Флавиновые ферменты — это сложные белки, простетической группой которых, как уже отмечалось, являются либо флавинмононуклеотид (ФМН), либо флавинадениндинуклеотид (ФАД).
ФМН и ФАД прочно, в отличие от коферментов НАД* и НАДФ+, присоединены к апоферменту, выступая, таким образом, в качестве простетических групп, а не свободно диссоциирующих коферментов. Обе группы представляют собой метаболически активную форму рибофлавина (витамин В2).
Активной частью ФАД (или ФМН) является сопряженная изоаллаксозиновая циклическая сгруктура витамина В2, к которой в процессе восстановления присоединяются атомы водорода:
ФАД-зависимые дегидрогеназы выполняют функцию, подобную НАД+-зависимым ферментам, а именно являются первичными акцепторами электронов, т. е. они непосредственно окисляют восстановленные субстраты, например сукцинат (ФАД-сукцинатдегидрогеназа) или ацил-КоА (ФАД-ацил-КоАдегидрогенеза).
ФМН-зависимая дегидрогеназа входит в состав комплекса НАДН: KoQ-оксидоредуктазы, окисляющей НАДН и восстанавливающей коэнзим О, г. е. она является промежуточным переносчиком электронов в дыхательной цепи.