Оценка эффективности прогнозирования хромосомной патологии у плода на основе нейросетевого моделирования
В группе изолированных УЗ маркеров наибольшую прогностическую значимость имели: увеличение ТВП (ОР=6,7), кистозная гигрома шеи (ОР=47,9), синдром Денди-Уокера (ОР=23,6), ВПС (ОР=8,9), ВЗРП (ОР=11,0). Максимальная прогностическая значимость отмечена в группе сочетанных УЗ маркеров, включавших: расщелины лица (ОР= 153,2), синдром Денди-Уокера (ОР=98,9), кистозная гигрома шеи (ОР=73,3), омфалоцеле… Читать ещё >
Оценка эффективности прогнозирования хромосомной патологии у плода на основе нейросетевого моделирования (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Содержание
- ГЛАВА 1. Проблема врожденной и наследственной патологии. Возможности пренатальной диагностики врожденных пороков развития и хромосомной патологии
- 1. 1. Общее состояние проблемы врожденных пороков развития и наследственных заболеваний
- 1. 2. Современные методы диагностики и пути профилактики врожденных пороков развития и наследственных заболеваний
- 1. 2. 1. Исследование уровня эмбриональных гормонов
- 1. 2. 2. Ультразвуковое исследование
- 1. 2. 3. Инвазивные методы пренатальной диагностики
- 1. 2. 4. Пренатальная цитогенетика
- 1. 2. 5. Медико-генетическое консультирование
- 1. 3. Роль скринирующих программ в профилактике и снижении врожденных пороков развития и наследственных заболеваний
- 1. 4. Использование искусственных нейронных сетей в медицине
- ГЛАВА 2. Материал и методы исследования
- 2. 1. Материал исследования
- 2. 2. Методы исследования
- 2. 2. 1. Методы сбора информации
- 2. 2. 2. Исследование уровня фетальных гормонов
- 2. 2. 3. Ультразвуковое исследование
- 2. 2. 4. Методы инвазивной пренатальной диагностики
- 2. 2. 5. Верификация патологоанатомического диагноза
- 2. 2. 6. Статистическая обработка материала
- 3. 1. Результаты биохимического скрининга при формировании группы риска по хромосомным аномалиям у плода для проведения инвазивных методов пренатальной диагностики
- 3. 2. Результаты эхографии в пренатальной диагностике хромосомных аномалий у плода
- 4. 2. Частота возникновения хромосомных аномалий у плода в различных возрастных группах
- 4. 3. Эффективность скринирующих программ в пренатальной диагностике синдрома Дауна у плода
- 5. 1. Показатели значимости различных факторов риска при хромосомных аномалиях у плода
Актуальность темы
.
Дородовая диагностика хромосомных аберраций остается одной из основных проблем пренатальной диагностики. Несмотря на повсеместное распространение ультразвуковых методов исследования в акушерстве, попытки внедрения различных скрининговых программ в практику дородовых обследований, количество детей родившихся с хромосомными аномалиями не уменьшается [Кулаков В.И., Бочков Н. П., 2003; Feuchtbaum L., Respondek М., 2002].
По данным ВОЗ, 2,5% всех новорожденных имеют различные пороки развития, из них 1,5% обусловлены действием неблагоприятных экзогенных факторов во время беременности, остальные имеют преимущественно генетическую природу. Около 40−50% ранней младенческой смертности и инвалидности с детства также обусловлены наследственными факторами, и примерно 30% коек в детских стационарах заняты детьми с наследственной патологией [Бочков Н.П., 2001; Olsen C.L., 2003; Carol J., 2002]. В Красноярском крае в 2002 году врожденные пороки развития и наследственные заболевания составили 2,7% среди всех новорожденных, в.
2003 — 3,35%. В структуре младенческой смертности, а также детской инвалидности врожденные пороки развития и наследственные заболевания занимают второе место. В структуре причин детской инвалидности в 2003 году данная патология составила 35,9% на 10 тыс. детского населения (в РФ — 35,7% на 10 тыс.). Количество детей-инвалидов с врожденными пороками развития и наследственными заболеваниями в Красноярском крае на 1 января.
2004 г. — составляло 2429 человек [Материалы государственного доклада по Красноярскому краю за 2003 год].
Патология хромосом является причиной многих врожденных пороков развития. Например, пороки сердца встречаются у 8−10 новорожденных на 1000, при этом 5% этих пороков вызваны хромосомными аномалиями.
Частота хромосомных аббераций у плодов значительно выше, чем у новорожденных, поскольку эта патология в большинстве случаев приводит к антенатальной гибели. Отличительной особенностью хромосомных аномалий является то, что чаще всего они возникают в результате de novo мутаций, поэтому не существует профилактических мер, позволяющих предотвратить их возникновение. Кроме того, во многих случаях эти заболевания не имеют ярких фенотипических проявлений в пренатальном периоде [Юдина Е.В., Медведев М. В., 2000; Chen С., 2001; Finnell R.H., 2002].
О состоянии плода судят по различным показателям. Биохимические исследования маркерных сывороточных белков, равно как ультразвуковые исследования, в настоящее время рассматривают как обязательные скринирующие методы дородовой диагностики, направленной на выявление беременных групп высокого риска рождения детей с пороками развития и хромосомными болезнями. Основная роль в формировании групп риска, принадлежит медико-генетическому консультированию, в процессе которого определяется стратегия пренатальной диагностики с использованием инвазивных методов [Юдина Е.В., Медведев М. В., 2002; Den Hollander N.S., 2002; Kesmodel U., 2002]. Инвазивные методы пренатальной диагностики позволяют получить достаточно полную информацию о кариотипе зародыша на основании соответствующих исследований ткани самого плода или его провизорных органов.
Особую актуальность приобретает проблема выделения из общего потока беременных, угрожаемых по рождению ребенка с хромосомными аномалиями, и нуждающихся в более подробном обследовании. — пренатальном кариотипировании. Настоящее исследование посвящено проблеме повышения эффективности формирования показаний для проведения инвазивной диагностики, на основе индивидуального подхода к оценке имеющихся у беременной факторов риска.
Цель исследования:
Разработать методику формирования групп для проведения инвазивных методов диагностики и вероятностного прогнозирования аномального кариотипа у плода путем использования программы нейросетевого моделирования, основанной на выявленных факторах риска. Задачи исследования:
1. Оценить информативность биохимического скрининга в формировании группы риска среди женщин Красноярского края по наличию хромосомных аномалий плода.
2. Изучить диагностическую значимость изолированных и сочетанных эхографических маркеров в диагностике аномального кариотипа у плода по данным Красноярского медико-генетического центра.
3. Оценить прогностическую значимость сочетанных показаний к проведению пренатального кариотипирования у беременных Красноярского края.
4. На основании использования искусственных нейронных сетей разработать алгоритм прогнозирования хромосомных аномалий плода с целью определения показаний к пренатальному кариотипированию.
5. Изучить динамику выявляемости синдрома Дауна на пренатальном этапе по данным Красноярского медико-генетического центра в результате использования методики нейросетевого моделирования.
Научная новизна На основании изученной прогностической значимости различных методов пренатальной диагностики и выявленных факторов риска развития хромосомных аномалий у плода среди женщин Красноярского края впервые был разработан метод индивидуального прогнозирования аномального кариотипа у плода с помощью искусственных нейронных сетей.
Впервые проведена оценка эффективности прогнозирования хромосомной патологии у плода на основе нейросетевого моделирования.
Использование данного метода позволит повысить эффективность пренатального консультирования и индивидуализировать показания к инвазивным методам диагностики хромосомных аномалий у плода.
Практическая значимость работы:
По результатам исследования с помощью искусственных нейронных сетей определены критерии, позволяющие наиболее эффективно формировать группу риска по хромосомным аномалиям у плода. Использование данного подхода к формированию показаний к пренатальному кариотипированию, позволило сократить количество неоправданных инвазивных процедур на 25,5%, уменьшить число осложнений до 1% и увеличить выявляемость хромосомных аномалий на пренатальном этапе на 30%.
Разработаны и внедрены в работу Межрегионального Красноярского диагностического центра медицинской генетики, Центральной городской больницы г. Дивногорска методические рекомендации «Инвазивные методы пренатальной диагностики хромосомных заболеваний у плода (показания, противопоказания)».
Результаты исследования используются в учебном процессе на кафедрах перинатологии, акушерства и гинекологии, педиатрии КрасГМА при подготовке врачей-интернов, врачей-ординаторов, в системе последипломного образования, в работе врачей женских консультаций и диагностических пренатальных центров.
Апробация работы и публикации:
Результаты работы доложены и обсуждены на VI съезде Российской ассоциации врачей ультразвуковой диагностики в перинатологии и гинекологии (Красноярск, 2000), Краевой научно-практической конференции акушеров-гинекологов (Красноярск, 2000; 2002), IV Всероссийской научно-практической конференции «Инфекционные и генетические поражения плода» (Красноярск, 2003), IV съезде врачей ультразвуковой диагностики.
Поволжья (Казань 2003), I конференции специалистов пренатальной диагностики Сибири (Красноярск, 2004), междисциплинарной проблемной комиссии (Красноярск 2005).
По теме диссертации опубликовано 9 печатных работ: 5 статей в рецензируемых журналах, 3 тезисов в материалах съездов, 1 учебно-методическое пособие.
Обьем и структура работы.
Диссертация изложена на 149 страницах машинописного текста, состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, 3 глав собственных исследований, обсуждения полученных результатов, выводов, практических рекомендаций, списка цитируемой литературы. Указатель литературы включает 236 источников, в том числе 94 отечественных и 142 зарубежных.
ВЫВОДЫ:
1. При оценке значимости различных факторов риска нейросетевая модель определила высокую прогностическую значимость данных биохимического скрининга только при прогнозировании синдрома Дауна и синдрома Эдвардса, для остальных хромосомных аномалий чувствительность сывороточных маркеров оказалась низкой.
2. В группе изолированных УЗ маркеров наибольшую прогностическую значимость имели: увеличение ТВП (ОР=6,7), кистозная гигрома шеи (ОР=47,9), синдром Денди-Уокера (ОР=23,6), ВПС (ОР=8,9), ВЗРП (ОР=11,0). Максимальная прогностическая значимость отмечена в группе сочетанных УЗ маркеров, включавших: расщелины лица (ОР= 153,2), синдром Денди-Уокера (ОР=98,9), кистозная гигрома шеи (ОР=73,3), омфалоцеле (ОР=49,5), атрезия ДПК (36,5), многоводие (ОР=23,6), голопрозэнцефалия (ОР=23,6), ВПС (ОР=22,8), увеличение ТВП (ОР=17,9), укорочение трубчатых костей (ОР=Т1,9).
3. По данным медико-генетического центра г. Красноярска наибольшее количество хромосомных аномалий — 39% диагностируется при сочетании ультразвуковых изменений и отклонений сывороточных маркеров, а также комбинации эхографических отклонений и возраста — 21%.
4. Разработанная на базе исскуственных нейронных сетей методика прогнозирования хромосомных аномалий у плода обладает высокой чувствительностью — 72,6%> и специфичностью 69,6%, что позволяет сузить показания для пренатального кариотипирования и повысить частоту выявляемое&tradeплодов с хромосомными аномалиями.
5. Использование метода нейросетевого моделирования для формирования группы риска по хромосомным аномалиям у плода, с целью проведения пренатального кариотипирования, позволило повысить выявляемость синдрома Дауна на пренатальном этапе с 39,1% до 72,7%.
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ:
1. Врачам женских консультаций и акушерам-гинекологам других учреждений здравоохранения целесообразно учитывать, что отклонения уровней сывороточных маркеров следует рассматривать как аргумент для более глубокого обследования беременной женщины.
2. Необходимо проведение оценки степени риска рождения ребенка с хромосомной патологией по результатам пренатальных скринирующих программ и имеющихся факторов риска с использованием нейросетевой экспертной программы, на 12 и 22 неделях беременности.
3. Рекомендуется использовать при пренатальном консультировании компьютерную экспертную систему, учитывающую все выявленные факторы риска, что позволит индивидуализировать показания к проведению инвазивных методов пренатальной диагностики.