Помощь в написании студенческих работ
Антистрессовый сервис

Использование метода полимеразной цепной реакции для генетического маркирования ремонтантной малины

Диссертация: Использование метода полимеразной цепной реакции для генетического маркирования ремонтантной малины
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Глубокую признательность за помощь, ценные советы и участие автор выражает ведущему научному сотруднику лаборатории генетической инженерии растений ИОГен РАН, д.б.н., Голденковой Ирине Васильевне и руководителю группы трансгенеза лаборатории физиологических и молекулярных механизмов адаптации ИФР РАН, к.б.н., Ралдутиной Галине Николаевне. Автор выражает глубокую признательность своему научному… Читать ещё >

Использование метода полимеразной цепной реакции для генетического маркирования ремонтантной малины (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Содержание

  • 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Род Rubus, подрод Idaeobatus
      • 1. 1. 2. Биологические особенности малины
      • 1. 1. 3. Генетические аспекты ремонтантности
    • 1. 2. Современные методы исследования генома растений
      • 1. 2. 1. Морфо-фенотипические и биохимические методы
      • 1. 2. 2. Молекулярно- генетические методы исследования генома растений
        • 1. 2. 2. 1. Подход основанный на полиморфизме длин рестрикционных фрагментов
        • 1. 2. 2. 2. Использование метода ПЦР для молекулярно- генетического исследования генома растений
        • 1. 2. 2. 3. RAPD-анализ
    • 1. 3. Микросателлиты и их типы
      • 1. 3. 1. Методы исследования генома с помощью микросателлитных последовательностей
    • 1. 4. Использование молекулярных маркеров в изучении генома и селекции малины
      • 1. 4. 1. Биохимические маркеры
      • 1. 4. 2. Изоферментные маркеры
      • 1. 4. 3. RFLP-маркеры
      • 1. 4. 4. RAPD — маркеры
      • 1. 4. 5. SCAR — маркеры
      • 1. 4. 6. ДНК секвенирование
  • 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
    • 2. 1. Объекты исследований
    • 2. 2. Методы исследования
      • 2. 2. 1. Выделение геномной ДНК
      • 2. 2. 2. ISSR-PCR
      • 2. 2. 3. RAPD-PCR
      • 2. 2. 4. M13-PCR
      • 2. 2. 5. Создание филогенетического дерева на основе ISSR-маркеров
      • 2. 2. 6. Приготовление компетентных клеток
      • 2. 2. 7. Лигирование
      • 2. 2. 8. Трансформация
      • 2. 2. 9. Выделение ДНК из агарозных гелей
    • 2. 3. Материалы и оборудование
      • 2. 3. 1. Оборудование
      • 2. 3. 2. Реактивы, среды и ферменты
  • 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ ИССЛЕДОВАНИЙ
    • 3. 1. Выделение ДНК малины
    • 3. 2. Выбор метода для молекулярно-генетического анализа малины
    • 3. 3. Полиморфизм межмикросателлитных последовательностей ДНК на межвидовом уровне
    • 3. 4. Использоание ISSR-маркеров для изучения филогенетических связей сортов и видов ремонтантной малины
    • 3. 5. Использование ISSR-маркеров для молекулярно-генетической идентификация и паспортизация сортов малины
    • 3. 6. Молекулярное маркирование признака ремонтантности у малины с использованием ISSR-PCR
  • ВЫВОДЫ
  • БЛАГОДАРНОСТИ

ВЫВОДЫ.

1. Выявлен высокий полиморфизм по межмикросателлитным последовательностям ДНК у тридцати двух образцов малины. Межвидовой полиморфизм в среднем составил 82,75%, полиморфизм между ремонтантными сортами- 74,1% и полиморфизм между неремонтантными сортами — 74,6%.

2. На основании ISSR-маркеров впервые построены дендрограммы генетического родства, включающие пятнадцать ремонтантных сортов, двенадцать сортов с обычным типом плодоношения и пять видов малины. Получено четкое разделение исследуемых образцов на два кластера: -ремонтантных сортов и сортов с летним типом плодоношения.

3. Выявлено присутствие генетического материала диких видов малины в геномах сортов современной селекции на основании результатов анализа межмикросателлитных последовательностей с использованием в качестве праймеров (GA)8YC, (CA)8RC, (СА)8А, (AC)8G.

4. По данным ISSR-PCR были составлены генетические «формулы» 28 сортов малины. Все «формулы» оказались уникальными, что подтверждает высокую эффективность использования ISSR-маркеров для паспортизации сортов малины.

5. Выявлен специфический межмикросателлитный маркерный фрагмент на признак ремонтантности у малины, длиной около 270 п.н.

6. Установлено, что использование метода ISSR-PCR для молекуляр-но-генетического исследования малины эффективнее метода RAPD-PCR по проценту выявляемого полиморфизма, как межвидового (на 27,6%), так и внутривидового (на 50%), а также по воспроизводимости результатов.

7. Создана модификация метода выделения ДНК по Дорохову, заключающаяся в внесение поликлар AT и дополнительных антиоксидантов (2-меркаптоэтанол — ОД % и о-третбутилоксианизол — 50 мг/л)в экстракционный буфер, а также в замене спиртового осаждения ДНК на осаждение 20% ПЭГ — 6000.

Подобранные условия позволяют получать препараты ДНК высокого качества из тканей малины, которая отличается высоким содержанием фенольных соединений.

БЛАГОДАРНОСТИ.

Автор выражает глубокую признательность своему научному руководителю, профессору кафедры ботаники, физиологии растений и микробиологии д.б.н. В. В. Заякину и зав. лабораторией биотехнологии, к.б.н. И. Я. Нам за огромную помощь при проведении исследований, обсуждении результатов изложенных в диссертационной работе и ее подготовке.

Автор признателен заведующему кафедрой плодоовощеводства Брянской ГСХА, член. корр. РАСХН И. В. Казакову за полезные советы и поддержку при проведении исследований.

Автор благодарен заведующему кафедрой с.-х. биотехнологии МСХА им. К. А. Тимирязева, академику РАСХН B.C. Шевелухе за полезные советы и поддержку при проведении исследований.

Автор сердечно благодарит зав. лабораторией регуляторов роста МСХА, к.б.н. Г. И. Карлова за неоценимую помощь оказанную им при проведении исследований, а также выражает искреннюю благодарность за помощь и поддержку сотрудникам кафедры с.-х. биотехнологии МСХА Г. Н. Андреевой, А. Н. Сахаровой, И. А. Фесенко и М. Ю. Куклеву.

Автор благодарит сотрудников лаборатории биотехнологии Брянской ГСХА: А. Г. Соболеву и E.JI. Зуеву за поддержку и дружеское отношение, а так же сотрудника кафедры экологического растениеводства к. с.-х. н. Сорокина А. Е. за помощь в оформлении работы.

Глубокую признательность за помощь, ценные советы и участие автор выражает ведущему научному сотруднику лаборатории генетической инженерии растений ИОГен РАН, д.б.н., Голденковой Ирине Васильевне и руководителю группы трансгенеза лаборатории физиологических и молекулярных механизмов адаптации ИФР РАН, к.б.н., Ралдутиной Галине Николаевне.

1. Айала Ф., 1984.

Введение

в популяционную генетику. М.: Мир.

2. Алтухов Ю. П., Рынков Ю. Г., 1972. Генетический мономорфизм видов и его возможное биологическое значение. Журн. общ. Биологии, 33, 281−300.

3. Брик А. Ф., Сиволап Ю. М., 2001. Молекулярно генетическая идентификация и паспортизация сортов сои (Glycinemax L.). Генетика, 37(9): 1266−1273.

4. Бузун Г. А., 1972. выделение ферментов из растений в присутствии эндогенных фенолов. Усп. биол. химии 13: 102−115.

5. Вартапетян А. Б., 1991. Полимеразная цепная реакция. Молекулярная биология, 25(4): 926−936.

6. Глазко В. И., Созинов И. А. Генетика изоферментов животных и растений. Киев, 1993.

7. Данилова Т. В., Данилов С. С., Карлов Г. И., 2003. Исследование молекулярно генетического полиморфизма сортов хмеля обыкновенного (Humulus lupulus) с использованием ISSR — ПЦР анализа. Генетика, 39(11): 1484−1489.

8. Данилова Т. В., Тикунов Ю. М., Weber G., Карлов Г. И. 2001, Молекулярное маркирование пола у хмеля (Humulus lupulus L.) с использованием ISSR-ПЦР. Сельскохозяйственная биотехнология. Том II. М.: Воскресенье.

9. Джинчарадзе А. Г., Иванов П. Л., Рысков А. П., 1987. Геномная «дактилоскопия»: характеристика клонированной последовательности генома человека, обладающей в составе вектора М13 свойствами высокополиморфного маркера ДНК. Доклюю АН СССР, 295, 230−233.

10. Журавлев Ю. Н., Арткжова Е. В., Козыренко М. М., Реунова Г. Д., 2003. Изучение генетических связей между дальневосточными видами семейства Araliaceae методом RAPD. Генетика, 39(1): 57−63.

11. Журавлев Ю. Н., Реунова Г. Д., Артюкова Е. В. и др. 1998. Изучение генетической изменчивости дикорастущего женьшеня (RAPD анализ). Молек. Биол. 32(6): 1075−1079.

12. Казаков И. В. Генетические ресурсы для создания хозяйственно-ценных форм малины ремонтантного типа. Сб. Современные проблемы генетики и селекции плодовых и ягодных культур и пути их решения. Мичуринск, 1999. с. 67−70.

13. Казаков И. В. Малина в вашем саду. «Придесенье», 1994. с. 144.

14. Казаков И. В. Малина и ежевика. Москва, «Фолио», 2001 С. 17−28.

15. Казаков И. В. Селекция малины в средней полосе РСФСР. Тула, При-окское книжное издательство, 1989. с. 53−61.

16. Кичина В. В. Генетика и селекция ягодных культур. М., Колос, 1984. С. 278.

17. Кичина В. В., Казаков И. В. Программа и методика селекции плодовых, ягодных и орехоплодных культур. Орёл, 1995. С. 368−380.

18. Кочиева Е. 3. и Т. П. Супрунова. 1999. Идентификация видового и сортового полиморфизма у томатов. Генетика, т. 35, № 10, 1386 -1389.

19. Кочиева Е. 3., Супрунова Т. П. и С. К. Семёнова, 1999. Использование RAPD-анализа для идентификации сортов баклажанов (Solarium melongenaL.). Генетика. Т. 35, № 8, 1165 1168.

20. Оганисян А. С., Кочиева Е. 3. и А. П. Рысков. 1996. Маркирование видов и сортов картофеля с помощью метода RAPD-PCR. Генетика, т. 32, № 448−451.

21. Розанова М. А., 1939. Роль автоплоидии в происхождении сибирской малины. Докл. АН СССР, 24, 58−60.

22. Сиволап Ю. М., Балашова И. А., Трошин Л. П., 1996. Исследование генетического полиморфизма винограда при помощи RAPD-анализа. Цитология и генетика, 30(6): 33−37.

23. Сиволап Ю. М., Вербицкая Т. Г., Тулаева М. И., Барышева И. А. 1993. Анализ генетических дистанций методом ПДРФ у винограда. Цитология и Генетика, 27(6), 24−28.

24. Сиволап Ю. М., Календарь Р. Н., Нецветаев В. П., 1997. Использование продуктов полимеразной цепной реакции для картирования генома ячменя. Генетика, 33(1): 53−60.

25. Сиволап Ю. М., Календарь Р. Н., Чеботарь С. В., 1994. Генетический полиморфизм злаковых растений при помощи ПЦР с произвольными праймерами. Цитология и генетика, 28(6): 54−61.

26. Сиволап Ю. М., Кожухова Н. Э., Вареник Б. Ф., 1999. Идентификация инбредных линий кукурузы с помощью произвольно праймированной ПЦР и SSRПЦР. Доклады Российской Академии Сельскохозяйственных Наук, 6: 3−6.

27. Сиволап Ю. М., Куцевич Л. И., Паламарчук А. И., Тоцкий В. Н., 1997. Молекулярно-генетический полиморфизм озимой твердой пшеницы, определяемый ПЦР с произвольными праймерами. Доклады РАСХН, 1: 6−8.

28. Сиволап Ю. М., Солоденко А. Е., Бурлов В. В., 1998. RAPD анализ молекулярно — генетического полиморфизма подсолнечника (Helian-thus annuus). Генетика, 34(2): 266−271.

29. Сиволап Ю. М., Топчиева Е. А., Чеботарь С. В., 2000. Идентификация и паспортизация сортов мягкой пшеницы методами RAPD и SSRPанализа. Генетика, 36(1): 44−51.

30. Сиволап Ю. М., Чеботарь С. В., Топчиева Е. А., Корзун В. Н., Тоцкий В. Н., 1999. Исследование молекулярно-генетического полиморфизма сортов Triticum aestivum L. с помощью RAPD и SSRP — анализа. Генетика, 35(12): 1665−1673.

31. Сулимова Г. Е., 1993. Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов ДНК сельскохозяйственных животных: методология, результаты и перспективы. Успехи совр. Генетики. Вып. 18.: 3−35.

32. Фортэ А. В., Игнатов А. Н., Пономаренко В. В., Дорохов Д. Б., Савельев Н. И., 2002. Филогения видов яблони рода Malus на основе оценки морфологических признаков и молекулярного анализа ДНК. Генетика, 38(10): 1357−1369.

33. Ярославцев Е. И. Малина. Москва, Колос, 1979. С. 159.

34. Agwanda CO., Lashermes P., Trouslot P. et al., 1997. Identification of RAPD markers for resistance to coffee berry disease, Colletotrichum ka-hawae. in arabica coffee. Euphytica, 97: 241−248.

35. Ajibade S. R., Weeden N. F., Chite S. M. 2000. Inter simple sequence repeat analysis of genetic relationships in the genus Vigna. Euphytica 111: 47−55.

36. Alice, L.A., Eriksson, Т., Eriksen, B. and Campbell, C.S., 1997. Intersub-generic hybridization between a diploid raspberry. Rubus idaeus, and a tetraploid blackberry, R, caesius (Rosaceae). American Journal of Botany, 84, 171.

37. Alice. L.A. and Campbell. C.S., 1996. A phylogeny of Rubus (Rosaceae: Rosoideae) based on internal transcribed space (ITS) sequences of nuclear ribosomal DNA. American Journal of Botany, 83, 136.

38. Antonius, K. and Nybom. H., 1995. Discrimination between sexual recombination and apomixis/automixis in a Rubus plant breeding programme. Hereditas. 123, 205−213.

39. Antonius. K. Werlemark, G. and Nybom, H., 1997. DNA fingerprinting demonstrates extremely low levels of genetic variation among blackberry cultivars grown in Finland. Agricultural and Food Science in Finland, 6, 241−245.

40. Arcade, A., Anselin, F., Faivre Rampant, P., Lesage, M.C., L. E. Paques & D. Prat, 2000. Application of AFLP, RAPD and ISSR markers to genetic mapping of European and Japanese Larch. Theor Appl Genet 100: 299 -307.

41. Areshchenkova, Т. & M. W. Ganal, 1999. Long tomato microsatellites are predominantly associated with centromeric regions. Genome 42: 536 -544.

42. Bammi R.K., 1965. Cytogenetics of Rubus. 4. Pachytene morphology of Rubus parvifolius L. chromosome complement. Can. J. Gen. Cyt., 7, 254 258.

43. Becker, J. & M. Heun, 1995a. Barley microstellites: allele variation and mapping. Plant Molecular Biology 27: 835−845.

44. Beckmann, J.S. & M. Soller, 1990. Toward a unified approach to genetic mapping of eukaryotes based on sequence tagged microsatellite sites. Biotechnology 8: 930−932.

45. Bell, С. J. & J. R. Ecker, 1994. Assignment of 30 microsatellite loci to the linkage map of Arabidopsis. Genomics 19: 137 144.

46. Bretting P.K., Widrlechner M.P., 1995. Genetic markers and plant genetic resource management. Plant. Breed. Rev., 13, 11−86.

47. Bretting P.K., Widrlechner M.P., 1995. Genetic markers and plant genetic resource management. Plant Breed. Rev., 13: 11−86.

48. Bringhurst. R.S., Arulsekar. S. Hancock, J.F. and Voth. V., 1981. Electrophoretic characterization of strawberry cultivars. Journal of the American Society for Horticultural Science, 106, 684−687.

49. Broun, P. & S. D. Tanksley, 1996. Characterization and genetic mapping in simple sequence repeats in the tomato genome. Mol Gen Genet 250: 39 -49.

50. Busemeyer, D.T., Pelikan. S., Kennedy. R.S. and Rogstad, S.H., 1997. Genetic diversity of Philippine Rubus moluccanus L. (Rosaceae) populations examined with VNTR DNA probes. Journal of Tropical Ecology. 14, 867−884.

51. Cao. E.P., 1993." Chloroplast DNA polymorphism in selected species of Rubus L. (Rosaceae). Thesis, Agris-database abstract.

52. Casas A.M., Igartua E., Balaguer G., Moreno M.A., 1999. Genetic diversity of Primus rootstocks analyzed by RAPD markers. Euphytica, 110: 139−149.

53. Cecikc C., Battey N. H. and M. J. Wilkinson. 2001. The potencial of ISSR-PCR primer-pair combination for genetic linkage analysis using the seasonal flowering locus in Fragaria as a model. Theor Appl Genet 103:540−564.

54. Cecikc C., Battey N. H. and M. J. Wilkinson. 2001. The potencial of ISSR-PCR primer-pair combination for genetic linkage analysis using the seasonal flowering locus in Fragaria as a model. Theor Appl Genet 103:540 564.

55. Charlesworth В, Morgan MT, Charlesworth D (1993) The effect of deleterious mutations on neutral molecular variation. Genetics 134:1289−1303.

56. Cohen S.N., Chang A.C.Y., Hsu L., 1972. Non chromosomal antibiotic resistance in bacteria: genetic transformation of Escherichia coli by Rfactor DNA. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 69: 2110 — 2114.

57. Coletta Filho H.D., Machado M.A., Targon M.L.P.N. et al., 1998. Analysis of the genetic diversity among mandarins (Citrus ssp.) using RAPD markers. Euphytica, 102: 133−139.

58. Cousineau J.C. and Donnelly. D.J., 1992a. Use of isoenzyme analysis to characterize raspberry cultivars and detect cultivar mislabelling. HortScience, 27, 1023−1025.

59. Cousineau, J. C and Donnelly. D.J. 1989a. Identification of raspberry cultivars by starch gel electrophoresis and isoenzyme staining. Acta Horticulture, 262, 259−265.

60. Cousineau. J. C, Anderson. A.K., Daubeny. H.A. and Donnelly. D.J., 1993. Characterization of red raspberry cultivars and selections using isoenzyme analysis. HortScience, 28, 1185−1186.

61. Cousineau. J.C. and Donnelly. D.J., 1989b. Identification of raspberry cultivars in vivo and vitro using isoenzyme analysis. HortScience, 24, 490−492.

62. Cousineau. J.C. and Donnelly. D.J., 1992b. Genetic analysis of isoenzymes in raspberry. Journal of the American Society for Horticultural Science, 117, 996−999.

63. Cousineau. J.C., 1992. Isoenzyme studies and tissue culture of raspberry (Rubus). Thesis, Dissertation Abstracts-database.

64. Dahleen L.S., Hoffman D.L., Dohrmann J., Gruber R. and Franckowiak J., 1997. Use of a subset of doubled haploid lines for RAPD interval mapping in barley. Genome, 40: 626−632.

65. Degani С., Rowland L.J., Saunders J.A. ei al., 2001. A comparison of genetic relationship measures in strawberry (Fragariu x anun-assa Duch.) based on AFLP, RAPD and pedigree data. Euphytica, 117: 1−12.

66. Dorokhov D., Kloke E., 1996. Rapid of RAPD analyses of plant genome and nature of the RAPD spectra. German Russian Cooper. Biotechnology. Workshop lv. Plant Molec. Biol., Genetics and Biotechnology, P. 34.

67. Du J.-K., Yao Y.-Y., Ni Z.-F., Peng H.-R., Sun Q.-X., 2002. Genetic diversity revealed by ISSR molecular marker in common wheat, spelt, Com-pactum and progeny of recurrent selection. Acta genet. Sinica, 29(5): 445 452.

68. Dudley J.W., 1993. Molecular markers in plant improvement manipulation of genes affecting quantitative traits. Crop Sci., 33: 660−668.

69. Dunemann F., Kahnau R., Schmidt H., 1994. Genetic relation ships in Mains evaluated by RAPD «fingerprinting» of cultivars and wild species. Plant Breeding, 113: 150−159.

70. Dunning A.M., Talmud P., Humphries S.F., 1988. Errors in the polymerase chain reaction. Nucl. Acids Res., 16: 10 393.

71. Echt, C. S., May-Marquardt, P., M. Hseih & R. Zahorchak, 1996. Charactrization of microsatellite markers in eastern white pine. Genome 39: 1102−1108.

72. Echt, C.S. & P. May-Marquardt, 1997. Survey of microsatellite DNA in pine. Genome 40: 9−17.

73. Ender, A., K. Schwenk, T. Stadler, B. Streit & B. Schierwater, 1996. RAPD identification of microsatellites in Daphina. Molecular Ecology 5:437−441.

74. Eriksson. O. and Bremer. В., 1993. Genet dynamics of the clonal plant Rubus saxatilis. Journal of Ecology. 81, 533−541.

75. Fang D., Krueger R.R., Roose M.L., 1998. Phylogenetic relationships among selected Citrus germplasm accessions revealed by inter simple se-quens repeat (ISSR) markers. J. Am. Soc. Hortic. Sc., 123(4): 612−617.

76. Fanizza G., Colonna G., Resta P., Ferrara G., 1999. The effect of the number of RAPD markers on the evaluation of genotypic distances in Vitis vinifera II Euphytica, 107: 45−50.

77. Fejer S. O., 1977. Inheritance of yild, yield components, and fall fruiting habit in red raspberry diallel crossesCanad. I. Cenet, Cytol, 19 (1), 1−13.

78. Fiedler J., Bufler G., Bangerth F. f 1998. Genetic relationships of avocado (Persea americana Mill.) using RAPD markers. Euphytica, 101: 249−255.

79. Giese H., Holm Jensen A.G., Mathiassen H., Kjaer В., Rasmussen S.K., Bay H. and Jensen J., 1994. Distribution of RAPD markers on a linkage map of barley. Hereditas, 120: 267−273.

80. Gortner, G., M. Nerino, K. Weising, D. Zink, W. Nagi & G. Kahl, 1998. Chromosomal localization and distribution of simple sequence repeats and the Arabidopsis-type telomere sequence in the genome of Cicer arietinum L. ChromRes 6: 97−104.

81. Graham. J. and McNicol. R.J., 1995. An examination of the ability of RAPD markers to determine the relationships within and between Rubus species. Theoretical and Applied Genetics, 90, 1128−1132.

82. Graham. J., McNicol. R.J., Greig. K. and Van de Ven. W.T.G., 1994. Identficiation of red raspberry cultivars and an assessment of their re-latedness using fingerprints produced by random primers. Journal of Horticultural Science, 69,123−130.

83. Graham. J., Squire. В., Marshall. B. and Harrison. R.E., 1997. Spatially dependent genetic diversity within and between colonies of wild raspberry Rubus idaeus detected using RAPD markers. Molecular Ecology, 6. 1001−1008.

84. Grodzicker Т., Williams J., Sharp P., Sambrook J. 1974. Physical mapping of temperature-sensitive mutations of adenoviruses. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 39, 439−446.

85. Gruber F., Knight R.L., Keep E., 1962. Fruit-breeding: berries. Rubus L. Sub-genera Idaeobatus Focke and Eubatus Focke. 1. Systematics. 2. Floral biology and seed formation. Handbuch der Pflanzenzuchtung, 6, 477−487.

86. Guichard. E., 1984. Comparison of two N2 entrainment methods for the extraction of volatile compounds from raspberry. Sciences des Aliments, 4. 317−324.

87. Gupta, P. K. and R. K. Varshney, 2000. The development and use of microsatellite markers for genetic analyses and plant breeding with emphasis on bread wheat. Euphytica 113:163−185.

88. Gupta, P. K. and R. K. Varshney, 2000. The development and use of microsatellite markers for genetic analyses and plant breeding with emphasis on bread wheat. Euphytica 113:163−185.

89. Gupta, P. К., H. S. Balyan, P. C. Sharma & B. Ramesh, 1996. Mi-crosatellites in plants: a new class of molecular markers. Curr Sci 70:4554.

90. Hall H.K., Quazi M.H. & Skirvin R.M., 1990. Isolation of a pure thornless Loganberry by meristem tip culture. Euphytica, 35: 1039−1044.

91. Haskel G., 1960. The raspberry wild in Britain. Watsonia. 4,238−255.

92. Haskell G. and Garrie. J.B., 1966. Fingerprinting raspberry cultivars by empirical paper chromatography. Journal of the Science of Food and Agriculture, 17, 189−192.

93. Heiberg N., Werlemark G. and Nybom. H., 1998. Two Phytophthora resistant raspberry cvs. prove to be almost identical with DNA fingerprinting. Gartenbauwissenschaft.

94. Heinkel R., Hartmann W., Stosser R., 2000. On the origin of the plum cultivars «Cacaks Beauty», «Cacaks Best». «Cacaks Fruitful» as investigated by the inheritance of random amplified polymorphic DNA (RAPD) fragments. Sci. Hortic., 83: 149−155.

95. Heslop-Harrison Y, 1953. Cytological studies in the genus Rubus L. 1. chromosome numbers in the British Rubus flora. New Phytol., 52, 22−39.

96. Hoepfner A.-S., Nestby R. and Nybom H., 1996. Genetic deviation initiated by adventitious shoot regeneration from tissue cultured red raspberry. Journal of Horticultural Science, 71, 71−79.

97. Hoepfner A.-S., Nybom, H., Carlsson U. and Franzen. R., 1993. DNA fingerprinting useful for monitoring cell line identity in micropropa-gated raspberries. Acta Agriculturae Scandinavica. Section B. Soil and Plant Science, 43, 53−57.

98. Hood, D. W., Deadman, M. E., Jennings, M. P., Bisercic, M., Fleischmann, R. D., J. C. Venter & E. R. Moxon, 1996. DNA repeats identify novel virulence genes in Haemophilus influenzae. Proc Natl Acad Sci USA 93: 11 121−11 125.

99. Jeffreys A.J., Brookfield J.F.Y., Semeonoff R., 1985. Positive identification test-case using human DNA fingerprint. 317, 818−819.

100. Jelkman W. and Martin R.R., 1988. Complementary DNA probes generated from double-stranded RNAs of a Rubus virus provide the potential for rapid in vitro detection. Acta Horticulturae, 236, 103−109.

101. Jennings D. L., 1988. Raspberries and Blackberries Their Breeding, De-seases and Growth. Academic Press., London, New York, 1−230.

102. Jennings D.L. and Charmichael E., 1980. Anthocyanin variation in the genus Rubus. New Phytologist, 84, 505 513.

103. Jennings D.L., Daybeny H.A. and Moore J.N., 1990. Blackberries and raspberries. Acta Hortiadturae, 290, 330−389.

104. Joshi, S. P., Gupta, V. S., Aggarwal, R. К., P. K. Ranjekar & D. S. Brar, 2000. Genetic diversity and phylogenetic relationship as revealed by inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism in the genus Oryza. Theor Appl Genet 100: 1311 1320.

105. Kalendar R., Grob Т., Regina M., Suoniemi A. and A. Schulman, 1999. IRAP and REMAP: two new retrotransposon-based DNA fingerprinting techniques. Theor Appl Genet 98:704−711.

106. Kashi Y, Soller M (1999) Functional roles of microsatellites and minisatel-lites. In: Goldstein DB, Schlotterer С (eds) Microsatellites: evolution and applications. Oxford University Press, Oxford, pp 10−23.

107. Kaundun S.S., Zhyvoloup A., Park Y.-G., 2000. Evaluation of the genetic diversity among elite tea (Camellia sinensis van sinensis) accessions using RAPD markers. Euphytica, 115: 7−16.

108. Kelly J.D., 1995. Use of random amplified polymorphic DNA markers in breeding for major gene resistance to plant pathogens. HortSci., 30(3): 461−465.

109. Keep E., 1961. Autum fruiting in raspberries. I. of Hort. Sci. 36 (3), 174 185.

110. Kojima, Т., Nagaoka, Т., К. Noda & Y. Ogihara, 1998. Genetic linkage map of ISSR and RAPD markers in einkorn wheat in relation to that of RFLP markers. Theor Appl Genet 96: 37 45.

111. Kokko H.I., Kivtneva M. and Karenlampi S.O., 1996. Single-step immu-nocapture RT-PCR in the detection of raspberry bushy dwarf virus. BioTechniques, 20, 842−846.

112. Kolodinska A., 2001. Genetic diversity importance and future prospective a study of barley in Nordic Baltic region. Sver. Utsadesforen. Tidskr., Arg. 111(4): 192−195.

113. Kraft Т., Nybom H. and Werlemark. G., 1994. Rubus vestenicensis (Rosaceae) its hybrid origin revealed by DNA fingerprinting. Sordic Journal of Botany, 15(3), 237 — 242.

114. Karp A, Seberg O., Buiatti M., 1996. Molecular techniques in the assessment of botanic diversity. Ann. Bot., 79(2): 143−149.

115. Lagercrantz U, Ellegren H, Andersson L, 1993. The abundance of various polymorphic microsatellite motifs differs between plants and vertebrates. Nucleic Acids Res 21:1111−1115.

116. Lanham P.G., 1996. Estimation of heterozigosity in Ribes nigrum L. using RAPD markers. Genetica, 98: 193−197.

117. Lanham P.G., Brennan R.M., 1999. Genetic characterization of gooseberry (Ribes grossularia, subgenus Grossularia) germplasm using RAPD, ISSR and AFLP markers. J. hortic. Sc. Biotechnology, 74(3): 361−366.

118. Lanham P.G., Korycinska A., Brennan R.M., 2000. Genetic diversity within a secondary gene pool for Ribes nigrum L. revealed by RAPD and ISSR markers. J. hortic. Sc. Biotechnology, 75(4): 371−375.

119. Lawrence F. J., 1975. The current states and Canada. Fruit varieties journal. 34, 84−89.

120. Lee M., 1995. DNA markers and plant breeding programs. Adv. Agron., 55, 265−344.

121. Leroy, X. J., Leon, K., Hily, J. M., P. Chaumeil & M. Branchard, 2001. Detection of in vitro culture-induced instability through inter-simple sequence repeat analysis. Theor Appl Genet 102: 885 891.

122. Levin, I., Gilboa, N., Yeselson, E., S. Shen & A. A. Schaffer, 2000. Fgr, a major locus that modulates the fructose to glucose ratio in mature tomato fruits. Theor Appl Genet 100: 256 262.

123. Levin, I., Gilboa, N., Yeselson, E., S. Shen & A. A. Schaffer, 2000. Fgr, a major locus that modulates the fructose to glucose ratio in mature tomato fruits. Theor Appl Genet 100: 256 262.

124. Lewis D. The relationschip between polyploidy and fruiting habit in the cultivated raspberry. Proceedings of the 7 International Cenetics Congress, Edinburg, 1939 1941, p. 190.

125. Lis J., 1980. Fractionation of DNA fragments by polyethylene glycol induced precipitation. Metod in Enzymology. V. 65. Nucleic Acids. Part INew York, 347−353.

126. Machado M.A., Coletta Filho H.D., Targon M.L.P.N., Pompeu.J.J., 1996. Genetic relationship of Mediterranean mandarins (Citrus deliciosa Tenore) using RAPD markers. Euphytica, 92: 321−326.

127. Marczewski W., 2001. Inter simple sequens repeat (ISSR) markers for the Ns resistance gene in potato (Solarium tuberosum L.). J. Appl. Genet, 42(2): 139−144.

128. Martelli G., Sunseri F., Greco I., Sabina M.R., Porreca P., Levi A., 1999. Strawberry cultivars genetic relationship using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. Adv. Hort. Sci., 13: 99−104.

129. McGregor C.E., Lambert C.A., Greyling M.M., Louw J.M., Warnich L., 2000. A comparative assessment of DNA fingerprinting techniques (RAPD, ISSR, AFLP and SSR) in tetraploid potato (Solarium tuberosum L.) germplasm. Euphytica, 113(2): 135−144.

130. Mehlenbacher S.A., 1995. Classical and molecular approaches to breeding fruit and nut crops for disease resistance. HortScience, 30, 466 477.

131. Melody S. Clark (Ed), 1997(a). Plant Molecular Biology A Laboratory Manual. P. 529.

132. Melody S. Clark (Ed), 1997(b). Plant Molecular Biology A Laboratory Manual. P. 537.

133. Metzgar, D., J. Bytof & C. Wills, 2000. Selection against frameshift mutations limits microsatellite expantion in coding DNA. Genome Res 10: 72 — 80.

134. Monte Corvo L., Cabrita L., Oliveira C., Leitao J., 2000. Assesment of genetic relationships among Pyrus species and cultivars using AFLP and RAPD markers. Genet. Res. Crop. Evolut., 47: 257−265.

135. Monte Corvo L., Goulao L., Oliveira C., 2001. ISSR analysis of cultivars of pear and suitability of molecular markers for clone discrimination. J. Am. Soc. Hortic. Sc., 126(5): 517−522.

136. Moore P.P., 1993. Chloroplast DNA diversity in raspberry. Journal of the American Society for Horticultural Science, 118, 371−376.

137. Morgante, M. & J. Vogel, 1994. Compound microsatellite primers for the detection of genetic polymorphisms. US patent application no. 08/326 456.

138. Morgante, M., A. Rafalski, P. Biddle, S. Tingey & X.M. Oliveri, 1994. Genetic mapping and variability of seven soybean simple sequence repeat loci. Genome 37: 763−769.

139. Nagaoka Т., Ogihara Y., 1997. Applicability of inter simple sequence repeat polymorphisms in wheat for use as DNA markers in comparison to RFLP and RAPD markers. Theor Appl Genet, 94: 597−602.

140. Naruhashi N. and Masuda N., 1986. Seasonal changes of peroxidase isoenzyme in several Rubus species. Acta Horticulturae, 183, 297−304.

141. Nei, M., F. Tajima & Y. Tateno, 1983. Accuracy of estimated phylogenetic trees from molecular data. II. Gene frequency data. J Mol Evol 19: 153 — 170.

142. Nicolosi E., Deng Z.N., Gentile A. et al., 2000. Cytrus phylogeny and genetic origin of important species as investigated by molecular markers. Theor. Appl. Genet., 100: 1155−1166.

143. Nilsson N.-O., Hallden C., Hansen M., Hjerdin A. and Sail Т., 1997. Comparing the distribution of RAPD and RFLP markers in a high density linkage map of sugar beet Genom, 40: 644−651.

144. Noli Enrico, Salvi Silvio and Tuberosa Roberto, 1997. Comparative analysis of genetic relationships in barley based on RFLP and RAPD markers. Genome, 40: 607−616.

145. Nonnecke G. R. Luby J. J., 1992. Raspberry cultivars and production in the Midwest. Fruit Vaieties Journal. 4, 207−212.

146. Nybom H. and Hall H.K., 1991. Minisatellite DNA «fingerprints» can distinguish Rubus cultivars and estimate their degree of related-ness. Euphytica, 53, 107−114.

147. Nybom H. and Schaal B.A., 1990. DNA «fingerprints» reveal genotypic distributions in natural populations of blackberries and raspberries (Rubus, Rosaceae). American Journal of Botany, 77, 883−888.

148. Nybom H., 1994. DNA fingerprinting a useful tool in fruit breeding. Euphynca, 11, 59−64.

149. Nybom H., 1995. Evaluation of interspecific crossing experiments in facultatively apomictic blackberries (Rubus subgen. Rubus) using DNA fingerprinting. Hereditas, 122, 57−65.

150. Nybom H., Rogstad S.H. and Schaal B.A., 1990. Genetic variation detected by use of the M13 «DNA fingerprint» probe in Malus, Prunus and Rubus (Rosaceae). Theoretical and Applied Genetics, 79, 153−156.

151. Nybom H., Schaal B.A. and Rogstad S.H., 1989. DNA «fingerprints» can distinguish cultivars of blackberries and raspberries. Acta Horticultural 262, 305−310.

152. Nybom N., 1966. Thin-layer chromatographv with the Balsgard system. Acta Agriculturae Scandinavica, Suppl., 16, 210−212.

153. Oliveira C.M., Mota M., Monte-Corvo L. el al., 1999. Molecular typing of Pyrus based on RAPD markers. Sci. Hortic., 79: 163−174.

154. Ourecky D. K., Slate G. L., 1969.Heritage. A new fall-bearing red raspberry. Res. Circular of the New York St. Agric. Exp. St., 19.

155. Pamfil.D., Zimmerman R.H., Naess. S.K. and Swartz. H.J., 1996. Taxo-nomic relationships in Ritbus based on RAPD and hybridization analysis. HortScience, 31, 620.

156. Pandolfi S., Rosati A. and Standardi A., 1993. Isozymatic patterns of 15 cultivars of Rubus idaeus L. Acta Horticuiturae, 352. 441−443.

157. Parent J.-G. and Page D., 1992. Identification of raspberry cultivars by non-radioactive DNA fingerprinting. HortScience, 27,1108−1110.

158. Parent J.-G. and Page D., 1998. Identification of raspberry cultivars by sequence characterized amplified region DNA analysis. HortScience, 33, 140−142.

159. Parent J.-G., Fortin. M.G. and Page D., 1993. Identification of raspberry cultivars by random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. Canadian Journal of Plant Science, 73, 1115−1122.

160. Parsons B. J., Newbury H. J., Jackson M. T. and В. V. Ford-Lloyd. 1997. Contrasting genetic diversity relationship are revealed in rice (Oriza sativa L.) using different marker types. Mol Breeding 3:115−125.

161. Parsons B. J., Newbury H. J., Jackson M. T. and В. V. Ford-Lloyd. 1997. Contrasting genetic diversity relationship are revealed in rice (Oriza sativa L.) using different marker types. Mol Breeding 3:115−125.

162. Pasakinskiene I., Griffiths С. M., Bettany A. J. E., Paplauskiene V., Humphreys M. W. 2000. Anchored simple sequence repeats as primers to generate species-specific DNA markers in Lolium and Festuca grasses. Theor Appl Genet 100:384−390.

163. Plaschke, J., M.W. Ganal & M.S. Roder, 1995. Detection of genetic diversity in closely related bread wheat using microsatellite markers. Theor Appl Genet 91: 1001−1007.

164. Potter D., Gao F., Aiello G., Leslie C., McGranahan G., 2002. Inter simple sequens repeat markers for fingerprinting and determining genetic relationships of walnut (Juglan regia) cultivars. J. Am. Soc. Hortic. Sc., 127(1): 75−81.

165. Powell, W., G.C. Machray & J. Provan, 1996a. Polymorphism revealed by simple sequence repeats. Trends Plant Sci 1: 215−222.

166. Powell, W., M. Morgante, C. Andre, M. Hanafey, J. Vogel, S. Tingey & J.A. Rafalaski, 1996b. The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Molecular Breeding 2: 225−238.

167. Prasad, M" R.K. Varshney, J.K. Roy, H.S. Balyan & P.K. Gupta, 2000. The use of microsatellites for detecting DNA polymorphism, genotype identification and genetic diversity in wheat. Theor Appl Genet 100: 584 -592.

168. Prevost, A. & M. J. Wilkinson, 1999. A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars. Theor Appl Genet 98: 107- 112.

169. Qi Lili, Cao Mingshu, Chen Peidu, Li Wanlong and Liu Dajun, 1996. Identification, mapping, and application of polymorphic DNA associated with resistance gene Pm21 of wheat. Genome, 39: 191−197.

170. Qian W., Ge S., Hong D-Y. 2001. Genetic variation within and among population of wild rice Oriza granulata from China detected by RAPD and ISSR markers. Theor Appl Genet 102:440−449.

171. Richardson, Т., S. Cato, J. Ramser, G. Kahl & K. Weising, 1995. Hybridization of microsatellites to RAPD: a new source of polymorphic markers. Nucl Acids Res 23: 3798−3799.

172. Roder, M.S., J. Plaschke, S.U. Konig, A. Bomer, M.E. Sorells, S.D. Tanksley & M.W. Canal, 1995. Abundance, variability and chromosomal location of microsatellites in wheat. Mol Gen Genet 246: 327−333.

173. Saiki R.K., Gelfand D., Staffel S. et al., 1988. Primer directed enzymatic amplification of with a thermosteble DNA polymerase. Scince, 239: 487 491.

174. Saiki R.K., Scharf F., Faloona F. et al., 1985. Enzymatic amplification of |3 globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia. Ibid, 230: 1350−1354.

175. Schlz В., Westphal L. & Wricke G., 1994. Linkage groups of isozymes, RFLP and RAPD markers in carrot (Daucus carota L. sativus). Euphytica, 74: 67−76.

176. Schmidt, T. & J.S. Heslop-Harrison, 1996. The physical and genomic organization of microsatellites in sugar beet. Proc Nati Acad Sci USA 93: 8761−8765.

177. Schulz В., Westphal L. & Wricke G. 1994. Linkage groups of isozymes, RFLP and RAPD markers in carrot (Daucus carota L. sativus). Euphytica, 74, 67−76.

178. Shimada Т., Hayama H., Haji T. et al., 1999. Genetic diversity of plums characterized by random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. Euphytica, 109: 143−147.

179. Shimada Т., Hayama H., Nishimura K, et al., 2001. The genetic diversities of 4 species of subg. Luthocerasus (Prunus. Rosaceae) revealed by RAPD analysis. Euphytica, 117: 85−90.

180. Slate G. L. Suit R. F., 1944. A second on the breeding of autumn-fruiting red raspberries. Proc. of the Amer. Soc. For Hort. Sci., 44, 283−288.

181. Smith J.S.C., Smith O.S., 1992. Fingerprinting crop varieties. Adv. Agron., 47: 85−140.

182. Somers D.J., Zhou Z., Bebeli P.J. et al., 1996. Repetitive, genome specific probes in wheat (Triticum aestivum) L-Em Thell amplified with minisatellite core sequences. Theor. Appl. Genet., 93(5−6): 982−989.

183. Tanksley S.D., Meding-Filho H., Rick C.M. 1982. Use of naturally-occuring enzyme variation to detect and map genes controlling quantitative traits in an interspecific backross of tomato. Heredity, 49,11−25.

184. Tautz, D., 1989. Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers. Nucl Acids Res 17:6463−6471.

185. Thompson M.M., 1995. Chromosome numbers of Rubus cultivars at the National clonal germplasm repository. HortScience, 30(7), 1453−1456.

186. Thompson M.M., 1997. Survey of chromosome numbers in Rubus (Rosaceae: Rosoideae). Ann. Missouri Bot. Garden, 84(1), 128−164.

187. Tikunov Yu.M., Khrustaleva L.I. & Karlov G.I., 2003. Application of ISSR markers in the genus Lycopersicon. Euphytica 131: 71−80.

188. Trople D.D. and Moore P.P., 1998. Taxonomic relationships in Rubus based on RAPD analysis. Seventh International Rubus-Ribes Symposium,. Australia and New Zealand 1998, Congress Abstracts.

189. Tzouwara-Karayanni S.M. and Philianos S.M., 1981. Chemical constituents of Rubus ulmifolius Schott. Quarterly Journal of Crude Drug Research, 19(2−3), 127−130.

190. Van der Beek, J. G., Yerkerk, K., P. Zabel & P. Lindhout, 1991. Mapping strategy for resistant genes in tomato based on RFLPs between cultivars: Cf9 (resistance to Cladosporium fulvum) on chromosome 1. Theor Appl Genet 84: 106- 112.

191. Vassart G., Georges M., Monsier et al., 1987. F sequence in M13 phage detects hypervariable minisatellites in human and animal DNA. Scince. 235, 683−684.

192. Verwoerd T.C., Dekker B.M.M., Hoehema A., 1988. A small scale procedure for the rapid isolation of plant RNAs. Nucl. Acids. Res., 17(6): 2362.

193. Vidal J.R., Coarer M., Defontaine A., 1999. Genetic relationships among grapevine varieties grown in different French and Spanish regions based on RAPD markers. Euphytica, 109: 161−172.

194. Yirk P. S., Zhu J., Newbury H. J., Bryan G. J., Lackson M. Т., Ford-Lloyd В. V. 2000. Effectiveness of different classes of molecular markers for classifying and revealing variation in rice (Oryza sativa) germplasm. Euphytica 112:275−284, 2000.

195. Vosman, B. & P. Arens, 1997. Molecular characterization of GATA/GACA microsatellite repeats in tomato. Genome 40: 25−33.

196. Wang, G., R. Mahalingam & H.T. Karp, 1998. (C-A) and (G-A) anchored simple sequence repeats (ASSRs) generated polymorphism in soybean, Glycine max L. Merr. Theor. Appl Genet 96: 1086−1096.

197. Wang, Y.-H., Thomas, C.E., and Dean, R.A. 1997. A genetic map of melon (Cucumis melo L) based on amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Theor. Appl. Genet. 95: 791−798.

198. Wang, Z., J.L. Weber, G. Zhong & S.D. Tanksley, 1994. Survey of plant short tandem repeats. Theor Appl Genet 88: 1−6.

199. Waugh R., van de Yen M., Millam S. Brennan R. and Powell W., 1990a. The potential use of restriction fragment length polymorphism in Rubus breeding. Acta Horticulturae, 280, 541−545.

200. Waugh R., van de Ven W.T.G., Phillips. M.S. and Powell W., 1990b. Chloroplast diversity in the genus Rubus (Rosaceae) revealed by Southern hybridization. Plant Systematics and Evolution, 172, 65−75.

201. Weeden N.F. and Lamb R.C., 1985. Identification of apple cultivars by isozyme phenotypes. Journal of the American Society for Horticultural Science, 110, 509−515.

202. Weeden N.F., Hemmat M., Lawson D.M., Lodhi M., Bell R.L., Manga-naris, A.G., Reisch B.L., Brown S.K. and Ye G.-N., 1994. Development and application of molecular marker linkage maps in woody fruit crops. Euphytica, 11, 71−75.

203. Weising K., Nybom H., Wolff K. and Meyer W., 1995. DNA fingerprinting in plants and fungi. CRC Press Inc., Boca Raton. Florida. USA.

204. Welsh J & McClelland M., 1990. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nuc. Acids Res. 18: 7213−7218.

205. Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J., Rafalski J.A. & Tingey S.V., 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nuc. Acids Res., 18: 6531−6535.

206. Witsenboer, H" J. Vogel & R.W. Michelmore, 1997. Identification, genetic localization, and allelic diversity of selectively amplified microsatellite polymorphic loci in lettuce and wild relatives (Lactuca spp.). Genome 40: 923−936.

207. Wolff, К., E. Zietkiewicz & H. Hofstra, 1995. Identification of chrysanthemum cultivars and stability of fingerprint patterns. Theor Appl Genet 91:439−447.

208. Wu Y.-T., Zhang T.Z., Yin J.-M., 2001. Genetic diversity detected by DNA markers and phenotypes in upland cotton. Acta. Genet. Sinica, 28(11): 1040−1050.

209. Yang Hongyu and Kruger Jutta, 1994. Identification of an RAPD Marker Linked to the VF Gene for Scab Resistance in Apples. Plant Breeding, 112: 323−329.

210. Zhou Z.Q., Li Y.N., 2000. The RAPD evidence for the phylogenetic relationship of the closely related species of cultivated apple. Genet. Res. Crop Evolut., 47: 353−357.

Показать весь текст
Заполнить форму текущей работой

Сессия? Спокойно!