Экспрессия тройного блока генов

Белки ТБГ экспрессируются с помощью двух субгеномных РНК (сгРНК). Белок, кодируемый первым геном тройного блока (ТБГ1) синтезируется на матрице своей сгРНК1, а ТБГ2 и ТБГ3 — с сгРНК2 (рис. 1). Количество синтезированных белков ТБГ1, ТБГ2 и ТБГ3 находится в соотношении приблизительно 100:10:1 соответственно (Verchot-Lubicz et al. 2010). Экспрессия ТБГ3 происходит за счет механизма пропускающего рибосомного сканирования матрицы (leaky ribosome scanning, LRS).

Рис. 1. Организация и экспрессия ТБГ (Verchot-Lubicz.2010). Обозначения: gRNA — геномная РНК; sgRNA — субгеномная РНК

Род Allexivirus

Род Allexivrus принадлежит семейству Flexiviridae, которое также включает роды Capillovirus, Carlavirus, Citrivirus, Foveavirus, Potexvirus, Trichovirus, Vitivirus, и Mandarivirus. Впервые Allexivirus были зарегестрированы как новая таксономическая группа в 1992, после того, как полностью был описан геном Х вируса шалота (Shallot virus X, ShVX) (Desk Encyclopedia of PLANT AND FUNGAL VIROLOGY, 2010). Заболевания, связанные с вирусами рода Allexivirus как правило, проходят мягко и бессимптомно. Очень часто вирусы этого рода присутствуют в растениях в составе комплексов с другими неродственными вирусами, обладающими таким же кругом хозяев. Так как Allexivirus не вызывают серьезных заболеваний, ими почти не занимается фитовирусология, однако, эти вирусы интересны с точки зрения таксономии, структуры генома, и отношения между родами, видами и подвидами различных вирусов (Brian W.J. Mahy, Marc H.V. van Regenmortel, Desk Encyclopedia of PLANT AND FUNGAL VIROLOGY, 2010).

Вирионы Allexivirus представляют собой достаточно гибкие нитевидные частицы длиной около 800 нм и диаметром около 12 нм. Геном представлен одноцепочечной РНК положительной полярности размером около 9 кб, имеющей 3' поли-А хвост. Структура генома будет рассмотрена на примере типичного представителя этого рода — ShVX.