Структура и функция гена РАХ-7 человека в норме и патологии

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

В результате скрининга фаговой библиотеки ДНК человека клонированы фрагменты геномной последовательности гена РАХ7. Посредством рестрикционного анализа и Southern гибридизации 39 изолированных фагов выявлены три группы клонов, содержащих перекрывающиеся последова-тельности вставок. Путем субклонирования и секвенирования наименьших экзон-позитивных рестрикционных фрагментов определены точная… Читать ещё >

Структура и функция гена РАХ-7 человека в норме и патологии (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Содержание

Список сокращений
1. Обзор литературы
- 1. 1. Открытие PAX генов
- 1. 2. Структурная организация белков PAX семейства
- 1. 3. Структура ДНК — связывающих доменов PD и HD
  - 1. 3. 1. Структура домена HD
  - 1. 3. 2. Структура домена PD
- 1. 4. Экспрессия PAX генов в эмбриогенезе
- 1. 5. PAX гены и раковые заболевания человека
- 1. 6. Гены РАХЗ и РАХ
  - 1. 6. 1. Экспрессия генов РАХЗ и РАХ7 в эмбриональном развитии
  - 1. 6. 2. Патологии, связанные с потерей функции гена РАХЗ
    - 1. 6. 2. 1. Мутация Splotch мыши
    - 1. 6. 2. 2. Синдром Ваарденбурга
- 1. 7. Альвеолярная рабдомиосаркома
  - 1. 7. 1. Транслокация [t (2- 13)(q35- q 14)] в альвеолярной рабдомиосаркоме
  - 1. 7. 2. Транслокация [t (1−13)(p36.2- q14)] в альвеолярной рабдомиосаркоме
2. Материалы и методы исследований
- 2. 1. Клеточные линии
- 2. 2. Клонирование кДНК гена РАХ
- 2. 3. Клонирование кДНК химерного гена PAX7-FKHR
- 2. 4. Клонирование и анализ геномных клонов гена РАХ
- 2. 5. Конструирование экспрессионных векторов
- 2. 6. Культивирование клеток и получение клеточных линий
- 2. 7. Анализ ДНК-связывающей активности белков
- 2. 8. Метод мягкого агара
- 2. 9. Анализ клеточного цикла
- 2. 10. Эксперименты с бестимусными мышами
- 2. 11. Анализ экспрессии известных генов методом обратной гибридизации
- 2. 12. Дифференциальный дисплей
- 2. 13. Компьютерный анализ
3. Результаты исследований и их обсуждение
- 3. 1. Клонирование и анализ кДНК гена РАХ
  - 3. 1. 1. Скрининг фаговой библиотеки кДНК
  - 3. 1. 2. Рабдомиосаркома как источник РНК для клонирования кДНК гена РАХ
  - 3. 1. 3. Клонирование кДНК гена РАХ7 методом RACE
  - 3. 1. 4. Старт трансляции белка РАХ
  - 3. 1. 5. Альтернативная терминация транскрипции гена РАХ
  - 3. 1. 6. Альтернативный сплайсинг транскриптов гена РАХ
  - 3. 1. 7. Белок РАХ7 отличается от РАХЗ уникальной последовательностью в С — конце
- 3. 2. Клонирование кДНК гибридного гена PAX7-FKHR
- 3. 3. Геномная организация гена РАХ7 человека
  - 3. 3. 1. Клонирование и анализ геномных клонов гена РАХ
  - 3. 3. 2. Гены РАХ7 и РАХЗ имеют сходную геномную организацию
  - 3. 3. 3. Седьмой интрон гена РАХ7 вовлечен в транслокацию t (1- 13)
- 3. 4. Клонирование геномных фрагментов генов РАХЗ и FKHR
- 3. 5. РАХ7 — вероятный кандидат на роль гена опухолевого супрессора
- 3. 6. РАХ7 и синдром Ваарденбурга
- 3. 7. Перенос генов РАХ7 и PAX7-FKHR в клетки NIH3T3 и получение стабильных клеточных линий с конститутивной экспрессией соответствующих белков
  - 3. 7. 1. Эктопическая экспрессия как подход для функционального анализа генов РАХ7 и PAX7-FKHR
  - 3. 7. 2. Эмбриональные фибробласты мыши в качестве тестовых клеток
  - 3. 7. 3. Получение клеточных линий, экспрессирующих белки РАХ и PAX7-FKHR
- 3. 8. Функциональный анализ генов РАХ7 и PAX7-FKHR
  - 3. 8. 1. Общие характеристики полученных клеточных линий
  - 3. 8. 2. Анализ клеточного цикла
  - 3. 8. 3. Анализ клеток методом мягкого агара
  - 3. 8. 4. Клетки, экспрессирующие PAX7-FKHR, образуют опухоли in vivo
  - 3. 8. 5. Обобщение результатов функционального анализа генов РАХ и PAX7-FKHR
- 3. 9. Анализ дифференциальной экспрессии генов
  - 3. 9. 1. Анализ экспрессии известных генов методом обратной гибридизации
  - 3. 9. 2. Идентификация и клонирование генов методом «дифференциального дисплея»
Выводы

Гены, принадлежащие к PAX семейству, кодируют транскрипционные фаюгоры, общей чертой которых является наличие эволюционно консервативного ДНК — связывающего домена Paired domain (PD). PAX гены экспрессируются в эмбриогенезе и играют важную роль в детерминации зачатков различных структур будущего организма.

PAX гены впервые были обнаружены у дрозофилы, а позже гомологичные им гены были идентифицированы и у других организмов, включая мышь и человека. В настоящее время PAX гены человека являются объектом интенсивного изучения. Выяснилось, что нарушение функции PAX генов связано с развитием ряда заболеваний человека. В частности, потеря функции PAX генов приводит к развитию наследственных болезней, связанных с аномальным формированием определённых органов и тканей, в то время как гиперактивность этих генов ассоциируется с развитием раковых заболеваний.

Семейство PAX генов человека состоит из девяти членов. На основании структурного сходства белковых продуктов это семейство подразделено на четыре группы генов. Одна из групп представлена двумя высоко гомологичными генами РАХЗ и РАХ7. В последние годы было обнаружено, что потеря функции гена РАХЗ приводит к развитию тяжёлого наследственного заболевания человека — синдром Ваарденбурга. В связи с этим, ген РАХЗ привлек к себе большое внимание и был подвергнут всестороннему изучению. В то же время ген РАХ7 оставался одним из наимение изученных членов PAX семейства. Его полная белковая последовательность и геномная организация не были известны ни у одного из организмов.

Недавно было установлено, что развитие одной из превалирующих форм рака, образующегося в детском возрасте, альвеолярной рабдомиосаркомы (АРМС) связано со структурными изменениями генов РАХЗ и РАХ7. Вместе с тем, появились данные, позволяющие предполагать, что ген РАХ7 может являться кандидатом на роль тканеспецифического опухолевого супрессора. Делеции хромосомного участка, где расположен этот ген, часто обнаруживаются в клетках раковых опухолей, мышечного и нейрального происхождения. При этом, известно, что функция гена РАХ7 тесно связана с формированием именно этих двух типов тканей. Однако чтобы обнаружить действительную связь между нарушением функции гена РАХ7 и развитием выше упомянутых заболеваний, важно знать его полную структуру и геномную организацию. Такая информация является необходимой для проведения мутационного анализа экзонов этого гена в поисках более тонких изменений, таких как нуклеотидные замены, небольшие делеции или инсерции.

Цель настоящей работы состоит в изучении структуры и функции транскрипционного фактора РАХ7 человека в норме и патологии. Для достижения поставленной цели предполагается решить следующие задачи:

1. Клонировать полную кодирующую последовательность гена РАХ7 человека.

2. Определить геномную организацию гена РАХ7 человека.

3. Клонировать кДНК химерного гена PAX7-FKHR, образуемого в результате хромосомной транслокации в клетках раковой опухоли — альвеолярной рабдомиосаркомы (АРМС).

4. Осуществить перенос генов РАХ7 и PAX7-FKHR в культивируемые эмбриональные фибробласты мыши и получить стабильные клеточные линии с конститутивной экспрессией соответствующих белков.

5. Исследовать функциональные свойства генов РАХ7 и PAX7-FKHR путем сравнительного анализа изменений клеточных характеристик, происходящих в ответ на эктопическую экспрессию этих генов.

6. Идентифицировать гены, дифференциально экспрессирующиеся под влиянием транскрипционных факторов РАХ7 и PAX7-FKHR.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Открытие PAX генов.

Гены, принадлежащие к PAX семейству, кодируют транскрипционные факторы, общей чертой которых является наличие эволюционно консервативного ДНК — связывающего домена Paired domain (PD). Впервые такие гены были обнаружены у дрозофилы. Основанием для их открытия послужила гипотеза «gene network». Эта гипотеза, исходящая из эволюционных наблюдений, была сформулирована Маркусом Нолом в 1986 году (Ворр et al., 1986; Frigerio et al., 1986). Суть гипотезы сводится к следующим положениям. Новые гены (транскрипционные факторы) возникают в результате дупликации уже существующих генов или путем рекомбинации последовательностей, кодирующих отдельные домены. Продукты новообразованных генов, в силу своего родства или наличия сходных доменов, становятся участниками сходных процессов (взаимодествий). В результате, образуются сети генов с аналогичными функциями. Согласно своему происхождению, все гены, принадлежащие к таким сетям, состоят из комбинаций относительно небольшого числа субпоследовательностей, кодирующих определенные функциональные домены. Эта концепция предсказывает, что любой член какой — либо генной сети содержит один или несколько доменов, присущих и другим членам этой сети. Следовательно, возможно найти все гены и домены, принадлежащие одной генной сети. В дальнейшем эта гипотеза оказалась очень плодотворной, хотя и не стала парадигмой. В качестве объекта для её экспериментального подтверждения был использован гомеобокс-содержащий ген дрозофилы, paired. Фенотип мух, мутантных по гену paired, свидетельствовал о важной роли этого гена в ранних процессах сегментации эмбриона, а именно, в определении парности сегментов. Чтобы обнаружить другие гены, относящиеся к той же функциональной группе, что и paired, его кДНК разделили на три примерно равные части и использовали эти фрагменты в качестве зондов для поиска гомологичных последовательностей других генов, кодирующих родственные домены. В результате, были изолированы новые гены, такие как bicoid, goosebery, neural goosebery, pox meso и pox neural. Общей чертой этих генов, за исключением bicoid, является наличие консервативной последовательности, которая была названа Paired box (РВ). В дальнейшем было установлено, что все эти гены, действительно, относятся к одной фенотипической группе мутаций парности сегментов (pair — rule). Позднее, используя в качестве зонда фрагмент ДНК, содержащий Paired box гена paired дрозофилы, были клонированы подобные гены других организмов. К настоящему моменту у мыши и человека известны девять членов этого семейства, получившего название PAX (paired box).

ВЫВОДЫ.

1. Методом RACE клонирована кДНК гена РАХ7 человека. В результате секвенирования и последующего компьютерного анализа определены 5'- и 3'-нетранслируемые последовательности, кодоны инициации и терминации трансляции, участок альтернативного сплайсинга и район альтернативной терминации транскрипции этого гена. Выяснено, что полученная кДНК содержит полную открытую рамку считывания и кодирует белок, состоящий из 520 аминокислотных остатков, с предполагаемой массой 56,9 кДа.

2. В результате скрининга фаговой библиотеки ДНК человека клонированы фрагменты геномной последовательности гена РАХ7. Посредством рестрикционного анализа и Southern гибридизации 39 изолированных фагов выявлены три группы клонов, содержащих перекрывающиеся последова-тельности вставок. Путем субклонирования и секвенирования наименьших экзон-позитивных рестрикционных фрагментов определены точная локализация экзонов и их интронные границы. На основании этих данных полностью определена геномная структура гена РАХ7 и построена крупномасштабная карта соответствующего геномного локуса. Установлено, что ген РАХ7 человека состоит из восьми экзонов и имеет протяженность более 90 т.п.н.

3. Методом RT-PCR, из РНК опухолевых клеток АРМС, клонирована кДНК, содержащая полную кодирующую область химерного гена PAX7-FKHR. Открытая рамка считывания соответствует белку, состоящему из 830 аминокислотных остатков, с молекулярным весом 90,8 кДА. В результате сравнительного анализа нуклеотидных последовательностей кДНК РАХ7 и гибридной кДНК PAX7-FKHR, с учетом выясненной экзон-интронной организации гена РАХ7, установлено, что хромосомные транслокации, ведущие к образованию химерного гена PAX7-FKHR, происходят в седьмом интроне гена РАХ7.

4. Осуществлен перенос генов РАХ7 и PAX7-FKHR, в составе экспрессионных векторов, в культивируемые эмбриональные фибробласты мыши, и путем клональной селекции получены стабильные клеточные линии с конститутивной экспрессией соответствующих белков. Эктопическая экспрессия функциональных белков РАХ7 и PAX7-FKHR и их ДНК-связывающая активность, в полученных клеточных линиях, подтверждены методом ретардации в геле.

5. Используя различные условия культивирования клеток, а также методы проточной цитофлюорометрии и мягкого агара, проведен систематический сравнительный анализ изменений основных клеточных характеристик, происходящих в ответ на эктопическую экспрессию генов РАХ7 и PAX7-FKHR. Установлено, что функция гена РАХ7 тесно связана с регуляцией клеточной пролиферации и дифференциации. Экспериментально показано, что экспрессия химерного транскрипционного фактора PAX7-FKHR приводит к неопластической трансформации клеток in vivo.

6. Методом обратной гибридизации идентифицированы 13 генов с известной функцией, которые дифференциально экспрессируются под влиянием транс-фактора PAX7-FKHR. Методом дифференциального дисплея клонированы 3 новых гена, транскрипция которых специфически активируется в ответ на эктопическую экспрессию как гена РАХ7, так и его химерной формы PAX7-FKHR.

Я приношу искреннюю и глубокую благодарность моим товарищам, благодаря участию которых эта работа стала успешной. Илья Мерцалов (Институт Биоорганической Химии, Москва) участвовал в клонировании и рестрикционном картировании геномных фагов гена РАХ7. Александр Кондрашов (Институт Цитологии, С. Петербург) определил условия для выявления специфической ДНК-связывающей активности белков РАХ7 и PAX7-FKHR. Владимир Курышев (Институт Экспериментальной Медицины, С. Петербург) секвенировал PCR-продукты генов, идентифицированных методом «дифференциального дисплея» .

Я очень признателен сотрудникам Университета г. Мюнстер (Германия) Christian Schulz, за помощь в использовании клеточного сортераRita Exeler, за проведение FISH экспериментовHans-Gerd Pauls, за помощь в экспериментах с бестимусными мышами.

Показать весь текст

Список литературы

Arnold, Н.Н., Braun, Т. Targeted inactivation of myogenic factor genes reveals their roles during myogenesis. // Int. Dev. Biol. 1996. v.40. pp.345 363.
Baldwin, C.T., Hoth, C.F., Amos, J.A., Da-Silva, E.O., Milunsky, A. An exonic mutation in the HuP2 paired domain gene causes Waardenburg syndrome. // Nature. 1992. v. 355. pp. 637 638.
Barr, F.G., Galili, N" Holick, J., Biegel, J.A., Rovera, G., Emanuel, B.S. Rearrangement of the PAX3 paired box gene in the paediatric solid tumour alveolar rhabdomyosarcoma. // Nature Genet. 1993. v. 3. pp. 113 -117.
Barr, F.G., Nauta, L.E., Davis, R.J., Schafer, B.W., Nycum, L.M., Biegel, J .A. In vivo amplification of the PAX3-FKHR and PAX7-FKHR fusion genes in alveolar rhabdomyosarcoma. // Hum. Mol. Genet. 1996. v. 5. pp. 5−12.
Barr, F.G. Fusions involving paired box and fork head family transcription factors in the pediatric cancer alveolar rhabdomyosarcoma. // Curr.Top.Microbiol.-Immunol. 1997. v.220. pp. 113−29.
Biegel, J.A., Meek, R.S., Parmiter, A.H., Conard, K., Emanuel, B.S. Chromosomal translocation t (1−13)(p36.2- q14) in a case of rhabdomyosarcoma. II Genes Chromosom Cancer. 1991. v. 3. pp. 483 484.
Blair, D.G., Cooper, C.S., Ea, L.A., Vande Woude, G.F. New method for detecting cellular transforming genes. //Science. 1982. v. 218. pp. 1122−1125.
Bopp D., Burri M., Baumgartner S., Frigerio G., Noll M. Conservation of a large protein domain in the segmentation gene paired and in functionally related genes of Drosophila. // Cell. 1986. v. 47. pp. 1033 -1040.
Burri, M., Tromvoukis, Y., Bopp, D., Frigerio, G., and Noll, M. Conservation of the paired domain in metazoans and its structure in three isolated human genes. // EMBO J. 1989. v.8. pp. 1183 1190.
Caron, H., Peter, M., P. van Sluis et al. Evidence for two tumour suppressor loci on chromosomal bands 1p35−36 involved in neuroblastoma: one probably imprinted, another associated with N-myc amplification. // Hum. Mol. Genet. 1995. v.4. pp. 535 539.
Chomczynski P. & Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate phenol — chloroform extraction. // Anal.Biochem. 1987. v. 162. pp. 156−159.
Cvekl A., Piatigorsky J. Lens development and crystallin gene expression: many roles for Pax6. // BioEssays. 1996. v. 18. pp. 621 630.
Dahl E., Koseki H., Balling R. PAX genes and organogenesis. // BioEssays. 1997. v. 19. pp. 755−765.
Davis, R.J., D’Cruz, C.M., Lovell, M.A., Biegel, J.A., and Barr, F.G. Fusion of PAX7 to FKHR by the variant t (1−13) (p36-q14) translocation in alveolar rhabdomyosarcoma. // Cancer. Res. 1994. v.54. pp. 2869 2872.
Davis, R.J., Bennicelli, J.L., Macina, R.A., Nycum, L.M., Biegel, J.A. & Barr, F.G. Structural characterization of the FKHR gene and its rearrangement in alveolar rhabdomyosarcoma. // Hum. Mol. Genet. 1995. v.4. pp. 2355 2362.
Dickie, M.M. Splotch, a new mutation in the house mouse Mus musculus. II J. Hered. 1964. v. 5. p. 97.
Douglass, E.C., Valentine, M., Etcubanas, E., Parham, D., Webber, B.L., Houghton, P.J., Green, A.A. A specific chromosomal abnormality in rhabdomyosarcoma. //Cytogenet. Cell Genet. 1987. v.45. pp. 148 -155.
Douglass, E.C., Rowe, S.T., Valentine, M., Parham, D., Berkow, R" Bowman, W.P., Maurer, H.M. Variant translocations of chromosome 13 in alveolar rhabdomyosarcoma. // Genes Chromosom Cancer. 1991. v.3. pp. 480 482.
Ellmeier, W., Barnas, C., Kobrna, A., Kleiner, E., Kurzbauer, R" Weith, A. Cloning and characterization of CpG islands of the human chromosome 1p36 region. II Genomics. 1996. v.32. pp. 155 -158.
Epstein, D.J., Vekemans, M. and Gros, P. Splotch, a mutation affecting development of the mouse neural tube, shows a deletion within the paired homeodomain of Pax3. // Cell. 1991. v.67. pp. 767 774.
Flether, J. A. Cytogenetics and experimental models of sarcomas. // Current Opinion in Oncology. 1994. v.6. pp. 367 371.
Frigerio G., Burri M., Bopp D., Baumgartner S., Noll M. Structure of the segmentation gene paired and the Drosophila PRD gene set as part of a gene network. // Cell. 1986. v.47. pp. 735 746.
Galili, N., Davis, R.J., Fredericks, W.J., Mukhopadhyay, S" Rauscherlll, F.J., Emanuel, B.S., Rovera, G. and Barr, F. Fusion of a fork head domain gene to PAX3 in the solid tumour alveolar rhabdomyosarcoma. // Nature Genet. 1993. v.5. pp. 230 235.
Gehring, W., Qian, Y.Q., Billeter, M., Furukubo-Tokunaga, K., Schier, A.F., Resendez-Perez, D., Affolter, M., Otting, G., Wuthrich, K. Homeodomain DNA recognition. // Cell. 1994. v.78. pp. 211 — 223.
Goulding, M.D., Chalepakis, G., Deutsch, U., Erselius, J.R., Gruss, P. Pax-3, a novel murine DNA binding protein expressed during early neurogenesis. // The EMBO-J. 1991. v. 10. pp. 1135 1147.
Goulding, M., Sterrer, S., Fleming, J., Balling, R., Nadeau, J., Moore, K.J., Brown, A.D.M., Steel, K.P. and Gruss, P. Analysis of the Pax3 mouse mutant splotch. // Genomics. 1993. v. 17. pp. 355 363.
Haider G., Callaerts P., Gehring W.J. Induction of ectopic eyes by targeted expression of the eyeless gene in Drosophila. // Science. 1995. v. 267. pp. 1788 -1792.
Harris W.A. Pax6: where to be conserved is not conservative. // Proc.Natl.Acad.Sci. 1997. v. 94. pp. 2098 2100.
Hoey T., and Levine M. Divergent homeobox proteins recognize similar DNA sequences in Drosophila. II Nature. 1988. v.332. pp. 858 861.
Hromas, R., Costa, R. The hepatocyte nuclear factor-3 / forkhead transcription regulatory family in development, inflammation, and neoplasia. // Critical Rev. Oncology Hematology. 1995. v. 20. pp.129 -140.
Jostes, B., Walther, C. and Gruss, P. The murine paired box gene, Pax7, is expressed specifically during the development of the nervous and muscular system. // Mech. Dev. 1991. v.33. pp. 27 38.
Jun, S. & Desplan, C. Cooperative interactions between paired domain and homeodomain. // Development. 1996. v. 122. pp. 2639 2650.
Kaufmann, E., Knochel, W. Five years on the wings of forkhead. // Mach. Dev. 1996. v.57. pp.3 20.
Kissinger, C.R., Liu, B., Martin-Blanco, E., Kornberg, T.B., Pabo, C.O. Crystal structure of an engrailed homeodomain-DNA complex at 2.8 A resolution: a framework for understanding homeodomain-DNA interactions. // Cell. 1990. v.65. pp. 579 590.
Land H., Parada L., Weinberg R. Tumorigenic conversion of primary embryo fibroblasts requires at least two cooperating oncogenes. // Nature. 1983. v.304. pp. 596 602.
Liang, P. and Pardee, A.B. Differential display of eukaryotic messenger RNA by means of the polymerase chain reaction. // Science. 1992. v.257. pp. 967 -971.
Macina, R.A., Barr, F.G., Galili, N. and Riethman, H.C. Genomic organization of the human PAX3 gene: DNA sequence analysis of the region disrupted in alveolar rhabdomyosarcoma. // Genomics. 1995. v.26. pp. 1−8.
Mansouri, A, Stoykova, A., Torres, M., Gruss, P. Dysgenesis of cephalic neural crest derivatives in PAX7 -/- mutant mice. II Development. 1996. v. 122. pp. 831 838.
Mansouri, A, Hallonet, M., Gruss, P. Pax genes and their roles in cell differentiation and development. // Curr. Opin. Cell. Biol. 1996. v.8. pp. 851 857.
Maulbecker C. & Gruss P. The oncogenic potential of Pax genes. // The EMBO J. 1993. v.12. pp. 2361 2367.
Pabo, C.O., and Sauer R.T. Transcription factors: structural families and principles of DNA recognition. //Annu. Rev. Biochem. 1992. v.61. pp. 1053 1095.
Protein structure prediction. / Ed. Sternberg, M.J.E. IRL Press at Oxford Press, England, 1996. 298 pp.
Quiring R., Walldorf U., Kloter U., Gehring W.J. Homology of the eyeless gene of Drosophila to the Small eye gene in mice and Aniridia in humans. // Science. 1994. v.265. pp. 785 789.
Report of the Second International Workshop on Human Chromosome 1 Mapping. II Cytogenet. Cell Genet. 1996. v.72. pp. 113 -154.
Sambrook, J., Maniatis, T., and Fritsch, E.F. «Molecular Cloning: A Laboratory Manual» / Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY. 1989.
Sanger, F., Nicklen, S., Coulson, A.R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1977. v. 74. pp. 5463 5467.
Schafer, B.W., Czerny, T., Bernasconi, M., Genini, M. and Busslinger, M. Molecular cloning and characterization of a human PAX7 cDNA expressed in normal and neoplastic myocytes. // Nucleic Acids Res. 1994. v.22. pp. 4574 -4582.
Schafer, B.W. and Mattei, M.G. The human paired domain gene PAX7 (Hup1) maps to chromosome 1p35 1p36.2. // Genomics. 1993. v. 17. pp. 249 -251.
Scheidler, S., Fredericks, W.J., Rauscher III, F.J., Barr, F.G. The hybrid PAX3-FKHR fusion protein of alveolar rhabdomyosarcoma transforms fibroblasts in culture. // Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 1996. v.93. pp. 9805 9809.
Shapiro, D.N., Sublett, J.E., Li, B., Downing, J.R., Naeve, C.W. Fusion of PAX3 to a member of the forkhead family of transcription factors in human alveolar rhabdomyosarcoma. // Cancer Res. 1993, a. v.53. pp. 5108 5112.
Shapiro, D.N., Sublett, J.E., Li, B., Valentine, M.B., Morris, S.W. and Noll, M. The gene for PAX7, a member of the paired-box-containing genes, is localized on human chromosome arm 1p36. // Genomics. 1993, b. v. 17. pp. 767 769.
Stapleton, P., Weith, A., Urbanek, P., Kozmik, Z. and Busslinger, M. Chromosomal localization of seven PAX genes and cloning of a novel family member, PAX9. // Nature Genet. 1993. v.3. pp. 292 298.
Steitz, T.A. Structural studies of protein nucleic acid interaction: the sources of sequence-specific binding. // Quart. Rev. Biophys. 1990. v.23. pp. 205 -280.
Stuart, E.T. and Gruss, P. PAX genes: what’s new in developmental biology and cancer? // Hum. Mol. Genet. 1995. v. 4. pp. 1717 -1720.
Tajbakhsh, S., Rocancourt, D., Cossu, G., Buckingham, M. Redefining the genetic hierarchies controlling skeletal myogenesis: Pax-3 and Myf-5 act upstream of MyoD. //Cell. 1997. v.89. pp.127 -138.
Tassabehji, M., Read, A.P., Newton, V.E., Harris, R., Balling, R., Gruss, P., Strachan, T. Waardenburg’s syndrome patients have mutations in the human homologue of the Pax3 paired box gene. // Nature. 1992. v. 355. pp. 635 636.
Tassabehji, M., Newton, V.E., Liu, X.-Z., Brady, A. et al. The mutational spectrum in Waardenburg syndrome. // Hum. Mol. Genet. 1995. v. 4. pp. 2131 -2137.
Taylor, S.M., Jones, P.A. Multiple phenotypes induced in 10T½ and 3T3 cells treated with 5-azacytidine. //Cell. 1979. v. 17. pp. 771 779.
Tomarev S., Callaerts P., Kos L., Zinovieva R., Haider G., Gehring W., Piatigorsky J. Squid Pax6 and eye development. // Proc.Natl.Acad.Sci. 1997. v.94. pp. 2421 2426.
Treisman J., Harris E., Desplan C. The paired box encodes a second DNA-binding domain in the paired homeo domain protein. // Genes Dev. 1991. v.5. pp. 594 604.
Turc-Carel, C., Lizard-Nacol, S., Justrabo, E., Favrot, M., Philip, T., Tubone, E. Consistent chromosomal translocation in alveolar rhabdomyosarcoma. // Cancer Genet. Cytogenet. 1986. v. 19. pp. 361 362.
Vogan, K.J., Epstein, D.J., Trasler, D.G., and Gros, P. The Splotch -delayed mouse mutant carries a point mutation within the paired box of the Pax3 gene. // Genomics. 1993. v. 17. pp. 364 369.
Waardenburg, P.J. A new syndrome combining developmental anomalies of the eyelids, eyebrows, and nose root with pigmentary defects of iris and head hair and with congenital deafness. // Am.J.Hum.Genet. 1951. v. 3. p. 195.
Wang-Wuu, S., Soukup, S., Ballard, E., Gotwals, B., Lampkin, B. Chromosomal analysis of sixteen human rhabdomyosarcomas. // Cancer Res. 1988. v.48. pp. 983−987.
Wilson, D.S., Guenther, B., Desplan, C., Kuriyan, J. High resolution crystal structure of a paired (Pax) class cooperative homeodomain dimer on DNA. // Cell.1995. v.82. pp. 709−719.
Whang-Peng, J., Knjutsen, T., Theil, K., Horowitz, M.E., Triche, T. Cytogenetic studies in subgroups of rhabdomyosarcoma. // Genes Chromosom. Cancer. 1992. v.5. pp. 299 310.
White, P. S., Maris, J.M., Beltinger, C., et al. A region of consistent deletion in neuroblastoma maps within human chromosome 1p36.2−36.3. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. v.92. pp.5520 5524.
Wilm, B., Dahl, E., Peters, H., Balling, R., lmai, K. Targeted disruption of Pax1 defines its null phenotype and proves haploinsufficiency. II Proc. Natl. Acad. Sci. 1998. v.95. pp. 8692 8697.
Wolberger, C" Vershon, A.K., Liu, B., Johnson, A.D., Pabo, C.O. Crystal structure of a MATa2 homeodomain-operator complex suggests a general model for homeodomain-DNA interactions. //Cell. 1991. v.67. pp. 517 528.
Xia, S.H., Yao, Z., Mansouri, A., Gruss, P. The expression of Pax7 in C2C12 cell line and its inducible inactivation. // Shih-Yen-Sheng-Wu-Hsueh-Pao.1996. v.29. 185−189.
Xu, W., Rould, M.A., Jun, S., Desplan, C., Pabo, C.O. Crystal structure of a paired domain DNA complex at 2.5 A resolution reveals structural basis for PAX developmental mutations. // Cell. 1995. v.80. pp. 639 — 650.

Заполнить форму текущей работой