Помощь в написании студенческих работ
Антистрессовый сервис

Молекулярно-генетическое разнообразие и филогения пород и типов пушных зверей семейства Canidae

Диссертация: Молекулярно-генетическое разнообразие и филогения пород и типов пушных зверей семейства Canidae
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Молекулярная филогения и систематика в последние годы претерпевает новый этап развития и становится все более активно развивающейся областью современной биологии. Это определяется разработкой новых разнообразных методов анализа молекулярных маркеров ДНК, что позволяет оценивать генетическое родство таксонов на более высоком уровне, а также получать новую информацию об их филогенезе… Читать ещё >

Молекулярно-генетическое разнообразие и филогения пород и типов пушных зверей семейства Canidae (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Содержание

  • ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Пушное звероводство — как самостоятельная отрасль животноводства
    • 1. 2. Проблемы систематики семейства псовых (Сашёае)
    • 1. 3. Молекулярно-генетическое разнообразие и филогения пушных зверей
    • 1. 4. Исследование генома животных с помощью молекулярных маркеров
      • 1. 4. 1. ЯБЬР и УШП-методы
      • 1. 4. 2. Методы, основанные на РСЯ-реакции
        • 1. 4. 2. 1. ЯАРО анализ
        • 1. 4. 2. 2. БТЯи ЗТЭ-маркирование
        • 1. 4. 2. 3. маркеры
    • 1. 5. Картирование генома и полиморфизм структурных генов сельскохозяйственных животных
  • ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
    • 2. 1. Сбор материала и создание коллекции образцов
    • 2. 2. Выделение ДНК
    • 2. 3. Амплификация ДНК и детекция продуктов реакции
    • 2. 4. Статистическая обработка данных
  • ГЛАВА 3. ОПТИМИЗАЦИЯ ЭТАПОВ ДНК-ТИПИРОВАНИЯ
    • 3. 1. Подбор методов выделения ДНК
    • 3. 2. Критерии выбора ДНК-методов для молекулярно-филогенетического анализа
  • ГЛАВА 4. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ МАРКИРОВАНИЕ ПОРОД ПУШНЫХ ЗВЕРЕЙ СЕМЕЙСТВА САЫГОАЕ
    • 4. 1. Молекулярное маркирование пород пушных зверей семейства Сапісіае методом ИАРО-анализа
    • 4. 2. Молекулярное маркирование пород пушных зверей семейства Сапісіае методом 188Я-анализа
    • 4. 3. Обсуждение
  • ГЛАВА 5. ХАРАКТЕРИСТИКА ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИХ ОТНОШЕНИЙ ПОРОД ПУШНЫХ ЗВЕРЕЙ СЕМЕЙСТВА САЫГОАЕ
    • 5. 1. Определение филогенетического сходства пород и типов пушных зверей семейства Сапісіае по данным КАРЭ- и ^БЯ-анализов
    • 5. 2. Обсуждение

Эффективное звероводство базируется на максимальном использовании потенциала пород животных, полученных в процессе селекции. В настоящее время активное внедрение в животноводство высокопродуктивных пород и гибридов приводит к постепенному вытеснению их менее перспективных аналогов. Как крайний случай, можно привести пример, когда руководствуясь временной конъюнктурой рынка, некоторые зверохозяйства в 2008;2009 гг. полностью избавлялись от разведения песцов. При очевидных временных экономических преимуществах подобных процессов в целом происходит обеднение генофондов популяций сельскохозяйственных животных. И это при том, что местные породы являются источником уникальных генетических свойств, обладают устойчивостью к неблагоприятным условиям среды, повышенной выносливостью и высокой резистентностью к заболеваниям.

В связи с этим представляет интерес проблема молекулярно-генетической систематики и оценки биоразнообразия существующих и исчезающих пород пушных зверей.

Очень важно, что при использовании ДНК маркеров отпадает необходимость ожидания определенной стадии онтогенеза для отбора толерантных генотипов животных, при этом достаточно небольшого количества генетического материала.

В настоящее время полиморфные последовательности ДНК применяют для маркирования генов и отдельных участков хромосом. Широкое распространение ДНК-маркеры получили также в области молекулярно-генетического картирования геномов различных животных, оценки уровня генетического полиморфизма, при генотипировании особей, линий, популяций, видов. Использование ДНК-технологий во многом позволило преодолеть недостатки метода белковых маркеров в решении ряда таксономических вопросов и отдельных задач селекции. Прежде всего, это связано с тем, что ДНК-маркеры не подвержены эндогенному влиянию и могут быть идентифицированы на любой стадии развития живого организма.

В результате точечных мутаций, вставок, делеций или инверсий гомологичные последовательности ДНК у разных индивидов могут различаться по одному или нескольким основаниям. Такие последовательности ДНК называются полиморфными, а само явление гетерогенности нуклеотидного состава — полиморфизмом ДНК.

Всего в геноме биологических организмов выделяют три типа последовательностей ДНК: 1.) уникальные, представленные всего лишь одной или несколькими копиями на геном- 2.) умеренно повторяющиеся последовательности, насчитывающие от нескольких десятков до нескольких сотен копий, среди которых имеются как кодирующие, так и некодирующие последовательности- 3.) частые повторы, представленные многими сотнями или даже тысячами копий. При этом размер генома может варьировать у разных видов в достаточно широких пределах (Гриф, 1999).

Благодаря развитию исследований повторяющихся последовательностей стало очевидно, что геном представляет собой сложную иерархию различных структурно-функциональных элементов. Полиморфизм отдельных таких элементов имеет отличные друг от друга механизмы и разные фенотипические и микроэволюционные последствия. То есть, анализ полиморфизма ДНК последовательностей к настоящему времени принципиально изменил положение в популяционной генетике и систематике животных.

Тем не менее, несмотря на активное развитие ДНК-технологий они еще не получили широкого распространения в селекции и разведении пушных зверей. В лучшем случае ДНК-методы используются в ветеринарии для диагностики инфекционных заболеваний, например, алеутской болезни норок.

Актуальность и новизна исследования Анализ научных публикаций показывает малую изученность полиморфизма ДНК промышленных популяций пушных зверей семейства Canidae. До сих пор за редким исключением в основном исследовали лишь дикие формы пушных зверей семейства псовых Alopex lagopus L., Vulpes vulpes L. и Nyctereutes procyonoides Gray (Stepniak et al., 2002; Dalen et al., 2004; Джикия и др., 2007; Плошница и др., 2007; Chunshan, Xiujuan, 2008). При этом отсутствуют какие-либо работы, устанавливающие филогенетические связи и уровень генетического разнообразия пород и типов лисиц, песцов и енотовидных собак между собой. Для сравнения аналогичные исследования на породах собак в количественном выражении измеряются десятками.

Цель исследования.

Целью настоящей работы является исследование генетического разнообразия пушных зверей семейства Canidae, разводимых в зверохозяйствах, и установление межвидовой и межпородной степени родства с применением мультилокусных маркеров (RAPD — random amplified polimorphic DNA и ISSRinter simple sequence repeats).

Задачи исследования.

1. Провести сравнительный анализ полиморфных фрагментов, выявляемых с использованием RAPDи ISSR-праймеров.

2. Оценить информативность спектров ампликонов ДНК, получаемых при использовании RAPDи ISSR-маркеров.

3. Выявить получаемые в результате RAPDи ISSR-анализа фрагменты, определяющие межвидовую и межпородную генетическую дифференциацию и связи.

4. Оптимизировать этап выделения ДНК из тканей мышц при использовании готовых наборов, путем сравнения метода высаливания с аналогичным методом, дополненным колоночной сорбцией.

5. По результатам RAPDи ISSR-исследований установить филогенетические отношения на уровне вид, пород-тип лисиц, песцов и енотовидных собак, разводимых в зверохозяйствах Российской Федерации.

Выводы.

1. Впервые на объектах пушного звероводства (породы и типы пушных зверей семейства Canidae) проведен молекулярно-филогенетический анализ. По результатам исследования установлено, что RAPDи ISSR-маркеры проявляют различную разрешающую способность. В частности, общий уровень полиморфизма, обнаруживаемый с использованием11АРО-праймеров составил 88,8% и ISSR-праймеров — 100,0%.

2. С учетом внутривидовой и внутрипородной (типовой) оценки информативности ампликонов RAPD-анализ предпочтителен для изучения таксономических связей на уровне вид, порода-тип, в то время как ISSR-метод целесообразно применять, для проведения популяционных исследований пушных зверей семейства Canidae.

3. По данным RAPD-анализа специфичными для всех рассматриваемых видов пушных зверей являются фрагменты: OPG-07 (312, 439 и 1250 н.п.), М-9 (500, 815 н.п.) и OPG-17 (500 н.п.), для лисиц и песцов: OPG-07 (500 H.n.), OPG-04 (312, 340 и 406 н.п.).

Уникальными RAPD-фрагментами для лисиц являются: ОРЕ-4 (406 н.п.), песцов: OPG-07 (300 н.п.) и М-9 (1700 н.п.), енотовидной собаки: OPG-07 (1750 н.п.), М-9 (680 н.п.), ОРЕ-4 (680 н п.), OPG-17 (421 н.п.).

Уникальными ISSR-фрагментамидля песцов являются (AG)9C (610 н.п.), енотовидной собаки — (AG)cC (710 н.п., 850 н.п.), жемчужной лисицы- (AG)9C (520 н.п., 720 н.п., 1000 н.п., 1200 н.п.).

4. Филогения видов (Vulpes vw/pes L., Alopex /agopus Ь. и Nyctereutes procyonoides Gray), установленная по результатам мультилокусного анализа (RAPD и ISSR-метод) в целом согласуется с данными морфологической и молекулярной систематики, а кластеризация пород и типов пушных зверей семейства Canidae, проведенная по данным RAPD-анализа, преимущественно совпадает с их генетической классификацией.

5. В ходе оптимизации этапа выделения ДНК установлено, что дополнительное использование экстракционной колонки в методе высаливаниясорбции не влияет на концентрацию и степень очистки ДНК, однако снижает степень ее деградации.

Предложения производству.

Использование предлагаемого набора КАРБ-праймеров: ОРв-04, ОРО-07, ОРО-17, М-9, М-15, ОРЕ-4 позволит в дальнейшем идентифицировать отдельные породы и типы пушных зверей семейства Сашс1ае и прогнозировать их некоторые хозяйственно-полезные признакиприменение 188Я-праймеров: (Ав^С и (ОА)дС применение рекомендуется для проведения популяционно-генетических исследований. Полученный в работе материал может быть использован в учебном процессе для характеристики представителей семейства Сашёае.

Заключение

.

Молекулярная филогения и систематика в последние годы претерпевает новый этап развития и становится все более активно развивающейся областью современной биологии. Это определяется разработкой новых разнообразных методов анализа молекулярных маркеров ДНК, что позволяет оценивать генетическое родство таксонов на более высоком уровне, а также получать новую информацию об их филогенезе и биоразнообразии. Очевидно, что применение молекулярных маркеров к все более широкому кругу видов и других таксонов, ранее не изученных, свидетельствует об актуальности и важности подобных исследований.

Тем не менее, приходится констатировать, что к настоящему времени из сотен тысяч таксонов мира растений ДНК исследованиями затронуты порядка тысяч (Антонов, 1999), а из десятков тысяч таксонов животных всего лишь около сотен. При этом только половина работ по молекулярным маркерам животных посвящена изучению двух-трех десятков наиболее доступных видов, остальные лишь эпизодически исследуемы (Avise, 1994; Elder, Turner, 1995).

Наряду с этим, набор методов молекулярно-биологического изучения разнообразия и филогении не так обширен, как хотелось бы. Некоторые из ранее предложенных подходов подвергаются в настоящее время критике и не могут рассматриваться как всеобъемлющие. Стало очевидно, что использование молекулярных технологий в этой области общей биологии должно сопровождаться сопоставлением результатов, полученных с помощью разных маркеров, в том числе имеющих разные диапазоны применения (Гречко, 2000).

Ответ на вопрос, какие именно филогении, полученные разными методами и с помощью разных молекулярных маркеров, следует считать истинными, довольно сложен. Тем не менее, в целом считается, что молекулярные данные имеют преимущество над немолекулярными в восстановлении истинных генеалогий, в то время как морфологические — при изучении направлений адаптивной радиации.

Основное преимущество молекулярных методов изучения изменчивости заключается в том, что они генерируют огромные наборы дискретных признаков, причем не только тех, которые находятся под давлением отбора, но и селективно нейтральных.

Несомненно, и то, что молекулярные подходы позволяют сопоставлять очень далеко отстоящие организмы. Там, где морфология бессильна найти синапоморфии, обнаруживаются гомологичные макромолекулы.

В этой связи наиболее достоверными, по-видимому, следует считать филогенетические гипотезы, совпадающие при использовании разных молекулярных маркеров. Кроме того, не вызывает сомнения преимущество комбинированной последовательности.

Потенциальные возможности больших наборов данных в решении противоречивых вопросов систематики выше, чем разрешающая способность одного или нескольких генов.

В частности, перспективным является углубленный анализ морфологических признаков в поисках особенностей, объединяющих выделяемые молекулярной филогенетикой новые группировки млекопитающих. Один из возможных подходов заключается также в методе супердеревьев, который базируется на матричном представлении всех опубликованных филогений независимо от признаков и методологий, использованных при их построении (Банникова, 2004).

Понятно, что сама техника анализа генома, так же как и методы филогенетической обработки данных будут развиваться и совершенствоваться по пути все большей автоматизации экспериментальной части и усложнения математического аппарата филогенетических алгоритмов. Однако основным фактором дальнейших успехов станет все же не техническая и не методологическая сторона молекулярно-филогенетических изысканий, а накопление знаний о закономерностях эволюции генома (Антонов, 2002).

Показать весь текст

Список литературы

  1. , A.A. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Хищные и ластоногие / A.A. Аристов, Г. Ф. Барышников // СПб: Зоологический институт РАН. 2001. — 560 с.
  2. , A.A. Молекулярные маркеры и современная филогенетика млекопитающих / A.A. Банникова // Общая биология. 2004. — Т. 65. — № 4. — С. 278−305.
  3. , С.Н. Происхождение и эволюция домашних животных / С. Н. Боголюбский. М: Сельхозгиз, 1940. — 167 с.
  4. Генофонд и геногеография народонаселения / Под ред. Ю. Г. Рычкова: Геногеографический атлас населения России и сопредельных стран. // СПб.: Наука, 2003.-Т. 2.-671 с.
  5. , В.И. Введение в ДНК-технологии / В. И. Глазко, И. М. Дунин, Г. В. Глазко, Л. А. Калашникова // М.: Роинформагротех. 2001. — 436 с.
  6. , С.А. Использование молекулярных маркеров для анализа генома растений / С. А. Гостимский, З. Г. Кокаева, В. К. Боброва // Генетика. 1999. — Т. 35. -№ 11. — С. 1538−1549.
  7. , В.В. Молекулярные маркеры в проблеме партеногенеза и филогении ящериц семейства Lacertidae: автореф. дис.. док. биол. наук:03.00.03/ Гречко Верната Викторовна. М., 2000. — 48 с.
  8. , В.Г. Значение количества ДНК в биосистематике растений / В. Г. Гриф // Цитология. 1999. — Т. 41. — № 12. — С. 1059−1060.
  9. , Дж. Биохимия нуклеиновых кислот / Дж. Дэвидсон // М: Мир, 1976. -412 с.
  10. , П.Л. Геномная дактилоскопия- гипервариабельные локусы и генетическое маркирование / П. Л. Иванов // Молекулярная биология. 1989. -Т.23. — С.341−347.
  11. , Е.Д. Основы генетики и селекции пушных зверей / Е. Д. Ильина, Г. А. Кузнецов // М.: Колос, 1983. 280 с.
  12. , Е.Д. Звероводство / Е. Д. Ильина, А. Д. Соболев // М.: Агропромиздат, 1990. 272 с.
  13. , М. Молекулярная эволюция: теория нейтральности / М. Кимура // М.: Мир, 1985. 398 с.
  14. , Е.М. Пушные звери клеточного разведения / Е. М. Колдаева // Генетика и селекция (книга первая). М: ФГУП Издательство «Известия», 2004. — 296 с.
  15. , С. Оценка генетической дистанции между енотовидной собакой (Nyc ter eutes procionoides) и другими представителями семейства Canidae / С.
  16. , В. Лапински, Б. Сливяк // Вестник ВОГиС. 2009. — Т. 13. — № 3. — С. 647 654.
  17. , Т.В. Молекулярные маркеры для видоидентификации и филогенетики растений / Т. В. Матвеева, O.A. Павлова, Д. И. Богомаз, А. Е. Демкович, Л. А. Лутова //Экологическая генетика. 2011. — Т. 9. — № 1. — С. 32−43.
  18. , A.C. Простая методика количественного определения дезоксирибонуклеиновой кислоты в животных тканях / A.C. Орлов, Е. И. Орлова // Биохимия. 1961. — Т. 26. — № 5. — С. 834.
  19. , А. С. Спектрофотометрическое определение суммарного количества нуклеиновых кислот / А. С. Спирин // Биохимия. 1958. — Т. 23. — № 4. — С. 656 662.
  20. , С.И. Звери восточной Европы и северной Азии / С. И. Огнев // Том II. Хищные млекопитающие. М.: Государственное издательство, 1931. — 802 с.
  21. , А.П. Диагностические возможности молекулярно-генетических подходов к таксономии трибы Bovini / А. П. Рысков, И. В. Кудрявцев, В. А. Васильев, С. Т. Потапов, П. И. Кудрявцев, Т. П. Сипко // Зоол. журн. 1994. — Т. 73.-№ 11.-С. 115−123.
  22. , А.С. Генетический анализ / А. С. Серебровский М.: Наука, 1940. — 342 с.
  23. , Э.Е. Молекулярные маркеры в растениеводстве / Э. Е. Хавкин // Сельскохозяйственная биология. 1997. — № 5. — С. 3−21.
  24. , П.Н. ДНК-технологии в развитии агробиологии / П. Н. Харченко, В. И. Глазко. М.: Воскресенье, 2006. — 480 с.
  25. , В.В. Пока еще не домашние / В. В. Хлебович, М.: Агропромиздат, 1987. 160 с.
  26. , А.В. Секвенирование ДНК / А. В. Чемерис, Э. Д. Ахунов, В. А. Вахитов, М.: Наука, 1999. 428 с.
  27. Aggarwal, R.K. Ancient origin and evolution of the Indian wolf: evidence from mitochondrial DNA typing of wolves from Trans-Himalayan region and Pennisular India / R.K. Aggarwal, J. Ramadevi, L. Singh // Genome Biology. 2003. — P. 1−30.
  28. Agnarsson, I. Dogs, cats, and kin: a molecular species-level phylogeny of Carnivora / I. Agnarsson, M. Kuntner, L.J. May-Collado // Mol. Phylogenet. Evol. 2010. -V. 54.-№ 3.- P. 726−745.
  29. Agusti, J. Mammoths, sabertooths and hominids: 65 million years of mammalian evolution in Europe / J. Agusti, M. Anton //Colambia. New York: University Press. -2002.
  30. Amos, B. Long-term preservation of whale skin for DNA analysis / B. Amos, R. Hoezel // Rep. Int. Whal. Comm. Special. 1991. — Issue 13. — P. 99−103.
  31. Anderson, T.D. A validation study for the extraction and analysis of DNA from human nail material and its application to forensic casework / T.D. Anderson, J.P.
  32. Ross, R.K. Roby, D.A. Lee, M.M. Holland // J. Forensic Sei. 1999. — V. 44. — № 5. -P. 1053 — 1056.
  33. Ayala, F.J. Phylogenies and Macromolecules. In Dobzhansky, T. / F.J. Ayala, G.L. Stebbins, J.W. Valentine, eds. // Evolution: San Francisco, W.H. Freeman & Co. -1977. P. 262−313.
  34. Bardeleben, C. A molecular phylogeny of the Canidae based on six nuclear loci / C. Bardeleben, R.L. Moore, R.K. Wayne // Mol. Phylogenet. Evol. 2005. — V. 37. — № 3. -P. 815−831.
  35. Jucheng, Y. Biometrics. / Y. Jucheng. Publisher: InTech, 2011. — 266 p.
  36. Brookes, A.J. The essence of SNPs / A.J. Brookes // Gene. 1999. — T. 8. — V. 234. -№ 2. — P. 177−186.
  37. Butler, J.M. Fundamentals of Forensic DNA Typing / J.M. Butler. San Diego: Elsevier Academic Press, 2010. — 520 p.
  38. Brito, P.H. Multilocus phylogeography and phylogenetics using sequence-based markers / P.H. Brito, S.V. Edwards // Genetica. -2009.- V. 135 № 3 p. 439−455.
  39. Charles worth, B. The evolutionary dynamics of repetitive DNA in eukaryotes / B. Charlesworth, P. Sniegowski, W. Stephan//Nature. 1994. — Vol. 371. — P.215−220.
  40. Dalen, L. DNA analysis on fox faeces and competition induced niche shifts / L. Dalen, B. Elmhagen, A. Angerbjorn // Mol. Ecol. 2004. — V. 13. — № 8. — P. 2389−2392.
  41. Dawson, M.N. Field preservation of marine invertebrate tissue for DNA analisys / M.N. Dawson, K. A .Raskoff, D.K. Jacobs // Mol. Mar. Biol. Biotechnol. 1998. — V. 7,-№ 2.-P. 145−152.
  42. Decorte, R. Forensic medicine and the polymerase chain reaction technique / R. Decorte, J.J. Cassiman // J. Med. Genet. 1993. — Vol.30. — P.625−633.
  43. Dalen, L. DNA analysis on fox faeces and competition induced niche shifts / L. Dalen, B. Elmhagen, A. Angerbjorn // Molecular Ecology. 2004. — № 13.- P. 2389−2392.
  44. DeSalle, R. Isolation and characterization of animal mitochondrial DNA / R. DeSalle, A.K. Williams, M. George // Methods Enzymol. 1993. — V. 224. — P. 176−204.
  45. DiatomDNAPrep 200. Набор реагентов для выделения ДНК из различного биологического материала / М.: ООО «Лаборатория Изоген», 2009. 4 с.
  46. Edwards A., DNA typing and genetic mapping with trimeric and tetrameric tandem repeats / A. Edwards, A. Civitello, H.A. Hammond, C.T. Caskey //Amer. J. Hum. Genet. 1991. — Vol.49. — P. 746−756.
  47. Farrel, Y. Models for kasein micelle formation / Y. Farrel. J. Dairy Sci., 1973. — V. 56. — P. 1195−1204.
  48. Flynn, J.J. Molecular phylogeny of the carnivora (mammalia): assessing the impact of increased sampling on resolving enigmatic relationships / J.J. Flynn, J.A. Finarelli, S. Zehr, J. Hsu, M.A. Nedbal // Syst. Biol. 2005. — V. 54. — № 2. — P. 317−337.
  49. Finarelli, J.A. The evolution of orbit orientation and encephalization in the Carnivora (Mammalia) / J.A. Finarelli, A. Goswami // Paleobiology. 2009. — V. 34. — № 4. — P. 553−562.
  50. Glasel, J. Validity of nucleic acid purities monitored by 260nm/280nm absorbance ratios / J. Glasel // BioTechniques, 1995. V. 18. — № 1. — P. 62−63.
  51. Graphodatsky, A.S. High-resolution GTG-banding patterns of dog and silver fox chromosomes: description and comparative analysis / A.S. Graphodatsky, V.R. Beklemisheva, G. Dolf// Cytogenet. Cell Genet. 1995. — V. 69. — P. 226−231.
  52. Gupta, P.K. Genetic mapping of 66 new microsatellite (SSR) loci in bread wheat / P.K. Gupta, H.S. Balyan, K.J. Edwards, P. Isaac // TAG. 2002. — V. 105. — P. 413−422.
  53. Hashiyada, M. Y-chromosomal STR haplotypes in Japanese / M. Hashiyada, T. Nagashima, Y. Itakura, J. Sakai, Y. Kanawaku, J. Kanetake, et al. 12 // Forensic Sci. Int. Genet. 2006. — V. 158. — P. 204−212.
  54. Hedman, J. A fast analysis system for forensic DNA reference samples / J. Hedman, L. Albinsson, C. Ansell, H. Tapper, O. Hansson, S. Holgersson, R. Ansell // Forensic Sci. Int. Genet. 2008 — V. 2. — № 3. — P. 184−189.
  55. Hossner, K.L. Cellular, molecular and physiological aspects of leptin: potential application in animal production / K.L. Hossner // Journal of animal Science. 1998. -V. 78. — P. 463−472.
  56. Hunt, R.M. Intercontinental Migration of Neogene Amphicyonids (Mammalia, Carnivora): Appearance of the Eurasian Beardog Ysengrinia in North America / R.M.
  57. Hunt //American museum novitates. NY.: Published by the American museum of natural history, 2002. № 3384. — 53 p.
  58. Jeffreys, A.J. Individual -specific «fingerprints» of human DNA / A.J. Jeffreys, V. Wilson, S.L. Thein//Nature. London, 1985. -V. 316. -P. 76−79.
  59. Koepfli, K.P. Type I STS markers are more informative than cytochrome B in phylogenetic reconstruction of the Mustelidae (Mammalia: Carnivora) / K.P. Koepfli, Wayne R.K. // Syst. Biol. 2003. — V. 52. — № 5. — P. 571−593.
  60. Ladon, D. Zastosowanie technik molekularnych do mapowania genomow psa i lisa pospolitego / D. Ladon, A. Pienkowska, M. Zajac, M. Switonski // Prace Materialy zootechn. Zeszyt spec. Warszawa, 1997. — № 7. — P. 73−74.
  61. Lee, H. C. Preservation and collection of biological evidence / H.C. Lee, C. Ladd // Croat. Med. J. 2001. — V. 42. — № 3. — P. 225−228.
  62. Leonard, J. A. Ancient DNA Evidence for Old World Origin of New World Dogs / J. A. Leonard, R.K. Wayne, J. Wheeler, R.S. Valadez, Guillen, C. Vila // Science. 2002. -V. 298 — № 5598 — P. 1613−1616.
  63. Li, W.-H. Molecular Evolution / W.-H. Li // USA Sunderland Massachusetts: Sinauer Associates. Inc. Publishers, 1997. 487 p.
  64. Liu, L. Coalescent methods for estimating phylogenetic trees / L. Liu, L. Yu, L. Kubatko, D.K. Pearl, S.V. Edwards // Mol. Phylogenet. Evol. 2009. — V. 53. — № 1. -P. 320−328.
  65. Macdonald, D.W. The Encyclopedia of Mammals / D.W. Macdonald // Oxford University Press, 2001. Vol. 1. — 1000 p.
  66. Meksem, K. Conversion of AFLP bands into high-throughput DNA markers / K. Meksem, E. Ruben, D. Hyten, K. Triwitayakorn, D.A. Lightfoot // Molecular Genetics and Genomics. 2001. — V. 265. — P. 207−214.
  67. Mullis, K.B. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase catalyzed chain reaction / K.B. Mullis, F. Faloona // Meth. Enzymol. 1987. — V. 155. — H. 335−350.
  68. Nash, W.G. The pattern of phylogenomic evolution of the Canidae / W.G. Nash, J.C. Menninger, J. Wienberg, H.M. Padilla-Nash, S.J. O’Brien // Cytogenet. Cell Genet. -2001. -V. 95. P. 210−224.
  69. Olson, M. A common language for physical mapping of the human genome / M. Olson, L. Hood, C. Cantor, D. Botstein // Science. 1989. — V. 245. — № 29. — P. 14 341 435.
  70. Rybczynski, N. A semi-aquatic Arctic mammalian carnivore from the Miocene epoch and origin of Pinnipedia / N. Rybczynski, M.R. Dawson, R. H. Tedford // Nature. -2009. -V. 458. P. 1021−1024.
  71. Perelman, P.L. Comparative chromosome painting in Carnivora and Pholidota / P.L. Perelman, V.R. Beklemisheva, D.V. Yudkin, T.N. Petrina, V.V. Rozhnov, W. Nie, A.S. Graphodatsky // Cytogenet. Genome Res. 2012. — V. 137. — № 2−4. — P. 174−193.
  72. Ross, P. High level multiplex genotyhing by MALDI-TOF mass spectrometry / P. Ross, L. Holl, I. Smirnov // Nature Biotech. 1998. — № 16. — P. 1347−1351.
  73. Sambrook, J.F. Molecular Cloning: A Laboratory Manual / J.F. Sambrook, D.W. Russell, // Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001. Vols 1, 2, 3 ed.- 2100 p.
  74. Savolainen, P. Genetic evidence for an East Asian origin of domestic dogs / P. Savolainen, Y. Zhang, J. Luo, J. Lundeberg, T. Leitner // 2002. V. 298 — №. 5598. -P. 1610−1613.
  75. Saitou, N. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees / N. Saitou, M. Nei // Mol. Biol. Evol. 1987. — № 4. — P. 1406−425.
  76. Sokal, R.R. The principles of numerical taxonomy / R.R. Sokal, P. H.A. Sneath // San Francisco: Freeman, 1963. 359 p.
  77. Slaska, B. Analysis of the mitochondrial haplogroups of farm and wild-living raccoon dogs in Poland/B. Slaska, L. Grzybowska-Szatkowska//Mitochondrial DNA. 2011. — V. 22-№ 4.-P. 105−110.
  78. Studer, Th. Die praehistorischen Hunde in ihrer Beziehung zu den gegenwartig lebenden Rassen / Th. Studer. Zurich, 1901.
  79. Ruitberg, C.M. STRBase: a short tandem repeat DNA database for the human identity testing community / C.M. Ruitberg, D.J. Reeder, J.M. Butler // Nucleic Acids Res.2001. V. 29. — № 1. — P. 320−322.
  80. Small, M.P. American marten (Martes americana) in the Pacific Northwest: population differentiation across a landscape fragmented in time and space / M.P. Small, K.D. Stone, J.A. Cook // Molecular Ecology. 2003. — № 12. — P. 89−103.
  81. Smith, D. Occurrence and inheritance of microsatellites in Pinus radiate / D. Smith, M.E. Devey // Genome. 1994. — V. 37. — P. 977−983.
  82. Stepniak, E. Use of RAPD technique in evolution studies of four species in the family Canidae / E. Stepniak, M.M. Zagalska, M. Switonski // Journal of applied genetics.2002. V. 43. — № 4.- P. 489−499.
  83. Stone, K.D. Molecular evolution of the holarctic genus Martes / K.D. Stone, J. A. Cook // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2002. — № 24. — P. 169−179.
  84. Stone, K.D. Post-glacial colonization of northwestern North America by the forest associated American marten (Martes americana) / K.D. Stone, R.W. Flynn, J.A. Cook // Molecular Ecology. 2002. — № 11. — P. 2049−2063.
  85. Switonski, M. Comparative genomics of 3 farm canids in relation to the dog / M. Switonski, I. Szczerbal, J. Nowacka-Woszuk // Cytogenet Genome Res. 2009 -V.126. — № 1−2. — P. 86−96.
  86. Swofford, D.L. Phylogeny inference. In: Molecular Systematics. 2nd ed. D.M. Hillis, C. Moritz and Mable K. eds. / D.L. Swofford, G.J. Olsen, P.G. Waddel, D.M. Hillis // Sinauer Associates. Massachusetts, 1996. P. 411−501.
  87. Tataurov, A.V. Predicting ultraviolet spectrum of single stranded and double stranded deoxyribonucleic acids / A.V. Tataurov, Y. You, R. Owczarzy // Biophys. Chem. 2008. — V. 133 (1−3). — P. 66−70.
  88. Taylor, W.E. Myostatin inhibits cell proliferation and protein synthesis in C2C12 muscle cells / W.E. Taylor, S. Bhasin, J. Artaza, F. Byhower, M. Azam, D.H. Willard,
  89. F.C. Kull, N. Gonzalez-Cadavid // Am J. Physiol. Endocrinol. Metab. 2001. — V. 280. — № 2. — P. 221−228.
  90. Thomas, M. Myostatin, a negative regulator of muscle growth, function by inhibiting of myoblast proliferation / M. Thomas, B. Langley, C. Berry, M. Sharma, S. Kirk, J. Bass, R. Kambadur // J. Biol. Chem. 2000. — V. 275. — № 51. — P. 4 023 540 243.
  91. Urban, T. A study of associations of the H-FABP genotypes with fat and meat production of pigs / T. Urban, R. Mikolasova, J. Kuciel, M. Ernst, I. Ingr // J. Appl. Genet. 2002. — V. 43. — № 3. — P. 505−509.
  92. Wandeler, P. Short microsatellite DNA markers for the red fox (Vulpes vulpes) / P. Wandeler, S. M. Funk // Molecular Ecology Notes. 2006. — V. 6, Issue 1 — P. 98 100.
  93. Wallace, D.C. Mitochondrial DNA variation in human evolution, degenerative disease, and aging / D.C. Wallace// Am. J. Hum. Genet. 1995. — V. 57. — № 2. — P. 201−223.
  94. Wayne, R.K. Molecular evolution of the dog family / R.K. Wayne // Trends in Genetics. 1993. — V. 9. — № 6. — P. 218−224.
  95. Wayne, R.K. Molecular systematics of the Canidae / R.K. Wayne, E. Geffen, D.J. Girman, K.P. Koepfli, L.M. Lau, C.R. Marshall // Syst. Biol. 1997. — V. 46. — № 4. — P. 622−53.
  96. Wayne, R.K. Origin, genetic diversity, and genome structure of the domestic dog / R.K. Wayne, E.A. Ostrander // BioEssays. 1999. — V. 21. — P. 247−257.
  97. Wayne, R. K. Out of the dog house: the emergence of the canine genome / R. K. Wayne, E. A. Ostrander // Heredity. 2004. V. 92. P. 273−274.
  98. Zietkiewicz, E. Genome fingerprinting by sequence repeat (SSR) anchored polymerase chain reaction amplification / E. Zietkiewicz, A. Rafalski, D. Labuda // Genomics. — 1994. — V. 20. — P. 176−183.
  99. Viranta, S. Geographic and temporal ranges of Middle and Late Miocene carnivores / S. Viranta // J. Mammal. 2003. — V. 84. — P. 1267−1278.
  100. Welsh, J. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers / J. Welsh, M. McClelland //Nucleic Acids Research. 1990. — V. 18. — № 24. — P. 7213−7218.
  101. Welsh, J. Genomic fingerprinting using of primers / J. Welsh, M. McClelland // Nucleic Acids Research. 1991. — V. 19. — № 19. — P. 5275−5279.
  102. Williams, J.G.K. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers / J.G.K. Williams, A.R. Kubelik, K.J. Livak, J.A. Rafalski, S.V. Tingey // Nucl. Acids Res. 1990. -V. 18. -№ 22. — P. 6531−6535.
Заполнить форму текущей работой

Сессия? Спокойно!