Конформационные различия нативной и рекомбинантной форм изофермента С пероксидазы хрена, выявляемые радиохимическими и кинетическими методами
Диссертация
В данной работе использован сравнительно новый экспериментальный метод исследования пространственной структуры биологических макромолекул и надмолекулярных структур — метод термической ак- «вации трития, являющийся основой метода тритиевой планиграфии. Этот метод разработан для изучения доступной поверхности и структуры исследуемого объекта и получения меченых соединений. Существует большое… Читать ещё >
Список литературы
- Welinder K G. (1992) Curr. Opin. Struc. Biol., 2, 388.
- Finzel B.C., Poulos T.L., and Kraut, J. (1984) J. Biol. Chem., 259, 13 027.
- Patterson W.R., and Poulos T.L. (1995) Biochemistry, 34, 4331.
- Poulos T.L., Edwards S.L., Wariishi H" and Gold M.H. (1993) J. Biol. Chem., 268,4429.
- Piontek K., Glumoff Т., and Winterhalter К. (1993) FEBS Letters, 315, 119.
- Sundaramoorthy M., Kishi K., Gold M.H., and Poulos T.L. (1994), J. Biol. Chem., 269, 32 759.
- Petersen J.F.W., Kadziola A., and Larsen S. (1994) FEBS Letters 339, 291.
- Kunishima N., Fukuyama K., Matsubara H., Hatanaka H., Shibano Y., and Amachi T. (1994) J. Mol. Biol., 235, 331.
- Schuller D.J., Ban N., van Huystee R.B., McPherson A., and Poulos T.L. (1996)1. Structure, 4, 311.
- Gajhede M., Schuller D.J., Henriksen A., Smith AT., and Poulos T P. (1997) Nature Structural Biology, 4, 1032.
- Henriksen A, Welinder K.G., and Gajhede M. (1998) J. Biol. Chem., 273, 2241.
- Newmyer S.L., and Ortiz de Montellano P R. (1995) J. Biol. Chem. 270, 19 430.
- Rodrigues-Lopez J.N., Smith A.T., and Thorneley R.N.F. (1996) J. Biol. Chem., 271, 4023.
- Henriksen A., Smith A T., and Gajhede, M. (1999) J. Biol. Chem., 274, 35 005.
- Логинов Д.Б. и др. (1994) Изв.АН, сер.хим., 43, № 11, 2034.
- Tams J.W., Vind J., Welinder KG. In: Plant Peroxidases. Biochemistry and Physiology (Ed. Welinder K G. et al), Geneve, 1993,143.
- Veitch N.C., Gao Y., Smith A.T., and White C.G. (1997) Biochemistry, 36, 14 751
- Gorton L., Lindgren A., Larsson Т., Munteanu F.D., Ruzgas T. and Gazaryan I. (1999) Anal.Chim.Acta, 400,91.
- Pelletier H. and Kraut J. (1992) Science, 258, 1748.
- Choudhury K., Sundaramoorthy M., Mauro J.M., and Poulos T.L. (1986) J.Biol.Chem. 267, 25 656.
- Blodig W., Doyle W, Smith AT., Winterhalter K" Choinowski T. and Piontek K. (1998) Biochemistry 37, 8832.
- Blodig W" Smith AT., Winterhalter K" and Piontek K. (1999) Arch.Biochem.Biophys., 370, 86.
- Choinowski Т., Blodig W., Winterhalter K., and Piontek K. (1999) J. Mol. Biol., 286, 809.
- Doyle W.A., Blodig W" Veitch N.C., Piontek K., and Smith AT. (1998) Biochemistry, 37, 15 097.
- Timofeevski S.L., Nie G., Reading N.S., and Aust S.D. (1999) Biochem. Biophys. Res. Communs, 256, 500.
- Timofeevski S.L., Nie G., Reading N.S., and Aust S.D. (2000) Arch. Biochem. Biophys., 373, 147.
- Picot D, Loll P.J., and Garavito, R.M. (1994) Nature, 367, 243.
- Haschke R.H., Friedhoff J.M. (1978) Biochem.Biophys.Res.Communs, 80, 1039.
- Morishima I., Kurono M" Shiro Y. (1986) J.Biol.Chem., 261, 9391.
- Rasmussen C.B., Hiner A.N.P., Smith A.T., Welinder K G. (1998) J.Biol.Chem., 273, 2232.
- Shiro Y., Kurono M., Morishima I. (1986) J.Biol.Chem., 261, 9382.
- Banci L., Carloni P., Diaz A., Savellini G.G. (1996) J.Biol.Inorg.Chem, 1, 264.
- George S.J., Kvaratskelia M., Dilworth M.J., Thorneley R.N.F. (1999) Biochem.J., 344, 237.
- Van Huystee R.B., Xu Y., O’Donnell J.P. (1992) Plant Physiol. Biochem., 30, 293.
- Barber K.R., Rodriguez Maranon M.J., Shaw G.S., van Huystee R.B. (1995) Eur.J.Biochem., 232, 825.
- Gazarian I.G., Lagrimini L.M., George S.J., Thorneley R.N.F. (1996) Biochem. J, 320, 369.
- Pollard E" Buzzel A., Forro F" Jeffrays C. (1951) Arch.Biochem., 33, 9.
- Циммер КГ. Проблемы количественной радиобиологии, Госатомиздат, Москва, 1962, 125 с.
- Ellory J.C. (1979) TIBS, 99.
- Houslay Н. et al. (1977) Biochim.Biophys. Acta, 467, 208.
- Орлова M.A. (1993) Успехи химии, 62(5), 529.
- Phihl A., Sanner T. (1963) Rad.Res., 19, 27.
- Орлова M.A., Никольская И. И., Голубцов И. В. (1987) Радиобиология, 27, 308.
- Никольская И.И., Орлова М. А., Голубцов И. В. (1986), Радиобиология, 26, 302.
- Орлова М.А. и др. (1989) Вестн.Моск.ун-та, 30, 309.
- Orlova М.А. etal. (1991) Biochem.Biotechnol.Elect.Express Data, 1, 15.
- Орлова М.А. и др. (1993) Вестн.Моск.ун-та, 34,465.
- Орлова М.А., Голубцов И. В., Никольская И И. (1987) Вестн.Моск.ун-та, 28, 601.
- Orlova М.А. et al. (1984) Rad.Eff.Lett., 85, 143.
- Орлова М.А., Никольская И. И., Богаевская Е. В., Голубцов И. В. (1986) Радиобиология, 26, 844.
- Никольская И.И., Орлова М. А., Богаевская Е В. (1986) Радиобиология, 26, 477.
- Lynn R.R., Orpen G. (1969) Radiat.Res., 39, 15.
- Lynn K.R. (1971) Rad.Res., 46, 268.
- Орлова M. А. и др. (1994) Изв.АН, Сер.хим., 43, 1260.
- Кост О.А. и др. (1996) Изв.АН, Сер.хим., 45, 223.
- Орлова М.А., Мареева Е. А., Досеева ВВ., Газарян ИГ. (1994) Изв.АН, сер.хим., 43, 2230.
- Газарян И.Г., Досеева ВВ., Мареева Е. А., Орлова М. А. (1994) Изв.АН, сер.хим., 43, 2234.
- Орлова М.А. и др. (1995) Изв.АН, сер.хим., 44, 176.
- Газарян И Г. и др. (1995) Изв. АН, сер.хим., 44, 371.
- Mareeva Е.А. et al. (1996) Appl.Biochem. and Biotechnol., 61, No 1−2, 13.
- Мосолов В.В. Протеолитические ферменты, Наука, Москва, 1971, 225 с.
- Газарян И.Г., в сб. Итоги науки и техники, Биотехнология, ВИНИТИ, Москва, 1992, 36, 28.
- Пикаев А.К. Современная радиационная химия, Наука, Москва, 1986.
- Orlova М.А. et al. (2000) Appl.Biochem.Biotechnol., 88, 321.
- Орлова М.А. и др. (1994) Изв.АН, сер.хим., 43, 1322.
- Smulevich G., Miller M.A., Kraut J., Spiro T. (1991) Biochemistry, 5, 1843.
- Gazaryan I., Doseeva V., Galkin A., Tishkov V. (1994) FEBS Lett., 354, 248.
- Ortiz de Montellano P R. (1992) Ann.Rev.Pharmacol.Toxicol., 32, 89.
- Arnao M B. et al. (1990) Anal. Biochem, 185, 35.
- Орлова M.A. (1996) Изв.АН, сер.хим., 45, 2828.
- Баратова JI.A., Гуляев Н. Н., Филатов Э. С., Нестерова М. В., Северин Е С., Унукович М. С., Шишков А. В. (1980) Радиохимия, 22, 886.
- Баратова Л.А., Румянцев Ю. М., Симонов Э. С., Унукович М. С., Цырапкин В. А., Шишков А. В. (1981) Химия высоких энергий, 15, 370.
- Богачева Е.Н., Мороз А. П., Шишков А. В., Баратова Л. А. (1996) Молекулярная биология, 30, № 3, 637.
- Волынская А.В., Скрипкин А. Ю., Шишков А. В., Гольданский В. И. (1982) Докл. АН СССР, 226, 871.
- Орлова М.А. Диссер.канд.хим.наук, МГУ, Москва, 1980, 162 с.
- Mezinger М., Wolfgang R. (1969) J.Chem.Phys., 50, 2991.
- Mezinger М., Wolfgang R. (1967) J.Amer.Chem.Soc., 89, 5992.
- Gann R.J., Ollison W.M., Dubrin J. (1970) J.Amer.Chem.Soc., 92, 450.
- Kuppermann A., White J.M. (1966) J.Chem.Phys., 44, 4352.
- Гедрович A.B., Гольданский В. И., Румянцев Ю. М., Унукович М.С, Шишков А. В. (1984) Радиохимия, 26, 483.
- Золотарев Ю.А. и др. (1997) Изв.РАН, сер.хим., 46, 757.
- Klein R, Sheer M. D (1958) J.Phys.Chem, 62, 1011.
- Шишков A.B., Филатов Э. С., Симонов Е. Ф., Унукович М. С., Гольданский В. И., Несмеянов Ан.Н. (1976) Докл.АН СССР, 228, 1237.
- Абатуров Л.В., Лебедев Ю. О., Молчанова Т. П. В кн.: Равновесная динамика структуры биополимеров (ред. Э. А. Бурштейн, Л.В.Абатуров). Пущино, ЦНТИ, 1990, 49.
- Гоникберг Э.М., Дегтярев И. А., Унукович М. С. (1976) Докл. АН СССР, 229, 112.
- Эванс Э. Тритий и его соединения. Атомиздат, Москва, 1970, 312 с.
- Jaenicke R., Bucher J. (1993) Chematract-Biochem. and Mol. Biol., 4, 1.
- Benz F.M., Roberts G.C.K. (1975) J.Mol.Biol., 91, 367.
- Matheson R.R., Scheraga H.A. (1976) Biochemistry, 18, 2437.
- Chavez L G., acheragaH.A. (1980) Biochemistry, 19, 1005.
- Kim P. S., Baldwin R.L. (1980) Biochemistry, 19, 6124.
- Kuwajima К. (1989) Proteins: structure, Function and Genetics, 6, 87.
- Ptitsyn O.B. (1987) J.Protein.Chem., 6, 273.
- Shakchnovich E.I., Finkelstein A.V. (1989) Biopolymers, 28, 1681.
- Цоу Ч.-Jl. (1998) Биохимия, 63, вып. З, 300.
- Волынская A.B., Скрипкин А. Ю., Шишков A.B., Джафаров Э. С., Румянцев Ю. М., Гольданский В. И. (1985) Молекулярная биология, 19, 1294.
- Волынская A.B., Мурашева С. А., Скрипкин А. Ю., Шишков A.B., Гольданский В. И. (1989) Молекулярная биология, 23, 356.
- Волынская A.B., Касумов Э. А., Шишков A.B. (1998) Молекулярная биология, 32, 472.
- Джафаров Э.С., Алиев Л. А., Скрипкин А. Ю., Волынская A.B., Шишков A.B., Баратова Л. А., Гольданский В. И. (1985) Изв. АН АзСССР, 3, 102.
- Джафаров Э.С. (1991) Молекулярная биология, 25, 1412.
- Скрипкин А.Ю., Волынская A.B., Шишков A.B., Гольданский В. И. (1989) Молекулярная биология, 23, 365.
- Kasumov Е.А., Volynskaya A.V., Shishkov A.V., Goldanskii V.l. (1990) Stud.Biophys., 136, 167.
- Volynskaya A.V., Kasumov E.A., Bogacheva E.N., Shishkov AV, Goldanskii V.l. (1994)Europ. J. Biophys., 23, 139.
- Pace C.N. (1975) CRC Crit.Rev.Biochem., 3, 1.
- Saio J., Wada A. (1983) Biopolymers, 22, 2105.
- Ayvad F., Yaday S., Taneja S. (1992) Biochem J., 287,481.
- Pace C.N. (1986) Methods Enzymol., 131, 266.
- Tanford C. (1968) Adv. Protein Chem., 23, 121.
- Mayr L.M., Schmid F.X. (1993) Biochemistry, 32, 7994.
- Miller J.F., Bolen D.W. (1978) Biochem. and Biophys. Res. Commun., 81, 610.
- Kachalova G.S., Morozov V.N., Morozova T.Ya., Myachin E.T., Vagin A.A., Strokopytov B.V., Nekrasov Yu.V. (1991) FEBS Lett., 28, 91.
- Остерман JI.А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот. Электрофорез и ультрацентрифугирование. Наука, Москва, 1981, 56.
- Рарра H.S., Cass A.E.G. (1993) Eur.J.Biochem., 212, 227.
- Тимофеев-Ресовский Н.В., Савич А. В., Шальнов М. И. Введение в молекулярную радиобиологию, Медицина, Москва, 1981, 193 с.
- Kalb V.F., Bernlohr R.W. (1977) Analyt. Biochem., 82, 362.
- Furhop J.H., Smith K.M. In: Laboratory Methods. Porphyrins and Metalloproteins (Ed. K.M. Smith), Elsevier, Amsterdam, 1975, 757.
- Childs RE., Bardsley W.G. (1975) Biochem.J., 145, 93.
- Bhattacharyya D.K., Bandyopadhyay V, Banerjee R.K. (1992) J.Biol.Chem., 267, 9800.
- Portsmann Т., Portsmann B. (1985) J.Clin.Chem.Clin.Biochem., 23, 41.
- Biochimica Information. Ed. J. Keesey, Boehringer Mannheim Biochemicals. Indianapolis, 1987, 57.
- Gallati H. (1977) J.Clin.Chem.Clin.Biochem., 15, 699.
- Bielski BHD., Allen AO. (1977) J.Phys.Chem., 81, 1048.
- Shrake A., Rupley J.А. (1973) J.Mol.Biol., 79, 351.
- Smith A T., Sanders S.A., Thorneley R.N.F., Burke J.F., Bray R.R. (1992) Eur.J.Biochem, Jul 15, 207(2), 507.
- Perez U., Dunford H.B. (1990) Biochim. Biophys. Acta, Mar 29, 1038 (1), 98.
- Капелюх Ю Л. Диссер. канд. хим. наук. МГУ, Москва, 1998.
- Hernandez-Ruiz J., Arnao M B., Hiner A.N., Garcia-Canovas F, Acosta M. (2001) Biochem.J. 354(1), 107.
- Rodriguez-Lopez J.N., Hernandez-Ruiz J., Garcia-Canovas F., Thorneley R.N., Acosta M" Arnao M B. (1997) Biol. Chem, 272(9), 5469.
- Arnao MB, Acosta M, del Rio J A, Varon R, Garcia-Canovas F. (1990) Biochim.Biophys. Acta, 1041(1), 43.
- Adams G.E., Baverstock K.F., Cundall R.B., Redpath J.L. (1973) Radiat.Res., 54, 375.
- Бурлакова Е.Б. (1999) Российский Химический Журнал, 43, № 5, 3.
- Ortiz de Montellano P R. et al. In: Plant Peroxidases: Biochemistry and Physiology. (Ed. Welinder K.G. et al.) Geneve, Geneva Univ., 1993, 137.
- Ushijima Y, Nakano M., Takyu C., Inaba H. (1985) Biochem.Biophys.Res.Communications, Apr 30,128(2), 936.
- Rodriguez-Lopez J.N. et al. (2001) J.Am.Chem.Soc, Dec 5,123(48), 11 838.
- Sivaraja M., Goodin D.B., Smith M" Hoffman B.M. (1989) Science, 245 (4919), 738.
- Hiner A.M. et al. (2001) Eur.J.Biochem, 268(10), 3091.
- Ryabov A.D., Goral V. N., Gorton L" and Csoregi E. (1999) Chem-Eur.J., 5, N3, 961.
- Орлова M.А., Егоров В.A. (1999) Изв. АН РФ, сер. хим, 48, № 4, 664.
- Орлова М.А., Чубарь Т. А., Игнатенко О. В., Газарян И. Г. Изв. АН РФ, сер.хим., в печати.
- Tanaka М., Ishimori К., Morishima I. (1998) Biochemistry, 37(8), 2629.
- Nagano S. et al. (1996) Biochemistry, 35(45), 14 251.
- Edwards S.L., Raag R., Wariishi H" Gold M.H., Poulos T.L. (1993) ProcNatl. Acad.Sci. USA, 90 (2), 750.
- Gazaryan I.G. and Egorov A.M. In: Advances in Molecular and Cell Biology, Ed.E.E.Bittar, JAI Press Inc., Greenwich (Connecticut), 1996, 15A, 59.
- МарееваЕ.А. Дисс.канд.хим.наук, МГУ, Москва, 2002, 120 с.