Вирусы растений. 
Экспрессия белка ТБГ3 Х-вируса шалота

Вирусы — единственная группа организмов, чей генетический материал может быть представлен РНК. Вирусы, геном которых представлен одноцепочечной РНК, имеющей ту же полярность, что и клеточные мРНК, т. е. способные напрямую кодировать вирусные белки, называются вирусами с РНК-геномом положительной полярности («positive-stranded RNA viruses», psRNAv). После попадания в клетку растения положительные РНК связываются с клеточными рибосомами, и происходит синтез вирусных белков, первым из которых является белок, обладающий РНК-зависимой РНК полимеразной активностью. Этот белок сначала синтезирует минус-копию геномной РНК, служащую матрицей для синтеза дочерних цепей геномной РНК, а также субгеномных РНК положительной полярнойсти, которые служат матрицами для трансляции других вирусных белков. (Acheson N. H. — Fundamentals of Molecular Virology (2nd ed.) — 2011)(см. далее).

Большое количество растительных вирусов являются psRNAv. Растительные вирусы проникают в клетки организма хозяина, как правило, через раневые отверстия или с участием насекомых-переносчиков. (Acheson N. H. — Fundamentals of Molecular Virology (2nd ed.) — 2011). Для распространения в другие части растения, вирусы кодируют так называемые транспортные белки (ТБ), которые изменяют пропускную способность плазмодесм, каналов, соединяющих цитоплазму соседних клеток (см. далее) и участвуют в транспортировке вирусного генома из одной клетки в другую.

Организация геномной РНК положительной полярности вирусов растений Вирусы, у которых геном представлен РНК положительной полярности, часто имеют на 5'-конце кэп (m7G) и/или последовательности поли-А на 3'конце (McDonald SM. 2013), что характерно для мРНК эукариотичестких клеток, что делает возможным их трансляцию клеточными рибосомами.

Иногда, psRNAv не имеют кэп-структуры, а инициация трансляции происходит с помощью IRES элементов. Такая организация 5'-конца встречается у представителей семейства Picornaviridae, таких как poliovirus, rhinovirus и других (McDonald SM. 2013, Witwer C et. al. 2001).

Более того, трансляция геномов Caliciviridae зависит от небольшого белка, кодируемого вирусом (VPg), который ковалентно связан с 5'-концом РНК и взаимодействует с белками клетки-хозяина, необходимыми для инициации синтеза белка (Goodfellow I et. al. 2005).

После заражения клетки хозяина с геномной вирусной РНК положительной полярности транслируется один белковый продукт, который может либо представлять собой РНК-зависимую РНК полимеразу, либо полипротеин, который котрансляционно и пострансляционно разрезается вирусными протеазами, давая зрелые вирусные белки. Одним из таких белков является РНК-зависимая РНК полимераза,(McDonald SM. 2013). Достаточно часто белки данной группы вирусов, обладающие полимеразной активностью, ассоциируются с мембранными внутриклеточными органеллами, захватывая и модифицируя участки мембран для формирования «репликационных капсул» (den Boon et. al. 2010). Так как молекула РНК положительной полярности является так же и функциональной мРНК, процессы транскрипции и трансляции вируса аналогичны, однако, часто с антигеномной РНК синтезируются, так называемые, субгеномные РНК (сгРНК), которые короче геномной РНК и 3'-котреминальны с ней. Молекулы сгРНК служат для экспрессии индивидуальных вирусных белков.