Начало созданию целостного здравоохранения и санитарно-эпидемиологической службы на территории Казахстана было положено Октябрьской Социалистической Революцией 1917 года. 26 августа 1920 года декретом ВЦИК и СНК была образована Автономная Киргизская (Казахская) Социалистическая Советская Республика, а 20 мая 1921 года решением 1 Всекиргизского (Всеказахского) совещания деятелей здравоохранения в структуру Народного комиссариата здравоохранения республики был впервые включен санитарно-эпидемиологический отдел. В его составе были выделены 4 подотдела: санитарный, эпидемический, санитарно-статистический и медсанпросвета. На санитарно-эпидемиологический отдел возлагалось общее руководство всеми санитарно-противоэпидемическими мероприятиями в республике. Первым заведующим санитарно-эпидемиологического отдела был назначен врач Геращенков Ю. Я., а в 1923 году его сменил — М. М. Чумбалов.
Санитарно-эпидемиологическая служба в Казахстане в годы Великой отечественной войны
С первых дней войны особый груз в деле охраны здоровья населения был возложен на санитарно-эпидемиологическую службу Казахстана. В 1941;42гг. в республику было эвакуировано несколько сот тысяч человек, депортирована 361 тысяча немцев, эвакуировано около 220 промышленных предприятий, в 1944 году депортировано 617 тысяч спецпереселенцев с Северного Кавказа, что усложнило санитарную обстановку.
Для предотвращения эпидемий были приложены огромные усилия. В этот тяжелый период по приказу Наркомздрава СССР в 1943 году в КазГМИ был открыт санитарно-гигиенический факультет, перед которым была поставлена задача «подготовки высококвалифицированных эпидемиологов и санитарных врачей для санитарной обороны родины во время войны и ближайший период после ее окончания».
Нужды военного времени потребовали расширения сети санитарно-эпидемиологических учреждений в Казахстане. Так, если в 1941 г. имелось 43 санитарно-эпидемиологические станции, 137,5 штатных врачебных должностей госсанинспекторов, 4 противоэпидемических отряда, 783 дезинфекционных камеры, 3907 бань, то в 1945 году число СЭС возросло до 100, штатов санинспекторов — до 274,5, противоэпидемических отрядов — до 45, дезинфекционных камер — до 1438, построено 3332 бани.
Жестким требованиям военного времени были подчинены и все темы научных исследований в КазГМИ. Изучались вопросы очистки воздуха в бомбоубежищах, санитарного обслуживания воинских частей, эпидемиологии военных инфекций, вакцинации населения.
Полностью ориентированной на нужды фронта научно-исследовательской и практической деятельностью занимался Краевой институт эпидемиологии, микробиологии и гигиены, производивший около 20 видов бакпрепаратов: сыпнотифозную вакцину, тифо-паратифозные таблетки, дизентерийный бактериофаг, холерный монофаг, противохолерную моновакцину и др.
В июне 1944 года в республике открывается Институт тропических болезней, который в 1945 году переименовывается в Институт краевой патологии и становится основным научно-исследовательским центром АН Казахской ССР по разработке краевых медицинских проблем.
