Разработка и программная реализация адаптивной модели геногеографического прогноза на основе методов оптимального оценивания и планирования эксперимента
Диссертация
Создан комплекс алгоритмов, позволяющих осуществлять автоматическую адаптацию структуры моделей геногеографического прогноза и расчет их параметров в зависимости от объема доступных для анализа результатов экспедиционных популяционно-генетических исследований. Преимущество разработанных алгоритмов заключается в автоматической настройке структуры и параметров модели прогноза, что позволяет… Читать ещё >
Список литературы
- Айала Ф., Кайгер Дж. Современная генетика. Т. 3. М.: Мир, 1988. 336 с. (Ayala F.J., Kiger J.A. Modern Genetics. Second Edition. Univ. Of California, Davis).
- Айала Ф. Введение в популяционную и эволюционную генетику // М., Мир. 1984. С.81−104.
- Алексеев В.П. Становление человечества // М.: Политиздат, 1984. 462 стр.
- Алтухов Ю.П. Внутривидовое генетическое разнообразие: мониторинг и принципы сохранения // Генетика. 1995. Т.31. № 10. С. 13 331 357.
- Алтухов Ю.П. Генетические процессы в популяциях: Учебние пособие, 3-е изд., перераб. и доп. / Ю.П. Алтухов- Отв. Ред. Л. А. Животовский. М.: ИКЦ «Академкнига». 2003. — 431 с.
- Амосов A.A., Дубинский Ю. А., Копченова Н. В. Вычислительные методы для инженеров // М.: Высш. шк., 1994. 544 с.
- Балановская Е.В. Возможности компьютерной геногеографии в изучении генофонда // Генетика. 1995. Т. 31. С. 12.
- Балановская Е.В. Стратегия комплексного изучения генофонда (по данным антропологии, дерматоглифики, археологии, антропонимики, классической и молекулярной генетики) // Вопросы антропологии. 2003. Вып. 91. С. 185−187.
- Балановская Е.В. Генофонд народов Северной Евразии: внутренняя структура и положение в мировом генофонде // Антропология на пороге III тысячелетия / Под ред. Т. Н. Алексеевой. М.: Старый сад, 2004. Т. 1. С. 358 390.
- Балановская Е.В., Балановский О. П. Роль этноса в истории популяций: геногеографический аспект // III Конгресс этнографов и антропологов России. Тез. докл. Москва, 1999. С. 103.
- И. Балановская Е. В., Балановский О. В. Русский Генофонд на Русской равнине. Луч, 2007 г. 416 стр.
- Балановская Е.В., Балановский О. П., Нурбаев С. Д., Дерябин В. Е., Долинова H.A., Бужилова А. П., Спицын В. А. Генофондика русского народа: данные разных наук // II Съезд ВОГиС. Тез. Докл. Т.2. С.-Петерб. 2000. С. 311−312.
- Балановская Е.В., Балановский О. П., Спицын В. А., Бычковская Л. С., Макаров C.B., Пай Г.В., Русаков А. Е., Суббота Д. С. Русский генофонд. Геногеография сывороточных генных маркеров (HP, GC, PI, TF)//Генетика. 2001. Т.37. № 8. С. 1125−1137.
- Балановская Е.В., Балановский О. П., Спицын В. А., Бычковская Л. С., Макаров C.B., Пай Г.В., Суббота Д. С. Русский генофонд. Геногеография эритроцитарных генных маркеров (ACPI, PGM1, ESD, GLOl, 6-PGD)//Генетика. 2001. Т.37. № 8. С. 1138−1151.
- Балановская Е.В., Батсуурь Ж., Белковский А. Н., Рычков A.B., Рычков Ю. Г. Геногеография народонаселения: создание регионального геногеографического атласа с помощью ЭВМ // Генетика. 1990. Т. 26. N 5. С. 925−935.
- Балановская Е.В., Иноземцев B.C., Нурбаев С. Д., Перепелов A.B., Петрин А. Н., Руденская Г. Е., Ситников В. Ф. Региональные особенности наследственных заболеваний нервной системы // Регионология. 1996. № 2(15). С. 153−161.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д. Компьютерная технология геногеографического изучения генофонда. III. Вычисление трендовых поверхностей // Генетика. 1995. Т. 31. N 4. С. 536−559.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д. Селективная структура генофонда.
- Возможности изучения //Генетика 1997а. Т. 33. № 11. С. 1572−1588.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д. Геногеография и генофонд. Пространство главных компонент // Новые методы новые подходы в современной антропологии. Москва: Старый сад, 19 976. С. 99−115.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д. Компьютерная технология геногеографического изучения генофонда. IV. Популяции в пространстве главных компанент//Генетика 1997 В. Т. 33. № 12. С. 1693−1710.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д. Селективная структура генофонда.1. Стандартная технология определения через FsT-статистики // Генетика 1998а. Т. 34. № 9. С. 1307−1321.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д. Селективная структура генофонда.
- I. Стандартная технология определения через FsT-статистики с помощью численного ресэмплинга//Генетика 19 986. Т. 34. № 10. С. 1434−1446.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д. Селективная структура генофонда.1. Технология определения через показатель интенсивности отбора RS // Генетика 1998 В. Т. 34. № 11. С. 1559−1573.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д. Пространственная изменчивость генофонда человека: геногеография и отбор // Исследования по генетике / Под ред. С.Г. Инге-Вечтомова. Вып. 12. СПб.: Изд-во С.-Петерб. Ун-та, 1999. С. 104−116.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д., Балановский О. П., Почешхова Э. А., Бровинских A.A., Гинтер Е. К. Геногеографический анализ подразделенной популяции. 1. Генофонд адыгов в системе кавказских генофондов // Генетика. 1999. Т. 35. N 6. С. 818−830.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д., Почешхова Э. А. Генофонд Кавказа в контексте расы // Раса: миф или реальность? Тр. 1 Международной конференции. РО Европ. антропол. ассоциации. М.: Старый сад, 1998. С. 2122.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д., Рычков Ю. Г. Компьютерная технология геногеографичеекого изучения генофонда. I. Статистическая информация карт//Генетика. 1994а. Т. 30. N 7. С. 951−965.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д., Рычков Ю. Г. Компьютерная технология геногеографичеекого изучения генофонда. II. Статистическая информация карт//Генетика. 19 946. Т. 30. N 11. С. 1538−1555.
- Балановская Е.В., Нурбаев С. Д., Спицына Н. Х. Геногеографическое положение башкир в системе Уральских генофондов // Второй международный Конгресс этнографов и антропологов. Резюме докл. и сообщ. Часть I. Уфа: Восточный унив., 1997. 64 с.
- Балановская Е.В., Почешхова Э. А., Балановский О. П., Нурбаев С. Д., Гинтер Е. К. Геногеографический анализ подразделенной популяции. II. География случайного инбридинга (по частотам фамилий адыгов) // Генетика. 2000. Т. 36. N 8. С. 1126−1139.
- Балановская Е.В., Рычков Ю. Г. Геногеография: Гены человека на карте СССР. М.: Знание, 1990а, 64 с.
- Балановская Е.В., Рычков Ю. Г. Этническая генетика: Этногеографическое разнообразие народов мира // Генетика. 19 906. Т. 26. № 1. С. 288−297.
- Балановский О.П., Бужилова А. П., Балановская Е. В. Геногеографический анализ русских фамилий // Второй (четвертый) российский съезд медицинских генетиков. Тез. докл. Курск, 2000. С. 153−154.
- Балановский О.П., Бужилова А. П., Балановская Е. В. Русский генофонд. Геногеография фамилий // Генетика. 2001. Т. 37. № 7. С. 974−990.
- Балановский О.П., Нурбаев С. Д., Кравчук О. И., Макаров C.B., Спицын В. А., Гинтер Е. К. «Синтетические» карты генофонда мари (поданным об нмунно-биохимическом полиморфизме) // Генетика. 1999. Т.35. № 1. С. 74−82.
- БерлянтА.М. Карты фоновых и остаточных поверхностей и их применение в географических исследованиях // Вести. МГУ. 1969. № 4. С. 8089.
- Берлянт A.M. Образ пространства: карта и информация. М.: Мысль, 1986. 240 с.
- Берлянт A.M., Кошель С. М., Мусин O.P., Суетова И. А. Опыт создания глобальной цифровой базы данных по гипсометрической карте мира в масштабе 1:15 000 000 // Геоморфология. 19 916. № 2. С. 25−31.
- Генетическая структура и наследственные болезни чувашской популяции / Под редакцией: Гинтера Е. К., Зинченко P.A. // Чебоксары: Издательский дом «Пегас». 2006. 232 стр.
- Генофонд и геногеография народонаселения Том 1. Генофонд населения России и сопредельных стран. / Под редакцией Рычкова Ю. Г. — Санкт-Петербург: Наука, 2000. — 611 с.
- Генофонд и геногеография народонаселения. Том 2. Геногеографический атлас населения России и сопредельных стран / под редакцией Рычкова Ю. Г. // Санкт-Петербург: Наука, 2000. — 672 с.
- Гинтер Е.К. Влияние генетической структуры на груз наследственных болезней в русской популяции // Вестн. РАМН. 1993. № 9. С. 23−26.
- Гинтер Е.К., Мамедова P.A., Ельчинова Г. И., Брусинцева О. В. Генетическая структура популяций и особенности территориального распределения аутосомно-рецессивных заболеваний в Кировской области // Генетика. 1994. Т.ЗО. № 1. С. 107−111.
- Евсюков А.Н., Жукова О. В., Папков В. Е., Сигнеев В. И., Шереметьева В. А., Шнейдер Ю. В., Рычков Ю. В. География генетических процессов в народонаселении. Генные миграции в Северной Евразии (Европейский регион) //Генетика. 1997. Т. 33. N 11. С. 1539−1550.
- Ельчинова Г. И., Кадошникова М. Ю., Мамедова P.A. Выявление особенностей генетической структуры популяций с помощью метода описания «генетического ландшафта» // Генетика, 1991. Т.27. № 11. С. 19 942 001.
- Ельчинова Г. И., Парадеева Г. М., Ревазов A.A. Медико-генетическое изучение населения Костромской области. Сообщение IX. Интерпретация матрицы генетических расстояний //Генетика, 1988. Т.24. № 11. С.2043−2049.
- Зедгинидзе И.Г. Организация и планирование инженерного эксперимента // Тбилиси: Технический университет, 2000. 224 с.
- Зедгинидзе И.Г. Планирование эксперимента для исследования многокомпонентных систем // М.: Наука, 1976. 390 с.
- Ильин В.А., Садовничий В. А., Сендов Б. Х. Математический анализ /4.1. Изд. 3. Ред. А. Н. Тихонов // М.: Проспект, 2004.
- Калиткин H.H. Численные методы // М.: Наука, 1978. 512 стр.
- Мамаев А.Н. Основы медицинской статистики. Практическое пособие. // М.: Практическая медицина, 2011. 128 стр.
- Материалы к библиографии ученых СССР / Александр Сергеевич Серебровский (1892—1948) // Сер. биол. наук. Генетика. Вып. 5. М.: Наука, 1993. 49 с.
- Медик В.А., Токмачев М. С. Математическая статистика в медицине: учеб. пособие // М.: Финансы и статистика, 2007. 800 стр.
- Налимов В.В., Теория эксперимента, изд-во «Наука», М., 1971. 208стр.
- НурбаевС.Д., Балановская Е. В. Геногеография и генофонд. Оценивание надежности карты // Новые методы новые подходы в современной антропологии. М.: Старый сад, 1997. С. 116−132.
- Нурбаев С.Д., Балановская Е. В. Компьютерная технология геногеографического изучения генофонда. V. Оценивание надежности карт // Генетики. 1998. Т. 34. № 6. С. 825−838.
- Планирование эксперимента в исследовании технологических процессов. / Под редакцией Э. К. Лецкого, К. Хартман, Э. Лецкий, В. Шефер и коллектив авторов // Москва: Издательство «Мир», 1977. 552 с.
- Почешкова Э.А. Генетико-демографический анализ подразделенной популяции адыгов. Автореферат канд. Дис. М.: 1998. 24 с.
- Рынков Ю.Г., Балановская Е. В. Этническая генетика: Соотношение адаптивной и нейтральной генетической дифференциации этносов // Генетика. 1999а. Т.26. № 3. С. 541−549.
- Рычков Ю.Г., Балановская Е. В. Генетическая дифференциация народонаселения: прогнозируемы ли данные о полиморфизме ДНК, исходя из иммуно-биохимического полиморфизма // Молекулярные механизмы генетических процессов. М.: Наука, 19 996. С. 67−83.
- Рычков Ю.Г., Балановская Е. В. Генофонд и геногеография населения СССР // Генетика. 1992. Т.28. Приложение. С. 52−75.
- Рычков Ю.Г., Балановская Е. В., Нурбаев С. Д., Шнейдер Ю. В. Историческая геногеография восточных славян // Восточные славяне и их соседи/ Отв. Ред. Т. И. Алексеева. М.: Научный мир, 2002. С. 109−134.
- Рычков Ю.Г., Батсуурь Ж. Монголы МНР и монголоидное население Азии в свете геногеографии // Вопросы антропологии. 1987. Вып.78. С. 44−68.
- Рычков Ю.Г., Рычков A.B., Балановская Е. В., Батсуурь Ж., Белковский А. Н., Будилова Е. В., Терехин А. Т. Геногеография народонаселения: опыт компьютерного картографирования популяционно-генетических данных// Генетика. 1990. Т. 26. 332−340.
- Салищев К.А. Картография М.: Высшая школа, 1982. 272 стр.
- Салищев К.А. Картоведение М.: МГУ. 1990. 400 стр.
- Сербенюк С.Н., Кошель С.М, Мусин О. Р. Методы моделирования геополей по данным в нерегулярно расположенных точках // Геодезия и картография. 1990. N 11. С. 31−35.
- Сербенюк С.Н., Кошель С.М, Мусин О. Р. Программы МАГ для создания цифровых моделей геополей // Геодезия и картография. 1991. N 4. С. 44−46
- Серебровский A.C. Геногеография и генофонд сельскохозяйственных животных СССР// Научное слово. 1928. N 9. С. 3−22.
- Серебровский A.C. Проблемы и метод геногеографии // Труды Всесоюзного съезда по генетике, селекции, семеноводству и племенному животноводству. 1930. Т.2 С. 71−86.
- Трофимов A.M., Панасюк М. В. Математико-географическое моделирование и автоматизация географических исследований // География в системе наук (Серия: Современные проблемы географии). JL: Наука, 1987. С. 194−206.
- Тюрин Ю.Н., Макаров A.A. Статистический анализ данных на компьютере//М.: Инфра-М, 1998. 528 стр.
- Фихтенгольц Г. М. Курс дифференциального и интегрального исчисления // М.: ФИЗМАТЛИТ, 2001. т. 1 616с.- т.2 — 810с.- т. З — 662с.
- Фогель Ф., Мотульски А. Генетика человека // Пер. с англ. Под ред. Ю. П. Алтухова и В. М. Гиндилиса. М.: Мир, 1989. Т.1. 312 с.
- Фогель Ф., Мотульски А. Генетика человека // Пер. с англ. Под ред. Ю. П. Алтухова и В. М. Гиндилиса. М.: Мир, 1990. Т.2. 378 с.
- Шапиро Н. И. Памяти A.C. Серебровского (18.11.1892 — 26.VI. 1948) // Генетика. 1966. № 9. С. 3—11.
- Ammerman A. J., Cavalli-Sforza L.L. Neolithic Transition and the Genetics of Populations in Europe. Princeton. N. J.: Princeton University Press. 1984. 176 p.
- Berlyant A.M., Koshel S.M., Musin O.R., Suyetova I.A. Constructing a global digital data base using a world hypsometric map 1:15,000,000 scale: preliminary results // Mapping Sciences and Remote Sensing. 1992. V. 29. N2. P. 146−154.
- Bodmer W.F., Cavalli-Sforza L.L. Genetics, Evolution, and Man // San Francisco: W.H. Freeman. 1976. 782 p.
- Cavalli-Sforza L.L. Population structure and human evolution // Proc. F. Soc. London. Ser. B. 1966. V. 164. P. 362−379.
- Cavalli-Sforza L.L., Bodmer W.F. The Genetics of Human Population. San Francisco / W.H. Freeman. 1971. 965 p.
- Cavalli-Sforza L.L., Edwards A.W.F. Phylogenetics analysis: Model and estimation procedures // Am. J. Human Genet. 1967. V.19. P. 223−257.
- Cavalli-Sforza L.L., MenozziP., Piazza A. History and Geography of Human Genes. Princeton: Princeton University Press. 1994. 1059 p.
- Cavalli-Sforza L.L., Piazza A. Human genomic diversity in Europe: A summary of recent research and prospects for the future // Europe Journal of Human Genetics. 1993. V.l. P. 3−18.
- Koshel S.M., Musin O.R. Digital models for studying of environmental change // Proc. of Int. Symp. On Environmental Change and GIS (INSEG'91). 1991. Asahikawa, Japan. V. 2. P. 321−327.
- Koshel S.M., Musin O.R. Spatial Modeling and Analysis for GIS // GIS Brno 1994. Conference «Europe in Transition». 1994. P. 30.
- Koshel S.M., Musin O.R., Semin V.N. Digital models and Geographical Information Systems // Proc. of Int. Conf. on GIS (GIS Brno 1991), 1991. P.50.
- Menozzi P., Piazza A., Cavalli-Sforza L.L. Synthetics maps of human gene frequencies in Europe // Science. 1978. V. 201. P. 786−792.
- Mourant A.E., Kopec A.C., Domaniewska-Sobczak K. The Distribution of the Human Blood Groups and Other Polymorphism. London, 1976. P. 1055.
- Piazza A., Menozzi P., Cavalli-Sforza L.L. Synthetic gene frequency maps of man and selective effects of climate // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1981a. V. 78. P. 2638−2642.
- Piazza A., Menozzi P., Cavalli-Sforza L.L. The making and tasting of geographic gene frequency maps // Biometrics. 1981b. V. 37. P. 635−659.
- Rychkov Yu. G., Sheremetyeva V.A. The genetic process in the system of ancient human isolates in North Asia // Population structure and Human Variation/ Ed. G. A. Harrison. Internat. Biol. Programme. V. 11. Cambridge Univ. Press. 1977. P. 47−108.
- Sokal R.R., Oden NX., Thomson B.A. A problem with synthetic maps // Human Biology. 1999a. V. 71. N 1. P. 1−13.
- Sokal R.R., Oden N.L., Thomson B.A. A problem with synthetic maps remain: Reply to Rendine et al. // Human Biology. 1999b. V. 71. N 3. P. 447−453.
- Ward R.H., Neel J.Y. The genetics of a tribal population, the Yanomama Indians. XIV. Clines and their interpretation// Genetics. 1976. V. 82. P. 103−121.
- Wright S. Isolation by distance // Genetics. 1943. V. 28. P. 114−138.