Термодинамика протолитических равновесий в водных растворах пептидов и реакций комплексообразования иона никеля (II) с ?-аланином и DL-?-аланил-DL-валином
Диссертация
Живые биологические системы являются открытыми, и протекающие в них реакции относятся к разряду не равновесных. Однако эти динамические, необратимые жизненные процессы происходят внутри организованной или крайне медленно меняющейся структуры. Это дает возможность при рассмотрении молекулярных уровней организации биосистем и механизмов биохимических реакций исходить из условного термодинамического… Читать ещё >
Список литературы
- Якубке Х.-Д., Ешкайт X. Аминокислоты, пептиды, белки. М.: Мир, 1985. С. 455.
- Тищенко Г. Н. Строение линейных и циклических олигопептидов в кристаллах. // В сб.: Итоги науки и техники. Кристаллохимия. ВИНИТИ, 1979. Т. 13. С. 189−249.
- Tristram G. R., // Nature, 159, 1947. P. 581.
- Bailey К., //Chem. Ind., 1950. P. 243.
- Corey R.B., Pauling L. Fundamental dimensions of polypeptide chains. //Proc. Roy. Soc. London. 1953. В 141. P. 10−20.
- Tables of Interatomic Distances in Molecules and Ions, Suppl. Spec. Publ. No. 18, The Chemical Society, London, 1965.
- Полинг Л. Природа химической связи, — М. Гос. изд. хим. лит., 1947.
- Marsh R.F., Donohue J. //J. Adv. Protein Chem. 1967. 22. P. 235.
- Ramachandran G.N., Ramakrishnan C., Sasisekharan V. Stereochemistry of polipeptide chain configuration. // J. Mol. Biol. 104, 1976. P. 59.
- Ramachandran G.N., Kolaskar A.S., Ramakrishnan C., Sasisekharan V. //Biochem. Etbiophys. acta. 1974. 359. P.298
- Winkler F. K., Dunitz J. D., The non-polar amide group. //J. Mol. Biol. 59, 1971. P. 169.
- Brant D.A., Miller W.G.Conformational energy estimates for statistically coiling polypeptide chains. // J. Mol. Biol. 23, 1967. P.47 .
- Nemetry G., Scheraga H.A., Protein Folding. // Duart. Rew. Biophis.10.1977. P. 239.
- Ramachandran G.N., Venkatachalam C.M., Stereochemical criterial for polypeptide and protein chain conformations. //Biophys. J.6.1966. P. 849.
- Ramachandran G.N., Sasisekharan V., Conformation of polypeptide and protein. // Adv. Prot. Chem. 23. 1968. P. 283.
- Шульц Г., Ширмер Р. Принцыпы структурной организации белков. М.: Мир. 1982. С27.
- Linderstom-Lang К. U., Sclmellman J. A. Protein stmktiire and enzyme activity. // Academic Press, New York, Yol. 1, 1956, P. 443.
- Perczel A., Kajtar M., Marcoccia J.F., Csizmadia I.G. The utility of the four-dimensional Ramachandran map for the description of peptide conformations. //J. Mol. Struct. Theochem. 1991. 232. P. 291−319.
- Grant J.A., Williams R.L., Scheraga H.A., // Biopolymers. 1990. 30. P. 929−949.
- Masataka K., Karuto Y., Tetsu K., Nobutaka F., Tooru T. // Bull. Chem. Soc. Jap. 1994. 67. N3. P. 648−652.
- Ramakrishann C., Srinivasan N. Glycyl residues in protein and peptides: An analysis. //Curr. Sci. (India). 1990. 59. N 17−18. P. 851−861.
- Flettericlc R.J., Tsai Chun Che, Hughes R.E. The crystal and molecular structure of L-alanyl-L-alanine. //J. Phys. Chem. 1971. 75(7). P. 918−922.
- Liff M.I., Lyu P.C., Kallenbach N.R. Analysis of asymmetry in the distribution of helical residues in peptides by 'H nuclear. //J. Amer. Chem. Soc. 1991. N3. P. 1014−1019.
- Blout E.R., Bloom S.M. The dependence of the conformation of the synthetic polypeptides on amino acid composition. //J. Amer. Chem. Soc. 1960. N82. P. 3787.
- Gorbitz C.H. Hydrogen-bond distances and angles in the structures ofamino acids and peptides. //Acta crystallogr. B. 1989. 45. N4. P.390−395. 2 8. Hitchcock D.I. //J. Biol. Chem. 114. 1936. P. 373.
- Colin E.J., Edsall J.T. Proteins, Amino Acids and Peptides.// Reinliold Publ. Corp., New York, 1943, P.84.
- Nozaki Y, Tanford С.// J. Biol. Chem. Vol. 246. 1971. P. 2211.
- Старобинец ГЛ., Капуцкий Ф. Н., Юркштович Т. А. // Журн. физ. химии. 1966. Т. 70, N 7. С.1307−1310.
- Meirovitch Н., Rackovsky S., Scheraga Н.А. // Mactomolecules. 1980. Vol.13. Р.1398−1405.
- Meirovitch Н., Scheraga Н.А. // Mactomolecules. 1980. Vol.13. P. 14 061 414.
- Pratt L. R- //Annu. Rev. Phus. Chem. 1985. Vol.36. P. 433−449.
- Биологически активные вещества в растворах. Структура термодинамика реакционная способность. Редактор Кутепов А. М, М.: Наука 2001. С. 184.
- Волков А.В. Стандартные энтальпии сгорания и образования кислород- и азотсодержащих органических соединений: Дисс. канд. хим. наук. Иваново. 1996. С. 104.
- Васильев В.П., Кочергина Л. А., Горболетова Г. Г., Попова О. Н. Тепловые эффекты диссоциации глицил-Т-аминомасляной кислоты. //Журн.физ. химии. 1997. т.71. N9. С. 1586
- Васильев В.П., Кочергина Л. А., Горболетова Г. Г., Попова О. Н. Стандартная энтальпия образования глицил-Т-аминомасляной кислоты и продуктов ее диссоциации в водном растворе. //Журн.физ. химии. 1999. т.73. N1. С. 47.
- Васильев В.П., Кочергина Л. А., Горболетова Г. Г., Попова О. Н. Теплоты ступенчатой ионизации глицил-Ь-аспарагина в водном растворе. //Журн.физ. химии. 1999. т.73. N4. С. 643.
- Васильев В.П., Кочергина JI.A., Крутова ОН. Термохимическое исследование реакций кислотно-основного взаимодействия в водном растворе р-аланил-р-аланина. //Изв.вузов.химия.и хим. технология 2003. т.46. вып.6. С.69−72.
- Diaz-E.L., Domalski E.S., Colbert J.C. //J. Chem. Thermodyn. 1992. 24. N12. C. 1311−1318.
- Badelin V.G., Kulikov O.V., Vatagin V.S., Udzig El, Zielenkiewicz A., Zielenkiewicz W., Krestov G.A. Physico-chemical properties of peptides and their solutions//Thennochimica Acta. 1990. 169. P. 81−93.
- Rodante F., Fantauzzi F. Theraiodynamics of dipeptides. Part II. Influence of methyl groups on the a-free carboxyl and amino groups. Study of a symmetrical system. //Thermochim. acta. 1990. 157. N2. P.279−285.
- Colin E.J., Edsall J.T. // Proteins, amino acids and peptides, Reinhold Publ. Corp., New York, 1943, p 445.
- Куликов О.В., Баделин В. Г., Крестов Г. А. // Биофизика 1991. Т.36, N3. С.394−398.
- Ellenbogen Е. Dissociatic constants of peptides. IV. The isomeric alanylalanines. //J. Amer. Chem. Soc. 1956. 78. C. 369−372.
- Kresheck G., Benjamin L. //J. Phys. Chem. 1964. 68. P. 2476.
- Matsumoto M., Amaya K. //Bull. Chem. Soc. Jap. 1983. 56. P.2521.
- Левушкин Д.А., Баделин В. Г., Крестов Г. А. Энтальпии растворения некоторых аминокислот и пептидов в воде при 298,15 К. Изв. Вузов. Химия и хим. технология. 1993. Т.36. N3. С. 117−118.
- Murphy К.Р., Gill S.J. Group additivity thermodynamics for dissolution of solid cyclic dipeptides into water. //Thermochim acta. 1990. 172. C. 11−20.
- ДюгаГ., Пенни К. Биоорганическая химия. М.: Мир. 1983. С. 512. 56. Stojanoski К., Zdravkovski Z. On the formation of peptide bonds. //J.
- Chem. Educ. 1993. 70. N2. P. 134−135. 57. Sanger F., Thompson E. // Biochim. Biophys. Acta. 9. 1952. P.225.
- Rekharsky M.V., Egorov A.M., Galchenco G.L. Thermochemistry of hydrolytic enzymatic reactions. //Thermochim. Acta. 1987. 112. P. 151 160.
- Kahne D., Still W.C. Hydrolysis of a peptide bond in neutral water. //J. Amer. Chem. Soc. 1988. 110. N22. P. 7529−7534.
- King E.J. The thermodynamics of ionization of amino acids. IV. The First ionization constants of some glycine peptides. // J. Amer. Chem. Soc. 1957.79. P. 6151.
- Петров H. B, Борисова А. П., Савич И. А., Спицин В. И. Определение констант устойчивости комплексов никеля с некоторыми дипептидами. //Докл. А. Н. СССР. 1970. 192. С. 574.
- Davies C.W. The extent of dissociation of salts in water. Part VIII. Au equation for the mean ionic activity coefficient of an electrolyte inwater, and a revission of the dissociation constants of some sulphates. //J. Chem. Soc. 1938. P.2093 2098.
- Васильев В.П. Приближенный расчет термодинамических констант нестойкости комплексных соединений. //ТЭХ. 1966. 2. С. 353 357.
- Петров Н. В, Набоков B.C., Жданов Б. В., Савич И. А., Спицин В. И. Константы устойчивости комплексов Ni (II) и Со (И) с дипептидами алифатического ряда. //Журн. физ. химии. 1977. 50. С. 2208−2212.
- Yamauchi О., Hirano Y., Nalcao Y., Nakahara A. Stability of fused rings in metal chelates.// Can. J. Chem. 1969. 47. P.3441−3445.
- Sigel H., Prijs В., Martin R. Sigel H., Prijs В., Martin R. Stability of binary and ternary p-alanine containing dipeptide copper (II) complexes.// Inorg. Chim. Acta. 1981. 56. P. 45−49.
- Irving H., Pettit L. The stabilities of metal complexes of some substituted derivatives of glycine. // J. Chem. Soc., 1963, p. 1546.
- Martin R., Paris R. Etude deschelates simples et mixtes formes dans le systeme nictkel-glycine-alanin.// Bull. Soc. Chim. Fr., 1964, v.80, p.3170.
- Jokl V. //Chromatography, 1964, v.14, p.71.
- Sharma V., Mathur H., Kilkarni P. // Indian. J.Chem., 1965 v. 146, p.475.
- Leussing D., Hanna E. // J. Amer. Chem. Soc., 1966 v.88, p.693−696.
- Ramel M., Paris M. Etude polarimetrique des complexes metalliques des amino-acides.// Bull. Soc. Chim. Fr., 1967, p. 1359.
- Anderson K., Greenhalgh W., Butler E. // Inorg. Chem., 1967, v.6, p.1056.
- Martin R., Mosoni L. // Bull. Soc. Chim. Fr., 1970, p.2917.
- Gergely A., Kiraly В., Nagypal I., et al // Acta Chim. Acad. Sci. Hung., 1971, v.67, p.133
- Gergely A., Sovago I., Nagypal I., Kiraly R. // Inorg. Chim. Acta, 1972, v.6, p.435.
- Joshi J., Bhattacharya P. // Indian. J. Chem., 1975, v.13, p.88.
- Enea О., Berthon G. // Thermochim. Acta, 1979, v.33, p.311.
- Orenburg J., Fischer В., Sigel H. Binary and ternary complexes of metal ions, nuceoside 5-monophosphates and amino acids.// J. Inorg. Nucl. Chem., 1980, v.42, p.785.
- Cole A., Furnival C., Huang Z.-X., Jones D., et al // Inorg. Chim. Acta, 1985, v. l08,p.l65.
- Rao A., Venkataiah P., Mohan M., et al // J. Coord. Chem., 1989, v.20, p.69.
- Farkas E., Brown D., Cittaro R., Glass W. // J. Chem. Soc., Dalton Trans., 1993, p.2803.
- Sovago I., Kiss Т., Gergely A. // Pure & Appl. Chem., 1993, v.65, p.1029.
- Stack W., Skinner H. // Trans. Faraday Soc., 1967, v.63, p. l 136.
- Черников B.B. Термодинамика кислотно-основного взаимодействия в водных растворах иминодиянтарной, 1-аминоэтилиден-1,1-дифосфоновой, этаноламин-К, Ы-диметиленфосфоновой кислот. Дисс. канд. хим. наук. Иваново.: ИХТИ, 1988. 161С.
- Иконников Н.А., Васильев В. П. Определение действительного перепада температуры в термохимическом опыте при использовании калориметра с автоматической записью кривой температура-время. // ЖФХ. 1970. Т.44. N8. С. 1940 1942.
- Parker W.B. Thermal proporties of aqueous uni-univalent elektrolytes. Washington NSRDS-NBS. 1965. N2. P.342.
- Коростелев П.П. Приготовление растворов для химико-аналитических работ. М.: Наука. 1964. С. 235.
- Васильев В.П., Бородин В. А., Козловский Е. В. Применение ЭВМ в химико-аналитических расчетах. М.: Высшая школа. 1993. С. И2.
- Химмельблау Д. Прикладное нелинейное программирование. М.:Мир, 1975. С. 417 .
- Бугаевский А.А., ДунайБ.А. //Журн.Аналит.Химии. 1971. Т.26. N.2. С. 205.
- Васильев В.П., Шеханова Л. Д. Калориметрическое определение теплоты ионизации воды в присутствии различных электролитов. //ЖНХ. 1974. Т. 19. N11. С.2969−2972.
- Васильев В.П. Термодинамические свойства растворов электролитов. М.: Высшая школа. 1982. С. 320.
- Гаравин В.Ю. Термодинамика реакций кислотно-основного взаимодействия в водных растворах имидазола, бензимидазола, гистаминаД-гистидина и а-аланина: Дисс.канд. хим. наук. Иваново. 1985.172с.
- Васильев В.П., Кочергина Л. А., Гаравин В. Ю. Влияние температуры и солевого фона на термодинамические характеристики кислотно-основного взаимодействия в растворах изомеров аланина. //ЖОХ. 1992. Т. 62. N1. С. 213−218.
- Термические константы веществ. Справочник под ред. В. П. Глушко и др. М.: ВИНИТИ. 1965−1978.
- Васильев В.П., Васильева В. Н., Дмитриева Н. Г., Кокурин Н. И. Стандартная энтальпия образования иона Ni2+ в водном растворе при 298,15К. // Журн. неорг. химии, 1984, т. 29, вып.5, с. 1123.
- Васильев В .П., Дмитриева Н. Г., Васильева В. Н., Яшкова В. И. Стандартная энтальпия образования иона никеля (II) в водном растворе при 298,15К. // Журн. неорг. химии, 1986, т. 31, вып.12, с. 3044.
- Бородин В.А., Васильев В. П., Козловский Е. В. Математические задачи химической термодинамики. Новосибирск: «Наука», 1985, с. 219.
- Bjerrum N. // Z.physik.Chem.-1923. v. 106. -р.219. lOO. Gane R, Ingold C.K.//J. Chem. Soc.-1931.-p.2153. 101. Ingold C.K.//J. Chem. Soc. -1931. -p.2170.102.1ngold C.K., Mohrhenn H.G.//J. Chem. Soc.-1931.-p.2153. 83.
- Kirkwood J.G.//J.Chem.Phys.-1934. v.2. -p.351.
- W4.Kirkwood J.G., Westheimer F.H.// J.Chem.Phys.-l 938.V.6. -p.506,513.
- Beetlestone J.G., Irvine D.H.// Proc.Roy.Soc. -1964. -A 277.-p.401,414.
- Beetlestone J.G., Irvine D.H.//J.Chem.Soc.-1964.-p.5086
- Ю7.Крутов Д. В. Термодинамика протолитических равновесий в водных растворах янтарной, винной, лимонной и этилендитиодиуксусной кислот. Дисс. канд. хим. наук. Иваново: ИГХТУ, 1997.
- Rahman A., Stillinger F.H. Molecular dynamics study of liquid water. //J.Chem. Phys. 1971. 55. P.3336−3359.
- Waters W.A. Physical Aspects of Organic Chemistry. Routledge .London. 1-st Edn. -1935. Chap. 9.
- O.Watson H.B. Modern Theories of Organic Chemistry. Oxford Univ.Press.l-st Edn.-1937.Chap.2.
- I .Dippy J.F.// Chem. Revs. -1939. v.25. -p.151.
- Branch G.E., Calvin M. The Theoriy of Organic Chemistry. Prentice-Hall. New York.-1941.Chap.6.
- ПЗ.Васильев В. П., Кочергина Л. А., Гаравин В. Ю. //Журн.общ.химии. 1992. Т. 62. N1. С. 213.
- Кочергина Л.А. Термодинамические характеристики некоторых реакций кислотно-основного взаимодействия в водном растворе: Дисс.канд.хим.наук. Иваново. 1967.149с.
- Общая органическая химия. Карбоновые кислоты и их произ-водные.-М.:МИР.1983.
- Yamauchi О., Miyata Н., Nakahara А. // Bull. Chem. Soc. Japan. 1971. 44. p.2716.
- Горболетова Г. Г. Термодинамика протолитических равновесий в водных растворах D, L-a- аланил-0,Ь-а- аланина, глицил-уаминомаслянной кислоты, глицил- L-аспарагина и D, L-a- аланил- D, L-аспарагина. Дисс. канд. хим. наук. Иваново: ИГХТУ, 1999.
- Anderson К.Р., Newell Р.А., Izatt R.M. Formation constants, entalpy, and entropy values for the association of alanine with H and Cu at 10,25 and 40°. -Inorgan. Chem., 1966, vol.5, № 11, pp.62−65.
- E. Ellenbogen. // J. Amer. Chem. Soc., 1952 v.74, p.5198.
- Кутуров M. В. Термодинамика реакций комплексообразования иона никеля (II) с аминокислотами и комплексонами Дисс. канд. хим. наук. Иваново: ИГХТУ, 1983.
- Васильев В.П. Составляющие термодинамических характеристик реакций кислотно-основного взаимодействия. //ЖНХ. 1984. Т.29. N11. С.2785−2792.
- Васильев В.П., Кочергина JI.A., Грошева С. Г. Термодинамика реакций кислотно-основного взаимодействия в растворе 0, Ь-треонина. Изв.Вузов. Химия и хим. Технология. 1991.Т.34. N3. С.48−51.
- Кочергина Л.А., Зеленин О. Ю. Термодинамические характеристики реакций комплексообразования иона Ni2+ с 0, Ь-лейцином.// Журн. физ. химии. 2001. т.75. N 5. С. 794−799.