Молекулярно-генетический анализ районов прикрепления хромосом к оболочке ядра трофоцитов яичников малярийных комаров Anopheles комплекса «Maculipennis»
Диссертация
Исследование архитектуры ядра на малярийных комарах комплекса «maculipennis» необходимо проводить в ключе поиска зависимости пространственной реорганизации хромосом от изменения последовательностей, находящихся в гетерохроматических районах хромосом. Ранее проводился анализ районов прикрепления хромосом к ядерной оболочке, которые расположены в прицентромерных районах хромосом (Грушко и др… Читать ещё >
Список литературы
- Байбородин и др., 1993. Клонирование и молекулярно-биологический анализ 120 фрагмента ДНК из бета-гетерохроматина Drosophila melanogaster / С. И. Байбородин, Э. М. Баричева, С. С. Богачев и др. // Генетика. 1993. -Т.29, № 3. — С. 403−416.
- Башкиров, 2002 Происхождение гетерохроматина эукариот / В. Н. Башкиров // Генетика. 2002. — Т.38, № 6. — С. 789−792.
- Галактионов и др., 1991. Ультраструктура и некоторые свойства прицентромерного гетерохроматина в культивируемых клетках трахеи быка / И. В. Галактионов, О. В. Зацепина, В. Ю. Поляков и др. // Цитология. 1991. — Т. ЗЗ, № 12. — С. 28−35.
- Гвоздев и др., 1999. Гетерохроматин: молекулярная эволюция и эффекты положения генов у Drosophila melanogaster / В. А. Гвоздев, В. Е. Алаторцев, А. А. Аравин и др. // Молекулярная биология. 1999 — Т. ЗЗ, № 1. — С. 14−25.
- Грушко и др., 2004. Характеристика и сравнительный анализ ДНК из прицентромерного гетерохроматина хромосомы 2 Anopheles atroparvus V. Tiel (Culicidae, Diptera) / О. Г. Грушко, M.B. Шарахова, А. И. Шевченко и др. // Генетика. 2004. — Т.40, № 8. — С.1−10.
- Жимулев, 1993. Гетерохроматин и эффект положения гена / И. Ф. Жимулев // Новосибирск: ВО Наука. Сибирская издательская фирма, 1993. -491с.
- Жимулев, 2002. Политенные хромосомы: морфология и структура / И. Ф. Жимулев // Новосибирск: Наука. Сиб. отд-ние, 1992. 480с.
- Кабанова и Карташева, 1972. Кариотипы кровососущих комаров рода Aedes (Diptera, Culicidae) / В. М. Кабанова и Н. Н. Карташева // Генетика. -1972. Т. 8, № 3. — С. 47.
- Кабанова, 1973. Сезонная динамика инверсионного полиморфизма в природной популяции малярийного комара Anopheles messeae / В. М. Кабанова, В. Н. Стегний, А. Г. Лужкова // Генетика. 1973. — Т. 9, № 10. — С. 78−92.
- Коган и Гвоздев, 2002. Молекулярная эволюция тандемных повторов гетерохроматина в связи с их функцией в геноме / Г. Л. Коган и В. А. Гвоздев //Генетика. 2002. — Т.38, № 6. — С. 710−718.
- Кузнецова и др., 2002. Положение сателлитной ДНК по отношению к гетерохроматину в интерфазных ядрах клеток в культуре / И. С. Кузнецова, И. В. Матвеев, О. П. Подгорная и др. // Цитология. — 2002. Т.44, № 5. — С. 423−430.
- Монахова, 1990. Цитогенетические аспекты пространственной организации ядра / М. А. Монахова // Успехи совр. биол. 1990. — Т.110, Вып. 2 (5). — С.163−179.
- Прокофьева-Бельговская, 1986. Гетерохроматические районы хромосом / А. А. Прокофьева-Бельговская // М.: Наука, 1986. 432с.
- Рубцов и др., 1999. Микроклонирование и характеристика ДНК из районов прицентромерного гетерохроматина политенных хромосом Drosophila melanogaster / Н. Б. Рубцов, А. А. Алексеенко, Е. С. Беляева и др. // Генетика. 1999. — Т.35, № 1. — С. 55−61.
- Стегний В.Н. Реорганизация структуры интерфазных ядер в онто- и филогенезе малярийных комаров // Докл. АН СССР. 1979. — Т.249, № 5 -С.1231.
- Стегний и Вассерлауф, 1994. Видовая архитектоника хромосом генеративной ткани и проблемы филогенетических отношений в подгруппеmelanogaster рода Drosophila (Sophophora) / В. H. Стегний и И. Э. Вассерлауф // Генетика.- 1994. Т. ЗО, № 4. — С. 478−483.
- Стегний и Шарахова, 1990. Повторяющиеся последовательности ДНК малярийных комаров. Особенности локализации высокоповторяющейся ДНК у Anopheles messeae / В. Н. Стегний и М. В. Шарахова // Генетика. — 1990. -Т.26, № 7. С. 1187−1194.
- Стегний, 1976. Цитогенетическое исследование видов-двойников Anopheles палеарктического комплекса maculipennis / В. Н. Стегний // Автореф. дис.. канд. биол. наук. J1.: Изд-во ЛГУ. 1976. — 16 с.
- Стегний, 1981. Генетические основы эволюции малярийных комаров. I. Хромосомные филогенетические связи / В. Н. Стегний // Зоол. журнал. -1981. -Т.60, Вып. 1.-С. 69.
- Стегний, 1983. Инверсионный полиморфизм малярийного комара Anopheles messeae. IV. Стационарность частотного распределения инверсий по ареалу вида / В. Н. Стегний // Генетика. 1983. — Т. 19, № 3. — С. 446
- Стегний, 1987. Системная реорганизация архитектоники политенных хромосом в онто- и филогенезе малярийных комаров. Сообщение I. Различия структуры ядер соматических и генеративной тканей / В. Н. Стегний // Генетика. 1987. — Т.23, № 5. — С.821−827.
- Стегний, 1991. Популяционная генетика и эволюция малярийных комаров / В. Н. Стегний // Изд-во Томского университета. 1991. — 137 с.
- Стегний, 1993. Архитектоника генома, системные мутации и эволюция / В. Н. Стегний // Новосибирск: Изд-во Новосиб. Ун-та, 1993. 111 с.
- Стегний, 2006. Эволюционное значение архитектоники хромосом как формы эпигенетического контроля онто- и филогенеза эукариот / В. Н. Стегний //Генетика. 2006. — Т. 42., № 9. — С. 1215−1224.
- Шабарина и др., 2006. Необычная нуклеотидная последовательность фрагмента ДНК, выделенного из ядерных оболочек гепатоцитов мыши / А. Н. Шабарина, Е. И. Прилепа, М. В. Глазков // Генетика. Т. 42, № 7. — С. 879 886.
- Яровая и Разин, 1983. Два типа участковприкрепления ДНК к ядерному скелету в клетках асцитной карциномы Эрлиха / О. В. Яровая и С. В. Разин // Молек. биология. 1983. — Т.34. — С. 120−126.
- Alexandrova et al., 2003. Replication labeling patterns and chromosome territories typical of mammalian nuclei are conserved in the early metazoan Hydra / O. Alexandrova, I. Solovei, T. Cremer, C.N. David // Chromosoma. 2003. -V. 112.-P. 190−200.
- Allen et al., 1996. High-level transgene expression in plant cells: effects of a strong scaffold attachment region from tobacco / G. C. Allen, G. J. Hall, S. Michalowski, et al. // Plant Cell. 1996. — V.8, No. 5. — P. 899−913.
- Alvarez et al., 2000. The MAR-binding protein SATB1 orchestrates temporal and spatial expression of multiple genes during T-cell development / J. D. Alvarez, D. H. Yasui, H. Niidaet al. // Genes Dev. 2000. — V. 14, No. 5. — P. 521−535.
- Ashery-Padan et al., 1997. Distinct regions specify the targeting of otefin to the nucleoplasms side of the nuclear envelope / R. Ashery-Padan, A. M. Weiss, N. Feinstein, Y. Gruenbaum // J. Biol. Chem. 1997. — V. 272. — P. 2493−2499.
- Avramova Z. et al., 1998. Matrix attachment regions and structural colinearity in the genomes of two grass species /ГДЕ // Nucleic Acids Res. 1998. — No. 26. -P. 761−767.
- Baimai, 1998. Heterochromatin accomulation and kariotypic evolution in some dipterian insects / V. Baimai // Zoological studies. 1998. — Vol. 37, No 2. — P. 75−88.
- Baricheva et al., 1996. DNA from Drosophila melanogaster beta-heterochromatin binds specifically to nuclear lamins in vitro and the nuclear envelope in situ / E. A. Baricheva, M. Berrios, S. S. Bogachev et al. // Gene. -1996.-V. 171.-P. 171−176.
- Belyaeva et al., 2008. Intercalary heterochromatin in polytene chromosomes of Drosophila melanogaster / E. S. Belyaeva, E. N. Andreyeva, S. N. Belyakin et al. // Chromosoma. 2008.-V. 117.-P. 411−418.
- Bengtsson and Wilson, 2004. Multiple and surprising new functions for emerin, a nuclear membrane protein / L. Bengtsson and K. L. Wilson // Curr. Opin. Cell Biol. 2004. — V. 16. — P. 73−79.
- Berger et al., 1996. The characterization and localization of the mouse thymopoietin/lamina-associated polypeptide 2 gene and its alternatively spliced products / R. Berger, L. Theodor, J. Shoham et al. // Genome Res. 1996. — V. 6. P. 361−370.
- Bidwell et al., 1993. Osteocalcin gene promoter-binding factors are tissue-specific nuclear matrix components / J. P. Bidwell, A. J. van Wijnen, E. G. Fey et al. // Proc. Natl. Acad. Sei. U S A. 1993. — V. 90, No. 8. — P. 3162−3166.
- Bode et al., 2006. Correlations between scaffold/matrix attachment region (S/MAR) binding activity and DNA duplex destabilization energy / J. Bode, S. Winkelmann, S. Gotze et al. // J. Mol. Biol. 2006. — V. 358, No. 2. — P. 597−613.
- Boulikas, 1993. Homeodomain protein binding sites, inverted repeats, and nuclear matrix attachment regions along the human beta-globin gene complex / T. Boulikas // J. Cell Biochem. 1993. — V. 52, No. 1. — P. 23−36.
- Boyle et al., 2001. The spatial organization of human chromosomes within the nuclei of normal and emerin-mutant cells / S. Boyle, S. Gilchrist, J.M. Bridger et al. // Hum. Mol. Genet. 2001. — V. 10. — P. 211−219.
- Branco and Pombo et al., 2006. Intermingling of chromosome territories in interphase suggests role in translocations and transcription-dependent associations / M.R. Branco and A. Pombo // PLoS Biol. 2006. — V.4. — P. 138
- Burke and Ellenberg, 2002. Remodelling the walls of thenucleus / B. Burke and J. Ellenberg // Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 2002. — V. 3. — P. 487−497.
- Cai et al., 2001. Solution structure of the constant region of nuclear envelope protein LAP2 reveals two LEM-domain structures: one binds BAF and the other binds DNA / M. Cai, Y. Huang, R. Ghirlando et al. // EMBO J. V. 20. P. 43 994 407.
- Casolari et al., 2004. Genome-wide localization of the nuclear transport machinery couples transcriptional status and nuclear organization / J.M. Casolari, C.R. Brown, S. Komili et al. // Cell. 2004. — V. 117. — P. 427−439.
- Chaly and Munro, 1996. Centromeres reposition to the nuclear periphery during L6E9 myogenesis in vitro / N. Chaly and S.B. Munro // Exp. Cell Res. -1996.-V. 223. P. 274−278.
- Charlesworth et al., 1994. The evolutionary dynamics of repetitive DNA in eukaryotes / B. Charlesworth, P. Sniegowski, W. Stephan // Nature. 1994. — V. 371.-P. 215−220.
- Chattopadhyay et al., 2000. SMAR1, a novel, alternatively spliced gene product, binds the Scaffold/Matrix-associated region at the T cell receptor beta locus / S. Chattopadhyay, R. Kaul, A. Charest et al. // Genomics. 2000. — V. 68, No. l.-P. 93−96.
- Chubb et al., 2002. Chromatin motion is constrained by association with nuclear compartments in human cells / J.R. Chubb, S. Boyle, P. Perry, W. A. Bickmore // Curr. Biol. 2002. — V. 12. — P. 439−445.
- Comings, 1968. The rationale for an ordered arrangement of chromatin in the interphase nucleus / D. E. Comings // The Amer. J. Human. Genet. 1968. V. 20, № 5. P.440.
- Cremer and Cremer, 2010. Chromosome Territories / T. Cremer and M. Cremer // Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2010. — No. 2. — P. 1−22.
- Cremer et al., 2006. Chromosome territories a functional nuclear land-scape / T. Cremer, M. Cremer, S. Dietzel et al. // Curr. Opin. Cell Biol. — 2006. — V.18. -P.307−316.
- Croft et al., 1999. Differences in the localization and morphology of chromosomes in the human nucleus / J.A. Croft, J.M. Bridger, S. Boyle et al. // J. Cell Biol. 1999.-V. 145.-P. 1119−1131.
- Croft et al., 1999. Differences in the localization and morphology of chromosomes in the human nucleus / J.A. Croft, J.M. Bridger, S. Boyle et al. // J. Cell Biol. 1999. — V.145, № 6. — P. 1119−1131.
- Czermin et al., 2001. Physical and functional association of SU (VAR)3−9 and HDAC1 in Drosophila / B. Czermin, G. Schotta, B. B. Hulsmann et al. // Imhof. A EMBO Rep. 2001. — V. 2. — P. 915−919.
- Dehghani et al., 2005. Organization of chromatin in the interphase mammalian cell / H. Dehghani, G. Dellaire, D. P. Bazett-Jones // Micron. 2005. -V.36. -P.95−108.
- Dijke and Hill, 2004. New insights into TGF-p-Smad signaling / P. ten Dijke, C. S. Hill // Trends Biochem. Sci. 2004. — V. 29. P. 265−273.
- Dobreva et al., 2003. SUMO modification of a novel MAR-binding protein, SATB2, modulates immunoglobulin mu gene expression / G. Dobreva, J. Dambacher, R. Grosschedl // Genes Dev. 2003. -V. 17, No. 24. — P. 3048−3061.
- Dover, 1982. Molecular drive: a cohesive mode of species evolution / G. Dover // Nature. 1982. — V.299, № 5879. — P. 111−117.
- Driel et al., 2004. Nuclear architecture and genome functioning in plants and animals: what can we learn from both? / van R. Driel, P. Fransz // Exp. Cell Res. -2004.-V.296.-P. 86−90.
- Duband-Goulet and Courvalin, 2000. Inner nuclear membrane protein LBR preferentially interacts with DNA secondary structures and nucleosomal linker / I. Duband-Goulet and J.-C. Courvalin // Biochemistry. 2000. — V. 39. — P. 64 836 488.
- Eberl et al., 1993. The role of heterochromatin in the expression of a heterochromatic gene, the rolled locus of Drosophila melanogaster / D.F. Eberl, B.J. Duyf, A.J. Hilliker // Genetics. 1993. — V.134. — P. 277−292.
- Elder and Turner, 1995. Concerted evolution of repetitive DNA sequences in eukaryotes / Jr. F. Elder and B. J. Turner // Q. Rev. Biol. 1995. — V.70. — P. 297 320.
- Elgin et al., 2004. Heterochromatin: silence is golden / C.R. Elgin, C.R.Sarah, I.S. Grewal Shiv // Current Biology. 2004. — Vol. 13, No.23. — P. 895−898.
- Ellingsen et al., 2007. Sequence evolution of the major satellite DNA of the genus Ctenomys (Octodontidae, Rodentia) / A. Ellingsen, C.H. Slamovits, M.S. Rossi // Gene. 2007. — V. 392, № 1−2. — P. 283−290.
- Fackelmayer et al., 1994. Nucleic-acid-binding properties of hnRNP-U/SAF-A, a nuclear-matrix protein which binds DNA and RNA in vivo and in vitro / F. O.
- Fackelmayer, K. Dahm, A. Renz et al. // Eur. J. Biochem. — 1994. V. 221, No. 2.- P. 749−757.
- Fukuda, 1997. Characterization of matrix attachment sites in the upstream regions of a tobacco chitinase gene / Y. J. Fukuda // Plant Mol. Biol. 1997. — V. 39, No. 5.-P. 1051−1062.
- Furukawa et al., 1994. Identification and cloning of an mRNA coding for a germ cell-specific A-type lamin in mice / K. Furukawa, H. Inagaki, Y. Hotta // Exp. Cell Res. V. 212. — P. 426−430.
- Galy et al., 2000. Nuclear pore complex in the organization of silent telomeric chromatin / V. Galy, J.C. Olivo-Marin, H. Scherthan et al. // Nature. 2000. — V. 403.-P. 108−112.
- Gaudin et al., 2009. Modeling the 3D functional architecture of the nucleus in animal and plant kingdoms / V. Gaudin, P. Andrey E. Devinoy et al. // C. R. Biologies. 2009. — V. 332 — P. 937−946.
- Girod et al., 2007. Genome-wide prediction of matrix attachment regions that increase gene expression in mammalian cells / P. A. Girod, D. Q. Nguyen, D. Calabrese et al. // Nat. Methods. 2007. — V. 4, No. 9. — P. 747−753.
- Goldman et al., 2002. Nuclear lamins: building blocks of nuclear architecture / R. D. Goldman, Y. Gruenbaum, R. D. Moir et al. // Genes Dev. 2002. — V. 16: -P. 533−547.
- Gong et al., 2009. SATB1 regulates beta-like globin genes through matrix related nuclear relocation of the cluster / H. Gong, Z. Wang, G. W. Zhao et al. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2009. — V. 383, No. 1. — P. 11−15.
- Grewal and Elgin, 2002. Heterochromatin: new possibilities for the inheritance of structure / I.S.Grewal and C.R. Elgin // Current Opinion in Genetics & Development. 2002. — V. 12. — P. 178−187.
- Grewal and Elgin, 2007. Transcription and RNA interference in the formation of heterochromatin / S. I. S. Grewal 1 and S. C. R. Elgin // Nature. 2007. — V. 447. — P. 399−406.
- Gruenbaum et al., 2000. Nuclear lamins-structural proteins with fundamental functions / Y. Gruenbaum, K. L. Wilson, A. Harel et al. // J. Struct. Biol. 2000. -V. 129.-P. 313−323.
- Gruenbaum et al., 2005. The nuclear lamina comes of age / Y. Gruenbaum, A. Margalit, D.K. Shumaker, K.L. Wilson // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2005. V. 6. -P. 21−31.
- Grushko et al., 2009 Molecular organization of heterochromatin in malaria mosquitoes of the Anopheles maculipennis subgroup / O. G. Grushko, M. V. Sharakhova, V. N. Stegnii, I. V. Sharakhov // Gene. 2009. — No.448. — P. 192 197.
- Guarda et al., 2009. Interaction between the inner nuclear membrane lamin B receptor and the heterochromatic methyl binding protein, MeCP2 / A. Guarda, F. Bolognese, I. M. Bonopace et al. // Exp. Cell Res. 2009. — V.315, № 11. — P. 1895−1903.
- Haaf and Schmidt, 1989. Centromeric association and non-random distribution of centromemres in human tumour cells / T. Haaf, M. Schmidt // Hum. Genet. 1989. — V.81. — P. 137−143.
- Habermann et al., 2001. Arrangements of macro- and microchromosomes in chicken cells / F.A. Habermann, M. Cremer, J. Walter et al. // Chromosome Res. -2001.-V. 9.-P. 569−584.
- Hakes and Berezney, 1991. DNAbinding properties of the nuclear matrix and individual nuclear matrix proteins. Evidence for salt-resistant DNA binding sites. / D. J. Hakes and R. Berezney // J. Biol. Chem. 1991. — V. 266, No. 17. — P. 11 131−11 140.
- Hall et al., 2003. Centromere Satellites From Arabidopsis populations: maintenance of conserved and variable domains / S.E. Hall, G. Kettler, D. Preuss // Genome Res. 2003. — V. 13. — P. 195−205.
- Hall, et al., 2005. Differential rates of local and global homogenization in centromere satellites from Arabidopsis relatives / S. E. Hall, S. Luo, A. E. Hall, D. Preuss // Genetics. 2005. — V. 170, No. 4. — V. 1913−27.
- Haraguchi et al, 2000. Live fluorescence imaging reveals early recruitment of emerin, LBR, RanBP2, and Nupl53 to reforming functional nuclear envelopes / T. Haraguchi, T. Koujin, T. Hayakawa et al. // J. Cell Sei. V. 113. — P. 779−794.
- Hart and Laemmli, 1998. Facilitation of chromatin dynamics by SARs / C. M. Hart and U. K. Laemmli // Curr. Opin. Genet. Dev. 1998. — V. 8, No. 5. — P. 51 925.
- Heitz, 1934. Uber a- und ?-heterochromatin sowie konstanz und bau der Chromosomen bei Drosophila /E. Heitz // Biol. Zentr. Bl. 1934. — V. 54. — S.588−609.
- Henikoff et al., 2001. The centromere paradox: stable inheritance with rapidly evolving DNA / S. Henikoff, K. Ahmad, H.S. Malik // Science. 2001. — V.293, № 5532.-P. 1098−1102.
- Henikoff, 2000. Heterochromatin Function in complex genomes / S. Henikoff // Biochimica et biophisica acta. 2000. — V. 1470. — P. 1−8.
- Holley et al., 2002. A model for interphase chromosomes and evaluation of radiation-induced aberrations / D. Holley // Radiat. Res. 2002. — V.158. — P. 568 580.
- Holmer and Worman, 2001. Inner nuclear membrane proteins: functions and targeting / L. Holmer and H. J. Worman // Cell Mol. Life Sci. 2001. — V. 58, No. 12−13.-P. 1741−1747.
- Holmer et al., 1998. The human lamin B receptor/sterol reductase multigene family / L. Holmer, A. Pezhman, H. J. Worman // Genomics. 1998. — V. 54. — P. 469−476.
- Holmquist et al., 1998. Mobile genetic elements? chiasmata? and the unique organization of beta-heterochromatin / G. P. Holmquist, V.V. Kapitonov, J. Jurka // Cytogenet. Cell Genet. 1998. — V.80, № 1−4. — P. l 13−116.
- Holt et al., 2002. The genome sequence of the malaria mosquito Anopheles gambiae / R.A. Holt, G. M. Subramanian, A. Halpern et al. // Science. 2002., Vol. 298. P.129−149.
- Kapitonov and Jurka, 2008. Helitrons on a roll: eukaryotic rolling-circle transposons / V. V. Kapitonov, J. Jurka // Trends in Genetics. 2007. — V.23, No. 10.-521−529.
- Karamjit et al., 1999. Mosquito Genomes: Structure, Organization, and Evolution / S. Karamjit, Rai, C. William, I.V. Black // Advances in genetics. -1999.-Vol. 41.-P. 27.
- Kidwell and Lisch, 2000. Transposable elements and host genome evolution TREE / M. G. Kidwell and D. R. Lisch // Trends Ecol. Evol. 2000. — V. 15, No.3. — P. 95−99.
- Kimura and Hirano, 1997. ATP-dependent positive supercoiling of DNA by 13S condensin- a biochemical implication for chromosome condensation // Cell. 1997. V. 90. P. 625−634.
- King and Cummings, 1997. Satellite DNA repeat sequence variation is low in three species of burying beetles in the genus Nicrophorus (Coleoptera: Silphidae) /
- M. King and M. P Cummings // Mol. Biol. Evol. 1997. — V. 14. — P. 10 881 095.
- Knight and Stone, 1977. A catalog of the mosquitoes of the world / K. L. Knight and A. Stone / Ent. Soc. of America, 1977. 612 p.
- Kries et al., 1991. A matrix/scaffold attachment region binding protein: identification, purification, and mode of binding / J. P. von Kries, H. Buhrmester, W. H. Startling// Cell. 1991. -V. 64, No. 1. — P. 123−135.
- Krzywinski et al., 2005. Satellite DNA from the Y chromosome of the malaria vector Anopheles gambiae / J. Krzywinski, D. Sangare and N. J. Besansky // Genetics. 2005. — No 1. — P. 185−196.
- Kumar et al., 1997. In situ hybridization to Anopheles polytene chromosomes / V. Kumar, A.J. Cornel O. Mukabayire // Molecular Biology of Insect Disease Vectors: A Methods Manual. London.: Chapman and Hall, 1997. P. 337−345.
- Mahy et al., 2002. Gene density and transcription influence the localization of chromatin outside of chromosome territories detectable by FISH / N. L. Mahy, P. E. Perry, W. A. Bickmore // J. of Cell Biol. 2002. — V. 159, № 5. — P. 753−763.
- Makunin et al., 2002. The Drosophila suppressor of underreplication protein binds to late-replicating regions of polytene chromosomes / I. V. Makunin, E. I. Volkova, E. S. Belyaeva et al. // Genetics. 2002. — V. 160, No. 3. — P. 1023−34.
- Malone et al., 1999. UNC-84 localizes to the nuclear envelope and is required for nuclear migration and anchoring during C. elegans development / C. J. Malone, W. D. Fixsen, H. R. Horvitz et al. // Development. 1999. — V. 126. — P. 31 713 181.
- Margueron et al., 2005. The key to development: interpreting the histone code? / R. Margueron, P. Trojer, D. Reinberg // Curr. Opin. Genet. Dev. 2005. -V. 15, No. 2.-P. 163−76.
- Marshall W. F. Gene expression and nuclear architecture during development and differentiation // Mechanisms of Development. 2003. — V. 120. — P. 12 171 230.
- Mattout-Drubezki and Gruenbaum, 2003. Dynamic interactions of nuclear lamina proteins with chromatin and transcriptional machinery / A. Mattout-Drubezki and Y. Gruenbaum // Cell. Mol. Life Sci. 2003. — V. 60. — P. 20 532 063.
- Mekhail, 2008. Role for perinuclear chromosome tethering in maintenance of genome stability / K. Mekhail, J. Seebacher, S. P. Gygi, D Moazed // Nature. -2008.-V. 456.-667−671.
- Melcer et al., 2007. Invertebrate lamins / S. Melcer, Y. Gruenbauma, G. Krohneb//Exp. Cell Res.-2007.-V. 313.-P. 2157−2166.
- Mora et al., 2006. Chromosome territory positioning of conserved homologous chromosomes in different primate species / L. Mora, I. Sanchez, M. Garcia et al. // Chromosoma. 2006. — V. l 15. — P. 367−375.
- Parada, 2004. Tissue-specific spatial organization of genomes / L. A. Parada, P. G. McQueen, T. Misteli // Genome Biol. 2004. — V. 5, No. 7. — P. R44.
- Pardue and DeBaryshe, 1999. Telomeres and telomerase: more than the end of line / M.-L. Pardue, P. G. DeBaryshe // Chromosoma. V. 108, No 2. — P. 7382.
- Pederson and Aebi, 2002. Actin in the nucleus: what form and what for? / T. Pederson and U. Aebi // J. Struct. Biol. 2002. — V. 140. — P. 3−9.
- Peng and Karpen, 2008. Epigenetic regulation of heterochromatic DNA stability / J. C Peng and G. H Karpen // Curr. Opin. Genet. Devel. 2008. — V. 18. -P. 204−211.
- Pickersgill et al., 2006. Characterization of the Drosophila melanogaster genome at the nuclear lamina / H. Pickersgill, B. Kalverda, V. de Wit et al. // Nat. Genet. 2006. — V. 38. — P. 1005−1014.
- Pindyurin et al., 2007. SUUR joins separate subsets of PcG, HP1 and B-type lamin targets in Drosophila / A. V. Pindyurin, C. Moorman, E. de Wit et al. // J. Cell Sei. 2007. — V. 120. — P. 2344−51.
- Plohl et al., 2008. Satellite DNAs between selfishness and functionality: Structure, genomics and evolution of tandem repeats in centromeric (hetero)chromatin / M. Plohl, A. Luchetti, N. Mestrovic, B. Mantovani // Gene. -2008.-V.409.-P. 72−82.
- Rabl, 1885. Uber Zellteilung / C. Rabl // Morphologisches Jahrbuch. 1885. P.214
- Reeves and Beckerbauer, 2001. HMGI/Y proteins: flexible regulators of transcription and chromatin structure / R. Reeves and L. Beckerbauer // Biochim. Biophys. Acta. 2001. — V. 1519, No. 1−2. — P. 13−29.
- Rice and Allis, 2001. Histone methylation versus histoneacetylation: new insights into epigenetic regulation / J. C. Rice and C. D. Allis // Curr. Opin. Cell Biol. -2001. -V. 13. P. 263−273.
- Rice et al., 2003. Histone methyltransferases direct different degrees of methylation to define distinct chromatin domains / J. C. Rice, S. D. Briggs, B. Ueberheide et al. // Mol Cell 2003, 12:1591−1598.
- Rogozin et al., 1999. Computer prediction of sites associated with various elements of the nuclear matrix / I. B. Rogozin, G. V. Glazko, M. V. Glazkov // Briefings in bioinformatics. 1999. — T. l, № 1. — P. 33−44.
- Rudd and Willard, 2004. Analysis of the centromeric regions of the human genome assembly / M.K. Rudd and H.F.Willard // Trends Genet. 2004. — V. 20. -P. 529−533.
- Rzepecki et al., 1998. In vivo association of lamins with nucleic acids in Drosophila melanogaster / R. Rzepecki, S. S. Bogachev, E. Kokozaet al. // J. Cell Sci. 1998. — V. 111. P. 121−129.
- Schirmer and Foisner, 2007. Proteins that associate with lamins: Many faces, many functions / E. C. Schirmer and R. Foisner // Exp. Cell Res. 2007. — V. 313 -P. 2167−2179.
- Schneider and Grosschedl, 2007. Dynamics and interplay of nuclear architecture, genome organization, and gene expression / R. Schneider, R. Grosschedl // Genes Dev. 2007. — V. 21. — P. 3027−3043.
- Schoenherr and Tilghman, 2000. Epigenetics in mammals. In Chromatin Structure and Gene Expression / C. J. Schoenherr and S. M. Tilghman // Oxford, UK: Oxford University Press. 2000. — P. 252−277.
- Sexton et al., 2009 Genomic interactions: Chromatin loops and gene meeting points in transcriptional regulation / T. Sexton, F. Bantignies, G. Cavalli // Seminars in Cell and Developmental Biology 2009. — V. 20. — P. 849−855.
- Sharachov et al., 2002. Inversions and gene order shuffling in Anopheles gambiae and A. funestus / I.V. Sharakhov, A.C. Serazin, O.G. Grushko et al. // Science. 2002. — V.298, № 5591. — P. 182−185.
- Singh, 1998. Molecular characterization of two heterochromatic genes from third chromosome Drosophila melanogaster / M. Singh // Simon Fraser University. 1998. — C. 138.
- Stuurman et al., 1995 Interphase phosphorylation of the Drosophila nuclear lamin: site-mapping using a monoclonal antibody / N. Stuurman, N. Maus, P.A. Fisher//J. Cell Sci. 1995.-V. 108.-P. 3137−3144.
- Stuurman et al., 1998. Nuclear lamins: their structure, assembly and interactions / N. Stuurman, S. Heins, U. Aebi // J. Struct. Biol. 1998. — V. 122. -P. 42−66.
- Talbert and Henikoff, 2006. Spreading of silent chromatin: inaction at a distance / P. B. Talbert and S. Henikoff// Nature Rev. Genet. 2006. — V. 7. — P. 793−803.
- Trojer and Reinberg, 2007. Facultative heterochromatin: is there a distinctive molecular signature? / P. Trojer and D. Reinberg // Molecular Cell. 2007. — V. 28. — P. 1−13.
- Tu and Coates, 2004. Mosquito transposable elements / Z. Tu and C. Coates // Insect Biochemistry and Molecular Biology. 2004. -No.34. — P. 631−644.
- Ugarkovic et al., 1995. Satellite DNAs in Tenebrionid species: structure, organization and evolution / D. Ugarkovic, E. Petitpierrz, C. Juan, M. Plohl // Croat. Chem. Acta. 1995. — V. 68. — P. 627−638.
- Ulitzur et al., 1992. Lamin activity is essential for nuclear envelope assembly in a Drosophila embryo cell-free extract / N. Ulitzur, A. Harel, N. Feinstein, Y. Gruenbaum // J. Cell Biol. 1992. — V. 119. — P. 17−25.
- Usdin, 2008. The biological effects of simple tandem repeats: lessons from therepeat expansion deseases / K. Usdin // Genom Res. 2008. — V.18. — P. 10 111 019.
- Vazquez et al., 2001. Multiple regimes of constrained chromosome motion are regulated in the interphase Drosophila nucleus / J. Vazquez, A.S. Belmont, J.W. Sedat//Curr. Biol.-2001.-V. 11.-P. 1227−1239.
- Visser et al., 2000. High resolution analysis of interphase chromosome domains / A.E. Visser, F. Jaunin, S. Fakan, J.A. Aten // J. Cell Sci. 2000. -V.113.-P. 2585−2593.
- Wagner et al., 2004. The lamin B receptor of Drosophila melanogaster / N. Wagner, D. Weber, S. Seitz, G. Krohne // J. Cell Sci. 2004. — V. 117. — P. 20 152 028.
- Wagner et al., 2006. The Drosophila melanogaster LEM-domain protein MAN1 / N. Wagner, B. Kagermeier, S. Loserth, G. Krohne // Eur. J. Cell Biol. -2006.-V. 85 P.91−105.
- Wang et al., 2004. Effects and the mechanism of nuclear matrix attachment regions on transgene expression / T. Y. Wang, Y. R. Chai, B. M. Yuan // Chin. J. Cell Biol. V. 26, No. 6. — P. 587−590.
- Wang et al., 2008. Analysis of repetitive DNA distribution patterns in the Tribolium castaneum genome / S. Wang, M.D. Lorenzen, R.W. Beeman et al. // Genome Biol. 2008. — V.9, № 3. — P. R61.
- Wang et al., 2010. A mini review of MAR-binding proteins / T.-Y. Wang, Z.-M. Han Y.-R. Chai, J.-H. Zhang // Mol. Biol. Rep. 2010 (in press).
- Wong et al., 1998. Distinct requirements for chromatin assembly in transcriptional repression by thyroid hormone receptor and histone deacetylase / J. Wong, D. Patterton, A. Imhof et al. // EMBO J. 1998. — V. 17. — P. 520−534.
- Zhang et al., 2003. Identification of novel histone post-translationalmodifications by peptidemass fingerprinting / L. Zhang, E. E. Eugeni, M. R. Parthun, M. A. Freitas // Chromosoma. 2003. — V. 112. — P. 77−86.
- Zhao et al., 1996. Binding of matrix attachment regions to nuclear lamin is mediated by the rod domain and depends on the lamin polymerization state / K. Zhao, A. Harel, N. Stuurman et al. // Y. FEBS Lett. 1996. — V. 380. — P. 161— 164.
- Zorn et al., 1979. Unscheduled DNA synthesis after partial UV irradiation of the cell nucleus: distribution in interphase and metaphase / C. Zorn, C. Cremer, T. Cremer, J. Zimmer // Exp. Cell Res. 1979. — V.124, № 1. — P. 111−119.