Разработка методов и тест-систем ускоренной индикации Yersinia Enterocolitica в кормах и мясных продуктах на основе ДНК-диагностики
Диссертация
Разработаная тест-система индикации Y. enterocolitica в кормах и мясных продуктах, включающая набор для выделения ДНК с лизирующим реагентом гуанидинтиоизоционатом и сорбентом NucleoS™, набор для постановки ПЦР и реагенты для детектирования амплифицированной ДНК с помощью электрофореза в агарозном геле, позволяют выявлять искомые бактерии в присутствии близкородственных видов бактерий… Читать ещё >
Список литературы
- Антонов А.С. Молекулярные основы геносистематики // Изд. МГУ, М., 1980, с. 24−31.
- Ахмедов Р.А. Кишечный иерсиниоз как природноочаговое заболевание//Тезисы докладов научной конференции «Современные аспекты профилактики зоонозных инфекций», Ставрополь, 1991.-С.156−158-
- Блохина И.Н., Леванова Г. Ф. Геносистематика бактерий // М., 1976.
- Брехова-Колесникова А.В., Ющенко Г. В. Результаты исследования больных острыми кишечными заболеваниями на кишечные иерсиниозы (иерсиниоз и псевдотуберкулез) в Краснодарском крае// Актуальные вопросы инфекционной патологии.- Саратов, 1981.-С. 60−61-
- Бузолева Л. С., Бурцева Т. И., Сомов Г. П. /Влияние температуры культивирования на содержание нуклеиновых кислот у бактерий Listeria monocytogenes и Yersinia psedotyberculosis. // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии.- 2000.-№ 6.-С. 22−25
- Бурыкина И.М., Сафронова Л. В. /Мониторинг за развитием Yersinia enterocolitica в обеспечении качества и безопасности молочныхпродуктов // Сборник трудов седьмого всероссийского конгресса «Политика здорового питания в России», Москва, 2003, с. 88.
- Вальехо-Роман К. М. Гибридизация ДНК В кн.: Молекулярные основы геносистематики //Изд-во МГУ, М., 1980, с.86−105.
- Васильев Д.А., Золотухин С. Н., Померанцев Д. А., Русалеев B.C., Каврук JI.C. Биологические свойства фагов Yersinia enterocolitica // Ветеринария, — 2003.-N 1.-С. 25−28
- Ю.Воскресенская Е. А., Протективное и диагностическое значение антигенов иерсиний псевдотуберкулеза // микробиология., Санкт-Петербургский научно- исследовательский институт Эпидемиологии и Микробиологии имени Пастера.-Санкт-Петербург.-1994.
- П.Гинцбург A.JI. Генодиагностика инфекционных заболеваний // Журнал микробиологии, эпизоотологии и иммунологии, 1998, № 3, с. 86−95.
- Гинцбург A.JI. Современное состояние и перспективы молекулярно-генетических методов и решение задач медицинской микробиологии // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунологии, 1999, № 5, с.22−26.
- Гинцбург А.Л., Романова Ю. М. Некультивируемые формы бактерий и их роль в сохранении возбудителей сапронозов во внешней среде // Журнал микробиологии, эпизоотологии и иммунологии, 1997, № 3, с. 116−121.
- Гордейко В.А., Литвин В. Ю., Шустрова И. М. Иерсинии в почве полей, орошаемых сточными водами свинокомплекса// Гигиена и санитария.-1991.- № 1.-С. 28−30.
- Гордейко В. А., Воронцова Т. А., Литвин В. Ю. Сероэпидемиологическое изучение кишечного иерсиниоза у работников свинокомплексов// ЖМЭИ.-1990.-№ 3.-С. 111−112.
- Гречищева Т.С. Кишечные иерсиниозы (псевдотуберкулез и иерсиниоз) у людей в Егорьевском районе Московской области// Актуальные вопросы инфекционной патологии.- Саратов, 1981.-С. 46−48.
- Гурлева Г. Г. Упрощенный способ определения серологических вариантов Y.enterocolitica// Лабораторное дело.-1989 № 7-С. 70−72.
- Дранкин Д.И., Гельдыев А. Г., Хотько Н. И. Вода и инфекция-Ашхабад, Мирап, 1994.- 67с.
- Дунаев В.И., Амиркулов А. И. Антигенное родство Y. enterocolitica с родом Brucella// Актуальные вопросы инфекционной патологии.-Саратов -1981.- С. 58−60-
- Емельяненко Е. Н. Некульти в ируемые формы иерсиний и листерий в почве и при взаимодействии с растениями, Научно- исследовательский институт эпидемиологии имени Н.Ф. Гамалеи, М., 1997.
- Золотарев Ф. Н, Голубев Д. Б., Петров Н. А. Метод точечной гибридизации в вирусологии.// Успехи современной биологии.- 1989.-том 108.- с. 375 382.
- Золотарев Ю.В., Мешандин А. Г., Золотарева Л. В. Серологическая диагностика сальмонеллезов // Клин. лаб. диагностика, 2001, № 1, с.52−54.
- Коромыслов Г. Ф., Фомин Б. А., Артюшин С. К. и др. Диагностикумы инфекционных болезней сельскохозяйственных животных на основе генной инженерии // Труды ВИЭВ, 1994, т. 69, с. 8−14.
- Корчагин Г., Васильев Д. А. /Возможности использования ПЦР для идентификации иерсиний/.,// Вопросы микробиологии, эпизоотологии и ветеринарно-санитарной экспертизы: Сборник научных работ/ Ульянов, гос. с-х. акад.- Ульяновск, 2000.-С. 67−70
- Кузнецов В.Г., Багрянцев В. Н., Клименко В. В. Роль рефрижераторов в распространении бактерий рода Yersinia// Гигиена и санитария -1992.-№ 2.-С. 43−46.
- Кузнецов В.Г., Тимченко Н. Ф., 1998 Взаимодействия между бактериями рода Yersinia в водной среде Журн. микробиол., 1998, № 6, С. 26−29.
- Куликовский А.В., Джентемирова К. М. Иерсиниоз- актуальная проблема ветиринарной медицины// Ветеринария.- 1993.-№ 11−12.-С. 28−35.
- Ленченко Е.М., Куликовский А. В., Павлова И. Б. Иерсиниоз. Этиология, эпизоотология, диагностика, меры борьбы и профилактики // Москва, 1998.
- Литвин В.Ю. Сапрофитическая фаза в экологии возбудителей инфекционных заболеваний// ЖМЭИ.- 1985.- № 6.-С. 98−101-
- Маккреди Б.Д., Чимера Д. А. Обнаружение и идентификация патогенных микроорганизмов молекулярными методами // В кн. Молекулярная клиническая диагностика, М., изд. «Мир», 1999, с.496−506.
- Маниатис Т., Фрич Э., Дж. Сэмбрук Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование // М., Мир, 1984.
- Медников Б.Н. Дивергенция геномов и некоторые вопросы эволюционной теории // Автореф. на соискании ученой степени доктора биологических наук, М., 1978.
- Павлова И.Б. Закономерности развития популяций бактерий в окружающей среде (электронно-микроскопическое исследование) // Диссертация в виде научного доклада, М., 1999.
- Прозоровский С.В., Кац Л.Н., Каган Г. Я. L-форма бактерий // М., изд. «Медицина», 1981, с. 5−112.
- Славчев Г. Развитие и преживаемост на Yersinia enterocolitica в краве масло//Ветеринарна сбирка.-1989.-№ 3.-С. 50−52.
- Славчев Г. Развития и проживаемост на Yersinia enterocolitica в постъеризирано мляко и сладолед// Ветеринарно- медицински науки.- 1986.-№ 6.-С. 77−85.
- Славчев Г. Термоустойчивост на Yersinia enterocolitica в краве мляко// Ветеринарна сбирка. —1989.-№ 2.-С. 46−47.
- Славчев Г. Продукция на термастобилен ентеротоксин от щамове на Y.enterocolitica серотип 03//Ветеринарна сбирка.-1990.-№ 5,6-С.43−45.
- Славчев Г., Цанев Н. Доказане на Y.enterocolitica серотип 0:3 в мляко и млечни продукти посредством коаглутинационния тест// Ветеринарна сбирка.- 1989.-№ 6.-С. 18−19.
- Сомов Г. П., Покровский В. И., Беседнова Н. Н. Псевдотуберкулез // М., 1990, С. 1.
- Сомов Г. П. Особенности экологии внеорганизменных популяций патогенных бактерий и их отражение в эпидемиологии инфекций //ЖМЭИ, 1997,№ 5, с.7−11.
- Стефанов И. Биохимична и серологична характеристика и потенциална патогенност на щамове Yersinia enterocolitica, изолиране от свине//Епид., микр., инф. болести.- 1990.-№ 2.-С. 30−36.
- Стефанов И. Изолирана на Yersinia spp. от тонзили и езици на рядовно заклани свине//Ветеринарна сбирка.-1989.-№ 8.-С.41−43.
- Стефанов И. Иерсинии и йерсиниози по животните// Ветеринарна сбирка.-1989.-№ 7.-С. 39−40.
- Тимченко Н.Ф. Генетико-биохимические механизмы патогенности бактерий и перспективы их изучения //Бюлл. АМН СССР, 1986, № 4, с. 66−71.
- Турова Т.П. Определение таксономического положения микроорганизмов с помощью метода гибридизации ДНК // Биологические науки, 1989, № 2, с. 26−28.
- Хапцев З.Ю. Усовершенствование лабораторной диагностики кишечного иерсиниоза сельскохозяйственных животных (микробиология).-Саратов-2000.
- Хачатрян Т.С. Обсемененность овощей иерсиниями в условиях г. Еревана// Актуальные вопросы краевой инфекционной патологии.-Ереван, 1988.- Выпуск VIII.-C. 106−107-
- Херрингтон С., Макги Дж. Молекулярная клиническая диагностика // М, изд. «Мир», 1999, с. 558.
- Ценева Г. Я. Иерсиниоз и псевдотуберкулез-СПб, 1992.-60с.
- Ценева Г. Я. Лабораторная диагностика псевдотуберкулеза и иерсиниоза- СПб, 1997.-62с.бб.Чан Т.В. Т. Гибридизация нуклеиновых кислот // В кн. Молекулярная клиническая диагност, методы, М., 1998, изд. «Мир», с. 374−394.
- Черкасский Б.Л., Подунова Л. Г., Акулова Н. К. Пищевые зоонозы у людей в России. Пищевые зоонозы сальмонеллезы, кампилобактриоз, иерсиниозы, листериоз // Методы и средства диагностики, лечения и профилактики: Тез.докл.М., 1995.С. 18−19.
- Шумилов К.В., Мельниченко Л. П., Селиверстов В.В./ Современные данные об иерсиниозе животных // Ветеринария.-1998.-N4.-C.7−13.
- Шумилов К.В., Мельниченко Л. П., Селиверстов В. В. Современные данные об иерсиниозе животных//Ветеринария.-1998.-№ 4.-С. 7−13.
- Ющенко Г. В. Антропогенная трансформация природных очагов иерсиниозов и особенности эпидемиологии// Тезисы докладов XII Всесоюзной конференции по природной очаговости болезней, Новосибирск, 10−12 октября 1989.-С.144−145.
- Ющенко Г. В. Род Yersinia// Энтеробактерии: (Руководство для врачей)/ Под ред. В. И. Покровского.- М.: Медицина, 1985,-Гл.З.-С. 220 239.
- Ющенко Г. В., Дунаев В. И. Методика выделения и идентификации Yersinia pseudotuberculosis и Y. enterocolitica// Лабораторное дело.-1980.-№ 6.-С. 367−370.
- Ющенко Г. В., Некрасова Л. И. Псевдотуберкулез и иерсиниоз у людей в Архангельске// Актуальные вопросы инфекционной патологии -Саратов, 1981.-С.54−55.
- Ющук Н.Д., Кареткина Г. Н. Иерсиниоз// Советская медицина.-1987.-№ 9.-С.54−58.
- Arends M.J. Identification of HPV: in situ hybridization or polymerase chain reaction //J.Pathol., 1991, v. 164, № 3, p. 191−193.
- Arrand J. Preparation of nucleic acid probes: Nucleic acid hybridization: a practical approach // ED. By BD Hames, IRL Rpess, 1986, p. 40.
- Asai Т., Zaporojets D., Squires C., Squires C.L. // An Escherichia coli strain with all chromosomal rRNA operons inactivated: Complete exchange of rRNA genes between bacteria // PNAS, 1996, v.96, p. 1971−1976.
- Baker R.F. Binding of DNA to cellulose nitrate filters under denaturing conditions //Anal. Biochem, 1977, v.78, p. 569−571.
- Berger С., Melchers F. In situ hybridization ofmRNA molecule in single cells // Annu rep, 1985, Basel Inst. Immunol, Basel, p. 1−10.
- Bernet C., Carret M., de Barbeyrac B. Detection ofMycoplasma pneumoniae by Using the Polymerase chain Reaction // J.clin. Microbiol.-1989,-Vol. 27. N II.-p. 2492−2495.
- Bevan I. S, Daw R.A., Day P.J.R., Ala F.A., Walker M.R. Polymerase chain reaction for detection of human cytomegalovirus infection in a blood donor population // Brit. J. Haematol., 1991, v.78, № 1, p. 94−99.
- Bohm H., Karch H. DNA fingerprinting of Escherichia coli 0157.-H7 strains by pilsed-fild gel electroforesis //J. Clin. Microbiol., 1992, v.30, p.2169−2172.
- Brechot C. Application du donare de 1 DNA du virus de 1 hepatite В pour le diagnostic des infection lines au virus de 1 hepatite В // Ann. Biol. Clin, 1985, № 4, p. 351.
- Brytting M, Sundgvist V.-A., Stahlhandske P., Linde A., Wahren B. Cytomegalovirus DNA detection of an immediate early protein gene with nested primer oligonucleotides // J. Virol. Meth., 1991, v. 32, № 2−3, p. 1 127 138.
- Church R.B. Method for study of hybridization and reassociation of nucleic acids axtracted from cells of higher animals // In: Molecular techniques and approach in developmental biology, ed. by M. J. Chrispeels. N. Y., 1973, p. 223−301.
- Conner C.P., Heithoff D.M., Julio S.M., Sinseheimer R.L., Mahan M.J. Differential papperns of acquired virulence genes distinguish Salmonella ctrains // PNAS, 1998, v.95, p.4641−4645.
- Denhardt D.T. A membrane filter technique for the detection of complementery DNA // «Biochem. Biophys. Res. Commun», 1966, v.23, p. 641−646.
- Ferenezy A. Latent papilomavirus and recurring genital warts // N. Engl. J. Mod., 1985, № 14, p. 784.
- Fukushima Iochi, Marugama Kenji, Omori Ichiro et al. Kontamination von Schweinen mit Yersinia im Schlachthaus// Fleischwirtschaft.-1990.-Vol. 70, № 10.-P. 1330−1332.
- Furowicz Antoni J., Czernomysy-Furowicz Danuta. Yersinia pseudotuberculosis infection in animals// Adv. Agr. Sci.-1996- Vol. 5, № 1.-P. 5−10
- Gannon V. P., King R.K., Kim J.Y., Thomas EJ. Rapid and sensitive metod for detection of Shiga-like toxin-produsing Escherichia coli in ground beef using the polimerase chain reaction // Appl. Environ Microbiol, 1992- v.58, p.3809−3815.
- Garrigue G., Poveda J.D., Carniel E. Yersinioses: Rappel bacteriologigue, epidemiologigue et clinigue. Etude de 8856 serologic en France// Feniel. Biol.-1993.-№ 190.- P. 25−28.
- Gillespie D., Spiegelman S. A quantive assay for DNA-RNA hybrids with DNA-RNA immobilized on a membrane // J. Molecul. Biol., 1965, v. 12, p.829−842.
- Gonul Sahika Aktug, Karapinar Mehmef. The microbiological guality of drinking water supplies of Izmir City: the incidence of Yersinia enterocolitica// Int. I. Food. Microbiol.- 1991.-Vol. 13, № 1.-P. 69−73.
- Haase A. Analysis of infections and pothological condition by in situ hybridization // DNA Probes: Appli. Genet and Infic. Disease and Cancer: Conf, Cold Spring Harbor. Apr. 20−23, 1986, Cold Spring. Harbor. N. Y., 1986, p. 113−118.
- Haase A., Brahic M., Blum H. Detection of viral nucleic acids by in situ hybridization // Meth. Virol. Vol., Orlando c. a., 1984, p. 189−226.
- Hashimoto Y., Itho Y., Fujinada Y., Khan A.Q., Sultana F., Miyake M., Hirose K., Yamamoto H., Ezaaki T. // Development of nested PCR based on the ViaB sequence to detect Salmonella thyphimurium // J. Clin. Microbiol., 1995, v.33,p.775−777.
- Hill W., Madden J. Foodbome enterotoxigenis Escherichia coli: detection and enumeration by DNA hybridization.// «Appl. and Enviro. Microbiol», 1983, № 4, p.1324−1330.
- Hill W., Payne A. Detection and enumeration of virulent Yersinia enterocalitica in food by DNA colony hybridization // Appl. F Environmental Microbiology, 1984, № 4, p. 801−807.103. inflamation// Int. J. Tissue React.-1992.- Vol.- 16, № 2.- P. 51−57.
- Jakubczak Antoni, Plaff-Samoraj Aleksandra, Siemionen Jan et el. Wystepowanic pateczek z rodzaju Yersinia i zwierzat hodowlanych, domowych, drikow ozaz ryb pochodzacych z wojewodztwa Olstynskiego// Med. Weter.-1993.-Vol.49, № 7.-P. 301−303.
- Jakubczak Antoni, Simeonek Jan, Anusz Jbigniew Ocena testow na patogennosc szezepow Yersinia enterocolitica izolowanych od ludi i zwieri// Med. vet.-1992.-Vol. 48,№ 7.- P. 313−316.
- Jeremic Svetlana, Veljavic L.J., Andelic D. Biochemical and serological characteristics of Yersinia ruckeri isolates whigh cause typical and alypical infections in californian trad (Onchorhynchus mykiss)// Acta vet.-1997-Vol. 47, № 5−6.- P. 345−351.
- Kacian D., Lawrence Т., Sanders M., Putnam J., Majlessi M., McDonough S., Ryder T. A rapid and sensitive chemiluminescent DNA probe system for detection of amplified HIV and HBV DNA // Fresenius J. Anal. Chem., 1990, v. 337, № 1, p. 95.
- Kaneuchi Choji, Shibata Masashi, Kawasaki Takako et al. Occurrence of Yersinia spp. in migratory birds, ducks, seaguels and swallows in Japan// Jap. J.vet. Sci.- 1989.-Vol 51,№ 4.- P. 805.
- Karh H., Meyer Т. Evalution of oligonucleotide probes for identification of shiga-like-toxin-producing Esherichia coli // J. Clin Microbiol, 1998, v.27, p.1180−1186.
- Kim H. et al. Applying of different methods for allocation DNA // J. of Food Sci., 1986, v. 5, № 3, p. 68−71.
- Kim J., Nietfeldt J., Benson A.K. Octamer-based genome scanning distinguishes a unigue subpopulation of Escherichia coli 0157: H7 strains in cattle // Proc. Nail. Acad. Sci., USA, 1999, v. 96, Issue 23, p. 13 288−13 293.
- Lanata C. Sensitivity and specifity of DNA probes with the stool blot technique for detection of Eschenchia coli enterotoxins.// «J. Infec. Diseases», 1985, № 5, p. 1087−1090.
- Lim J.K., Gunther N.W., Zhao H., Johnson D.E., Keay S.K., Mobley H.L.T. // In Vivo Phase Variation of Escherichia coli Type 1 Fimbrial Genes in Women with Urinary Tract Infection // Infection and immunity, 1998, v. 66, № 7, p.3303−3310.
- Louie M., de Azavedo J, Clarke R., Borczyk A., Lior H., Richter M., Brunton J. Sequence heterogeneity of the eae gene and detection of verotoxin-produsing Escherichia coli using serotype-specific primers // Epidemiol Infect- 1994, № 112, p. 449−461.
- Luk J.M., Kongmuang U., Trans R.S., Lindberg A.A. An enzyme-linked immunosorbent assay to detect PCR products of the rfbS gene from serogroup
- D salmonellae: a rapid screening prototype // J. Clin. Microbiol., 1997, v.35, p.714−718.
- Marmur J., Doty P. Heterogeneity in deoxyribonucleic acids. I. Dependens on composition of the configurational stbility of deoxyribonucleic acid // Nature, 1959, v. 183, p. 1427−1431.
- Marmur J., Doty P. Thermal renaturation of deoxyribonucleic acid. // J. Molecul. Biol., 1961, v.3, p.585−594.
- Moseley S.L., Hyg J. Detection of enterotoxigen Esherichia coli by DNA colong hybridization // J. Infect, 1989, № 6, p. 892−898.
- Nataro J.P. Detection of an abherence factor of enteropathogenes Escherichia coli with a DNA probe // J. Infec. Diseases, 1985, № 3, p.560−565.
- Palva A. A gene in the detection of Escherichia coli and other Enterobacteriaceae by nucleic acid sandwich hybridization // J. Clin. Microbiol., 1983, № 1, p.92−100.
- Pannwitz S. Roost H. Gehaufites Auftreten blutserologischer Brucellose-Reaktionen in einem Mastschweinebestand mit Yersinia- enterocolitica-Nachweis- Fallbericht//Tierarztl. Umsch.-2001.- Jg. 56, N 6.-S 306−314
- Quaglio P., Aggazzotti G., Fabio A. et al. Presenza di batteri appartenenti al genere Yersinia in agna superficiali e di falda// Ann. ig.: Med. prev. comunita-1989.-Vol. l,№l-2.-P. 157−162.
- Ramisse J., Manet G., Pellerin J. et. al. Biotypes de Yersinia retrouves dans des produits alimentaires. Des prelevements biologigues et des eaux//Microbiol., alim. nutr.- 1990.-Vol.8, № 1.-P. 39−43.
- Ranki M. Sandweich hybridization as a convmient method for detection ofnucleic acids in crude samples // Gene, 21, 1983, p. 77.
- Rifai S., Barbancon V., Prevost G., Piemont Y. Staphylococcus aureus Synthetic exfoliative toxin A and В DNA probes for detecton of toxigenic Staphylococcus aureus strains // J. Clin. Microbiol., 1989, № 3, p. 504−506.
- Saebo A., Lassen J. Yersinia enterocolitica: An inducer of chronic inflomation // Int. J. Tissue React. Vol. 16, № 2. P. 51−57.
- Saiki R. X., Chu-An Chang B.S., Levenson C.H., Warren T.C., Bochm C.D., Kazazian J.H., Erilch H.A. // New Eng. J. Mod. 1988. v. 391. p. 537−541.ft
- Saiki R.K., Walsh P. S., Levenson C.H., Erlich H.A. Genetic ahalisis of amplified DNA with immobilized sequence-specific oligonucleotide probes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1989, vol. 86, p. 6230−6234.
- Stinson Stephen C. Identifying bacteria: looking for a fast track // Chem. and Eng. News, 1999−77, № 13, p.36−38.
- Vladik P., Prouza A. Naler Yersinia ruckeri u pstrohu duhovych v Ceskoslovensku// Vet. med.-1990.-Vol.35, № 7.- P. 437−442.
- Webb L., Carl M., Malloy D. et al. Detection of murine typhus infection in fleas by using the polymerase chain reaction// J. Clin. Micr.-1990.-Vol.28, N3.-P. 530−534.fe>
- Wegmuller В., Luthy J., Candriau U. Direct polymerase chain reaction detection of Campylobacter jeuni and Campilobacter coli in raw milk and dairy products//Appl. Environ. Microbiol.- 1993.-V.59.-N 7.-P. 2161−2165.
- Wright D.J., Chapman P.A., Siddons C.A. Immunomagnetic separation as a sensitive method for isolating Escherichia coli 0157 from food samples // «Epidemiol infect», 1994, v. 113, p. 31−39.
- Yesim Ozbas Z., Aykut Aytac S. Incidence of Yersinia enterocolitica in samples of pasteurized milk// Chem. microbiol. Technol. Lebensm.-1993.-Vol. 15, № 5−6.-P 129−133.