Применение биологических днк-микрочипов в этиологической верификации острых кишечных инфекций бактериальной природы
Диссертация
В последние десятилетия в диагностике инфекционных болезней, как и в других областях медицины все более широко применяется метод полимеразной цепнойреакции (ПЦР). В отечественной литературе уже имеется ряд сообщений о преимуществе метода полимеразной цепной реакции в этиологической расшифровке ОКИ, в частности, вирусных диарей. Особенно перспективными в диагностике ОКИ являются методы, основанные… Читать ещё >
Список литературы
- Алиева Е.В., Афанасьев Е. Н., Тюменцева И. С. Новое в диагностике кампилобактериоза и листериоза. // Вестник Российской военно-медицинской академии. — СПб. — 2006. — Приложение 1(15). — С.221
- Барский В., Колчинский А., Лысов Ю., Мирзабеков А. Биологические микрочипы, содержащие иммобилизованные в гидрогеле нуклеиновые кислоты, белки и другие соединения: свойства и приложения в геномике //Мол. биол.- 2002. Т. 36. — С.563−584.
- Бондаренко В. М. Факторы патогенности бактерий и их роль в развитии инфекционного процесса. // Журн. микробиол.- 1999. № 5.-С.34−39
- Бондаренко В. М. «Острова» патогенности бактерий. // Журн. микробиол, — 2001, — № 4. С.67−74
- Бондаренко В. М. Дисбактериоз кишечника как клинико-лабораторный синдром: современное состояние проблемы // В. М. Бондаренко, Т. В. Мацулевич. — М.: ГОЭТАР-Медиа, — 2006. С.304
- Бродов Л.Е., Ющук Н. Д., Малеев В. В. Диагностика и лечение острых кишечных инфекций. // Эпидемиология и инфекционные болезни. — 1997.- № 4. С.4−6.
- Воробьев А.А., Сичинский Л. А., Дратвин С. А. Возможности лабораторной диагностики инфекций, вызванных бактериями рода Campylobacter. // Журнал микробиологии и эпидемиологии.- 2000.-№ 1.- С.95−103
- Герасимов А.Н. Медицинская статистика: Учебное пособие. М.: ООО «Медицинское информационное агенство». — 2007.- 480 с.
- Ю.Грядунов Д., Михайлович В., Носков А., Лапа С., Соболев А., Паньков С., Рубина А., Заседателев А., Мирзабеков А. // Обнаружение Bacillus Anthracis методом мультиплексной ПЦР на олигонуклеотидных биочипах. Докл. Акад. Наук. 2001.- Т. 381. — № 2.- С. 265.
- П.Гюлазян Н. М., Белая О. Ф., Малов В. А., Пак С. Г. Клинические и диагностические особенности смешанных острых кишечных инфекций //Международный Евро-Азиатский конгресс по инфекционным болезням. Витебск, Беларусь.- 5−6 июня.- 2008.- С. 130.
- Екимов А.Н., Шипулин Г. А., Бочкарев Е. Г., Рюмин Д. В. Новейшие технологии в генодиагностике: полимеразная цепная реакция в реальном времени (Real- time PCR). //Вестник последипломного медицинского образования. -2001.- № 3.- С.4−8
- Жеребцова Н.Ю., Валишин Д. А., Мавзютов А. Р. Перспектива генетической оценки потенциальной патогенности условно-патогенных энтеробактерий, выделенных при острых кишечных инфекциях. // Клиническая лабораторная диагностика. 2006. — № 9. — С.50−51.
- Ивашкин В.Т., Шептулин А. А., Баранская Е. К., Секачева М. И. Рекомендации по обследованию и лечению больных с синдромом острой диареи. // Методическое пособие для врачей.- Москва.- 2002.-С.17
- Игнатюк Т.Е., Голутвин И. А., Насикан Н. С., Иванова О. Е., Еремеева Т. П. Применение атомно-силовой микроскопии для детекции кишечных вирусов. // Вопросы вирусологии.- № 6. -2003.- С.66−69
- Ильина Е.Н. Актуальные аспекты типирования микробов и вирусов. // Материалы V Всероссийской научно практической конференции «Генодиагностика инфекционных болезней», — Москва.- 2004.- Том 2.-С.32−33
- Клинико-лабораторная диагностика инфекционных болезней. // Руководство для врачей.- СПб.: Фолиант.- 2001.- С. 273−276.
- Колупаев В.Е. Преимущества метода ПЦР в реальном времени (Real Time PCR). //Сборник тезисов IV Всероссийской научно-практической конференции ««Генодиагностика инфекционных болезней» Москва.-2002.-С. 182−185
- Кэрри Б. Мюллис. Необычная история о том, как родилась полимеразная цепная реакция. //В мире науки (Scientific American) Июнь № 6.-1990- Ст.Петербург.- 2006
- Лобзин Ю. В. Дисбактериоз кишечника (клиника, диагностика, лечение): руководство для врачей / Ю. В. Лобзин, В. Г. Макарова, Е. Р. Корвякова, С. М. Захаренко. — СПб.: ООО «Издательство ФОЛИАНТ».- 2006.- 256с.
- Лучшев В.И., Шахмарданов М. З., Корнилова И. И. и соавт. Шигеллёз Флекснера (клиника, диагностика, лечение). // Методические рекомендации.- Москва.- 2000.-22с.
- Мавзютов А.Р., Фиалкина С. В., Бондаренко В. М. «Острова» патогенности условно-патогенных энтеробактерий //Журн. микробиол.-2002.- № 6.- С.5−9.
- Малов В. А. Горобченко А. Н., Дмитриева Л. Н. Острые инфекционные диарейные заболевания: вопросы терапии // Лечащий врач.- 2007.- № 5.-С.67−72.
- Медицинские лабораторные технологии // под ред. А. И. Карпищенко.-СПб.: Интермедика.- 2002, — Т.2.- 600 с.
- Милютина Л.Н., Гурьева О. В., Рожнова С. Ш. Эволюция лекарственной резистентности Salmonella enteritidis, выделенных от детей. //Эпидемиол. и инфекц. Болезни.- 2008.- № 2.- С.44−47.
- Мирзабеков А.Д. Биочипы в биологии и медицине. //Вестник Российской Академии наук. 2003.- Т.73.- № 5.- С.412
- Мирзабеков А.Д. с соавт.- 2004.- Патент РФ № 2 175 972.
- Михайлович В.М., Наседкина Т. В., Рубина А. Ю., Чечеткин В. Р., Прокопенко Д. В. Заседателев А.С. Биочипы для медицинской диагностики. // Лабораторная диагностика России 2007/2008: Справочник. С-Пб.:Человек.- 2007.- с.43−46
- Молекулярная клиническая диагностика. //Методы: пер. с англ. под ред. С. Херрингтона и<�Дж. Макги. -М.: Мир.- 1999.-558с.
- Пак С. Г. Инфекционные болезни: взгляд через призму времени (Актовая речь). М.: Издание ГОУ ВПО ММА им. И. М. Сеченова.-2005. -44 с.
- Пак С.Г., Пальцев М. А., Турьянов М. Х. Сальмонеллёз. М.: Медицина.- 1986.- 304 с.
- Пальцев М.А. Фундаментальные науки и развитие молекулярной медицины. // Молекулярная медицина.- 2003.- № 1.- С.4−11
- Письмо департамента Государственного Санитарно-Эпидемиологического Надзора от 16 апреля 2004 г. N 1100/1067−04−113 «О мерах по совершенствованию эпиднадзора за кампилобактериозами».
- Письмо Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав ¦ потребителей и благополучия человека от 18 июня 2008 года № 01/63 558−32 «Об улучшении эпидемиологического надзора за сальмонеллезами в Российской Федерации».
- Подколзин А.Т., Мухина А. А. Шипулин Г. А., Кузьмина В. Н. и соавт. Изучение этиологии острых кишечных инфекций у детей, госпитализированных в инфекционные отделения стационаров Москвы. // Инфекционные болезни.- 2004.- Том 2.- № 4.- С. 85−91.
- Подколзин А.Т., Мухина А. А., Шипулин Г. А., Малеев В. В. Калицивирусная инфекция. //Инфекционные болезни, — 2004.- Т.2.- № 2.-С.64−73
- Подколзин А. Т., Фенске Е. Б., Абрамычева Н. Ю., Шипулин Г. А. и др. Сезонность и возрастная структура заболеваемости острымикишечными инфекциями на территории РФ //Терапевтический архив. -2007. -№ 11. -С. 10−16
- Поздеев O.K. Медицинская микробиология. // Под редакцией В. М. Покровского. -2 изд., испр, — М.: ГОЭТАР-МЕД.-2004.- 768 с.
- Поздеев O.K., Федоров Р. В. Энтеробактерии: руководство для врачей. // М.: ГЭОТАР -Медиа- 2007.- 720 с.
- Покровский В.И., Онищенко Г. Г., Черкасский Б. Л. Эволюция инфекционных болезней в России в XX веке. //М.: Медицина.- 2003.-664с.
- Покровский В.И., Ющук Н. Д. Бактериальная дизентерия. М.: ' Медицина.- 1994.- 256 с.
- Сапронов Г., Трякина И. Энтеровирусные инфекции. //Мед. газ. 2007. -№ 49. — С. 8−9.
- Северин Е.С., Пальцев М. А. История и современное состояние молекулярной диагностики. //Молекулярная медицина.- 2006.- № 4.-С.13−25
- Сергевнин В.И. Этиологическая структура и экологическая классификация острых кишечных инфекций // Эпидемиология* и инфекционные болезни. 1997. — № 6. — С.8−9.
- Сидоренко С.В. Микроорганизмы семейства Enterobacteriaceae: клиническое значение и этиотропная терапия. Consilium Medicum.-2004.- Том.6.- № 1.-С.78−80
- Туркадзе К.А. Значение определения генов инвазивности, шигоподобных и энтеротоксинов методом ПЦР для клиники идиагностики острой дизентерии. //Автореф., дисс. канд. мед. н. М.-2003.
- Шляпникова Е.А., Шляпников Ю. М., Грановский И. Э., Афанасьева, Г.В., Гаврюшкин А. В., Белецкий И. П. Биологические микрочипы в медицине. Лабораторная диагностика России 2007/2008: Ежегодный справочник. //СпБ.: Человек.-2007, — С.43−46
- Шувалова Е.П. Ошибки в диагностике инфекционных болезней: Монография. Изд. 4-е, перераб., доп. //М.: Медицина.- 2001.- С. 27.
- Шувалова Е.П., Беляева Т. В., Осипова Г. И. Клиника, диагностика и терапия дизентерии. //Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии.-1997.- № 5.- С.60−66.
- Эллиот В. Биохимия и молекулярная биология. Пер. с англ. // М.:
- МАИК «Наука/Интерпериодика». — 2002.- 446с. 69. Эпидемиологический надзор и профилактика энтеровирусной (неполно) инфекции. Методические Указания МУ 3.1.1.2363−08. -Москва.- 2008.
- Ющук Н.Д., Бродов Л. Е. Острые инфекционные диарейные заболевания. // Мед. Газета.- 2000.- № 31
- Ющук Н.Д., Маев И. В., Гуревич К. Г., Бродов Л. Е. Современные принципы лечения диареи. //Тер. архив. 2002. — № 2. — С.73−78.
- Ющук Н.Д., Шестакова И. В. Проблемы лабораторной диагностики иерсиниозов и пути их решения. // Журн. микробиол.-2007.- № 3.- С. 61 -66.
- Abu-Elyazeed R., Wierzba T.F., Frenk R.W. Epidemiology of Shigella-associated diarrhea in rural Egiptian Children. //Am. J. Trop. Med. Hyg.-71(3).- 2004.- P. 367−372
- Adekunle O.C., Coker A.O., Kolawole D.O. Incidence, isolation and characterization of Campylobacter species in Osogbo, Nigeria. // Biology and Medicine.-2009.- Vol. 1 (l).-P. 24−27.
- Alizadeh A.A., Eisen M.B., Davis RE, Ma C, Lossos IS. Distinct types of diffuse large B-cell lymphoma identified by gene expression profiling. //Nature .-2000.- 403.- P.503−511
- Alios В. M. Campylobacter jejuni infections: update on emerging issues and trends. //Clin. Infect. Dis. -2001, — Vol.32.-No.8.-P.1201−6
- Altekruse S.F., Stern N.J., Fields P.I., Swerdlow D.L. Campylobacter jejuni— An emerging foodborne pathogen. //Emerging Infectious Diseases.-1999.-Vol.5-No.l.-P.28−35
- Ansaruzzaman M., Bhuiyan N.A., Begum Y.A., Characterization of enterotoxigenic Escherichia coli from diarrhoeal patients in Bangladesh' using phenotyping and genetic profiling. //Journal of Medical Microbiology.- 2007.-Vol.56.-P.217−222
- Aranda K.R., Fagundes-Neto U., Scaletsky I.C. Evaluation of multiplex PCRs for diagnosis of infection with diarreagenic Escherichia coli and Shigella spp. // J Clin Microbiol.- 2004.- Dec.- Vol.42.-No.l2.-P.5849−53
- Archacki S., Wang Q. // Expression profiling of cardiovascular disease. Hum Genomics.- 2004.-Vol.l.- No.5.- P. 355−370.
- Arnheim N., Erlich H. Polymerase chain reaction strategy // Annu. Rev. Biochem.- 1992.-Vol. 61.-P. 131−156
- Barsky Ya., Grammatin A., Ivanov A., Kreindlin E., Kotova E., Barskii V., Mirzabekov A. // Wide-field luminescence microscopes for analyzing biological microchips. J. Opt. Technol. -1998. -V.65. -No.ll.- P. 938.
- Bavykin S.G., Akowski J.P., Zakhariev V.M., Barsky V.E., Mirzahekov A.D. Microbial identification: A portable system for sample preparation and oligonucleotide microarray hybridization // Appl. & Environ. Microbiology. 1997.- Vol. 67.- P. 922−928.
- Berg R.D. The indigenous gastrointestinal microflora. //Biochem. Pharmacol.-1996.- Jun 15, — Vol. 47.-No.-12.- P.2294−2297.
- Blanchard A.P., Kaiser R.J., Hood L.E. High density oligonucleotide arrays. // Biosensors & Bioelectronics.- 1996.-No.l l.-P. 687−690.
- Blanton LH, Adams SM, Beard RS, et al. Molecular and epidemiologic trends of caliciviruses associated with outbreaks of acute gastroenteritis in the United States, 2000−2004. //J. Infect. Dis.- 2006.-Vol.193.-No3.- P.413−421.
- Bosch A. Human enteric viruses in the water environment: a minireview. //Internal Microbiol.- 1998, — Vol.l.-P. 191−196
- Bounnanh P., Sithivong N. et al. Pathogenesity of Shigella in healthy carriers: a study in Vientiane, Lao People’s Democratic Republic. //Jpn. J. Infect. Dis.-2005.- Vol.58.- P. 232−234
- CDC. FoodNet Surveillance Report for 2004 (Final Report). P.7−15
- CDC. Turtle-associated salmonellosis in humans—United States, 20 062 007. MMWR Morb Mortal Wkly Rep.- 2007.-Vol.56.-No.26.-P.649−652.
- Centers for Disease Control and Prevention. Diagnosis and Management of Foodborne Illnesses: a Primer for Physicians. // MMWR -2001.-Vol.50.-No. RR-2.- P.4
- Cho S.-H., Kim J.-H., Kim J.-C. Surveillance of Bacterial Pathogens Associated with Acute Diarrheal Disease in the Republic of Korea During One Year, 2003. // The Journal of Microbiology.-2006.- Vol.44.-No.3.-P:327−335.
- Choudary P.V., Molnar M., Evans S.J. et al. Altered cortical glutamatergic and GABAergic signal transmission with glial involvement in depression. //Proc Natl Acad Sci USA.- 2005.-Vol.102.- No.43.- P. 15 653−58.
- Clarke S.C. Diarrhoeagenic Escherichia coli: an emerging problem? Diagn. Micrbiol.Infect. Dis.-2001.-Vol.41- P.93−98
- Clarke P.A., te Poele R., Wooster R., Workman P. //Gene expression microarray analysis in cancer biology, pharmacology and drug development: progress and potential. Biochem. Pharmacol.- 2001.- Vol. 62.- No. 10.- P. 1311
- Coker A.O., Isokpehi R.D., Thomas B.N., Amisu K.O. et al. Human campylobacteriosis in developing countries Synopsis- Statistical Data Included. //Emerging Infectious Diseases.-2002.-Vol.8.-No.3.- P.237−243
- Cornells G.R. Yersinia enterocolitica, a very sophisticated pathogen in our everyday life. // Resent Advances in the Pathogen, of Gastrointestinal Bacterial. Infect./ Eds. P. Rampal, P. Boquet / Paris.- John Libbey Eurotext-1998.- P. 97−109
- Departement of Preventive Medicine and Field Epidemiology Training Program. Salmonella Food Poisoning Outbreak in Riyadh, Saudi Arabia 2001. //Saudi Epidemiology Bullet~n.- 2002.-Vol. 9.- No 1.
- Diniz-Santos D.R., Santana J.S., Barretto J. R. et al. Epidemiological and microbiological aspects of acute bacterial diarrhea in children from Salvador, Bahia, Brazil.- The Brazilian Journal of Infectious Diseases.- 2005.-Vol.9.-No. 1.- P.77−83
- Doane F.W., Electron microscopy for detection of gastroenteritis viruses. In A.Z. Kapikian (ed.).Viral infection of the gastrointestinal tract, 2nd ed. Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y.-1994.-P. 101−130
- Dolin R. Noroviruses- challenges to control. //The New England Journal ofMedecine.-2007.-Vol.357.- Noll.- P.1072−1073
- Eastwood K., Schuster H., Gascoyne-Binzi D. Comparison of realtime PCR and direct culture for the detection of Campylobacter spp. from human faecal samples. // 17th European Congress of Clinical ICC. 2007.-Germany.- 31 Mar — 04 Apr.
- Eisen, M. В. & Brown, Р. О. DNA arrays for analysis of gene expression.//Methods Enzymol.- 1999.-Vol.303.-P. 179−205
- Ekins R.P. An overview of present and future ultrasensitive nonisotopic immunoassay development. // Clin. Biochem. Revs.- -1987.-Vol.8.-P. 12−22.
- Elnifro E.M., Ashshi A.M., Cooper R.J., Klapper P.E. Multiplex PCR: optimization and application in diagnostic virology. // Clin Microbiol Rev-2000.-Vol. 13.- No.4.- P.559−570
- Falk P.G., Hooper L.V., Midtvedt Т., Gordon J.I. Creating and maintaining the gastrointestinal ecosystem: what we know and need to know from gnotobiology // Microbiol. Molec. Biol. Rev.- 1998.-Vol.62.-No.4-P.l 157−1170.
- Favre-Bonte S., Darfeuille-Michaud A., Forestier C. Aggregative adherence of Klebsiella pneumoniae to human intestine-407 cells. // Infect, and Immun.- 1995.-Vol.63 .-No.4.-P. 1318−1328
- Fernandez-Delgado M., Contreras M., Carcia-Amado M. et al. Occurrence of Proteus mirabilis associated with two species of Venezuelan oysters. //Rev. Inst. Med. trop. S. Paulo.-2007.- Vol.49.-No.6.- P. 355−359
- Fong T.T., Lipp E.K. Enteric Viruses of humans and animals in aquatic environments: health risks, detection, and potential water quality assessment tools. // Microbilolgy and Molecular Biology Reviews.-2005.-Vol.69.- No.2.- P.357−371.
- Friedman C.R., Neimann J., Wegener H.C., Tauxe R. V Campylobacter.il in: I. Nachamkin, M.J. Blaser (Eds.), ASM Press, Washington DC.- 2000.- P. 121−138.
- Galanis E. Campylobacter and bacterial gastroenteritis. //CMAJ-JAMC.-2007.- Vol.177.- No.6.- P.570−571
- Garcia L.S., Garcia J.P. Detection of Giardia lamblia antigens in human fecal specimens by a solid-phase qualitative immunochromatographic assay. IIJ. Clin. Microbiol. -2006.-Vol.44.- P. 4587−4588
- Gerhold D.L., Jensen R.V., Gullans S.R. Better therapeutics through microarrays. //Nature Genetics.- 2002.- Vol. 32.- Supplement.- P. 547.
- Gerold D., Rushmore Т., Caskey C.T. DNA chips: promising toys have become powerful tools // Trends. Biochem. Sci.- 1999.- Vol. 24.- P. 168−173.
- Gill C.J., Joseph L., Gorbach S. L. and Hamer D. H. Diagnostic accuracy of stool assays for inflammatory bacterial gastroenteritis in developed and resource-poor countries.// Clin. Infectious Diseas.- 2003.-Vol. 37.- P.365−75
- Golub T. R. et al. Molecular classification of cancer: class discovery and class prediction by gene expression monitoring. Science .-1999.-Vol.286.-P:531−537.
- Gonzalez SF, Krug MJ, Nielsen ME, Santos Y, Call DR: Simultaneous detection of marine fish pathogens by using multiplex PCR and a DNA microarray. //J Clin Microbiol.- 2004.-Vol.42.-No.4.- P.1414−1419
- Guerrant R.L., Gilder T.V., Steiner T.S., Thielman N.M., Slutsker L. et al. Practice guidelines for the management of infectious diarrhea.// Clin. Infect. Dis.- 2001.- Vol.32.-P.331−50
- Guerrant R.L., M. Kosek A.A. Lima B. Lomtz and H.L. Guyatt. Updating the DALYs for diarrhoeal disease. Trends Parasitol.- 2002.-Vol.18.-P. 191−193.
- Guschin D., Mobarry В., Proudnikov D. et al. Oligonucleotide microchips as genosensors for determinative and environmental studies in microbiology // Applied and Environmental Microbiology.- 1997.- Vol. 63.- P. 2397−2402.
- Haque R. Human intestinal parasites. // Journal of Health, Population and Nutrition. -2007.-Vol. 25.- No. 4, — P.387−391
- Haque R., Huston Ch. D., M.D. et al. Amebiasis. //The New England Journal of Medecine.-2007.-Vol.348.- No.16.- P. 1565−1573
- Haque R, Roy S., Siddique A., Mondal U., Rahman S.M., Mondal D. et al. Multiplex real-time PCR assay for detection of Entamoeba histolytica,
- Giardia intestinalis, and Cryptospordium spp. // Am J Trop Med Hyg -2007.-Vol.76.-P.713−717.
- Hauser M.A., Li Y.J., Xu H., Noureddine M.A., Shao Y.S. et al. Expression profiling of substantia nigra in Parkinson disease, progressive supranuclear palsy, and frontotemporal dementia with parkinsonism. Arch Neurol.- 2005.- Vol.62.-No.6.-P. 917−921.
- Higuchi R. Kinetic PCR analysis: Real time monitoring of DNA amplification reactions. // Biotechnology. — 1993.- No. l 1.- P. 1026−1030
- Hill Gaston J.S., Lillicrap M. Arthritis associated with enteric infection. //Best Practice & Research Clinical Rheumatology.- 2003. -Vol. 17.-No. 2.-P. 219−239
- Jaaskelainen A.J., Piiparinen H., Lappalainen M., Koskiniemi M., Vaheri A. // Multiplex-PCR and oligonucleotide microarray for detection of eight different herpesviruses from clinical specimens. //J Clin Virol.- 2006.-Vol.37.-No.2.- P.83−90.
- James P. Nataro and James B. Kaper. Diarrheagenic Escherichia coli. //Clin. Microbiol. Rev.- 1998.-Vol.ll.- P.142−201.
- Kartalija M, Sande MA. Diarrhea and AIDS in the era of highly active antiretroviral therapy. //Clin Infect Dis.- 1999.- Vol.28.-P.701−7.
- Khrapko K., Lysov Yu., Khorlin A. et al. An oligonucleotide hybridization approach to DNA sequencing // FEBS Letters.- 1989.- Vol. 256.-P. 118−122.
- Kongmuang U., Luk J.M., Lindberg A.A. Comparisom of three stool-processing methods for detection of Salmonella serogroups В, C2, and D by PCR. //-J. Clin. Microbiol.- 1994.- Vol. 32.- P.3072−3074.
- Kosek M, Bern С, Guerrant RL. The global burden of diarrhoeal disease, as estimated from studies published between 1992 and 2000. //Bull World Health Organ 2003.-Vol.8l.-No3.- P. 197−204
- Kovats RS, Edwards SJ, Charron D. Climate variability and Campylobacter infection: an international study. //Int J Biometeorol.- 2005.-Vol.49.-No.4.-P.207−14.
- LaGier M.J., Joseph L.A., Passaretti T.V., Musser K.A., Cirino N.M. A real-time multiplexed PCR assay for rapid detection and differentiation of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli. И Mol Cel Probes.- 2004.-Vol.l8.-No.4.- P.275−82
- Lan R., Lumb В., Ryan D. at al. Molecular evolution of large virulence plasmid in Shigella colones and Enteroinvasive Escherichia coli. II Infect. Immun. 2001.-Vol.69.- P.6303−6309.
- Lapa S., Mikheev M., Shchelkunov S., Mikhailovich V., Sobolev A., Blinov et al. Species-level identification of orthopoxviruses with an oligonucleotide microchip. //J. Clin. Microbiol.- 2002.- Vol. 40. No.3. P. 753.
- Leushner J., Kelly M. Detection of pathogenic enteric bacteria in stool by multiplex PCR. // Qiagennews. 2000.- No.4.- P.21
- Liu R., Wang X., Chen G.Y., Dalerba P. et al. //The prognostic role of a gene signature from tumorigenic breast-cancer cells. N Engl J Med.- 2007.-Vol.356.- No.3.-P.217−226.
- Lockhart D.J., Winzeler E.A. Genomics: gene expression and DNA arrays. //Nature. -2000. -Vol. 405(6788). P. 827.
- Louie M., Louie L., Simor A. E. The role of DNA amplification technology in the diagnosis of infectious diseases. // CMAJ (Canadian Medical Association Journal) — 2000.- Vol. 163.-No.3.-P. 301−309
- Mahadevappa M., Janet A. Warrington. Microarrays- optimizacion and application to cancer discovery. // QIAGEN news. — 2000.- № 4.-P:3−6
- Mandell G.L., Bennett J. E, Dolin R. Douglas and Bennett’s principles and practice of infectious diseases. 6th edn. Pennsylvania: Elsevier, Churchill Livingstone, 2005.-2006.-Vol. 17.- No. 1.-P. 11−17
- Marshall, M. M., Naumovitz, Y. Ortega, C. R. Sterling. Waterborne protozoan pathogens. Clin. Microbiol. Rev. -1997-. Vol. l0.-P.67−85
- Michael J., Sharon L. New Gram-negative enteropathogens: fact or fancy? //Rev. Med. Microb.-2006.-Vol.l7.-No.l.-P.27−37
- Moor J.E., Corcoran D., Dooley J.S.G. et al. Campylobacter. Vet. Res. -2005.-Vol.36.- P. 351−382
- Nachamkin I. Chronic effects of Campylobacter infection.// Microbes and Infection.-Vol. 4.-2002.-P. 399103
- Nanni L., Romualdi C., Maseri A., Lanfranchi G. Differential gene expression profiling in genetic and multifactorial cardiovascular diseases. //J Mol Cell Cardiol.- 2006.-Vol.41.-No.6.- P. 934−48.
- Ng C.T., Gilchrist C.A., Lane A., Roy S., Haque R., Houpt E.R. Multiplex real-time PCR assay using Scorpion probes and DNA capture for genotype-specific detection of Giardia lamblia on fecal samples. //J Clin Microbiol.- 2005.- Vol.43.-P. 1256−60
- Oberhelman RA, Taylor DN. Campylobacter infections in developing countries. In: Nachamkin I, Blaser MJ, editors. Campylobacter, 2nd edition. Washington: American Society for Microbiology.-2000.- P.139−53.
- Ochs M.F., Godvin A.K. // Microarrays in cancer: research and applications. BioTechniques. -Vol. 34.- Supplement. -P. 17−21.
- Okamoto Т., Suzuki Т., Yamamoto N. // Microarray fabrication with covalent attachment of DNA using Bubble Jet technology. Nature Biotechnology. -2000. -V.18. No4.- P.438.
- Pachiadakis I., Karavassilis V., Vasdeki A. at al. Direct detection of Salmonella spp. in faecal specimens by real-time PCR assay. // 16th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, France. 2006,-April 1−4
- Parashar U.D., Bresee J.S., Gentsh J.R., Glass R.I. Rotavirus. //Emergihg Infect. Dis.-1998.-Vol.4.-No. 4.- P.561−570
- Pemov A., Modi H., Chandler D.P., Bavykin S. DNA analysis with multiplex microarray-enhanced PCR. Nucleic Acids Res. 2005.-Vol. 33.-No.2.- P. 1−9
- Peterson MC. Clinical aspects of Campylobacter jejuni infections in adults. //Wes J Med.- 1994.-Vol.l61.-P.148−52.
- Person S., Olsen K.E.P. Multiplex PCR for identification of Campylobacter coli and Campylobacter jenini from pure culture and directly on stool samples. Journal of Medical Microbiology.-2005.-Vol.54.- P. 10 431 047
- Preliminary FoodNet data on the incidence of foodborne illnesses ~ selected sites, United States, 2002. //MMWR Morb Mortal Wkly Rep .-2003.-52.-P.340−343.
- Public Health Labortory Services (PHLS). Gastrointestinal infections. PHLS. //1998 Annual review of communicable diseases. London: PHLS publications.- 2000.- P. 79−88.
- Pupo G.M., Karaolis D.K., Lan R., et al. Evolutionary relationships among pathogenic and nonpathogenic Escherichia coli strains inferred from multilocus enzyme electrophoresis and mdh sequence studies. // Infect. Immun.- 1997- Vol.65.- P.2685−2692
- Quackenbush J. // Microarray analysis and tumor classification. N. Eng. J. Med.-2006. -V. 354.- № 23.- P. 2463.
- Roy S., Kabir M., Mondal D., Ali I.K., Petri W.A., Jr., Haque R. Real-time-PCR assay for diagnosis of Entamoeba histolytica infection. //J Clin Micrbiol.- 2005.- Vol.43.-P.2168−72.
- Sair A.I., D’Souza D.H., Jaykus L.A. Human Enteric Viruses as Causes of Foodborne Disease. //Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety.-2002.-Vol.l.- P.73−89
- Samal S.K., Khunitia H.K., Nanda P.K. et al. Incidence of bacterial Enteropathogens among hospitalized diarrhea patients from Orissa, India. // Jpn. J. Infect. Dis.-2008.-Vol.61.- P.350−355
- Selvapandiyan A, Stabler K, Ansari NA et al. A novel semi-quantitative fluorescence-based multiplex PCR assay for rapid simultaneous detection of bacterial and parasitic pathogens from blood. //J Mol Diagn.- 2005.-Vol.7.No.2.- P.268−275
- Sen K, Asher D. M Multiplex PCR for detection of Enterobacteriaceae in blood. //Transfusion.- 2001.-Vol.41.-No. 11.-P. 13 56−1364
- Slonim D.K. // From patterns to pathways: gene expression data analysis comes of age. Nature Genetics. -2002.-Vol. 32. -Supplement.- P. 502.
- Sopwith W., Birtles A., Matthews M., Fox A. Campylobacter jejuni Multilocus Sequence Types in Humans, Northwest England, 2003−2004.-Emerging Infectious Diseases.-2006.-Vol.l2.-No.l0.-P.1500−1507
- Spencer K.L., Soave R., Acosta A., Gellin B. et al. Cryptosporidiosis in HIV-infected Persons: Prevalence in a New York City Population. // International Journal of Infectious Diseases.- 1997.-Vol. l.-No. 4.-217−221
- Stears R.L., Martinsky Т., Schena M. // Trends in microarray analysis. Nature Medicine. -2003. -Vol. 9. No.l.- P. 140.
- Stoughton R.B. // Applications of DNA microarrays in biology. Annu. Rev. Biochem.-2005. -Vol. 74.- P. 53.
- Takahashi M., Koga M., Yokoyama K., Yuki N. Epidemiology of Campylobacter jejuni isolated from patients with Guillain-Barre' and Fisher syndromes in Japan // Journ. of Clin. Microb.- 2005.-Vol.43.-No.l.- P.335−339
- Tam С. С., Rodrigues L. С. and O’Brien S. J. Guillain-Barre' syndrome associated with Campylobacter jejuni infection in England, 20 002 001. // Clinical Infectious Diseases. -2003.- Vol.37.-P.307−10
- Tauxe R.V. Emerging foodborne pathogens. //Int. J. Food Microbiol.-2002.-Vol.78.- P.31−41.
- The Campylobacter sentinel surveillance scheme collaborators. Ciprofloxacin resistance in Campylobacter jejuni: case-case analysis as a tool for elucidating risks at home and abroad. // J. Antimicrob. Chemother. 2002.-Vol. 50.-P.561−568.
- The Increasing Incidence of Human Campylobacteriosis. Report and Proceedings of a WHO Consultation of Experts Copenhagen, Denmark, 21−251. November 2000- 135
- Thielman N.M., Guerrant R.L. Clinical practice. Acute infectiousdiarrhea. //N Engl J Med.- 2004.-Vol. 350.-P.38−47
- Tillib S., Strizhkov В., Mirzabekov A. Integration of multiple PCR amplification and DNA mutation analyses by using oligonucleotide microchip //Analyt. Biochem.- 2001.-Vol. 292.-P. 155−160.
- Timofeev E., Mirzabekov A. //Immobilization of DNA in polyacrylamide gel for the manifacture of DNA and DNA-oligonucleotide microchips and protein microchips. //Anal.Biochem.- 1998.-2Vol.59.- P. 3441.
- Tomioka K., Peredelchuk M., Zhu Xian. Arena R. //A Multiplex Polymerase chain reaction microarray assay to detect bioterror pathogens in blood. // JMD Journal of molecular diagnostics.- 2005.-Vol. 7.- No. 4.-P.486−494
- Tzipori S, Widmer G. A hundred-year retrospective on cryptosporidiosis. //Trends Parazitol. -2008.- Vol.24.-No4.- P. 184−9
- Voetsch AC, Van Gilder TJ, Angulo FJ, et al. Food-Net estimate of the burden of illness caused by nontyphoidal Salmonella infections in the United States. //Clin Infect Dis.- 2004.- Vol.38.-Suppl 3.-P.S127-S134.
- Wilhelmi, I., E. Roman, and A. Sanchez-Fauquier. Viruses causing gastroenteritis. //Clin. Microbiol. Infect.- 2003.-Vol. 9.-P.247−262
- World Health Statistics 2008. Geneva, World Health Organization, 2008.
- Worley J., Bechtol K., Penn S., Roach D., Hanzel D., Trounstine M., Barker D. A system approach to fabricating and analyzing DNA microarrays. //In: MicroarrayBiochip Technology (ed. Schena M.). Eaton Publ., Natick, MA.- 2000.- P.65−86.
- Yates J. Traveler’s diarrhea. //American Family Physician.-2005.-Vol.71 .-No. 11 .-P.2095−2100
- Yauk C.L., Williams A., Boucher S., Berndt L.M. et al. Novel design and controls for focused DNA microarrays: applications in quality assurance/control and normalization for the Health Canada ToxArray. BMC Genomics.- 2006.-Vol. 7.- P.266.
- Yolken R.H., Lennette D.A., Smith T.F., Waner J.L. Algorithms for detection and identification of viruses. In: Murray P.R., Baron E.J., Pfaller M.A., Tenover F.C., Yolken R.H., editors. //Manual of clinical microbiology. 7thed.-1999.- P.843−846