Изменчивость митохондриальной ДНК гольцов рода Salvelinus
Диссертация
Практическая значимость работы. Лососевые рыбы рода 8а1 у.е.Нпиз являются важными компонентами водных экосистем Дальнего Востока. Для гольцов характерно повышенное биологическое разнообразие, а также существование редких, эндемичных форм. Гольцовые рыбы — ценные объекты рыболовного промысла. Они имеют особое значение для экономики Ф коренных народностей, для любительского и спортивного лова… Читать ещё >
Список литературы
- Алтухов Ю.П., Салменкова Е.А, Полиморфизм ДНК в популяционной генетике // Генетика. 2002. Т. 38. № 9. 1173−1195.
- Барсуков В.В. К систематике чукотских гольцов рода Salvelinus // Вопросы ихтиологии. 1960. Т. 14. 3−17.
- Берг Л.С. Рыбы пресных вод СССР и сопредельных стран. М.- Л.: изд-во АНСССР, 1948.4.1.467 с.
- Брыков Вл.А. Эволюция генома, изменчивость и дивергенция ДНК у морских животных: автореф. дис. …докт. биол. наук. М.: Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН, 2001. 52 с.
- Вейр Б. Анализ генетических данных. М.: Мир, 1995. 320 с.
- Викторовский P.M. Механизмы видообразования у гольцов Кроноцкого озера. М.: Наука, 1978. 110 с.
- Викторовский P.M. Сравнительная кариология, эволюция и видообразование у гольцов рода Salvelinus // Экология и систематика лососевидных рыб. Л.: ЗИН АН СССР, 1976. 16−19.
- Викторовский P.M., Глубоковский М. К. Механизмы и темпы видообразования у гольцов рода Salvelinus (Salmonidae, Pisces) // Докл. АН СССР. 1977. Т. 235. № 4. 946−949.
- Викторовский P.M., Глубоковский М.К, Ермоленко Л. Н., Скопец М. Б, Гольцы рода Salvelinus из озера Эльгыгытгын (Центральная Чукотка) // Рыбы в экосистемах лососевых рек Дальнего Востока, Владивосток: ДВНЦ АН СССР, 1981. 67−78,
- Волобуев В.В. Систематика и экология нейвы Salvelinus neiva Taranetz оз. Уегинского (бассейн р. Охоты) // Вопр. ихтиологии. 1976. Т. 16. № 6. 989−999,
- Волобуев В.В., Васильева Е. Д., Савваитова К. А. О систематическом статусе чукотских проходных гольцов рода Salvelinus // Вопр. ихтиологии. 1979. Т. 19. № 3. 408−418.
- Глубоковский М.К. Таксономические отношения гольцов рода Salvelinus в бассейне р. Камчатки // Биология моря. 1977. Т. 3. 24−35.
- Глубоковский М.К., Черешнев И. А. Спорные вопросы филогении гольцов рода Salvelinus Голарктики. I. Изучение проходных гольцов из бассейна Восточно-Сибирского моря // Вопр. ихтиологии. 1981. Т. 21. № 5. 771−786.
- Глубоковский М.К. Эволюционная биология лососевых рыб. М.: Наука, 1995.343 с.
- Гриценко О.Ф., Савваитова К. А., Груздева М. А., Кузищин К. В. О таксономическом положении гольцов рода Salvelinus северных Курильских островов // Вопр. ихтиологии. 1998. Т. 38. № 2. 189−198.
- Гудков П.К. Материалы по биологии кунджи Salvelinus leucomaenis бассейна Охотского моря // Вопр. ихтиологии. 1991. Т. 30. № 6. 898−908.
- Гудков O.K., Радченко О. А. Характеристика гольца рода Salvelinus из Элекчанских озер (северное побережье Охотского моря) — морфология, биология, генетика//Вопр. ихтиологии. 2000. Т. 40. № 5. 621−631.
- Дорофеева Е.А., Савваитова К. А. Сем. 5. Salmonidae // Аннотированный каталог круглоротых и рыб континентальных вод России, М.: Наука, 1998. ^ 31−41. I
- Животовский Л. А, Статистические методы анализа частот генов в природных популяциях // Итоги науки и техники. Общая генетика. М.: ВИНИТИ АН СССР, 1983. Т. 8. 76−104.
- Животовский ЛА. Популяционная биометрия. М.: Наука, 1991. 271 с.
- Кагановский А.Г. Голец из бассейна Берингова моря // Вопр. ихтиологии. 1955. Т. 3. 54−56.
- Картавцев Ю.Ф., Глубоковский М. К., Черешнев И. А. Генетическая дифференциация и изменчивость двух симпатрических видов гольцов (Salvelinus, Salmonidae) Чукотки//Генетика. 1983. Т. 19. 584−593.
- Кеннетт Дж. Морская геология: В 2-х т. Т. 1. М.: Мир, 1987. 397 с.
- Кирильчик СВ., Слободянюк Я. Эволюция фрагмента гена цитохрома b митохондриальной ДНК байкальских и внебайкальских видов подкаменщиковых рыб // Мол. биол. 1997. Т. 31. № 1. 168−175.
- Комплексные исследования экосистем субарктической части Северо- Востока Азии в 1997 г. М.: ВИНИТИ, 1998.
- Лакин Г. Ф. Биометрия. М.: Высш. школа, 1973. 343 с.
- Льюин Б. Гены. М.: Мир, 1987. 544 с.
- Малярчук Б.А. Проблемы молекулярной систематики рода Salvelinus, основанной на данных об изменчивости нуклеотидных последовательностей главной некодирующей области митохондриальной ДНК // Генетика. 2002. Т. 38. № 8. 1−6.
- Минченко А.Г., Дударева Н. А. Митохондриальный геном. Новосибирск: Наука, 1990. 193 с.
- Олейник А.Г. Молекулярная эволюция лососевых рыб: автореф. дис. … канд. биол, наук. Владивосток: ИБМ ДВО РАН, 1995. 23 с.
- Олейник А.Г. Молекулярная филогения лососевых рыб: соответствие результатов анализа ядерной и митохондриальной ДНК // Генетика. 1997. Т. 33. № 2. 229−234.
- Олейник А.Г., Скурихина Л. А. Родственные взаимоотношения проходных гольцов рода Salvelinus (Salmonidae, Salmoniformes) по данным рестриктазного анализа ядерной ДНК // Генетика. 1999. Т. 35. № 9. 1258−1268.
- Олейник А.Г., Скурихина Л. А., Брыков Вл.А. Дивергенция мальмы Salvelinus malma в азиатской части Северной Пацифики по данным PCR-RFLP-анализа мрггохондриальной ДНК // Генетика. 2002. Т. 38. № 10. 1393−1401.
- Омельченко В.Т., Политов Д. В., Салменкова Е. А., Малинина Т. В., Фролов СВ. Генетическая дифференциация симпатричных гольцов рода Salvelinus р. Яма//Генетика. 1996. Т. 32. № 11. 1562−1568.
- Омельченко В.Т., Салменкова Е. А., Малинина Т. В., Фролов СВ. Генетическая дифференциация симпатричных популяций гольцов рода Salvelinus озера Аччен (Чукотский полуостров) // Генетика. 1998. Т. 34. № 3. 399−405.
- Омельченко В.Т., Салменкова Е. А. Генетические различия гольцов арктической группы (Salvelinus alpinus L., Salvelinus taranetzi Kaganovsky) и тихоокеанской мальмы (Salvelinus malma Walbaum) // Генетика. 1998. Т. 34. №
- Осипов А.Г., Берначе Л. «Атлантическая» и «Дунайская» филогенетические группы кумжи Salmo trutta complex: генетическая дивергенция, эволюция, охрана//Вопр. ихтиологии. 1996. Т. 36. № 6. С 762−786.
- Осипов А.Г., Павлов СД., Максимов В. А. Аллозимная изменчивость и генетическая дифференциация популяций арктического гольца Salvelinus alpinus L. на ареале от Балтики до Таймыра // Генетика. 1996. Т. 32. № 4. С 547−559.
- Осинов А.Г., Павлов Д. Аллозимная изменчивость и генетическая дивергенция популяций арктического гольца и мальмы (Salvelinus alpinus — S. malma complex) // Вопр. ихтиологии. 1998. Т. 38. № 1. 47−61.
- Осинов А.Г. Эволюционные взаимоотношения между основными таксонами Salvelinus alpinus — Salvelinus malma complex: результаты сравнигельного анализа аллозимных данных разных авторов // Вопр. ихтиологии. 2001. Т. 41. № 2. 167−183.
- Осинов А.Г. Арктический голец Salvelinus alpinus Забайкалья и Таймыра: генетическая дифференциация и происхождение // Вопр. ихтиологии. 2002. Т. 42. № 2. 149−160.
- Павлов Д.С., Савваитова К. А., Груздева М. А. и др. Разнообразие рыб Таймыра: Систематика, экология, структура видов как основа биоразнообразия в высоких широтах, современное состояние в условиях антропогенного воздействия. М.: Наука, 1999. 207 с,
- Политов Д.В., Омельченко В. Т., Салменкова Е. А., Малинина Т. В. Генетическая дифференциация арктических и дальневосточных гольцов рода Salvelinus // Генетика. 1998. Т. 34. № 1. 83−92.
- Радченко О.А., Малярчук Б. А., Соловенчук Л. Л. Сравнительный рестрикционный анализ сегмента гена цитохрома b у кижуча, кеты и горбуши //Генетика. 1997а. Т. 33. № 4. 471−474.
- Радченко О.А., Дмитренко И. С., Малярчук Б. А. Полиморфизм гена цитохрома b у тихоокеанских лососей рода Oncorhynchus // Тезисы докладов 1 Всероссийского конгресса ихтиологов. 19 976. 363.
- Радченко О.А. Молекулярно-генетическая дифференциация тихоокеанских лососей по данным об изменчивости митохондриальной ДНК // Мол. биол. 1998. Т. 32. № 2. 376−377.
- Радченко О.А., Малярчук Б. А. Генетическая дифференциация популяций мальмы и гольца Таранца по данным рестрикционного анализа гена цитохрома b // Генетика. 1999. Т. 35. № 8. 1104−1108.
- Радченко О.А. Генетическая дифференциация северной и южной форм мальмы по данным рестрикционного анализа митохондриальной ДНК // Генетика. 2002. Т. 38. № 4. 521−528.
- Савваитова К.А. Арктические гольцы (структура популяционных систем, перспективы хозяйственного использования). М.: Агропромиздат, 1989. 223 с.
- Салменкова Е.А., Омельченко В. Т. Популяционно-генетическая структура мальмы (Salvelinus malma Walbaum) Юго-Восточного Сахалина и южных Курильских островов // Генетика. 2000. Т. 36. № 8. 1100-И10.
- Сычевская Е.К. Пресноводная палеогеновая ихтиофауна СССР и Монголии. М.: Наука, 1986. 157 с.
- Таранец А.Я. О некоторых новых пресноводных рыбах из Дальневосточного Края //Докл. АН СССР. Сер. А. 1933. № 2. 83−85.
- Фролов СВ. Дивергенция кариотипов чукотских гольцов // Докл. РАН, 1997. Т. 357. № 5. С 703−705.
- Фролов СВ., Фролова В. Н., Молодиченко А. В. Кариотип мальмы Salvelinus malma реки Яма и таксономический статус северной и южной мальмы //Биология моря. 1997. Т. 23. № 5. 309−313,
- Фролов СВ. Изменчивость и эволюция кариотипов лососевых рыб. Владивосток: Дальнаука, 2000. 229 с.
- Фролов СВ. Кариологические различия северной мальмы Salvelinus malma malma и белого гольца Salvelinus albus из бассейна реки Камчатки // Генетика. 2001. Т. 37. № 3. 350−357.
- Черешнев И.А. К вопросу о таксономическом статусе симпатрических проходных гольцов рода Salvelinus (Salmonidae) Восточной Чукотки // Вопр. ихтиологии. 1982. Т. 22. № 6. 922−936.
- Черешнев И.А., Скопец М. Б., Гудков П. К. Новый вид гольца Salvelinus levanidovi sp. nov. из бассейна Охотского моря // Вопр. ихтиологии. 1989. Т, 29. № 5. 691−704.
- Черешнев И.А., Скопец М.Б, Salvethymus svetovidovi gen. et sp. nova — новая эндемичная рыба из подсемейства лососевых (Salmoninae) из озера ц Эльгыгытгын (Центральная Чукотка) // Вопр. ихтиологии. 1990. Т. 30. № 2. 201−213.
- Черешнев И.А., Скопец М. Б. Биология гольцовых рыб озера Эльгыгытгын // Природа впадины озера Эльгыгытгын (проблемы изучения и охраны). Магадан: СВКНИИ ДВО РАН, 1993. 105−127.
- Черешнев И.А. Биологическое разнообразие пресноводной ихтиофауны Северо-Востока России. Владивосток: Дальнаука, 1996. 198 с.
- Черешнев И.А. Биогеография пресноводных рыб Дальнего Востока России. Владивосток: Дальнаука, 1998. 131 с.
- Черешнев И.А., Волобуев В. В., Шестаков А. В., Фролов СВ. Лососевидные рыбы Северо-Востока России. Владивосток: Дальнаука, 2002. 496 с.
- Шедько СВ. Филогения митохондриальной ДНК лососевых рыб подсемейства Salmoninae: анализ последовательностей гена цитохрома b // Генетика. 2002. Т. 38. № 3. 357−367.
- Andersson L., Ryman N., Stahl G. Protein loci in the Arctic charr, Salvelinus alpinus L.: electrophoretic expression and variability patterns // J. Fish. Biol. 1983. V, 23. P. 75−94.
- Anderson S., de Bruijn M.H.L., Coulson A.R., Eperon I. C, Sanger F., Young I.G. Complete sequence of bovin mitochondrial DNA // J. Mol. Biol. 1982. V. 156. P. 683−717.
- Aquadro C.F., Greenberg B.D. Human mitochondrial DNA variation and evolution: Analysis of nucleotide sequences from seven individuals // Genetics. 1983. V. 103. P. 287−312.
- Amason U., Gullberg A., Widegren В. The complete nucleotide sequence of the mitochondrial DNA of the fm whale, Balaenoptera physalus // J. Mol. Evol. 1991. V. 33. P. 556−568. т
- Attardi G. Animal mitochondrial DNA: An extreme example of genetic economy // Int. Rev. Cyt. 1985. V. 93. P. 93−145.
- Avise J.C. Mitochondrial DNA and the evolutionary genetics of higher animals // Proc. Roy. Soc. Lond. B. 1986. V. 312. P. 325−342.
- Avise J.C. Molecular markers, natural history and evolution. N. Y.: Chapman andHall, 1994. S l i p .
- Avise J. C, Bermingham E., Kessler L.G., Saunders N.C. Characterization of mitochondrial DNA variability in a hybrid swarm between subspecies of bluegill sunfish (Lepomis macrochir) // Evolution. 1984. V. 38. P. 931−941.
- Avise J. C, Arnold J., Ball R.M., Bermingham E., Lamb Т., Neigel J.E., Reeb C.A., Saunders N. C Intraspecific phylogeography: The mitochondrial DNA bridge between population genetics and systematics // Ann. Rev. Ecol. Syst. 1987. V. 18. P. 489−522.
- Bartlett S.E., Davidson W.S. Identification of Thunnus tuna species by the polymerase chain reaction and direct sequence analysis of their mitochondrial cytochrome b genes // Can. J. Fish. Aquat. Sci. 1991. V. 48. P. 309−317.
- Barton N.bl., Charlesworth B. Genetic revolutions, founder effects, and speciation // Ann. Rev. Ecol. Syst. 1984. V. 15. P. 133−164.
- Battey J., Clayton D.A. The transcription map of human mitochondrial DNA implicates transfer RNA excision as a major processing event // J. Biol. Chem. 1980. V. 255. P. 11 599−11 606.
- Beckenbach A.T., Thomas W.K., Sohrabi H. Intraspecific sequence variation in the mitochondrial genome of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) // Genome. 1990. V. 33. P. 13−15.
- Behnke R.J. Organizing the diversity of the Arctic charr complex // Biology of the Arctic charr: Proc. Int. Symp. on Arctic charr, Winnipeg, May 1981. Winnipeg: Univ. Manitoba Press, 1984. P. 3−21.
- Behnke R.J. Interpreting the phylogeny of Salvelinus // Physiol. Ecol. Japan. 1989. Spec. V.l. P. 35−48. т
- Bentzen P., Wright J.M., Bryden L.T. et al. Tandem repeat polymorphism in the mitochondrial control region of redfishes (Sebastes: Scorpaenidae) // J. Heredity. 1998. V. 89. P. 1−7.
- Bematchez L., Glemet H., Wilson C. C, Danzmann R.G. Introgression and fixation of Arctic char (Salvelinus alpinus) mitochondrial genome in an allopatric population of brook trout (Salvelinus fontinalis) // Can. J. Fish. Aquat. Sci. 1995. V.
- Bematchez L., Wilson C.C. Comparative phylogeography of Nearctic and Palearctic fishes // Mol. Ecol. 1998. V. 7. P. 431−452.
- Bibb M.J., Van Etten R.A., Wright СТ., Walberg M.W., Clayton D.A. Sequence and gene organization of mouse mitochondrial DNA // Cell. 1981. V. 26. P. 167−180.
- Brown J.R., Gilbert T.L., Kowbel D.J., O’Hara P.J., Buroker N.E., Beckenbach A.T., Smith M.J. Nucleotide sequence of the apocytochrome В gene in white sturgeon mitochondrial DNA //Nucl. Acids. Res. 1989. V. 17. P. 4389.
- Brown W.M. The mitochondrial genome of animals // Molecular Evolutionary Genetics / Eds. R.J. Macintyre. N. Y.: Plenum Press, 1985. P. 95−130.
- Brown W.M., George M.Jr., Wilson A.C. Rapid evolution of mitochondrial DNA//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1979. V. 76. P. 1967−1971.
- Brown W.M., Prager E.M., Wang A., Wilson A.C. Mitochondrial DNA sequences of primates: Tempo and mode of evolution // J. Mol. Evol. 1982. V. 18. P. 225−239.
- Brunner P.C., Douglas M.R., Osinov A., Wilson C. C, Bematchez L, Holarctic phylogeography of arctic charr (Salvelinus alpinus L.) inferred from mitochondrial DNA sequnces // Evolution. 2001. V. 55. № 3. P. 573−586.
- Buroker N.E., Brown J.R., Gilbert T.A., O’Hara P.J., Beckenbach A.T., Thomas W.K., Smith M.J. Length heteroplasmy of sturgeon mitochondrial DNA: An illegitimate elongation model // Genetics. 1990. V. 124. P. 157−163.
- Cann R.L., Brown W.M., Wilson A.C. Ро1утофЬ1с sites and the mechanism of evolution in human mitochondrial DNA // Genetics. 1984. V. 106. P. 479−499.
- Cantatore P., Robert! M., Rainaldi G., Gadaleta M.N., Saccone C. The complete nucleotide sequence, gene organization, and genetic code of the mitochondrial genome of Paracentrotus lividus // J. Biol. Chem. 1989. V. 264. P. 10 965−10 975.
- Cantatore P., Saccone С Organization, structure, and evolution of mammalian mitochondrial genes//Int. Rev. Cytol. 1987. V. 108. P. 149−208.
- Carr S.M., Marshall D. DNA sequence variation in the mitochondrial cytochrome b gene of Atlantic cod (Gadus morhua) detected by the polymerase chain reaction // Can. J. Fish. Aquat. Sci. 1991. V. 48. P. 48−52.
- Cavender T.M., Kimura S. Cytotaxonomy and interrelationships of Pacific BasinSalvelinus/ZPhysiol.Ecol. Jap. 1989. V. l .P. 49−68.
- Clary D.O., Wolstenholme D.R. The mitochondrial DNA molecule of Drosophila yakuba: nucleotide, gene organization and genetic code // J. Mol. Evol. 1985. V. 22. P. 252−271.
- Clayton D.A. Transcription of the mammalian mitochondrial genome // Ann. Rev. Biochem. 1984. V. 53. P. 573−594.
- Clayton D.A. Replication and transcription of vertebrate mitochondrial DNA // Ann. Rev. Cell. Biol. 1991. V. 7. P. 453−478.
- Consuegra S., Garcia de Leaniz C, Serdio A., Gonzalez Morales M., Straus 1.G., bCnox D., Verspoor E. Mitochondrial DNA variation in Pleistocene and modem Atlantic salmon from Iberian glacial refugium // Mol. Ecol. 2002. V. 11. №
- Crane P.A., Seeb L.W., Seeb J.E. Genetic relationships among Salvelinus species inferred from allozyme data // Can. J. Fish. Aquat. Sci. 1994. V. 51. № 1. P. 182−197.
- Dawid LB. Evolution of mitochondrial DNA sequences in Xenopus // Dev. Biol. 1972. V. 29. P. 139−151.
- DeCicco A.L. Long-distance movements of anadromous dolly varden between Alaska and the USSR//Arctic. 1992. V. 45. P. 120−123.
- Densmore L.D., Wright J.W., Brown W.M. Length variation and heteroplasmy are frequent in mitochondrial DNA from parthenogenetic and bisexual lizards (genus Cnemidophorus) // Genetics. 1985. V. 110. P. 689−707.
- Derenko M., Malyarchuk В., Shields G. Mitochondrial cytochrome b sequence from a 33,000 year-old wooly mammoth (Mammuthus primigenius) // Ancient Biomolecules. 1997. V. 1. P. 149−153.
- Desjardins P., Morals R. Sequence and gene organization of the chicken mitochondrial genome // J. Mol. Biol. 1990. V. 212. P. 599−634.
- Efstratiadis A.J., Posakony J.W., Maniatis T. et al. The structure and evolution of the human beta-globin gene family // Cell. 1980. V. 21. P. 653−668.
- Ewens W.J. The role of models in the analysis of molecular genetic data, with particular reference to restriction fragment data // Statistical analysis of DNA sequence data / Ed. B.S.Weir. N. Y.: Dekker, 1983. P. 45−73.
- Eyre-Walker A. Do mitochondrial genome recombine in humans? // Phil. Tans. R. Soc. Lond. B. 2000. V. 355. P. 1573−1580.
- Farias LP., Orti G., Meyer A. Total evidence: molecules, morphology, and the phylogenetics of cichlid fishes // J. Exp. Zool. 2000. V. 288. № 1. P. 76−92.
- Felsenstein J. PHYLIP — Phylogeny Inference Package (Version 3.2) // Cladistics. 1989. V. 5. P. 164−166.
- Ferguson A. Systematics of Irish charr as indicated by electrophoretic analysis of tissue proteins // Biochem. Syst. Ecol. 1981. V. 9. P. 225−232.
- Ferris S.D., Sage R.D., Huang СМ., Nielsen J.M., Ritte U., Wilson A.C. Flow of mitochondrial DNA across a species boundary // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1983. V. P. 2290−2294.
- Ferris S.D., Sage R.D., Wilson A.C. DNA variation and evolution // Nature, 1984. V. 309. P. 285−286. Ш
- Gissi C, Reyes A., Pesole G., Saccone С Lineage-specific evolutionary rate in mammalian mtDNA // Mol. Biol. Evol. 2000. V. 17. № 7. P. 1022−1031.
- Glemet H., Blier P., Bematchez L. Geographical extent of Arctic charb (Salvelinus alpinus) mtDNA introgression in brook char populations (S. fontinalis) from eastern Quebec, Canada// Mol, Ecology. 1998. V. 7. P. 1655−1662.
- Gray M.W. Mitochondrial genome diversity and the evolution of mitochondrial DNA // Can. J. Zool. 1982. V. 60. P. 157−171.
- Greenberg B.D., Newbold J.E., Sugino A. Intraspecific nucleotide sequence variability surrounding the origin of replication in human mitochondrial DNA // Gene. 1983. V. 21. P. 33−49.
- Grewe P.M., Billington N., Hebert P.D.N. Phylogenetic relationships among members of Salvelinus inferred from mitochondrial DNA divergence // Can. J. Fish. Aquat. Sci. 1990. V. 47. P. 984−991. «I