Экологические условия и микробные процессы цикла углерода в стратифицированных озерах Сибири
Диссертация
Благодарности. Автор выражает искреннюю благодарность своему научному руководителю к.б.н. С. П. Бурюхаеву, д.б.н. Б. Б. Намсараеву, к.б.н. В. Б. Дамбаеву, к.б.н. Т. Г. Банзаракцаевой и всем сотрудникам и аспирантам лаборатории микробиологии ИОЭБ СО РАН за помощь и поддержку. Автор признателен сотрудникам других лабораторий и организаций за помощь на разных этапах полевых и лабораторных… Читать ещё >
Список литературы
- Беляев С.С., Иванов M.B. Радиоизотопный метод определения интенсивности бактериального метанобразования // Микробиология. -1975.-Т. 44.-Вып. 1.- 166−168 С.
- Большой практикум по микробиологии / Под ред. Г. Л. Селибера. — М., 1962.
- Борисенко И.М., Замана Л. В. Минеральные воды Бур. АССР // Улан-Удэ: Бурят, кн. изд-во, 1978. СЛ54−161.
- Бриних В.А., Ткаченко Е. Э., Кирилюк В. Е., Горошко O.A., Сараева Л. И., Кирилюк O.K., Васильченко A.A., Васильченко З. А., Сыроечковский Е. Е. Даурский заповедник // Заповедники России. Заповедники Сибири. М.: Изд-во Логата, 1999. — С. 210−220.
- Брюханов А.Л., Нетрусов А. И. Аэротолерантность строго анаэробных микроорганизмов: факторы защиты от окислительного стресса // Прикладная биохимия и микробиология. 2007. — Т. 43. — № 6. — С. 637 654.
- Брянцева И.А. Аноксигенные фототрофные бактерии содовых озер Юго-Восточного Забайкалья: Автореферат диссертации на соискание ученой степени к.б.н. М., 2000. — 23 с.
- Вайнштейн М.Б., Лауринавичус К. С. Учет и культивирование анаэробных бактерий. Пущино, 1988. — С.64.
- Власов H.A., Павлов Л. И., Иванов A.B. Гидрохимические исследования природных вод Восточной Сибири. // Труды Ирк. госуниверситета. 1970.- Т. 50. № 3. — Ч. II. — С. 19−40.
- Волков И.И., Жабина H.H. Метод определения соединений серы в морской воде // Океанология. 1990. — Т. 90. — № 5. — С. 778−782.
- Герасименко Л.М., Дубинин А.В, Заварзин Г. А. Алкалофильные цианобактерии содовых озер Тувы и их экофизиология // Микробиология.- 1996. Т. 65. — № 6. — С. 844−849.
- Герасименко Л.М., Заварзин Г. А. Реликтовые цианобактериальные сообщества // Проблемы доантропогенной эволюции биосферы / Отв. ред. д.г.-м.н. А. Ю. Розанов. -М.: Наука, 1993. С. 222−254.
- Гидрохимия озер и рек Бурятии // отв. ред. д.г.н. К. К. Вотанцев, Новосибирск: Наука, 1984.
- Гидрохимия экстремальных водных систем с основами гидробиологии: учеб. пособие / В. В. Хахинов, Б. Б. Намсараев, Е. Ю. Абидуева, Э. В. Данилова. Улан-Удэ: Издательство Бурятского госуниверситета, 2007. -148 с.
- Гиттерман К.Э. Концентрирование соляных рассолов естественным вымораживанием // Труды Соляной лаборатории АН СССР. 1937. — Ч. 1. -№ 15.
- Горбунов М.Ю. Вертикальная стратификация водных масс в малых озерах лесостепного Поволжья // Известия Самарского научного центра РАН. 2007. — Т. 9, № 4.
- Горленко В.М. Аноксигенные фототрофные бактерии содовых озер // Труды института микробиологии им. С. Н. Виноградского РАН. Алкалофильные микробные сообщества / отв. ред. В. Ф. Гальченко. М.: Наука, 2007. — Вып. 14. — С. 225−257.
- Горленко В.М., Дубинина Г. А., Кузнецов С. И. Экология водных микроорганизмов. М.: Наука, 1977. — 288 с.
- Горленко В.М., Намсараев Б. Б., Кулырова A.B., Заварзина Д. Г., Жилина Т. Н. Активность сульфатредуцирующих бактерий в донных осадках содовых озер Юго-Восточного Забайкалья // Микробиология. -1999. Т. 68. — № 5. — С. 664−670.
- Гросвальд М. Г. Евразийские гидросферные катастрофы и оледенение Арктики. — М.: Научный мир, 1999. — 120 с.
- Гусев М.В., Минеева JI.A. Микробиология. М.: МГУ, 1992. — 448 с.
- Деткова E.H. Осмоадаптация галоалкалофильных бактерий из содовых озер // Труды Института микробиологии имени С. Н. Виноградского РАН. -М.: Наука, 2007. Выпуск 14. — С. 348−373.
- Дзюба A.A. Минеральные озера // География и природные ресурсы. -2002. № 2.-С. 61−67.
- Дзюба A.A., Тулохонов А. К., Абидуева Т. И., Гребнева П. И. Распространение и химизм соленых озер Прибайкалья и Забайкалья // География и природные ресурсы. 1997. — № 4. — С. 65−71.
- Дубинин A.B., Герасименко Л. М., Заварзин Г. А. Экофизиология и видовое разнообразие цианобактерий содового озера Магади // Микробиология. 1995. — Т. 64. — с. 845 — 849.
- Жилина Т.Н. Хемотрофные анаэробы микробных сообществ содовых озер // Труды института микробиологии имени С. Н. Виноградского РАН. -М.: Наука. 2007. — Выпуск 14. — С. 158−224.
- Заварзин Г. А. Алкалофильное микробное сообщество // Труды института микробиологии имени С. Н. Виноградского РАН. М.: Наука. -2007. — Выпуск 14. — С. 58−87.
- Заварзин Г. А. Бактерии и состав атмосферы. М.: Наука, 1984. — С. 199.
- Заварзин Г. А., Жилина Т. Н., Кевбрин В. В. Алкалофильное микробное сообщество и его функциональное разнообразие // Микробиология. 1999. -Т. 68.-№ 5.-С. 579−599.
- Заварзин Г. А, Колотилова H.H. Введение в природоведческую микробиологию: Учебное пособие. М.: Книжный дом «Университет», 2001.-256 с.
- Заварзин Г. А. Лекции по природоведческой микробиологии. М.: Наука, 2003. — 348 с.
- Заварзин Г. А. Эпиконтинентальные содовые водоемы как предполагаемые реликтовые биотопы формирования наземной биоты // Микробиология. 1993. — Т. 62. — Вып. 5. — С. 789−800.
- Замана JI.B., Борзенко C.B. Элементная сера в рапе озера Доронинское (Восточное Забайкалье) // Доклады АН. 2011. — Т. 438. — С. 515−518.
- Иванов A.B., Трофимова JI.H. Гидрохимия озер Центрального Забайкалья.—Владивосток, 1982.
- Иванов М.В. Применение изотопов для изучения интенсивности процесса редукции сульфатов в озере Беловодь // Микробиология. 1956. -Т. 25.-Вып. 3.- С. 305−310.
- Карначук О.В., Пименов Н. В., Юсупов С. К., Франк Ю. А., Пухакка Я. А., Иванов М. В. Распределение, разнообразие и активность сульфатредуцирующих бактерий в водной толще озера Гёк-Гель, Азербайджан // Микробиология. 2006. — Т. 75. — № 1. — С. 101−109.
- Кондратьева E.H. Фототрофные прокариоты. Учеб. пособие. М.: Изд-воМГУ, 1996.-312 с.
- Королев В.Ф. Термический анализ морской воды // Труды Соляной лаборатории АН СССР. 1937. — Вып. 15. — Ч. 1.
- Кузнецов С.И. Микрофлора озёр и её геохимическая деятельность. -Ленинград: Изд-во «Наука», Ленингр. отд., 1970. 400 с.
- Кузнецов С.И., Дубинина Г. А. Методы изучения водных микроорганизмов. М.: Наука, 1989. — 288 с.
- Кузнецов С.И., Саралов А. И., Назина Т. Н. Микробиологические процессы круговорота углерода и азота в водоемах. М.: Наука, 1985. -212 с.
- Методические рекомендации по сбору и обработке материалов при гидробиологических исследованиях на пресноводных водоемов. Бактериопланктон и его продукция / Под ред. Г. Г. Винберга. Ленинград, 1984. — с. 22.
- Михайлов В.Н., Добровольский А. Д., Добролюбов С. А. Гидрология: Учебник для вузов. М.: Высш. шк., 2005. — 463 е.: ил.
- Намсараев Б.Б., Горленко В. М., Намсараев З. Б., Дагурова О. П. Полевой практикум по водной микробиологии и гидрохимии: Методическое пособие. Улан-Удэ: Изд-во Бурятского госуниверситета, 2005.
- Намсараев Б. Б, Жилина Т. Н., Кулырова A.B., Горленко В. М. Бактериальное образование метана в содовых озерах юго-восточного Забайкалья // Микробиология. 1999. — Т. 68. — № 5. — С. 671−676.
- Намсараев Б.Б., Намсараев З. Б. Микробные процессы круговорота углерода и условия среды обитания в щелочных озерах Забайкалья и Монголии // Труды института микробиологии им. С. Н. Виноградского РАН. М.: Наука, 2007. — 398 с.
- Намсараев З.Б., Горленко В. М., Намсараев Б. Б., Бурюхаев С. П., Юрков В. В. Структура и биогеохимическая активность фототрофных сообществ щелочного термального Болыпереченского источника // Микробиология. -2003. Т. 72. — № 2. — с. 228−238.
- Обязов В.А. Зун-Торей Электронный ресурс. Режим доступа: http://ez.chita.ru/encycl/concepts/7icN838
- Перфильев Б.В. Биология лечебных грязей // Основы курортологии. -М.: Медгиз. 1932. — Т. 1. — 210 с.
- Пикута Е.В., Жилина Т. В., Заварзин Г. А., Кострикина H.A., Осипов Г. А., Рейни Ф.А. Desulfonatronum lacustre gen. nov., sp. nov. новая алкалофильная сульфатвосстанавливающая бактерия, использующая этанол // Микробиология. — 1998. — Т. 67. — С. 123−131.
- Пименов Н.В., Русанов И. И., Карначук О. В., Рогозин Д. Ю., Брянцева И. А., Лунина О. Н., Юсупов С. К., Парначев В. П., Иванов М. В. Микробные процессы циклов углерода и серы в озере Шира (Хакасия) // Микробиология. 2003. — Т. 72. — № 2. — С. 259−267.
- Пиннекер E.B. Минеральные воды Тувы. Кызыл: Типография управления по печати при Совете Министров Тувинской АССР, 1968. -110 с.
- Полторак О.М. Термодинамика в физической химии. М.: Высшая школа, 1991.
- Посохов В.В. Происхождение содовых вод в природе. Л.: Гидрометеоиздат, 1969. — 332 с.
- Практикум по курсу «Гидрохимия»: Учебно-методическое пособие для вузов / Под ред. Т. Д. Буниной. Воронеж: Воронежский государственный университет, 2007. — 28 с.
- Практическая гидробиология. Пресноводные экосистемы: Учеб. для студ. биол. спец. университетов / Под ред. В. Д. Федорова и В. И. Капкова. -М.: Изд-во «ПИМ», 2006. 367 е.: ил.
- Предбайкалье и Забайкалье / Под ред. Бирина и др. М.: Наука, 1965. -491 с.
- Промышленная микробиология / Под ред. Н. С. Егорова. М.: Высшая школа, 1993. — 693 с.
- Резников A.A., Муликовская Е. П., Соколов И. Ю. Методы анализа природных вод. М.: Недра. — 1970.
- Саввичев A.C., Русанов И. И., Пименов Н. В., Мицкевич И. Н., Байрамов И. Т., Леин А. Ю., Иванов М. В. Микробиологические исследования северной части Баренцева моря в начале зимнего сезона // Микробиология.- 2000. Т. 69. — № 6. — С. 819−830.
- Савельев Б.А. Гляциология: Учебник. М.: Изд-во МГУ, 1991. — 288 с.
- Саралов А.И., Крылова И. Н., Кузнецов С. И. Модификация Сорокина для раздельного определения интенсивности бактериального хемосинтеза и гетеротрофной ассимиляции углекислоты в водоёмах // Микробиология.- 1984. Т. 53. — Вып. 6. — С. 989−996.
- Серебренникова Н.В., Юргенсон Г. А., Флешлер В. И., Котова Н. П. Гуджир Доронинского содового озера // Труды VII международного симпозиума «Проблемы геологической и минерагенической корреляции в сопредельных районах России, Китая и Монголии». Чита, 2007.
- Солоноватые и соленые озера Забайкалья: гидрохимия, биология / Отв. ред. Б. Б. Намсараев. Улан-Удэ: Изд-во Бурятского госуниверситета, 2009. — 340 с.
- Сорокин Д.Ю. Натрофильные аэробные хемолитотрофные бактерии содовых озер // Труды института микробиологии им. С. Н. Виноградского РАН. Алкалофильные микробные сообщества / Отв. ред. В. Ф. Гальченко. -М.: Наука, 2007. Вып. 14. — С. 258−275.
- Сорокин Ю.И. Применение изотопного метода в водной микробиологии // Успехи микробиологии. М.: Наука, 1975. — № 10. -С.214−228.
- Спиридонов А. Четырёхъязычный энциклопедический словарь терминов по физической географии. — М.: Советская энциклопедия, 1980. — С. 296. —703 с.
- Статистика погоды в городах России Электронный ресурс. Режим доступа: http://www.atlas-yakutia.ru/weather/climate russia-III.html
- Толстихин Н.И., Посохов Е. В. Минеральные воды. Л.: Изд-во ЛГИ, 1975.- 171 с.
- Цыренов Б.С. Сезонные изменения физико-химических условий и активности микробного сообщества в содовом озере Белое (Западное Забайкалье): Автореферат диссертации на соискание ученой степени канд. биол. наук. Улан-Удэ, 2010. — 20 с.
- Цыренова Д.Д. Видовой состав и экофизиология цианобактерий солоноватых и соленых озер Южного Забайкалья: Автореферат диссертации на соискание ученой степени канд. биол. наук. Улан-Удэ, 2009.-22 с.
- Экология микроорганизмов экстремальных водных систем: учеб. пособие / Б. Б. Намсараев, Е. Ю. Абидуева, Е. В. Лаврентьева и др. Улан-Удэ: Издательство Бурятского госуниверситета, 2008. — 94 с.
- Boone D.R., Worakit S., Mathrani I.M., Mah R.A. Alcaliphilic methanogens from high-pH soda lake sediments. // Syst. Appl. Microbiol. 1986. — V. 7. — P. 230−234.
- Csonka L.N., Hanson Ad. Prokaiyotic osmoregulation: genetics and physiology // Ann. Rev. Microbiol. 1991. — Vol. 45. — P. 569−606.
- Degermendzhy A.G., Gulati R.D. Understanding the mechanisms of blooming of phytoplankton in Lake Shira, a saline lake in Siberia (the Republic of Khakasia) // Aquatic Ecology. 2002. — 36: 331−340.
- Duckworth A.W., Grant W.D., Jones B.E., van Steenbergen R. Phylogenetic diversity of soda lakes // FEMS Microbiol. Ecol. 1996. — Vol. 19. — P. 181−191.
- Eisenberg H., Wachtel E.J. Structural studies of halophilic proteins, ribosomes, and organelles of bacteria adapted to extreme salt concentrations // Ann. Rev. Biophys. Chem. 1987. — 16:69−92.
- Galinski E.D., Truper H.G. Microbial behavior in salt stressed ecosystems // FEMS Microbiol Rev. 1994. — Vol. 15. — P. 95−108.
- Gaumette P., Cohen Y., Matheron R. Isolation and characterization of Desulfovibrio halophilus sp. nov., a halophilic sulphate reducing bacterium isolated from solar lake (Sinai) // Syst. Appl. Microbiol. 1991. — Vol. 14. — P. 33−38.
- Gorlenko V.M., Bryantseva I.A. Novel Heliobacteria from soda lake and thermal springs of southwest Siberia // Abstracts of the Workshop on «Green ind Heliobacteria». Spain, Girona, 1999. — August 28−31. — P. 71.
- Grant S., Sorokin D.Y., Grant W.D. A phylogenetic analysis of Wadi el Natrun soda lake cellulase enrichment cultures and identification of cellulase genes from these cultures // Extremophiles. 2004. — Vol. 8. — P. 421−429.
- Hammer U.T. Saline Lake Ecosystems of the World. Springer, 1986. — P. 15.
- Hutchinson G.E. A Treatise on Limnology. New York: Wiley & Sons, 1957. — 1015 p.
- Imhoff J.F., Thiemann B. Influence of salt concentration and temperature on the fatty acid composition of Ectothiorhodospora and other halophilic phototrophic purple bacteria // Arch Microbiol. 1991. — Vol. 156. — P. 370−375.
- Imhoff J.F. Osmoregulation and compatible solutes in eubacteria // FEMS Microbiol. Review. 1986. — Vol. 39. — P. 57−66.
- Iriarte J.L., Gonzalez H.E., Liu K.K., Rivas C., Valenzuela C. Spatial and temporal variability of chlorophyll and primary productivity in surface waters of southern Chile (41.5E, 43S). Estuarine, Coastal and Shelf Science. 2007. — 74 (3): 47180.
- Kalacheva G.S., Gubanov V.G., Gribovskaya I.V., Gladchenko I.A., Zinenko G.K., Savitsky S.V. Chemical analysis of Lake Shira water (19 972 000) // Aquatic Ecology. 2002. — 36: 123−141.
- Konig H., Stetter K.O. Isolation and characterization of Methanolobus tindarius, sp. nov., a coccoid methanogen growing only on methanol andmethylamines // Zentralbl. Bakteriol. Parasitenkd. Infektionskr. Hyg. Abt. 1 Orig. 1982. — C3: 478490.
- Kopylov A.I., Kosolapov D.B., Degermendzhy N.N., Zotina T.A., Romanenko A.V. Phytoplankton, bacterial production and protozoan bacterivory in stratified, brackish-water Lake Shira (Khakasia, Siberia) // Aquatic Ecology. -2002.-36:205−217.
- Kopylov A.I., Kosolapov D.B., Romanenko A.V., Degermendzhy A.G. Structure of planktonic microbial food web in a brackish stratified Siberian lake // Aquatic Ecology. 2002. — 36: 179−204.
- Laube V. M, Martin S.M. Conversion of cellulose to methane and carbon dioxide by triculture of Acetivibrio celluloliticus, Desulfovibrio sp. and Methanosarcina barkeri // Appl. Environ. Microbiol. 1981. — 42:413−420.
- Malakhov F.M., Skornyakov V.A., Zizarin G.V. Hydromineral resources of the health resort 'Lake Shira' // Materials of Investigations of Medical Muds, Mud Lakes and Deposits. Moscow, 1963. — P. 51−151.
- Mathrani I.M., Boone D.R., Mah R.A., Fox G.E., Lau P.P. Methanohalophilus zhilinae sp. nov., an alkaliphilic, halophilic, methylotrophic methanogen // Int. J. Syst. Bacterid. 1988. — 38(2): 139−142.
- Miller Ch.B. Biological Oceanography. Maiden, MA: Blackwell Publishing, 2004. — 402 p.
- Moss B., Beklioglu M., Carvalho L. Vertically-challenged limnology- contrasts between deep and shallow lakes // Hydrobiol. 1997. — P. 342−343.
- Ollivier B., Caumette P., Garcia J.-L., Mah R.A. Anaerobic bacteria from hypersaline environments // Microbiol. Rev. 1994. — Vol. 58. — P. 27−38.
- Oremland R.S., Marsh L., DesMarais D.I. Methanogenesis in Big Soda Lake, Nevada- an alkaline, moderately hipersaline desert lake // Appl. Environ. Microbiol. 1982. — V. 43. — P. 462−468.
- Oren A., Gurevich P., Henis Y. Reduction of nitrosubstituted aromatic compounds by the halophilic eubacteria Haloanaerobium praevalens and Sporohalobacter marismortui // Appl. Environ. Microbiol. 1991. — V. 57. — P. 3367−3370.
- Padisak J., Reynolds C.S. Shallow lakes: the absolute, the relative, the functional and the pragmatic // Hydrobiol. 2003. — V. 506−509.
- Parnachev V.P., Degermendzhy A.G. Geographical, geological and hydrochemical distribution of saline lakes in Khakasia, Southern Siberia // Aquatic Ecology. 2002. — 36: 107−122.
- Rodrigo M.A., Miracle M.R., Vicente E. The meromictic Lake La Cruz (Central Spain). Patterns of stratification // Aquat. Sci. 2001. — V. 63.
- Sorokin D.Yu., Kuenen J.G. Chemolithotrophic haloalkaliphiles from soda lakes // FEMS Microbiol. Ecol. 2005. — Vol. 52. — P. 287−295.
- Temerova T.A., Degermendzhy A.G., Tolomeyev A.P. Lake Shira, a Siberian salt lake: ecosystem structure and function. 2. Brachionus plicatilis (Rotatoria) growth and development // International Journal of Salt Lake Research. 1999. — 8: 233−244.
- Thauer R.K., Jungermann K., Decker K. Energy conversation in chemotrophic anaerobic bacteria // Bacteriol. Revs. 1977. — 41:100−180
- Wen Z., Mian-Ping Z., Xian-Zhong X., Xi-Fang L., Gan-Lin G., Zhi-Hui H. Biological and ecological features of saline lakes in northern Tibet, China // Hydrobiologia. 2004. — V. 541. — P. 189.
- Zhilina T.N., Zavarzin G.A. Extremely halophilic, methilotrophic, anaerobic bacteria // FEMS Microbiol Rev. 1990. — Vol. 87. — P. 315−322.
- Zhilina T.N., Zavarzin G.A., Reiney F.A., Pikuta E.V., Osipov G.A. and Kostrikina N.A. Desulfonatronovibrio hydrogenovorans gen. nov., sp. nov. alkaliphilic sulfate reducing bacterium. // Int. J. System. Bacterid. 1997. — Vol. 47(1).-P. 144−149.
- ZoBell C.E. Microbial degradation of oil: present status, problems and perspectives // The microbial degradation of oil pollutants. Atlanta: Georgia State University, 1973.-P. 153−162.
- Zotina T.A., Tolomeyev A.P., Degermendzhy N.N. Lake Shira, a Siberian salt lake: ecosystem structure and function. 1. Major physico-chemical and biological features // International Journal of Salt Lake Research. 1999. — 8: 211−232.