prokaryotic genomes // Bioinformatics. 2010. V. 26. P. 417−418.
- 6. Hunter P.R., Gaston M.A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson’s index of diversity // J. Clin. Microbial. 1988. V. 26. P. 2465−2466.