ΠŸΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒ Π² написании студСнчСских Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚
АнтистрСссовый сСрвис

ΠšΠ»ΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ характСристика Π³Π΅Π½Π° ygjG ΠΈΠ· Escherichia coli K12

Π”ΠΈΡΡΠ΅Ρ€Ρ‚Π°Ρ†ΠΈΡΠŸΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒ Π² Π½Π°ΠΏΠΈΡΠ°Π½ΠΈΠΈΠ£Π·Π½Π°Ρ‚ΡŒ ΡΡ‚ΠΎΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒΠΌΠΎΠ΅ΠΉ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹

ЦСлью прСдставлСнной Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ являлась идСнтификация Π³Π΅Π½Π° E. coli, ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρƒ, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ конструированиС ΠΏΠ»Π°Π·ΠΌΠΈΠ΄, ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅Ρ‡ΠΈΠ²Π°ΡŽΡ‰ΠΈΡ… достаточно высокий ΡƒΡ€ΠΎΠ²Π΅Π½ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ†ΠΈΠΈ этого Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π° ΠΈ ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ основных физичСских ΠΈ ΠΊΠΈΠ½Π΅Ρ‚ичСских ΠΏΠ°Ρ€Π°ΠΌΠ΅Ρ‚Ρ€ΠΎΠ² ΠΎΡ‡ΠΈΡ‰Π΅Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚Π° ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρ‹. Π’ ΠΏΡ€ΠΎΡ†Π΅ΡΡΠ΅ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ Π±Ρ‹Π»ΠΈ Ρ€Π΅ΡˆΠ΅Π½Ρ‹ ΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Π·Π°Π΄Π°Ρ‡ΠΈ: Π’ΠΏΠ΅Ρ€Π²Ρ‹Π΅ ΠΈΠ΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΡ†ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ ΠΈ ΠΊΠ»ΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ Π³Π΅Π½ (ygjG), ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠΉ путрСсцин… Π§ΠΈΡ‚Π°Ρ‚ΡŒ Π΅Ρ‰Ρ‘ >

ΠšΠ»ΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ характСристика Π³Π΅Π½Π° ygjG ΠΈΠ· Escherichia coli K12 (Ρ€Π΅Ρ„Π΅Ρ€Π°Ρ‚, курсовая, Π΄ΠΈΠΏΠ»ΠΎΠΌ, ΠΊΠΎΠ½Ρ‚Ρ€ΠΎΠ»ΡŒΠ½Π°Ρ)

Π‘ΠΎΠ΄Π΅Ρ€ΠΆΠ°Π½ΠΈΠ΅

  • БПИБОК Π˜Π‘ΠŸΠžΠ›Π¬Π—Π£Π•ΠœΠ«Π₯ Π‘ΠžΠšΠ ΠΠ©Π•ΠΠ˜Π™

Π¦Π•Π›Π¬ И Π—ΠΠ”ΠΠ§Π˜ Π ΠΠ‘ΠžΠ’Π«.6.

НАУЧНАЯ ΠΠžΠ’Π˜Π—ΠΠ И ΠŸΠ ΠΠšΠ’Π˜Π§Π•Π‘ΠšΠΠ― Π—ΠΠΠ§Π˜ΠœΠžΠ‘Π’Π¬ Π ΠΠ‘ΠžΠ’Π«.7.

Π“Π»Π°Π²Π° 1. ΠžΠ‘Π—ΠžΠ  Π›Π˜Π’Π•Π ΠΠ’Π£Π Π«.8.

1.1. ΠŸΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½Ρ‹ Π² Escherichia coli.8.

1.1.1. Π­Ρ„Ρ„Π΅ΠΊΡ‚Ρ‹ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ² in vivo ΠΈ in vitro.8.

1.1.2. ΠŸΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½Ρ‹, прСдставлСнныС Π² E.coli.11.

1.1.3. ВлияниС ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ² Π½Π° Π°Π΄Π°ΠΏΡ‚Π°Ρ†ΠΈΡŽ Π•. coli Π² ΡƒΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΡΡ… стрСссов.12.

1.1.4. БиосинтСз ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ².15.

1.1.5. ΠšΠ°Ρ‚Π°Π±ΠΎΠ»ΠΈΠ·ΠΌ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ².20.

1.1.6. ВранспортныС систСмы ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ².27.

1.2. Ntr-ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚ E.coli.30.

1.2.1. Π”Π²Π° ΠΏΡƒΡ‚ΠΈ ассимиляция Π°Π·ΠΎΡ‚Π° Π² Π•. coli.30.

1.2.2. GS Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ. ΠœΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌ рСгуляции Ntr-ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚Π°.32.

1.2.3. Роль Π³Π»ΡƒΡ‚Π°ΠΌΠΈΠ½Π° ΠΈ Π°-ΠΊΠ΅Ρ‚ΠΎΠ³Π»ΡƒΡ‚Π°Ρ€Π°Ρ‚Π°.33.

1.2.4. Π’ΠΊΠ»Π°Π΄ GlnK ΠΈ AmtB Π² Ρ€Π΅Π³ΡƒΠ»ΡΡ†ΠΈΡŽ Ntr-ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚Π°.35.

1.2.5. ΠžΡΠΎΠ±Π΅Π½Π½ΠΎΡΡ‚ΠΈ Π°54 — зависимой транскрипции.36.

1.2.6. ΠŸΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ ст54-зависимых ΠΏΡ€ΠΎΠΌΠΎΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠ² ΠΈ ΡΠ°ΠΉΡ‚ΠΎΠ² связывания NRI39.

1.3. PLP-зависимыС аминотрансф Π΅Ρ€Π°Π·Ρ‹.41.

1.3.1. Π“Ρ€ΡƒΠΏΠΏΡ‹ PLP-зависимых аминотрансфСраз.42.

1.3.2. Π˜Π½Π²Π°Ρ€ΠΈΠ°Π½Ρ‚Π½Ρ‹Π΅ аминокислотныС остатки аминотрансфСраз.44.

1.3.3. Π­Π²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½Ρ‹Π΅ взаимосвязи ΠΌΠ΅ΠΆΠ΄Ρƒ PLP — зависимыми Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°ΠΌΠΈ.45.

Π“Π»Π°Π²Π° 2. ΠœΠΠ’Π•Π Π˜ΠΠ›Π« И ΠœΠ•Π’ΠžΠ”Π«.48.

2.1 Π‘Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ ΡˆΡ‚Π°ΠΌΠΌΡ‹.48.

2.1.1 ΠŸΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΡˆΡ‚Π°ΠΌΠΌΠ° MG1655 ptr+.48.

2.1.2 ΠŸΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΡˆΡ‚Π°ΠΌΠΌΠΎΠ² MG1655 ygjG ΠΈ MG1655 ptr+ ygjG.48.

2.2 Π‘Ρ€Π΅Π΄Ρ‹, условия ΠΊΡƒΠ»ΡŒΡ‚ΠΈΠ²ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΡˆΡ‚Π°ΠΌΠΌΠΎΠ² ΠΈ ΠΏΡ€ΠΈΠ³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π»ΠΈΠ·Π°Ρ‚ΠΎΠ² ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΠΊ.49.

2.3 ЭкспСримСнты с Ρ€Π΅ΠΊΠΎΠΌΠ±ΠΈΠ½Π°Π½Ρ‚Π½ΠΎΠΉ Π”ΠΠš.50.

2.3.1 Π“Π΅Π½Π½ΠΎ-ΠΈΠ½ΠΆΠ΅Π½Π΅Ρ€Π½Ρ‹Π΅ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎ Π΄ΠΈΠΊΠΈ.50.

β€’.

2.3.2 ΠšΠΎΠ½ΡΡ‚Ρ€ΡƒΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Ρ€Π΅ΠΊΠΎΠΌΠ±ΠΈΠ½Π°Π½Ρ‚Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠ»Π°Π·ΠΌΠΈΠ΄.51.

2.4 ΠžΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ старта транскрипции мРНК Π³Π΅Π½Π° ygjG.54.

2.5 Π’Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ ΠΎΡ‡ΠΈΡΡ‚ΠΊΠ° Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ².55.

2.5.1 ΠžΡΠ½ΠΎΠ²Π½Ρ‹Π΅ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄ΠΈΠΊΠΈ ΠΎΡ†Π΅Π½ΠΊΠΈ ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚ΠΎΠ² Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ².55.

2.5.2 Π’Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚ΠΎΠ² Ht-ORF 1 ΠΈ Ht-ORF2.55.

2.5.3 Π’Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π½Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚Π° YgjG.56.

2.5.4 ΠžΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΠ»ΠΈΠ³ΠΎΠΌΠ΅Ρ€Π½ΠΎΠΉ структуры Π½Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠ³ΠΎ YgjG.57.

2.6 Π˜Π·ΠΌΠ΅Ρ€Π΅Π½ΠΈΠ΅ энзиматичСских активностСй.57.

2.6.1 ΠœΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹ измСрСния энзиматичСских активностСй.57.

2.6.2 ΠžΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ основных физичСских ΠΈ ΠΊΠΈΠ½Π΅Ρ‚ичСских ΠΏΠ°Ρ€Π°ΠΌΠ΅Ρ‚Ρ€ΠΎΠ² ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚ΠΎΠ² ПАВаз .58.

2.7 ΠŸΡ€ΠΎΠ³Ρ€Π°ΠΌΠΌΡ‹, ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ для ΠΊΠΎΠΌΠΏΡŒΡŽΡ‚Π΅Ρ€Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π°.59.

Π“Π»Π°Π²Π° 3. РЕЗУЛЬВАВЫ И ΠžΠ‘Π‘Π£Π–Π”Π•ΠΠ˜Π•.61.

3.1 Π˜Π΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΡ ΠΈ ΠΊΠ»ΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Π³Π΅Π½Π° pat Escherichia coli К12, ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ путрСсцин: Π°-ΠΊΠ΅Ρ‚ΠΎΠ³Π»ΡƒΡ‚Π°Ρ€Π°Ρ‚ аминотрансфСразу.61.

3.1.1 Π˜Π΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΡ Π³Π΅Π½Π°, ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρƒ, Π² Ρ…ромосомС Π•. coli К12.61.

3.1.2 Амплификация 1,8-Ρ‚.ΠΏ.Π½. Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°, содСрТащСго ΡΡ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Π½ΡƒΡŽ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π³Π΅Π½Π° ygjG, Π² ΡΠΎΡΡ‚Π°Π²Π΅ ΠΌΡƒΠ»ΡŒΡ‚ΠΈΠΊΠΎΠΏΠΈΠΉΠ½ΠΎΠΉ ΠΏΠ»Π°Π·ΠΌΠΈΠ΄Ρ‹.63.

3.2 Π˜Π·ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ структурной ΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΠΈ 1,8-Ρ‚.ΠΏ.Π½. Ρ„Ρ€Π°Π³ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°, содСрТащСго Ρ€Π΅Π³ΡƒΠ»ΡΡ‚ΠΎΡ€Π½ΡƒΡŽ ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚ΡŒ ΠΈ ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΡƒΡŽ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π³Π΅Π½Π° ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρ‹.65.

3.2.1 Анализ Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ ygjG ΠΈ aer-ygjG мСТцистронного Ρ€Π°ΠΉΠΎΠ½Π° .65.

3.2.2 Π˜Π·ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ рСгуляции экспрСссии Π³Π΅Π½Π° ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρ‹.68.

3.2.3 ΠžΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ старта ΠΈΠ½ΠΈΡ†ΠΈΠ°Ρ†ΠΈΠΈ транскрипции Π³Π΅Π½Π° ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρ‹.71.

3.2.4 Анализ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚ΠΎΠ² трансляции orfl ΠΈ orf2.74.

3.3 Π₯арактСристика каталитичСской активности YgjG (ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρ‹) E.coli.77.

3.3.1 ЭкспрСссия ΠΈ Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ° ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π° выдСлСния Π±Π΅Π»ΠΊΠ° YgjG.78.

3.3.2 ΠžΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΠ»ΠΈΠ³ΠΎΠΌΠ΅Ρ€Π½ΠΎΠΉ структуры ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρ‹ Π•. coli.80.

3.3.3 Π₯арактСристика субстратной спСцифичности ΠΈ ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π½Ρ‹Ρ… физичСских ΠΈ ΠΊΠΈΠ½Π΅Ρ‚ичСских ΠΏΠ°Ρ€Π°ΠΌΠ΅Ρ‚Ρ€ΠΎΠ² ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚ΠΎΠ² Ht-YgjG ΠΈ YgjG.81.

3.4 ВлияниС аллСльного состояния Π³Π΅Π½Π° ygjG Π½Π° ΡƒΡ‚ΠΈΠ»ΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΡŽ путрСсцина.88.

3.5 Поиск гомологов бСлка YgjG.90.

Π’Π«Π’ΠžΠ”Π«.95.

БПИБОК Π›Π˜Π’Π•Π ΠΠ’Π£Π Π«

96.

БПИБОК Π˜Π‘ΠŸΠžΠ›Π¬Π—Π£Π•ΠœΠ«Π₯ Π‘ΠžΠšΠ ΠΠ©Π•ΠΠ˜Π™ ptr — путрСсцин ΠΏ.Π½. — ΠΏΠ°Ρ€Π° Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ…ΠΈΠ΄ΠΎΠ² Π°.ΠΊ.ΠΎ. — Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠΊΠΈΡΠ»ΠΎΡ‚Π½Ρ‹ΠΉ остаток.

RNAP — РНК-ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π°Π·Π°.

RBS — участок связывания рибосом.

SD ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Shine-Dalgarno.

ORF — открытая Ρ€Π°ΠΌΠΊΠ° считывания Π°-ΠšΠ“ — Π°-ΠΊΠ΅Ρ‚ΠΎΠ³Π»ΡƒΡ‚ΠΎΡ€Π°Ρ‚.

GABA — Ρƒ-Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ±ΡƒΡ‚ΠΈΡ€Π°Ρ‚.

ABAD — Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ±ΡƒΡ‚ΠΈΡ€Π°Π»ΡŒΠ΄Π΅Π³ΠΈΠ΄.

PLP — ΠΏΠΈΡ€ΠΈΠ΄ΠΎΠΊΡΠ°Π»ΡŒΡ„ΠΎΡΡ„Π°Ρ‚.

АВаза — аминотрансфСраза.

ПАВаза — путрСсцин аминотрансфСраза.

ABADDHa3a — Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ±ΡƒΡ‚ΠΈΡ€Π°Π»ΡŒΠ΄Π΅Π³ΠΈΠ΄ Π΄Π΅Π³ΠΈΠ΄Ρ€ΠΎΠ³Π΅Π½Π°Π·Π°.

GABAATa3a — Ρƒ-Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ±ΡƒΡ‚ΠΈΡ€Π°Ρ‚ трансаминаза.

SDHa3a — сукцинат Π΄Π΅Π³ΠΈΠ΄Ρ€ΠΎΠ³Π΅Π½Π°Π·Π°.

IPTG — ΠΈΠ·ΠΎΠΏΡ€ΠΎΠΏΠΈΠ» — p-D-Ρ‚ΠΈΠΎΠ³Π°Π»Π°ΠΊΡ‚ΠΎΠΏΠΈΡ€Π°Π½ΠΎΠ·ΠΈΠ΄.

Мг-молСкулярная масса.

SDS — Π΄ΠΎΠ΄Π΅Π΄ΠΈΠ»ΡΡƒΠ»ΡŒΡ„Π°Ρ‚ натрия.

АВР — Π°Π΄Π΅Π½ΠΎΠ·ΠΈΠ½ 5'- трифосфат.

ΠŸΠΠΠ“ — ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΊΡ€ΠΈΠ»Π°ΠΌΠΈΠ΄Π½Ρ‹ΠΉ гСль.

ПЦР — полимСразная цСпная рСакция.

EDTA — этилСндиаминтСтрауксусная кислота.

PMSF — Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΈΠ»ΡΡƒΠ»ΡŒΡ„ΠΎΠ½ΠΈΠ»Ρ„Ρ‚ΠΎΡ€ΠΈΠ΄.

DTT — Π΄ΠΈΡ‚ΠΈΠΎΡ‚Ρ€Π΅ΠΈΡ‚ΠΎΠ» (Ρ‚Ρ€Π΅ΠΎ-2,3-дигидрокси-1,4-Π΄ΠΈΠΌΠ΅Ρ€ΠΊΠ°ΠΏΡ‚ΠΎΠ±ΡƒΡ‚Π°Π½) dNTP — дизоксинуклСотид сАМР — циклоадСнозинмонофосфат.

ΠΠšΠ’Π£ΠΠ›Π¬ΠΠžΠ‘Π’Π¬ ΠŸΠ ΠžΠ‘Π›Π•ΠœΠ«.

ΠŸΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½Ρ‹ ΠΏΡ€ΠΈΡΡƒΡ‚ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ практичСски Π²ΠΎ Π²ΡΠ΅Ρ… Π²ΠΈΠ΄Π°Ρ… биологичСских ΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ², ΠΎΡ‚ Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ ΠΈ Π²ΠΈΡ€ΡƒΡΠΎΠ² Π΄ΠΎ Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ°, ΠΈ ΡƒΡ‡Π°ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ Π² ΠΎΠ³Ρ€ΠΎΠΌΠ½ΠΎΠΌ количСствС Ρ€Π°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±Ρ€Π°Π·Π½Ρ‹Ρ… биологичСских ΠΈ Π±ΠΈΠΎΡ…имичСских Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΉ, Π²ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°Ρ синтСз Π”ΠΠš, РНК ΠΈ Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ² [1−3]. ИсслСдованиС ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΠΊ ΠΏΡ€ΠΎΠΊΠ°Ρ€ΠΈΠΎΡ‚ ΠΈ ΡΡƒΠΊΠ°Ρ€ΠΈΠΎΡ‚ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π»ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π² Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠ°Ρ… Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‚ Π½Π΅ Ρ‚ΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΎ ΠΎΠ΄ΠΈΠ½Π°ΠΊΠΎΠ²Ρ‹Π΅ соСдинСния ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ² (Ρ‡Π°Ρ‰Π΅ всСго это путрСсцин, спСрмидин, спСрмин ΠΈ, сущСствСнно Ρ€Π΅ΠΆΠ΅, ΠΊΠ°Π΄Π°Π²Π΅Ρ€ΠΈΠ½), Π½ΠΎ Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ ΡƒΠ½ΠΈΠ²Π΅Ρ€ΡΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹ ΠΈ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΈΠ΅ этапы биосинтСза этих ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΊΠ°Ρ‚ΠΈΠΎΠ½ΠΎΠ² [4,5]. Π₯отя Π½Π΅ Π²Ρ‹Π·Ρ‹Π²Π°Π΅Ρ‚ сомнСний Ρ‚ΠΎΡ‚ Ρ„Π°ΠΊΡ‚, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½Ρ‹ Π²Ρ‹ΠΏΠΎΠ»Π½ΡΡŽΡ‚ Π²Π°ΠΆΠ½Ρ‹Π΅ физиологичСскиС Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΈ ΠΈ ΡΠΎΠ²Π΅Ρ€ΡˆΠ΅Π½Π½ΠΎ Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΡ‹ для обСспСчСния Π½ΠΎΡ€ΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠ³ΠΎ роста, ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΈΠ·Π±Ρ‹Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠ΅ Π½Π°ΠΊΠΎΠΏΠ»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ² Π² ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ΅ ΠΈΠ½Π³ΠΈΠ±ΠΈΡ€ΡƒΠ΅Ρ‚ синтСз Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ², Π²Ρ‹Π·Ρ‹Π²Π°Π΅Ρ‚ Π·Π°ΠΌΠ΅Π΄Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ роста, Π° Π² Π½Π΅ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… случаях ΠΏΡ€ΠΈΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ ΠΊ Π³ΠΈΠ±Π΅Π»ΠΈ ΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠ° [6]. АцСтилированиС ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ² ΠΏΠΎ Ρ‚Π°ΠΊ Π½Π°Π·Ρ‹Π²Π°Π΅ΠΌΠΎΠΌΡƒ Π°Ρ†Π΅Ρ‚ΠΈΠ»Π°Π·Π½ΠΎΠΌΡƒ ΠΏΡƒΡ‚ΠΈ Π΄Π΅Π³Ρ€Π°Π΄Π°Ρ†ΠΈΠΈ, ΠΏΠΎΠΌΠΎΠ³Π°Π΅Ρ‚ ΠΏΡ€Π΅Π΄ΠΎΡ‚Π²Ρ€Π°Ρ‚ΠΈΡ‚ΡŒ эффСкт токсичности ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ² ΠΊΠ°ΠΊ Π² ΠΏΡ€ΠΎ-, Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ Π² ΡΡƒΠΊΠ°Ρ€ΠΈΠΎΡ‚Π°Ρ… [4,7]. ΠžΠ±Ρ€Π°Π·ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ΡΡ ΠΏΡ€ΠΈ этом Π°Ρ†Π΅Ρ‚ΠΈΠ»ΠΏΡ€ΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄Π½Ρ‹Π΅ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ² Π΄Π°Π»Π΅Π΅ ΠΎΠΊΠΈΡΠ»ΡΡŽΡ‚ΡΡ полиаминоксидазами, Π΄Π΅Π°Ρ†Π΅Ρ‚ΠΈΠ»ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‚ΡΡ, Π»ΠΈΠ±ΠΎ ΡΠΊΡΠΊΡ€Π΅Ρ‚ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‚ΡΡ ΠΈΠ· ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠΈ [4,8]. Π£ Π½Π΅ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ² ΠΎΡ…Π°Ρ€Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ Π°Π»ΡŒΡ‚Π΅Ρ€Π½Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½Ρ‹ΠΉ аминотрансфСразный ΠΏΡƒΡ‚ΡŒ Π΄Π΅Π³Ρ€Π°Π΄Π°Ρ†ΠΈΠΈ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ².

НаиболСС ΠΏΠΎΠ΄Ρ€ΠΎΠ±Π½ΠΎ ΠΈΠ·ΡƒΡ‡Π΅Π½ аминотрансфСразный ΠΏΡƒΡ‚ΡŒ Π΄Π΅Π³Ρ€Π°Π΄Π°Ρ†ΠΈΠΈ путрСсцина Π² ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°Ρ… Escherichia coli. Показано, Ρ‡Ρ‚ΠΎ трансаминированиС путрСсцина, ΠΊΠ°Ρ‚Π°Π»ΠΈΠ·ΠΈΡ€ΡƒΠ΅ΠΌΠΎΠ΅ путрСсцин аминотрансфСразой (КЀ 2.6.1.29), ΠΈ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π΅ дСкарбоксилированиС ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎΡΡ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ±ΡƒΡ‚ΠΈΡ€Π°Π»ΡŒΠ΄Π΅Π³ΠΈΠ΄Π° приводят ΠΊ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡŽ Ρƒ-Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ±ΡƒΡ‚ΠΈΡ€Π°Ρ‚Π° (GABA), ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ΠΉ Π² Π΄Π°Π»ΡŒΠ½Π΅ΠΉΡˆΠ΅ΠΌ прСобразуСтся Π² ΡΡƒΠΊΡ†ΠΈΠ½Π°Ρ‚, Π²ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°ΡΡΡŒ Π² Ρ†ΠΈΠΊΠ» ΠšΡ€Π΅Π±ΡΠ° [9]. Π‘ΠΎΠ²ΠΎΠΊΡƒΠΏΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΉ биосинтСза путрСсцина ΠΈΠ· Π°Ρ€Π³ΠΈΠ½ΠΈΠ½Π° ΠΈ Π΅Π³ΠΎ Π΄Π΅Π³Ρ€Π°Π΄Π°Ρ†ΠΈΠΈ Π΄ΠΎ ΡΡƒΠΊΡ†ΠΈΠ½Π°Ρ‚Π° ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΡƒΡŽΡ‚ Ρ‚Π°ΠΊ Π½Π°Π·Ρ‹Π²Π°Π΅ΠΌΡ‹ΠΉ Π°Ρ€Π³ΠΈΠ½ΠΈΠ½ дСкарбоксилазный ΠΏΡƒΡ‚ΡŒ Π΄Π΅Π³Ρ€Π°Π΄Π°Ρ†ΠΈΠΈ Π°Ρ€Π³ΠΈΠ½ΠΈΠ½Π° (ADC) E.coli. Π‘Ρ‹Π»ΠΎ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ всС Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρ‹ ADC ΠΏΡƒΡ‚ΠΈ, Π·Π° ΠΈΡΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Π°Ρ€Π³ΠΈΠ½ΠΈΠ½ дСкарбоксилазы, ΠΈΠ½Π΄ΡƒΡ†ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‚ΡΡ Π² ΡƒΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΡΡ… Π°Π·ΠΎΡ‚Π½ΠΎΠ³ΠΎ голодания. Однако, нСсмотря Π½Π° Ρ‚ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ADC ΠΏΡƒΡ‚ΡŒ Π΄Π΅Π³Ρ€Π°Π΄Π°Ρ†ΠΈΠΈ E. coli достаточно Ρ…ΠΎΡ€ΠΎΡˆΠΎ ΠΎΡ…Π°Ρ€Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ ΠΊΠ°ΠΊ биохимичСски, Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ Π³Π΅Π½Π΅Ρ‚ичСски, Π΅Ρ‰Π΅ Π½Π΅ Π²ΡΠ΅ Π³Π΅Π½Ρ‹ этого ΠΏΡƒΡ‚ΠΈ ΠΊΠ°Ρ€Ρ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Ρ‹. Π’Π°ΠΊ Π΄ΠΎ ΡΠΈΡ… ΠΏΠΎΡ€ Π½Π΅ Π±Ρ‹Π»ΠΈ Π»ΠΎΠΊΠ°Π»ΠΈΠ·ΠΎΠ²Π°Π½Ρ‹ Π³Π΅Π½Ρ‹, ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π΅Π²Ρ‹Π΅ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρ‹ Π΄Π΅Π³Ρ€Π°Π΄Π°Ρ†ΠΈΠΈ ΠΏΡƒΡ‚Ρ€Π΅ΡΡ†ΠΈΠ½Π°ΠΏΠΈΡ€ΠΈΠ΄ΠΎΠΊΡΠ°Π»ΡŒΡ„ΠΎΡΡ„Π°Ρ‚ (PLP) — Π·Π°Π²ΠΈΡΠΈΠΌΡƒΡŽ путрСсцин: Π°-ΠΊΠ΅Ρ‚ΠΎΠ³Π»ΡƒΡ‚Π°Ρ€Π°Ρ‚ (Π°-ΠšΠ“) аминотрансфСразу (ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρƒ) ΠΈ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ±ΡƒΡ‚ΠΈΡ€Π°Π»ΡŒΠ΄Π΅Π³ΠΈΠ΄ Π΄Π΅Π³ΠΈΠ΄Ρ€ΠΎΠ³Π΅Π½Π°Π·Ρƒ (ABADDHa3y). ВслСдствиС Ρ‚ΠΎΠ³ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΡƒΡ€ΠΎΠ²Π΅Π½ΡŒ активности ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρ‹ Π΄Π°ΠΆΠ΅ Π² ΠΈΠ½Π΄ΡƒΡ†ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… условиях Π°Π·ΠΎΡ‚Π½ΠΎΠ³ΠΎ голодания Ρ‡Ρ€Π΅Π·Π²Ρ‹Ρ‡Π°ΠΉΠ½ΠΎ Π½ΠΈΠ·ΠΊΠΈΠΉ, ΠΈΠ·ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ этого Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π° Π΄ΠΎ ΡΠΈΡ… ΠΏΠΎΡ€ ΠΏΡ€ΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΠ»ΠΎΡΡŒ Ρ‚ΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΎ Π² ΠΌΡƒΡ‚Π°Π½Ρ‚Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎ ΡƒΡ‚ΠΈΠ»ΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΠΈ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ² ΠΈ GABA ΡˆΡ‚Π°ΠΌΠΌΠ°Ρ… E.coli. Π’ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ, ΠΏΠΎ ΡΡ‚ΠΎΠΉ ΠΏΡ€ΠΈΡ‡ΠΈΠ½Π΅ Π² Π½Π΅Π·Π°Π²ΠΈΡΠΈΠΌΠΎ Π²Ρ‹ΠΏΠΎΠ»Π½Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Ρ… Kim [10] ΠΈ Prieto-Santos [11] ΠΏΡ€ΠΈΠ²Π΅Π΄Π΅Π½Ρ‹ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΈΠ²ΠΎΡ€Π΅Ρ‡ΠΈΠ²Ρ‹Π΅ биохимичСскиС характСристики частично ΠΎΡ‡ΠΈΡ‰Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚ΠΎΠ² ПАВаз.

Π’ ΡΡ‚ΠΎΠΉ связи Π°ΠΊΡ‚ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ являСтся Π·Π°Π΄Π°Ρ‡Π° ΠΈΠ΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ Π³Π΅Π½Π° E. coli, ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρƒ, с ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄ΠΎΠ² Π±ΠΈΠΎΠΈΠ½Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠ°Ρ‚ΠΈΠΊΠΈ ΠΈ Π³Π΅Π½Π΅Ρ‚ичСской ΠΈΠ½ΠΆΠ΅Π½Π΅Ρ€ΠΈΠΈ, Π²Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π½Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠ³ΠΎ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π° ΠΈ ΠΈΠ·ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π΅Π³ΠΎ свойств соврСмСнными ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π°ΠΌΠΈ молСкулярной Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ.

Π¦Π•Π›Π¬ И Π—ΠΠ”Π Π§Π˜ Π ΠΠ‘ΠžΠ’Π«.

ЦСлью прСдставлСнной Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ являлась идСнтификация Π³Π΅Π½Π° E. coli, ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρƒ, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ конструированиС ΠΏΠ»Π°Π·ΠΌΠΈΠ΄, ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅Ρ‡ΠΈΠ²Π°ΡŽΡ‰ΠΈΡ… достаточно высокий ΡƒΡ€ΠΎΠ²Π΅Π½ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ†ΠΈΠΈ этого Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π° ΠΈ ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ основных физичСских ΠΈ ΠΊΠΈΠ½Π΅Ρ‚ичСских ΠΏΠ°Ρ€Π°ΠΌΠ΅Ρ‚Ρ€ΠΎΠ² ΠΎΡ‡ΠΈΡ‰Π΅Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚Π° ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρ‹. Π’ ΠΏΡ€ΠΎΡ†Π΅ΡΡΠ΅ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ Π±Ρ‹Π»ΠΈ Ρ€Π΅ΡˆΠ΅Π½Ρ‹ ΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Π·Π°Π΄Π°Ρ‡ΠΈ:

Π˜Π΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΡ Π³Π΅Π½Π°, ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρƒ, Π² Ρ…ромосомС ΡˆΡ‚Π°ΠΌΠΌΠ° E. coli К12 (Π³Π΅Π½ ygjG)-,.

Π˜Π·ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ Ntr-зависимой рСгуляции экспрСссии Π³Π΅Π½Π°ygjG;

ΠšΠΎΠ½ΡΡ‚Ρ€ΡƒΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ экспрСссионных ΠΏΠ»Π°Π·ΠΌΠΈΠ΄, ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅Ρ‡ΠΈΠ²Π°ΡŽΡ‰ΠΈΡ… ΡΡ„Ρ„Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΡƒΡŽ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ†ΠΈΡŽ ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρ‹ ΠΊΠ°ΠΊ Π² Π²ΠΈΠ΄Π΅ слитого Π±Π΅Π»ΠΊΠ° с his6-tag Π»ΠΈΠ΄Π΅Ρ€Π½Ρ‹ΠΌ ΠΏΠ΅ΠΏΡ‚ΠΈΠ΄ΠΎΠΌ (Ht-YgjG), Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ Π½Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π±Π΅Π»ΠΊΠ° (YgjG);

Π Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ° Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Π° Π²Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π±Π΅Π»ΠΊΠ° YgjG ΠΈΠ· Ρ€Π°ΡΡ‚Π²ΠΎΡ€ΠΈΠΌΠΎΠΉ Ρ„Ρ€Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π»ΠΈΠ·Π°Ρ‚ΠΎΠ² Ρ€Π΅ΠΊΠΎΠΌΠ±ΠΈΠ½Π°Π½Ρ‚Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡˆΡ‚Π°ΠΌΠΌΠ° E. coli;

ИсслСдованиС ΠΈ ΡΡ€Π°Π²Π½ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Π°Ρ характСристика каталитичСских активностСй ΠΈ Π½Π΅ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… основных физичСских ΠΈ ΠΊΠΈΠ½Π΅Ρ‚ичСских ΠΏΠ°Ρ€Π°ΠΌΠ΅Ρ‚Ρ€ΠΎΠ² ΠΎΡ‡ΠΈΡ‰Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚ΠΎΠ² YgjG ΠΈ Ht-YgjG.

НАУЧНАЯ ΠΠžΠ’Π˜Π—ΠΠ И ΠŸΠ ΠΠšΠ’Π˜Π§Π•Π‘ΠšΠΠ― Π—ΠΠΠ§Π˜ΠœΠžΠ‘Π’Π¬ Π ΠΠ‘ΠžΠ’Π«.

Π’ΠΏΠ΅Ρ€Π²Ρ‹Π΅ ΠΈΠ΄Π΅Π½Ρ‚ΠΈΡ„ΠΈΡ†ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ ΠΈ ΠΊΠ»ΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ Π³Π΅Π½ (ygjG), ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠΉ путрСсцин аминотрансфСразу Π² ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°Ρ… Escherichia coli К12. Π˜Π·ΡƒΡ‡Π΅Π½Π° Π΅Π³ΠΎ структурная организация ΠΈ Π²Ρ‹ΡΠ²Π»Π΅Π½Ρ‹ рСгуляторныС ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ, ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅Ρ‡ΠΈΠ²Π°ΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ ΠΎ54 -Π·Π°Π²ΠΈΡΠΈΠΌΡƒΡŽ ΠΈΠ½Π΄ΡƒΠΊΡ†ΠΈΡŽ экспрСссии ygjG Π² ΡƒΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΡΡ… Π°Π·ΠΎΡ‚Π½ΠΎΠ³ΠΎ голодания.

Π Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½Π° ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄ΠΈΠΊΠ° получСния Π²Ρ‹ΡΠΎΠΊΠΎΠΎΡ‡ΡˆΡ†Π΅Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚Π° каталитичСски Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π±Π΅Π»ΠΊΠ° YgjG ΠΈΠ· Π±ΠΈΠΎΠΌΠ°ΡΡΡ‹ Ρ€Π΅ΠΊΠΎΠΌΠ±ΠΈΠ½Π°Π½Ρ‚Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡˆΡ‚Π°ΠΌΠΌΠ° E.coli.

Показано, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ эффСктивно ΠΊΠ°Ρ‚Π°Π»ΠΈΠ·ΠΈΡ€ΡƒΠ΅Ρ‚ путрСсцин: Π°-ΠšΠ“ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΡ‚Ρ€Π°Π½ΡΡ„Π΅Ρ€Π°Π·Π½ΡƒΡŽ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΡŽ, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΊΠ°Π΄Π°Π²Π΅Ρ€ΠΈΠ½ ΠΈ, с ΠΌΠ΅Π½ΡŒΡˆΠ΅ΠΉ ΡΡ„Ρ„Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ, спСрмидин Π² ΠΊΠ°Ρ‡Π΅ΡΡ‚Π²Π΅ Π΄ΠΎΠ½ΠΎΡ€ΠΎΠ² Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ³Ρ€ΡƒΠΏΠΏ. Π€Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ тСрмостабилСн, Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π΅Π½ Π² Ρ‰Π΅Π»ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΌ Π΄ΠΈΠ°ΠΏΠ°Π·ΠΎΠ½Π΅ Π·Π½Π°Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠΉ рН ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΡΠ²Π»ΡΠ΅Ρ‚ максимум активности ΠΏΡ€ΠΈ рН 9.0 ΠΈ Ρ‚Π΅ΠΌΠΏΠ΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Π΅ 70 Β°C. Π˜Π½Ρ‚Π΅Ρ€Π΅ΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΎΡΠΎΠ±Π΅Π½Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π° являСтся Π΅Π³ΠΎ ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΊΠ°Ρ‚Π°Π»ΠΈΠ·ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Π³Π»ΡƒΡ‚Π°ΠΌΠ°Ρ‚: ΠΏΠΈΡ€ΡƒΠ²Π°Ρ‚ (GPT, КЀ 2.6.1.2) Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΡ‚Ρ€Π°Π½ΡΡ„Π΅Ρ€Π°Π·Π½ΡƒΡŽ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΡŽ. Ни ΠΎΠ΄Π½Π° ΠΈΠ· ΠΈΠ·Π²Π΅ΡΡ‚Π½Ρ‹Ρ… ΠΊ Π½Π°ΡΡ‚оящСму Π²Ρ€Π΅ΠΌΠ΅Π½ΠΈ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ аминотрансфСраз Π½Π΅ ΠΏΡ€ΠΎΡΠ²Π»ΡΠ΅Ρ‚ GPT активности. Бубстратная ΡΠΏΠ΅Ρ†ΠΈΡ„ΠΈΡ‡Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈ Ρ€Π Π·Π°Π²ΠΈΡΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒ активности YgjG ΡΠΎΠ²ΠΏΠ°Π΄Π°ΡŽΡ‚ с ΠΏΠ°Ρ€Π°ΠΌΠ΅Ρ‚Ρ€Π°ΠΌΠΈ ПАВ Π°Π·Ρ‹, Π²Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½ΠΎΠΉ Kim [10] ΠΈΠ· ΠΌΡƒΡ‚Π°Π½Ρ‚Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΏΠΎ ΡƒΡ‚ΠΈΠ»ΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΠΈ путрСсцина ΡˆΡ‚Π°ΠΌΠΌΠ° E. coli Π’6.

Π‘Ρ€Π°Π²Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ свойств ΠΎΡ‡ΠΈΡ‰Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚ΠΎΠ² YgjG ΠΈ Ht-YgjG, нСсущСго Π΄ΠΎΠΏΠΎΠ»Π½ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΡƒΡŽ his6-tag Π»ΠΈΠ΄Π΅Ρ€Π½ΡƒΡŽ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π½Π° N-ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π΅ Π±Π΅Π»ΠΊΠ°, ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π»ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ данная модификация N-ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π΅Π²ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ влияСт Π½Π° ΡΡƒΠ±ΡΡ‚Ρ€Π°Ρ‚Π½ΡƒΡŽ ΡΠΏΠ΅Ρ†ΠΈΡ„ΠΈΡ‡Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΈ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΡƒΡŽ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚Π°. Π’Π°ΠΊΠΆΠ΅, элиминация ΠΏΠ΅Ρ€Π²Ρ‹Ρ… 30 аминокислот YgjG ΠΏΡ€ΠΈΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ ΠΊ ΠΏΡ€Π°ΠΊΡ‚ичСски ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΡ‚Π΅Ρ€Π΅ активности Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°.

ΠŸΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½Π½Ρ‹Π΅ Π² Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π΅ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π½Ρ‹ для исслСдования ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ аминотрансфСраз Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΡ… ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠΎΡ€Π³Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ² ΠΈ Π΄Π»Ρ дальнСйшСго изучСния ΠΏΡƒΡ‚Π΅ΠΉ ΠΌΠ΅Ρ‚Π°Π±ΠΎΠ»ΠΈΠ·ΠΌΠ° ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ² Π² E.coli.

Π²Ρ‹Π²ΠΎΠ΄Ρ‹.

1. ΠšΠ»ΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ Π³Π΅Π½ ygjG E. coli К12 MG1655 ΠΈ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ аннотированная ΠΊΠ°ΠΊ ΠΎΡ€Π½ΠΈΡ‚ΠΈΠ½ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΡ‚Ρ€Π°Π½Π΅Ρ„Π΅Ρ€Π°Π·Π° ORF ygjG ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΠ΅Ρ‚ ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρƒ — Π±Π΅Π»ΠΎΠΊ, ΠΎΠ±Π»Π°Π΄Π°ΡŽΡ‰ΠΈΠΉ путрСсцин: Π°-ΠΊΠ΅Ρ‚ΠΎΠ³Π»ΡƒΡ‚Π°Ρ€Π°Ρ‚ аминотрансфСразной Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ ΠΈ ΡΡ„Ρ„Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎ ΠΊΠ°Ρ‚Π°Π»ΠΈΠ·ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠΉ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΡŽ пСрСаминирования ΠΊΠ°Π΄Π°Π²Π΅Ρ€ΠΈΠ½Π°.

2. Показано, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π°54 -зависимая экспрСссия ygjG индуцируСтся Π² ΡƒΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΡΡ… Π°Π·ΠΎΡ‚Π½ΠΎΠ³ΠΎ голодания. ΠžΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ старт транскрипции мРНК ygjG ΠΈ ΡΡ‚Π°Ρ€Ρ‚ΠΎΠ²Ρ‹ΠΉ ΠΊΠΎΠ΄ΠΎΠ½ (UUG) трансляции YgjG.

3. Бконструированы Ρ€Π΅ΠΊΠΎΠΌΠ±ΠΈΠ½Π°Π½Ρ‚Π½Ρ‹Π΅ ΠΏΠ»Π°Π·ΠΌΠΈΠ΄Ρ‹, ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅Ρ‡ΠΈΠ²Π°ΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ ΡΡ„Ρ„Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΡƒΡŽ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ†ΠΈΡŽ YgjG ΠΊΠ°ΠΊ Π² Π²ΠΈΠ΄Π΅ слитого с his6-tag Π»ΠΈΠ΄Π΅Ρ€ΠΎΠΌ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΏΠ΅ΠΏΡ‚ΠΈΠ΄Π° (Ht-YgjG) Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ Π² Π²ΠΈΠ΄Π΅ Π½Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π±Π΅Π»ΠΊΠ°. Π Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄ выдСлСния ΠΈ ΠΎΡ‡ΠΈΡΡ‚ΠΊΠΈ Π½Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π±Π΅Π»ΠΊΠ° ΠΈ ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½Ρ‹ высокоочищСнныС ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚Ρ‹ YgjG ΠΈ Ht-YgjG.

4. Π˜ΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½Ρ‹ субстратная ΡΠΏΠ΅Ρ†ΠΈΡ„ΠΈΡ‡Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΎΠ±ΠΎΠΈΡ… Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ² ΠΈ ΠΈΡ… ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π½Ρ‹Π΅ кинСтичСскиС ΠΏΠ°Ρ€Π°ΠΌΠ΅Ρ‚Ρ€Ρ‹ Π² Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΡΡ… трансаминирования с ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ путрСсцина, ΠΊΠ°Π΄Π°Π²Π΅Ρ€ΠΈΠ½Π° ΠΈ ΡΠΏΠ΅Ρ€ΠΌΠΈΠ΄ΠΈΠ½Π° Π² ΠΊΠ°Ρ‡Π΅ΡΡ‚Π²Π΅ Π΄ΠΎΠ½ΠΎΡ€ΠΎΠ² ΠΈ Π°-ΠΊΠ΅Ρ‚ΠΎΠ³Π»ΡƒΡ‚Π°Ρ€Π°Ρ‚Π° Π² ΠΊΠ°Ρ‡Π΅ΡΡ‚Π²Π΅ Π°ΠΊΡ†Π΅ΠΏΡ‚ΠΎΡ€Π° Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ³Ρ€ΡƒΠΏΠΏ. ΠžΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Ρ‹ рН ΠΈ Ρ‚СмпСратурная зависимости Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠΉ активности ΠŸΠΠ’Π°Π·Ρ‹ YgjG.

ΠŸΠΎΠΊΠ°Π·Π°Ρ‚ΡŒ вСсь тСкст

Бписок Π»ΠΈΡ‚Π΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Ρ‹

  1. Abraham ΠšΠ: Studies on DNA-dependent RNA polymerase from Escherichia coli. 1. The mechanism of polyamine induced stimulation of enzyme activity.
  2. Eur JBiochem 1968, 5: 143−146.
  3. Frydman L, Rossomando PC, Frydman V, Fernandez CO, Frydman B, Samejima K- Interactions between natural polyamines and tRNA: an 15N NMR analysis. Proc Natl Acad Sci USA 1992,1: 9186−9190.
  4. Igarashi K, Kashiwagi K: Polyamines: mysterious modulators of cellularfunctions. Biochem Biophys Res Commun 2000, 271: 559−564.
  5. Pegg AE: Recent advances in the biochemistry of polyamines in eukaryotes.
  6. Biochem J1986,234: 249−262.
  7. Tabor CW, Tabor H: Polyamines in microorganisms. Microbiol Rev 1985, 49: 81−99.
  8. He Y, Kashiwagi K, Fnkuchi J, Terao K, Shirahata A, Igarashi K: Correlation between the inhibition of cell growth by accumulated polyamines and the decrease of magnesium and ATP. Eur J Biochem 1993, 217: 89−96.
  9. Matsui I, Kamei M, Otani S, Morisawa S, Pegg AE: Occurence and induction of spermidine iVl-acetyltransferase in Escherichia coli. Biochem Biophys Res Commun 1982, 106: 1155−1160.
  10. Ignatenko NA, Fish JL, Shassetz DP, Woolridge DP, Gerner EW: Expression of the human spermidine/spermine iVl-acetyltransferase in spermidine acetylation-deficient Escherichia coli. Biochem J1996, 319: 435−440.
  11. Snaibe E, Metzer E, Halpern YS: Metabolic pathway for the utilization of L-arginine, L-ornithine, agmathine, and putrescine as nitrogen sourses in
  12. Escherichia coliK-12. JBacteriol 1985,163: 933−937.
  13. Kim KH: Purification and properties of a diamine a-ketoglutarate transaminase from Escherichia coli. J Biol Chem 1964, 239: 783−786.
  14. Prieto-Santos MI, Martin-Checa J, Balana-Force R, Garrido-Pertierra A: A pathway for putrescine catabolism in Escherichia coli. Biochim Biophys Acta 1986, 880: 242−244.
  15. Tabor H, Tabor CW: Biosynthesis and metabolism of 1,4-diaminobutane, spermidine, spermine and related amines. Adv Enzymol Relat Areas Mol Biol 1972, 36: 203−268.
  16. Капо K, Oka T: Polyamine transport and metabolism in mouse mammary gland. General properties and hormonal regulation. J Biol Chem 1976, 10: 2795−2800.
  17. Kakinuma Y, Hoshino K, Igarashi K: Characterization of the inducible polyamine transporter in bovine lymphocytes. Eur JBiochem 1988,15: 409 414.
  18. Tabor H, Hafner EW, Tabor CW.: Construction of an Escherichia coli strain unable to synthesize putrescine, spermidine, or cadaverine: characterization of two genes controlling lysine decarboxylase. JBacteriol 1980,144: 952−956.
  19. Tabor H, Hafner EW, Tabor CW: Mutants of Escherichia coli that do not contain 1,4-diaminobutane (putrescine) or spermidine. J Biol Chern 1979, 254: 12 419−12 426.
  20. Algranati ID, Echandi G, Goldemberg SH, Cunningham-Rundles S, Maas WK: Ribosomal distribution in a polyamine auxotroph of Escherichia coli. J
  21. Bacteriol 1975,124: 1122−1127.
  22. Algranati ID, Goldemberg SH: Initiation, elongation and termination of polypeptide synthesis in cell-free systems from polyamine-deficient bacteria.
  23. Biochem Biophys Res Commun 1981,103: 8−15.
  24. Goldemberg SH, Fernandez-Velasсо JG, Algranati ID: Differential binding of streptomycin to ribosomes of polyamine-deficient bacteria grown in the absence and presence of putrescine. FEBSLet 1982,142: 275−279.
  25. Goldemberg SH, Algranati ID: Polyamine requirement for streptomycin action on protein synthesis in bacteria. Eur J Biochem 1981,117: 251−255.
  26. Mitsui K, Igarashi K, Kakegawa T, Hirose S: Preferential stimulation of the in vivo synthesis of a protein by polyamines in Escherichia coli'. purification and properties of the specific protein. Biochemistry 1984, 23: 2679−2683.
  27. Mitsui K, Ohnishi R, Hirose S, Igarashi K: Necessity of polyamines for maximum in vivo synthesis of beta beta' subunits of RNA polymerase.
  28. Biochem Biophys Res Commun 1984,123: 528−534.
  29. Raina A, Janne J: Polyamines as cellular regulators. Med Biol 1981, 59: 461.
  30. Sakai TT, Cohen SS: Effects of polyamines on the structure and reactivity of tRNA. Prog Nucleic Acid Res Mol Biol 1976,17: 15−42.
  31. Abraham AK: Effect of polyamines on the fidelity of macromolecular synthesis. Med Biol 1981, 59: 368−373.
  32. Geiger LE, Morris DR: Stimulation of deoxyribonucleic acid replication fork movement by spermidine analogs in polyamine-deficient Escherichia coli. J
  33. Bacteriol 1980,141: 1192−8-1198.
  34. Jorstad CM, Harada JJ, Morris DR: Structural specificity of the spermidine requirement of an Escherichia coli auxotroph. J Π’acteriol 1980,141: 456−463.
  35. Gorini L: The contrasting role of strA and ram gene products in ribosomal functioning. Quant Biol. 101−109.
  36. Schiller D, Kruse D, Kneifel H, Kramer R, Burkovski A.: Polyamine transport and role of potE in response to osmotic stress in Escherichia coli. JBacteriol 2000,182: 6247−6249.
  37. Bachrach U, Persky S, Razin S: Metabolism of amines. Biochem J1960, 76: 306 310.
  38. Tabor H, Tabor CW: Formation of 1,4-diaminobutane and of spermidine by an ornithine auxotroph of Escherichia coli grown on limiting ornithine or arginine. J Biol Chem 1963, 244: 2286−2292.
  39. Goldemberg SH: Lysine decarboxylase mutants of Escherichia coli: evidence for two enzyme forms. J Bacteriol 1980,141: 1428−1431.
  40. Dover S, Halpern YS: Utilization of y-aminobutyric acid as the sole carbon and nitrogen source by Escherichia coli K-12 mutants. J Bacteriol 1972,109: 835−843.
  41. Tkachenko AG, Salakhetdinova Ola, Pshenichnov MR: Role of putrescine and potassium transport in the adaptation of Escherichia coli to ammonium starvation. Mikrobiologiia 1996, 65: 740−744.
  42. Balke VL, Gralla JD: Changes in the linking number of supercoiled DNA accompany growth transitions in Escherichia coli. J Bacteriol 1987,169: 44 994 506.
  43. Tkachenko AG, Pshenichnov MR, Nesterova Liu: Putrescine as an oxidative stress protecting factor in Escherichia coli. Mikrobiologiia 2001, 70: 487−494.
  44. Tkachenko AG, Nesterova Liu: The role of putrescine in of oxidative stress defense genes expression regulation in Escherichia coli. Mikrobiologiia 2001, 70: 168−173.
  45. Ha HC, Yager JD, Woster PA, Casero RA Jr: Structural specificity of polyamines and polyamine analogues in the protection of DNA from strand breaks induced by reactive oxygen species. Biochem Biophys Res Commun 1998, 244: 298−303.
  46. Lin J, Smith MP, Chapin КБ, Baik HS, Bennett GN, Foster JW: Mechanisms of acid resistance in enterohemorrhagic Escherichia coli. Appl Environ Microbiol 1996, 62: 3094−3100.
  47. Blankenhorn D, Phillips J, Slonczewski JL: Acid- and base-induced proteins during aerobic and anaerobic growth of Escherichia coli revealed by two-dimensional gel electrophoresis. J Bacterial 1999,181: 2209−2216.
  48. Stancik LM, Stancik DM, Schmidt B, Barnhart DM, Yoncheva YN, Slonczewski JL: pH-dependent expression of periplasmic proteins and amino acid catabolism in Escherichia coli. J Π’acteriol 2002,184: 4246−4258.
  49. Zilberstein D, Agmon V, Schuldiner S, Padan E: Escherichia coli intracellular pH, membrane potential, and cell growth. J Π’ acteriol 1984,158: 246−252.
  50. Booth IR: Regulation of cytoplasmic pH in bacteria. Microbiol Rev 1985, 49: 359−378.
  51. Tkachenko AG, Chudinov AA, Nagorskikh TG: Role of the energy status and putrescine transport in the maintenance of the intracellular pH homeostasis in the course of alkaline and acidic shifts in Escherichia coli. Mikrobiologiia 1993, 62: 37−45.
  52. Meng SY, Bennett GN: Regulation of the Escherichia coli cad operon: location of a site required for acid induction. J Π’ acteriol 1992,174: 2670−2678.
  53. Samartzidou H, Delcour AH.: Excretion of endogenous cadaverine leads to a decrease in porin-mediated outer membrane permeability. JBacteriol 1999, 181: 791−798.
  54. Samartzidou H, Delcour AH: Distinct sensitivities of OmpF and PhoE porins to charged modulators. FEBS Lett 1999, 444: 65−70.
  55. Glansdorff N: Biosynthesis of arginine and polyamines. In Escherichia coli and Salmonella: cellular and molecular biology. Edited by Neidhardt FC, Curtiss R, Ingraham JL, Lin EC, Low KB, Magasanik Π’ et al. Washington, DC: ASM Press- 1996.
  56. Morris DR, Boeker EA: Biosynthetic and biodegradative ornithine and arginine decarboxylases from Escherichia coli. Methods Enzymol 1983, 94: 134.
  57. Davis RH, Morris DR, Coffino P: Sequestered end products and enzyme regulation: the case of ornithine decarboxylase. Microbiol Rev 1992, 56: 280 290.
  58. Blethen SL, Boeker EA, Snell EE: Arginine decarboxylase from Escherichia coli. I. Purification and specificity for substrates and coenzyme. J Biol Chem 1968, 243: 1671−1677.
  59. Nowak S, Boeker EA: The inducible arginine decarboxylase of Escherichia coli B: activity of the dimer and the decamer. Arch Biochem Biophys 2003, 207: 110−116.
  60. Morris DR, Fillingame RH: Regulation of amino acid decarboxylation. Anna Rev Biochem 1974, 43: 303−325.
  61. Boeker EA, Fischer EH, Snell EE: Arginine decarboxylase from Escherichia coli. 3. Subunit structure. J Biol Chem 1969, 244: 5239−5245.
  62. Boyle SM, Markham GD, Hafner EW, Wright JM, Tabor H, Tabor CW: Expression of the cloned genes encoding the putrescine biosynthetic enzymes and methionine adenosyltransferase of Escherichia coli (speA, speB, speC and metK). Gene 1984, 30: 129−136.
  63. Wu WH, Morris DR: Biosynthetic arginine decarboxylase from Escherichia coli. Purification and properties. J Biol Chem 2003, 248: 1687−1695.
  64. Wu WH, Morris DR: Biosynthetic arginine decarboxylase from Escherichia coli. Subunit interactions and the role of magnesium ion. J Biol Chem 1973, 248: 1696−1699.
  65. Morris DR, Jorstad CM: Growth and macromolecular composition of a mutant of Escherichia coli during polyamine limitation. JBacteriol 1973,113: 271 277.
  66. Satishchandran C, Boyle SM: Purification and properties of agmatine ureohydrolyase, a putrescine biosynthetic enzyme in Escherichia coli. J
  67. Bacteriol 1986,165: 843−848.
  68. Morris DR, Koffron KL: Urea production and putrescine biosynthesis by Escherichia coli. J Bacteriol 1967, 94: 1516−1519.
  69. Tabor CW, Tabor H: Methionine adenosyltransferase (S-adenosylmethionine synthetase) and S-adenosylmethionine decarboxylase. Adv Enzymol Relat Areas Mol Biol 1984, 56: 282.
  70. Tabor CW, Tabor H: Putrescine aminopropyltransferase (Escherichia coli).
  71. Methods Enzymol 1983, 94: 265−270.
  72. Sabo DL, Boeker EA, Byers B, Waron H, Fischer EH: Purification and physical properties of inducible Escherichia coli lysine decarboxylase. Biochemistry 1974,13: 662−670.
  73. Igarashi K, Kashiwagi K, Hamasaki H, Miura A, Kakegawa T, Hirose S et al.: Formation of a compensatory polyamine by Escherichia coli polyamine-requiring mutants during growth in the absence of polyamines. J Bacteriol 1986,166: 128−134.
  74. Dubin DT, Rosenthal SM: 1960. The acetylation of polyamines in E.coli. J Biol Chem 1960, 235: 776−782.
  75. Tabor CW, Dobbs LG: Metabolism of 1,4-diaminobutane and spermidine in Escherichia coli: the effects of low temperature during storage and harvesting of cultures. J Biol Chem 2003, 245: 2086−2091.
  76. Kashiwagi K, Hosokawa N, Furuchi T, Kobayashi H, Sasakawa C, Yoshikawa M et ah: Isolation of polyamine transport-deficient mutants of Escherichia coli and cloning of the genes for polyamine transport proteins. J Biol Chem 1990, 165: 20 893−20 897.
  77. Matsui I, Kamei M, Otani S, Morisawa S, Pegg AE- Occurrence and induction of spermidine-Nl-acetyltransferase in Escherichia coli. Biochem Biophys Res Commun 1982, 106: 1155−1160.
  78. Fukuchi J, Kashiwagi K, Takio K, Igarashi K: Properties and structure of spermidine acetyltransferase in Escherichia coli. J Biol Chem 1994, 269: 22 581−22 585.
  79. Kwon DS, Lin CH, Chen S, Coward JK, Walsh CT, Bollinger JM Jr: Dissection of glutathionylspermidine synthetase/amidase from Escherichia coli into autonomously folding and functional synthetase and amidase domains. J Biol Chem 1997, 272: 2429−2436.
  80. Smith K, Borges A, Ariyanayagam MR, Fairlamb AH: Glutathionylspermidine metabolism in Escherichia coli. Biochem J1995, 312: 465−469.
  81. Dover S, Halpern YS: Utilization of y-aminobutyric acid as the sole carbon and nitrogen source by Escherichia coli K-12 mutants. J Π’acteriol 1972,109: 835−843.
  82. Michaels R, Kim KH: Comparative studies of putrescine degradation by microorganisms. Biochim Biophys Acta 1966,115: 59−64.
  83. Friedrich B, Magasanik B: Enzymes of agmatine degradation and the control of their synthesis in Klebsiella aerogenes. JBacteriol 1979,137: 1127−1133.
  84. Yonaha K, Suzuki K, Minei H, Toyama S: Distribution of «-amino acid: pyruvate transaminase and aminobutyrate: a-ketoglutarate transaminase in microorganisms. Agric Biol Chem 1983, 47: 2257−2265.
  85. Lu CD, Itoh Y, Nakada Y, Jiang Y: Functional analysis and regulation of the divergent spuABCDEFGH-spul operons for polyamine uptake and utilization in Pseudomonas aeruginosa PAOl. J Π’ acteriol 2002,184: 3765−3773.
  86. Yorifuji T, Kondo S, Shimizu E, Naka T, Ishihara T: Purification and characterization of polyamine aminotransferase of Arthrobacter sp. TMP-1. J
  87. Biochem (Tokyo) 1997,122(3):537−43.
  88. Prieto MI, Martin J, Balana-Fouce R., Garrido-Pertierra A.: Properties of y-aminobutyraldehyde dehydrogenase from Escherichia coli. Biochimie 1987, 69: 1161−1168.
  89. Cooper RA, Skinner MA: Catabolism of 3- and 4-hydroxyphenylacetate by the 3,4-dihydroxyphenylacetate pathway in Escherichia coli. J Π’ acteriol 1980, 143: 302−306.
  90. Metzer E, Levitz R, Halpern YS: Isolation and properties of Escherichia coli К-12 mutants impaired in the utilization of gamma-aminobutyrate. JBacteriol 1979,137: 1111−1118.
  91. Donnelly MI, Cooper RA: Succinic semialdehyde dehydrogenases of Escherichia coli'. their role in the degradation of hydroxyphenylacetate and gamma-aminobutyrate. Eur J Π’ iochem 1981,113: 555−561.
  92. Bacteriol 1990,172: 7035−7042.
  93. Niegemann E, Scliulz A, Bartsch K: Molecular organization of the Escherichia coli gab cluster: nucleotide sequence of the structural genes gabD and gabP and expression of the GABA permease gene. Arch Microbiol 1993,160: 454 460.
  94. Schneider BL, Ruback S, Kiupakis AK, Kasbarian H, Pybus C, Reitzer L: The Escherichia coli gabDTPC operon: specific gamma-aminobutyrate catabolism and nonspecific induction. J Bacteriol 2002, 184: 6976−6986.
  95. Snaibe E, Metzer E, Halpern YS: Control of utilization of L-arginine, L-ornithine, agmathine, and putrescine as nitrogen sources in Escherichia coli K-12. J Bacteriol 1985,163: 938−942.
  96. Zimmer DP, Soupene E, Lee HL, Wendisch VF, Khodursky AB, Peter Π’ J et al.: Nitrogen regulatory protein C-controlled genes of Escherichia coli: scavenging as a defense against nitrogen limitation. Proc Natl Acad Sci USA 2000, 97: 14 674−14 679.
  97. Zaboura M, Halpern YS: Regulation of gamma-aminobutyric acid degradation in Escherichia coli by nitrogen metabolism enzymes. J Bacteriol 1978,133: 447−451.
  98. Ullman A, Danchin A: Role of cyclic AMP in bacteria. Adv Cycl Nucl Rec 1983, 15: 1−53.
  99. McFall E, Newman EB: Amino acids as carbon sources. In Escherichia coli and Salmonella: cellular and molecular biology. Edited by Lin EC, Low KB, Magasanik B, Reznikoff WS, Riley M, Schaechter M et al. Washington, D. C.: ASM Press- 1996.
  100. Large PJ: Enzymes and pathways of polyamine breakdown in microorganisms. FEMS Microbiol Rev 1992, 88: 249−262.
  101. Kashiwagi K, Igarashi K: Adjustment of polyamine contents in Escherichia coli. J Bacteriol 1988,170: 3131−3135.
  102. Kashiwagi K, Hosokawa N, Furuchi T, Kobayashi H, Sasakawa C, Yoshikawa M et al.: Isolation of polyamine transport-deficient mutants of Escherichia coli and cloning of the genes for polyamine transport proteins. J Biol Chem 1990, 265: 20 893−20 897.
  103. Pistocchi R, Kashiwagi K, Miyamoto S, Nukui E, Sadakata Y, Kobayashi H et al.: Characteristics of the operon for a putrescine transport system that maps at 19 minutes on the Escherichia coli chromosome. J Biol Chem 1993, 268: 146 152.
  104. Furuchi T, Kashiwagi K, Kobayashi H, Igarashi K: Characteristics of the gene for a spermidine and putrescine transport system that maps at 15 min on the
  105. Escherichia coli chromosome. J Biol Chem 1992, 266: 20 928−20 933.
  106. Igarashi K, Kashiwagi K: Polyamine transport in bacteria and yeast. Biochem J 1999, 344: 633−642.
  107. Kashiwagi K, Miyamoto S, Suzuki F, Kobayashi H, Igarashi K: Excretion of putrescine by the putrescine-ornithine antiporter encoded by thepotE gene of Escherichia coli. Proc Natl Acad Sci USA 1992, 89: 4529−4533.
  108. Kashiwagi K, Suzuki T, Suzuki F, Furuchi T, Kobayashi H, Igarashi K: Coexistence of the genes for putrescine transport protein and ornithine decarboxylase at 16 min on Escherichia coli chromosome. J Biol Chem 2003, 266: 20 922−20 927.
  109. Vassylyev DG, Tomitori H, Kashiwagi K, Morikawa K, Igarashi K: Crystal structure and mutational analysis of the Escherichia coli putrescine receptor. Structural basis for substrate specificity. J Biol Chem 1998, 273: 17 604−17 609.
  110. Kashiwagi K, Kuraishi A, Tomitori H, Igarashi A, Nishimura K, Shirahata A et al.: Identification of the putrescine recognition site on polyamine transport protein PotE. J Biol Chem 2000,275: 36 007−36 012.
  111. Meng SY, Bennett GN: Regulation of the Escherichia coli cad operon: location of a site required for acid induction. J Bacteriol 1992,174: 2670−2678.
  112. Gong S, Richard H, Foster JW: YjdE (AdiC) is the arginine: agmatine antiporter essential for arginine-dependent acid resistance in Escherichia coli. J Bacteriol 2003,185: 4402−4409.
  113. Iyer R, Williams C, Miller C: Arginine-agmatine antiporter in extreme acid resistance in Escherichia coli. J Bacteriol 2003,185: 6556−6561.
  114. Molenaar D, Bosscher JS, ten Brink B, Driessen AJ, Konings W: Generation of a proton motive force by histidine decarboxylation and electrogenic histidine/histamine antiport in Lactobacillus buchneri. J Bacteriol 1993,175: 2864−2870.
  115. Meng SY, Bennett GN: Nucleotide sequence of the Escherichia coli cad operon: a system for neutralization of low extracellular pH. J Bacteriol 1992, 174: 2659−2669.
  116. Takayama M, Ohyama T, Igarashi K, Kobayashi H: Escherichia coli cad operon functions as a supplier of carbon dioxide. Mol Microbiol 1994,11: 913−918.
  117. Reitzer LJ: Sources of nitrogen and their utilization. In Escherichia coli and Salmonella: cellular and molecular biology. Edited by Lin EC, Low KB, Magasanik B, Reznikoff WS, Riley M, Schaechter M et al. Washington, D.C.: ASM Press- 1996.
  118. Magasanik Π’: Regulation of nitrogen utilization. In Escherichia coli and Salmonella: cellular and molecular biology. Edited by Lin EC, Low KB, Magasanik B, Reznikoff WS, Riley M, Schaechter M et al. Washington, D.C.: ASM Press- 1996:1344−1356.
  119. Reitzer L, Schneider BL: Metabolic context and possible phisiological thermesof c54-dependent genes in Escherichia coli. Microbiology and molecular biology reviews 2001, 65: 422−444.
  120. Meers JL, Tempest DW, Brown CM: Glutamine (amide):2-oxogIutarate amino transferase oxido-reductase (NADP) — an enzyme involved in the synthesis of glutamate by some bacteria. J Gen Microbiol 1970, 64: 187−194.
  121. Jiang P, Peliska JA, Ninfa AJ: The regulation of Escherichia coli glutamine synthetase revisited: role of a-ketoglutarate in the regulation of glutamine synthetase adenylylation state. Biochemistry 1998, 37: 12 802−12 810.
  122. Rustu S, Hirschman J, Burton D, Jelesko J, Meeks JC: Covalent modification of bacterial glutamine synthetase: physiological significance. Mol Gen Genet 1984, 197: 309−317.
  123. Adler SP, Punch D, Stadtman ER: Cascade control of Escherichia coli glutamine synthetase. Properties of the PII regulatory protein and the uridylyltransferase-uridylyl-removing enzyme. J Biol Chem 1975, 250: 62 646 272.
  124. Jiang P, Peliska JA, Ninfa AJ.: Reconstitution of the signal-transduction bicyclic cascade responsible for the regulation of Ntr gene transcription in
  125. Escherichia coli. Biochemistry 1998, 37: 12 795−12 801.
  126. Microbiol 1996, 21: 133−146.
  127. Atkinson MR, Ninfa AJ: Characterization of the GlnK protein of Escherichia coli. Mol Microbiol 1999, 32: 301−313.
  128. Atkinson MR, Blauwkamp ВА, Bondarenko V, Studitsky V, Ninfa AJ: Activation of the glnA, glnK, and nac promoters as Escherichia coli undergoes the transition from nitrogen excess growth to nitrogen starvation. J Π’ acteriol 2002,184: 5358−5363.
  129. Blauwkamp ВА, Ninfa AJ: Physiological role of the GlnK signal transduction protein of Escherichia coli: survival of nitrogen starvation. Mol Microbiol 2002, 46: 203−214.
  130. Soupene E, Lee H, Kustu S: Ammonium/methylammonium transport (Amt) proteins facilitate diffusion of NH3 bidirectionally. Proc Natl Acad Sci USA 2002, 99: 3926−3931.
  131. Blauwkamp ВА, Ninfa AJ: Antagonism of PII signalling by the AmtB protein of Escherichia coli. Mol Microbiol 2003, 48: 1017−1028.
  132. Coutts G, Thomas G, Blakey D, Merrick M. Membrane sequestration of the signal transduction protein GlnK by the ammonium transporter AmtB.1. EMBO J 21, 536−545. 2002.
  133. Buck M, Gallegos M-T, Studholme DJ, Guo Y, Gralla JD: The bacterial enhancer-dependent o54 (oN) transcription factor. JBacteriol 2000,182: 41 294 136.
  134. Wang YP, Kolb A, Buck M, Wen J, O’Gara F, Buc H: CRP interacts with promoter-bound sigma54 RNA polymerase and blocks transcriptional activation of the dctA promoter. EMBOJ1998,17: 786−796.
  135. Popham DL, Szeto D, Keener J, Kustu S: Function of a bacterial activator protein that binds to transcriptional enhancers. Science 1989, 243: 629−635.
  136. Wang L, Gralla JD: Multiple in vivo roles for the -12-region elements of o54promoters. J Bacteriol 1998,180: 5626−5631.
  137. Guo Y, Gralla JD: Promoter opening via a DNA fork junction binding activity.
  138. Proc Natl Acad Sci USA 1998, 95: 11 655−11 660.
  139. Barrios H, Valderrama B, Morett E: Compilation and analysis of sigma (54)-dependent promoter sequences. Nucleic Acids Res 1999, 27: 4305−4313.
  140. John RA: Pyridoxal phosphate-dependent enzymes. Biochim Biophys Acta 1995,1248: 81−96.
  141. Alexander FW, Sandmeier E, Mehta PK, Christen P: Evolutionary relationships among pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzymes. Regio-specific alpha, beta and gamma families. Eur J Biochem 1994, 219: 953−960.
  142. Gribskov M, McLachlan AD, Eisenberg D: Profile analysis: detection of distantly related proteins. Proc Natl Acad Sci USA 1987, 84: 4355−4358.
  143. Mehta PK, Hale TI, Christen P: Aminotransferases: demonstration of homology and division into evolutionary subgroups. Eur J Biochem 1993, 214: 549−561.
  144. Luthy R, Xenarios I, Bucher P: Improving the sensitivity of the sequence profile method. Protein Sci 1994, 3: 139−146.
  145. Ovchinnikov YA, Egorov CA, Aldanova NA, Feigina MY, Lipkin VM, Abdulaev NG et al.: The complete amino acid sequence of cytoplasmic aspartate aminotransferase from pig heart. FEBS Lett 1973, 29: 31−34.
  146. Kirsch JF, Eichele G, Ford GC, Vincent MG, Jansonius JN, Gehring H et al.: Mechanism of action of aspartate aminotransferase proposed on the basis of its spatial structure. JMolBiol 1984,174: 497−525.
  147. McPhalen CA, Vincent MG, Picot D, Jansonius JN, Lesk AM, Chothia C: Domain closure in mitochondrial aspartate aminotransferase. J Mol Biol 1992, 227: 197−213.
  148. Shen BW, Hennig M, Hohenester E, Jansonius JN, Schirmer T: Crystal structure of human recombinant ornithine aminotransferase. J Mol Biol 1998,227: 81 102.
  149. Gallagher T, Snell EE, Hackert ML: Pyruvoyl-dependent histidine decarboxylase. Active site structure and mechanistic analysis. J Biol Chem 1989, 264:12 737−12 743.
  150. Ziak M, Jager J, Malashkevich VN, Gehring H, Jaussi R, Jansonius JN et al.: Mutant aspartate aminotransferase (K258H) without pyridoxal-5'-phosphate-binding lysine residue. Structural and catalytic properties. Eur J Biochem 1993, 211: 475−484.
  151. Ziak M, Jaussi R, Gehring H, Christen P: Aspartate aminotransferase with the pyridoxal-5'-phosphate-binding lysine residue replaced by histidine retains partial catalytic competence. Eur J Biochem 1990,187: 329−333.
  152. Jansonius JN, Eichele G, Ford GC, Kirsch JF, Picot D, Thaller Π‘ et al.: Crystallographic studies on the mechanism of action of mitochondrial aspartate aminotransferase. Prog Clin Biol Res 1984,144: 195−203.
  153. Picot D, Sandmeier E, Thaller C, Vincent MG, Christen P, Jansonius JN: The open/closed conformational equilibrium of aspartate aminotransferase. Studies in the crystalline state and with a fluorescent probe in solution. Eur J
  154. Biochem 1991,196: 329−341.
  155. Cronin CN, Kirsch JF: Role of arginine-292 in the substrate specificity of aspartate aminotransferase as examined by site-directed mutagenesis.
  156. Biochemistry 1988, 27: 4572−4579.
  157. Inoue Y, Kuramitsu S, Inoue K, Kagamiyama H, Hiromi K, Tanase S et al.: Substitution of a lysine residue for arginine 386 of Escherichia coli aspartate aminotransferase. J Biol Chem 1989, 264: 9673−9681.
  158. Danishefsky AT, Onnufer JJ, Petsko GA, Ringe D: Activity and structure of the active-site mutants R386Y and R386 °F of Escherichia coli aspartate aminotransferase. Biochemistry 1991, 30: 1980−1985.
  159. Hyde CC, Ahmed SA, Padlan EA, Miles EW, Davies DR: Three-dimensional structure of the tryptophan synthase alpha 2 beta 2 multienzyme complex from Salmonella typhimurium. J Biol Chem 1988, 263: 17 857−17 871.
  160. Pan P, Jaussi R, Gehring H, Giannattasio S, Christen P: Shift in pH-rate profile and enhanced discrimination between dicarboxylic and aromatic substrates in mitochondrial aspartate aminotransferase Y70H. Biochemistry 1994, 33: 2757−2760.
  161. Hayashi H, Kuramitsu S, Inoue Y, Morino Y, Kagamiyama H: Arg292—ValJ or [Arg292—Leu. mutation enhances the reactivity of Escherichia coli aspartate aminotransferase with aromatic amino acids. Biochem Biophys Res Commun 1989, 159: 337−342.
  162. Pan P, Jakob CA, Sandmeier E, Christen P, Gehring H: Modulation of the activity of mitochondrial aspartate aminotransferase H352C by the redoxstate of the engineered interdomain disulfide bond. J Biol Chem 1994, 269: 25 432−25 436.
  163. Guyer MS, Reed RR, Steitz JA, Low KB: Identification of a sex-factor-affinity site in E. coli as gamma delta. Cold Spring Harb Symp Quant Biol 1981, 45: 135−140.
  164. Maniatis T, Fritsch E, Sambrook T: Molecular cloning. Cold Spring Harbor Laboratory- 1982.
  165. Studier FM, Rosenberg AH, Dunn JJ, Dubendorff JM: Use of T7 RNA polymerase to direct expression of cloned gene. Meth Enzymol 1990,185: 6089.
  166. Datsenko KA, Wanner BL: One-step inactivation of chromosomal genes in Escherichia coli K-12 using PCR products. Proc Natl Acad Sci USA 2000,97: 6640−6645.
  167. Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T: Moleccular cloning: a laboratory manual., 2nd ed. edn. Cold Spring Harbor, N.Y.- 1989.
  168. Sanger F, Nicklen S, Coulson AR: DNA sequencing with chain-terminatinginhibitors. Proc Natl Acad Sci USA 1977, 74: 5463−5467.
  169. Groisman EA, Casadaban MJ: Mini-mu bacteriophage with plasmid replicons for in vivo cloning and lac gene fusing. J Bacteriol 1986, 168: 357−364.
  170. Ptitsyn LR, Fatova MA, Stepanov Al: Expression of the bioluminescence system of Photobacterium leiognathi in E. coli. Mol Gen Mikrobiol Virusol Russian 1990,16: 26−29.
  171. Laemmli UK: Cleavage of structural proteins during the assemblay of the head of bacteriophage T4. Nature Landon 1970, 227: 680−685.
  172. Bradford MM: A rapid and sensitive method of for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding.
  173. Anal Biochem 1976, 72: 248−254.
  174. Miller J: Experiments in molecular genetics. Cold Spring Harbor, N. Y: 1972.
  175. Brenner M, Niederwieser A, Pataki G: Thin layer chromatography. Aminoacids and derivatives. In Laboratory handbook (E.StahlrEds.). New York: Springer-Verlag- 1969:730−786.
  176. SamsonovaN.N., Smirnov S.V., Altman I.B., Ptitsyn L.R.: Molecular cloning and characterization of Escherichia coli K12 ygjG gene. BMC Microbiol 2003, 3:2.
  177. Jakoby WB, Fredericks J: Pyrrolidine and putrescine metabolism: j-aminobutyraldehyde dehydrogenase. J Biol Chem 1959, 234: 2145−2150.
  178. Madduri К, Stuttard Π‘, Vining LC: Lysine catabolism in Streptomyces spp: is primarily through cadaverine: beta-lactam producers also make alpha-aminoadipate. J Bacteriol 1989,171: 302.
  179. Cornish-Bowden A.: Principles of enzyme kinetics. In Lecturer in biochemistry, University of Birmingham. Edited by Phil D. Sydney-Willington-Durban-Toronto: Butterworths.- 1979.
  180. Blattner F.R., Plunkett III G., Bloch C.A., Perna Π’., Burland V., Riley M. et at.: The complete genome sequence of Escherichia coli K-12. Science 1997, 277: 1453−1474.
  181. Marquardt DW. An algorithm for list squares estimation of parameters. J Soc Ind Appl Math 11, 431−441.1963.
  182. Edwards JS, Pals son BO: The Escherichia coli MG1655 in silico metabolic genotype: its definition, characteristics, and capabilities. Proc Natl Acad Sci USA 2000, 97: 5528−5533.
  183. Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ: Basic local alignment search tool. JMolBiol 1990, 215: 403−410.
  184. M., Serres M.H. : Interim report on genomics of Escherichia coli. Annu Rev Microbiol 2000, 54: 341−411.
  185. Parsons GD, Donly Π’Π‘, Mackie GA: Mutations in the leader sequence and initiation codon of the gene for ribosomal protein S20 (rpsT) affect both translational efficiency and autoregulation. J Bacteriol 1988,170: 2485−2492.
  186. Makrides SC: Strategies for achievning high-level expression of genes in Escherichia coli. Microbiol Rev 1996, 60: 512−538.
  187. Studier FW, Moffatt BA: Use of bacteriophage T7 RNA polymerase to direct selective high-level expression of cloned genes. JMolBiol 1986,189: 113−130.
  188. Wang MD, Buckley L, Berg CM: Cloning of genes that suppress an Escherichia coli K-12 alanine auxotroph when present in multicopy plasmids.
  189. J Bacteriol 1987,169: 5610−5614.
Π—Π°ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡƒ Ρ‚Π΅ΠΊΡƒΡ‰Π΅ΠΉ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΎΠΉ