Помощь в написании студенческих работ
Антистрессовый сервис

Структурные изменения молекулы ДНК, индуцированные ее взаимодействием с ионами металлов и металлоорганическими соединениями

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Целью диссертационной работы является определение конформационных изменений молекулы ДНК при ее взаимодействии с новыми двуядерными и моноядерными координационными соединениями двухвалентной платины, сравнение их действия на уровне модельных систем с результатами, полученными для известных противоопухолевых препаратов и их неактивных аналогов, для изучения влияния структурных особенностей… Читать ещё >

Структурные изменения молекулы ДНК, индуцированные ее взаимодействием с ионами металлов и металлоорганическими соединениями (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Содержание

  • ГЛАВА. СОВРЕМЕННЫЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ О ВЗАИМОДЕЙСТВИИ МОЛЕКУЛЫ ДНК С КООРДИНАЦИОННЫМИ СОЕДИНЕНИЯМИ ПЛАТИНЫ И ДВУХВАЛЕНТНЫМИ ИОНАМИ В РАСТВОРЕ
    • 1. 1. Структура молекулы ДНК
    • 1. 2. Взаимодействие молекулы ДНК с двухвалентными ионами металлов
    • 1. 3. Взаимодействие молекулы ДНК с координационными соединениями платины
    • 1. 4. Разветвленные структуры нуклеиновых кислот
  • ГЛАВА 2. МЕТОДЫ И МАТЕРИАЛЫ
    • 2. 1. Низкоградиентная вискозиметрия
    • 2. 2. Динамическое двойное лучепреломление
    • 2. 3. Атомная силовая микроскопия
    • 2. 4. Динамическое рассеяние света
    • 2. 5. Флуоресцентная микроскопия
    • 2. 6. Спектральные методы
    • 2. 7. Материалы
  • ГЛАВА. СПЕЦИФИКА ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С ДНК РАЗЛИЧНЫХ ИЗОМЕРОВ И МОДИФИКАЦИЙ КООРДИНАЦИОННЫХ СОЕДИНЕНИЙ ПЛАТИНЫ
    • 3. 1. Применение методов прямого наблюдения для изучения конформационных изменений молекулы ДНК в результате ее комплексообразования с цис-ДДП и транс-ДДП в растворе
    • 3. 2. Исследование комплексов молекулы ДНК с двуядерными соединениями двухвалентной платины
  • ГЛАВА. ИЗУЧЕНИЕ ДИНАМИКИ МИГРАЦИИ ВЕТВЕЙ РАЗВЕТВЛЕННЫХ СТРУКТУР НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ
    • 4. 1. Структурные особенности четырехсторонних разветвлений ДНК в присутствии двухвалентных ионов
    • 4. 2. Динамика поведения и миграции ветвей подвижных четырехсторонних разветвлений ДНК в реальном времени

Дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) является универсальным носителем генетической информации высших организмов. В настоящее время известно, что механизм действия ряда лекарственных препаратов обусловлен их взаимодействием с молекулой ДНК в клетке. К таким соединениям, например, относятся некоторые противоопухолевые препараты. Наиболее широко используемым в медицинской практике неорганическим противоопухолевым препаратом является цис-дихлордиамминплатина (цис-ДДП). Однако чрезвычайно высокая противоопухолевая активность препарата, обусловленная блокированием процессов деления клетки, сопровождается серьезными побочными эффектами, существенно ограничивающими клиническое использование цис-ДДП. Поиск аналогов цис-ДЦП из числа координационных соединений платины на основе анализа влияния их структурных особенностей на характер взаимодействия с молекулой ДНК, определяющий противоопухолевые свойства препаратов этого класса, является актуальной задачей. Изучение подобных взаимодействий в условиях реальных биологических систем весьма затруднено. Поэтому, несмотря на значительный прогресс, достигнутый в последнее время в понимании механизма действия цис-ДДП, окончательно вопрос о причинах противоопухолевой активности препаратов платины не решен. Проводимые в работе исследования комплексообразования координационных соединений платины с ДНК в модельных системах, представляющих собой водно-солевые растворы, могут служить простым и эффективным способом изучения молекулярных основ терапевтического действия противоопухолевых препаратов этого класса. Результаты, полученные при сравнении модификации ДНК в растворе новыми соединениями платины с результатом действия известных противоопухолевых препаратов и их неактивных аналогов могут быть использованы для первоначального отбора перспективных соединений.

Электростатические взаимодействия играют важную роль в определении конформации молекулы ДНК и оказывают существенное влияние на характер ее взаимодействия с биологически активными лигандами. Хотя некоторые платиновые комплексы не являются электролитами, в результате реакции акватации' они могут приобретать положительный заряд. В связи с этим сравнение конформационных изменений ДНК, обусловленных ее взаимодействием с комплексными ионами платины, с результатом влияния точечных двухвалентных ионов металлов, может дать дополнительную информацию о роли электростатических сил в процессе формирования комплексов. Исследование структурных изменений ДНК, индуцированных присутствием ионов Mn2+, Mg2+ и Zn2+, представляет значительный интерес также в связи с исследованием роли этих ионов в важнейших биологических процессах (репликации, транскрипции и гомологичной генетической рекомбинации). В работе изучается влияние этих ионов на процесс образования и стабильность разветвленных структур нуклеиновых кислот. Интересно отметить, что действие противоопухолевых соединений платины основано именно на подавлении процесса репликации.

Сказанное выше свидетельствует об актуальности темы предлагаемой работы и практической значимости выполненных исследований.

Используемые в работе соединения платины были синтезированы в Санкт-Петербургской химико-фармацевтической академии. В СПбХФА на протяжении многих лет проводятся работы по синтезу новых потенциальных противоопухолевых препаратов на основе платины. В последнее время большой интерес вызывают двуядерные комплексы платины триаминового типа. Они показывают хорошую эффективность в предварительных биологических экспериментах. Важным обстоятельством является возможность их применения после курса лечения цис-ДДП. В работе исследованы комплексы ДНК с рядом новых двуядерных соединений платины, содержащих общий ароматический лиганд.

Целью диссертационной работы является определение конформационных изменений молекулы ДНК при ее взаимодействии с новыми двуядерными и моноядерными координационными соединениями двухвалентной платины, сравнение их действия на уровне модельных систем с результатами, полученными для известных противоопухолевых препаратов и их неактивных аналогов, для изучения влияния структурных особенностей соединений платины и выявления роли определенных атомных групп в процессе формирования биологически значимых комплексованализ влияния ионов двухвалентных металлов на структуру и стабильность образующихся при репликации, транскрипции и гомологичной генетической рекомбинации четырехсторонних разветвлений ДНК.

Научная новизна работы состоит в том, что в работе впервые исследуются новые двуядерные соединения двухвалентной платины, содержащие пиразин и цитозин, проводится сравнение их действия с аналогичными моноядерными комплексами. Впервые применяются методы флуоресцентной микроскопии и динамического рассеяния света для определения конформационных изменений молекулы ДНК, вызванных ее взаимодействием с координационными соединениями платины. Впервые используется метод атомной силовой микроскопии в применении к подвижным четырехсторонним разветвлениям ДНК при изучении динамики их поведения в реальном времени.

Результаты работы докладывались и обсуждались на конференциях и симпозиумах: международных конференциях «DNA Conformation, Modification and Recognition in Biomedicine», 2000 (Брно, Чехия) — «Фармация в XXI веке: инновации и традиции», 1999 (С.-Петербург) — Европейском биофизическом конгрессе, 2000 (Мюнхен, Германия) — 2 съезде биофизиков России, 1999 (Москва) — VII Международном Черняевском совещании по химии, анализу и технологии платиновых металлов, 2001 (Москва) — III Всероссийской Каргинской конференции «Полимеры-2004», 2004 (Москва).

Структура и объем работы. Диссертация состоит из введения, трех глав, заключения и списка цитируемой литературы. Работа изложена на 198 страницах, содержит 96 рисунков, 6 таблиц. Список цитируемой литературы состоит из 258 наименований.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

.

В диссертации проведено исследование структурных изменений молекулы ДНК, вызванных ее взаимодействием с новыми координационными соединениями платины и ионами металлов. Используемые в работе новые препараты платины являются биологически активными и могут рассматриваться в качестве потенциальных противоопухолевых агентов. В работе выполнен анализ влияния природы общего лиганда, циси трансрасположения NH3 групп на характер конформационных изменений ДНК при связывании. Проводится сравнение влияния монои биядерных соединений платины с одинаковым ароматическим лигандом на процесс комплексообразования. Исследование разветвленных структур нуклеиновых кислот, выполненное методом атомной силовой микроскопии в режиме реального времени, впервые позволило получить информацию о динамике изменений холидеевских структур и влиянии ионов металлов на их стабильность. В заключение можно сформулировать основные результаты работы:

1. Методы прямого наблюдения (атомная силовая и флуоресцентная микроскопия), а также метод динамического светорассеяния, используемые для подобных систем впервые, позволили зафиксировать уменьшение размеров ДНК при образовании ее комплексов с цис-ДДП и транс-ДДП без изменения формы молекулярного клубка в растворе. Вместе с тем, зафиксировано различие локальных структурных изменений ДНК при комплексообразовании с этими препаратами.

2. Все исследованные в работе двуядерные координационные соединения двухвалентной платины образуют координационную связь с молекулой ДНК по позиции N7 гуанина, при этом наиболее существенные конформационные изменения наблюдаются при связывании ДНК с соединением Ptl, содержащим пиразин.

3. В связывании препаратов PtlO, Ptl 1, Ptl2 с ДНК в растворе участвует только один атом платины из двух, входящих в состав координационного соединения, при этом структурные изменения ДНК при образовании комплексов с PtlO и Ptl 1 имеют много общего с наблюдаемыми при комплексообразовании ДНК с цис-ДДП.

4. Характер комплексообразования соединений платины с ДНК в значительной степени зависит от цисили трансрасположения лигандов в первой координационной сфере платины, а также от суммарного заряда комплексного иона, вступающего во взаимодействие с макромолекулой.

5. Сопоставление данных, полученных при изучении связывания ДНК в растворе с двуядерным и аналогичным моноядерным координационными соединениями платины цис-конформации, в состав которых входит цитозин, показало, что в обоих случаях реализуется одна координационная связь платины с ДНК, вместе с тем, в эксперименте фиксируется разный характер изменения параметров ДНК. В случае моноядерного препарата его взаимодействие с ДНК осуществляется с участием цитозинового лиганда.

6. Показано, что для неподвижных четырехсторонних разветвлений ДНК в присутствии ионов Mg2+ и Мп2+ преимущественно реализуется антипараллельная Х-структура.

7. Опыт показал, что ионы Mg2+, Мп2+ и Zn сходным образом влияют на структуру подвижных четырехсторонних разветвлений и способствуют формированию Х-структур при используемых в работе концентрациях.

8. Присутствие двухвалентных ионов в растворе понижает скорость миграции точки ветвления подвижных разветвленных структур.

9. Показано, что при наблюдении в реальном времени за динамикой подвижных разветвленных структур в растворах, содержащих ионы Mg2+, происходят спонтанные переходы из цис-конформации в транси обратно.

Показать весь текст

Список литературы

  1. Watson J.D., Crick F.H.C., A structure of deoxyribose nucleic acid.// Nature, 1953, 171,737−738
  2. Crick F.H.C., Watson J.D., The complementary structure of deoxyribonucleic acid.// Proc. Roy. Soc. (London), 1954, Ser. A, 223, 80−96
  3. Zamenhof S., Brawermann G., Chargaff E., On the desoxypentose nucleic acids from several microorganisms.// Biochim. Biophys. Acta, 1952,9,402−405
  4. Leslie A.G.W., Arnott S., Chandrasekaran R., Ratliff R.L. Polymorphism of DNA double helices.//J. Mol Biol., 1980, 143, 49−72
  5. В., Принципы структурной организации нуклеиновых кислот.// Москва, Мир, 1987
  6. Lewitt M., How many base-pair per turn does DNA have in solution and in chromatin? Some theoretical calculations.// Proc. Nat. Acad. Sci., USA, 1978, 75, 640−644
  7. Calladine C.R., Mechanism of sequence-dependent stacking of bases in B-DNA.// J. Mol. Biol., 1982,161,343−352
  8. Ч., Шиммел П., Биофизическая химия.// т. 1, Москва, Мир, 1984
  9. И. Hoogsteen К., The crystal and molecular structure of a hydrogen-bonded complex between 1-methylthymine and 9-methyladenine.// Acta Crystallogr., 1963,16, 907−916
  10. Eichhorn G.L., Inorganic Biochemistry.// Elsevier, Amsterdam, 1973
  11. Sissoeff L., Grisvard S., Guille E., Studies on metal ions-DNA interactions: Specific behaviour of reviterative DNA sequensces.// Prog. Biophys. Mol. Biol., 1973,31, 165−199
  12. Pezzano H., Podo F., Structure of binary complexes of mono- and polynucleotides with metal ions of the first transition group.// Chem. Rev., 1980, 365−401
  13. Mildvan A.S., Loeb L.A., The role of metal ions in the mechanism of DNA and RNA polymerases.// CRC Crit. Rev. Biochem., 1979, 6, 219−244
  14. Sissoeff I., Grisvald J., Guite E., Studies on metal ions DNA interactions: specific behaviour of reiterative DNA sequences.// Progr. Biophys. and Mol. Biol., 1976,31(2), 165−199
  15. Clement R.M., Sturm J., Daune M.P., Interaction of metallic cations with DNA. VI. Specific binding of Mg2+ and Mn2+.// Biopolymers, 1973, 12(2), 405−421
  16. Daune M., Interactions of metal ions with nucleic acids.// Metal Ions in Biol. Syst., N.Y., Marcel Dekker, 1979, 3, 1−43
  17. Mathieson A.R., Olayemi I.Y., The interaction of calcium and magnesium ions with deoxyribonucleic acids.//Arch. Biochem. Biophys. 1975, 169(1), 237−243
  18. Blagoi Yu.P., Sorokin V.A., Valeev V.A., Magnesium ion effect on the helix-coil transition of DNA.//Biopolymers, 1978, 17(5), 1103−1118
  19. Dove W.F., Davidson N., Cation effects on the denaturation of DNA.// J.Mol.Biol., 1962, 5(1), 467−478
  20. Record M.T., Effect of Na and Mg ions on the helix-coil transition of DNA.// Biopolymers, 1975, 14(9), 2137−2158
  21. Lyons J.W., Kotin L., The effect of magnesium ion on the secondary structure of deoxyribonucleic acid.//J. Am. Chem. Soc., 1965, 87(8), 1781−1785
  22. Chang K.Y., Carr Ch.W., The binding of calcium with deoxyribonucleic acid and deoxyribonucleic acid-protein complexes.// Biochim. Biophys. Acta., 1968, 157(1), 127−129
  23. Reuben J., Gabbay E.J., Binding of manganese (II) to DNA and the competitive effects of metal ions and organic cations. An electron paramagnetic resonance study.//Biochemistry 1975, 15(6), 1230−1235
  24. Eichorn G.L., The effect of metal ions on the structure and function of nucleic acids. // Metal Ions Genet. Inf. Transfer, N.Y., 1981, 1−46
  25. H.A., Дьяконова H.E., Фрисман Э. В., Исследование молекулярного механизма взаимодействия ДНК с двухвалентными ионами металлов.//Молек. биология, 1989, 23(4), 835−841
  26. Zimer С., Luck G., Triebel Н., Conformation and reactivity of DNA. IV. Base binding ability of transition metal ions to native DNA and effect of helic conformation with specific reference to DNA-Zn (II) complex.// Biopolymers, 1974, 13(2), 425−453
  27. Dix D.E., Strauss D.B., DNA helix stability. I. Differential stabilization by counter cations.//Arch. Biochem. Biophys, 1972,152(1), 299−310
  28. Hanlon S., Wolf В., Berman S., The conformational sensitivity of DNA to ionic interactions in aqueous solutions. // Metal-ligand interactions in organic chemistry and biochemistry, Dordrecht: Holland D. Reidel Publ., 1977, 1, 77 106
  29. А.Д., Монаселидзе Д. Р., Исследование плавления ДНК в области инверсии относительной стабильности ГЦ- и АТ-пар.// Молек. Биология, 1975,9(5), 783−789
  30. Rosenberg В., Van Camp L., Krigas Т., Inhibition of cell division in escherichia coli by electrolysis products from a platinum electrode.// Nature, 1965, 205, 698−699
  31. Rosenberg В., Van Camp L., Trosko J.E., Mansour V.N., Platinum compounds: a new class of potent antitumour agents.// Nature, 1969, 222, 385−386
  32. Giaccone, G., Clinical perspectives on platinum resistance.// Drugs, 2000, 59, 917
  33. Wong, E., Giandomenico, C.M., Current status of platinum-based antitumor drugs.// Chem. Rev., 1999, 99,2451−2466
  34. Weiss, R.B., Christian, M.C., New cisplatin analogs in development: a review.// Drugs, 1993,46,360−377
  35. Gale G.R., Morris C.R., Atkins L.M., Smith A.B., Binding of an antitumor platinum compound to cells as influenced by physical factors and pharmacologically active agents.// Cancer Res., 1973,33, 813−818
  36. Binks S.P., Dobrota M., Kinetics and mechanism of uptake of platinum-based pharmaceuticals by the rat small intestine.// Biochem. Pharmacol., 1990, 40, 1329−1336
  37. Hromas R.A., North J.A., Burns C.P., Decreased cisplatin uptake by resistant L1210 leukemia cells.// Cancer Lett., 1987,32(2), 197−201
  38. Mann S.C., Andrews P.A., Howell S.B., Short-term cis-diamminedichloroplatinum (II) accumulation in sensitive and resistant human ovarian carcinoma cells.// Cancer Chemother. Pharmacol., 1990,25,236−240
  39. Andrews P.A., Mann S.C., Velury S., Howell S.B., Platinum and other metal coordination compounds in cancer chemotherapy.// Nicolini M. (ed.), Martinus Nijoff Publishing, Boston, 1988, 248−254
  40. Witkin E.M., The radiation sensitivity of Escherichia coli B: a hypothesis relating filament formation and prophage induction.// Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1967,57, 1275−1279
  41. Adler H.I., Hardigree A.A., Postirradiation growth, division, and recovery in bacteria.// Radiat. Res., 1965,25, 92−102
  42. Reslova S., The induction of lysogenic strains of Escherichia coli by cis-dichloro-diammineplatinum (II).// Chem. Biol. Interact., 1971, 4(1), 66−70
  43. Harder H.C., Rosenberg В., Inhibitory effects of anti-tumor platinum compounds on DNA, RNA and protein syntheses in mammalian cells in virtro.// Int. J. Cancer, 1970, 6(2), 207−216
  44. Howie J.A., Gale G.R.// Biochem. Pharmacol., 1970, 19,2757−2762
  45. Akaboshi M., Kawai K., Maki H., Akuta K., Ujeno Y., Miyahara Т., The number of platinum atoms binding to DNA, RNA and protein molecules of HeLa cells treated with cisplatin at its mean lethal concentration.// Jpn. J. Cancer Res., 1992, 83(5), 522−526
  46. Beck D.J., Brubaker R.R., Effect of cis-platinum (II)diamminodichloride on wild type and deoxyribonucleic acid repair deficient mutants of Escherichia coli.// J. Bacteriology, 1973,116(3), 1247−1252
  47. Drobnik J., Urbankova M., Krekulova A., The effect of cis-dichlorodiammineplatinum (II) on Escherichia coli B. The role of fil, exr and her markers.//Mutat. Res., 1973, 17(1), 13−20
  48. Markham B.E., Brubaker R.R., Influence of chromosome integrity on Escherichia coli cell division.//J. Bacteriology, 1980, 143(1), 455−462
  49. Brouwer J., van de Putte P., Fichtinger-Schepman A.M., Reedijk J., Base-pair substitution hotspots in GAG and GCG nucleotide sequences in Escherichia coli
  50. К-12 induced by cis-diamminedichloroplatinum (II).// Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A., 1981,78(11), 7010−7014
  51. Beck D.J., Popoff S., Sancar A., Rupp W.D., Reactions of the UVRABC excision nuclease with DNA damaged by diamminedichloroplatinum (II).// Nucl. Acids Res., 1985, 13(20), 7395−7412
  52. Fram R.J., Cusick P. S., Wilson J.M., Marinus M.G., Mismatch repair of cis-diamminedichloroplatinum (II) — induced DNA damage.// Mol. Pharmacol., 1985, 28(1), 51−55
  53. Popoff S.C., Beck D.J., Rupp W.D., Repair of plasmid DNA damaged in vitro with cis- or trans- diamminedichloroplatinum (II) in Escherichia coli.// Mutat. Res., 1987,183(2), 129−137
  54. Eastman A., The formation, isolation and characterization of DNA adducts produced by anticancer platinum complexes.// Pharmacol. Ther., 1987, 34(2), 155−166
  55. Bruhn S.L., Toney J.H., Lippard S J., Biological processing of DNA modified by platinum compounds.// In Progress in Inorganic Chemistry: Bioinorganic Chemistry, Lippard S.J. (ed.), John Wiley and Sons Inc., 1990,38,477−516
  56. Reedijk J., The relevance of hydrogen bonding in the mechanism of action of platinum antitumor compounds. Inorg. Chim. Acta, 1992,198, 873−881
  57. Sip M., Leng M., DNA, cis-platinum and intercalators: Catalytic activity of the DNA double helix.// Nucleic Acids and Molecular Biology, Eckstein F. and Lilley D.MJ. (ed)., Springer Berlin, 1993, 7, 1−15
  58. Mello J.M., Lippard S.J., Essigman J.E., DNA adducts of cis-diamminedichloroplatinum (II) and its trans isomer inhibit RNA polymerase II differentially in vivo.//Biochemistry, 1995,34(45), 14 783−14 791
  59. Pinto A.L., Lippard S.J., Binding of the antitumor drug cis-diamminedichloroplatinum (II) (cisplatin) to DNA.// Biochim. Biophys. Acta, 1985, 780(3), 167−180
  60. Zamble D.B., Mu D., Reardon J.T., Sancar A., Lippard S.J., Repair of cisplatin-DNA adducts by the mammalian excision nuclease.// Biochemistry, 1996, 35(31), 10 004−10 013
  61. Fichtinger-Schepman A.M., van der Veer J.L., den Hartog J.H., Lohman P.H.M., Reedijk J., Adducts of the antitumor drug cis-diamminedichloroplatinum (II) with DNA: formation, identification, and quantitation.//Biochemistry, 1985, 24(3), 707−713
  62. Eastman A., Reevaluation of interaction of cis-dichloro (ethylenediamine)platinum (II) with DNA.// Biochemistry, 1986, 25(13), 3912−3915
  63. Roberts J.J., Pascoe J.M., Cross-linking of complementary strands of DNA in mammalian cells by antitumour platinum compounds.// Nature, 1972, 235(5336), 282−284
  64. Jamieson E.R., Lippard S.J., Structure, Recognition, and Processing of Cisplatin-DNA Adducts.// Chem. Rev., 1999,99(9), 2467−2498
  65. Van de Vaart P.J.M., Belderbos J., de Jong D., Sneeuw K.C.A., Majoor D., Bartelink H., Begg A.C., DNA-adduct levels as a predictor of outcome for NSCLC patients receiving daily cisplatin and radiotherapy.// Int. J. Cancer, 2000, 89, 160−166
  66. Brabec V., Chemistry and structural biology of 1,2-interstrand adducts of cisplatin.// Kelland, L.R., Farrell, N.P. (Eds.), Platinumbased Drugs in Cancer Therapy. Humana Press Inc., Totowa, NJ, 2000, 37−61
  67. Perez C., Leng M., Malinge J.M., Rearrangement of interstrand cross-links into intrastrand cross-links in cis-diamminedichloroplatinum (II)-modified DNA.// Nucleic Acids Res., 1997,25(4), 896−903
  68. Brabec, V., Kleinwachter, V., Butour, J.L., Johnson, N.P., Biophysical studies of the modification of DNA by antitumour platinum coordination complexes.// Biophys. Chem. 1990,35, 129−141
  69. H.A., Богданов A.A., Дефрене С. Взаимодействие молекулы ДНК с координационными соединениями платины и кобальта в растворе.// Биофизика, 2002, 47(3), 449
  70. Brabec V., Leng М., DNA interstrand cross-links of trans-diamminedichloroplatinum (II) are preferentially formed between guanine and complementary cytosine residues.// Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1993, 90, 5345−5349
  71. Eastman A., Jennerwein M.M., Nagel D.L., Characterization of bifunctional adducts produced in DNA by trans-diamminedichloroplatinum (II).// Chem. Biol. Interact., 1988, 67(1−2), 71−80
  72. Arpalahti J., Mikola M., Mauristo S., Kinetics and mechanism of the complexation of cis-diammindichloroplatinum (II) with the purine nucleoside inosine in aqueous solution.//Inorg. Chem., 1993, 32(15), 3327−3332
  73. Bancroft D.P., Lepre C.A., Lippard S.J., Pt-195 NMR kinetic and mechanistic studies of cis- diamminedichloroplatinum and trans-diamminedichloroplatinum (II) binding to DNA.// J. Am. Chem. Soc., 1990,112, 6860−6871
  74. Johnson N.P., Hoeschele J.D., Rohn R.O., Kinetic analysis of the in vitro binding of radioactive cis- and trans-dichlorodiammineplatinum (II) to DNA.// Chem. Biol. Interact., 1980, 30(2), 151−169
  75. Barnham K.J., Bernens-Price S.J., Frenkiel T.A., Frey U., Sadler P.J., Platination Pathways for Reactions of Cisplatin with GG Single-Stranded and Double-Stranded Decanucleotides.// Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 1995, 34(17), 1874−1877
  76. Horacek P., Drobnik J., Interaction of cis-dichlorodiammineplatinum (II) with DNA.// Biochim. Biophys. Acta, 1971,254(2), 341−347
  77. Bodenner D.L., Dedon P.C., Keng P.C., Borch R.F., Effect of diethyldithiocarbamate on cis-diamminedichloroplatinum (II)-induced cytotoxicity, DNA cross-linking, and gamma-glutamyl transpeptidase inhibition.// Cancer Res., 1986,46(6), 2745−2750
  78. Malinge J. M., Leng M., Reactivity of monofunctional cis-platinum adducts as a function of DNA sequence.//Nucleic Acids Res. 1988, 16(15), 7663−7672
  79. Eastman A., Barry M.A., Interaction of trans-diamminedichloroplatinum (II) with DNA: formation of monofunctional adducts and their reaction with glutathione.//Biochemistry, 1987, 26(12), 3303−3307
  80. Bernal-Mendez E., Boundvillain M., Gonzales-Vilchez F., Leng M., Chemical versatility of transplatin monofunctional adducts within multiple site-specifically platinated DNA.// Biochemistry, 1997,36(24), 7281−7287
  81. Reedijk J., Improved understanding in platinium antitumour chemistry.// Chem. Commun., 1996, 7, 801−806
  82. Cohen G.L., Bauer W.R., Barton J.K., Lippard S.J., Binding of cis- and trans-dichlorodiammineplatinum (II) to DNA: evidence for unwinding and shortening of the double helix.// Science, 1979,203(4384), 1014−1016
  83. Macquet J.P., Butour J.I., Biochimie.//1978, 60,901−914
  84. Scovell W.M., Kroos L.R., Cis-diamminedichloroplatinum (II) modification of SV40 DNA occurs preferentially in (G+C) rich regions: implications into the mechanism of action.// Biochem. Biophys. Res. Commun., 1982,108(1), 16−23
  85. Maeda Y., Nunomura K., Ohtsubo E., Cis-diamminedichloroplatinum (II) modification of SV40 DNA occurs preferentially in (G+C) rich regions: implications into the mechanism of action.// J. Mol. Biol., 1990,215(2), 321−329
  86. Nunomura K., Maeda Y., Ohtsubo E., The interaction of platinum complexes with DNA studied by differential scanning calorimetry.// J. Gen. Appl. Microbiol., 1991, 37, 207−214
  87. Kagemoto A., Takagi H., Naruse K., Baba Y., Thermochim. Acta.// 1991, 190, 191−201
  88. Sherman S.E., Gibson D., Wang A.H. J., Lippard S.J., X-ray structure of the major adduct of the anticancer drug cisplatin with DNA: cis-Pt (NH3)2(d (pGpG)).// Science, 1985,230(4724), 412−417
  89. Sherman S.E., Gibson D., Wang A.H.J., Lippard S.J., Crystal and Molecular Structure of Сis-(Pt (NH3)2 {d (pGpG)}), the Principal Adduct Formed by Cisdiamminedichloroplatinium (II) with DNA.// J. Am. Chem. Soc., 1988, 110, 7368−7381
  90. Takahara P.M., Rosenzweig A.C., Frederick C.A., Lippard S.J., Crystal structure of double-stranded DNA containing the major adduct of the anticancer drug cisplatin.// Nature, 1995, 377(6550), 649−652
  91. Takahara P.M., Frederick C.A., Lippard S.J., Crystal structure of the anticancer drug cisplatin bound to duplex DNA.// J.Am. Chem. Soc., 1996, 118, 1 230 912 321
  92. Gelasco A., Lippard S.J., NMR solution structure of a DNA dodecamer duplex containing a cis- diammineplatinum (II) d (GpG) intrastrand cross-link, the major adduct of the anticancer drug cisplatin.// Biochemistry, 1998, 37(26), 9230−9239
  93. Huang H., Zhu L., Reid B.R., Drobny G.P., Hopkins P.B., Solution structure of a cisplatin-induced DNA interstrand cross-link.// Science, 1995, 270(5243), 1842−1845
  94. Paquet F., Perez C., Leng M., Lancelot G., Malinge J.M., NMR solution structure of a DNA decamer containing an interstrand cross-link of the antitumor drug cis-diamminedichloroplatinum (II).// J. Biomol. Struct. Dyn. 1996, 14, 67−77
  95. Bellon S.F., Lippard S.J., Bending studies of DNA site-specifically modified by cisplatin, trans- diamminedichloroplatinum (II) and cis-Pt (NH3)2(N3-cytosine)Cl.+.// Biophys. Chem., 1990, 35(2−3), 179−188
  96. Bellon S.F., Coleman J.H., Lippard S.J., DNA unwinding produced by site-specific intrastrand cross-links of the antitumor drug cis-diamminedichloroplatinum (II).//Biochemistry, 1991, 30(32), 8026−8035
  97. Sip M., Schwartz A., Vovelle F., Ptak M., Leng M., Distortions induced in DNA by cis-platinum interstrand adducts.// Biochemistry, 1992,31(9), 2508−2513
  98. Malinge J.M., Perez C., Leng M., Base sequence-independent distorsions induced by interstrand cross-links in cis- diamminedichloroplatinum (II)-modified DNA.// Nucl. Acids Res., 1994,22(19), 3834−3839
  99. Brabec V., Kasparkova J., Molecular aspects of resistance to antitumor platinum drugs.// Drug Resistance Updates 5,2002, 147−161
  100. Kartalou M., Essigmann J.M., Recognition of cisplatin adducts by cellular proteins.// Mut. Res., 2001,478, 1−21
  101. Cohen S.M., Lippard S.J., Cisplatin: from DNA damage to cancer chemotherapy.// Prog. Nucl. Acid Res. Mol. Biol., 2001, 67, 93−130
  102. Jordan P., Carmo-Fonseca M., Molecular mechanisms involved in cisplatin cytotoxicity.// Cell. Mol. Life Sci. 2000, 57, 1229−1235
  103. Kelland L.R., Preclinical perspectives on platinum resistance.// Drugs, 2000, 59, 1−8
  104. Johnson S.W., Ferry K.V., Hamilton T.C., Recent insights into platinum drug resistance in cancer.//Drug Resist. Updates 1, 1998,243−254
  105. Pinto A.L., Lippard S.J., Sequence-dependent termination of in vitro DNA synthesis by cis- and trans-diamminedichloroplatinum (II).// Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1985, 82,4616−4620
  106. Sorenson C.M., Eastman A., Mechanism of cis-diamminedichloroplatinum (II)-induced cytotoxicity role of G2 arrest and DNA doublestrand breaks.// Cancer Res., 1988,48,4484−4488
  107. Chu G., Cellular responses to cisplatin: the roles of DNA-binding proteins and DNA repair.// J. Biol. Chem., 1994, 269, 787−790
  108. Allday M.J., Inman G.J., Crawford D.H., Farrell P.J., DNA damage in human В cells can induce apoptosis, proceeding from Gl/S when p53 is transactivation competent and G2/M when it is transactivation defective.// EMBO J., 1995, 14, 4994−5005
  109. Gonzalez V.M., Fuertes M.A., Alonso C., Perez J.M., Is cisplatininduced cell death always produced by apoptosis?// Mol. Pharmacol., 2001, 59, 657−663
  110. Lilley D.M.J., Structures of helical junctions in nucleic acids.// Quarterly Reviews of Biophysics, 2000, 33,2, 109−159
  111. Lilley D. M. J., Clegg R. M., Diekmann S., Seeman N. C., von Kitzing E., Hagerman P., Nomenclature Committee of the International Union of
  112. Biochemistry: A nomenclature of junctions and branchpoints in nucleic acids. Recommendations 1994.// Eur. J. Biochem., 1995,230, 1−2
  113. Holliday R., A mechanism for gene conversion in fungi.// Genet. Res., 1964, 5, 282−304
  114. Broker T. R., Lehman I. R., Branched DNA molecules: intermediates in T4 recombination.//J. Molec. Biol., 1971, 60, 131−149
  115. Sherratt D. J., Wigley D. B. Conserved themes but novel activities in recombinases and topoisomerases. // Cell, 1998, 93, 149−152.
  116. Potter H., Dressier D., On the mechanism of genetic recombination: electron microscopic observation of recombination intermediates.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1976, 73,3000−3004
  117. Potter H., Dressier D. In vitro system from Escherichia coli that catalyses generalised genetic recombination.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1978, 75, 3698−3702
  118. Orr-Weaver T.L., Szostak J.W., Rothstein R. J., Yeast transformation: a model system for the study of recombination.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1981, 78, 6354−6358
  119. Schwacha A., Kleckner N., Identification of double Holliday junctions as intermediates in meiotic recombination.// Cell, 1995, 83, 783−791
  120. Hoess R., Wierzbicki A., Abremski K., Isolation and characterisation of intermediates in sitespecific recombination.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1987, 84,6840−6844
  121. Nunes-Duby S. E., Matsomoto L., Landy A. Site-specific recombination intermediates trapped with suicide substrates.// Cell, 1987, 50, 779−788
  122. Kitts P.A., Nash H.A. Homologydependent interactions in phage к site-specific recombination.//Nature, 1987, 329,346−348
  123. Jayaram M., Crain K.L., Parsons R.L., Harshey R.M., Holliday junctions in FLP recombination: resolution by step-arrest mutants of FLP protein.// Proc. natn. Acad. Sci. USA, 1988, 85, 7902−7906
  124. McCulloch R., Coggins L.W., Colloms S.D., Sherratt D.J. Xer-mediated site-specific recombination at cer generates Holliday junctions in vivo.// EMBO J., 1994, 13, 1844−1855
  125. Kemper В., Janz E., Function of gene 49 of bacteriophage T4. 1. Isolation and biochemical characterisation of very fast sedimenting DNA.// J. Virol., 1976,18, 992−999
  126. Lee C.S., Davis R.W., Davidson N., A physical study by electron microscopy of the terminally repetitious, circularly permuted DNA from the coliphage particles of Escherichia coli 15.//J. Molec. Biol., 1970,48,1−22
  127. Benbow R.M., Zuccarelli A.J., Sinsheimer R.L., Recombinant DNA molecules of bacteriophage фХ174.//Ргос. Natl. Acad. Sci. USA, 1975, 72,235−239
  128. Thompson B.J., Camien M.N., Warner R.C., Kinetics of branch migration in doublestranded DNA.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1976, 73, 2299−2303
  129. Thompson В J., Escarmis C., Parker В., Slater W.C., Doniger J., Tessman I., Warner R.C., Figure-8 cofiguration of dimers of S13 and phiX174 replicative form DNA.// J. Molec. Biol., 1976,91,409−419
  130. Lilley D.M.J., Kemper В., Cruciformresolvase interactions in supercoiled DNA.// Cell, 1984,36,413−422
  131. Mizuuchi K., Kemper В., Hays J., Weisberg R.A., T4 endonuclease VII cleaves Holliday structures.// Cell, 1982, 29, 357−365
  132. Mizuuchi K., Mizuuchi M., Gellert M., Cruciform structures in palindromic DNA are favored by DNA supercoiling.// J. Molec. Biol., 1982,156,229−243
  133. Courey A.J., Wang J.C. Cruciform formation in negatively supercoiled DNA may be kinetically forbidden under physiological conditions.// Cell, 1983, 33, 817−829
  134. Lilley D.M.J., Hallam L. R., Thermodynamics of the ColEl cruciform. Comparisons between probing and topological experiments using single topoisomers.//J. Molec. Biol., 1984, 180, 179−200
  135. Greaves D.R., Patient R.K., Lilley D.M.J. Facile cruciform formation by an (AT) sequence from a Xenopus globin gene.// J. Molec. Biol., 1985,185,461−478
  136. Gellert M., Mizuuchi K., O’Dea M.H., Ohmori H., Tomizawa J., DNA gyrase and DNA supercoiling.// Cold Spring Harbor Symp. quant. Biol., 1979, 43, 3540
  137. Lilley D.M.J., The inverted repeat as a recognisable structural feature in supercoiled DNA molecules.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1980, 77, 6468−6472
  138. Panayotatos N., Wells R.D., Cruciform structures in supercoiled DNA.// Nature, 1981,289, 466−470
  139. Giraud-Panis M.J.E., Lilley D.M.J., Near-simultaneous DNA cleavage by the subunits of the junction-resolving enzyme T4 endonuclease VII.// EMBO J., 1997, 16, 2528−2534
  140. Kallenbach N. R., Ma R.I., Seeman N.C., An immobile nucleic acid junction constructed from oligonucleotides.//Nature, 1983, 305, 829−831
  141. Hsu P.L., Landy A., Resolution of synthetic att-site Holliday structures by the integrase protein of bacteriophage k.//Nature, 1984, 311, 721−726
  142. Gough G.W., Lilley D.M.J., DNA bending induced by cruciform formation.// Nature, 1985,313,154−156
  143. Duckett D.R., Murchie A.I.H., Lilley D.M.J., The global folding of four-way helical junctions in RNA, including that in U1 snRNA.// Cell, 1995, 83, 10 271 036
  144. Walter F., Murchie A.I.H., Duckett D.R., Lilley D.M.J., Global structure of four-way RNA junctions studied using fluorescence resonance energy transfer.// RNA, 1998,4,719−728
  145. Lilley D.M.J., Analysis of the global conformation of branched RNA species by a combined electrophoresis and fluorescence approach.// Method. Enzymol., 2000,317,368−393
  146. Altona C., Classification of nucleic acid junctions.// J. Molec. Biol., 1996, 263, 568−581
  147. Cooper J. P., Hagerman P.J., Gel electrophoretic analysis of the geometry of a DNA four-way junction.// J. Molec. Biol., 1987, 198, 711−719
  148. Duckett D.R., Murchie A.I.H., Diekmann S., von Kitzing E., Kemper В., Lilley D.M.J., The structure of the Holliday junction and its resolution.// Cell, 1988, 55, 79−89
  149. Murchie A.I.H., Clegg R.M., von Kitzing E., Duckett D.R., Diekmann S., Lilley D.M.J., Fluorescence energy transfer shows that the four-way DNA junction is a right-handed cross of antiparallel molecules.//Nature, 1989, 341, 763−766
  150. Cooper J.P., Hagerman P.J., Geometry of a branched DNA structure in solution.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1989, 86, 7336−7340
  151. Clegg R.M., Murchie A.I.H., Zechel A., Carlberg C., Diekmann S., Lilley D.M.J., Fluorescence resonance energy transfer analysis of the structure of the four-way DNA junction.// Biochemistry, 1992, 31, 4846−4856
  152. Chen J.H., Churchill M.E.A., Tullius T.D., Kallenbach N.R., Seeman N.C., Construction and analysis of monomobile DNA junctions.// Biochemistry, 1988, 27, 6032−6038
  153. Sigal N., Alberts В., Genetic recombination: the nature of crossed strand-exchange between two homologous DNA molecules.// J. Molec. Biol., 1972, 71, 789−793
  154. Lushnikov A.Y., Bogdanov A., Lyubchenko Y.L., DNA recombination: Holliday junctions dynamics and branch migration. // J. Biol. Chem., 2003, 278(44), 43 130−43 134
  155. Nowakowski J., Shim P.J., Prasad G.S., Stout C.D. Joyce G.F., Crystal structure of an 82 nucleotide RNA-DNA complex formed by the 10−23 DNA enzyme.// Nature Struct. Biol., 1999, 6,151−156
  156. Ortiz-Lombardi!a M., Gonzalez A., Erijta R., Aymami J., Azorin F., Coll M., Crystal structure of a DNA Holliday junction.// Nature Struct. Biol., 1999, 6, 913−917
  157. Eichman B.F., Vargason J.M., Mooers B.H.M., Ho P. S., The Holliday junction in an inverted repeat DNA sequence: sequence effects on the structure of four-way junctions.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, 97, 3971−3976
  158. Shlyakhtenko L.S., Potaman V.N., Sinden R.R., Lyubchenko Y.L., Structure and dynamics of supercoil-stabilized DNA cruciforms.// J. Mol. Biol., 1998, 280(1), 61−72
  159. Shlyakhtenko L.S., Hsieh P., Grigoriev M., Potaman V.N., Sinden R.R., Lyubchenko Y.L., A cruciform structural transition provides a molecular switch for chromosome structure and dynamics.// J. Mol. Biol., 2000, 296(5), 11 691 173
  160. Duckett D.R., Murchie A.I.H., Lilley D.M.J., The role of metal ions in the conformation of the four-way junction.// EMBO J., 1990, 9, 583−590
  161. Clegg R.M., Murchie A.I.H., Zechel A., Lilley D.M.J., The solution structure of the four-way DNA junction at low salt concentration- a fluorescence resonance energy transfer analysis.// Biophys. J. (1994). 66,99−109
  162. Hsieh P., Panyutin I.G., DNA branch migration.// Nucleic Acids Res. and Molec. Biol., Eckstein F., Lilley D.M.J, (eds.), Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg, 1995, 9,42−65
  163. Radding C.M., Beattie K.L., Holloman W.K., Wiegand R.C., Uptake of homologous single-stranded fragments by superhelical DNA. IV. Branch migration.//J. Molec. Biol., 1977, 116, 825−839
  164. Green C., Tibbetts C., Reassociation rate limited displacement of DNA strands by branch migration.//Nucleic Acids Res., 1981, 9, 1905−1918
  165. Meselson M., Formation of hybrid DNA by rotary diffusion during genetic recombination.//J. Molec. Biol., 1972, 71, 795−798
  166. Thompson B.J., Camien M.N., Warner R.C., Kinetics of branch migration in doublestranded DNA.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1976, 73, 2299−2303
  167. Warner R.C., Fishel R.A., Wheeler F.C., Branch migration in recombination.// Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol., 1979, 43, 957−968
  168. Gellert M., O’Dea M.H., Mizuuchi K., Slow cruciform transitions in palindromic DNA.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1983, 80, 5545−5549
  169. Sinden R.R., Pettijohn D.E., Cruciform transitions in DNA.// J. Biol. Chem., 1984, 259, 6593−6600
  170. Panyutin I.G., Hsieh P., Formation of a single base mismatch impedes spontaneous DNA branch migration.// J. Molec. Biol., 1993,230,413−424
  171. Panyutin I.G., Hsieh P., The kinetics of spontaneous DNA branch migration.// Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1994, 91, 2021−2025
  172. Panyutin I.G., Biswas I., Hsieh P., A pivotal role for the structure of the Holliday junction in DNA branch migration.//EMBO J., 1995,14, 1819−1826
  173. Mulrooney S.B., Fishel R.A., Hejna J. A., Warner R.C., Preparation of Figure 8 and cruciform DNAs and their use in studies of the kinetics of branch migration.// J. Biol. Chem., 1996,271, 9648−9659
  174. Johnson R.D., Symington L.S., Crossed stranded DNA structures for investigating the molecular dynamics of the Holliday junction.// J. Molec. Biol., 1993,229,812−820
  175. Huggins M., The viscosity of dilute solutions of long chain molecules. IV. Dependence on concentration.// J. Am. Chem. Soc., 1942, 64,11.
  176. B.H., Эскин B.E., Френкель С. Я. Структура макромолекул в растворах//М., Наука, 1964
  177. О.Б., Эйзнер Ю. Е., Гидродинамика растворов полимеров. IV. О влиянии объемных эффектов на рассеяние света и константу трения макромолекул в растворе.// Высокомол. соед., 1959,1(7), 966−977
  178. О.Б., Эйзнер Ю. Е., Гидродинамика растворов полимеров. II. Гидродинамические свойства макромолекул в хороших растворителях.// Журнал Тех. Физ., 1959,29, 1117−1134
  179. Yamakawa Н., Fujii М., Intrinsic viscosity of wormlike chains determination of the salt factor.//Macromol., 1974, 7(1), 128−135
  180. B.H., Фрисман Э. В., Геометрическая форма и оптические свойства цепных макромолекул в растворе.// ДАН СССР, 1954,47(4), 647−650
  181. Frisman E.V., Tsvetkov V.N., The effects of shape in streaming birefrigence of polymer solutions.//J. Polym. Sci., 1958,30(121), 297−314
  182. Peterlin A., Viscosity and streaming birefrigence in the non-linear concentration range of macromolecular solutions.// J. Polym. Sci., 1954, 12, 45−51
  183. Э.В., Сибилева M.A., Красноперова A.B., Гидродинамические и оптические свойства растворов полимеров в области больших концентраций.//Высокомол. соед., 1959, 1(4), 597−606
  184. В.Н., Жесткоцепные полимерные молекулы.// JI-д, Наука, 1986, 380
  185. Э.В., Исследование оптического и гидродинамического поведения макромолекул в растворах синтетических и биологических полимеров.// Докт. дисс., Jl-д, 1964
  186. Э.В., Щагина Л. В., Воробьев В. И., Стеклянный ротационный вискозиметр.//Коллоид, журн., 1965,27(2), 130−134
  187. Shlyakhtenko L.S., Potaman V.N., Sinden R.R., Gall A.A., Lyubchenko Y.L., Structure and dynamics of three- way DNA junctions: atomic force microscopy studies.//Nucleic Acids Res., 2000, 28(18), 3472−3477
  188. Berne B.J., Pecora R., Dynamic Light Scattering With Applications to Chemistry, Biology, and Physics.// Dover Ed., Mineola, New York, 2000
  189. Seils J., Pecora R., Dynamics of a 2311 Base Pair Superhelical DNA in Dilute and Semidilute Solutions.// Macromolecules, 1995,28,661−673
  190. Stepanek P., Dynamic Light Scattering: Method and Some Applications.// Ed. by W. Brown, Oxford: Clarendron Press, 1993
  191. П., Легран M., Грожан М., Оптический круговой дихроизм.// М., Мир, 1969
  192. Г., Дисперсия оптического вращения и круговой дихроизм в органической химии.// М., Мир, 1970.
  193. Ч., Шиммел П., Биофизическая химия.// М., Мир, 2,1984
  194. А.С., Спектрофотометрическое определение суммарного количества нуклеиновых кислот. // Биохимия, 1958, 23(5), 656−662
  195. Lyubchenko Y.L., Shlyakhtenko L.S., Potaman V.N., Sinden R.R., Global and Local DNA Structure and Dynamics. Single molecule studies with AFM.// Microscopy and Microanalysis, 2002, 8,170−171
  196. Prestayko A.W., Crooke S.T., Carter S., Cisplatin: Current Status and New Development.// K. N. Y.: Acad. Press., 1980, 527
  197. Tulub A.A., Stefanov V.E., Cisplatin stops tubulin assembly into microtubules. A new insight into the mechanism of antitumor activity of platinum complexes.// Int. J. of Biol. Macromol., 2001,28, 191−198
  198. Kartalou M., Essigmann J.M., Recognition of cisplatin adducts by cellular proteins.// Molecular Mechanisms of Mutagenesis, 2001,478,1−21
  199. H.A., Фрисман, Э.В., Валуева C.B., Сморыго Н. А., Дьяченко С. А., Исследование взаимодействия молекулы ДНК с координационными соединениями двухвалентной платины I. Взаимодействие цис-ДДП с молекулой ДНК.//Молек. биол., 1995,29,345
  200. Horacek P., Drobnick J. Interaction of cis-dichlorodiammineplatinum (II) with DNA.//Biochem. Biophys. Acta., 1971,254,341
  201. Н.А., Сэльман Х.С.Г., Уверский В. Н., Фрисман Э. В., Исследование влияния ионов магния и марганца на конформацию молекулы ДНК в растворе.// Молек. биол., 1987,20,140−146
  202. Kasyanenko N.A., Zanina A.V., Simonenkov A.A., Defrenne S., Nazarova O.V., Panarin E.F., Study of the DNA Packing Caused by Charged Compounds of Different Nature in solution.// Macromol. Symp., 1998,136,25−31
  203. M.O., Яминский И. В., Нуклеиновые кислоты.// Сканирующая зондовая микроскопия биополимеров, Под ред. Яминского И. В., М.: Научный мир, 1997,25
  204. Iwamoto М., Mukundan S.Jr., Marzilli L.G.// J. Am. Chem. Soc., 1994, 116, 6238
  205. Chao C.C., Huang S.L., Lee L.Y., Lin-Chao S., Identification of inducible damage-recognition proteins that are overexpressed in HeLa cells resistant to cis-diamminedichloroplatinum (II).// Biochem. J., 1991, 277, 875−878
  206. Calsou P., Frit P., Salles В., Repair synthesis by human cell extracts in cisplatin-damaged DNA is preferentially determined by minor adducts.// Nucleic Acids Res. 1992,20(23), 6363−6368
  207. Chu G., Cellular responses to cisplatin. //J. Biol. Chem., 1994, 269, 787−790
  208. Herman F., Kozelka J., Stoven V., Guittet E., Girault J.P., Huynh-Dinh Т., Igolen J., Lallemand J.Y., Chottard J.C., A d (GpG)-Platinated Decanucleotide Duplex Is Kinked An Extended NMR and Molecular Mechanics Study.// Eur. J. Biochem, 1990,194,119−133
  209. Bellon S. F, Coleman J. H, Lippard S. J, DNA unwinding produced by site-specific intrastrand cross-links of the anti-tumor drug cis-diamminedichloroplatinum (II).// Biochem, 1991, 30, 8026−8035
  210. Rampiro J.N.// Biochem. and Biophys. Res. Commun, 1992, 182(1), 201
  211. W. // Kolloid. Z, 1939, 87, 3
  212. Goinga H. T, Pecora R.// Macromol, 1991, 24,6128
  213. Newman J, Tracy J, Pecora R.// Macromol, 1994, 27, 6808
  214. А.И., Преснов М. А., Коновалова A.JL// Успехи химии, 1981, 50, 4, 665−692
  215. М.А., Коновалова A.JL, Горбунова В.А.// Вестн. АН СССР, 1986, № 12,79−89
  216. Harrap K.R.// Cancer Chemotherapy, 1983, 1, 171−217
  217. Keppler В.К.// New J. Chem., 1990,14, 6(7), 389−403
  218. А.И., Яковлев К. И., Алексеева Г. М., Коновалова A.JL, Комплексы платины (И) триаминового типа и их противоопухолевые свойства.// Теор. и экспер. химия, 1991, 3,354−361
  219. К.Б., Стеценко А. И., Сидорик Е.П.// Докл. АН СССР, 1979, 245,2,385−387
  220. А.И., Волченкова И. И., Дмитриева Е.С.// Коорд. химия, 1980, 6(9), 1455−1462
  221. Beck W., Purucker B.U., Girth MM Naturforsch, 1976, 31, 932−945
  222. Mollis S.L., Doran S.L., Amundsen A.R., Stern E.W., Platinum and other metal coordination compounds in cancer chemotherapy.// Proc. Of the 5th Intern. Symp., Padua, Italy, 1987, 538−554
  223. Passini A., Zinino F.// Angew. Chem., 1987, 99, 632−641
  224. Drobnick J., Platinum and other metal coordination compounds in cancer chemotherapy,.//Proc. Of the 5th Intern. Symp., Padua, Italy, 1987,62−66
  225. E.B., Николин В. П., Матвиенко M.A.// Докл. АН СССР, 1982, 265(1), 225−228
  226. В.Б., Быстрова Е. М., Ларина Л.П.// Изв. АН СССР, Сер. биол., 1988,5,746−751
  227. Hollis S.L., Amundsen A.R., Stern E.W., Platinum triamine antitumour agents.// Eur. Pat. Bull., 1986,44
  228. К.И., Стеценко А. И., Алексеева Г. М., Имсырова А. Ф., Коновалова A.JL, Камалетдинов Н. С., Глазкова Т. Ю., Новый тип противоопухолевых комплексов платины (2+).// Хим-фарм. журнал, 1991,4,48−50
  229. Коновалова A. J1Яковлев К.И., Стеценко А. И., Рожкова Н. Д., Герасимова Г. К., Иванова Т. И., Камалетдинов Н. С., Синдицкий В. П., противоопухолевая активность биядерных катионных комплексов платины (II).//Хим-фарм. журнал, 1994, 1, 17−20
  230. Rosenberg В., Some biological effects of platinum compounds. New agents for the control of tumoure.// Plat. Met. Rev., 1971, 15,42−51
  231. Lippard S.J., Chemistry and molecular biology of platinum anticancer drugs.// Pure and Appl. Chem., 1987, 59, 731−742
  232. H.A., Айа Э.Э.Ф., Богданов A.A., Космотынская Ю. В., Яковлев К. И., Сравнение комплексообразования ДНК с противоопухолевым препаратом цис-ДДП и биядерным соединением двухвалентной платины, содержащим пиразин.//Молек. биол., 2002, 36(4), 1−8
  233. Courtois Y., Fromageot P., Gushlbauer W., Protonated polynucleotide structures. III. An optic rotatory dispersion study of the protonation of DNA.// Eur. J. Biochem., 1968, 6,493−501
  234. H.A., Бартошевич С. Ф., Фрисман Э. В., Исследование влияния рН среды на конформацию молекулы ДНК.// Молек. биол., 1985, 19, 13 861 393
  235. Reinert К.Е., Aspects of specific DNA protein interaction- local bending of DNA molecules by in — register binding of the oligopeptide antibiotic distamycin.//Biophys. Chem., 1981, 13,1−14
  236. Kasyanenko N., Arikainen N., Frisman E., Investigation of DNA complexes with iron ions in solution.//Biophys. Chem., 1998, 70, 93−100
  237. Kasyanenko N.A., Zanina A.V., Nazarova O.V., Panarin E. F., DNA interaction with complex ions in solution.// Langmuir, 1999, 15, 7912−7917
  238. Seeman N.C., Kallenbach N.R., DNA branched junctions.//Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 1994, 23, 53−86
Заполнить форму текущей работой