Помощь в написании студенческих работ
Антистрессовый сервис

Создание и изучение биологических свойств кандидатных ДНК-вакцин против ВИЧ

Диссертация: Создание и изучение биологических свойств кандидатных ДНК-вакцин против ВИЧ
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Впервые был получен отечественный препарат кандидатной ДНК-вакцины против ВИЧ-инфекции, несущий фрагменты генов российского штамма ВИЧ-1 субтипа А, и всесторонне изучены его биологические свойства. Разработанная оригинальная векторная система обеспечивает эффективную экспрессию антигенов и адъювантность кандидатных ДНК-вакцин в системе in vitro. Модификация последовательности гена nef штамма… Читать ещё >

Создание и изучение биологических свойств кандидатных ДНК-вакцин против ВИЧ (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Содержание

  • СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ
  • 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Особенности развития ВИЧ-инфекции и возможность создания вакцины против ВИЧ
      • 1. 1. 1. Развитие ВИЧ-инфекции и уход вируса из-под иммунной атаки
      • 1. 1. 2. Перспективность вакцинирования против ВИЧ-инфекции
      • 1. 1. 3. Значимость ЦТЛ-ответа при вакцинации против ВИЧ-инфекции
      • 1. 1. 4. Значимость IgG-ответа при вакцинации против ВИЧ-инфекции
      • 1. 1. 5. Значимость хелперного ответа, опосредованного CD4+ Т-лимфоцитами, при вакцинации против ВИЧ-инфекции
    • 1. 2. ДНК-вакцины
      • 1. 2. 1. Структура и отдельные элементы ДНК-вакцины
      • 1. 2. 2. Потенциальные преимущества ДНК-вакцин перед традиционными подходами
      • 1. 2. 3. Экспрессия и презентация антигена, специфика иммунного ответа
      • 1. 2. 4. Эффективность трансформации и возможность интеграции в геном
      • 1. 2. 5. Самоадъювация ДНК-вакцин за счет CpG последовательностей
      • 1. 2. 6. Иммунологическое усиление ДНК-вакцин
    • 1. 3. ДНК-вакцины против ВИЧ
      • 1. 3. 1. Возможность создания субтипической и субтип-независимой вакцины
      • 1. 3. 2. ДНК-вакцина как прайм при иммунизации
      • 1. 3. 3. Доклинические и клинические испытания ДНК-вакцин против ВИЧ-инфекции, проводящиеся в мире
    • 1. 4. Методы очистки ДНК-вакцин и стандарты их качества
      • 1. 4. 1. Различные методы очистки ДНК-вакцин
      • 1. 4. 2. Контроль качества препаратов ДНК-вакцин
  • 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
    • 2. 1. Методы генно-инженерных манипуляций с ДНК
      • 2. 1. 1. Плазмидные ДНК, использованные в работе
      • 2. 1. 2. Реакции ферментативной модификации ДНК
        • 2. 1. 2. 1. Полимеразная цепная реакция
        • 2. 1. 2. 2. Реакция рестрикции плазмидной ДНК
        • 2. 1. 2. 3. Реакция обработки ДНК-полимеразой фага Т4 (Т4 ДНКпол)
        • 2. 1. 2. 4. Реакция обработки ДНК щелочной фосфотазой из кишечника теленка (CIAP)
        • 2. 1. 2. 5. Реакция лигирования фрагментов ДНК
        • 2. 1. 2. 6. Реакция ферментативного секвенирования ДНК
      • 2. 1. 3. Электрофорез нуклеиновых кислот
        • 2. 1. 3. 1. Аналитический электрофорез ДНК в агарозном геле
        • 2. 1. 3. 2. Препаративный электрофорез ДНК и выделение ДНК из агарозного геля
        • 2. 1. 3. 3. Электрофорез РНК в денатурирующих условиях
      • 2. 1. 4. Микробиологические методы
        • 2. 1. 4. 1. Приготовление компетентных клеток E. coli для трансформации
        • 2. 1. 4. 2. Трансформация клеток Е. col
        • 2. 1. 4. 3. Скрининг рекомбинантных клонов на наличие искомой плазмидной ДНК
        • 2. 1. 4. 4. Масштабное культивирования клеток E. coli — продуцентов плазмидных ДНК-вакцин
    • 2. 2. Очистка нуклеиновых кислот
      • 2. 2. 1. Выделение плазмидной ДНК из клеток E. col
      • 2. 2. 2. Очистка ДНК между ферментативными реакциями
      • 2. 2. 3. Концентрирование нуклеиновых кислот
      • 2. 2. 4. Очистка плазмидной ДНК в градиенте плотности хлористого цезия с бромистым этидием
      • 2. 2. 5. Хроматографическая очистка плазмидной ДНК
      • 2. 2. 6. Выделение тотальной РНК из трансформированных культур клеточных линий
    • 2. 3. Контроля качества препаратов плазмидных ДНК
      • 2. 3. 1. Определение содержания суперскрученной формы плазмид
      • 2. 3. 2. Определение содержания РНК в препаратах плазмидных ДНК
      • 2. 3. 3. Определение содержания хромосомной ДНК E. coli в препаратах плазмидных ДНК
        • 2. 3. 3. 1. Подготовка проб к анализу
        • 2. 3. 3. 2. Перенос и иммобилизация ДНК на фильтрах
        • 2. 3. 3. 3. Получение специфического меченого зонда
        • 2. 3. 3. 4. Проведение гибридизации ДНК
      • 2. 3. 4. Определение спектрофотометрических показателей препаратов плазмидных ДНК и РНК
      • 2. 3. 5. Определение содержания белка в препаратах плазмид
      • 2. 3. 6. Определение содержания эндотоксинов в препаратах плазмид
      • 2. 3. 7. Методы идентификации плазмид
      • 2. 3. 8. Определение стерильности препаратов плазмид
    • 2. 4. Анализ экспрессии генов ВИЧ-1 in vitro
      • 2. 4. 1. Культуральные методы
        • 2. 4. 1. 1. Линии клеток, среды и условия культивирования
        • 2. 4. 1. 2. Трансформация клеток млекопитающих
        • 2. 4. 1. 3. Определение эффективности трансформации с помощью проточного цитофлуориметра
      • 2. 4. 2. Northern-гибридизация
        • 2. 4. 2. 1. Перенос и иммобилизация препаратов РНК на фильтрах
        • 2. 4. 2. 2. Получение специфических меченых зондов
        • 2. 4. 2. 3. Проведение гибридизации РНК
      • 2. 4. 3. Иммуноблотинг
        • 2. 4. 3. 1. Получение образцов
        • 2. 4. 3. 2. Электрофорез белков в ПААГ
        • 2. 4. 3. 3. Перенос препаратов белков на фильтр
        • 2. 4. 3. 4. Проведение иммунологического окрашивания белков
      • 2. 4. 4. Анализ экспрессии гена nef с помощью проточного цитофлуориметра
    • 2. 5. Иммунологические методы исследования
      • 2. 5. 1. Иммунизация мышей и забор иммунологических проб
      • 2. 5. 2. Анализ специфической активности ЦТЛ
        • 2. 5. 2. 1. Выделение эффекторных лимфоцитов
        • 2. 5. 2. 2. Цитотоксический анализ с использованием набора CytoTox
        • 2. 5. 2. 3. Цитотоксический анализ с использованием проточного цитофлуориметра
      • 2. 5. 3. Анализ CD8± спленоцитов иммунизированных мышей
      • 2. 5. 4. Анализ CD4± спленоцитов иммунизированных мышей
      • 2. 5. 5. Иммуноферментный анализ (ИФА)
      • 2. 5. 6. Анализ неспецифической стимуляции лимфоцитов мыши плазмидной ДНК in vitro
    • 2. 6. Обработка результатов и статистический анализ данных
  • 3. РЕЗУЛЬТАТЫ
    • 3. 1. Создание плазмидного экспрессионного вектора рВМС
    • 3. 2. Создание плазмид на основе вектора рВМС
    • 3. 3. Очистка плазмидных ДНК
      • 3. 3. 1. Хроматографическая очистка плазмидных ДНК
      • 3. 3. 2. Контроль качества плазмидных ДНК
    • 3. 4. Изучение свойств полученных плазмид in vitro
      • 3. 4. 1. Анализ экспрессии генов ВИЧ-1 in vitro
      • 3. 4. 2. Неспецифическая стимуляция лимфоцитов мыши плазмидами in vitro
    • 3. 5. Результаты лабораторных иммунологических испытаний препаратов кандидатных ДНК-вакцин
      • 3. 5. 1. Результаты сравнительнх испытаний ДНК вакцин на основе вектора рВМС и других векторов, полученных соисполнителями Биомедицинского центра по данной тематике
      • 3. 5. 2. Результаты иммунологических испытании ДНК-вакцин несущих гены ВИЧ-1 субтипа В
      • 3. 5. 3. Некоторые результаты доклинических испытаний кандидатных ДНК-вакцин несущих гены ВИЧ-1 субтипа А
  • 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
    • 4. 1. Создание плазмидного экспрессионного вектора рВМС и серии плазмидных ДНК-вакцин
    • 4. 2. Оптимизация штамма-продуцента
    • 4. 2. Очистка плазмидных ДНК-вакцин
    • 4. 3. Свойства кандидатных ДНК-вакцин в системе in vitro
    • 4. 4. Изучение иммунологических свойств кандидатных ДНК-вакцин на мышах
  • ВЫВОДЫ

Актуальность проблемы.

В России и других странах бывшего СССР в настоящее время эпидемия ВИЧ-инфекции находится в стадии перехода от концентрированной, в среде инъекционных наркопотребителей, к генерализованной, т. е. распространяющейся среди людей, не принадлежащих к обособленным группам риска. Как было показано в нашей и других лабораториях, уровень генетического разнообразия ВИЧ-1 в странах СНГ и темпы его роста являются самыми низкими в мире [138, 156]. Таким образом, полученная в лаборатории биомедицинского центра полная нуклеотидная последовательность генома ВИЧ-1 доминирующего на территории России и стран СНГ субтипа A (00UA0116) является основой для создания отечественной вакцины против ВИЧ-инфекции.

ДНК-вакцины являются новым методом вакцинации, основанным на введении ДНК, кодирующей антигены патогена и обеспечивающей их экспрессию в клетках иммунизированного организма. Имитируя вирусную инфекцию и не являясь таковой в действительности, данный подход инициирует развитие полноценного, преимущественно опосредованного Т-клетками иммунного ответа [75]. Применение гетерологичной системы праймирования и бустирования с использованием различных векторов доставки одного и того же иммуногена стимулирует как Т-клеточное, так и гуморальное звено иммунного ответа. При этом многими авторами показано, что использование ДНК-вакцин при праймировании является перспективным и целесообразным [188].

Существует общепризнанное мнение, что профилактическая вакцина против ВИЧ-инфекции должна индуцировать специфический Т-клеточный и, возможно, гуморальный иммунный ответ. При этом в связи с высоким генетическим разнообразием ВИЧ-1 в мире считается, что создание кандидатных вакцин против ВИЧ/СПИД целесообразно проводить на основе субтипов ВИЧ-1, доминирующих в регионе, для которого эти вакцины предназначены [103].

Цели и задачи исследования.

Целью данного исследования является создание кандидатных ДНК-вакцин против ВИЧ и изучение их биологических свойств.

Задачи исследования:

1. Осуществление молекулярного дизайна плазмидного вектора и разработка серии плазмидных кандидатных ДНК-вакцин против ВИЧ-инфекции.

2. Изучение экспрессионных и адъювантных возможностей кандидатных ДНК-вакцин в системе in vitro.

3. Определение способности ДНК-вакцин вызывать различные формы иммунного ответа у мышей.

Научная новизна работы.

Впервые был получен отечественный препарат кандидатной ДНК-вакцины против ВИЧ-инфекции, несущий фрагменты генов российского штамма ВИЧ-1 субтипа А, и всесторонне изучены его биологические свойства. Разработанная оригинальная векторная система обеспечивает эффективную экспрессию антигенов и адъювантность кандидатных ДНК-вакцин в системе in vitro. Модификация последовательности гена nef штамма ВИЧ-1 доминирующего субтипа, А российского изолята увеличивает уровень его экспрессии по отношению к природному. Показана активация ВИЧ-специфического иммунного ответа при внутримышечной вакцинации мышей кандидатными ДНК-вакцинами, а также образование клеток иммунологической памяти.

Научно-практическое значение работы.

Данные проведенного исследования представляют собой часть работы по созданию профилактической вакцины против ВИЧ-инфекции, проводимой в ННИУ «Биомедицинский центр», ФГУП «ГосНИИ особо чистых биопрепаратов ФМБА России» и СПбГУ. В ходе работы созданы генно-инженерные конструкции и кандидатные вакцины против ВИЧ/СПИД. Включение в конструкции последовательностей фрагментов генов штамма ВИЧ-1 субтипа А, доминирующего на территории России и стран СНГ, делает перспективным дальнейшие испытания и применение полученных кандидатных вакцин в данном регионе. Проведено всестороннее изучение биохимических, биологических и иммунологических свойств данного препарата. Доклинические испытания, осуществленные в лабораториях ННИУ «Биомедицинский центр» и ФГУП «ГосНИИ особо чистых биопрепаратов ФМБА России», показали, что новая вакцина не токсична, не вызывает аллергических реакций, безопасна, апирогенна и не обладает раздражающим действием. Эффективная активация ВИЧ-специфического Т-клеточного иммунного ответа и образование клеток иммунологической памяти при вакцинации мышей, выявленные в работе, являются потенциальной предпосылкой иммуногенности данных препаратов у людей и протективности вызываемых реакций против инфицирования ВИЧ. Таким образом, данная работа не только углубляет фундаментальные знания и теоретические основы вакцинологии, но и вносит непосредственный практический вклад в борьбу с эпидемией ВИЧ/СПИД.

Форма выполнения диссертационной работы.

Работа выполнялась в рамках финансирования ННИУ «Биомедицинский центр» и ФГУП «ГосНИИ особо чистых биопрепаратов» ФМБА России по Межведомственной научно-технической программе «Вакцины нового поколения и медицинские диагностические системы будущего», Федеральной целевой научно-технической программе «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники», а также по грантам Международного центра Фогарти (FIC, AITRP, 5-D43-TWO1028−04) и МНТЦ № 2344.

Апробация работы.

Материалы диссертации были представлены на 7-й — 12-й и 14-й — 16-й Международных конференциях «СПИД, рак и родственные проблемы», Санкт-Петербург, Россия, 1999;2004 и 2005;2007; международных конференциях «Вакцина против СПИДа» Филадельфия, США, 2001; Нью-Йорк, США, 2003 и Амстердам, Голландия, 2006; 10-й конференции по ретровирусам и оппортунистическим инфекциям, Бостон, США, 2003. По теме диссертации опубликовано 11 статей, 29 тезисов докладов и получено 6 патентов Российской Федерации.

Объем и структура диссертации.

Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов исследования, обсуждения полученных результатов, выводов и списка литературы. Работа изложена на 196 страницах машинописного текста, иллюстрирована 28 рисунками, 17 таблицами и 9 приложениями.

Список литературы

содержит 260 литературных источников.

ВЫВОДЫ.

1. Создана идеологическая, методическая и реагентная база для разработки вакцин нового поколения — ДНК-вакцин.

2. Получен плазмидный вектор рВМС, на основе которого создана коллекция плазмидных ДНК, являющихся кандидатными ДНК-вакцинами против ВИЧ-инфекции.

3. Осуществлена модификация последовательности гена nef ВИЧ-1, которая значительно увеличивает его уровень экспрессии, но не во всех клетках одинаково.

4. Установлено, что кандидатные ДНК-вакцины in vitro обладают адъювантным эффектом по отношению к Т-лимфоцитам, выраженным в неспецифической дифференцировке хелперных лимфоцитов по Независимому пути.

5. Показано, что при вакцинации мышей кандидатными ДНК-вакцинами возникает системный ВИЧ-специфический Thl-зависимый Т-клеточный иммунный ответ, и образуются клетки иммунологической памяти. При этом уровень индукции ВИЧ-специфических антител незначителен.

Показать весь текст

Список литературы

  1. И.В. Изучение свойств ДНК-иммуногенов на основе гена gag ВИЧ-1 субтипа А. / И. В. Духовлинов, Е. В. Ворожцова, Е. В. Казеннова, Б. В. Мурашев и др. // Русский журнал СПИД, рак и общественное здоровье. -2006. Т.10. -№ 1. — С.35−42.
  2. Н.А. Сравнительные испытания новых иммуногенов и способов их доставки на мелких лабораторных животных./ Н. А. Климов, A.M. Ерошкин, С. Г. Поздняков и др. // Аллергия, астма и клиническая иммунология. 1999. -Т.9.-С.110−113.
  3. А.П. Рекомбинантная плазмидная ДНК pBMC-gpl20(A)m-l для иммунизации против вируса иммунодефицита человека. / Козлов А. П., Климов Н. А., Машарский А. Э. и др. // Патент на изобретение Российской Федерации. -№ 2 227 161. 2003.
  4. .В. Разработка ДНК-вакцин против ВИЧ/СПИД на основе генов, кодирующих иммуногенные эпитопы вариантов ВИЧ. / Б. В. Мурашев, И. В. Мурашева, И. В. Духовлинов и др. // Аллергия, астма и клиническая иммунология. 2003. — Т.7. — № 9. — С.126−133.
  5. .В. Создание и изучение иммунологических свойств ДНК-вакцины на основе гена env ВИЧ-1. / Б. В. Мурашев, И. В. Мурашева, А. Э. Романович и др. // Русский журнал ВИЧ/СПИД и родственные проблемы. -2000. Т.4. — № 2. — С.29−36.
  6. .В. Экспрессия рекомбинантных белков Nef и р24 ВИЧ-1 в клетках E.coli и их очистка. / Б. В. Мурашев, И. В. Мурашева, А. С. Рождественская и др. // Русский журнал «СПИД, рак и общественное здоровье». 2006. — Т. 10. — № 1. — С.28−34.
  7. P.M. СПИД / P.M. Хаитов, Г. А. Игнатьева // Москва: Народная академия культуры и общечеловеческих ценностей. — 1992.
  8. Ada G.L. The immune response to influenza infection. / G.L. Ada, P.D. Jones // Curr Top Microbiol Immunol. 1986. — V. 128. — P. 1−54.
  9. Albini A. HIV-1 Tat protein mimicry of chemokines. / A. Albini, S. Ferrini, R. Benelli et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA- 1998. V.95. — P. 13 153−8.
  10. Alexander-Miller M.A. Role of antigen, CD8, and cytotoxic T lymphocyte (CTL) avidity in high dose antigen induction of apoptosis of effector CTL. / M.A. Alexander-Miller, G.R. Leggatt, A. Sarin, J.A. Berzofsky // J. Exp. Med. 1996. -V. 184.-P.485−92.
  11. Alizon M. Genetic variability of the AIDS virus: nucleotide sequence analysis of two isolates from African patients / M. Alizon, S. Wain-Hobson, L. Montagnier et al. // Cell. 1986. — V.46. — P.63−74.
  12. Allen P.M. Promethean viruses? / P.M. Allen, R.M. Zinkernagel // Nature. 1994. — V.369. -P.355−6.
  13. Alving C.R. Novel vaccines and adjuvants: mechanisms of action. / C.R. Alving, N.M. Wassef// AIDS Res. Hum. Retrovir. 1994.- V. l0.-P.91^L
  14. Amano H. Morphological estimation of total number of influenza A type virion spikes. / H. Amano, Y. Hosaka // J. Electron. Microsc. 1992. — V.41. — P. 104−6
  15. Andre S. Increased immune response elicited by DNA vaccination with a synthetic gpl20 sequence with optimized codon usage. / S. Andre, B. Seed, J. Eberle et al. // J. Virol. 1998. — V.72. — P.1497−503.
  16. Annunziata P. HIV-1 gpl20 increases the permeability of rat brain endothelium cultures by a mechanism involving substance P./ P. Annunziata, C. Cioni, S. Toneatto, E. Paccagnini // AIDS. 1998. — V.12. — P.2377−85.
  17. Appay V. Characterization of CD4(+) CTLs ex vivo. / V. Appay, J.J. Zaunders, L. Papagno et al. // J. Immunol. 2002. — V. l68. — P.5954−8.
  18. Ara Y. Zymosan enhances the immune response to DNA vaccine for human immunodeficiency virus type-1 through activation of complement system. / Y. Ara, T. Saito, T. Takaqi et al. // Immunol. 2001. — V.103. — P.98−105.
  19. Badovinac V.P.Programmed contraction of CD8(+) T cells after infection. / V.P.Badovinac, B.B. Porter, J.T. Harty // Nat. Immunol. 2002. — V.3. — P.619−26.
  20. Barnett S.W. Vaccination with HIV-1 gpl20 DNA induces immune responses that are boosted by a recombinant gpl20 protein subunit. / S.W. Barnett, S. Rajasekar, H. Legg // Vaccine. 1997. — V.15. — P.869−73.
  21. Barouch D.H. Control of viremia and prevention of clinical AIDS in rhesus monkeys by cytokine-augmented DNA vaccination. / D.H. Barouch, S. Santra, J.E. Schmitz et al. // Science. 2000. — V.290. — P.486−92.
  22. Barouch D.H. DNA vaccination for HIV-1 and SIV./ D.H. Barouch, N.L. Letvin // Intervirology. 2000. — V.43. — P.282−7.
  23. Belz G.T. Compromised influenza virus-specific CD8(+)-T-cell memory in CD4(+)-T-cell-deficient mice. / G.T. Belz, D. Wodarz, G. Diaz // J. Virol. -2002. V.76. — P.12 388−93.
  24. Benimetskaya L. Mac-1 (CDllb/CD18) is an oligodeoxynucleotide-binding protein. / L. Benimetskaya, J.D. Loike, Z. Khaled, et al. // Nat. Med. 1997. -V.3.-P.414−20.
  25. Bertoletti A. Natural variants of cytotoxic epitopes are T-cell receptor antagonists for antiviral cytotoxic T cells. / A. Bertoletti, A. Sette, F.V.Chisari et al. // Nature. 1994. — V.369. — P.407−10.
  26. Binley J.M. Analysis of the interaction of antibodies with a conserved enzymatically deglycosylated core of the HIV type 1 envelope glycoprotein 120. / J.M. Binley, R. Wyatt, E. Desjardins et al. // AIDS Res. Hum. Retroviruses. -1998. V.14. -P.191−8.
  27. Birnboim H.C. A rapid alkaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA. / H.C.Birnboim, J. Doly // Nucleic. Acids. Res. 1979. — V.7. -P.l 513—1523.
  28. Borrow P. Virus-specific CD8+ cytotoxic T-lymphocyte activity associated with control of viremia in primary human immunodeficiency virus type 1 infection. / P. Borrow, H. Lewicki, B.H. Hahn et al. // J. Virol. 1994. — V.68. — P.6103−10.
  29. Bourinbaiar A.S. The ratio of defective HIV-1 particles to replication-competent infection virions. / A.S. Bourinbaiar//Acta. Virol. 1994. — V.38. -P.59−61.
  30. Branovic K. Application of short monolithic columns for fast purification of plasmid DNA. / K. Branovic, D. Forcic, J. Ivancic et al. // J. Chromatogr. В Analyt. Technol. Biomed. Life. Sci. 2004. — V.801. — P.331−7.
  31. Buchbinder S. HIV-infected long-term nonprogressors: epidemiology, mechanisms of delayed progression, and clinical ahd research implications. / S. Buchbinder, E. Vittinghoff// Microbes ahd Infection. 1999. — P. l 113−20.
  32. Budker V. Hypothesis: naked plasmid DNA is taken up by cells in vivo by a receptor-mediated process. / V. Budker, T. Budker, G. Zhang et al. // J. Gene. Med.-2000.-V.2.-P.76−88.
  33. Burrows S.R. The specificity of recognition of a cytotoxic T lymphocyte epitope. / S.R. Burrows, S.J. Rodda, A. Suhrbier et al. // Eur. J. Immunol. 1992. — V.22. -P.191−5.
  34. Burton D.R. A sound rationale needed for phase III HIV-1 vaccine trials. / D.R. Burton, R.C.Desrosiers, R.W. Doms et al. // Science. -2004. -V.303. -P.316.
  35. Cao H. Cytotoxic T-lymphocyte cross-reactivity among different human immunodeficiency virus type 1 clades: implications for vaccine development. / H. Cao, P. Kanki, J.L. Sankale et al. // J. Virol. 1997. — V.71. -P.8615−23.
  36. Caplen N.J. Gene therapy for cystic fibrosis in humans by liposome-mediated DNA transfer: the production of resources and the regulatory process. / NJ. Caplen, X. Gao, P. Hayes et al. // Gene Ther. 1994. — V.l. — P.13947
  37. Chakrabarti B.K. Modifications of the human immunodeficiency virus envelope glycoprotein enhance immunogenicity for genetic immunization. / B.K. Chakrabarti, W.P.Kong, B.Y. Wu et al. // J. Virol. 2002. — V.76. — P.5357−68.
  38. Chandra G. Large-scale purification of plasmid DNA by fast protein liquid chromatography using Hi-Load Q Sepharose column. / G. Chandra, P. Patel, T.A. Kost, J.G. Gray // Anal. Biochem. 1992. — V.203. — P. 169−72.
  39. Chang K.M. Differential CD4(+) and CD8(+) T-cell responsiveness in hepatitis С virus infection. / K.M. Chang, R. Thimme, J.J. Melpolder et al. // Hepatology. -2001. V.33. -P.267−76.
  40. Chapman B.S. Effect of intron A from human cytomegalovirus (Towne) immediate-early gene on heterologous expression in mammalian cells. / B.S. Chapman, R.M. Thayer, K.A. Vincent et al. // Nucleic Acids Res. 1991. — V.19. -P.3979−86.
  41. Choi M.J. Topical vaccination of DNA antigens: topical delivery of DNA antigens. / M.J. Choi, H.I. Maibach // Skin Pharmacol. Appl. Skin Physiol. 2003. — V.16. -P.271−82.
  42. Cichutek K. Nucleic acid immunization: a prophylactic gene therapy? / Cichutek K. // Vaccine. 1994. — V. 12. — P. 1520−5.
  43. Cocchi F. Identification of RANTES, MIP-1 alpha, and MIP-1 beta as the major HIV-suppressive factors produced by CD8+ T cells. / F. Cocchi, A.L. DeVico, A. Garzino-Demo et al. // Science. 1995. — V.270. — P.1811−5.
  44. Coffin J.M. Genetic variation in AIDS viruses. / J.M. Coffin // Cell. 1986. -V.46. -P.l-4.
  45. Coffin J.M. HIV population dynamics in vivo: implications for genetic variation, pathogenesis, and therapy. / J.M. Coffin 11 Science. 1995. — V.267. — P.483−9.
  46. Conant K. Induction of monocyte chemoattractant protein-1 in HIV-1 Tat-stimulated astrocytes and elevation in AIDS dementia. / K. Conant, A. Garzino-Demo, A. Nath, et al. // Proc Natl Acad Sci U S A. 1998. — V.95. — P.3117−21.
  47. Constant S.L. Induction of Thl and Th2 CD4+ T cell responses: the alternative approaches. / S.L. Constant, K. Bottomly // Annu. Rev. Immunol. 1997. — V.15. — P.297−322.
  48. Currier J.R. A panel of MHC class I restricted viral peptides for use as a quality control for vaccine trial ELISPOT assays. / J.R. Currier, E.G. Kuta, E. Turk et al. // J. Immunol. Methods. 2002. — V.260. — P. 157−72.
  49. Davenport M.P. Clonal selection, clonal senescence, and clonal succession: the evolution of the T cell response to infection with a persistent virus. / M.P.Davenport, C. Fazou, A.J. McMichael, M.F. Callan // J. Immunol. 2002. -V.168. -P.3309−17.
  50. Davis H.L. Comparison of plasmid DNA preparation methods for direct gene transfer and genetic immunization. / H.L. Davis, M. Schleef, P. Moritz et al. // Biotechniques. 1996. — V.21. — P.92−9.
  51. Demkowicz W.E. Vaccinia virus-specific CD8+ cytotoxic T lymphocytes in humans. / W.E. Demkowicz, F.A. Ennis // J. Virol. 1993. — V.67. — P. 1538−44.
  52. Diogo M.M. Purification of a cystic fibrosis plasmid vector for gene therapy using hydrophobic interaction chromatography. / M.M. Diogo, J.A. Queiroz, G.A. Monteiro, et al. // Biotechnol. Bioeng. 2000. — V.68. — P.576−83.
  53. Donnelly J.J. DNA vaccines. / J.J. Donnelly, J.B. Ulmer, J.W. Shiver, M.A. Liu // Annu. Rev. Immunol. 1997. — V.15. — P.617−48.
  54. Dukhovlinov I.V. Design and development of candidate DNA vaccines based on subtype A HIV-1 gag and nef gene. / I.V.Dukhovlinov, B.V.Murashev, I.V.Murashevaetal. //AIDS Vaccine 2003 Conference. -2003. P. 140.
  55. Dupuis M. Distribution of DNA vaccines determines their immunogenicity after intramuscular injection in mice. / M. Dupuis, K. Denis-Mize, C. Woo et al. // J. Immunol. 2000. — V.165. — P.2850−8.
  56. Earl P.L. Immunogenicity and protective efficacy of oligomeric human immunodeficiency virus type 1 gpl40. / P.L. Earl, W. Sugiura, D.C.Montefiori et al. // J. Virol. 2001. — V.75. — P.645−53.
  57. Eigen M. On the nature of virus quasispecies / M. Eigen // Trends. Microbiol. -1996. V.4. -P.216−8.
  58. Esser M.T. Memory T cells and vaccines. / M.T. Esser, R.D. Marchese, L.S. Kierstead et al. // Vaccine. 2003. — V.21. — P.419−30.
  59. Estcourt M.J. DNA vaccines against human immunodeficiency virus type 1. / M.J. Estcourt, A.J. McMichael, T. Hanke // Immunol. Rev. 2004. — V.199. — P.144−55.
  60. Estcourt M.J. Prime-boost immunization generates a high frequency, high-avidity CD8(+) cytotoxic T lymphocyte population. / M.J. Estcourt, A.J. Ramsay, A. Brooks et al. // Int. Immunol. 2002. — V.14. — P.31−7.
  61. Fackler O.T. Live and let die: Nef functions beyond HIV replication. / O.T. Fackler, A.S. Baur // Immunity. -2002. V. l6. — P.493−7.
  62. Ferrantelli F. Neutralizing antibodies against HIV back in the major leagues? / F. Ferrantelli, R.M. Ruprecht // Curr. Opin. Immunol. — 2002. — V. l4. — P.495−502.
  63. Ferreira G.N.M. Studies on the batch adsorbtion of plasmid DNA onto anion-exchange chromatographic supports. / G.N.M. Ferreira, J.M.S. Cabral, D.M.F. Prazeres // Biotechnol. Prog. 2000. — V. l6. — P.416−24.
  64. Foecking M.K. Powerful and versatile enhancer-promoter unit for mammalian expression vectors. / M.K. Foecking, H. Hofstetter // Gene. 1986. — V.45. -P.101−5.
  65. Fouts T.R. Expression and characterization of a single-chain polypeptide analogue of the human immunodeficiency virus type 1 gpl20-CD4 receptor complex. / T.R. Fouts, R. Tuskan, K. Godfrey et al. // J. Virol. 2000. — V. l A. — P. 11 427−36.
  66. Fujii Y. Evidence for the role of human immunodeficiency virus type 1 Nef protein as a growth inhibitor to CD4+T lymphocytes and for the bloking of the nef function by anti-Nef antibodies. / Y. Fujii, M. Ito, K. Ikuta // Vaccine. 1993. -V.l 1-P.837−47.
  67. Fujita K. Rapid degradation of CD4 in cells expressing human immunodeficiency virus type 1 Env and Vpu is blocked by proteasome inhibitors / K. Fujita, S. Omura, J. Silver//J. Gen. Virol. 1997.-V.78. -P.619−25.
  68. Gallimore A. Protective immunity does not correlate with the hierarchy of virus-specific cytotoxic T cell responses to naturally processed peptides. / A. Gallimore, T. Dumrese, H. Hengartner, et al. // J. Exp. Med. 1998. — V. l87. — P. 1647−57.
  69. Gallo R.C. Tat as one key to HIV-induced immune pathogenesis and Tat (correction of Pat) toxoid as an important component of a vaccine. / R.C.Gallo // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 1999. — V. 96. — P.8324−6.
  70. Geleziunas R. HIV-1 Nef inhibits ASKl-dependent death signaling providing a potential mechanism for protecting the infected host cell. / R. Geleziunas, W. Xu, K. Takeda et al. //Nature. -2001. V.410. -P.834−8.
  71. Glansbeek H.L. Adverse effects of feline IL-12 during DNA vaccination against feline infectious peritonitis virus. / H.L. Glansbeek, B.L. Haagmans, E.G. Lintelo et al. // J. Gen. Virol.- 2002. V.83. — P. 1−10.
  72. Goodenow M. HIV-1 isolates are rapidly evolving quasispecies: evidence for viral mixtures and preferred nucleotide substitutions / M. Goodenow, T. Huet, W. Saurin et al. // J. Acquir. Immune. Defic. Syndr. 1989. — V.2. — P.344−52.
  73. Gould SJ. The trojan exosome hypothesis. / SJ. Gould, A.M. Booth, J.E. Hildreth // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 2003. V.100. — P. 10 592−7.
  74. Graf M. Codon-optimized genes that enable increased heterologous expression in mammalian cells and elicit efficient immune responses in mice after vaccination of naked DNA. / M. Graf, L. Demi, R. Wagner // Methods. Mol. Med. 2004. -V.94.-P.197−210.
  75. Greenberg M.E. The SH3 domain-binding surface and an acidic motif in HIV-1 Nef regulate trafficking of class IMHC complexes. / M.E. Greenberg, A.J. Iafrate, J. Skowronski // EMBO J. 1998.- V.7. — P.2777−289.
  76. Greenway A. Human immunodeficiency virus type 1 Nef protein inhibits activation pathways in peripheral blood mononuclear cells and T-cell lines / A. Greenway, A. Azad, D. McPhee // J. Virol. 1995. — V.69. — P. l842−50.
  77. Grundner G. Factors limiting the immunogenicity of HIV-1 gpl20 envelope glycoproteins. / G. Grundner, M. Pancera, J.M. Kang et al. // Virology. 2004. -V.330. -P.23318.
  78. Gursel M. Differential and competitive activation of human immune cells by distinct classes of CpG oligodeoxynucleotide. / M. Gursel, D. Verthelyi, I. Gursel, et al. // J. Leukoc. Biol. 2002. — V.71. — P.813−20.
  79. Gurunathan S. DNA vaccines: a key for inducing long-term cellular immunity. / S. Gurunathan, C.Y. Wu, B.L. Freidag, R.A. Seder // Curr. Opin. Immunol. -2000. V.12. — P.442−7.
  80. Gurunathan S. DNA vaccines: immunology, application, and optimization. / S. Gurunathan, D.M. Klinman, R.A. Seder // Annu. Rev. Immunol. 2000. — V.18. -P.927−74.
  81. Gutierrez-Rivas M. A mutation in the primer grip region of HIV-1 reverse transcriptase that confers reduced fidelity of DNA synthesis. / M. Gutierrez-Rivas, L. Menendez-Arias // Nucleic. Acids. Res. 2001. — V.29. — P.4963−72.
  82. Hahn B.H. Genetic variation in HTLV-III/LAV over time in patients with AIDS or at risk for AIDS / B.H. Hahn, G.M. Shaw, M.E. Taylor et al. // Science. 1986. -V.232.-P.1548−53.
  83. Haigwood N.L. Native but not denatured recombinant human immunodeficiency virus type 1 gpl20 generates broad-spectrum neutralizing antibodies in baboons. / N.L. Haigwood, P.L. Nara, E. Brooks et al. // J. Virol. 1992. — V.66. — P. 172−82.
  84. Halstead S.B. Global epidemiology of dengue hemorrhagic fever. Southeast Asian. / S.B. Halstead // J. Trop. Med. Public. Health. 1990. — V.21. — P.6361.
  85. ЮЗ.Напке Т. Design and construction of an experimental HIV-1 vaccine for a year-2000 clinical trial in Kenya. / T. Hanke, A.J. McMichael // Nat. Med. 2000. -V.6. -P.951−5.
  86. Hanke T. Enhancement of MHC class I-restricted peptide-specific T cell induction by a DNA prime/MVA boost vaccination regime. / T. Hanke, T.J. Blanchard, J. Schneider et al. // Vaccine. 1998. — V.16. — P.4395.
  87. Hassett D.E. Direct ex vivo kinetic and phenotypic analyses of CD8(+) T-cell responses induced by DNA immunization / D.E. Hassett, M.K. Slifka, J. Zhang, J.L. Whitton // J. Virol. 2000. — V.74. — P.8286−91.
  88. Haynes J.R. Particle-mediated nucleic acid immunization. / J.R. Haynes, D.E. McCabe, W.F. Swain et al. // J. Biotechnol. 1996. — V.44. — P.372.
  89. Hines R.N. Large-scale purification of plasmid DNA by anion-exchange high-performance liquid chromatography. / R.N. Hines, K.C. O’Connor, G. Vella, W. Warren // Bio.Techniques. 1992. — V. 12. — P.430^
  90. Ho D.D. Rapid turnover of plasma virions and CD4 lymphocytes in HIV-1 infection / D.D. Ho, A.U. Neumann, A.S. Perelson et al. // Nature. 1995. -V.373.-P.123−6.
  91. Horn N.A. Cancer gene therapy using plasmid DNA: Purification of DNA for human clinical trials. / N.A. Horn, J.A. Meek, G. Budahazi, M. Marquet // Hum. Gene. Ther. 1995. — V.6. — P.565−73.
  92. Hou S. Virus-specific CD8+ T-cell memory determined by clonal burst size. / S. Hou, L. Hyland, K.W. Ryan et al. // Nature. 1994. — V. 369. — P.6521.
  93. Hu W.S. Retroviral recombination and reverse transcription / W.S. Ни, H.M. Temin // Science. -1990. V.250. — P. 1227−33.
  94. Hua J. Human immunodeficiency virus types 1 and 2 and simian immunodeficiency virus Nef use distinct but overlapping target sites for downregulation of cell surface CD4 / J. Hua, B.R. Cullen // J. Virol. 1997. -V.71. -P.6742−8.
  95. Irvine K.R. Enhancing efficacy of recombinant anticancer vaccines with prime/boost regimens that use two different vectors. / K.R. Irvine, R.S. Chamberlain, E.P. Shulman et al. // J. Natl. Cancer. Inst. 1997. — V.89. -P. 1595−601.
  96. Janssen E.M. CD4+ T cells are required for secondary expansion and memory in CD8+ T lymphocytes. / E.M. Janssen, E.E. Lemmens, T. Wolfe et al. // Nature. -2003. V.421. — P.852−6.
  97. Jeffs S.A. Antigenicity of truncated forms of the human immunodeficiency virus type 1 envelope glycoprotein. / S.A. Jeffs, J. McKeating, S. Lewis et al. // J. Gen. Virol. 1996. — V.77. — P.1403−10.
  98. Jones T.R. Synthetic oligodeoxynucleotides containing CpG motifs enhance immunogenicity of a peptide malaria vaccine in Aotus monkeys / T.R. Jones, N. Obaldia, R.A. Gramzinski et al. // Vaccine. 1999. — V. l7. — P.3065−71.
  99. Kang C.Y. Development of HIV/AIDS vaccine using chimeric gag-env virus-like particles. / C.Y. Kang, L. Luo, M.A. Wainberg, Y. Li // Biol. Chem. 1999. -V.380. -P.353−64.
  100. Kaul R. New insights into HIV-1 specific cytotoxic T-lymphocyte responses in exposed, persistently seronegative Kenyan sex workers. / R. Kaul, S.L. Rowland-Jones, J. Kimani et al. // Immunol. Lett. 2001. — V.79. — P.3−13.
  101. Khanolkar A. Preferential utilization of the perforin/granzyme pathway for lysis of Epstein-Barr virus-transformed lymphoblastoid cells by virus-specific CD4+ T cells. / A. Khanolkar, H. Yagita, M.J. Cannon // Virology. 2001. — V.287. -P.79−88.
  102. Klenerman P. Cytotoxic T-cell activity antagonized by naturally occurring HIV-1 Gag variants. / P. Klenerman, S. Rowland-Jones, S. McAdam et al. // Nature. -1994. V.369. — P.403−7.
  103. Klinman D.M. CpG motifs as immune adjuvants / D.M. Klinman, K.M. Barnhart, J. Conover // Vaccine. 1999. — V.17. — P. 19−25.
  104. Klotman M.E. Kinetics of expression of multiply spliced RNA in early human immunodeficiency virus type 1 infection of lymphocytes and monocytes. / M. E. Klotman, S. Kim, A. Buchbinder et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. -V.88. -P.5011−5.
  105. Kolchinsky P. Adaptation of a CCR5-using, primaiy human immunodeficiency virus type 1 isolate for CD4-independent replication. / P. Kolchinsky, T. Mirzabekov, M. Farzan et al. // J. Virol. 1999. — V.73. — P.8120−6.
  106. Koup R.A. Temporal association of cellular immune responses with the initial control of viremia in primary human immunodeficiency virus type 1 syndrome. / R.A. Koup, J.T. Safrit, Y. Cao et al. // J. Virol. 1994. — V.68. — P.4650−5.
  107. Kozak M. Initiation of translation in prokaryotes and eukaryotes. / M. Kozak // Gene. 1999. — V.234. — P. l 87−208.
  108. Krieg A.M. The role of CpG motifs in innate immunity. / A.M. Krieg // Curr. Opin. Immunol. 2000. — V.12. — P.3513.
  109. LaBranche C.C. Determinants of CD4 independence for a human immunodeficiency virus type 1 variant map outside regions required for coreceptor specificity. / C.C. LaBranche, T.L. Hoffman, J. Romano et al. // J. Virol. 1999. — V.73. — P. l0310−9.
  110. LaCasse R.A. Fusion-competent vaccines: broad neutralization of primary isolates of HIV. / R.A. LaCasse, K.E. Follis, M. Trahey et al. // Science. 1999. — V.283. -P.357−62.
  111. Lamb R.A. Do Vpu and Vpr of human immunodeficiency virus type 1 and NB of influenza В virus have ion channel activities in the viral life cycles? / R.A. Lamb, L.H. Pinto // Virology. 1997. — V.229. — P. 1−11.
  112. LaRosa G.J. Conserved sequence and structural elements in the HIV-1 principal neutralizing determinant. / G.J. LaRosa, J.P. Davide, K. Weinhold et al. // Science. 1990. — V.249. — P.932−5.
  113. Lazouskaya N.V. The HIV type 1 epidemic in Belarus: predominance of Eastern European subtype A strains and circulation of subtype В viruses. / N.V. Lazouskaya, V.F. Eremin, K.W. Adema et al. // AIDS Res. Hum. Retroviruses. -2005. V.21. — P.830−3.
  114. Le T.P. Safety, tolerability and humoral immune responses after intramuscular administration of a malaria DNA vaccine to healthy adult volunteers. / T.P. Le, K.M. Coonan, R.C. Hedstrom et al. // Vaccine. 2000. — V. l8. — P. 1893−901.
  115. HO.Ledwith B.J. Plasmid DNA vaccines: investigation of integration into host cellular DNA following intramuscular injection in mice. / B.J. Ledwith, S. Manam, P.J. Troilo et al. // Intervirology. 2000. — V.43. — P.258−72.
  116. Lee A.L. A method for ladge scale plasmid purification. / A.L. Lee, S. Sagar // World Intellectual Propery Organization pub. 1996. — V.2 658.
  117. Leifer C.A. Heterogeneity in the human response to immunostimulatory CpG oligodeoxynucleotides. / C.A. Leifer, D. Verthelyi, D.M. Klinman // J. Immunother. 2003. — V.26. — P.313−9.
  118. Leifert J.A. Targeting plasmid-encoded proteins to the antigen presentation pathways. / J.A. Leifert, M.P. Rodriguez-Carreno, F. Rodriguez, J.L. Whitton // Immunol. Rev. 2004. — V. l99. — P.40−53.
  119. Lemmens R. Supercoiled plasmid DNA: selective purification by thiophilic/aromatic adsorption. / R. Lemmens, U. Olsson, T. Nyhammar, J. Stadler // J. Chromatogr. В Analyt. Technol. Biomed. Life. Sci. 2003. — V.784. — P.291−300.
  120. Leong K.H. Generation of enchanced immune responses by consecutive immunization with DNA and recombinant fowl poxvirus. / K.H. Leong, A.J. Ramsay, I.A. Ramshaw et al. // Vaccines Cold Spring Harbor Laboratory Press. -1995. -P.327−331.
  121. Letvin N.L. Potent, protective anti-HIV immune responses generated by bimodal HIV envelope DNA plus protein vaccination. / N.L. Letvin, D.C. Montefiori, Y. Yasutomi et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1997. V.94. — P.9378−83.
  122. Levy J.A. Pathogenesis of human immunodeficiency virus infection. / J.A. Levy // Microbiol. Rev. -1993. V.57. — P. 183−289.
  123. Li C.J. Induction of apoptosis in uninfected lymphocytes by HIV-1 Tat protein. / C.J. Li, D.J. Friedman, C. Wang et al. // Science. 1995. — V.268. — P.429−31.
  124. Loke S.L. Characterization of oligonucleotide transport into living cells. / S.L. Loke, C.A. Stein, X.H. Zhang et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1989. -V.86. P.3474−8.
  125. Lole K.S. Full-length human immunodeficiency virus type 1 genomes from subtype C-infected seroconverters in India, with evidence of intersubtype recombination / K.S. Lole, R.C.Bollinger, R.S. Paranjape et al. // J. Virol. 1999. — V.73. -P.152−60.
  126. Lubon H. Cell-specific activity of the modulator region in the human cytomegalovirus major immediate-early gene. / H. Lubon, P. Ghazal, L. Hennighausen et al. //Mol. Cell. Biol. 1989. — V.9. — P. 1342−5.
  127. Malm M. GTU-MultiHIV DNA vaccine results in protection in a novel P815 tumor challenge model. / M. Malm, R. Sikut, K. Krohn, V. Blazevic // Vaccine. -2007. V.25. -P.3293−301.
  128. Mansky L.M. Lower in vivo mutation rate of human immunodeficiency virus type 1 than that predicted from the fidelity of purified reverse transcriptase / L.M. Mansky, H.M. Temin // J. Virol. 1995. — V.69. — P.5087−94.
  129. Martin T. Plasmid DNA malaria vaccine: the potential for genomic integration after intramuscular injection. / T. Martin, S.E. Parker, R. Hedstrom et al. // Hum. Gene. Ther. 1999. — V.10. — P.759−68.
  130. Marzio R. CD69 and regulation of the immune function. / R. Marzio, J. Mauel, S. Betz-Corradin // Immunopharmacol Immunotoxicol. 1999. -V.21. — P.565−82.
  131. Masharsky A.E. Molecular cloning and analysis offull-length genome of HIV type 1 strains prevalent in countries of theformer Soviet Union. / A.E. Masharsky, N.A. Klimov, A.P. Kozlov // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2003. — V.19. -P.933−9.
  132. Melief C.J. Regulation of cytotoxic T lymphocyte responses by dendritic cells: peaceful coexistence of cross-priming and direct priming? / C.J. Melief // Eur. J. Immunol. 2003. — V.33. — P.2645−54.
  133. Meyerhans A. In vivo persistence of a HIV-l-encoded HLA-B27-restricted cytotoxic T lymphocyte epitope despite specific in vitro reactivity. / A. Meyerhans, G Dadag. io, J.P. Vartanian et al. // Eur. J. Immunol. 1991. — V.21. -P.2637−40.
  134. Miller M.D. The human immunodeficiency virus-l nef gene product: a positive factor for viral infection and replication in primary lymphocytes and macrophages
  135. M.D. Miller, M.T. Warmerdam, I. Gaston et al. // J. Exp. Med. 1994. — V.179. -P.101−13.
  136. Montgomery D.L. Heterologous and homologous protection against influenza A by DNA vaccination: optimization of DNA vectors. / D.L. Montgomery, J.W. Shiver, K.R. Leander et al. // DNA. Cell Biol. 1993. — V.12. — P.777−83.
  137. Moore J.P. Genetic subtypes, humoral immunity, and human immunodeficiency virus type 1 vaccine development. / J.P. Moore, P.W. Parren, D.R. Burton // J. Virol. 2001. — V.75. — P.5721−9.
  138. Moore J.P. Sattentau. Dissociation of gpl20 from HIV-1 virions induced by soluble CD4. / J.P. Moore, J.A. McKeating, R.A. Weiss, Q.J. Sattentau. // Science.- 1990.-V.250.-P.1139−42.
  139. Moskophidis D. Virus persistence in acutely infected immunocompetent mice by exhaustion of antiviral cytotoxic effector T cells. / D. Moskophidis, F. Lechner, H. Pircher, R.M. Zinkernagel //Nature. 1993. — V.362. -P.758−61.
  140. Mountain A. Recombinant proteins, monoclonal antibodies and therapeutic genes. / A. Mountain, U. Ney, D. Schomburg // Biotechnology, Weinheim, Wiley-VCH.- 1999. V. 5a. — Ch.20.
  141. Mourich D.V. Spermine compaction is an efficient and economical methodof producing vaccination-grade DNA. / D.V. Mourich, M.W. Munks, J.C. Murphy et al. // J. Immunol. Methods. 2003. — V.274. — P.257−64.
  142. Mueller Y.M. Increased CD85/Fas-induced apoptosis of HlV-Specific CD8+ T cells. / Mueller Y.M. //Immunity. -2001. V. 15. — P.871−82.
  143. Muller D. LCMV-specific, class II-restricted cytotoxic T cells in beta 2-microglobulin-deficient mice. / D. Muller, B.H. Koller, J.L. Whitton et al. // Science. 1992. — V.255. — P. 1576−8.
  144. Murashev B.V. Immunogenicity of candidate DNA vaccine based on subtype A human immunodeficiency virus type 1 predominant in Russia. / B.V. Murashev, E.V. Kazennova, A.A. Kozlov et al. // Biotechnol. J. 2007. — V.2. — P.871−8.
  145. Murashev B.V. Immunological properties of HIV-1 env gene based DNA vaccines. / B.V. Murashev, I.V. Murasheva, T.Yu. Kreslavskiy et al. // Abstract Conferentce AIDS VACCINE 2001, Philadelphia, PA USA. 2001. — P. 84.
  146. Murphy J.C. Purification of plasmid DNA using selective precipitation by compaction agents. / J.C. Murphy, J.A. Wibbenmeyer, G.E. Fox, R.C. Wilson // Nature Biotechnol. 1999. — V.17. — P.822−3.
  147. Mwau M. Design and validation of an enzyme-linked immunospot assay for use in clinical trials of candidate HIV vaccines. / M. Mwau, A.J. McMichael, T. Hanke // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2002. — V. l 8. — P.611−8.
  148. Myers G. Human Retroviruses and AIDS. / G. Myers // Theoretical Biology and Biophysics Group, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM. 1987.
  149. Nehete P.N. Studies on V3-specific cross-reactive T-cell responses in chimpanzees chronically infected with HIV-1IIIB. / P.N. Nehete, K.K. Murthy, W.C. Satterfield et al. //AIDS. 1995.- V.9.-P.567−72.
  150. Pang S. Human immunodeficiency virus Env-independent infection of human CD4(-) cells. / S. Pang, D. Yu, D.S. An et al. // J. Virol. 2000. — V.74. -P.l 0994—1000.
  151. Patterson S. CD4 expression on dendritic cells and their infection by human immunodeficiency virus. / S. Patterson, J. Gross, N. English et al. // J. Gen. Virol. 1995.-V.76.-P.l 155−63.
  152. Paul N.L. Expression of HIV-1 envelope glycoproteins by Semliki Forest virus vectors. / N.L. Paul, M. Marsh, J.A. McKeating et al. // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1993. — V.9. — P.963−70.
  153. Pinto B.L.A. Alloantigen-stimulated anti-HIV activity. / B.L.A. Pinto // Blood. -1998. V.92. — P.3346−54
  154. Pinto L.A. ENV-specific cytotoxic T lymphocyte responses in HIV seronegative health care workers occupationally exposed to HIV-contaminated body fluids. / L.A. Pinto, J. Sullivan, J.A. Berzofsky et al. // J. Clin. Invest. 1995. -V.96. -P.867−76.
  155. Pircher H. Viral escape by selection of cytotoxic T cell-resistant virus variants in vivo. / H. Pircher, D. Moskophidis, U. Rohrer et al. // Nature. 1990. — V.346. -P.629−33.
  156. Prazeres D.M. Large-scale production of pharmaceutical-grade plasmid DNA for gene therapy: problems and bottlenecks. / D.M. Prazeres, G.N. Ferreira, G.A. Monteiro et al. //Trends. Biotechnol. 1999. — V.17. — P. 169−74.
  157. Prazeres D.M.F. Preparative purification of supercoiled plasmid DNA using anion-exchange chromatography. / D.M.F. Prazeres, T. Schluep, C. Cooney // J. Chrom. A. 1998. — V.806. -P.3115.
  158. Price D.A. Antigen-specific release of beta-chemokines by anti-HIV-1 cytotoxic T lymphocytes. / D.A. Price, A.K. Sewell, T. Dong et al. // Curr. Biol. 1998. -V.8. -P.355−8.
  159. Quinn D.G. Transfer of lymphocytic choriomeningitis disease in beta 2-microglobulin-deficient mice by CD4+ T cells. / D.G. Quinn, A.J. Zajac, J.A. Frelinger, D. Muller//Int. Immunol. 1993. — V.5.- P. 1193−8.
  160. Ramshaw I.A. The prime-boost strategy: exciting prospects for improved vaccination. / I.A. Ramshaw, A.J. Ramsay // Immunol. Today. 2000. — V.21. -P.163−5.
  161. Raposo G. Human macrophages accumulate HIV-1 particles in МНС II compartments. / G. Raposo, M. Moore, D. Innes et al. // Traffic. 2002. — V.3. -P.718−29.
  162. Raul R. Late seroconversion in HIV-resistant Nairobi prostitutes despite preexisting HIV-specific CD8+ responses. / R. Raul // The Journal of clinical investigation. -2001. V. l 07. -P.341−9.
  163. Reitter J.N. A role for carbohydrates in immune evasion in AIDS. / J.N. Reitter, R.E. Means, R.C. Desrosiers //Nat. Med. 1998. — V.4. -P.679−84.
  164. Ribergo R.M. In vivo dynamics of T cell activation, proliferation, and death in HIV-1 infection: Why are CD4+ but not CD8+ T cells depleted? / R.M. Ribergo, H. Monhri, D.D. Ho, A.S. Perelson // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 2002. -V.99.-P.l 5572−7.
  165. Rickinson A.B. Long-term T-cell-mediated immunity to Epstein-Barr virus. / A.B. Rickinson, D.J. Moss, L.E. Wallace et al. // Cancer Res. 1981. — V.41. -P.4216−21.
  166. Roberts J.D. The accuracy of reverse transcriptase from HIV-l / J.D. Roberts, K. Bebenek, T.A. Kunkel // Science. 1988. — V.242. — P. l 171−3.
  167. Robertson J.S. Assuring the quality, safety, and efficacy of DNA vaccines. / J.S. obertson, E. riffiths // Mol. Biotechnol. 2001. — V. 17. — P. 143−9.
  168. Robinson H.L. New hope for an AIDS vaccine. / H.L. Robinson // Nat. Rev. Immunol. 2002. — V.2. — P.239−50.
  169. Robinson H.L. Prime boost vaccines power up in people. / H.L. Robinson // Nat. Med.-2003.-V.9.-P.642−3.
  170. Robinson H.L. T cell vaccines for microbial infections. / H.L. Robinson, R.R. Amara // Nat. Med. 2005. — V. 11. — P.25−32.
  171. Robinson W.E. Antibodies to the primaiy immunodominant domain of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) glycoprotein gp41 enhance HIV-1 infection in vitro. / W.E. Robinson, T. Kawamura, D. Lake et al. // J. Virol. -1990. V.64. -P.5301−5.
  172. Rockville M.D. Characterization of plasmid DNA vectors for use in Human gene therapy. / M.D. Rockville, M. Marquet, N.A. Horn, J.A.Meek // Biopharm. -1997. V.5. — P.42−50.
  173. Rodriguez F. Immunodominance in virus-induced CD8+ T-cell responses is dramatically modified by DNA immunization and is regulated by gamma interferon. / F. Rodriguez, S. Harkins, M.K. Slifka, J.L. Whitton // J. Virol. -2002.-V.76.-P.4251−9.
  174. Rowland-Jones S.J. HIV-specific cytotoxic T-cells in HIV-exposed but uninfected Gambian women. / S.J. Rowland-Jones, K. Sutton, T. Ariyoshi, et al. // Nat. Med. 1995. — V.l. -P.59−64
  175. Rowland-Jones S.L. HIV-specific cytotoxic T-cell activity in an HIV-exposed but uninfected infant. / S.L. Rowland-Jones, D.F. Nixon, M.C. Aldhous et al. // Lancet. 1993.-V.3.-P. 860−1
  176. Medzhitov R. Innate immune recognition: mechanisms and pathways./ R. Medzhitov, C.Jr.Janeway // Immunol Rev. 2000. — V.173. — P.89−97.
  177. Rugeles M.T. Alloantigen recognition in utero: dual advantage for the fetus? / M.T. Rugeles // Trends in immunology. 2004. — V.25. — P.348−52.
  178. Sanger F. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors / F. Sanger, S. Nicklen, A.R. Coulson//Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1977. — V.74.-P.5463−7.
  179. Sato Y. Immunostimulatory DNA sequences necessaiy for effective intradermal gene immunization. / Y. Sato, R. Mark, H. Tighe et al. // Science. 1996. — V.273. -P.352−354.
  180. Schmitz J.E. Control of viremia in simian immunodeficiency virus infection by CD8+ lymphocytes. / J.E. Schmitz, M.J. Kuroda, S. Santra et al. // Science. -1999. V.283. — P.857−60.
  181. Seaman M.S. Subsets of memory cytotoxic T lymphocytes elicited by vaccination influence the efficiency of secondary expansion in vivo. / M.S. Seaman, F.W. Peyerl, S.S. Jackson et al. // J. Virol. 2004. — V.78. — P.206−15.
  182. Secchiero P. Extracellular HIV-1 tat protein up-regulates the expression of surface CXC-chemokine receptor 4 in resting CD4+ T cells. / P. Secchiero, D. Zella, S. Capitani et al. Hi. Immunol. 1999. — V. 162. -P.2427−31.
  183. Sedegah M. Protection against malaria by immunization with plasmid DNA encoding circumsporozoite protein. / M. Sedegah, R. Hedstrom, P. Hobart, S.L. Hoffman // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1994. V.91. — P.9866−70.
  184. Sedlik C. In vivo induction of a high-avidity, high-frequency cytotoxic T-lymphocyte response is associated with antiviral protective immunity. / C. Sedlik, G. Dadaglio, M.F. Saron et al. // J. Virol. 2000. — V.74. — P.5769−75.
  185. Shata M.T. Recent advances with recombinant bacterial vaccine vectors. / M.T. Shata, L. Stevceva, S. Agwale, et al. // Mol. Med. Today. 2000. — V.6. — P.66−71.
  186. Shiver J.W. Cytotoxic T lymphocyte and helper T cell responses following HIV polynucleotide vaccination. / J.W. Shiver, H.C. Perry, M.E. Davies et al. // Ann. N.Y. Acad. Sci. 1995. — V.772. — P. 198−208.
  187. Simmonds P. Analysis of sequence diversity in hypervariable regions of the external glycoprotein of human immunodeficiency virus type 1 / P. Simmonds, P. Balfe, C.A. Ludlam et al. //J. Virol. 1990. — V.64. -P.5840−50.
  188. Slifka M.K. Functional avidity maturation of CD8(+) T cells without selection of higher affinity TCR. / M.K. Slifka, J.L. Whitton // Nat. Immunol. 2001. — V.2. -P.711−7.
  189. Sofer G. Handbook of process chromatography: a guide to optimization. Scale-up, and validation. / G. Sofer, L. Hagel // Academic Press, San Diego. 1997.
  190. Sol-Foulon N. HIV-1 Nef-induced upregulation of DC-SIGN in dendritic cells promotos lymphocyte clustering and viral spread. / N. Sol-Foulon, A. Moris, C. Nobile et al. // Immunity. 2002. — V.16. — P. 145−55.
  191. Sparwasser T. Bacterial CpG-DNA activates dendritic cells in vivo: T helper cell-independent cytotoxic T cell responses to soluble proteins. / T. Sparwasser, R.M. Vabulas, B. Villmow et al. // Eur. J. Immunol. 2000. — V.30. — P.3591−7.
  192. Srivastava P. Interaction of heat shock proteins with peptides and antigen presenting cells: chaperoning of the innate and adaptive immune responses. / P. Srivastava // Annu. Rev. Immunol. 2002. — V.20. — P.395−425.
  193. Stadler J. Plasmid DNA purification. / J. Stadler, R. Lemmens, T. Nyhammar // J. Gene. Med. 2004. — V.6. — P.54−66.
  194. Stein B.S. pH-independent HIV entry into CD4-positive T cells via virus envelope fusion to the plasma membrane. / B.S. Stein, S.D. Gowda, J.D. Lifson et al. // Cell. 1987. — V.49. — P.659−68.
  195. Steven G.W. Repressor titration: a novel system for selection and stable maintenance of recombinant plasmids. / G.W. Steven, R.M. Cranenburgh, A.M.E. Weiss et al. // Nucleic Acids Research. 1998. — V.26. -P.2120−4.
  196. Stranford S.A. Lack of infection in HIV-exposed individuals is associated with a strong CD8(+) cell noncytotoxic anti-HIV response. / S.A. Stranford, J. Skurnick, D. Louria et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1999. V.96. — P. 1030−5.
  197. Strick T.R. Behavior of supercoiled DNA. / T.R. Strick, J.F. Allemand, D. Bensimon, V. Croquette // Biophys. J. 1998. — V.74. — P.2016−28.
  198. Su L. Characterization of a virtually full-length human immunodeficiency virus type 1 genome of a prevalent intersubtype (C/B') recombinant strain in China / L. Su, M. Graf, Y. Zhang et al. // J. Virol. 2000. — V.74. — P. 11 367−76.
  199. Sumida S.M. Neutralizing antibodies and CD8+ T lymphocytes both contribute to immunity to adenovirus serotype 5 vaccine vectors. / S.M. Sumida, D.M. Truitt, M.G. Kishko et al. // J. Virol. 2004. — V.78. — P.2666−73.
  200. Sun S. Type I interferon-mediated stimulation of T cells by CpG DNA. / S. Sun, X. Zhang, D.F. Tough, J. Sprent // J. Exp. Med. 1998. — V.188. — P. 233512.
  201. Suni M.A. Detection of antigen-specific T cell cytokine expression in whole blood by flow cytometry. / M.A. Suni, L.J. Picker, V.C. Maino // J. Immunol. Methods. 1998. — V.212. — P.89−98.
  202. Turner B.G. Structural biology of HIV. / B.G. Turner, M.F. Summers // J. Mol. Biol. 1999.-V.285.-P. 1−32.
  203. Ulmer J.B. Heterologous protection against influenza by injection of DNA encoding a viral protein. / J.B. Ulmer, J.J. Donnelly, S.E. Parker et al. // Science. -1993. V.259. — P.1745−9.
  204. Van Parijs L. The Fas/Fas ligand pathway and Bcl-2 regulate T cell responses to model self and foreign antigens. / L. Van Parijs, D.A. Peterson, A.K. Abbas // Immunity. 1998. — V.8. — P.265−74.
  205. Wabl M. Hypermutation at the immunoglobulin heavy chain locus in a pre-B-cell line / M. Wabl, P.D. Burrows, A. von Gabain et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. -1985. V.82. -P.479−82.
  206. Walker B.D. Immune control of HIV: the obstacles of HLA and viral diversity. / B.D. Walker, B.T. Korber // Nat. Immunol. 2001. — V.2. — P.473−5.
  207. Whitmire J.K. Costimulation in antiviral immunity: differential requirements for CD4(+) and CD8(+) T cell responses. / J.K.Whitmire, R. Ahmed // Curr. Opin. Immunol. 2000. — V.12. — P.448−55.
  208. Whitton J.L. The regulation and maturation of antiviral immune responses. / J.L. Whitton, M.K. Slifka, F. Liu et al. // Advances in virus research. 2004. — V.63. -P.181−238.
  209. Wicks I.P. Bacterial lipopolysaccharide copurifies with plasmid DNA: implications of animal models and human gene therapy. / I.P. Wicks, M.L. Howell, T. Hancock et al. // Hum. Gene. Ther. 1995. — V.6. — P.317−23.
  210. Widera G. Increased DNA vaccine delivery and immunogenicity by electroporation in vivo. / G. Widera, M. Austin, D. Rabussay et al. // J. Immunol. 2000. — V. 164. — P.4635−40.
  211. Wilson C.C. Development of a DNA vaccine designed to induce cytotoxic T lymphocyte responses to multiple conserved epitopes in HIV-1. / C.C. Wilson, D. McKinney, M. Anders et al. // J. Immunol. 2003. — V. l71. — P.5611−23.
  212. Wu Y. Selective transcription and modulation of resting T cell activity by preintegrated HIV DNA. / Y. Wu, J.W. Marsh // Science. 2001. — V.293. -P. 1503−6.
  213. Wyatt R. Functional and immunologic characterization of human immunodeficiency virus type 1 envelope glycoproteins containing deletions of the major variable regions. / R. Wyatt, N. Sullivan, M. Thali et al. // J. Virol. 1993. -V.67. -P.4557−65.
  214. Xin K.Q. Immunization of RANTES expression plasmid with a DNA vaccine enhances HIV-1-specific immunity. / K.Q. Xin, Y. Lu, K. Hamajima et al. // Clin. Immunol. 1999. — V.92. — P.90−6.
  215. Yang X. Modifications that stabilize human immunodeficiency virus envelope glycoprotein trimers in solution. / X. Yang, L. Florin, M. Farzan et al. // J. Virol. -2000. V.74. — P.4746−54.
  216. Yang X. Stiochiometry of envelope glycoprotein trimers in the entry of human immunodeficiency virus type 1. / X. Yang, S. Kurteva, X. Ren et al. // J.Virol. -2005. V.79. — P.12 13247.
  217. Zagury D. Interferon alpha and Tat involvement in the immunosuppression of uninfected T cells and C-C chemokine decline in AIDS. / D. Zagury, A. Lachgar, V. Chams et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1998. V.95. — P.3851−6.
  218. Zeh H.J. High avidity CTLs for two self-antigens demonstrate superior in vitro and in vivo antitumor efficacy. / H.J. Zeh, D. Perry-Lalley, M.E. Dudley et al. // J. Immunol. 1999.- V.162.-P.989−94.
  219. Zinkernagel R.M. Antiviral protection by virus-immune cytotoxic T cells: infected target cells are lysed before infectious virus progeny is assembled. / R.M. Zinkemagel, A. Althage // J. Exp. Med. 1977. — V. 145. — P.644−51.
  220. Zinkernagel R.M. On Immunity Against Infections and Vaccines: Credo 2004. / R.M. Zinkemagel // Scand. J. Immunol. 2004. — V.60. — P.9−13.
  221. Zocchi M.R. HIV-1 Tat inhibits human natural killer cell function by blocking L-type calcium channels. / M.R. Zocchi, A. Rubartelli, P. Morgavi, A. Poggi // J. Immunol. 1998. — V.161. -P.293813.
  222. Полная нуклеотидная последовательность плазмидного вектора рВМС
Заполнить форму текущей работой

Сессия? Спокойно!