Перевозчик при нарушении сроков расчетов уплачивает владельцу инфраструктуры пени в размере, установленном соглашением сторон. Если размер пени договором не установлен, следует руководствоваться ст. 395 ГК.
Договором может быть предусмотрено, что перевозчик в случае отказа от получения услуг уплачивает владельцу инфраструктуры штраф. Это не освобождает его от возмещения убытков (ст. 15 ГК). Однако при этом возмещается только реальный ущерб, но не упущенная выгода. Следует отметить, что данные правила не ставят владельца транспортной инфраструктуры перед перевозчиком в более выгодное положение, поскольку перевозчик также при неисполнении или ненадлежащем исполнении своих обязательств по договору возмещает владельцу инфраструктуры реальный ущерб.
Владелец инфраструктуры при несоблюдении срока информирования перевозчика об изменении графика движения пассажирских поездов уплачивает перевозчику штраф. Стороны могут договориться о неприменении мер обеспечения исполнения взаимных обязательств (пеней, штрафа).
Ущерб, причиненный третьим лицам в связи с неисполнением или ненадлежащим исполнением обязательств владельцем инфраструктуры и (или) перевозчиком, возмещается сторонами в порядке и размерах, предусмотренных УЖТ, ГК и другими федеральными законами.
Ни одна из сторон не несет ответственности за полное или частичное неисполнение любых своих обязательств по договору, если докажет, что неисполнение или ненадлежащее исполнение обязательств явилось следствием обстоятельств непреодолимой силы, а именно: наводнения, пожара, землетрясения и прочих природных бедствий, а также войны или военных действий, которые начались после заключения договора. Если какое-нибудь из этих обстоятельств непосредственно повлияло на сроки исполнения обязательств, установленных договором, то срок исполнения таких обязательств увеличивается на время, в течение которого действовало обстоятельство. Сторона, у которой отсутствует возможность исполнения обязательств из-за непреодолимой силы, обязана известить другую сторону о наступлении, предполагаемой продолжительности и прекращении действия этих обстоятельств немедленно. Факты наступления и (или) прекращения действия обстоятельств непреодолимой силы, содержащиеся в извещении, должны быть подтверждены документально. Неуведомление или несвоевременное уведомление лишает сторону права ссылаться на данные обстоятельства для освобождения ее от ответственности за неисполнение или ненадлежащее исполнение своих обязательств.