Распространение и функциональная активность сульфатредуцирующих бактерий в гидротермах Западного Забайкалья
Диссертация
Микробные сообщества щелочных гидротерм относятся к наиболее древним биоценозам Земли. Их изучение играет важную роль в формировании представлений об эволюции биосферы (Kelley et al., 2001; Marteinsson et al., 2001; Lowe, Tice, 2004). Исследование распространения и активности СРБ при высоких значениях температуры и щелочных значений pH актуально для расширения знаний о многообразии микробного… Читать ещё >
Список литературы
- Аверкин Ю.А. Динамика отложения компонентов из гидротермального раствора при выкипании С02 / Ю. А. Аверкин // Геохимия, 1987. -№ 11. С.1580−1585.
- Антоновская М.С. Распределение сульфатредуцирующих бактерий в грунте вблизи газопровода / М. С. Антоновская М.С., И. А. Козлова, Е.И. Анд-реюк // Микробиол. Журнал, 1985. Т. 47, № 2. — С. 93−94.
- Аринушкина Е.В. Руководство по химическому анализу почв / Е. В. Аринушкина // М.: Изд-во МГУ, 1961. 481 с.
- Барабанов Л.Н. Азотные термы СССР / Л. Н. Барабанов, В. Н. Дисдер // М.: Геоминвод ЦНИИ КиФ, 1968. 120 с.
- Барашков Г. К. Сравнительная биохимия водорослей / Г. К. Барашков // М.: Изд-во «Пищевая промышленность», 1972. 336 с.
- Бархутова Д.Д. Влияние экологических условий на распространение и активность бактерий-деструкторов в сероводородных источниках Прибайкалья / Д. Д. Бархутова // Автореф. дис.. канд. биол. наук. Улан-Удэ, 2000. 23 с.
- Басков Е.А. Гидротермы Земли / Е. А. Басков, С. Н. Суриков // Л.: Недра, 1989.-245 с.
- Большой практикум по микробиологии/ Под ред. Г. Л. Селибера // М.: Высшая школа, 1962. 491 с.
- Бонч-Осмоловская Е. А. Восстановление молекулярной серы в термальных альгобактериальных сообществах кальдеры Узон (Камчатка) / Е.А. Бонч-Осмоловская // Биология термофильных микроорганизмов. М.: Наука, 1986.-С. 112−113.
- Бонч-Осмоловская Е. А. Термофильные бактерии, восстанавливающие серу, и формирование ими геохимического барьера / Е.А. Бонч-Осмоловская, Г. А. Заварзин // Кальдерные микроорганизмы. М.: Наука, 1989. 254 с.
- Бонч-Осмоловская Е. А. Термофильные микроорганизмы: общий взгляд / Е.А. Бонч-Осмоловская // Труды института микробиологии имени С. Н. Виноградского. М.: МАКС Пресс, 2011. С. 5−14.
- Борисенко И.М. Минеральные воды Бурятской АССР / И.М. Бо-рисенко, Л. В. Замана // Улан-Удэ: Бурят, кн. изд-во, 1978. 162 с.
- Борисенко И.М. Состав травертинов из отложений некоторых минеральных источников Забайкалья / И. М. Борисенко, Ю. Ч. Очиров, P.M. Сусленкова // Труды геологического института БФ СО АН СССР. Улан-Удэ, 1976. Выпуск 7 (15). С. 36−52.
- Брянская A.B. Биогеохимические процессы в альгобактериаль-ных матах щелочного термального Уринского источника / A.B. Брянская, З. Б. Намсараев, О. М. Калашникова и др. // Микробиология, 2006. Т. 75. № 5. С. 1−11.
- Вайнштейн М.Б. Сульфатвосстанавливающие бактерии водоемов: экология и кластерирование / М. Б. Вайнштейн // Прикладная биохимия и микробиология, 1996. Т. 32, № 1. С. 136−143.
- Геохимия подземных минеральных вод Монгольской Народной Республики / Отв. ред. д. г-м.н. Е. В. Пиннекер // Новосибирск: Наука, 1976. -С. 27−36.
- Герасименко Л.М. Актуалистическая палеонтология цианобакте-риальных сообществ / Л. М. Герасименко // Автореф. дисс.. канд. биол. наук. Москва, 2002. 25 с.
- Голлербах М.М. Определитель пресноводных водорослей СССР / М. М. Голлербах, Е. К. Косинская, В. И. Полянский // М.: Госуд. Изд-во «Советская наука», 1953. Вып. 2. 398 с.
- Голубев В.А. Тепловые и химические характеристики гидротермальных систем Байкальской рифтовой зоны / В. А. Голубев // Сов. геология, 1982. № 10.-С.100−108.
- Горленко В.М. Продукционные процессы в микробных сообществах горячего источника Термофильного / В. М. Горленко, Д. А. Старынин, Е.А. Борч-Осмоловская, В. И. Качалкин // Микробиология, 1987. Т. 56. Вып. 5.-С. 872−878.
- Горленко В.М. Формирование микробных матов в горячих источниках и активность продукционных и деструкционных процессов / В. М. Горленко, Е.А. Бонч-Осмоловская // Кальдерные микроорганизмы. М.: Наука, 1989.-С. 53−64.
- Грабович М.Ю. Участие прокариот в круговороте серы / М. Ю. Грабович // Соросовский образовательный журнал, 1999. № 12. С. 16−20.
- Гусев М.В. Микробиология / М. В. Гусев, Л. А. Минеева // М.: Из-дат. центр «Академия», 2003. 464 с.
- Дулов Л.Е. Микробиологические процессы на гидротермальном поле Лост Сити, Срединно-Атлантический хребет / Л. Е. Дулов, А. Ю. Леин, Г. А. Дубинина, Н. В. Пименов // Микробиология, 2005. Т. 74. С. 111−118.
- Еленкин A.A. Синезеленые водоросли СССР. Специальная часть / A.A. Еленкин // М. Л.: Изд-во АН СССР, 1949. Вып. 2. — С. 990.
- Заварзин Г. А. Бактерии и состав атмосферы / Г. А. Заварзин // М.: Наука, 1984. 199 с.
- Заварзин Г. А. Введение в природоведческую микробиологию / Г. А. Заварзин, H.H. Колотилова // М.: Книжный дом «Университет», 2001. -256 с.
- Заварзин Г. А. Кальдерные микроорганизмы / Г. А. Заварзин, Г. А. Карпов, В. М. Горленко и др. // М.: Наука, 1989. 120 с.
- Заварзин Г. А. Лекции по природоведческой микробиологии / Г. А. Заварзин// М.: Наука, 2003.-348 с.
- Заварзин Г. А. Литотрофные микроорганизмы / Г. А. Заварзин // М.: Наука, 1972.-323 с.
- Заварзин Г. А. Микробный геохимический цикл кальция Г.А. Заварзин // Микробиология, 2002. Т. 71. С. 5−22.
- Заварзин Г. А. Развитие микробных сообществ в истории Земли / Г. А. Заваризн / В кн.: Проблемы доантропогенной эволюции биосферы / Отв. ред. д.г.-.м.н. А. Ю. Розанов // М.: Наука, 1993. С. 212−222.
- Заварзин Г. А. Эпиконтинентальные содовые водоемы как предполагаемые реликтовые биотопы формирования наземной биоты Г.А. Заваризн // Микробиология, 1993. Т. 62. Вып. 5. С. 789−800.
- Замана Л.В. О происхождении сульфатного состава азотных терм Байкальской рифтовой зоны / Л. В. Замана // ДАН, 2000. Т. 372. № 3. С. 361 363.
- Зякун A.M. Теоретические основы изотопной масс-спектрометрии в биологии A.M. Зякун // Пущино: Фотон-век, 2010. 224 с.
- Иванов В.М. Круговорот серы в озерах и водохранилищах В.М. Иванов / В кн.: Глобальный геохимический цикл серы и влияние на него деятельности человека // М.: Наука, 1983. С. 256−280.
- Иванов М.В. Применение изотопов для изучения интенсивности процесса редукции сульфатов в озере Беловодь / М. В. Иванов // Микробиология, 1956. Т. 25. Вып. 3. С. 305−310.
- Илялетдинов А.Н. Микробиологические превращения металлов /
- A.Н. Илялетдинов // Алма-Ата: Наука, 1984. 268 с.
- Исаченко Б.Л. Микробиологические исследования над грязевыми озерами Б.Л. Исаченко // Избр. труды. М.: Изд-во АН СССР, 1951. Т. 2. 143 с.
- Исаченко Б.Л. Хлористые, сульфатные и содовые озера Кулундин-ской степи и биогенные процессы в них / Б. Л. Исаченко // Изб. труды. Л.: Изд-во АН СССР, 1951. Т.2.-143 с.
- Калашникова О.М. Продукция и состав органического вещества циано-бактериальных матов щелочных водных экосистем Забайкалья / О. М. Калашникова // Автореф. дисс.. .канд. биол. наук. Улан-Удэ, 2006. 23 с.
- Кашеварова И.М. Оценка численности сульфатредуцирующих и ме-танобразующих бактерий в донных отложениях водоема охладителя Белорусской АЭС / И. М. Кашеварова // Конф. молодых ученых и специалистов «Эколо-гия-98»: Тез. докл. Архангельск, 1998. С. 81.
- Кирюхин В.К. Гидрогеохимическое значение и методы изучения органических форм миграции элементов / В. К. Кирюхин, С. Р. Крайнов, В. М. Швец // Гидрогеохимические методы поисков рудных месторождений. Новосибирск: Наука, 1982. С. 33−38.
- Компанцева Е.И. Фототрофные сообщества в некоторых термальных источниках озера Байкал / Е. И. Компанцева, В. М. Горленко // Микробиология, 1988. Т. 57. № 5. С. 841−846.
- Крайнов С.Р. Основы геохимии подземных вод / С. Р. Крайнов,
- B.М. Швец // М.: Недра, 1980. 285 с.
- Крайча Я. Газы в подземных водах / Я. Крайча // М.: Недра.1980.
- Кузнецов A.JI. Новое в фауне Дальневосточных морей. Необычное сообщество. Жизнь в условиях сероводородного и метанового насыщения / А. Л. Кузнецов // 3 съезд сов. экологов. Тезисы докл. Л., 1987. 4.2. С. 82−84.
- Кузнецов С. И. Роль микроорганизмов в круговороте веществ в озерах / С. И. Кузнецов // М.: Изд-во АН СССР, 1952. 300 с.
- Кузнецов С.И. Круговорот серы в озерах / С. И. Кузнецов // Микробиология, 1942. Т. 11. № 5−6. С. 218−241.
- Кузнецов С.И. Микробиологические процессы круговорота углерода и азота в озерах / С. И. Кузнецов, A.M. Саралов, Т. Н. Назина // М.: Наука, 1985.-213 с.
- Кузнецов С.И. Микробиологическое изучение внутренних водоемов / С. И. Кузнецов, В. И. Романенко // Л.: Изд-во АН СССР, 1963. 129 с.
- Кузнецов С.И. Микрофлора озер и ее геохимическая деятельность / С. И. Кузнецов // Л.: Наука, 1970. 440 с.
- Леин А.Ю. Белые столбы Покинутого города / А. Ю. Леин, Ю. А. Богданов, A.M. Сагалевич, В. И. Пересыпкин, Л. Е. Дулов // Природа, 2002. № 12.-С. 40−46.
- Ломоносов И.С. Геохимия и формирование современных гидротерм Байкальской рифтовой зоны И.С. Ломоносов // Новосибирск: Наука, 1974.-227 с.
- Назина Т.Н. Микробиологическая и геохимическая характеристика карбонатных нефтяных коллекторов Татарии / Т. Н. Назина, А. Е. Иванова, B.C.
- Ивойлов, Ю.М. Миллер, Р.Р. Иватуллин, С. С. Беляев, М. В. Иванов // Микробиология, 1998. Т. 67. № 5. с. 694−700.
- Намсараев Б.Б. Геохимическая деятельность микроорганизмов гидротерм Байкальской рифтовой зоны / Б. Б. Намараев, Д. Д. Бархутова, Э. В. Данилова // Новосибирск: Академическое изд-во «Гео», 2011. 302 с.
- Намсараев Б.Б. Микробиологические процессы круговорота углерода в донных осадках озера Байкал / Б. Б. Намсараев, Т. И. Земская // Новосибирск: Изд-во СО РАН, филиал «Гео», 2000. 160 с.
- Намсараев З.Б. Микробные сообщества щелочных гидротерм / З. Б. Намсараев // Автореф. дисс.. канд. биол. наук. Москва, 2003. 23 с.
- Намсараев З.Б. Микробные сообщества щелочных гидротерм / З. Б. Намсараев, В. М. Горленко, Б. Б. Намсараев, Д. Д. Бархутова // Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2006. 111 с.
- Намсараев З.Б. Структура и биогеохимическая активность фото-трофных сообществ щелочного Болыпереченского термального источника / З. Б. Намсараев, В. М. Горленко, Б. Б. Намсараев, С. П. Бурюхаев, В. В. Юрков // Микробиология, 2003а. Т. 72. С. 228−238.
- Нетрусов А.И. Практикум по микробиологии / А. И. Нетрусов, М. А. Егорова, Л. М. Захарчук и др. / Под ред. А. И. Нетрусова // М.: Изд. центр «Академия», 2005. 608 с.
- Нетрусов А.И. Экология микроорганизмов / А. И. Нетрусов, Е.А. Бонч-Осмоловская, В. М. Горленко и др. // Учебн. для студ вузов под ред. А. И. Нетрусова. М.: Издательский центр «Академия», 2004. 272 с.
- Орлеанский В.К. Лабораторное моделирование термофильного циано-бактериального сообщества / В. К. Орлеанский, Л. М. Герасименко // Микробиология, 1982. Т. 51. № 4. С. 538−542.
- Перельман А.И. Геохимия ландшафтов / А. И. Перельман // М.: Высшая школа, 1966. 268 с.
- Перельман А.И. Геохимия элементов в зоне гипергенеза / А. И. Перельман // М.: Недра, 1972. 288 с.
- Петрографический словарь. М.: Недра, 1981.
- Пименов Н.В. Использование минерального углерода для измерения продукции органического вещества в водоемах / Н. В. Пименов, A.M. Зякун, Т. С. Прусакова, О. Н. Лунин, М. В. Иванов // Микробиология, 2008. Т. 77. № 2.-С. 261−265.
- Пиневич A.B. Микробиология. Биология прокариотов A.B. Пине-вич // Учебник. В 3 т. Том 2. СПб.: Изд-во С.-Петерб. ун-та, 2007. 331 с.
- Пиннекер Е.В. Геохимия подземных минеральных вод Монгольской Народной Республики / Е. В. Пиннекер // Новосибирск: Наука, 1980. С. 437.
- Плюснин A.M. Особенности формирования травертинов из углекислых и азотных термальных вод в зоне Байкальского рифта / A.M. Плюснин, А. П. Суздальницкий, A.A. Адушинов, А. Г. Миронов // Геология и геофизика, 2000. Т.41. № 4. С. 564−570.
- Посохов Е.В. Общая гидрогеохимия / Е. В. Посохов // Л.: Недра, 1975.-208 с.
- Резников A.A. Методы анализа природных вод / A.A. Резников, Е. П. Муликовская, И. Ю. Соколов // М.: Недра, 1970. С. 152.
- Резяпова К.Б. Мониторинг биообразований оборотного водоснабжения нефтеперерабатывающих заводов / К. Б. Резяпова, H.H. Силищев, P.P. Ха-зипов, Р. Я. Нучаев // Башкирский химический журнал, 1998. Т. 5. № 4. С. 6263.
- Розанова E.JI. Методы культивирования и идентификации анаэробных бактерий, восстанавливающих серу и ее окисленные соединения / Е. Л. Розанова // Теоретические и методические основы изучения анаэробных организмов. Пущино, 1978.-С. 123−136.
- Розанова Е.Л. Микробиологические процессы и коррозия металлического оборудования в заводняемом нефтяном пласте / Е. Л. Розанова, И.А. Мехтиева//Микробиология, 1969. Т. 38. № 5. С. 860−867.
- Розанова Е.Л. Микрофлора нефтяных месторождений / Е. Л. Розанова, С. И. Кузнецов // М.: Наука, 1974. 196 с.
- Розанова Е.Л. Новые данные о сульфатвосстанавливающих и мета-нобразующих бактериях / Е. Л. Розанова // Успехи микробиологии, 1978. Т. 13. -С. 164−187.
- Розанова Е.П. Современные представления о сульфатвосстанавливающих бактериях. Хемосинтез / Е. Л. Розанова, Т. Н. Назина // М.: Наука, 1989.-С. 199−227.
- Розанова Е.П. Сульфатвосстанавливающие бактерии. Систематика и метаболизм / Е. П. Розанова, Т.Н. Назина// Успехи микробиологии, 1989. Т.23.-С. 191−226.
- Рубенчик Е.П. Сульфатредуцирующие бактерии / Е. П. Рубенчик // М.: Изд-во АН СССР, 1947. 95 с.
- Семихатов М.А. Биотические события и положительная изотопная аномалия карбонатного углерода 2.3−2.06 млрд. лет назад / М. А. Семихатов, М. Е. Раабен, В. Н. Сергеев, А. Ф. Вейс, О. В. Артемова // Стратиграфия. Геол. Корреляция, 1999. Т.7. № 5. С. 3−27.
- Скибицкий A.B. Основы курортологии / A.B. Скибицкий // М.: Изд-во Феникс, 2008. 557 с.
- Слободкин А.И. Диссимиляционное восстановление неорганических акцепторов электронов термофильными анаэробными прокариотами / А. И. Слободкин, Д. Г. Заварзина, Т. Г. Соколова // Микробиология, 1999. Т. 68. № 5.-С. 600−622.
- Соколова Е.А. Влияние температуры на развитие сульфатредуци-рующих бактерий в экспериментальных и полевых условиях в зимний период / Е. А. Соколова // Сибирский эколог. Журнал, 2010. № 6. С. 865−869.
- Соломин Г. А., Крайнов С. Р. Щелочные составляющие природных и сточных щелочных вод, геохимические процессы их нейтрализации кислыми и околонейтральными подземными водами / Г. А. Соломин, С. Р. Крайнов // Геохимия, 1998. № 2. -С. 183−201.
- Сорокин Ю. И. Взаимосвязь микробиологических процессов круговорота серы и углерода в меромиктическом озере Беловодь / Ю. И. Сорокин // Тр. ИБВВ АН СССР, 1966. Т. 12 (15). С. 332−355 .
- Сорокин Ю.И. Биомасса бактерий и химический состав грунтов Рыбинского водохранилища / Ю. И. Сорокин // Бюл. Ин-та биологии водохранилищ, 1954. № 4. С. 3−6.
- Сорокин Ю.И. О содержании сульфидов в грунтах Черемшанекого и Сусканского заливов Куйбышевского водохранилища Ю.И. Сорокин // Бюл. Ин-та биологии водохранилищ, 1960. № 6. — С. 3−6.
- Сорохтин О.Г. Развитие Земли / О. Г. Сорохтин, С. А. Ушаков / Под ред. акад. В. А. Садовничего // М.: Изд-во Моск. ун-та. 2002. 560 с.
- Справочник биохимика / Р. Досон, Д. Элиот, У. Элиот, К. Джонс // М.: Мир, 1991.-554 с.
- Старынин Д.А. Альгобактериальные маты бухты Кратерной / Д. А. Старынин, В. М. Горленко, М. В. Иванов, О. В. Карначук // Биология моря, 1989. № 3.-С. 70−77.
- Стащук М.Ф. Проблема окислительно-восстановительного потенциала в геологии / М. Ф. Стащук // М.: Недра, 1968. 256с.
- Сукачева М.В. Синтрофные ассоциации фототрофных и сульфат-восстанавливающих бактерий / М. В. Сукачева, Ю. В. Родионов // Матер, межд. конф. «Автотрофные микроорганизмы». М.: 2000. С. 177.
- Улановский И. Б. Электрокинетические свойства сульфатвосстанав-ливающих бактерий И. Б. Улановский, Е. К. Руденко, Е. А. Суприн, А. В. Леденев // Микробиология, 1980. Т. 49. № 1. С. 117−122.
- Шлегель Г. Общая микробиология / Г. Шлегель // М.: Мир, 1987. 567 с.
- Akagi J.M. Biology of inorganic nitrogen and sulfur / J.M. Akagi // Berlin. Heidelberg. New York: Springer, 1981. P. 178−187.
- Awramik S.M. Microbial mats: Stromatolites / S.M. Awramik, Y. Eds Cohen, R.W. Castenholz, H.O. Halvorson // New York: Alan R. Liss, 1984. 22 p.
- Bayomy M.A. Sulfide production by sulfate reducing bacteria with lactate as feed in a upfloww anaerobic fixed film reactor / M.A. Bayomy, J.A. Bewtia,
- N. Bismas // Water Air. and Soil Pollut, 1999. Vol. 112. P. 67−84.
- Belkin S. Biological and abiological sulfur reduction at high temperatures / S. Belkin, C.O. Wirsen, H.W. Jannasch // Appl. Environ. Microbiol, 1985. Vol. 49.-P. 1057−1061.
- Blank C.E. Microbial composition of near-boiling silica-depositing thermal springs throughout Yellowstone National Park / C.E. Black, S.L. Cady, N.R. Pace // Appl. Environ. Microbiol, 2002. Vol. 68. P. 5123−5135.
- Boetius A. OCEAN SCIENCE: Lost City Life / A. Boetius // Science, 2005. Vol. 307. P. 1420−1422.
- Bryant M.P. Growth of Desulfovibrio on lactate or ethanol media low in sulfate with H2 utilizing methanogenic bacteria / M.P. Bryant, L.L. Campbell, C.A. Reddy, M.A. Crabil // Appl. and Environ Microbiol. 1977. Vol. 53 P. 11 621 169.
- Burggaf S. Archaeoglobus profundus sp. nov., represents a new species within the sulfate-reducing archaebacteria / S. Burgaff, H.M. Jannasch, B. Nicolaus, K.O. Stetter// Syst. Appl. Microbiol, 1990. Vol. 13. P. 24−28.
- Campbell L.L. Classification of the sporeforming sulfate reducing bacteria / L.L. Campbell, J.R. Postgate // Bacterid. Revs, 1965. Vol. 29. № 3. P. 359 369.
- Castenholtz R.W. Composition of hot spring microbial mats // A summary. / R.W. Castenholtz, Y. Cohen, H.O. Halvorson // Microbial Mats: Stromatolites. New York, 1984. P. 101−119.
- Castro H.F. Phylogeny of sulfate-reducing bacteria / H.F. Castro, N.H. Williams, A. Orgam // FEMS Microbiol. Ecol., 2000. Vol. 31. P. 1−9.
- Chafetz H.S. Microenvironmental controls on mineralogy and habit of CaC03 precipitates: an example from an active travertine system /H.S. Chafetz, P.F. Rush, N.M. Utech // Sedimentology, 1991. Vol. 38. P. 107−126.
- Chafetz H.S. Travertines: depositional morphology and the bacterially constructed constituents / H.S. Chafetz, R.L. Folk // J. Sedim. Petrol., 1984. Vol. 54.-P. 289−316.
- Compeace G.C. Sulphate-reducing bacteria: principal methylators of mercury in anoxic estuarinesediment / G.C. Compeace, R. Bartha // Appl. and Environ Micribiol, 1985. Vol. 50. № 2. P. 498−502
- Cook T.L. Biogeological mineralization in deep-sea hydrothermal deposits / T.L. Cook, D.S. Stackes // Science, 1995. Vol. 267. P. 1975−1979.
- Cypionka H. Oxygen respiration by Desulfovibrio species / H. Cy-pionka // Annu. Rev. Microbiol., 2000. Vol. 54. P. 827−848.
- Dermot M. Heavy metal removal / M. Dermot // Chem. Brit., 1991. Vol. 27. № 10.-P. 884.
- Dilling W. Aerobic respiration in sulfate-reducing bacteria / W. Dilling, H. Cypionka // FEMS Microbiology Letters, 1990. Vol. 71 (1). P. 123−127.
- Dolla A. Oxygen defense in sulfate-reducing bacteria A. Dolla, M. Fournier, Z. Dermoun // J. of Biotechnology, 2006. Vol.126. P. 87−100.
- Donnenberg S. Oxydation of H2, organic compounds and inorganic compounds coupled to reduction of 02 or nitrate by sulfate-reducing bacteria / S. Donnerbarg, M. Kroder // Arch. Microbiol. 1992. Vol. 158. P. 93−99.
- Edwards E.A. Anaerobic degradation toluene and xylene by aquifer microorganisms under sulfate-reducing conditions / E.A. Edwards, L.E. Wills, A. Rein-nard, D. Grbic-Galic // Appl. and Environ Microbiol., 1992. Vol. 58. № 3. P. 798 800.
- Ehrlih H.L. Geomicrobiology. 3rd ed. Marcel Dekker Inc. / H.L. Ehrlih //New York, 1996.
- Fareleira P. Response of a strict anaerobe to oxygen: survival strategies in Desulfovibrio gigas / M.J. Ferris, B.S. Santos, C. Antonio // Microbiology, 2003. Vol. 149.-P. 1513−1522.
- Ferris F.G. Iron-silica crystallite nucleation by bacteria in a geother-mal sediment / F.G. Ferris, T.J.Bevridge, W.S. Fyfe // Nature, 1986. Vol. 320. P. 609−611.
- Ferris M.J. Population structure and physiological changes within a hot spring microbial mat community following disturbance / M.J. Ferris. S.C.
- Nold, N.P. Revsbech, D.M. Ward // Appl. Environ. Microbiol., 1997. Vol. 63. P. 1367−1374.
- Fiebig K. Methanogenesis from choline by a coculture of Desulfovi-brio sp. and Methanosarcina barkeri / K. Fiebig, G. Gottschalk // Appl. Environ. Microbiol., 1983. Vol. 45. P. 161−168.
- Finster K. Sulfurospirillum arcchonense sp. nov., a new microaero-philic sulfur-reducing bacterium / K. Finster, W. Liesack, BJ. Tindall // Int. l J. Syst. Bacterial., 1998. Vol. 39. P. 159−167.
- Fortin D. Precipitation of iron, silica, and sulfate on bacterial cell surfaces / D. Fortin, F.G. Ferris // Geomicrobiol. J., 1998. Vol. 15. № 4. P. 309−324.
- Fouke B.W. Depositional facies and aqueous-solid geochemistry of travertine depositing hot springs (Angel terrace, Mammoth hot springs, Yellowstone national park, USA) / B.W. Fouke et al. // J. Sedimentary Resarch., 2000. Vol. 70.-P. 565−585.
- Friedrich M.W. Phylogenetic analysis reveals multiple lateral transfers at adenosine-5″ -phosphosulfate reductase genes among sulphate-reducing microorganisms / M.W. Friedrich // J. Bacteriol., 2002. V. 184. P. 278−289.
- Garrity G.M. Bergeys manual of systematic bacteriology. 2th ed. Tax-onomic outline of the prokaryotes release 5.0 / G.M. Garrity, J.A. Bell, T.G. Lil-burn // Springer. New York, 2004. P. 401−406.
- Geladi P. Analysis of multiway (multimode) data / P. Gelady // Che-mom. Intell. Lab. Syst., 1989. Vol. 7. P. 11−30.
- Golanty E. Living on sulfide. Internal nutrition on the ocean floor II / E. Golanty // Oceanus, 1985. Vol. 18. № 4. P. 65−66.
- Gorban A. N. Principal manifolds and graphs in practice: from molecular biology to dynamical systems / A.N. Gorban. A. Zinovyev // Int. J. Neural Syst., 2010. Vol. 20. № 3. P. 219−232.
- Griechaber M.K. Animal adaptations for tolerance and explotation of pi-osonous sulfide / M.K. Griechaber, S. Volkel // Annu. Rev. Physiol., 1998. Vol.60. Palo Alto (Calif.). P. 37- 53.
- Hanada S. A new thermophilic filamentous photosynthetic bacterium which actively forms bacterial mat-like aggregates / S. Hanada, A. Hiraishi, K. Shimada, K. Matsuua // 8th. Intern. Symp. on Phototrophic Procaryotes. Italy, 1994.-P. 10−15.
- Haouari O. Desulfotomaculum hydrothermal sp. nov., a thermophilic sulfate-reducing bacterium isolated from a terrestrial Tunisian hot spring / O. Haouari // Int. J. of Syst. and Evolutionary Microbiology, 2008. Vol. 58. P. 25 292 535.
- Hugenholtz P. Novel division level bacterial diversity in a Yellowstone hot spring / P. Hugenholtz, C. Pitulle, K.L. Hershberger, N.R. Pace // J. Bac-teriol., 1998. V.180. -P.366−376.
- Inagaki F. Microbial silica deposition in geothermal hot waters / F. Inagaki, Y. Motomura, S. Ogata // Appl. Microbiol. Biotechnol., 2003. Vol. 60. -P. 605−611.
- Itoh T. Caldivirga maquilingensis gen. nov., sp. nov., a new genus of rod-shaped crenarchaeote isolated from a hot spring in the Philippines T. Itoh, K. Suzuki, P.C. Sanchez, T. Nakase // Int. J. Syst. Bacterid., 1999. Vol. 49. P. 1157−1163.
- Jannasch H.W. Geomicrobiology of deep-sea hydrothermal vents / H.W. Jannasch, MJ. Mottl // Science, 1985. Vol. 229. P. 717−725.
- Jones B. Biogenicity of silica precipitation around geysers and hot spring vents, North Island, New Zealand / B. Jones, R.W. Renaut, M.R. Rosen // J. Sediment. Res., 1997. Vol. 67. P. 88−104.
- Jones B. Influence of thermophilic bacteria on calcite and silica precipitation in hot springs with water temperature above 90°C: evidence from Kenya and New Zealand / B. Jones, R.W. Renaut // Can. J. Earth Sci., 1996. Vol. 33. P. 72−83.
- Jones B. Vertical zonation of biota in microstromatolites associated with Hot Springs, North Island, New Zealand / R.W. Renaut, M.R. Rosen // Palaios, 1997. Vol. 12. P. 220−236.
- Jonkers H. M. Dimethylsulfoxide reduction by marine sulfur-reducing bacteria / H.M. Jonkers // FEMS Microbiology Letters, 1996. Vol. 136. P. 283 287.
- Jorgensen B.B. Bacterial zonation, photosynthesis and spectral light distribution in the hot spring microbial mats of Iceland / B.B. Jorgensen, D.C. Nelson // Microbial Ecology, 1988. Vol. 16. P. 133−148.
- Karnachuk O.V. Sulfate reduction potential in sediments in the Norilsk mining area, northern Siberia / O.V. Karnachuk // Geomicrobiol. J., 2005. Vol. 22.-P. 11−25.
- Kerry A., Welboum P.M., Prucha B., Mierly G. Mercury methylation by sulphate-reducing bacteria from sediments of an acid stressed lake / A. Kerry, P.M. Welboum, B. Prucha, G. Mierly // Poll. Arch. Hydrobiol, 1992. Vol. 37. P. 313−326.
- Kevbrin V. Anoxybacillus kamchatkensis sp. nov., a novel thermophilic facultative aerobic bacterium with a broad pH optimum from the Geyser valley, Kamchatka / V. Kevbrin, K. Zengler, A. Lysenko, J. Wiegel // Extremo-philes., 2005. V. 9. P. 391−398.
- Klein M. Multiple lateral transfer events of dissimilatory sulfite reductase genes between major lineages of bacteria / M. Klein // J. Bacterid., 2001. Vol. 183.-P. 6028−6034.
- Konhauser K.O. Diversity of iron and silica precipitation by microbial mats in hydrothermal waters, Iceland: implications for Precambrian iron formations / K.O. Konhauser, F.G. Ferris // Geology. 1996. Vol. 24. P. 323−326.
- Kremer D.R. Ethanol dissimilation in Desulfavibrio / D.R. Kremer, T.A. Hansen//Arch.V Microbiol., 1987. Vol. 147.-P. 249−256.
- Kuwabara J.S. Dissolved sulfides in the oxic water columb of San Francisco Bay, California / J.S. Kuwabara // Estuaries, 1993.Vol. 16. № 3A. P. 850−856.
- Lane D. J. 16S/23S sequencing // In: Nucleic acid techniques in bacterial systematics / Stackebrandt E. a. Goodfellow M. (Eds.)// Chichester: John Wiley, Sons Ltd., 1991.-P. 115−175.
- Lemos R.S. The «strict» anaerobe Desulfavibrio gigas contains a membrane-bound oxygen respiratory chain / R.S. Lemos, C.M. Gomes, M. Santa-na, J. LeGall, A.V. Xavier, M. Teixeira // J. Inorg. Biochem., 2001. Vol. 86. P. 314.
- Lovley D.R. Dissimilatory Fe (III) and Mn (IV) reduction / D.R. Lov-ley, D.E. Holmes, K.P. Nevin // Adv. Microb. Physiol., 2004. Vol. 49. P. 221 286.
- Lovley D.R. Enzymatic iron and uranium reduction by sulfate-reducing bacteria/ D. R. Lovley, E. E. Roden, E. J. P. Phillips, J. C. Woodward// Marine Geol., 1993. Vol. 113. P. 41−53.
- Lovley D.R. Reduction of uranium by Desulfavibrio desulfuricans! D.R. Lovley, E.J. Phillips // Appl. Environ. Microbiol., 1992. Vol. 58. P. 850 856.
- Myers C.R. Bacterial manganese reduction and growth with manganese oxide as the sole electron-acceptor / C.R. Myers, K.H. Nealson // Science, 1988. Vol. 240.-P. 1319−1321.
- Neal C. Hydrogen generation from mantle source rocks in Oman C. Neal, G. Strahger // Earth Planet. Sci. Lett., 1983. Vol. 66. P. 315−320.
- Oehler J.H. Artificial microfossils: experimental studies of permineralisation of blue-green algae in silica / J.H. Oehler, J.W. Schopf // Science, 1971. Vol. 174. P. 1229−1231.
- Ollivier B., Cord-Ruwisch R., Hatchikian E.C., Garcia J. L. Characterization of Desulfovibrio fructosovorans sp. nov. / B. Ollivier, R. Cord-Ruwisch, E.C. Hatchikian, J.L. Garcia//Arch. Microbiol., 1988. Vol. 149. P. 447−450.
- Pentecost A. Formation of laminate travertines at Bagno Vignone, Italy / A. Pentecost // Geomicrobiol. J., 1994. Vol. 12. P. 239−252.
- Pentecost A. Significance of the biomineralizing microniche in a Lyngbia (Cyanobacterium) travertine / A. Pontecost // Geomicrobiol. J., 1995. Vol. 13.-P. 213−222.
- Pfennig N. Photosynthetic bacteria / N. Pfennig // Ann. Rev. Microbiol., 1967. Vol. 21. P. 285- 324.
- Pfennig N. Phototrophic green and purple bacteria: a comparative systematic survey / N. Pfennig // Ann. Rev. Microbiol., 1977. Vol. 31. P. 275−290.
- Phillips L.E. Enrichment and characterisation of sulfate-reducing bacteria from sands tone rock cores from the UK continental shelf / L.E. Phillips, M.M. Lappr-Seatt // FEMS Microbiology, 1997. Vol. 20. № 374. P. 415−424.
- Postgate J.R. Classification of Desulfovibrio species the now sporulat-ing sulfate-reducing bacteria / J.R. Postgate, L.L. Campbell // Bacterid. Revs, 1966. Vol. 30. № 4.-P. 728−738.
- Rabus R. Dissimilatory sulfateand sulfur-reducing prokaryotes / R. Rabus, T.A. Hansen, F. Widdel // In: M. Dworkin, S. Falkow, E. Rosenberg, K.-H. Schleifer, E. Stackebrandt (Eds). The Procaryotes. 3rd ed. Springer. New York. 2006. Vol. 2.-P. 659−768.
- Revsbech N.P. Microelectrode studies of interstitial water chemistry and photosynthetic activity in a hot spring microbial mat / N.P. Revsbech, D.M. Ward // Appl. Environ. Microbiol, 1984. Vol. 48. № 2. P. 270−275.
- Roy A.B. The biochemistry of inorganic compounds of sulphur / A.B. Roy, P.A. Trudinger // Cambridge.: Cambridge University Press, 1970.
- Rueter P. Anaerobic oxidation of hydrocarbons in crubde oil by new types of sulfate-reducing bacteria / P. Rueter, R. Rabus, H. Wilkes // Nature. 1994.1. Vol. 372.-P. 455−458.
- Sanger F. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors / F. Sanger, S. Nicklen, A.R. Coulson // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1977. Vol. 84. P. 5463−5467
- Schauder R. Bacterial sulfur respiration/ R. Schauder, A. Kroger / R. Schauder, A. Kroger // Arch. Microbiol. 1993. Vol. 159. P. 491−497.
- Schauder R. Polysulfide as a possible substrate for sulfur-reducing bacteria / R. Schauder, E. Muller // Arch. Microbiol. 1993. Vol. 160. P. 377−382.
- Schoberth S. A new strain of Desulfovibrio gigas isolated from a sewage plant / S. Schoberth // Archives of Microbiology, 1973. Vol. 92. P. 365 368.
- Shen Y.A. Isotopic evidence for microbial sulfate reduction in the early Archaean era / Y.A. Shen, R. Buick, D.E. Canfield // Nature, 2001. Vol. 410. -P. 77−81.
- Sleep N.P. H2-rich fluids from serpentinization: geochemical and bio-tic implications / N.P. Sleep, A. Meibom, Th. Fridriksson // PNAS, 2004. Vol. 101. № 35.-P. 12 818−12 823.
- Smith D.W. Ecological actions of sulfate-reducing bacteria/ In: The sulfate-reducing bacteria contemporary perspectives (Eds.: J.M. Odom Rivers Singleton, Jr.) / D.W. Smith // Contemporary Bioscience. XXI. 1993. P. 161−189.
- Spiro B. One day in the life of a stream a diurnal inorganic carbon mass balance for a travertine-depositing stream (Waterfall beck, Yorkshire) / B. Spiro, A. Pentecost // Geomicrobiol. J., 1991. Vol. 9. № 1. — P. 1−12.
- Stamse A.J.M. Utilization of amino acids as energy substrates by two marine Desulfovibrio strains / A.J.M. Stamse, T.A. Hansen, G.W. Skyring // FEMS Microbiol, andEcol. 1985. Vol. 31.-P. 11−15.
- Stetter K.O. Archaeoglobus fulgidus gen.nov., sp.nov.: a new taxon of extremely thermophilic Archeabacterial K.O. Stetter // Syst. Appl. Microbiol. 1988. Vol. 10.-P. 172−173.
- Stetter K.O. Hyperthermophilic archaea are thriving in deep North Sea and Alaskan oil reservoirs / K.O. Stetter, R. Huber, E. Blochl, M. Kurr // Nature. 1993. Vol. 365.-P. 743−745.
- Thauer R.K. A Fifth Pathway of Carbon Fixation / R.K. Thauer // Science. 2007. Vol. 318.-P. 1732−1733.
- Truper H.G., Schlegel H.G. Sulphur metabolism in Thiorhodaceae. I. Quantative measurements on growing cells of Chromatium okenii / H.G. Truper, H.G. Schlegel // J. Microbiol. And Serol. 1964. Vol. 30. № 3. P. 225
- Ueki K. Removal of sulfate and heavy metals from acid’mine water by anaerobic treatment with cattle waste: Effects of heavy metals on sulfate reduction / K. Ueki, A. Ueki // J. Environ Sci. and Healt. A. 1991. Vol. 26. № 8. P. 1471−1489.
- Volkel S. Sulfide tolerance and detoxication in Arenicola marina and Si-punculus nudus / S. Volkel // II Amer. Zool. 1995. Vol. 35. № 2. P. 145−153.
- Walter M.R. Archean stromatolites: evidence of the Earth’s earliest benthos. In Earth’s earliest biosphere: it’s origin and evolution / M.R. Walter // J.W. Schopf. Princeton. 1983. P. 326−362.
- Walter M.R. Geyserites of Yellowstone national park: an example of abiogenic «stromatolites» / M.R. Walter // In Stromatolites. Developments in sedi-mentology. Elsevier. Amsterdam-Oxford-New-York. 1976. Vol. 20. P. 87−112.
- Ward D.M. Decomposition of hot spring microbial mats / D.M. Ward, E. Beck, N.P. Revsbech, K.A. Sandbeck, M.R. Winfrey // In Microbial mats: Stromatolite. 1984.-P. 191−214
- Ward D.M. Microbiology in Yellowstone National Park / D.M. Ward //ASM News. 1998. Vol. 64 (3).-P. 141−146.
- Widdel F. Micribiology and ecology of sulfate- and sulfur-redicing bacteria / F. Widdel // Biology of anaerobic microorganisms (ed. A. Zehnder). 1988.-P. 469−585.
- Widdel F. Microbiology and ecology of sulfate- and sulfur-reducing bacteria. In: Biology of Anaerobic Microorganisms / F. Widdel // Ed. A .J.B. Zehn-der. 1987.-P. 120−126
- Widdel F. The dissimilatory sulfate- and sulfur-reducing bacteria. The prokaryotes / F. Widdel, T.A. Hansen. (2nd ed) // Springer-verlag. New York Inc. 1992. Vol. 1.-P. 583−624.
- Wiegel J. Anaerobic alkalithermophiles, a novel group of extremo-philes / J. Wiegel // Extremophiles. 1998. Vol. 2. P. 257−267.
- Williams P.G. Biological sulphate removal from industrial effluent / P.G. Williams // II Water Rept. 1984. P. 6−9.
- Zellner G., Messner P., Kneiffl M., Winter J. Desulfovibrio simpex sp. nov. a new sulfate-reducing bacterium from a sour whey digester / G. Zellner, P. Messner, M. Kneiffl, J. Winter // II Archives Microbiology. 1989. Vol. 152. -P. 329−334.
- Zeng Y.B. Biogeochemistry of hot spring environments. Apolar and polar lipids in the biologically active layers of a cyanobacterial mat / Y.B. Zeng, D.M. Ward, S. Brassell, G. Eglinton // Chem. Geol. 1992. Vol. 95. P. 347−360.