Применение метода прецизионного измерения сдвигов ЯМР для изучения координационных соединений и ферментов
Диссертация
В заключительных главах (У, 71) изложены результаты метрологических, модельных и реальных биофизических экспериментов, призванных продемонстрировать работоспособность предложенного метода и экспериментальной установки. Достигнутая точность измерения сдвига до ~ 0,0015 Гц при паспортной разрешающей способности спектрометра ^ 0,24 Гц свидетельствует о хороших потенциальных возможностях метода. При… Читать ещё >
Список литературы
- Эмсли Д., Финей Д., Сатклиф J1. Спектроскопия ядерного магнитного резонанса высокого разрешения. T.I. — М.: Мир, 1968, — 630 с.
- Эмсли Д., Финей Д., Сатклиф Л. Спектроскопия ядерного магнитного резонанса высокого разрешения. Т.2. М.: Мир, 1969, — 468 с.
- Dickinson W.C. The time average magnetic field at the nucleus in nuclear magnetic resonance experiments. Phys.Rev., 1951, v.81 N5, p. 717 — 731 .
- Lamb W.E. Internal diamagnetic fields. Phys.Rev., 1941, v.60 N15, p. 817 819 .
- Керрингтон А., Мак-Лечлан Э. Магнитный резонанс и его применение в химии. М.: Мир, 1970, — 448 с.
- Ramsey N.F. Chemical effects in nuclear magnetic resonance and in diamagnetic susceptibility. Phys.Rev., 1952, v.86 N2, p. 243 246 .
- Лундин А.Г., Федин Э. И. Ядерный магнитный резонанс. Основы и применения. Новосибирск: Наука, 1980, 189 с.
- Дорфман Я.Г. Диамагнетизм и химическая связь. М.: Физмат- -гиз, 1961, — 227 с.
- Petrakis L., Sederholm С.Н. Temperature-dependent chemical shifts in the NMR spectra of gases. J.Chem.Phys., 1961, v.35 N4, p. 1174 — 1178 .
- Gutowsky H.S. Isotope effects in high resolution NMR spectroscopy. J.Chem.Phys., 1959, v.31 N6, p. 1683 — 1684 .
- Альтшуллер С.А., Козырев Б. М. Электронный парамагнитный резонанс. М.: Гос.изд.физ.-мат.лит., 1961, — 368 с.
- Dwek R.A. Nuclear magnetic resonance (NMR) in biochemistry.- Oxford, Clarendon Press, 1973, 395 ps .
- Dwek R.A. Nuclear magnetic resonance (NMR) in biochemistry.- Oxford, Clarendon Press, 1973, 395 ps.
- McConnellHH., Robertson R. Isotropic nuclear resonance shifts.- J.Chem.Phys., 1958, v.29 N6, p. 1361 1365. H. Jesson J.P. Theory of isotropic nuclear resonance shifts inoctahedral Co2+ systems. J.Chem.Phys., 1967, v.47 N2, p. 579- 581 .
- Рамзей H. Молекулярные пучки . M.: Издат. иностр. лит., I960, — Ш с.
- Bloembergen N. Comments on «Proton relaxation times in paramagnetic solutions». J.Chem.Phys., 1959, v.27 N2, p. 595- 596 .
- Александров И.В. Теория ЯМР. М.: Наука, 1964, — 208 с.
- Bloembergen N., Morgan L.O. Proton relaxation times in paramagnetic solutions. Effect of electron spin relaxation.- J.Chem.Phys., 1961, v.34 N3, p.842 853 .
- Wuthricht К., Shulman R.G., Wyluda В.J., Gaughey W.C. Proton magnetic resonance studies of porphyrin iron (III) cyanides.- Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 1969, v.62 N3, p. 636 643 .
- Eaton D.R., Josey A.D., Phillips W.D., Benson R.E. Hyperfine contact shifts and density dystributions in some nickel (II) chelates. -Disc.Farad.Soc.(London), 1962, N34, p.77 87 .
- Barry C.D., Glasel J.A., North A. C, T., Williams R.J.P., Xavier A.V. Quantitative determination of mononucleotide conformations in solution using lanthanoide ion shift and relaxation NMR probes. — Nature, 1971, v.232 N5308, p. 236 — 245.
- Barry C.D., Glasel J.A., Dobson C., Williams R.J.P., Xavier A. Lanthanide (III) cations as nuclear magnetic resonance conformation probes: studies on citidine 5'-monophosphate at pH 2.- J.Chem.Sci., Dalton Transactions, 1974, v.16 N6, p. 1765
- Бреслер C.E. Введение в молекулярную биологию. M.-JI.: Наука, 1966, — 513 с.
- Arnold J.Т., Packard М.Е. Variations in absolute chemical shift of nuclear induction signals of hidroxyl groups of methyl alckohol. J.Chem.Phys., 1951, v.19 N12, p. 1608−1609 .
- Кабачник М.И., Федин Э. И., Морозов Jl.JI., Петровский П. В., Вайсберг М. С., Шипов А. Э. Мастрюкова Т.А. Теоретический анализ спектров ЯМР ассоциат-диастереоизомеров. Докл. Акад. Наук СССР, 1974, т.215 вып. б, с. 1400 — 1403 .
- Van-Duijnevelt Р.В., Murrel J.N. Some calculation on the hydrogen bond. J.Chem.Phys., 1967, v.46 N5, p. 1759 — 1767 .
- Гордеев Г. П., Хайдаров Т. Температурная зависимость динамических параметров воды, в кн. Вода в биологических системах и их компонентах. — Л.: Изд.Ленингр.Ун-та, 1983, с. 3−9 .
- Gutowsky H.S., Saika A. Dissociation, chemical exchange and the proton magnetic resonance in some aqueus electrolytes.- J.Chem.Phys., 1953, v.21 N5, p. 1688 1697 .
- McConnell H.M. Reaction rates by nuclear magnetic resonance.- J.Chem.Phys., 1958, v.28 N3, p. 430 431 .1 7
- Swift T.J., Connick R.E. NMR-relaxation mechanisms of 0 in aqueous solutions of paramagnetic cations and the lifetime of water molecules in the first coordination sphere. J.Chem. Phys., 1962, v.37 N2, p. 307 — 320 .
- Luz Z., Meiboom S. Proton relaxation in dilute solution of cobalt (II) and nickel (II) ions in methanol and the rate of methanol exchange of the solvation sphere. J.Chem.Phys., 1964, v.40 N9, p. 2686 — 2692 .
- Неронов Ю.И., Барзах A.E., Мухамадиев X. Исследование изотопов водорода методом ЯМР для определения отношения магнитных моментов протон-дейтрон до восьмого знака. Журн.эксп.теор. физики, т.69 вып.6 (12), с. 1872 — 1882 .
- Неронов Ю.И., Барзах А. Е. Определение методом ЯМР отношения магнитных моментов тритон-протон с погрешностью 10% .- Журн.Эксп.Теор.Физ., 1977, т.72 вып.5, с. 1658 1669 .
- Лихтенштейн Г. И. Метод спиновых меток в молекулярной биологии. М.: Наука, 1974, — 254 с.
- ЗЭ.Кольтовер В. К. Спиновые метки и зонды в исследованиях модельных и биологических мембран, в сборн. Итоги науки и техники. Серия «Биофизика», т. II, М., 1969, с. 10 — 100 .
- Добрецов Г. Е. Флуоресцентные зонды:.оптические свойства и взаимодействие с мембранами, в сборн. Итоги науки и техники. Серия «Биофизика», т. II, М., 1969, с. 101 — 188 .
- ESR and NMR of paramagnetic species in biological and related systems, ed. by Bertini I. and Drago R.S. Dordrecht, Boston, London, D. Reidel Publ.Comp., 1979 — 425 ps.
- Satterlee J., Erman J. Proton magnetic resonance studies of cytochrome С peroxidase: pD dependence of isotropically shifted resonances. Arch.Biochem.Biophys., 1980, v.202 N2, p. 608 — 616 .
- Roy S., Redfield A. Assignement of imino proton spectra of yeast phenilalanine transfer ribonucleic acid. Biochemistry, 1983, v.22 N7, p. 1386 — 1390 .
- Bruker Report, W-Germany, Bruker-Physik A.G., 1979, N3, p.12- 16 .
- Маршелл Э. Биофизическая химия, т.2. М.: Мир, 1981, — 820 с.
- Уо Д. Новые методы ЯМР в твёрдых телах. М.: Мир, 1978, — 179 с.
- Aue W.P., Bartholdi Е., Ernst R.R. Two-dimensional spectroscopy. Application to nuclear magnetic resonance. J.Chem. Phys., 1976, v.64 N5, p.2229 — 2246 .
- Hahn E.L. Spin echoes. Phys.Rev., 1950, v.80 N4, p.580 594.
- Spin labeling, ed. by Berliner L. New-York, San-Francisco, London, Acad. Press, 1976, -.592 ps.
- Исаев-Иванов В.В., Исаева-Иванова JI.С., Клейнер А. Р., Одинцов В. Б., Сидоров О. Ю., Фошчёв В. Н. Спектральное разделение1. Jtt оконформационных состояний на спин-меченой тРНК из
- Молек.Биол., 1983, т.17 вып.2, с. 362 — 372 .
- Huestic W.H., Raftery М.А. Use of fluorine-19 nuclear magnetic resonance to study conformation changes in selectively modified ribonuclease S. Biochemistry, 1971, v.10 N7, p. 1181 1186 .
- Spanier R.F., Vladimiroff Т., Malinowski E.R. Bulk magnetic susceptibility determined from NMR spinning sideband using coaxial cells. J.Chem.Phys., 1966, v.45 N11, p.4355 — 4357.
- Evans D. The determination of paramagnetic susceptibility of substances in solution using NMR. J.Chem.Soc.(London), 1959, N6, p. 2003 — 2005 .
- Калинников В.Т., Ракитин Ю. В. Введение в магнетохимию. Метод статической магнитной восприимчивости в химии. М.: Наука, 1980, — 302 с.
- Брилл А. Обнаружение свободных радикалов по магнитной восприимчивости, в кн. Свободные радикалы в биологических системах, ред. Блюменфельд Л. А. — М.: Изд.Иностр.Лит., 1963, с. 76 100 .
- Melamud E., Mildvan A. Magnetic resonance studies of the interaction of and phosphoenolpyruvate with pyruvate kinase. J.Biol.Chem., 1974, v.250 N20, p. 8193 — 8201 .
- Asakura Т., Reed G.H., Leigh G.S. Solution electron paramagnetic resonance spectra of hemoproteins at room temperature.- Biochemistry, 1972, v.11 N3, p.334 337 .
- Reuben J., Reed G.H., Cohn M. Note on the distinction between transverse and longitudinal relaxation studies. J.Chem.Phys. 1970, v.52, N3 part 2, p. 1617 .
- Фаррар Т., Беккер Э. Импульсная и фурье-спектроскопия ЯМР.- М.: Мир, 1973, 164 с.
- Лениндкер А. Биохимия. Молекулярные основы структуры и функции клетки. М: Мир, 1974, 956 с.
- Angerman N.S., Hasinoff В.В., Dunford Н.В., Jordan R.B. Study of the exchange rates of ethanol and water on protoporphyrin IX by NMR line broadening.- Can.J.Chem., 1969, v.471. N 17, p. 3217 3224 .
- Luz.Z., Shulman R. Proton magnetic resonance shifts in aqueous solutions of paramagnetic metal ions. J.Chem.Phys., 1965, v.43 N10, p. 3750 — 3756 .
- King Т.Е. Reconstitution of the respiratory chain. in Advances in Enzymology, founded by Nord P.P., ed. by Meister A., New-York, J. Wiley and Sons, v.28, 1966, p. 155 — 236 .
- Gupta R.K., Mildvan A.S. Nuclear relaxation studies on human methemoglobin. J.Biol.Ghem., 1975, v.250 N1, p. 246 — 253 .
- Vuk-Pavlovic's., Benko B. The haem-environment in horseradish peroxidase as seen by proton magnetic relaxation. Biochem. Biophys.Res.Commun., 1975, v.66 N4, p. 1154 — 1159 .
- Navon G., Shulman R.G., Wyluda B.J., Jamane T. Nuclear magnetic resonance studies of the active site of carboxypeptidase A.- Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 1968, v.60 N1, p. 86−91 .
- Navon G., Shulman R.G., Wyluda B.J., Jamane T. Nuclear magnetic resonance study of the binding of fluoride ions to carboxypeptidase. J.Mol.Biol., 1970, V.51 N1, p. 15 — 30 .
- Lanir A., Gradstain S., Navon G. Temperature and frequency dependance of solvent proton relaxation rates in solution of manganese (II) carbonic anhidrase. Biochemistry, 1975, v.141. N2, p. 242 248 .35
- Ward R.L. CI nuclear magnetic resonance studies of a zinc metalloenzyme carbonic anhydrase. Biochemistry, 1969, v.8 N5, p. 1879 — 1883 •
- Ward R.L.Zinc environmental differences in carbonic anhydrase isozymes. Biochemistry, 1970, v.9 N12, p. 2447 — 2453 .83"Danchin A. tRNA structure and binding sites for cations.- Biopolimers, 1972, v.11 N7, p. 1317 1333 .
- Peacock A.R., Richards R.E., Sherard B. Proton magnetic relaxation in solution of E. Coli ribosomal RNA containing Mn^+ions.- Molec.Phys., 1969, v.16 N1, p. 177 188 .
- Walters J.A.L.I., Greedes H.A.M., Hilbers C.W. On the binding of Mg2+ and Mn2+ to tRNA. Biophys.Chem., 1977, v.7 nN1, p. 147 151 .
- Lanir A., Navon G. NMR studies of bovine carbonic anhydrase. Binding of sulfonamides to the zinc enzime. Biochemistry, 1971, v. 10 N6, p. 1024- - 1032 .
- Lanir A., Navon G. Nuclear magnetic resonance studies of carbonic anhydrase. Binding of sulfacetamide to the manganese enzyme. Biochemistry, 1972, v.11 N19, p. 3536 — 3544 .
- Lanir A., Navon G. Interaction of bovine carbonic anhydrase with acetate ions. Biochim.Biophys.Acta, 1974, v.341 N1, p. 65 — 74 .
- Lanir A., Navon G. NMR studies of two binding sites of acetate ions to manganese (II) carbonic anhydrase. Biochim.Biophys. Acta, 1974, v.341 N1, p. 75 — 84 .
- Gadian D.G., Radda G.K., Richards R.E. NMR studies on substrate binding to phosphoglucomutase. Biochim.Biophys.Acta, 1974, v.358 N1, p. 57 68 .
- Leigh J.J.S., Maltempo M.M., Ohlsson P.-I., Paul K.-G. Optical, NMR and EPR properties of horseradish peroxidase and it’s donor complexes. FEBS Letters, 1975, v.51 N2, p. 304 — 309 .
- Paul K.-G., Ohlsson P.-I. Equilibria between horseradish peroxidase and aromatic donors. Acta Chem.Scand., 1978, V. B32
- E.Coli, in Cancer Enzymology, ed. by Schultz J, Ahmad D.F., New-York, Acad. Press, 1976, p. 123 — 137 .
- Burns P.D., Luoma G.A., Marshall A, G. Evaluation of base-pairing schemes for E. Coli 5S RNA by 400 MHz proton nuclear magnetic resonance spectroscopy. Biochem.Biophys.Res.Commun., 1980, v.96 n"N2, p. 805 — 811 .
- Tritton T. Ribosome-chloramphenicol interactions: a nuclear magnetic resonance study. Arch.Biochem.Biophys., 1979, v.197, N1, p. 10 — 17 .
- Villafranca J.J. EPR spectra of Fe (III)-superoxide dismutase with special reference to the electron spin relaxation time of Fe (III). FEBS Letters, 1976, v.62 N2, p. 230 — 236 .
- WM 500 multinuclear NMR. Bruker-Physik A.G. Publ., 1982 .
- Freeman R., Gestblom B. Localized saturation effects in nuclear magnetic double resonance. J.Chem.Phys., 1968, v.48 N11, p.5008 — 5020 .
- Gray K.W., Ozier I. New technique for the measurement of NMR splittings to very high accuracy. Phys.Rev.Letters, 1971, v.26 N4, p. 161. — 165 .
- ЮЗ.Константинов Ю. С., Смирнов A.M. О некоторых применениях спиновых генераторов в ЯМР спектроскопии. Приборы и техн. эксп., 1972, № 5, с. 134 — 135 .
- Ю4.Константинов Ю. С., Смирнов A.M. О многочастотных колебаниях спинового генератора. Радиотехника и электроника, 1972, т.17 № II, с. 2456 — 2459 .
- Ю5. Умарходнаев P.M. Об устойчивости спинового генератора боковой полосы, работающего на неоднородно уширенной линии."Радиотехника и электроника, 1974, т.19 № 4, с. 760 765 .
- Ю6.Владимирский К. В., Лабзов Б. А. Спектрометр, стабилизированный спиновым генератором. Приборы и техн. эксп., 1962, № 2, с. 102 — 106 .
- Ю7.Худсон Д. Статистика для физиков. Лекции по теории вероятности и элементарной статистике. М.: Мир, 1970, — 296 с.
- Ю8.паунд Р.В. О весе фотонов. Успехи физ. наук, I960, т.72 вып.4, с. 673 — 683 .
- Ю9.Эрнст Р. Повышение чувствительности в спектроскопии магнитного резонанса. I. Анализ метода усреднения во времени. Приборы для научн. исслед., 1965, И2, с. 3 — 10 .
- Williams G.A., Gutowsky H.S. Sample spinning and field modulation effects in nuclear magnetic resonance. Phys.Rev., 1956, v.104 N2, p. 278- 283 .
- Андерсон В. Электрические шиммы, в кн. ЯМР- и ЭПР-спект-роскопия. — М.: Мир, 1964, с. 149 — 152 .
- Сысоева H.A., Степанянц А. У., Бучаченко А. Л. Парамагнитные сдвиги протонов растворителей в присутствии органических радикалов. Журн.структ.химии, 1968, т.9 вып.2, с. 311 — 312.
- Morishima I., Endo К., Yonezawa Т. Interaction between closed1 13and open-shell molecules. VI. H andC contact shifts and molecular orbital studies on hydrogen bond of nitroxide radical. J.Chem.Phys., 1973, v.58 N8, p.3146 — 3159 .
- Торчинский Ю.М. Сера в белках. М.: Наука, 1977, — 302 с.
- Hayaishi О. Oxigenases. Ed. by Hayaishi 0., New-York, Acad. Press, 1962, 588 ps.
- Taylor J.E., Yan J.P., Jin-Liang Wang. The iron (III)-cataly-zed oxidation of cystein by molecular oxygen in the aqueus phase. An example of two-thirds order reaction. J.Am.Chem. Soc., 1966, v.88 N8, p. 1663 — 1667 .
- Hanaki A., Kamide H. Transient intermediates in the copper catalysed oxidation of cystein. Chem.Pharm.Bull., 1974, v.22 N9, p. 2491 — 2498 .
- Hanaki A., Kamide H. Autooxidation of cysteine catalysed by copper in glycilglycine buffer. Сhem.Pharm.Bull., 1975, v.23 N6, p. 1671 — 1676 .
- Yang C.S., Huennekens P.M. Iron-mercaptoetanol-inorganic sulfide complex. Possible model for the chromophore of non-heme iron proteins. Biochemistry, 1970, v.9 N10, p. 2127- 2133 .
- Hoskins B.P., Martin R.L., White A.H. Molecular and cristal structure of a 5-covalent iron (III) complex with spin S =3/2. Nature (London), 1966, v.211 N 5049, p. 627 — 628 .
- Niarhos D., Kosticas A., Simopulos A., Concovanis D., Philtigstrud P., Coffman R.E. Mossbauer, magnetic susceptibility and EPR studies of intermediate spin iron (III) dithiooxa-lato halides. J.Chem.Phys., 1978, v.69 N10, p. 4411 — 4418.
- Zahlenwerte und functionen aus physik, Chemie, astronomie, geophysik und technik. Berlin, Springer-Verlag, 1951, Bd.1, teil 3, seite 522 .
- Wickman H., Klein M., Shirley D. Paramagnetic resonance of Fe^+ in policrystalline ferrichrome A. J.Chem.Phys., 1965, v.42 N6, p. 2113 — 2117 .
- Вейсблут M. Физика гемоглобина. в кн. Структура и связь, — М.: Мир, 1969, с. II 185 .
- Go1ding R.M., Tennant W.C., Kanekar C.R., Martin R.L., White A.H. NMR studies of a series of iron (III) dithiocarba-mate complexes.- J.Chem.Phys., 1966, v.47 N6, p. 2688 2693.
- Рачинский Ф.Ю., Славичевская H.M. Химия аминотиолов. М.-Л.: Химия, 1965, — 295 с.
- Yagi К. Reaction intermediates of d-amino acid oxidase, -in Flavins and flavoproteins, ed. by Slater E.C., Amsterdam, London, New-York, Elsevier Publ. Сотр., 1966, v.8, p. 210- 225 .
- Бреслер C.E., Васильева H.H., Казбеков Э. Н. Изучение механизма действия оксидазы д-аминокислот. I. Доказательство свободно-радикального механизма реакции, катализируемой димернойформой фермента. Молек. биология, 1976, т.10 вып.2, с. 260 — 267. .
- Sussman J.L., Holbrook S.R., V/arrant R. Y/., Church G.M.,
- D.С.Butterworth, 1964, ps. 139. Yamazaki I., Yokota K. The oxidation states of peroxidase.- Molec. and Cell.Biochem., 1973, v.2 N1, p.39 52. НО. Магонов C.H., Давыдов P.M., Блюменфельд JI.A., Арутюнян A.M.,
- Шаронов Ю.А. Спектры поглощения и магнитного кругового дихроизма гемсодержащих белков в неравновесных состояниях.III.Комплексы пероксидазы.-Молек.биология, 1978, т.12 вып.5,с.П91- 97,
- Maltempo М.М., Ohlsson P.-I., Paul K.-G., Petersson L.,
- Ehrenberg A. Electron paramagnetic resonance analysis of horseradish peroxidase in situ and after purification.- Biochemistry, 1979, v.18 N14, p. 2935 2941 .
- Marklud S. Mechanisms of irreversible inactivation of horseradish peroxidase caused by hydroxymethylhydroperoxide.
- Arch.Biochem.Biophys." 1973, v.154 N2, p. 614 622 .
- Tamura M. Optical and magnetic measurements of horseradish peroxidase. II. pH dependence of peroxidase. Biochim. Bio-phys.Acta, 1971, v.243 N2, p. 249 — 258 .
- Tamura M. Optical and magnetic measurements of horseradish peroxidase. I. Azide complex of peroxidase. Biochim.Biophys. Acta, 1971, v.243 N2, p. 239 — 248 .
- Wever R., Bakkenist A.R.J. The interaction of mieloperoxidase with ligands as studied by EPR. Biochem.Biophys.Acta, 1980, v.612 N1, p. 178 — 184 .
- Critchlow J.E., Dunford H.B. Studies on horseradish peroxidase. X. The mechanism of the oxidation of p-cresol, ferro-cianide and iodide by compound II. J.Biol.Chem., 1972, v.247 N12, p. 3714 — 3725 .