Помощь в написании студенческих работ
Антистрессовый сервис

Выводы. 
Экспрессия белка ТБГ3 Х-вируса шалота

РефератПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Учитывая, что альтернативные инициаторные кодоны всегда менее эффективны, чем AUG, замена AUG на CUG в алексивирусах, возможно служит для уменьшения уровня экспрессии ТБГ3. Известно, что ТБГ3 во всех ТБГ-кодирующих вирусах экспрессируется на очень низком уровне (Morozov and Solovyev, 2003), и дальнейшее уменьшение уровня его экспрессии может быть полезным адаптивным признаком, например… Читать ещё >

Выводы. Экспрессия белка ТБГ3 Х-вируса шалота (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Полученные в нашей лаборатории данные доказывают, что гомологичная ТБГ3 последовательность ShVX является экспрессируемым геном, чья экспрессия осуществляется с помощью неканонического стартового кодона CUG. Возможно, эта экспрессия происходит по механизму LRS, однако, это предположение нуждается в дальнейших экспериментальных подтверждениях.

Учитывая, что альтернативные инициаторные кодоны всегда менее эффективны, чем AUG, замена AUG на CUG в алексивирусах, возможно служит для уменьшения уровня экспрессии ТБГ3. Известно, что ТБГ3 во всех ТБГ-кодирующих вирусах экспрессируется на очень низком уровне (Morozov and Solovyev, 2003), и дальнейшее уменьшение уровня его экспрессии может быть полезным адаптивным признаком, например, позволяющим вирусу адаптироваться к определенным видам растений-хозяев.

Список литературы

  • 1. Acheson N. H. — Fundamentals of Molecular Virology (2nd ed.) — 2011
  • 2. Andrew E. Firth and Ian Brierley (2012) Non-canonical translation in RNA viruses, Journal of General Virology, 93, 1385−1409
  • 3. Bayne, E. H., Rakitina, D. V., Morozov, S. Y., and Baulcombe, D. C. 2005. Cell-to-cell movement of potato potexvirus X is dependent on suppression of RNA silencing. Plant J. 44:471−482.
  • 4. Brian W.J. Mahy, Marc H.V. van Regenmortel, Desk Encyclopedia of PLANT AND FUNGAL VIROLOGY, 2010
  • 5. Cann A. J., Principles of Molecular Virology, 4th edition, 2005
  • 6. Chiu MH, Chen IH, Baulcombe DC, Tsai CH.(2010) The silencing suppressor P25 of Potato virus X interacts with Argonaute1 and mediates its degradation through the proteasome pathway. Mol Plant Pathol.;11(5):641−9.
  • 7. Chu PW, Westaway E. Replication strategy of kunjin virus: evidence for recycling role of replicative form RNA as template in semiconservative and asymmetric replication. Virology 1985, 140:68−79
  • 8. Cumakov IM, Lipskaya GY, Agol VI. Comparative studies on the genomes of some picornaviruses: denaturation mapping of replicative form RNA and electron microscopy of heteroduplex RNA. Virology 1979, 92:259−270.
  • 9. den Boon JA, Diaz A, Ahlquist P. Cytoplasmic viral replication complexes. Cell Host Microbe 2010, 8:77−85.
  • 10. Goodfellow I, Chaudhry Y, Gioldasi I, Gerondopoulos A, Natoni A, Labrie L, Laliberte JF, Roberts L. Calicivirus translation initiation requires an interaction between VPg and eIF4E. EMBO Rep2005, 6:968−972
  • 11. H. T., Chou, Y. L., Tseng, Y. H. Lin, Y. H., Lin, T. M., Lin, N. S., Hsu, Y. H., and Chang, B. Y. 2008. Topological properties of the triple gene block protein 2 of Bamboo mosaic virus. Virology 379:1−9
  • 12. H. Lodish; A. Berk; P. Matsudaira; C.A.Kaiser; M. Krieger; M.P.Scott; S.L.Zipursky; J.E.Darnell Molecular Cell Biology (5th Edition) W.H. Freeman & Company; 2003
  • 13. Haupt, S., Cowan, G. H., Ziegler, A., Roberts, A. G., Oparka, K. J., and Torrance, L. 2005. Two plant-viral movement proteins traffic in the endocytic recycling pathway. Plant Cell 17:164−181.
  • 14. Haylor MT, Brunt AA, Coutts RH. Conservation of the 3' terminal nucleotide sequence in five caflaviruscs.1990 Nucleic Acids Research 18, 6127.
  • 15. Howard, A. R., Heppler, M. L., Ju, H.-J., Krishnamurthy, K., Payton, M. E. & Verchot-Lubicz, J. (2004). Potato virus X TGBp1 induces plasmodesmata gating and moves between cells in several host species whereas CP moves only in N. benthamiana leaves. Virology 328, 185−197.
  • 16. Jackson, R. J., Hellen, C. U. & Pestova, T. V. (2010). The mechanism of eukaryotic translation initiation and principles of its regulation. Nat Rev Mol Cell Biol 11, 113−127.
  • 17. Jackson, R. J., Hellen, C. U. & Pestova, T. V. (2012). Termination and post-termination events in eukaryotic translation. Adv Protein Chem Struct Biol 86, 45−93.
  • 18. James E. Schoelza, Phillip A. Harriesb and Richard S. Nelsonc, Intracellular Transport of Plant Viruses: Finding the Door out of the Cell, Molecular Plant V4, № 5, 2011, pages 813−831
  • 19. K.V. Kanyuka, V.K. Vishnichenko, K.E. Levay, D.Yu. Kondrikov, E.V. Ryabov, S.K. Zavriev, Nucleotide sequence of shallot virus X RNA reveals a 5' proximal cistron closely related to those of potexviruses and a unique arrangement of the 3t-proximal cistronsJ. Gen. Virol. 73, 2553−2560 (1992)
  • 20. Kalinina, N. O., Rakitina, D. V., Solovyev, A. G., Schiemann, J. & Morozov, S. Yu. (2002). RNA helicase activity of the plant virus movement proteins encoded by the first gene of the triple gene block. Virology 296, 321−329.
  • 21. Kozak, M. (1986). Point mutations define a sequence flanking the AUG initiator codon that modulates translation by eukaryotic ribosomes. Cell 44, 283−292.
  • 22. Kozak, M. (2002). Pushing the limits of the scanning mechanism for initiation of translation. Gene 299, 1−34.
  • 23. Liou, D. Y., Hsu, Y. H., Wung, C. H., Lin, N. S. & Chang, B. Y. (2000).Functional analyses and identification of two arginine residues essential to the ATP-utilizing activity of the triple gene block protein 1 of bamboo mosaic potexvirus. Virology 277, 336−344.
  • 24. Lough, T. J., Netzler, N. E., Emerson, S. J., Sutherland, P., Carr, F., Beck, D. L., Lucas, W. J. & Forster, R. L. S. (2000). Cell-to-cell movement of potexviruses: evidence for a ribonucleoprotein complex involving the coat protein and first triple gene block protein. Mol Plant Microbe Interact 13, 962−974.
  • 25. Makarov, V., Rybakova, E., Efimov, A., Dobrov, E., Serebryakova, M., Solovyev, A., Yaminsky, I., Taliansky, M., Morozov, S., and Kalinina, N. 2009. Domain organization of the N-terminal portion of hordeivirus movement protein TGBp1. J. Gen. Virol. 90:3022−3032.
  • 26. McDonald SM, RNA synthetic mechanisms employed by diverse families of RNA viruses. Wiley Interdiscip Rev RNA, 2013
  • 27. Morozov, S. Y., and Solovyev, A. G. 2003. Triple gene block: Modular design of a multifunctional machine for plant virus movement. J. Gen. Virol. 84:1351−1366.
  • 28. S. Sumi, T. Matsumi, T. Tsuneyoshi, Complete nucleotide sequences of garlic viruses A and C, members of the newly ratified genus Allexivirus. Arch. Virol. 144, 1819−1826 (1999)
  • 29. S. Sumi, T. Tsuneyoshi, H. Furutani Novel rod-shaped viruses isolated from garlic, Allium sativum, possessing a unique genome organization., J. Gen. Virol. 74, 1879−1885 (1993)
  • 30. Schepetilnikov, M. V., Solovyev, A. G., Gorshkova, E. N., Schiemann, J., Prokhnevsky, A. I., Dolja, V. V., and Morozov, S. Y. 2008. Intracellular targeting of a hordeiviral membrane-spanning movement protein: Sequence requirements and involvement of an unconventional mechanism. J. Virol. 82:1284−1293.
  • 31. Shemyakina, E.A., Erokhina, T.N., Gorshkova, E.N., Schiemann, J., Solovyev, A.G. and Morozov, S.Yu. (2011). Formation of protein complexes containing plant virus movement protein TGBp3 is necessary for its intracellular trafficking. Biochimie 93, 742−748.
  • 32. Shu-Chuan Lee, Chih-Hang Wu and Chao-Wen Wang. (2010) Traffic of a Viral Movement Protein Complex to the Highly Curved Tubules of the Cortical Endoplasmic Reticulum. Traffic 11: 912−930
  • 33. Tamai, A., and Meshi, T. 2001. Cell-to-cell movement of Potato virus X: The role of p12 and p8 encoded by the second and third open reading frames of the triple gene block. Mol. Plant-Microbe Interact. 14:1158−1167.
  • 34. Touriol, C., Bornes, S., Bonnal, S., Audigier, S., Prats, H., Prats, A. C. & Vagner, S. (2003). Generation of protein isoform diversity by alternative initiation of translation at non-AUG codons. Biol Cell 95, 169−178.
  • 35. Tseng YH, Hsu HT, Chou YL, Hu CC, Lin NS, Hsu YH, Chang BY. The two conserved cysteine residues of the triple gene block protein 2 are critical for both cell-to-cell and systemic movement of Bamboo mosaic virus. Mol Plant Microbe Interact. 2009 Nov;22(11):1379−88.
  • 36. Turina, M., Desvoyes, B. & Scholthof, K. B. (2000). A gene cluster encoded by panicum mosaic virus is associated with virus movement. Virology 266, 120−128.
  • 37. Verchot-Lubicz J, Torrance L, Solovyev AG, Morozov SY, Jackson AO, Gilmer D (2010) Varied movement strategies employed by triple gene block-encoding viruses. Mol Plant-Microbe Interact 23: 1231−1247
  • 38. Verchot-Lubicz, J., Ye, C.-M., and Bamunusinghe, D. 2007. Molecular biology of potexviruses: Recent advances. J. Gen. Virol. 88:1643−1655.
  • 39. Wells, S. E., Hillner, P. E., Vale, R. D. & Sachs, A. B. (1998). Circularization of mRNA by eukaryotic translation initiation factors. Mol Cell 2, 135−140.
  • 40. Westaway EG. Flavivirus replication strategy. Adv Virus Res 1987, 33:45−90.
  • 41. Witwer C, Rauscher S, Hofacker IL, Stadler PF. Conserved RNA secondary structures in picornaviridae genomes. Nucleic Acids Res 2001, 29:5079−5089
  • 42. Zamyatnin Jr., A.A., Solovyev, A.G., Bozhkov, P.V., Valkonen, J.P., Morozov, S. Yu, Savenkov, E.I., 2006. Assessment of the integral membrane protein topology in living cells. Plant J. 46, 145−154.
  • 43. Zavriev SK, Kanyuka KV, Levay KE. The genome organization of potato virus M RNA.1991 Journal of General Virology 72, 9−14.
Показать весь текст
Заполнить форму текущей работой