Компьютерная оценка плейотропного действия фармакологических веществ
Диссертация
Американского химического общества (Новый Орлеан, США, 2003) — Международный симпозиум «Вычислительные методы в токсикологии и фармакологии, интеграция Интернет-ресурсов» (Салоники, Греция, 2003; Шанхай, Китай, 2005; Москва, 2007; Стамбул, Греция, 2009) — Международный симпозиум по достижениям в области синтетической, комбинаторной и медицинской химии (Москва, 2004) — Международная конференция… Читать ещё >
Список литературы
- CAS Chemical Abstract Service: сайт. URL: http://www.cas.org/
- Overington J.P., Al-Lazikani В., Hopkins A. L. How many drug targets are there? //Nature Reviews Drug Discovery. 2006. Vol. 5, № 12. P. 993−996.
- Wishart D.S., Knox C., Guo A.C., Cheng D., Shrivastava S., Tzur D., Gautam В., Hassanali M. DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug targets. // Nucleic Acids Res. 2008. Vol. 36. Database issue. D901-D906.
- Black C.B., Duensing T.D., Trinkle L.S., Dunlay R.T. Cell-based screening using high-throughput flow cytometry. // Assay Drug Dev. Technol. 2011. Vol. 9, № 1. P. 13−20.
- Raucy J.L., Lasker J.M. Current in vitro high throughput screening approaches to assess nuclear receptor activation. // Curr. Drug Metab. 2010. Vol. 11, № 9. P. 806−814.
- Bleicher K.H., Bohm H.J., Mtiller K., Alanine A.I. Hit and lead generation: beyond high-throughput screening. // Nature Reviews Drug Discovery. 2003. Vol. 2, № 5. P. 369−378.
- Lunn C.A. Label-free screening assays: a strategy for finding better drug candidates. // Future Med. Chem. 2010. Vol. 2, № 11. P. 1703−1716.
- Huser J., Mannhold R., Kubinyi H., Folkers G. (Eds.). High-Throughput Screening in Drug Discovery. // WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim. 2006. PP. 365.
- Зефиров H.C. Современные принципы конструирования лекарств. // Вестник Российской Академии Наук. 2004. Т. 74, № 5. С. 415−418.
- Morphy R., Kay C., Rankovic Z. From magic bullets to designed multiple ligands. // Drug Discovery Today. 2004. Vol. 9, № 15. P. 641−651.
- Hopkins A.L. Network pharmacology AAV vectors and tumorigenicity. // Nature. 2007. Vol. 25, № 10. P. 1110−1111.
- Zimmermann G.R., Lehar J., Keith C.T. Multi-target therapeutics: when the whole is greater than the sum of the parts. // Drug Discov. Today. 2007. Vol. 12, № 1−2. P. 34−42.
- Ehrlich P. The Theory and Practice of Chemotherapy. // Folia Serologica. 1911. Vol. 7. P. 697−714.
- Morphy R., Rankovic Z. Multi-target Drugs: Strategies and Challenges for Medicinal Chemists / In The Practice of Medicinal Chemistry. Wermuth C. Ed. Hardbound Elsevier. 2008. P. 549−571.
- Hartman J.L. 4th, Garvik В., Hartwell L. Principles for the buffering of genetic variation. // Science. 2001. Vol. 291, № 5506. P. 1001−1004.
- Hanahan D., Weinberg R.A. The hallmarks of cancer. // Cell. 2000. Vol. 100. P. 57−70.
- Wermuth C.G. Multitargeted drugs: the end of the 'one-target-one-disease' philosophy? // Drug Disc. Today. 2004. Vol. 9, № 19. P. 826−827.
- Kramer M.S., Last В., Getson A., Reines S.A. The effects of selective D4 dopamine receptor antagonist (L-745, 870) in acutely psychotic inpatients with schizophrenia. // Arch. Gen. Psychiatry. 1997. Vol. 54. P. 567−572.
- Renan M.J. How many mutations are required for tumorigenesis? Implications from human cancer data. // Mol. Carcinog. 1993. Vol. 7. P. 139−146.
- Kinzler K.W., Vogelstein B. Lessons from hereditary colorectal cancer. // Cell. 1996. Vol. 87. P. 159−170.
- Vogelstein B., Kinzler K.W. Cancer genes and the pathways they control. // Nat. Med. 2004. Vol. 10. P. 789−799.
- Larder B.A., Kemp S.D., Harrigan P.R. Potential mechanism for sustained antiretroviral efficacy of AZT-3TC combination therapy. // Science. 1995. Vol. 269. P. 696 699.
- Law M.R., Wald J., Morris J.K., Jordan R.E. Value of low dose combination treatment with blood pressure lowering drugs: analysis of 354 randomised trials. // Br. Med. J. 2003. Vol. 326. P. 1427 1431.
- Glass G. Cardiovascular combinations. // Nat. Rev. Drug. Discov. 2004. Vol. 3.P. 731 -732.
- Herrick T.M., Million R.P. From the analyst’s couch: tapping the potential of fixed-dose combinations. //Nat. Rev. Drug. Discov. 2007. Vol. 6. P. 513 -514.
- Rollinger J.M., Langer T., Stuppner H. Strategies for efficient lead structure discovery from natural products. // Curr. Med. Chem. 2006. Vol. 13. P. 1491−1507.
- Yao L., Rzhetsky A. Quantitative systems-level determinants of human genes targeted by successful drugs. // Genome Res. 2008. Vol. 18, № 2. P. 206−213.
- Korcsmaros T., Szalay M. S, Bode C., Kovacs I.A., Csermely P. How to design multi-target drugs: Target search options in cellular networks. // Expert Opinion on Drug Discovery. 2007. Vol. 2. P. 1−10.
- Butcher E.C. Can cell systems biology rescue drug discovery? // Nat. Rev. Drug Discov. 2005. Vol. 4. P. 461−467.
- Fishman M.C., Porter J.A. Pharmaceuticals: a new grammar for drug discovery. //Nature. 2005. Vol. 437. P. 491193.
- Barabasi A-L., Oltvai Z.N. Network biology: understanding the cell’s functional organization. //Nat. Rev. Genet. 2004. Vol. 5. P. 101−113.
- Chaudhuri A., Chant J. Protein-interaction mapping in search of effective drug targets. // Bioessays. 2005. Vol. 27. P. 958−969.
- Kim P.M., Lu L.J., Xia Y., Gerstein M.B. Relating three-dimensional structures to protein networks provides evolutionary insights. // Science. 2006. Vol. 314. P. 1938−1941.
- Hopkins A.L. Network pharmacology: the next paradigm in drug discovery. // Nat. Chem. Biol. 2008. Vol. 4, № 11. P. 682−690.
- Carmen A. In Silico Technologies in drug target identification and validation. //Taylor and Francis Group. 2006. PP. 481.
- Loewe S. Die quantitativen probleme der pharmakologie. // Ergebn. Physiol. 1928. Vol. 27. P. 47−187.
- Chou T.C., Talalay P. Generalized equations for the analysis of inhibitions of Michaelis-Menten and higher-order kinetic systems with two or more mutually exclusive and nonexclusive inhibitors. // Eur. J. Biochem. 1981. Vol. 115. P. 207−216.
- Merz K.M., Ringe D., Reynolds C.H. (Eds.) Drug Design: Structure- and Ligand-Based Approaches. // Cambridge University Press. NY USA. 2010. PP. 276.
- Sotriffer C., Mannhold R., Kubinyi H., Folkers G. (Eds.) Virtual Screening: Principles, Challenges, and Practical Guidelines (Methods and Principles in Medicinal Chemistry). // WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Wienheim, Germany. 2011. PP. 520.
- Proudfoot J.R. High-Throughput Screening and Drug Discovery. / In: The Practice of Medicinal Chemistry. Wermuth C. Ed. Hardbound Elsevier. 2008. P. 144−158.
- Morphy R., Rankovic Z. Fragments, network biology and designing multiple ligands. // Drug Discov Today. 2007. Vol. 12, № 3−4. P. 156−160.
- Morphy R., Rankovic Z. Designed multiple ligands. an emerging drug discovery paradigm. // J. Med. Chem. 2005. Vol. 48. P. 6523−6543.
- Lipinski C.A., Lombardo F., Dominy B.W., Feeney P.J. Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings. // Adv. Drug Deliv. Rev. 2001. Vol. 23. P. 3−25.
- Vieth M., Siegel M.G., Higgs R.E., Watson I.A., Robertson D.H., Savin K.A., Durst G.L., Hipskind P.A. Characteristic physical properties and structural fragments of marketed oral drugs. // J. Med. Chem. 2004. Vol. 47. P. 224−232.
- Morphy R. The influence of target family and functional activity on the physicochemical properties of pre-clinical compounds. // J. Med. Chem. 2006. Vol. 49. P. 2969−2978.
- Robl J.A., Sun C.-Q., Stevenson J., Ryono D.E., Simpkins L.M., Cimarusti M.P., Dejneka T., Slusarchuk W.A., Chao S., Stratton L., Misra R.N.,
- Hann M.M., Leach A.R., Harper G. Molecular complexity and its impact on the probability of finding leads for drug discovery. // J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2001. Vol. 41. P. 856−864.
- Hopkins A.L., Mason J.S., Overington J.P. Can we rationally design promiscuous drugs? // Curr. Opin. Struct. Biol. 2006. Vol. 16. P. 127−136.
- Gruber C.W., Muttenthaler M., Freissmuth M. Ligand-based peptide design and combinatorial peptide libraries to target G protein-coupled receptors. // Curr. Pharm. Des. 2010. Vol. 16, № 28. P. 3071−3088.
- Cooper T.W., Campbell I.B., Macdonald S.J. Factors determining the selection of organic reactions by medicinal chemists and the use of these reactions in arrays (small focused libraries). // Angew Chem. Int. Ed. Engl. 2010. Vol. 49, № 44. P. 8082−8091.
- Kola I., Landis J. Can the pharmaceutical industry reduce attrition rates? // Nat. Rev. Drug Discov. 2004. Vol. 3, № 8. P. 711−715.
- Mitchell J.A., Warner T.D. Discontinuation of Vioxx. // Lancet. 2005. Vol. 365(9453). P. 27−28.
- Whitebread S., Hamon J., Bojanic D., Urban L. Keynote review: in vitro safety pharmacology profiling: an essential tool for successful drug development. // Drug Discov. Today. 2005. Vol. 10, № 21. P. 1421−1433.
- Su B.H., Shen M.Y., Esposito E.X., Hopfinger A.J., Tseng Y.J. In silico binary classification QSAR models based on 4D-fingerprints and MOEdescriptors for prediction of hERG blockage. // J. Chem. Inf. Model. 2010. Vol. 50, № 7. P. 1304−1318.
- Greene N., Fisk L., Naven R.T., Note R.R., Patel M.L., Pelletier D.J. Developing structure-activity relationships for the prediction of hepatotoxicity. // Chem. Res. Toxicol. 2010. Vol. 23, № 7. P. 1215−1222.
- Ellison C.M., Enoch S.J., Cronin M.T. A review of the use of in silico methods to predict the chemistry of molecular initiating events related to drug toxicity. // Expert Opin. Drug Metab. Toxicol. 2011. Vol. 7, № 12. P. 1481−1495.
- Kortagere S., Krasowski M.D., Ekins S. The importance of discerning shape in molecular pharmacology. // Trends Pharmacol. Sci. 2009. Vol. 30. P. 138−147.
- Potemkin V., Grishina M. Principles for 3D/4D QSAR classification of drugs. // Drug Discov. Today. 2008. Vol. 13. P. 952−959.
- Peristera O., Spreafico M., Smiesko M., Ernst B., Vedani A. Mixed-model QSAR at the human mineralocorticoid receptor: predicting binding mode and affinity of anabolic steroids. // Toxicol. Lett. 2009. Vol. 189, № 3. P. 219−224.
- Muster W., Breidenbach A., Fischer H., Kirchner S., Muller L., Pahler A. Computational toxicology in drug development. // Drug Discov. Today. 2008. Vol. 13, № 7−8. P. 303−310.
- Ji Z.L., Wang Y., Yu L., Han L.Y., Zheng C.J., Chen Y.Z. In silico search of putative adverse drug reaction related proteins as a potential tool for facilitating drug adverse effect prediction. // Toxicology Letters. 2006. Vol. 164. P. 104−112.
- Chen Y.Z., Zhi D.G. Ligand-protein inverse docking and its potential use in the computer search of protein targets of a small molecule. Proteins. 2001. Vol. 43. P. 217−226.
- Ji Z.L., Han L.Y. Han L.Y., Yap C.W., Sun L.Z., Chen X., Chen Y.Z. Drug Adverse Reaction Target Database (DART): proteins related to adverse drug reactions. // Drug Safety. 2003. Vol. 26. P. 685−690.
- Филимонов Д.А., Поройков В. В. Прогноз спектров биологической активности органических соединений. // Российский химический журнал. 2006. Т. 50, № 2. Р. 66−75.
- Poroikov V., Filimonov D., Lagunin A., Gloriozova Т., Zakharov A. PASS: Identification of probable targets and mechanisms of toxicity. // SAR & QSAR in Environmental Research. 2007. Vol. 18, № 1−2. P. 101 110.
- Гуськова Т. А. Токсикология лекарственных средств. // М.: Издательский дом «Русский врач». 2008. 196 С.
- Marti С., Cole R., Kalogeropoulos A., Georgiopoulou V., Butler J. Medical therapy for acute decompensated heart failure: what recent clinical trials have taught us about diuretics and vasodilators. // Curr. Heart Fail. Rep. 2012. Vol. 9, № 1. P. 1−7.
- Hensley M.L. Update on gemcitabine and docetaxel combination therapy for primary and metastatic sarcomas. // Curr. Opin. Oncol. 2010. Vol. 22, № 4. P. 356−361.
- Pirrone V., Thakkar N., Jacobson J.M., Wigdahl В., Krebs F.C. Combinatorial approaches to the prevention and treatment of HIV-1 infection. // Antimicrob. Agents Chemother. 2011. Vol. 55, № 5. P. 18 311 842.
- Крылов Ю.Ф. Взаимодействие лекарств: Справочник. // PJIC-ПАТЕНТ, Москва. 2008. С. 319.
- Деримедведь JI.B., Перцев И. М., Шуванова Е. В., Зупанец И. А., Хоменко В. Н. Взаимодействие лекарств и эффективность фармакотерапии: Справочное пособие для врачей и фармацевтов // Мегаполис, Харьков. 2002. 784 С.
- Rodrigues D. Drug-Drug Interactions. // Stanford University, Stanford, California, USA. 2008. 738 P.
- Hansten P.D., Horn J.R. The Top 100 Drug Interactions: A Guide to Patient Management. // H & H Publications, Edmonds, WA. 2011. 187 P.
- Погребняк А. В., Оганесян Э. Т., Коновалов Д. А., Глушко А. А. Теоретический метод прогнозирования биологической активности суммарных растительных препаратов на основе алгоритма MATRIX". // Хим.-фарм. журн. 2004. Т.38, № 9. С. 19−22.
- Jonker D.M., Visser S.A., van der Graaf P.H., Voskuyl RA., Danhof M. Towards a mechanism-based analysis of pharmacodynamic drug-drug interactions in vivo. // Pharmacol. Ther. 2005. Vol. 106, № 1. P. 1−18.
- Tachibana Т., Kato M., Takano J., Sugiyama Y. Predicting drug-drug interactions involving the inhibition of intestinal CYP3A4 and P-glycoprotein. // Curr. Drug Metab. 2010. Vol. 11, № 9. P. 762−777.
- Преферанский Н.Г. Представление знаний с использованием правил в экспертной системе «Взаимодействие лекарственных средств» // Фармация. 1992. № 3. С. 8−12.
- Metabolism & Transport Drug Interaction Database: сайт. URL: http://www.druginteractioninfo.org
- Rostami-Hodjegan A., Tucker G.T. In silico simulations to assess the in vivo consequences of in vitro metabolic drug-drug interactions. // Drug Discovery Today: Technologies. 2004. Vol. 1. P. 441−448.
- Galetin A., Burt H., Gibbons L., Houston J.B. Prediction of time-dependent CYP3A4 drug-drug interactions: impact of enzyme degradation, parallel elimination pathways, and intestinal inhibition. // Drug Metab Dispos. 2006. Vol. 34, № 1. P. 166−175.
- Mizuno N., Niwa T., Yotsumoto Y., Sugiyama Y. Impact of drug transporter studies on drug discovery and development. // Pharmacol Rev. 2003. Vol. 55, № 3. P. 425−461.
- Manzi S.F., Shannon M. Drug Interactions A Review. // Clin. Ped. Emerg. Med. 2005. Vol. 6, № 2. P. 93−102.
- Goodman L.S., Gilman A.G., Brunton L. L, Lazo J.S., Parker K.L. Goodman and Gilman’s The Pharmacological Basis of Therapeutics. // Eleventh edition. McGraw-Hill. 2006. PP. 2021.
- Hansten P.D., Horn J.R. The Top 100 Drug Interactions: A Guide to Patient Management. // H & H Publications, Edmonds, WA. 2010. 195 P.
- Lurcott G. The Effects of the Genetic Absence and Inhibition of CYP2D6 on the Metabolism of Codeine and Its Derivatives, Hydrocodone and Oxycodone. // Anesth. Prog. 1999. Vol. 45. P. 154−156.
- Thakur V., Cooka M.E., Wallina J.D. Antihypertensive effect of the combination of fosinopril and HCTZ is resistant to interference by nonsteroidal antiinflammatory drugs. // Am. J. Hypertens. 1999. V. 12, № 9. P. 925−928.
- Gandhi P.J., Menezes P.A., Vu H.T., Rivera A.L., Ramaswamy K. Fluconazole- and levofloxacin-induced torsades de pointes in an intensivecare unit patient. // Am. J. Health Syst. Pharm. 2003. Vol. 60, № 23. P. 2479−2483.
- ChemSpider: сайт. URL: http://www.chemspider.com/
- Reid D., Sadjad B.S., Zsoldos Z., Simon A. LASSO-ligand activity by surface similarity order: a new tool for ligand based virtual screening. // J. Comput. Aided Mol. Des. 2008. Vol. 22, № 6−7. P. 479−487.
- Dunkel M., Gtinther S., Ahmed J., Wittig В., Preissner R. SuperPred: drug classification and target prediction. // Nucleic Acids Res. 2008. Vol. 36. (Web Server issue) P. W55-W59.
- Погребняк A.B. Молекулярное моделирование и дизайн биологически активных веществ: Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора химических наук / А. В. Погребняк. Ростов-на-Дону, 2004.46 С.
- Карпов П.В. Виртуальный скрининг библиотек химических структур на основе одноклассовой классификации: Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата химических наук / Карпов П. В. Москва. 2011.22 С.
- Васильев П.М. Информационная технология прогноза фармакологической активности химических соединений: Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук / П. М. Васильев. Волгоград. — 2009. — 48 С.
- Filimonov D. and Poroikov V. Probabilistic approach in activity prediction. / In: Chemoinformatics Approaches to Virtual Screening. Alexandre Varnek and Alexander Tropsha (Eds.) // Cambridge. UK. RSC Publishing. P. 182−216.
- Wermuth C.G. The Practice of Medicinal Chemistry. // Academic Press, London, 2008. P.67−72.
- Imming P., Sinning C., Meyer A. Drugs, their targets and the nature and number of drug targets. Nat. Rev. Drug Discov. 2006. Vol. 5. P. 821−834.
- Burger A. Classification of drugs. // In Hansch C., Sammes P.G., and Taylor J.B. (eds) Comprehensive Medicinal Chemistry. Pergamon Press, Oxford, 1990. V.I. P. 249−260.
- Reuben B.G., Wittkoff H.A. Pharmaceutical Chemicals in Perspective. // Wiley, New York, 1989.
- Харкевич Д.А. Фармакология. // M. Геотар Медицина, 2006. — С. 38.
- Taylor J.B., Kenewell H.A. Modern Medicinal Chemistry. // Ellis Horwood, London, 1993. 290 PP.
- МКБ-10. Международная статистическая классификация болезней и проблем, связанных со здоровьем. Десятый пересмотр. // ВОЗ, Женева, 1995. Т. 1,2.
- Pradal Н. Les Grands Medicaments. // Editions du Seuil, Paris, 1975.
- Metge C., Black C., Kozyrskyj A. The Population’s Use of Pharmaceuticals. //Med. Care, 1999. V.37. № 6. Suppl. JS42-JS59.
- WHO Collaborating Centre for Drug Statistics Methodology: «Guidelines for АТС classification and DDD assignment». Oslo, 2010. 282 PP.
- PJB Publication: сайт. URL: http://www.pharmaprojects.com/
- Машковский М.Д. Лекарственные средства. Издание четырнадцатое. // М. «Новая Волна». 2010. 1262 С.
- ТЕЗАУРУС информационно-поисковый по биологической активности химических соединений. // М. ЦБНТИмедпром. 1982. 216 С.
- Sigma-RBI eHandbook: сайт. URL: http://www.sigmaaldrich.com/life-science/cell-biology/learning-center/ehandbook.html
- MeSH: сайт. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh
- Horn F., Weare J., Beukers M., Horsch S., Bairoch A., Chen W., Edvardsen 0., Campagne F., Vriend G. GPCRDB: an information system for G protein-coupled receptors. // Nucleic Acids Res., 1998. V.26. № 1. P.275−279.
- NC-IUPHAR: сайт. URL: http://www.iuphar.org/nciuphar.html
- Enzyme Nomenclature. Recommendations of the International Union of Pure and Applied Chemistry and the International Union of Biochemistry. // Elsevier Publishing Company. 1972.
- ENZYME database (BRENDA): сайт. URL: http://www.brenda-enzymes.org/
- Schriml L.M., Arze C., Nadendla S., Chang Y.W., Mazaitis M., Felix V., Feng G., Kibbe W.A. Disease Ontology: a backbone for disease semantic integration. //Nucleic Acids Res. 2012. Vol. 40. Database issue. D940−946.
- Simonaitis L., Schadow G. Querying the National Drug File Reference Terminology (NDFRT) to assign drugs to decision support categories. // Stud Health Technol. Inform. 2010. Vol. 160.2. P. 1095−1099.
- Gene Ontology: сайт. URL: http://www.geneontology.org
- Rosenbloom S.T., Brown S.H., Froehling D., Bauer B.A., Wahner-Roedler D.L., Gregg W.M., Elkin P.L. Using SNOMED CT to represent two interface terminologies. // J. Am. Med. Inform. Assoc. 2009. Vol. 16, № 1. P. 81−88.
- BioPortal: сайт. URL: http://bioportal.bioontology.org/
- DNP Dictionary of Natural Products: сайт. URL: http://dnp.chemnetbase.com
- Filimonov D., Poroikov V., Borodina Yu., Gloriozova T. Chemical Similarity Assessment Through Multilevel Neighborhoods of Atoms: Definition and Comparison with the Other Descriptors. // J.Chem.Inf.Comput. Sci. 1999. V. 39, № 4. P. 666−670.
- Borodina Yu., Filimonov D., Poroikov V. Computer-aided estimation of synthetic compounds similarity with endogenous bioregulators. // Quant. Struct.-Activ. Relationships. 1998. V.17. № 5. P.459−464.
- Accelrys MDL Inc.: сайт. URL: http://accelrys.com/
- Dean P. M. (Ed.) Molecular Similarity in Drug Design. // Blackie Academic & Professional. London. 1995. P. Ill -137.
- Embarcadero: сайт. URL: http://www.embarcadero.com/
- Ader R., Weijnen J. A.W.M., Moleman P. Retention of a passive avoidance response as a function of the intensity and duration of electric shock. // Psychon. Sci. 1972. V. 26. P. 125−128.
- Vogel J.R., Beer D., Clody D.E. A simple and reliable conflict procedure for testing antianxiety drugs. // Psychopharmacologia. 1971. Vol. 21. P. 17.
- Liliequist S., Engel J.A. The effects of GABA and benzodiazepine receptor antagonists on the anticonflict actions of diazepam and ethanol. // Pharmacology, Biochemistry & Behavior. 1984. Vol. 21. P. 521−525.
- Молодавкин Г. М., Воронина Т. А. Многоканальная установка для поиска транквилизаторов и изучения механизмов их действия по методу конфликтной ситуации. // Эксперим. и клин фармакол. 1995. Т. 58, № 2. С. 54−56.
- Боровиков В.П., Боровиков И.П. Statistica®-cTaTHCTH4ecKmi анализ и обработка данных в среде Windows®. // Москва. Информационно-издательский дом «Филинъ». 1997. СС. 608.
- Woodbury D.M., Woodbury J.W. Effects of vagal stimulation on experimentally induced seizures in rats. // Epilepsia. 1990. Vol. 31, № 2. Suppl. S7-S19.
- Комиссарова H.B., Симе B.E., Гомазков O.A., Оэме Р. Подавление веществом Р активности ангиотензин-превращающего фермента из сыворотки крови человека. // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 1982. № 6. С. 3−5.
- Mumford R. A., Strauss A.W., Powers J.C., Pierzchala, P.A., Nishino N., Zimmerman M. A. Zinc metalloendopeptidase associated with dog pancreatic membranes. // J. Biol. Chem. 1980. Vol. 255, № 6. P. 22 272 230.
- Taraporewala I.B., Kauffman J.M. Synthesis and structure-activity relationships of anti-inflammatory 9,10-dihydro-9-oxo-2-acridinealkanoic acids and 4-(2-carboxyphenyl)aminobenzenealkanoic acids. // J. Pharm. Sci. 1990. Vol. 79, № 2. P. 173−178.
- Салимов P.M. Оценка упорядоченности пути в процессе исследовательского поведения у мышей. // Журнал высшей нервной деятельности. 1988. Т. 38, № 3. С. 569−571.
- Markina N.V., Salimov R.M., Poletaeva I.I. Exploratory behaviour of F2 crosses of mouse lines selected for different brain weight: A multivariateanalysis. // Prog. Neuro-Psychopharmacol. Biol. Psychiat. 2004. Vol. 28, № 3. P. 583−589.
- Salimov R.M. Different behavioral patterns related to alcohol use in rodents: A factor analysis. // Alcohol. 1999. Vol. 17, № 2. P. 157−162.
- Collins English Dictionary: сайт. URL: http://www.collinsdictionary.com/english-thesaurus/
- Crum-Brown A., Fraser T.R. // Trans. R. Soc. Edinbours. 1868. Vol. 25. P. 151−203.
- Hansch C. and Fujita. Т., J. [rho.]-[[sigma]]-[[pi]] Analysis. A Method for the Correlation of Biological Activity and Chemical Structure. // Amer.
- Chem. Soc., 1964. V.86. P.1616−1626.i
- Filimonov D.A., Poroikov V.V. PASS: computerized prediction of biological activity spectra for chemical substances. / In: Bioactive Compound Design: Possibilities for Industrial Use. // BIOS Scientific Publishers. Oxford. UK. 1996, P.47−56.
- UniProt: сайт. URL: http://www.uniprot.org/
- Gene NCBI: сайт. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene
- MDDR MDL Drug Data Report база данных фирмы Accelrys: сайт. URL: http://accelrys.com/products/databases/bioactivity/mddr.html
- Prous J.R. The year’s drug news Therapeutic Targets. // 1995 edition, Prous science. Barcelona, Philadelphia. 1995. PP. 743.
- Goodman L.S., Gilman A.G., Rail W.T., Nies A.S., Taylor P. Goodman and Gilman’s The Pharmacological Basis of Therapeutics. // Eight edition. Pergamon Press. 1990. PP. 1811.
- Rang H.P., Dale M.M., Ritter J.M. Pharmacology, Third edition // Pearson Professional Limited. USA. 1995. PP. 855.
- Katzung B.G. Basic and Clinical Pharmacology. Eight Edition. // Lange Medical Books/McGraw-Hill. 2001. PP. 1217.
- Aronson J.K. Meyler’s Side Effects of Drugs. The international Encyclopedia of Adverse Drug Reactions and Interactions. Fifteenth edition. // Elsevier. Amsterdam. 2006. PP. 3993.
- Watling K., Kebabian J., Neumeyer J., The RBI Handbook of Receptor Classification and Signal Transduction. // Research Biochemicals International. Natick, USA. 1995. PP. 195.
- GPCRDB: Information system for G-protein-coupled receptors (GPCRs): сайт. URL: http://www.gpcr.org/7tm/
- Thomson Reuters Integrity: сайт. URL: https://integrity.thomson-pharma.com/integrity/xmlxsl/
- DrugBank: сайт. URL: http://www.drugbank.ca/
- CTD Comparative Toxicogenomics Database: сайт. URL: http://ctd.mdibl.org/
- TTD Therapeutic Target Database: сайт. URL: http://bidd.nus.edu.sg/group/cjttd/
- DART database Drug Adverse Reaction Target Database: сайт. URL: http://bidd.nus.edu.sg/group/drt/dart.asp
- PDTD Potential Drug Target Database: сайт. URL: http://www.dddc.ac.cn/pdtd/172. ddTargets: drug targets/disease targets database: сайт. URL: http://www.sciclips.com/sciclips/drug-targets-all.do
- Deeks E.D., Perry C.M. Efavirenz/emtricitabine/tenofovir disoproxil fumarate single-tablet regimen (Atripla®): a review of its use in the management of HIV infection. // Drugs. 2010. Vol. 70, № 17. P. 2315−2338.
- Drugs.com: сайт. URL: http://www.drugs.com/sfx/atripla-side-effects.html
- CEREP: сайт. URL: http://www.cerep.fr/Cerep/Users/index.asp
- Goldstein D.M., Gray N.S., Zarrinkar P.P. High-throughput kinase profiling as a platform for drug discovery. // Nat. Rev. Drug Discov. 2008. Vol. 7, № 5. P. 391−397.
- Husain M, Mehta MA. Cognitive enhancement by drugs in health and disease. // Trends Cogn. Sci. 2011. Vol. 15, № 1. P. 28−36.
- Lanni C., Lenzken S.C., Pascale A., Del Vecchio I., Racchi M., Pistoia F., Govoni S. Cognition enhancers between treating and doping the mind. // Pharmacol Res. 2008. Vol. 57, № 3. P. 196−213.
- Wittchen H-U., Kessler R.C., Beesdo K., Krause P., Hofler M., Hoyer J. Generalized anxiety and depression in primary care: prevalence, recognition, and management. // J. Clin. Psychiatry. 2002. Vol. 63, (suppl. 8). P. 24−34.
- Allgulander C. Generalized anxiety disorder: what are we missing? // Eur Neuropsychopharmacol. 2006. Vol. 16, P. S101-S108.
- Hoffman D.L., Dukes E.M., Wittchen H-U. Human and economic burden of generalized anxiety disorder. // Depress Anxiety. 2008. Vol. 25. P. 72−90.
- Baldwin D., Woods R., Lawson R., Taylor D. Efficacy of drug treatments for generalised anxiety disorder: systematic review and meta-analysis. // BMJ. 2011. 342: dll99. doi: 10.1136/bmj.dl 199.
- Gerlach A.C., Krajewski J.L. Antiepileptic Drug Discovery and Development: What Have We Learned and Where Are We Going? // Pharmaceuticals. 2010. Vol. 3. P. 2884−2899.
- Cumin R., Bandeis R.F., Haefely W.E. Effects of the novel compound aniracetam (Ro 13−5057) upon impaired learning and memory in rodents. // Psychopharmacology. 1982. Vol. 78, № 2. P. 104−111.
- Olah M.M., Bologa C.G., Oprea T.I. Strategies for compound selection. // Curr. Drug Discov. Technol. 2004. Vol.1. P. 211−220.
- Лагунин A.A., Филимонов Д. А., Поройков B.B. Компьютерный поиск потенциальных антигипертензивных соединений комбинированного действия. // Хим.-фарм. журн. 2001. Т. 35, № 7. С. 28−34.
- Asher J.R., Naftilan A.J. Vasopeptidase inhibition: a new direction in cardiovascular treatment. // Curr. Hypertens. Rep. 2000. Vol. 2. № 4. P.384−391.
- Гомазков О.А. Пептиды в кардиологии. Биохимия. Физиология. Патология. Информация. Анализ. // М. Материк Альфа, 2000. 143 С.
- Roques В. P., Noble F., Daugee V., Fournie-Zaluski М.С., Beaumont A. Neutral endopeptidase 24.11: structure, inhibition, and experimental and clinical pharmacology. // Pharmacol. Rev. 1993. Vol.45. P.87−146.
- Ruskoaho H. Atrial natriuretic peptide: synthesis, release, and metabolism. // Pharmacol. Rev. 1992. Vol. 44. № 4. P. 479−602.
- Turner A.J., Tanzawa K. Mammalian membrane metallopeptidases: NEP, ECE, KELL, and PEX. // FASEB J., 1997. Vol. 11, № 5. P.355−364.
- Main B. W. Cardiovascular effects of YM-16 151−4, a novel dihydropyridine derivative which possesses calcium entry blocking and selective beta 1-adrenoceptor blocking activities, in dogs. // FASEB J., 1988. V.2. № 4. Abst. 1797.
- Panzenbeck M. J. BMY-20 014 is a combined Ca++/alphal-adrenergic antagonist with prolonged effects on coronary blood flow. // FASEB J., 1989. V.3. № 4. Abst. 4607.
- Taylor D. P. BMS-181 102: Neuroprotection with 5-HT2 antagonism and L-type Ca++ channel blockade. // Soc. Neurosci. Abst. 1994. Vol. 20 (Part 1). Abst. 81.12.
- Walsh T.F. Potent dual antagonists of endothelin and angiotensin II receptors derived from alpha-phenoxyphenylacetic acids (Part III). // Bioorg. Med. Chem. Lett. 1995. Vol. 5, № 11. P. 1155.
- McKittrick B.A. Design and synthesis of phosphinic acids that triply inhibit endothelin converting enzyme, angiotensin converting enzyme and neutralendopeptidase 24.11. // Bioorg. Med. Chem. Lett. 1996. Vol. 6. № 14. P. 1629.
- Ksander G.M. Benzofused macrocyclic lactams as triple inhibitors of endothelin-converting enzyme, neutral endopeptidase 24.11, and angiotensin-converting enzyme. // J. Cardiovasc. Pharmacol. 1998. V.31. Suppl.l. S71.
- Ebert R.H., Grant L. In: The Inflammatory Process. 2nd edition. // Eds.: Zwreifach B.W., Grant L., & McCluskey R.T., / Raven Press New York. 1974. Vol.1. P. 4−49.
- Consumer Reports 2011. сайт. URL: http://www.consumerreports.org/health/resources/pdf/best-buy-drugs/Nsaids2 .pdf
- Green G.A. Understanding NSAIDs: from aspirin to COX-2. // Clin. Cornerstone. 2001. Vol. 3, № 5. P. 50−60.
- Traversa G., Walker A.M., Ippolito F.M., Caffari B., Capurso L., Dezi A., Koch M., Maggini M., Alegiani S.S., Raschetti R. Gastroduodenal toxicity of different nonsteroidal antiinflammatory drugs. // Epidemiology. 1995. Vol. 6, № 4. P. 466−467.
- Weir M.R. Renal effects of nonselective NSAIDs and coxibs. // Cleve. Clin. J. Med. 2002. Vol. 69, Suppl 1. SI53-SI58.
- Rubenstein J.H., Laine L. Systematic review: the renaTOTOKCHHHOCTbity of non-steroidal anti-inflammatory drugs. // Aliment. Pharmacol. Ther. 2004. Vol. 20, № 4. P. 373−380.
- Krotz F., Schiele T.M., Klauss V., Sohn H.Y. Selective COX-2 inhibitors and risk of myocardial infarction. // J. Vase. Res. 2005. Vol. 42, № 4, P. 312−324.
- Leval X., Julemont F., Delarge J., Pirotte B., Dogne J-M. New Trends in Dual 5-LOX/COX Inhibition. // Curr. Med.Chem. 2002. Vol. 9. P. 941 962.
- Altman H., Luciardi L., Muntaner J.- Herrera, R.N. Therapeutic role of dual inhibitors of 5-LOX and COX, selective and non-selective non-steroidal anti-inflammatory drugs. Ann. Rheum. Dis. 2003. Vol. 62. P. 501−509.
- Jouzeau J.Y., Terlain B., Abid A., Nedelec E., Netter P. Cyclo-oxygenase isoenzymes. How recent findings affect thinking about nonsteroidal antiinflammatory drugs. // Drugs. 1997. Vol. 53. P. 563−582.
- Fu J.Y., Masferrer J.L., Seibert K., Raz A., Needleman P. The induction and suppression of prostaglandin H2 synthase (cyclooxygenase) in human monocytes. //J. Biol. Chem. 1990. Vol. 265. P. 16 737−16 740.
- Belvisi M.G., Saunders M., Yacoub M., Mitchell J.A. Expression of cyclooxygenase-2 in human airway smooth muscle is associated with profound reductions in cell growth. // Br. J. Pharmacol. 1998. Vol. 125. P. 1102−1108.
- Bray M.A., Ford-Hutchinson A.W., Smith M.J. Leukotriene B4: an inflammatory mediator in vivo. // Prostaglandins. 1981. Vol. 22. P. 213— 222.
- Martel-Pelletier J., Lajeunesse D., Reboul P., Pelletier J-P. Therapeutic role of dual inhibitors of 5-LOX and COX, selective and non-selective nonsteroidal anti-inflammatory drugs. // Ann. Rheum. Dis. 2003. Vol. 62. P. 501−509.
- Bayes M., Rabasseda X., Prous J.R. Gateways to clinical trials. // Methods Find. Exp. Clin. Pharmacol. 2002. Vol. 24, № 8. P. 525−551.
- Fukunishi Y. Structure-based drug screening and ligand-based drug screening with machine learning. // Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. 2009. Vol. 12. P. 397−408.
- Гомазков O.A., Лагунин A.A., Поройков B.B. Компьютерный прогноз комбинированного действия препаратов, используемых в терапии артериальной гипертонии. // Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2008. Т. 7, № 5. С. 100 104.
- Lagunin A., Filimonov D., Poroikov V. Multi-Targeted Natural Products Evaluation Based on Biological Activity Prediction with PASS. // Cur. Pharm. Design. 2010. Vol. 16, № 15. P. 1703−1717.
- Sakata K., Shirotani M., Yoshida H., Urano Т., Takada Y., Takada A. Differential effects of enalapril and nitrendipine on the fibrinolytic system in essential hypertension. // Am. Heart J. 1999. — Vol. 137, № 6. — P. 1094−1099.
- Arslanagic A., Bajraktarevic A. The effect of lisinopril and amlodipin treatment on left ventricular hypertrophy in hypertensive patients. // Med Arh. 2006. Vol. 60, № 6 Suppl 2. P. 71−73.
- Pall D., Katona E., Juhasz M., Paragh G. Prevention of target organ damage with modern antihypertensive agents. // Orv. Hetil. 2006. Vol. 147, № 32. P. 1505−1511.
- Давидович И.М., Петричка T.A. Комбинированная терапия амлодипином и лизиноприлом в лечении больных артериальной гипертонией: эффективность низкодозовой комбинации. // Терапевтический архив. 2006. Vol. 78, № 5. Р. 65−68.
- PJ1C. Регистр лекарственных средств России, сайт.: URL: http://www.rlsnet.ru/
- The NAVIGATOR Study Group. Effect of valsartan on the incidence of diabetes and cardiovascular events. // N. Engl. J. Med. 2010. Vol.362, № 16. P.1477−1490.
- Fogari R., Zoppi A., Mugellini A., Corradi L., Lazzari P., Preti P., Derosa
- G. Comparative evaluation of effect of valsartan/amlodipin and atenolol/amlodipin combinations on atrial fibrillation recurrence in hypertensive patients with type 2 diabetes mellitus. // J. Cardiovasc. Pharmacol. 2008. Vol. 51, № 3. P. 217−222.
- Philipp Т., Smith T.R., Glazer R., Wernsing M., Yen J., Jin J., Schneider
- Samuelsson G. Drugs of Natural Origin: a Textbook of Pharmacognosy. 5th Edn. // Swedish Pharmaceutical Press, Stockholm. 2004. PP. 620.
- Kong D-X., Li X-J., Zhang H-Y. Where is the hope for drug discovery? Let history tell the future. // Drug Discov. Today. 2009. Vol. 14. P. 115−119.
- Vaidya A.D.B., Devasagayam T.P.A. Current status of herbal drugs in India: an overview. // J. Clin. Bioch. Nutrit. 2007. Vol. 41. P. 1−11.
- Domarew C.A., Holt R.R., Snitkoff G.G. A study of Russian phytomedicine and commonly used herbal remedies. // J. Herbal. Pharmacother. 2002. Vol. 2. P. 31−48.
- Ertl P., Roggo S., Schuffenhauer A. Natural product-likeness score and its application for prioritization of compound libraries. // J. Chem. Inf. Model.2008. Vol. 48. P. 68−74.
- Newman D.J., Cragg G.M. Natural products as sources of new drugs over the last 25 years. // J. Natur. Prod. 2007. Vol. 70. P. 461−477.
- Harley A.L. Natural products in drug discovery. // Drug Discov. Today. 2008. Vol. 13. P. 894−901.
- Morphy R., Rankovic Z. Designing multiple ligands medicinal chemistry strategies and challenges. // Cur. Pharm. Des. 2009. Vol. 15. P. 586−600.
- Petersen F., Amstutz R. Natural compounds as drugs. // Progr. Drug Res. 2008. Vol. 65. PP. 377.
- Ehrman T.M., Barlow D.J., Hylands PJ. Phytochemical databases of Chinese herbal constituents and bioactive plant compounds with known target specificities. // J. Chem. Inf. Model. 2007. Vol. 47, P. 254−263.
- Di Carlo G., Borrelli F., Ernst E., Izzo A.A. St John’s wort: Prozac from the plant kingdom. // Trends Pharmacol. Sci. 2001. Vol. 22, № 6. P. 292−297.
- Erdelmeier C.A.J., Koch E., Hoerr R. Hypericum perforatum St. John’s Wort chemical, pharmacological and clinical aspects. // Stud. Nat. Prod. Chem. 2000. Vol. 22, № 3. P. 643−716.
- Куркин B.A. Фармакогнозия. // Учебник для студентов фармац. вузов (ф-тов). 2-е изд., перераб. и доп. — Самара. Офрот. СамГМУ Росздрава. 2007. 1239 С.
- Smelcerovic A., Spiteller М., Ligon А.Р., Smelcerovic Z., Raabe N. Essential oil composition of Hypericum L. species from Southeastern Serbia and their chemotaxonomy. // Biochem. Systematics Ecol. 2007. Vol. 35. P. 99−113.
- Radusiene J., Judzentiene A., Bernotiene G. Essential oil composition and variability of Hypericum perforatum L. growing in Lithuania. // Biochem. Systematics Ecol. 2005. Vol. 33. P. 113−124.
- Viagra. // Chemical & Engineering News. 2005. Vol. 83, № 25. P. 132.
- Wermuth C.G. Selective optimization of side activities: the SOSA approach. // Drug Discov. Today. 2006. Vol. 11, № 3−4. P. 160−164.
- Poroikov V., Akimov D., Shabelnikova E., Filimonov D. Top 200 medicines: can new actions be discovered through computer-aided prediction? // SAR & QSAR Environ. Res. 2001. Vol. 12, № 4. P. 327 344.
- Salimov R., Salimova N., Shvets L., Shvets N. Effect of chronic piracetam on age-related changes of cross-maze exploration in mice. // Pharmacol. Biochem. Behav. 1995. Vol. 52, № 3. P. 637−640.
- Yip A.G., Brayne C., Easton D., Rubinsztein D.C. An investigation of ACE as a risk factor for dementia and cognitive decline in the general population. // J. Med. Genet. 2002. Vol. 39, № 9. P. 403−406.
- Свидетельства о регистрации компьютерных программ и баз данных:
- Филимонов Д.А., Поройков В. В., Глориозова Т. А., Лагунин А. А. Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ PAS S № 2 006 613 275 от 15 сентября 2006 г., Москва, Федеральная служба по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам.
- Глориозова Т.А., Филимонов Д. А., Лагунин А. А., Поройков В. В. Тестирование компьютерной системы предсказания спектра биологической активности PASS на выборке новых химических соединений. // Хим.-фарм. журн. 1998. Т. 32, № 12. С. 32−39.
- Lagunin A., Stepanchikova A., Filimonov D., Poroikov V. Internet server for on-line prediction of the biological activity spectrum for a substance. // Bioinformatics. 2000. Vol. 16, № 8. P. 747−748.
- Лагунин А.А., Филимонов Д. А., Поройков В. В. Компьютерный поиск потенциальных антигипертензивных соединений комбинированного действия. // Хим.-фарм. журн. 2001. Т. 35, № 7. С. 28−34.
- Садым A.B., Лагунин А. А., Филимонов Д. А., Поройков В. В. Интернет-система прогноза спектра биологической активности химических соединений. // Хим.-фарм. журн. 2002. Т. 36, № 10. С. 21−26.
- Lagunin A., Poroikov V. PharmaExpert: knowledge-based computer system for interpretation of biological activity spectrum for substance. // Newsletter of The QSAR and Modelling Society. 2002. № 13. P. 23−25.
- Stepanchikova A.V., Lagunin A.A., Filimonov D.A., Poroikov V.V. Prediction of biological activity spectra for substances: evaluation on the diverse set of drug-like structures. // Current Medicinal Chemistry. 2003. Vol. 10, № 3. P. 225−233.
- Geronikaki A., Vicini P., Theophilidis G., Lagunin A., Poroikov V., Dearden J. Study of Local Anesthetic Activity of some Derivatives of 3-amino-benzo-d.-isothiazole. // SAR QSAR Environ. Res. 2003. Vol. 14, № 5−6. P. 485 495.
- Филимонов Д.А., Бородина Ю. В., Лагунин A.A., Акимов Д. В., Садым А. В., Поройков В. В. Компьютерное прогнозирование биологической активности химических соединений. // В кн.: Проблемы создания новых лекарственных средств, Уфа: Гилем. 2003. С. 83−84.
- Sadym A., Lagunin A., Filimonov D., Poroikov V. Prediction of Biological Activity Spectra via the Internet. // SAR QSAR Environ. Res. 2003. Vol. 14, № 5−6. P. 339−347.
- Lagunin A., Dearden J., Filimonov D., Poroikov V. A New in silicoth
- Approach for the Mutagenicity Prediction. // In: Proceedings of the 15 European Symposium on Structure-Activity Relationships (QSAR) and Molecular Modeling. / Esin Aki (SENER), Ismail Yalcin, Ed. 2004. P. 209 210.
- Lagunin A.A., Dearden J.C., Filimonov D.A., Poroikov V.V. Computer-aided rodent carcinogenicity prediction. // Mutation Research. 2005. Vol. 586, № 2. P. 138−146.
- Поройков B.B., Филимонов Д. А., Глориозова T.A., Лагунин А. А. Компьютерное прогнозирование спектров биологической активности азотсодержащих органических соединений. // В кн.: Азотсодержащие гетероциклы, М.: ICSPF. 2006. С. 92−97.
- Захаров А.В., Лагунин А. А., Филимонов Д. А., Поройков В. В. Количественный анализ взаимосвязей «структура-активность» ингибиторов циклин-зависимой киназы 1. // Биомедицинская химия.2006. Т. 52, № 1. С. 3−18.
- Geronikaki A., Vasilevsky S., Hadjpavlou-Litina D., Lagunin A., Poroikov V. Synthesis and anti-inflammatory activity of ethynylthiazoles. // In: Chemistry of Heterocyclic Compounds, M.: ICSPF. 2006. Vol. 5. P. 769 774.
- Poroikov V., Filimonov D., Lagunin A., Gloriozova Т., Zakharov A. PASS: identification of probable targets and mechanisms of toxicity. // SAR QSAR Environ. Res. 2007. Vol. 18, № 1−2. P. 101−110.
- Lagunin A.A., Zakharov A.V., Filimonov D.A., Poroikov V.V. A new approach to QSAR modelling of acute toxicity. // SAR QSAR Environ. Res.2007. Vol. 18, № 3−4. P. 285−298.
- Devillers J., Dore J.C., Guyot M., Poroikov V., Gloriozova Т., Lagunin A., Filimonov D. Prediction of biological activity profiles of cyanobacterial secondary metabolites. // SAR QSAR Environ. Res. 2007. Vol. 18, № 7. P. 629−643.
- Сергейко А.П., Степанчикова А. В., Соболев Б. Н., Зотчев С. Б., Лагунин А. А., Филимонов Д. А., Поройков В. В. Компьютерное конструирование поликетидов с заданными свойствами. // Биомедицинская химия. 2007. Т. 53, № 5. С. 522−531.
- Filz O., Lagunin A., Filimonov D., Poroikov V. Computer-aided prediction of QT-prolongation. // SAR QSAR Environ. Res. 2008. Vol. 19, № 1−2. P. 81−90.
- Гомазков O.A., Лагунин A.A., Поройков В. В. Компьютерный прогноз комбинированного действия препаратов, используемых в терапии артериальной гипертонии. // Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2008. Т. 7, № 5. С. 100−104.
- Lagunin A., Filimonov D., Zakharov A., Xie W., Huang Y., Zhu F., Shen Т., Yao J., Poroikov V. Computer-Aided Prediction of Rodent Carcinogenicity by PASS and CISOC-PSCT. // QSAR Comb. Sci. 2009. Vol. 28, № 8. P. 806−810.
- Koborova O.N., Filimonov D.A., Zakharov A.V., Lagunin A.A., Ivanov S.M., Kel A., Poroikov V.V. In silico method for identification of promising anticancer drug targets. // SAR QSAR Environ. Res. 2009. Vol. 20, № 7−8. P. 755−766.
- Filimonov D.A., Zakharov A.V., Lagunin A.A., Poroikov V.V. QNA based «Star Track» QSAR approach. // SAR QSAR Environ. Res. 2009. Vol. 20, № 7−8. P. 679−709.
- Lagunin A., Filimonov D., Poroikov V. Multi-Targeted Natural Products Evaluation Based on Biological Activity Prediction with PASS. // Cur. Pharm. Design, 2010. Vol. 16, № 15. P. 1703−1717.
- Hardy В., Douglas N., Helma C., Rautenberg M., Jeliazkova N., Jeliazkov V., Nikolova I., Benigni R., Tcheremenskaia O., Kramer S., Girschick Т.,
- Goel R.K., Singh D., Lagunin A., Poroikov V. PASS-assisted exploration of new therapeutic potential of natural products. // Med. Chem. Res. 2011. V. 20, № 9. P. 1509−1514.
- Lagunin A., Zakharov A., Filimonov D., Poroikov V. QSAR Modelling of Rat Acute Toxicity on the Basis of PASS Prediction. // Molecular Informatics. 2011. Vol. 30, № 2−3. P. 241−250.
- Лагунин А.А., Поройков В. В. Реляционная система классификации биологически активных веществ. // Материалы И-го съезда биохимического общества РАН. Москва. 1997. Часть II. С. 446.
- Лагунин А.А., Филимонов Д. А., Поройков В. В. Экспертная система для интерпретации результатов прогноза спектра биологической активности веществ. // Труды V-ro Всероссийского национального конгресса «Человек и лекарство». Москва. 1998. С. 582.
- Филимонов Д.А., Лагунин А. А., Поройков В. В. Компьютерная оценка свойств химических соединений с использованием неполной эмпирической информации. // Материалы П-го съезда биофизиков России. Москва. 1999. Т. III. С. 982.
- Lagounine A., Poroikov V., Filimonov D. PharmaExpert: knowledge-based computer system for discovery of new drugs. // Abstracts of XVIth International Symposium on Medicinal Chemistry. Bologna. 2000. PB 148.
- Gomazkov О.А., Lagunin А.А., Poroikov V.V. A new computer-aided approach for analysis of modern medicines with dual mechanisms of antihypertensive actions. // Abstracts of Deutsche Medizinische Wochenscrift, Hypertonie. Berlin. 2001. P. 12−9.
- Лагунин А.А., Поройков B.B., Филимонов Д. А., Степанчикова A.B., Глориозова Т.А. Web-сайт для прогнозирования спектра биологической активности химических веществ. // 2-ая Всероссийская конференция «Молекулярное моделирование». Москва. 2001. С. 77.
- Лагунин А.А., Филимонов Д. А., Поройков В. В., Гомазков О. А., Соловьева Н. И. Компьютерный поиск новых антигипертензивных веществ с комбинированными механизмами действия. // Материалы IX
- Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Москва.2002. С. 647.
- Lagunin A.A., Poroikov V.V., Filimonov D.A. Computer-aided discovery of new pharmaceutical agents with dual mechanism of action. // Abstract oftVi
- XVII International Symposium on Medicinal Chemistry. Barcelona. 2002. P. 309.
- Lagunin A. A., Filimonov D. A., Poroikov V. V. Acute toxicity prediction with computer program PASS. // J. Pharmacy and Pharmacology, Abstracts of 140th British Pharmaceutical Conference, Science Proceedings. 2003. S. 57−58.
- Poroikov V., Filimonov D., Sadym N., Lagunin A. Prediction of biological activity spectra via Internet. // Abstracts of Computational Methods in Toxicology and Pharmacology. Integrating Internet Resources. Greece.2003. P. 11.
- Лагунин A.A., Поройков B.B., Воронина T.A., Героникаки А. Компьютерный поиск новых анксиолитиков, антиконвульсантов и ноотропных средств. // Материалы X Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Москва. 2003. С. 728.
- Глориозова T.A., Филимонов Д. А., Лагунин A.A., Поройков В. В. Компьютерный прогноз биологической активности для химических соединений из больших баз данных. // Материалы 4-го Всероссийского симпозиума по органической химии. Москва. 2003. С. 36.
- Poroikov V., Lagunin A., Filimonov D. PharmaExpert: diseases, targets and ligands-three in one. // Abstracts of 15th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships. Istanbul. 2004. P. 334.
- Филимонов Д.А., Бородина Ю. В., Лагунин A.A., Акимов Д. В., Рудик А. В., Поройков В. В. Компьютерное прогнозирование биологической активности химических соединений. // Материалы Ш-го съезда биофизиков России. Воронеж. 2004. Т.2. С. 801−802.
- Lagunin A.A., Zakharov A.V., Filimonov D.A., Poroikov V.V., Dearden J. Computer aided carcinogenicity prediction in drug design. // Abstracts of 2nd International Conference «Genomics, Proteomics and Bioinformatics for Medicine». Moscow. 2004. S. 5.6.
- Lagunin A., Zakharov A., Dmitriev A., Filtz O., Poroikov V. Database of drug-drug interactions. // Abstract of 3rd International Conference «Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanotechnologies for Medicine» (GPBM 2006). Novosibirsk. 2006. P. 111.
- Geronikaki A., Dearden J.C., Lagunin A., Garibova T.L., Voronina T.A.
- QSAR analysis of some thiazole derivatives with anti-amnestic activity. //th
- Abstracts of 12 International Workshop on Quantitative Structure-Activity Relationships in Environmental Toxicology. Lyon. 2006. P. 138.
- Gomazkov O., Dergacheva L., Lagunin A., Gloriozova T., Filimonov D., Poroikov V. Computer aided approach for search of phytomedicines with the required properties. // Kongressband Phytopharmaka Phytotherapie. Berlin. 2006. S. 23.
- Лагунин А, А., Филимонов Д. А., Захаров A.B., Фильц O.A., Дмитриев А. В., Поройков В. В. Компьютерный прогноз взаимодействия лекарств. // Материалы XIV Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Москва. 2007. С. 297.
- Гомазков O.A., Лагунин A.A., Поройков B.B. Компьютерный прогноз комбинированного действия препаратов, используемых в терапииартериальной гипертонии. // Материалы XV Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Москва. 2008. С. 520.
- Lagunin A.A., Zakharov A.V., Koborova O.N., Filimonov D.A., Poroikov
- V.V. computer aided finding of new anticancer targets and their ligands. //th
- Abstracts of the 5 International Conference «Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanobiotechnology for Medicine». St. Peterburg- Kizhi-Mandrogy-Valaam-Konevets- St.Peterburg. 2010. P. 79.
- Poroikov V., Filimonov D., Lagunin A., Gloriozova T. PASS based virtual screening of druglike compounds. Abstracts of XXIst International Symposium on Medicinal Chemistry. Brussels. 2010. P. 174.
- Поройков B.B., Глориозова T.A., Лагунин A.A., Филимонов Д. А. Применение компьютерных методов для репозиционирования лекарств. // Материалы XVIII Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Москва. 2011. С. 561.