Практическая часть.
Экспрессия белка ТБГ3 Х-вируса шалота

РефератПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Множественные выравнивания были построены программой ClustalW2 на веб-сервере Европейского Института Биоинформатики (http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/). Программа GeneDoc (http://www.nrbsc.org/gfx/genedoc/) была использована для визуализации полученных выравниваний. Аббревиатуры названий вирусов и accession numbers последовательностей, использованных в анализе. Аббревиатуры приведены… Читать ещё >

Практическая часть. Экспрессия белка ТБГ3 Х-вируса шалота (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Для транспорта из клетки в клетку вирусы используют специальные белки, называемые транспортными. Одним из примеров могут служить белки, закодированные в ТБГ — ТБГ1, ТБГ2, ТБГ3. Было показано, что все три белка необходимы для вирусного транспорта. Интересно, что ShVX, так же как и другие известные представители рода Аllexivirus, не имеет ОРС для ТБГ3, но последовательность, гомологичная ТБГ3 других вирусов, правда, лишенная стартового AUG кодона, была обнаружена (Kanyuka et al. 1992). Так как ранее не было получено других представителей РНК-вирусов, которые осуществляют межклеточный транспорт с помощью только ТБГ1 и ТБГ2, появилась необходимость проверить возможность экспрессии ТБГ3-гомолога аллексивирусов.

Цель работы

Изучить возможность экспрессии ТБГ3 у ShVX.

Материалы и методы

Анализ последовательностей

Аббревиатуры названий вирусов и accession numbers последовательностей, использованных в анализе.

Аббревиатуры приведены в алфавитном порядке. Acession numbers приведены по данным GeneBank.

AltMV, Alternanthera mosaic virus [NC_7 731].

ApLV, Apricot latent virus [NC_14 821].

ASPV, Apple stem pitting virus [NC_3 462].

BaMV, Bamboo mosaic virus [NC_1 642].

BVE, Blackberry virus E [NC_15 706].

BVX, Botrytis virus X [NC_5 132].

CLBV, Citrus leaf blotch virus [NC_3 877].

CLV, Carnation latent virus [X52627].

CVB, Chrysanthemum virus B [NC_9 087].

CVX, Cactus virus X [NC_2 815].

CYMV, Clover yellow mosaic virus [NC_1 753].

DVS, Daphne virus S [NC_8 020].

FoxMV, Foxtail mosaic virus [NC_1 483].

GarV-A, Garlic virus A [NC_3 375].

GarV-B, Garlic virus B [AB010301].

GarV-C, Garlic virus C [NC_3 376].

GarV-D, Garlic virus D [AB010303].

GarV-E, Garlic virus E [NC_4 012].

GarV-X, Garlic virus X [AJ292229].

GLV, Garlic latent virus [NC_3 557].

GMBMV, Garlic mite-borne mosaic virus [D49443].

HelVS, Helenium virus S [D10454].

HpMV, Hop mosaic virus [NC_10 538].

ICRSV, Indian citrus ringspot virus [NC_3 093].

LoVX, Lolium latent virus [NC_10 434].

LSV, Lily symptomless virus [NC_5 138].

LVX, Lily virus X [NC_7 192].

MVX, Mint virus X [NC_6 948].

PapMV, Papaya mosaic virus [NC_1 748].

PCMV, Peach chlorotic mottle virus [NC_9 892].

PepMV, Pepino mosaic virus [NC_4 067].

PhVS, Phlox virus S [NC_9 383].

PlAMV, Plantago asiatica mosaic virus [NC_3 849].

PVM, Potato virus M [NC_1 361].

PVS, Potato virus S [NC_7 289].

PVX, Potato virus X [NC_11 620].

ShVX-Dindugal, Shallot virus X strain Dindugal [GQ268322].

ShVX-NZ, Shallot virus X New Zealand strain [EU835197].

TVX, Tulip virus X [NC_4 322].

WAMV, White ash mosaic virus [NC_11 533, GU906791].

WClMV, White clover mosaic virus [NC_3 820].

Показать весь текст

Заполнить форму текущей работой

Другие работы

Значение технологических факторов

Процесс превращения исходных лекарственных веществ (препаратов) в лекарство — это прежде всего технологический процесс. Вряд ли кто будет оспаривать тот факт, что способ получения лекарственных форм во многом определяет стабильность препарата, скорость его высвобождения из лекарственной формы, интенсивность его всасывания и, в конечном итоге, его терапевтическую эффективность. Например…

Реферат